Les zones littorales à macrophytes ont un rôle fonctionnel important dans les hydrosystèmes fluviaux. Outre leur forte productivité, ces milieux se caractérisent également par une forte biodiversité. Cependant, les liens pouvant exister entre hétérogénéité spatiale, biodiversité et flux de matière restent encore peu connus. En milieu aquatique, les microcrustacés représentent un maillon clef entre les microorganismes eucaryotes, qui sont les principaux producteurs d’acide gras polyinsaturés (AGPI), et le compartiment piscicole. Dans ce travail de thèse, nous avons donc cherché à savoir comment la diversité des cladocères rencontrée dans une zone littorale à macrophytes pouvait affecter le transfert des AGPI dans les réseaux trophiques. L’approche vers laquelle s’est orienté ce travail combine à la fois des études menées en milieu contrôlé, permettant des expériences de nutrition, ainsi que des études menées en milieu naturel. Cette double approche permet de faciliter l’interprétation des résultats issus des analyses lipidiques, isotopiques et isotopiques de composés spécifiques. Nos résultats montrent ainsi qu’il n’existe pas de variabilité dans les capacités d’accumulation et de bioconversion des AGPI chez les cladocères coexistant dans une zone littorale à macrophytes. D’après ces résultats, il semble donc que le principal facteur influençant la variabilité des transferts d’AGPI vers le compartiment piscicole soit la stratégie alimentaire et le compartiment trophique exploité par les différentes espèces de microcrustacés. En effet, outre le seston, notre étude montre que certaines espèces de cladocères rencontrées en zone littorale sont capables d’exploiter l’épiphyton et le neuston. Les analyses lipidiques mettent de plus en évidence, que la diversité des compartiments trophiques exploités s’accompagne d’une variabilité d’apports en AGPI. Dans notre étude, l’épiphyton est ainsi significativement plus concentré en AGPI que le seston. A l’interface air-eau, le neuston se caractérise de plus, par une forte accumulation de matière organique d’origine allochtone qui, dans le cas d’une pluie de pollen, représente une source de carbone et d’AGPI non négligeable pour certaines espèces de microcrustacés. Dans les zones littorales à macrophytes, la complémentarité des espèces de cladocères entraine donc une utilisation plus complète des ressources. La diversité des compartiments trophiques, associée à la diversité des microcrustacés, permet donc probablement une optimisation du transfert des AGPI vers les niveaux trophiques supérieurs. / Areas with littoral macrophytes play an important functional role in freshwater systems. In addition to the high productivity recorded in such areas, they also shelter a high diversity of organisms. However, possible links between spatial heterogeneity, biodiversity and energy pathways are still poorly known. As they constitute the major link between microorganisms and species higher in the food web, microcrustaceans play a key role in the transfer of polyunsaturated fatty acids (PUFA) to organisms at higher trophic levels. In this study, we wanted to assess if microcrustaceans diversity encountered in macrophytes littoral zones would lead to a variability of PUFA transfer in the food web. This work combined controlled conditions experiment and studies run in natural environments in order to help the interpretation of results from lipid analysis, isotopic analysis and fatty acid isotope analysis. Our results indicate that there are no differences of PUFA concentrations between cladocerans from a macrophyte littoral zone when they were exposed to the same pool of dietary PUFA. Hence, in heterogeneous feeding habitats such as macrophytes zones where these cladocerans often co-exist, foraging behavior of cladoceran species more than differences of metabolism may be crucial for determining PUFA transfer to upper trophic levels. In addition to seston, our study shows indeed that some cladoceran species are able to forage on the epiphytic and neustonic compartments. Lipid analyses highlight moreover that the diversity of trophic compartments lead to a variability of PUFA inputs to primary consumers. In our study, the epiphytic compartment is indeed significantly more concentrated in PUFA than seston. At the air-water interface, neuston is moreover characterized by important allochthonous organic matter accumulation. During a pollen rain, this organic matter represents an important source of carbon and PUFA for some microcrustacean species. In macrophytes littoral zones, cladocerans complementarity leads to a more complete use of PUFA sources. The association of trophic compartment diversity and microcrustacean diversity probably allows an optimization of PUFA transfer to higher trophic levels.

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Diploma thesis ‚The project of a small water reservoir in the Níhov cadastral area’ has goal to introduce to reader the small water reservoir as the important landscape element. Small water reservoir is cornerstone of local ecological stability, which has important income for microclima in the closes surrounding. Furthermore, the function of constant improvement water quality in the basis or contribute to increasing of ground water level. Thesis is divided into two parts. In the first theoretical part thesis describes the topic of small water reservoirs briefly. The first part shortly describes the details of designing process or inner process within the reservoir. In the second practical part is created basic project documentation based on the data collected and measured in the affected area. The project was created in cooperation and upon request of investor the representation of the village Níhov.

The Master´s thesis is elaborated in a study small reservoirs. It is a container with a homogeneous dam with associated security object. The technical design solution tank based on the ČSN 75 2410 "Small water reservoirs". Water reservoir will serve as an ecological and landscaping features in the landscape. Will increase the biodiversity of the landscape and contribute to the ecological stability of the territory. The littoral zone of the reservoir area will serve in the future as a habitat for a variety of organisms. Accompanying vegetation serve to integrate small water tank to the ecological corridor.

MSc (Microbiology) / Department of Microbiology / Background: Human Herpes Virus-8 (HHV-8) and Human Immunodeficiency Virus (HIV) are endemic in sub-Saharan Africa. However, the prevalence of HHV-8 in HIV-infected individuals in sub-Saharan Africa has not been fully described and characterized. Objectives: The objective of this study was to determine the seroprevalence and genetic subtypes of HHV-8 in an HIV-infected population in Cameroon. Methodology: KSHV/HHV-8 Enzyme-linked Immunosorbent Assay (ELISA) kit (Advanced Biotechnologies Inc., USA) was used to detect IgG antibodies in the plasma of 406 HIV-infected outpatients of the Mutengene Baptist Health Centre, Cameroon. To detect the viral presence, a 233 bp fragment of the ORF 26 gene of HHV-8 was targeted by polymerase chain reaction (PCR) in total DNA purified from patients’ whole blood. A 453 bp of the K1 gene was amplified by nested PCR, sequenced and phylogenetically analysed to infer subtypes. The online tool, Synonymous Non-synonymous Analysis Program (SNAP), was used to determine the rate of synonymous and nonsynonymous mutations in the K1 gene. The genetic variability among the derived K1 nucleotide sequences was determined by mean genetic distance analysis. Results: Of the 406 participants, an HHV-8 seroprevalence of 79.1% was obtained. There was a statistically significant association of seroprevalence with age (p= 0.00), CD4+ cell count (p= 0.02), marital status (p= 0.02) and ownership of a transistor radio set (p= 0.00). Seventy samples (23.3%) were successfully amplified for ORF 26 gene confirming the presence of replicating virus. K1 sequences were obtained for 14 of the 20 (70%) K1 amplified DNAs. The mean genetic diversity of K1 sequences ranges from 0.0%-22.3%. Phylogenetic analysis revealed two infecting viral subtypes in the study cohort: subtype A5 (57.1%), and subtype B (35.7%). Greater positive selection and genetic diversity were observed in A5 subtype compared to B subtype of K1. Interestingly, one sample (BM 547) clustered with an unclassifiable sequence from South Africa. Conclusions and recommendation: This study revealed the endemicity of HHV-8 infection in the studied population, with subtypes A5 and B as the most important epidemiological genetic variants. In addition, targeting the ORF 26 region by PCR could be an approach to detect replicating virus in individuals. Further studies should investigate the association between HHV-8 infection and KS development in the study area which is endemic for HIV. This study contributes data to the HIV/HHV-8 co-infection landscape in the study area and in Africa at large.

Sur un site multi-influencé par des émissions urbaines et industrielles, l'analyse de la pollution aux aérosols, au voisinage des sources, requiert une connaissance multi-échelles de la dynamique atmosphérique. une campagne de mesure a été développée afin d'étudier la variabilité météorologique et micro-météorologique et l'évolution des particules, en particulier, submicroniques, sur une durée d'une année. Des oscillations de la concentration en aérosols, autour de la moyenne régionale, ont été identifiées le long du littoral dunkerquois, et attribuées aux phénomènes météorologiques locaux à proximité des industries. Des méthodes de reconnaissance et d'apprentissage supervisé, faisant appel aux mesures par anémomètre ultrasonique et aux profils verticaux du vent par lidar Doppler, ont été mises en œuvre pour établir la variabilité de phénomènes pertinents dans les événements de pollution de l'air : brise de mer, brouillard, front et tempête. L'analyse d'une base de données de six ans a permis de montrer que l’occurrence annuelle des brises de mer est corrélée à celle du nombre de journées anticycloniques. Par ailleurs, la fréquence annuelle des brouillards pourrait être liée à la concentration annuelle régionale en aérosols. L'analyse des covariances du vent a révélé deux situations contrastées, à faible et à fort flux turbulents. Le brouillard et la brise de mer, de faible flux, génèrent une pollution élevée aux PM₁, et sont le siège d'une forte concentration en aérosols organiques oxygénés (aérosols secondaires). Les situations à fort flux, favorisant les échanges verticaux, sont associées à une forte variabilité des sulfates particulaires. L'observation de longue durée a permis de mettre en évidence la construction d'épisodes de pollution particulaire, au cours de séquences de phénomènes météorologiques locaux, du fait des sources locales, mais aussi par incorporation de la pollution à plus grande échelle. / On a site that is multi-influenced by urban and industrial emissions, the analysis of aerosol pollution, in the vicinity of sources, requires a multi-scale knowledge of atmospheric dynamics. A measurement campaign was developed in order to study the meteorological and micro-meteorological variability and the evolution of particles, in particular, submicronic evolution, during a one-year period.Oscillations of the aerosol concentration around the regional average were identified along the Dunkirk coastline, and were attributed to the local meteorological phenomena close to the industries. Recognition and machine learning methods using measurements by an ultrasonic anemometer and vertical wind profiles by a Doppler lidar, were implemented to define the variability of relevant phenomena in air pollution events : sea breeze, fog, front and storm. A six-years database analysis has highlighted a correlation between the annual sea breeze occurrence and the annual number of anticyclonic days. Furthermore, the annual fog frequency could be connected with the annual regional concentration of aerosols. Analysis of wind covariance revealed two contrasting situations, low-level and high-level turbulent fluxes. The fog and the sea breeze, with low-level fluxes, generate a high PM₁ pollution and are in favor of a high organic oxygenated aerosols concentration (secondary aerosols). High-level fluxes situations, favoring vertical exchanges, are associated with a large variability of sulfate aerosols. The long-term observation, made it possible to highlight the development of episodes of particulate pollution during local weather phenomena, owing to the local emissions, but also by taking into account the larger-scale pollution.

Titre de l'écran-titre (visionné le 25 septembre 2023) / Les risques d'érosion et de submersion marine sont en constante augmentation pour plusieurs municipalités côtières de l'est du Québec. Alors qu'ils sont exacerbés par la pression des changements climatiques, plusieurs acteurs territoriaux entament des démarches de planification pour mieux anticiper les aléas côtiers et s'adapter. Pour faire face à la complexité d'une telle démarche, impliquant une pluralité d'acteurs et d'échelles territoriales, la science montre que les outils de mises en situation appelés « jeux sérieux » se démarquent comme approches de médiation et d'expérimentation. Proches des « labs », ils peuvent agir comme outils de transmission de connaissances et d'engagement des parties prenantes. Mais qu'en est-il plus particulièrement? Comment les jeux sérieux s'insèrent-ils dans une démarche de planification territoriale? Quelle perception s'en font les acteurs territoriaux? Par une approche qui combine analyse documentaire et mise à l'épreuve d'un jeu sérieux, nous cherchons à saisir l'intérêt d'un tel outil dans une démarche territoriale de l'adaptation. L'évaluation d'un jeu par des méthodes d'observation, de discussions de groupe et d'entretiens semi-dirigés invite à voir son effet mobilisateur et sa capacité à initier la discussion sur un enjeu vécu. Les professionnels montrent un intérêt marqué et un engagement fort dans les mises en situation proposées. Cela dit, les répercussions à long terme d'un tel outil sont encore peu documentées. La mise à l'épreuve répétée d'un jeu et la multiplicité des méthodes d'évaluation sont requises pour établir l'impact sur les connaissances acquises et la perception des joueurs. / The risks of coastal erosion and flooding are increasing for several municipalities in eastern Quebec. As climate change increases the exposure of coastal infrastructure and building, by driving sea-level rise and intensifying storms, several localities are initiating planning processes to better anticipate coastal hazards and adapt. To deal with the complexity of the process, that involves a plurality of actors and territorial scales, scientific literature shows that simulation tools called "serious games" stand out as mediation and experimentation approaches. Similar to "labs", they act as learning and engagement tools for stakeholders. More specifically, what are the contributions of serious games into a territorial planning process? How do stakeholders perceive them? Through an approach that combines documentary analysis and the application of a serious game, we seek to understand the interest of such a tool in a territorial approach to adaptation. The evaluation of a game through observation methods, group discussions and semi-directed interviews shows its mobilizing effect and its capacity to initiate discussion on an issue. The players showed an interest and a strong engagement to the proposed scenarios. However, the long-term effects of such a tool have not yet been well documented. Repeated testing of a game and combined multiple evaluation methods are required to establish the impact on learning and perception.

Une courbe des variations du niveau marin relatif a été dressée pour les complexes deltaïques de Betsiamites et de Manicouagan-Outardes, montrant l’existence d’un bas niveau marin et de la transgression Laurentienne. Cette dernière origine d’une remontée eustatique lors de la période chaude de rHypsithermal et pourrait constituer un analogue au réchauffement climatique appréhendé. Le déficit sédimentaire des plages, en raison de la diminution considérable des apports sédimentaires des rivières depuis 3 500 ans, est nettement amplifié depuis moins d’une décennie par l’augmentation de la fréquence des tempêtes, la diminution de la largeur du pied de glace et l’accroissement de l'artificialité des falaises sableuses, se traduisant par un recul généralisé de la ligne de rivage. Une première quantification des processus et des agents d’érosion montre que les processus cryogéniques peuvent contribuer jusqu’à 65 % de l’érosion totale annuelle pour une côte de sédiments fins et que la suffosion est responsable dans une large mesure de la réactivation des falaises. / Québec Université Laval, Bibliothèque 2018

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La complexité morpho-stratigraphique de la falaise côtière de Pointe-au-Bouleau (Charlevoix Est) a été étudiée en lien avec la morphologie et la dynamique de la côte. Les analyses ont permis d’identifier des liens entre les propriétés lithostratigraphiques des sédiments qui composent les falaises, la variabilité spatiale des taux de recul côtier ainsi que la géométrie des falaises. Cette étude montre que la lithologie des unités stratigraphiques, leur origine, leur épaisseur, leur position ainsi que la nature des contacts entre elles expliquent une forte proportion de la variabilité spatiale du recul de la côte. Le développement d’une approche intégrant le LiDAR terrestre (2013), le LiDAR aéroporté (2005-2010), les photographies aériennes (1964-2012), l’analyse de coupes stratigraphiques et le suivi horaire (caméras de surveillance) a permis d’identifier des unités stratigraphiques à fort potentiel d’érosion. Les relations mises en évidence entre la lithostratigraphie, la variabilité spatio-temporelle des processus subaériens et marins ainsi que les valeurs de recul côtier ont finalement permis de développer un modèle conceptuel géomorphologique de l’évolution côtière de la falaise de Pointe-au-Bouleau.