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Modelos para estimação de componentes de (co)variância para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Nelore /

Boligon, Arione Augusti. January 2011 (has links)
Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Paulo Roberto Nogara Rorato / Banca Lenira El Faro Zadra / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Fernando Sebastián Baldi Rey / Resumo: O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de estudar a variação genética de pesos obtidos do nascimento à idade adulta, utilizando modelos multi-características (MC) e de regressão aleatória (MRA), visando obter modelos adequados e parcimoniosos para a estimação de componentes de (co)variância e predição de valores genéticos de animais da raça Nelore, os quais possam ser utilizados em programas de melhoramento genético. As medidas de peso utilizadas são provenientes de oito fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). As análises MC foram realizadas considerando nove pesos: peso ao nascer, desmama, ano, sobreano e aos 2, 3, 4, 5 e 6 anos de idade. Foram estudados os seguintes modelos: multi-características padrão, cinco modelos de posto reduzido ajustando os primeiros 1, 2, 3, 4 e 5 componentes principais genéticos e cinco modelos utilizando análise de fatores com 1, 2, 3, 4 e 5 fatores. Em todos os modelos foram considerados os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual. Para o peso ao nascer e à desmama também foram incluídos, como aleatórios, os efeitos genético materno e ambiente permanente materno. Foram considerados os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e efeitos linear e quadrático da idade do animal à pesagem (exceto para o peso ao nascer) e idade da mãe ao parto. As matrizes de (co)variâncias genética materna, de ambiente permanente materno e residual foram assumidas terem posto completo. Os resultados indicam que apenas três componentes principais são requeridos para modelar a estrutura das (co)variâncias genéticas entre pesos do nascimento à idade adulta, reduzindo assim o número de parâmetros nas análises. Nas análises utilizando MRA foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The genetic variation of weights obtained from birth to adult ages were studied using multi-trait (MT) and random regression (RRM) models in order to obtain adequate and parsimonious models for the estimation of (co)variance components and prediction of genetic values of Nellore cattle, which can be used in breeding programs. The weights traits were obtained from eight herds participating in the Nelore Cattle Breeding Program (NCBP). In the MT analyses were included weight records taken at nine standard ages (at birth, weaning, 365 and 550 days of age and 2, 3, 4, 5 and 6 years of age). A standard multivariate analysis, reduced rank analyses fitting the first 1, 2, 3, 4 and 5 genetic principal components, and analyses that fitted a factor analytic structure considering 1, 2, 3, 4 and 5 factors, were carried out. All models included genetic additive direct and residual as random effect. For birth and weaning weight also was considered genetic maternal and maternal permanent environmental effects as random. Contemporary groups, age at weighing (except for birth weight) and dam age at calving was included as fixed effect. The genetic maternal, maternal permanent environmental and residual covariance matrices were assumed to have full rank throughout. The results indicate that only three principal components are required to model the genetic covariance structure among weight from birth to mature, decreasing the number of parameter in the analyses. For RRM were used female weights from birth to mature. The models included direct additive and maternal genetic effects and animal and maternal permanent environmental effects as random. Contemporary group and dam age at calving within the age class of the animal (linear and quadratic effect) were included as fixed effects, and orthogonal Legendre... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Modelos para estimação de componentes de (co)variância para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Nelore

Boligon, Arione Augusti [UNESP] 09 August 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-09Bitstream added on 2014-06-13T18:07:18Z : No. of bitstreams: 1 boligon_aa_dr_jabo.pdf: 467218 bytes, checksum: b80d4efde7c57e886e21ae839bf5def4 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de estudar a variação genética de pesos obtidos do nascimento à idade adulta, utilizando modelos multi-características (MC) e de regressão aleatória (MRA), visando obter modelos adequados e parcimoniosos para a estimação de componentes de (co)variância e predição de valores genéticos de animais da raça Nelore, os quais possam ser utilizados em programas de melhoramento genético. As medidas de peso utilizadas são provenientes de oito fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). As análises MC foram realizadas considerando nove pesos: peso ao nascer, desmama, ano, sobreano e aos 2, 3, 4, 5 e 6 anos de idade. Foram estudados os seguintes modelos: multi-características padrão, cinco modelos de posto reduzido ajustando os primeiros 1, 2, 3, 4 e 5 componentes principais genéticos e cinco modelos utilizando análise de fatores com 1, 2, 3, 4 e 5 fatores. Em todos os modelos foram considerados os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual. Para o peso ao nascer e à desmama também foram incluídos, como aleatórios, os efeitos genético materno e ambiente permanente materno. Foram considerados os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e efeitos linear e quadrático da idade do animal à pesagem (exceto para o peso ao nascer) e idade da mãe ao parto. As matrizes de (co)variâncias genética materna, de ambiente permanente materno e residual foram assumidas terem posto completo. Os resultados indicam que apenas três componentes principais são requeridos para modelar a estrutura das (co)variâncias genéticas entre pesos do nascimento à idade adulta, reduzindo assim o número de parâmetros nas análises. Nas análises utilizando MRA foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento... / The genetic variation of weights obtained from birth to adult ages were studied using multi-trait (MT) and random regression (RRM) models in order to obtain adequate and parsimonious models for the estimation of (co)variance components and prediction of genetic values of Nellore cattle, which can be used in breeding programs. The weights traits were obtained from eight herds participating in the Nelore Cattle Breeding Program (NCBP). In the MT analyses were included weight records taken at nine standard ages (at birth, weaning, 365 and 550 days of age and 2, 3, 4, 5 and 6 years of age). A standard multivariate analysis, reduced rank analyses fitting the first 1, 2, 3, 4 and 5 genetic principal components, and analyses that fitted a factor analytic structure considering 1, 2, 3, 4 and 5 factors, were carried out. All models included genetic additive direct and residual as random effect. For birth and weaning weight also was considered genetic maternal and maternal permanent environmental effects as random. Contemporary groups, age at weighing (except for birth weight) and dam age at calving was included as fixed effect. The genetic maternal, maternal permanent environmental and residual covariance matrices were assumed to have full rank throughout. The results indicate that only three principal components are required to model the genetic covariance structure among weight from birth to mature, decreasing the number of parameter in the analyses. For RRM were used female weights from birth to mature. The models included direct additive and maternal genetic effects and animal and maternal permanent environmental effects as random. Contemporary group and dam age at calving within the age class of the animal (linear and quadratic effect) were included as fixed effects, and orthogonal Legendre... (Complete abstract click electronic access below)
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Effects of Divergent Selection for Insulin-like Growth Factor I (IGF-I) on Mature Weight and Growth Curves in Angus Cattle

Qin, Qing 01 September 2010 (has links)
No description available.
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Estimação dos parâmetros genéticos do peso adulto em matrizes da raça Nelore / Genetic parameters estimation for mature weight in Nelore beef cattle

Pedrosa, Victor Breno 07 December 2006 (has links)
O estudo das características produtivas visa a obtenção de animais possuidores de genótipos com potencial para altas produções mas que sejam também adaptados ao meio ambiente de criação extensiva no Brasil. Esses animais produtivos e adaptados poderiam otimizar os custos, tornando assim, sua criação sustentável em escala comercial. Apesar das características reprodutivas serem de extrema importância como objetivo de seleção, sua utilização não tem sido ampla em programas de melhoramento genético por serem consideradas de baixa herdabilidade. Entre as características produtivas existentes em bovinos de corte pode ser citada a caracterítica de peso adulto, que deve ser avaliado e monitorado o aumento do tamanho das fêmeas pela resposta indireta a seleção para peso, afim de confrontar os resultados economicamente. Dentro deste contexto foram avaliados dados de 74.547 animais com o objetivo de analisar o peso adulto e o peso adulto com repetibilidade (PAVr) em animais Nelore estimando a herdabilidade de características de desenvolvimento ponderal, utilizando modelos lineares; Estimar a correlação entre peso adulto (PAV) e características de peso ao sobreano (PS), conformação (CONF), precocidade (PREC), musculosidade (MUSC) e altura de garupa (AG); Determinar se há ou não vantagem em incluir o peso adulto em programas de seleção na raça Nelore. Os componentes de variância e de covariância foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (MTDFREML) utilizando-se o modelo animal. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram de 0,43 para PAV e 0,41 para PAVr; 0,38 para PS; 0,23 para CONF; 0,19 para PREC; 0,22 para MUSC e 0,35 para AG. Os coeficientes de correlação genética obtidos variaram de 0,37 a 0,97. Os resultados sugerem que ganhos genéticos podem ser obtidos com a seleção para a característica de peso adulto, em monitoramento do tamanho de fêmeas na raça Nelore. A correlação entre as característica em estudo demonstra haver uma tendência de alteração das características de tamanho a partir da seleção para peso adulto. / The study of the productive traits aims the obtention of animals that have genotypes with potencial for high productions but that are also adaptable to the environment of the extensive creation in Brazil. These productive and adaptable animals could improve the costs, making therefore, their creation sustainable on a commercial scale. Although the reproductive characteristics have an extremely importance as an objective of the selection, its utilization have not been ample in genetic improvement programs for being considered as a low heritability trait. Between the productive traits existent in beef cattle it can be cited the mature weight trait, that must be evaluated and monitorated for the size increase control of the females by the indirect answer to weight selection, in order to confront, economically, the results. In this context it was evaluated data from 74.547 animals with the objective of analyze the mature weight and the adult weight with repeated measurements (MWr) in Nelore animals estimating the heritability of the ponderal development traits, using linear models; Estimate the correlation between mature weight (MW) and the post-weaning weight trait (PW), conformation (CONF), precocity (PREC), musculature (MUSC) and hip height (HH); Determine if there is an advantage in the inclusion of the mature weight in selection programs of the Nelore breed. The components of variance and covariance were estimated by the method of Restricted Maximum Likelihood Multiple Trait Derivative Free (MTDFREML) using the animal model. The estimation of the heritability coefficients were 0,43 for MW and 0,41 for MWr; 0,38 for PW; 0,23 for CONF; 0,19 for PREC; 0,22 for MUSC and 0,35 for HH. The genetic correlation coefficients varied from 0,37 to 0,97. The results suggest that genetic gains can be obtained with the selection for the mature weight characteristic, with the monitoration of the female sizes for Nelore breed. The correlation between the characteristics in study shows that there is a tendency for alteration in size characteristics through the selection for mature weight.
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Estimativas de (co) varância genética de pesos do nascimento até a maturidade em rebanhos da raça Nelore usando modelos de regressão aleatória e de características múltiplas /

Boligon, Arione Augusti. January 2008 (has links)
Resumo: Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Nelore por meio de análises uni, bi e multicaracterísticas e modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais nascidos de 1975 e 2002, provenientes de 8 fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). Os pesos foram obtidos do nascimento aos 8 anos de idade. Nas análises uni, bi e multicaracterísticas foram utilizados pesos em idades padrão como nascimento, desmama, ano, sobreano e aos 2, 3 e 5 anos de idade. Também foram realizadas análises utilizando o peso mais próximo aos 4,5 anos de idade como indicativo de peso adulto, considerando uma única medida a partir de 2, 3 e 4 anos de idade ou como registros repetidos de pesos a partir dessas mesmas idades. Nas análises de regressão aleatória, foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento aos 8 anos de idade, considerando como variáveis independentes polinômios de Legendre da idade na data da pesagem. A variância residual foi modelada por meio de classes variando de 1 a 5. Foram utilizados 8 modelos de coeficientes de regressão aleatória para os efeitos direto e materno de animal, e de ambiente permanente de animal e materno. O modelo multicaracterística, incluindo registros de pesos ao desmame e à seleção é o mais indicado para a avaliação genética de pesos pós-desmama. Em avaliações genéticas para a característica de peso adulto, o emprego de modelos de repetibilidade, considerando pesos a partir de 3 anos de idade, seria o mais adequado em relação à utilização de medida única...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Weight records of Nelore cattle from birth to mature age were analyzed using univariate, bivariate, multivariate and random regression models. Records of Nelore cattle born from 1975 to 2002, from 8 herds participating in the Nelore Cattle Breeding Program (NCBP) were used. The weights were obtained from birth to 8 years of age. Weights at birth, weaning, yearling, 18 months and 2, 3 and 5 years of age were analyzed using univariate, bivariate and multivariate models. Also, as indicative of the mature weight, the weight closest to 4.5 years of age, was analyzed considering only one record or repeated records obtained from 2, 3 and 4 years of age. For random regression models age of cow varied from birth to 8 years. Direct and maternal genetic and, animal and maternal permanent environmental variances were modeled by random regression on Legendre polynomials of age at recording, with order of fit from 3 to 6 and a total of 8 models. Residual variances were modeled by a step function with 1 or 5 classes. The multivariate model including weight records at weaning and at selection age is the most indicated for genetic evaluation of pos-weaning weights. For genetic evaluation of mature weight to use repeated records obtained from 3 years of age is better than only one record per animal. The random regression models were able to model changes of variances with age adequately, with parameter estimates similar to those obtained by multivariate analyses. The model with direct and maternal genetic effects, animal and maternal permanent environmental effects ajusted by quartic, cubic, sixth and cubic polynomials, respectively, and residual variances modeled by 5 classes, was the most adequate to describe the covariance structure of the data...(Complete abstract, click electronic access below) / Orientadora: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientadora: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Mestre
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Estimação dos parâmetros genéticos do peso adulto em matrizes da raça Nelore / Genetic parameters estimation for mature weight in Nelore beef cattle

Victor Breno Pedrosa 07 December 2006 (has links)
O estudo das características produtivas visa a obtenção de animais possuidores de genótipos com potencial para altas produções mas que sejam também adaptados ao meio ambiente de criação extensiva no Brasil. Esses animais produtivos e adaptados poderiam otimizar os custos, tornando assim, sua criação sustentável em escala comercial. Apesar das características reprodutivas serem de extrema importância como objetivo de seleção, sua utilização não tem sido ampla em programas de melhoramento genético por serem consideradas de baixa herdabilidade. Entre as características produtivas existentes em bovinos de corte pode ser citada a caracterítica de peso adulto, que deve ser avaliado e monitorado o aumento do tamanho das fêmeas pela resposta indireta a seleção para peso, afim de confrontar os resultados economicamente. Dentro deste contexto foram avaliados dados de 74.547 animais com o objetivo de analisar o peso adulto e o peso adulto com repetibilidade (PAVr) em animais Nelore estimando a herdabilidade de características de desenvolvimento ponderal, utilizando modelos lineares; Estimar a correlação entre peso adulto (PAV) e características de peso ao sobreano (PS), conformação (CONF), precocidade (PREC), musculosidade (MUSC) e altura de garupa (AG); Determinar se há ou não vantagem em incluir o peso adulto em programas de seleção na raça Nelore. Os componentes de variância e de covariância foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (MTDFREML) utilizando-se o modelo animal. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram de 0,43 para PAV e 0,41 para PAVr; 0,38 para PS; 0,23 para CONF; 0,19 para PREC; 0,22 para MUSC e 0,35 para AG. Os coeficientes de correlação genética obtidos variaram de 0,37 a 0,97. Os resultados sugerem que ganhos genéticos podem ser obtidos com a seleção para a característica de peso adulto, em monitoramento do tamanho de fêmeas na raça Nelore. A correlação entre as característica em estudo demonstra haver uma tendência de alteração das características de tamanho a partir da seleção para peso adulto. / The study of the productive traits aims the obtention of animals that have genotypes with potencial for high productions but that are also adaptable to the environment of the extensive creation in Brazil. These productive and adaptable animals could improve the costs, making therefore, their creation sustainable on a commercial scale. Although the reproductive characteristics have an extremely importance as an objective of the selection, its utilization have not been ample in genetic improvement programs for being considered as a low heritability trait. Between the productive traits existent in beef cattle it can be cited the mature weight trait, that must be evaluated and monitorated for the size increase control of the females by the indirect answer to weight selection, in order to confront, economically, the results. In this context it was evaluated data from 74.547 animals with the objective of analyze the mature weight and the adult weight with repeated measurements (MWr) in Nelore animals estimating the heritability of the ponderal development traits, using linear models; Estimate the correlation between mature weight (MW) and the post-weaning weight trait (PW), conformation (CONF), precocity (PREC), musculature (MUSC) and hip height (HH); Determine if there is an advantage in the inclusion of the mature weight in selection programs of the Nelore breed. The components of variance and covariance were estimated by the method of Restricted Maximum Likelihood Multiple Trait Derivative Free (MTDFREML) using the animal model. The estimation of the heritability coefficients were 0,43 for MW and 0,41 for MWr; 0,38 for PW; 0,23 for CONF; 0,19 for PREC; 0,22 for MUSC and 0,35 for HH. The genetic correlation coefficients varied from 0,37 to 0,97. The results suggest that genetic gains can be obtained with the selection for the mature weight characteristic, with the monitoration of the female sizes for Nelore breed. The correlation between the characteristics in study shows that there is a tendency for alteration in size characteristics through the selection for mature weight.
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Estimativas de (co) varância genética de pesos do nascimento até a maturidade em rebanhos da raça Nelore usando modelos de regressão aleatória e de características múltiplas

Boligon, Arione Augusti [UNESP] 25 February 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-25Bitstream added on 2014-06-13T19:33:22Z : No. of bitstreams: 1 boligon_aa_me_jabo.pdf: 786716 bytes, checksum: 55a12f5a16a7a8f8acd0c213b48d9308 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Nelore por meio de análises uni, bi e multicaracterísticas e modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais nascidos de 1975 e 2002, provenientes de 8 fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). Os pesos foram obtidos do nascimento aos 8 anos de idade. Nas análises uni, bi e multicaracterísticas foram utilizados pesos em idades padrão como nascimento, desmama, ano, sobreano e aos 2, 3 e 5 anos de idade. Também foram realizadas análises utilizando o peso mais próximo aos 4,5 anos de idade como indicativo de peso adulto, considerando uma única medida a partir de 2, 3 e 4 anos de idade ou como registros repetidos de pesos a partir dessas mesmas idades. Nas análises de regressão aleatória, foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento aos 8 anos de idade, considerando como variáveis independentes polinômios de Legendre da idade na data da pesagem. A variância residual foi modelada por meio de classes variando de 1 a 5. Foram utilizados 8 modelos de coeficientes de regressão aleatória para os efeitos direto e materno de animal, e de ambiente permanente de animal e materno. O modelo multicaracterística, incluindo registros de pesos ao desmame e à seleção é o mais indicado para a avaliação genética de pesos pós-desmama. Em avaliações genéticas para a característica de peso adulto, o emprego de modelos de repetibilidade, considerando pesos a partir de 3 anos de idade, seria o mais adequado em relação à utilização de medida única... / Weight records of Nelore cattle from birth to mature age were analyzed using univariate, bivariate, multivariate and random regression models. Records of Nelore cattle born from 1975 to 2002, from 8 herds participating in the Nelore Cattle Breeding Program (NCBP) were used. The weights were obtained from birth to 8 years of age. Weights at birth, weaning, yearling, 18 months and 2, 3 and 5 years of age were analyzed using univariate, bivariate and multivariate models. Also, as indicative of the mature weight, the weight closest to 4.5 years of age, was analyzed considering only one record or repeated records obtained from 2, 3 and 4 years of age. For random regression models age of cow varied from birth to 8 years. Direct and maternal genetic and, animal and maternal permanent environmental variances were modeled by random regression on Legendre polynomials of age at recording, with order of fit from 3 to 6 and a total of 8 models. Residual variances were modeled by a step function with 1 or 5 classes. The multivariate model including weight records at weaning and at selection age is the most indicated for genetic evaluation of pos-weaning weights. For genetic evaluation of mature weight to use repeated records obtained from 3 years of age is better than only one record per animal. The random regression models were able to model changes of variances with age adequately, with parameter estimates similar to those obtained by multivariate analyses. The model with direct and maternal genetic effects, animal and maternal permanent environmental effects ajusted by quartic, cubic, sixth and cubic polynomials, respectively, and residual variances modeled by 5 classes, was the most adequate to describe the covariance structure of the data...(Complete abstract, click electronic access below)

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