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Programa computacional para ajuste de curvas polinomiais em experimentos envolvendo dados longitudinais /

Oshiiwa, Marie, 1964- January 2005 (has links)
Orientador: Carlos Roberto Padovani / Banca: Carlos Roberto Padovani / Banca: Adalberto José Crocci / Banca: Jacinta Ludovico Zambotti / Banca: Luciano Soares de Souza / Banca: José Carlos Martinez / Resumo: O presente trabalho discutiu aspectos teóricos e práticos do comportamento da variável resposta nos diferentes grupos e condições de avaliação utilizando o Ajuste de Curvas de Crescimento, procedimento multivariado de análise de dados experimentais que possibilita fazer previsões sobre o comportamento médio da resposta para situações diferentes daquelas para as quais o estudo foi planejado, além de propiciar análise comparativa das curvas dos grupos de interesse. Considerando a dificuldade existente quanto a programas computacionais acessíveis a pesquisadores das áreas agronômicas, biológicas e da saúde, e a falta de entendimento da complexidade da estrutura de análise dos dados longitudinais, elaborou-se programa computacional em linguagem que permita ao usuário facilidade de manuseio, e torná-lo disponível, para pesquisadores das áreas aplicadas e, finalmente, discutir as vantagens do procedimento multivariado na preservação da estrutura de dependência dos dados em relação aos procedimentos convencionais utilizados na experimentação agronômica. / Abstract: The purpose of the present paper is to discuss theoretical and practical aspects of the behavior of response variables in different groups and evaluation conditions by using Growth Curves methodology. This methodology refers to a multivariate procedure of experimental data analysis that makes forecasts about the average behavior of the response variable for different situations from that for which the study was planned. In additien, the methodology enables comparative analysis of the curves between each of the experimental groups. Considering the lack of easy-use computer programs for researchers in the agronomical, biological and health fields, and the difficulty to understand the complexity of the data structure in longitudinal studies, a computer program will be proposed and written using high level language. The software will be of simple handling, easy access to researchers of applied areas and available. This work will also discuss the advantages of using the multivariate procedure of analysis compared to the conventional procedures commonly used in agronomic experimentation, related to the preservation of the structure of data dependence. / Doutor
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Características do crescimento corporal, dos órgãos e tecidos de duas linhagens comerciais de frangos de corte /

Marcato, Simara Márcia. January 2007 (has links)
Orientador: Nilva Kazue Sakomura / Banca: Elisabeth Gonzales / Banca: Renato Luis Furlan / Banca: Alice Eiko Murakami / Banca: Francisco Ernesto Moreno Bernal / Resumo: Com objetivo determinar os parâmetros de crescimento do peso vivo e da ave depenada, das penas e componentes químicos corporais, das partes, dos órgãos e tecidos de frangos de corte, machos e fêmeas das linhagens Ross e Cobb, foram utilizados 1920 pintos criados em galpão alojados em boxes. O delineamento foi inteiramente casualizado em esquema fatorial 2x2 (linhagens e sexo), 4 repetições de 120 aves cada. Foi avaliado o crescimento das aves depenadas e das penas, das partes e dos órgãos, dos músculos, ossos e peles. Foram realizados abates semanais até 56 dias de idade, após jejum de 24 horas. As aves foram pesadas para obtenção do peso de jejum, um grupo de aves foram depenados para obter o peso de penas, e as demais aves foram evisceradas e realizadas os cortes para avaliação do desenvolvimento das partes e órgãos. Após, foram pesadas, identificadas e congeladas. Posteriormente, as amostras foram moídas, liofilizadas e encaminhadas para análises de matéria seca, nitrogênio, extrato etéreo e cinzas. Foram elaboradas curvas e taxas de crescimento através da equação de Gompertz. As aves Cobb foram mais precoces no crescimento e deposição de proteína e cinzas corporais, na deposição de proteína, gordura e água das penas, na taxa de crescimento e deposição de nutrientes da coxa, dorso, cabeça, proventrículo e no crescimento do intestino. As aves Ross apresentaram maior potencial de crescimento de asa, pescoço, sobrecoxa e pés, e foram mais precoces no crescimento das penas, do fígado e deposição de água e cinzas no fígado. Houve semelhança entre as linhagens para peso do músculo, crescimento e deposição de nutrientes para o peito e coração e no peso e proteína dos ossos. / Abstract: The objective of this study was determine the growth parameters of the live weight, of feathers, of parts, organs and tissues and body chemical components strains chickens, males and females Cobb and Ross broilers. Were used 1920 chicks raised in boxes from 1 to 56 days of age, distributed randomly in a factorial model (2 strains x 2 sex), with 4 replicate pens of 120 birds. The birds were fed ad libitum with diets formulated according to requirements for each age phase. The birds were weight and four birds of each group were slaughtered weekly. Afther 24 hours of fasting, the birds were slaughtered to determined body, parts, organs, tissues weight and nutrients deposition. Thereafther, samples were freeze-fried to be analized for dry matter, protein, ash and fat. The parameters of weight and in nutrient depositions obtained weekly were adjusted by the Gompertz equation in order to estimate the growth parameters Wt= Wm exp(-exp(-B(t-t))). The growth and body nutrients deposition rates were determined by derived of the equations. Cobb broilers were more precocious in growth and of body protein and ash deposition than Ross. The deposition of protein, fat and water feather, in growth rate and depositions of nutrients in the thigh, dorsum, head and proventriculum and intestine were higher compared to Ross. The of Ross boilers was bigger than Cobb wing, neck, drumstick and feet growth potential. The Ross strains were more precocious in the growth of leg, liver and depositions of water and ash in the liver. The strains had similarity growth potencial of muscle and nutrients deposition in the breast, heart and bones. / Doutor
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Estimativas de (co) varância genética de pesos do nascimento até a maturidade em rebanhos da raça Nelore usando modelos de regressão aleatória e de características múltiplas /

Boligon, Arione Augusti. January 2008 (has links)
Resumo: Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Nelore por meio de análises uni, bi e multicaracterísticas e modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais nascidos de 1975 e 2002, provenientes de 8 fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). Os pesos foram obtidos do nascimento aos 8 anos de idade. Nas análises uni, bi e multicaracterísticas foram utilizados pesos em idades padrão como nascimento, desmama, ano, sobreano e aos 2, 3 e 5 anos de idade. Também foram realizadas análises utilizando o peso mais próximo aos 4,5 anos de idade como indicativo de peso adulto, considerando uma única medida a partir de 2, 3 e 4 anos de idade ou como registros repetidos de pesos a partir dessas mesmas idades. Nas análises de regressão aleatória, foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento aos 8 anos de idade, considerando como variáveis independentes polinômios de Legendre da idade na data da pesagem. A variância residual foi modelada por meio de classes variando de 1 a 5. Foram utilizados 8 modelos de coeficientes de regressão aleatória para os efeitos direto e materno de animal, e de ambiente permanente de animal e materno. O modelo multicaracterística, incluindo registros de pesos ao desmame e à seleção é o mais indicado para a avaliação genética de pesos pós-desmama. Em avaliações genéticas para a característica de peso adulto, o emprego de modelos de repetibilidade, considerando pesos a partir de 3 anos de idade, seria o mais adequado em relação à utilização de medida única...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Weight records of Nelore cattle from birth to mature age were analyzed using univariate, bivariate, multivariate and random regression models. Records of Nelore cattle born from 1975 to 2002, from 8 herds participating in the Nelore Cattle Breeding Program (NCBP) were used. The weights were obtained from birth to 8 years of age. Weights at birth, weaning, yearling, 18 months and 2, 3 and 5 years of age were analyzed using univariate, bivariate and multivariate models. Also, as indicative of the mature weight, the weight closest to 4.5 years of age, was analyzed considering only one record or repeated records obtained from 2, 3 and 4 years of age. For random regression models age of cow varied from birth to 8 years. Direct and maternal genetic and, animal and maternal permanent environmental variances were modeled by random regression on Legendre polynomials of age at recording, with order of fit from 3 to 6 and a total of 8 models. Residual variances were modeled by a step function with 1 or 5 classes. The multivariate model including weight records at weaning and at selection age is the most indicated for genetic evaluation of pos-weaning weights. For genetic evaluation of mature weight to use repeated records obtained from 3 years of age is better than only one record per animal. The random regression models were able to model changes of variances with age adequately, with parameter estimates similar to those obtained by multivariate analyses. The model with direct and maternal genetic effects, animal and maternal permanent environmental effects ajusted by quartic, cubic, sixth and cubic polynomials, respectively, and residual variances modeled by 5 classes, was the most adequate to describe the covariance structure of the data...(Complete abstract, click electronic access below) / Orientadora: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientadora: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Mestre
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Estimação de parâmetros genéticos para características de crescimento em bovinos da raça Canchim com modelos de dimensão finita e infinita /

Baldi Rey, Fernando Sebastián. January 2008 (has links)
Resumo: Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Canchim por meio de análises uni, bi e multicaracterística, e por modelos de regressão aleatória. Os dados analisados são provenientes do rebanho da raça Canchim da Embrapa Pecuária Sudeste, localizada no município de São Carlos, São Paulo. Os pesos foram obtidos do nascimento até os nove anos e meio de idade. Nas análises uni, bi e multicaracterística foram utilizados pesos em ao nascimento, desmama, 12, 18, 24 e 30 meses de idade e, na idade adulta. Na análise unicaracterística foram utilizados quatro modelos, em que, diferentes efeitos aleatórios (efeito genético materno e de ambiente permanente materno) foram adicionados em seqüência. Nas análises de regressão aleatória, foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento até os nove anos e meio de idade, considerando como funções base polinômios de Legendre e funções "b-splines". A variância residual foi modelada utilizando 1, 4, 11 e 19 classes. Foram utilizados 12 modelos de regressão aleatória sobre polinômios de Legendre de segunda à sétima ordem para modelar a trajetória da variância dos efeitos genético aditivo direto e aditivo materno e de ambiente permanente direto e materno. Vinte modelos de regressão aleatória sobre funções "bsplines" foram considerados, empregando polinômios linear, quadrático e cúbico para cada segmento individual. Polinômios do mesmo grau foram considerados no modelo para todos os efeitos aleatórios. Até sete segmentos foram utilizados para os efeitos genético direto e de ambiente permanente do animal. Para os efeitos genético aditivo materno e de ambiente permanente materno foi utilizado um único segmento com dois nós nos extremos da curva Os efeitos maternos influenciam os pesos do nascimento aos dois anos de idade sendo o peso à desmama... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Genetic parameters were estimated for weights taken from birth to mature age in Canchim (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) cattle of breed by one, two and multitrait analyses and by random regression models. The data analyzed were from a herd of Canchim beef cattle belonging to Embrapa's Southeast Cattle Research Center, located in São Carlos county, state of São Paulo. Weights were taken from birth to nine and half years of age. Weights at birth, weaning, 12, 18, 24 and 30 months of age and at mature age were analyzed using one, two and multitrait models. In onetrait analyses, four models were tested, in which different random effects (genetic and environment permanent maternal effects) were added. For random regression models age of cow varied from birth to 3.542 days of age. Legendre polynomials and b-splines functions of age at recording were used as basis functions in random regression models. Residual variances were modeled by a step function with 1, 4, 11 and 19 classes. A total of 12 random regression models using Legendre polynomials as basis functions, from second to seventh order, were used to model direct and maternal genetic effects, animal and maternal permanent environmental effects. A total of twenty analyses, considering linear, quadratic and cubic b-splines functions and up to nine knots, were carried out. Spline functions of the same order were considered for all random effects. Maternal effects influenced weights from birth until two years of age, being weaning weight the most affected by maternal effects. Direct heritabilities obtained by twotrait and multitrait analyses were higher than estimates obtained from onetrait analyses. In order to estimate genetic parameters for weights after selection it is important to consider weights before selection and the multitrait analyses is the most adequate. The model with direct and maternal genetic effects, animal and maternal... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientadora: Lúcia Galvão de Albuquerque / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Doutor
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Estudo de modelos não-lineares na descrição do crescimento de fêmeas da raça Canchim /

Gaviolli, Vanessa Rejane Nogueira. January 2010 (has links)
Resumo: Os objetivos deste trabalho foram identificar as funções matemáticas que melhor se ajustam para descrever o crescimento de fêmeas da raça Canchim e do grupo genético MA (filhos de touros da raça Charolesa e vacas ½ Canchim + ½ Nelore), e estimar a herdabilidade dos parâmetros A e k da curva que melhor se ajustou aos dados e a correlação genética desses com a idade (IPP) e o peso (PPP) ao primeiro parto e idade (ISP) e peso (PSP) ao segundo parto. As funções não lineares Brody, Richards, Von Bertalanffy e duas alternativas de Gompertz e de Logístico foram ajustadas pelo método de Gauss Newton e procedimento NLIN do SAS, a dados peso-idade de 1.923 bovinos da raça Canchim e MA, nascidos de 1972 a 2006, com pesagens no mínimo até os 37 meses de idade e no máximo até os 100 meses de idade e com pelo menos sete pesagens. A comparação entre os modelos foi realizada com base na interpretação biológica dos parâmetros e nos avaliadores de qualidade de ajuste. A estimação dos parâmetros genéticos foi feita pelo método da máxima verossimilhança restrita, utilizando análises uni e bicaracterísticas com modelos que incluíram o efeito fixo de grupo de contemporâneos e o efeito aleatório aditivo direto. Os modelos Brody e Von Bertalanffy ajustaram aos dados peso-idade, enquanto que os demais não convergiram, sendo que o modelo Brody foi escolhido para a obtenção dos parâmetros A e k de cada animal. As estimativas de herdabilidade obtidas foram 0,32 ± 0,05; 0,12 ± 0,04; 0,12 ± 0,04; 0,43 ± 0,06; 0,19 ± 0,06 e 0,44 ± 0,06, para A, k, IPP, PPP, ISP e PSP, respectivamente. Estes resultados sugerem que é possível, mas difícil obter mudanças na curva de crescimento dos animais pela seleção. As estimativas de correlação genética dos parâmetros A e k com as idades e os pesos aos partos sugerem que a seleção para modificar A deve provocar mudanças no ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objectives in this study were to identify the mathematical function that best fits the growth of Canchim and MA (offspring of Charolais bulls and ½ Canchim + ½ Nelore cows) females, and to estimate the heritability of parameters A and k of the function that best fitted the data and the genetic correlations of these parameters with age (IPP) and weight (PPP) at first calving and age (ISP) and weight (PSP) at second calving. Brody, Richards, Von Bertalanffy and two alternatives of Gompertz and of Logistic non-linear models were fitted by Gauss Newton method and NLIN procedure of SAS. Weight-age data of 1,923 females born from 1972 to 2006, with weighing at least at 37 months of age and at most at 100 months of age, and with at least seven weighing were used. The comparison between the models was based on the biological interpretation of parameters and measures of quality of adjustment. The genetic parameters were estimated by the restricted maximum likelihood method using one and two-trait analyses with animal models that included the fixed effect of contemporary group and the random additive direct effect. The Brody and the Von Bertalanffy models adjusted the weight-age data well, while the others did not converge, and the Brody function was chosen to obtain the parameters A and k of each animal. The heritability estimates were 0.32 ± 0.05, 0.12 ± 0.04, 0.12 ± 0.04, 0.43 ± 0.06, 0.19 ± 0.06 and 0.44 ± 0.06 for A, k, IPP, PPP, ISP and PSP were, respectively. These values suggest that it is possible, but difficult to obtain changes in the pattern of the growth curve of the animals by selection. Estimates of genetic correlation of parameters A and k with the other traits suggest that selection to change A should cause changes in the same direction in PPI, PPP, ISP and PSP, and that changes in k, if they occur, should also be followed by changes in the other traits, but in the opposite direction / Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientador: Alfredo Ribeiro de Freitas / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Lenira El Faro Zadra / Mestre

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