Orientador: Carlos Roberto Padovani / Banca: Carlos Roberto Padovani / Banca: Adalberto José Crocci / Banca: Jacinta Ludovico Zambotti / Banca: Luciano Soares de Souza / Banca: José Carlos Martinez / Resumo: O presente trabalho discutiu aspectos teóricos e práticos do comportamento da variável resposta nos diferentes grupos e condições de avaliação utilizando o Ajuste de Curvas de Crescimento, procedimento multivariado de análise de dados experimentais que possibilita fazer previsões sobre o comportamento médio da resposta para situações diferentes daquelas para as quais o estudo foi planejado, além de propiciar análise comparativa das curvas dos grupos de interesse. Considerando a dificuldade existente quanto a programas computacionais acessíveis a pesquisadores das áreas agronômicas, biológicas e da saúde, e a falta de entendimento da complexidade da estrutura de análise dos dados longitudinais, elaborou-se programa computacional em linguagem que permita ao usuário facilidade de manuseio, e torná-lo disponível, para pesquisadores das áreas aplicadas e, finalmente, discutir as vantagens do procedimento multivariado na preservação da estrutura de dependência dos dados em relação aos procedimentos convencionais utilizados na experimentação agronômica. / Abstract: The purpose of the present paper is to discuss theoretical and practical aspects of the behavior of response variables in different groups and evaluation conditions by using Growth Curves methodology. This methodology refers to a multivariate procedure of experimental data analysis that makes forecasts about the average behavior of the response variable for different situations from that for which the study was planned. In additien, the methodology enables comparative analysis of the curves between each of the experimental groups. Considering the lack of easy-use computer programs for researchers in the agronomical, biological and health fields, and the difficulty to understand the complexity of the data structure in longitudinal studies, a computer program will be proposed and written using high level language. The software will be of simple handling, easy access to researchers of applied areas and available. This work will also discuss the advantages of using the multivariate procedure of analysis compared to the conventional procedures commonly used in agronomic experimentation, related to the preservation of the structure of data dependence. / Doutor

Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Marcilio Dias Silveira da Mota / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Resumo: O Objetivo deste trabalho foi avaliar o valor adaptativo anual para possível utilização como critério de seleção para a eficiência reprodutiva de fêmeas da raça Nelore. Foram estudadas medidas de valor adaptativo do 4º ao 13º ano de permanência no rebanho de 21.610 fêmeas. Os valores adaptativos anuais foram calculados com base na capacidade de sobrevivência e no número de crias deixado ano após ano. O modelo de melhor ajuste aos dados, segundo os critérios adotados, foi o de 5ª ordem para a tendência média da população, 5ª ordem para o efeito genético aditivo direto e 3ª ordem para efeito de ambiente permanente de animal. O modelo heterogêneo com 10 classes foi o mais adequado na modelagem da das variâncias residuais. As herdabilidades para valor adaptativo anual aumentaram com a idade dos animais (0,05 a 0,55). As correlações entre os valores adaptativos em diferentes idades foram baixas nas idades menores e altas entre as idades adultas. A tendência genética para valor adaptativo anual foi realizada com base nos valores genéticos preditos referentes às medidas adaptativas do 4º (Pti4), 8º(Pti8) e 13º(Pti13) ano de idade. Como critério de comparação foram utilizadas as características idade ao primeiro parto (Ipp) e stayability (Stay). As associações entre os valores genéticos preditos das características foram feitas utilizando a correlação de Pearson e porcentagem de touros coincidentes. Estimativas de herdabilidade para Ipp, Stay1 e Stay2 foram respectivamente 0,12, 0,33 e 0,40. As tendências genéticas indicaram que houve ganhos para Pti4 e Pti13 e, para Pti8 as médias dos valores genéticos se mantiveram quase que constantes com o passar dos anos. As associações entre os valores genéticos indicaram maior associação entre valores genéticos preditos para valor adaptativo medido no 4º ano e valores genéticos preditos para as características Ipp e Stay / Abstract: The objective of this study was to evaluate the annual Fitness as selection criteria for reproductive performance of Nelore cows. We studied measures of fitness of the 4th to the 13th year of stayability of 21,610 females. The annual fitness was calculated based on survivability and the number of offspring left year after year. The most appropriate model, according to criteria adopted, was a 5th order for the average trend of the population, 5th order for the direct genetic effect and 3th order for the permanent environmental effect of animal. The heterogeneous model with 10 classes was the most appropriated in modeling of residual variances. Heritability estimates for annual fitness increased with age of animals (0.05 to 0.55). The correlations between fitness at ages different were lower in younger ages, and high among the adult ages. The genetic trend for annual fitness was based on predicted breeding values to adaptive measures relating to the 4th (Pti4), 8th (Pti8) and 13th (Pti13) years of age. As criterion for comparison were used the traits age at first calving (IPP) and stayability (Stay). The associations between predicted breeding values of traits were made using Pearson correlation and percentage of bulls coincide. Heritability estimates for Ipp, and Stay1 Stay2 were respectively 0.12, 0.33 and 0.40. The genetic trends indicated that there were gains for Pti4 and Pti13, however for Pti8, the average genetic values remained almost constant over the years. The associations between breeding values indicate greater association between breeding values for annual fitness measured in year 4th year and the breeding values for the traits Ipp and Stay / Mestre

Resumo: Considerando-se que a contagem de células somáticas (CCS) de amostras de leite é um valioso indicador da saúde do úbere de búfalas, foi desenvolvido este trabalho com o objetivo de estimar a relação existente entre a CCS e a produção de leite (PL). Foram analisadas informações de 9404 amostras de controles de CCS e PL, referentes a 2198 lactações de animais da raça Murrah com idades entre 2 e 15 anos, filhas de 187 reprodutores, que ocorreram entre os anos 1997 e 2005. Para quantificar as perdas de PL em relação à CCS, nas análises de variância para a variável PL, foram incluídos no modelo os efeitos fixos de fazenda, ordem e ano de parto e estação do parto o escore da contagem de células somáticas (ECCS) como covariável, o efeito de animal dentro da fazenda foi considerado como aleatório. Para a estimação de parâmetros genéticos para a CCS, utilizaram-se "test day models", a média da contagem de células somáticas na lactação (CCSt270) e a produção de leite aos 270 dias (PL270); os componentes de (co) variância foram estimados usando método de máxima verossimilhança restrita. A CCS de cada mês da lactação foi considerada como uma característica distinta, em análises uni e bicaracterísticas, o modelo incluiu como efeitos aleatórios, o genético aditivo direto e de ambiente permanente e residual. Além disso, foram considerados como efeitos fixos: grupo de contemporâneos, número de controle e idade da vaca ao parto como covariável (efeito linear e quadrático). Para a CCSt nos diferentes meses, os grupos de contemporâneos foram definidos como... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Considering that the somatic cells count (SCC) of samples of milk is a valuable indicator of the health of the buffaloes' udder, this work was developed with the objective of estimating the relationship between SCC and milk yield (MY). Information on 9404 SCC and MY controls were analyzed. Data contained 2198 lactations of Murrah animals aging between 2 and 15 years, daughters of 187 sires, from 1997 and 2005. To quantify the decreases of MY in relation to SCC, the analyses of variance for the variable MY, included in the model a random animal effect nested in farm and the fixed effects of farm, order and year of parity and season of parity, somatic cells count score (SCCE) as covariate. For estimating genetic parameters for SCC, "test day models" were used. For average of somatic cells count in the lactation (SCCt270) and milk yield to 270 days (MY270); the (co) variance components were estimated using Restricted Maximum Likelihood (MTDFREML). SCCs of every month of lactation were considered as different traits in single and double trait analyses. The model included genetic additive, permanent environmental (for SCCt270 and for MY270) and residual random effects. Other fixed effects were: contemporary group; control number and age of cow at parity as a covariate (linear and quadratic effects). For CCSt, contemporary groups were defined as flock-year-month of the control, and for SCCt270 and MY270 as herd-year- season of the parity. x It was found that all effects influenced the expression of SCCE. For first parity females, no relationship between MY and SCC was found. The results indicated that the largest decreases were observed in females with more than one parity. This category... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Humberto Tonhati / Coorientador: Lenira El Faro Zadra / Coorientador: Mario Fernando Ceron Munoz / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Vera Lúcia Cardoso / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Doutor

Resumo: Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Nelore por meio de análises uni, bi e multicaracterísticas e modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais nascidos de 1975 e 2002, provenientes de 8 fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). Os pesos foram obtidos do nascimento aos 8 anos de idade. Nas análises uni, bi e multicaracterísticas foram utilizados pesos em idades padrão como nascimento, desmama, ano, sobreano e aos 2, 3 e 5 anos de idade. Também foram realizadas análises utilizando o peso mais próximo aos 4,5 anos de idade como indicativo de peso adulto, considerando uma única medida a partir de 2, 3 e 4 anos de idade ou como registros repetidos de pesos a partir dessas mesmas idades. Nas análises de regressão aleatória, foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento aos 8 anos de idade, considerando como variáveis independentes polinômios de Legendre da idade na data da pesagem. A variância residual foi modelada por meio de classes variando de 1 a 5. Foram utilizados 8 modelos de coeficientes de regressão aleatória para os efeitos direto e materno de animal, e de ambiente permanente de animal e materno. O modelo multicaracterística, incluindo registros de pesos ao desmame e à seleção é o mais indicado para a avaliação genética de pesos pós-desmama. Em avaliações genéticas para a característica de peso adulto, o emprego de modelos de repetibilidade, considerando pesos a partir de 3 anos de idade, seria o mais adequado em relação à utilização de medida única...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Weight records of Nelore cattle from birth to mature age were analyzed using univariate, bivariate, multivariate and random regression models. Records of Nelore cattle born from 1975 to 2002, from 8 herds participating in the Nelore Cattle Breeding Program (NCBP) were used. The weights were obtained from birth to 8 years of age. Weights at birth, weaning, yearling, 18 months and 2, 3 and 5 years of age were analyzed using univariate, bivariate and multivariate models. Also, as indicative of the mature weight, the weight closest to 4.5 years of age, was analyzed considering only one record or repeated records obtained from 2, 3 and 4 years of age. For random regression models age of cow varied from birth to 8 years. Direct and maternal genetic and, animal and maternal permanent environmental variances were modeled by random regression on Legendre polynomials of age at recording, with order of fit from 3 to 6 and a total of 8 models. Residual variances were modeled by a step function with 1 or 5 classes. The multivariate model including weight records at weaning and at selection age is the most indicated for genetic evaluation of pos-weaning weights. For genetic evaluation of mature weight to use repeated records obtained from 3 years of age is better than only one record per animal. The random regression models were able to model changes of variances with age adequately, with parameter estimates similar to those obtained by multivariate analyses. The model with direct and maternal genetic effects, animal and maternal permanent environmental effects ajusted by quartic, cubic, sixth and cubic polynomials, respectively, and residual variances modeled by 5 classes, was the most adequate to describe the covariance structure of the data...(Complete abstract, click electronic access below) / Orientadora: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientadora: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Mestre

Resumo: Para o presente estudo foram utilizadas 3.202 primeiras lactações, de vacas da raça Holandesa pertencentes a quatro fazendas da região Sudeste, registradas semanalmente, com o objetivo de verificar a influência da estrutura de dados de produção de leite no decorrer da lactação, sobre os parâmetros genéticos estimados por modelos de regressão aleatória. Foram testados quatro arquivos contendo estruturas diferentes de dados. O arquivo de controles semanais (CS) contava com 122.842 controles, o arquivo mensal (CM) com 30.883 controles, o bimestral (CB) com 15.837 controles, e por fim, o arquivo de controles trimestrais (CT) continha de 12.702 controles. O modelo utilizado foi o de regressão aleatória, e como aleatórios foram considerados os efeitos genético aditivo e o de ambiente permanente de animal. A ordem das funções de covariância para estes dois efeitos foi de sexta ordem para efeito genético aditivo e de sétima ordem para o efeito de ambiente permanente, com variâncias residuais heterogêneas a estrutura de variâncias residuais foi modelada por meio de uma "step function" O modelo teve como efeito fixo os grupos de contemporâneos (GC) comuns para todos os arquivos de dados. Os GC foram compostos por fazenda, mês e ano do controle,e como co-variável a idade da vaca ao parto (regressão linear e quadrática) e o número de dias em lactação (regressão fixa para a média populacional). Todos os arquivos de dados estudados foram analisados incluindo arquivo de genealogia composto por 4.380 animais com 3202 mães e 228 touros. As estimativas de herdabilidades para produção de leite apresentaram tendências semelhantes entre os arquivos de dados analisados, com maior semelhança entre os bancos CS, CM e CB. As estimativas de herdabilidade para produção de leite no dia do controle (PLDC) do banco CT apresentou pequenas diferenças, em relação aos demais... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: To this study the first 1293 Holstein dairy lactation registered weekly were used, having cows belonging to four farms in the Southeast region of Brazil, aiming verify the milk production data structure influence during lactation under genetic parameters estimated by random regression models. Four files with different data structures were tested. The week control files (CS) counted with 122,842 controls; the month files (CM), 30,883 controls; the bimestrial (CB) had 15,837 controls and finally the quarterly (CT) had 12,702 controls. It was used the random regression model and, as random, the genetic additive and the animal permanent environmental effects were considered. The covariance function to these two effects was the sixth grade to the genetic effect additive and the seventh grade to the permanent environmental effect, having heterogeneous residual variances, and the residual variance structure was modeled by a "step function". The model had as the fixed effect the contemporaneous groups (GC) commons to all data set, GC were compounded by farm, month, and year of control. The co-variable was the cow age at birth (linear and quadratic regression) and the milking days (fixed regression to the population average). All evaluated data files presented genealogy file composed by 4,380 animals having 1,416 mothers and 228 bulls. The estimate of heritability presented tendencies similar among the analyzed data, having the higher similarity CS, CM and CB. The CT presented small differences in the estimate of heritability when compared to the others. The CB data file presented all the analyzed genetic parameters estimative with the same tendency and magnificence of the CS and CM, allowing the milk control in a CB structure, random regression model in genetic evaluations speaking. The genetic values (VG) to partial milking period production were predicted (MRA100, MRA200, MRA300 e MRA90_305) ...(Complete abstract click electronic access below) / Orientadora: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientadora: Lenira El Faro Zadra / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Claudia Cristina Paro de Paz / Doutor