Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-03-21Bitstream added on 2014-11-10T11:58:12Z : No. of bitstreams: 1 000794419.pdf: 812707 bytes, checksum: 88138b4662c10f708939f96f85e793e2 (MD5) / A eficiência de seleção pode ser ampliada para determinado caráter utilizando-se estimativas de parâmetros genéticos, que permitem identificar a natureza da ação dos genes envolvidos no controle dos caracteres e avaliar a eficiência de diferentes estratégias de melhoramento para a obtenção de ganhos genéticos. A análise de trilha é um dos métodos de se estimar a correlação, um parâmetro genético, e proporciona um conhecimento detalhado das influências dos caracteres envolvidos em um diagrama previamente estabelecido, justificando a existência de correlações positivas e negativas, de altas e baixas magnitudes entre os caracteres estudados. Assim, objetivou-se verificar a existência de variabilidade e correlação entre caracteres agronômicos e morfológicos em populações sintéticas de milho, visando seleção indireta. Foram utilizadas 13 populações sintéticas de milho, avaliadas em experimentos de campo em Jaboticabal-SP e Campo Alegre de Goiás-GO na safra de 2009/2010 e safrinha de 2010, utilizando-se o delineamento em blocos casualizados. Os caracteres considerados foram acamamento, quebramento, altura de plantas, altura de espiga, e produtividade de grãos. As 13 populações também foram semeadas em sacos plásticos de 1 kg sob sombrite, utilizando-se delineamento em blocos casualizados com nove repetições. Foi realizada avaliação das características morfológicas: matéria fresca de raiz, matéria seca de raiz, comprimento da raiz principal, diâmetro médio de raiz, área de superfície da raiz, densidade de tecido radicular e matéria seca da parte aérea. O caráter produtividade de grãos apresentou grande variabilidade genética, indicando ser eficiente se utilizado para seleção. A seleção sobre os caracteres morfológicos é mais indicada sobre matéria seca de raiz, devido à facilidade e precisão na obtenção dos dados, alta correlação ... / The efficiency of selection can be broadened for certain trait using estimates of genetic parameters, that allow to identify the nature of the action of the genes involved in the control of the traits and evaluate the efficiency of different breeding strategies to obtain genetic gains. Path analysis is one of the methods to estimate the correlation, a genetic parameter, and provides a detailed understanding of the influences of the traits involved in a diagram previously established, justifying the existence of positive and negative correlations, high and low magnitudes among the traits studied. Thus, this study aimed to verify the variability and correlation between agronomic and morphology traits in synthetic maize populations, in order to practice indirect selection. The 13 synthetic populations of maize were evaluated at field experiments in Jaboticabal-SP and Campo Alegre de Goiás-GO in regular season crop (2009/2010) and off-season crop (2010), using a randomized block design. The traits considered were lodging, culm breakage, plant height, ear height and grain yield. The 13 populations were also sown in 1 kg-plastic bags under black shade cloth, using a randomized complete block design with nine replications. Evaluation of the following morphological traits was performed: root fresh matter, root dry matter, main root length, average root diameter, root surface area, root tissue density and shoots dry matter. The trait grain yield exhibited great genetic variability, indicating to be effective if used for selection. The selection on the morphological traits is more indicated on root dry matter, due to the ease in obtaining data and its accuracy, high correlation with all morphological traits and association with grain yield. The simultaneous selection based on the traits root fresh matter and root dry matter, for gains in grain yield, can be performed. The highest direct effect on grain ...

Made available in DSpace on 2015-03-03T11:52:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-29Bitstream added on 2015-03-03T12:06:23Z : No. of bitstreams: 1 000811948_20160218.pdf: 119492 bytes, checksum: 1b8e70af25175908045fe43566b8c61d (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-18T10:00:24Z: 000811948_20160218.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-18T10:01:05Z : No. of bitstreams: 1 000811948.pdf: 619713 bytes, checksum: dc914320e284f5690f063a320e6781cd (MD5) / A soja é a oleaginosa mais importante cultivada no planeta. Dela são retirados inúmeros derivados, que compõem a alimentação humana e animal. Dentre os principais estão o farelo e o óleo que têm sua cotação influenciada pela razão demanda/produção no cenário mundial. Desde sua introdução no Brasil em 1882, a soja vem passando por um processo constante de melhoramento genético, o que permitiu que a cultura expandisse a área de cultivo que era basicamente a região Sul até a década de 70 para a região dos cerrados que corresponde ao Triângulo Mineiro, Mato Grosso do Sul, Mato Grosso, Goiás, Tocantins, sul do Maranhão, sul do Piauí e oeste da Bahia. Para um programa de melhoramento genético, a obtenção de estimativas de parâmetros genéticos é de grande importância, pois possibilita conhecer a magnitude dos efeitos que controlam o carácter além da possibilidade de predizer qual será o ganho com a seleção. O ganho genético para o melhorista tem grande importância, pois com os valores deste parâmetro pode-se efetuar alterações no critério seletivo adotado, visando adequar a população selecionada aos objetivos do programa de melhoramento. Avaliar as características agronômicas da soja e analisar todos os parâmetros ao mesmo tempo em função das informações coletadas durante o ensaio, se torna interessante quando o objetivo é selecionar genótipos superiores, uma vez que muitos fatores estão relacionados de maneira que seus diferentes efeitos são melhor interpretados se estudados em conjunto. A estatística multivariada permite identificar quais caracteres estão diretamente correlacionados com a produtividade de grãos e discriminar os genótipos levando em consideração a similaridade dos múltiplos caracteres avaliados, ajudando no processo seletivo. A análise, a descrição e a inferência são realizadas com base nas respostas simultâneas, valendo-se da estrutura de correlação ... / Soybean is the most important cultivated oilseed crop on the planet, it is extracted numerous derivatives that make up the human and animal food. Among the main ones are the bran and oil that have influence your quote according to the reason of demand and production on the world stage. Since its introduction in Brazil in 1882, the soybean has been undergoing a constant process of genetic breeding, which allowed the culture expand the area of cultivation which was basically South in the 70 years for the Cerrado region that corresponds to Triangulo Mineiro, Mato Grosso do Sul, Mato Grosso, Goias, Tocantins, Maranhao south, south west of Piaui and Bahia. For a breeding program, obtain estimates of genetic parameters is of great importance, as they allow to know the magnitude of the effects that control the character and the ability to forecast the gain with selection. The genetic gain for the breeder is very important, because with the values of this parameter can make changes to the selection criteria adopted in order to adjust the improved population for the objectives of the breeding program. Evaluate the agronomic characteristics of soybean and analyze all parameters at the same time in function on the information collected during the test becomes interesting when the goal is to select superior genotypes, since many factors are correlated so that their different effects are best interpreted if studied together. The Multivariate statistics allows to identify which characters are directly correlated with grain yield and discriminate the genotypes taking into account the similarity of multiple traits evaluated, helping in the selective process. The Analysis, description and inference are performed based on the simultaneous responses, taking advantage of the correlation structure between the variables. The objective of this study was to estimate genetic parameters in advanced soybean lines, identify characters directly and ...

Orientador: Maurício Dutra Zanotto / Coorientador: Fabiana Mota da Silva / Banca: Sérgio Gonçalves Dutra / Banca: Bárbara Panoff Valário / Banca: Antonio Orlando Di Mauro / Resumo: Em função de identificar potenciais parentais a serem utilizados por um programa de melhoramento visando alta qualidade fisiológica de sementes e boa produção de sementes, o objetivo do trabalho foi avaliar a diversidade fenotípica através de caracteres agronômicos que afetam a produção de sementes e o potencial fisiológico de 32 cultivares comerciais brasileiras de soja, possibilitando futura seleção das melhores cultivares para compor um programa de melhoramento genético direcionado ao Cerrado brasileiro. Foram avaliadas oito características fenotípicas e sete para qualidade fisiológica de sementes. As análises das características quantitativas foram conduzidas por técnicas de estatística multivariada e componentes principais. Para os testes de qualidade fisiológica de sementes, o delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado (DIC), os dados foram submetidos à análise de variância, ao teste F e teste Scott-Knott a 5% de significância. As cultivares AS 3797IPRO, AS 7307RR, CD 2728IPRO, CD 2820IPRO, TMG2181IPRO e TMG2183IPRO, foram selecionadas por obterem as melhores estimativas quanto à qualidade fisiológica de sementes, no entanto, não foram as que apresentaram as maiores produtividades. Sendo assim, as análises estatísticas utilizadas possibilitaram à diferenciação e agrupamento entre as cultivares comerciais estudadas para a diversidade fenotípica e o potencial fisiológico, possibilitando a escolha dos melhores genótipos quanto aos caracteres agronômic... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In order to identify characteristics that helps in the selection of superior genotypes to be used by a breeding program, aiming high physiological quality of seeds and good seed production, the main objective of this study was evaluate the phenotypic diversity through agronomic traits affecting seed production and the physiological potential of 32 Brazilian soybean cultivars, enabling future selection of the best cultivars to be part of a soybean breeding program directed to the Brazilian Savana. Eight agronomic traits and seven physiological quality seeds characteristics were evaluated. Analyzes of the quantitative features were conducted using multivariate statistical techniques and main components. For the seed physiological quality tests, the experimental design was completely randomized (DIC), the data were submitted to analysis of variance, F test and Scott-Knott test at 5% of significance. The cultivars AS 3797IPRO, AS 7307RR, CD 2728IPRO, CD 2820IPRO, TMG2181IPRO and TMG2183IPRO were selected for obtaining the best estimates regarding the physiological quality of seeds, however, they weren't those that presented the greatest seeds production. Therefore, the statistical analyzes allowed the differentiation and grouping between the commercial cultivars studied for the phenotypic diversity and the seeds physiological potential, allowing the selection of the best genotypes to the agronomic traits and seed quality judged of greater importance to selection in this experiment ... / Mestre

Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Roberto Carvalheiro / Banca: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Rúsbel Raúl Aspilcueta Borquis / Banca: Fernanda Brito / Banca: Fabyano Fonseca e Silva / Resumo: Esta tese compreende quatro diferentes estudos conduzidos a fim de avaliar estratégias alternativas para aumentar a eficiência de seleção genômica (GS) em programas de melhoramento animal. Um primeiro estudo foi desenvolvido com a finalidade de avaliar a performance preditiva de diferentes métodos estatísticos com base na informação de painéis de marcadores densamente distribuídos ao longo do genoma. Cinco diferentes características de uma população real de camundongos foram analisadas. Verificou-se que métodos com grandes diferenças conceituais apresentaram performance preditiva similar em algumas situações, também havendo variação na performance relativa dos métodos em função da característica analisada. O uso de diferentes variáveis resposta (pseudo-fenótipos) para estimação de efeitos de marcadores foi avaliado num segundo estudo, por meio da simulação de uma grande população de bovinos de corte, para a qual predições genômicas foram obtidas usando um procedimento de múltiplas etapas. Houve evidência de que provas desregredidas (dEBV) são mais apropriadas do que valores genéticos preditos (EBV) e médias ajustadas de desempenho da progênie (PYD), tanto para o treinamento de modelos quanto para a validação de predições genômicas. No terceiro estudo, procurou-se avaliar consequências em longo-prazo da aplicação de GS numa população de bovinos de corte sob seleção. Verificou-se grande benefício da aplicação de GS em cenários simulando seleção para características de qualidade de carne e reprodução de fêmeas. Houve evidência de que pode-se esperar maior benefício para GS, quando comparada à seleção por BLUP, no caso de características oligogênicas. Também foi possível inferir que em aplicações de GS, o uso de um critério de seleção em que se atribui maior peso a alelos favoráveis de menor frequência poderia proporcionar ... / Abstract: Improvements in production levels and product quality are needed in livestock systems to meet the growing world demand for animal-source foods. Besides this increasing demand, the productive sector must deal with constraints related to competition for land, greenhouse gas emissions and also due to hardening legislation in the fields of environment and animal welfare (FAO, 2011). In this context, animal breeding has played and will continue to play an important role to improve the efficiency of such production systems, especially in terms of competitiveness, safety, sustainability and biodiversity conservation (Harlizius et al., 2004). The main objective of animal breeding programs is to improve the performance of the next generations, through identification and reproduction of the animals with better genetic pool to efficiently produce in a specific environment (herein, superior animals). In the last decades, animal breeders succeeded in achieving this goal, mostly through the application of statistical tools grounded in quantitative genetics theory, what could be called as 'classical animal breeding'. In this case, the traditional prediction of the genetic merit of individuals (estimated breeding values, EBV) is obtained based on information of pedigree and phenotypes (own records and measures on relatives). With the advent of dense molecular marker panels, the implementation and design of breeding programs, especially in dairy cattle, had changed dramatically as a consequence of incorporating this new information to identify superior animals earlier and more precisely. Pioneer simulation studies drew attention of animal breeders to the possibility of making accurate predictions of the genetic merit of individuals by using genotypic information from dense marker panels, a process known as genomic selection (GS) (Nejati-Javaremi et al., 1997; Meuwissen et al., 2001). Other influential work ... / Doutor

Orientador: Ricardo da Fonseca / Banca: Leonardo de Oliveira Seno / Banca: Francisco Ribeiro de Araújo Neto / Banca: Fernando Sebastian Baldi Rey / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: Para o capítulo 2 o objetivo do trabalho foram avaliar a qualidade das predições de mérito genético entre os métodos BLUP e GBLUP na presença de imprecisão nos dados. Para o capítulo 3 o objetivo do trabalho foi comparar os métodos BLUP, GBLUP e BAYESR considerando ou não a interação genótipoambiente em ovinos multirraciais. Os dados utilizados para a realização do capítulo 2 foram simulados com três níveis de imprecisão nos dados fenotípicos, 0%, 25% e 50% em três características com magnitude de herdabilidade de 0,02, 0,15 e 0,30, respectivamente, as metodologias BLUP e GBLUP foram aplicadas nesse dados e seus desempenhos foram comparados. Para a comparação das metodologias os parâmetros de erro quadrático médio, variância do erro de predição, viés, acurácia e eficiência de seleção foram utilizados. Melhores resultados foram obtidos pelo método BLUP em relação ao método GBLUP. O método GBLUP não apresentou vantagem em relação ao método BLUP, exceto quando a magnitude da herdabilidade foi de 0,02 e não houve imprecisão nos dados fenotípicos. Para o capítulo 3 foram utilizados 4.288 fenótipos e genótipos de dois rebanhos núcleos de informação (Information Nucleus Flock) oriundos do Australian Sheep Cooperative Research Center program (CRC). Para acessar a acurácia das estimativas, foi utilizada a validação cruzada. Os métodos BLUP, GBLUP e BAYESR, foram utilizados para estimar os valores genéticos sob dois modelos, univariado, o qual não considera a interação genótipo-ambiente e o modelo bivariado com o efeito da interação é considerado. As acurácias dos modelos univariados variaram de 0,17 à 0,27 para o ambiente 1 e de 0,19 à 0,20 para o ambiente 2. As acurácias dos modelos bivariados variam de 0,14 à 0,23 para o ambiente 1 e para o ambiente 2 as acurácias foram de 0,19. Não houve benefício da aplicação da seleção genômica sobre o método BLUP no ambiente 2 para... / Abstract: In Chapter 2 the objective of the work was to evaluate the quality of the genetic merit of predictions between BLUP and GBLUP methods in the presence of uncertainty in the data. In chapter 3 the objective was to compare the BLUP methods, GBLUP and BAYESR considering whether or not to genotypeenvironment interaction in multi-racial sheep. The data used for the realization of Chapter 2 were simulated with three levels of inaccuracy in phenotypic data, 0%, 25% and 50% in three features with magnitude of heritability of 0.02, 0.15 and 0.30, respectively, the BLUP and GBLUP methodologies were applied this data and their performances were compared. To compare the methodologies the mean square error parameters, prediction error variance, bias, accuracy and selection efficiency were used. Better results were obtained by BLUP method over the GBLUP method. The GBLUP method showed no advantage over the BLUP method, except when the magnitude of heritability was 0.02 and there was no inaccuracy in phenotypic data. For chapter 3 we were used 4,288 phenotypes and genotypes dual-core herds of information (Information Nucleus Flock) coming from the Australian Sheep Cooperative Research Center program (CRC). To access the accuracy of the estimates, cross-validation was used. Methods BLUP, GBLUP and BAYESR, were used to estimate breeding values under two models, univariate, which does not consider the genotype-environment interaction and the bivariate model with the interaction effect is considered. The accuracies of the univariate models ranged from 0.17 to 0.27 for the environment 1 and 0.19 to 0.20 for the environment 2. The accuracies of bivariate models ranging from 0.14 to 0.23 for the environment 1 to the environment and the accuracies were 0.19. There was no benefit from the application of genomic selection on BLUP method in environment 2 for gastrointestinal resistance feature. On the other hand, for the application of 1 atmosphere genomic ... / Doutor

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Annaiza Braga Bignardi / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Ricardo Vieira Ventura / Banca: Luciana Correia de Almeida Regitano / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: Objetivou-se com este estudo realizar associação genômica ampla, visando detectar regiões cromossômicas associadas a características indicadoras de precocidade sexual de bovinos da raça Nelore, bem como avaliar metodologias para a predição de valores genômicos visando à seleção destas características. Foram utilizados dados de animais da raça Nelore, pertencentes a fazendas que integram os programas de melhoramento genético da DeltaGen® e Paint® (CRV Lagoa). As características associadas à precocidade sexual utilizadas neste estudo foram a idade ao primeiro parto (IPP), a ocorrência de prenhez precoce de novilhas (P16) e o perímetro escrotal (PE). Após o controle de qualidade e consistência dos dados fenotípicos, permaneceram para as análises informações de 68.170, 72.675 e 83.911 animais com fenótipo e de 1.738, 1.770 e 1.680 animais genotipados para IPP, P16 e PE, respectivamente, e 412.993 SNPs. No Capítulo 2, as estimativas dos efeitos dos SNPs foram obtidas utilizando-se a metodologia single-step (WssGBLUP). Todos os animais foram utilizados aplicando-se modelo animal unicaracterística para predizer os valores genéticos e, posteriormente, as soluções dos efeitos dos SNPs foram obtidas a partir destes valores genéticos. Foram identificadas as 10 janelas de 150 SNPs que capturaram a maior proporção da variância explicada pelos marcadores. As 10 janelas de maior efeito obtidas para a P16 estão localizadas nos cromossomos 5, 6, 7, 14, 18, 21 e 27 e somadas explicaram 7,91% da variância genética total. Para o PE, estas janelas estão nos cromossomos 4, 8, 11, 13, 14, 19, 22 e 23, explicando 6,78% da variância total. Com as análises de GWAS foi possível identificar regiões cromossômicas associadas com P16 e PE. A identificação dessas regiões possibilita o melhor entendimento e avaliação destas características, além de indicar genes candidatos para estudos futuros de investigação de... / Abstract: The objective of this study was to perform genome-wide association to detect chromosomal regions associated with indicator traits of sexual precocity of Nellore cattle, and evaluating methodologies for prediction of genomic values to use for selection of these traits. Data from Nellore animals belonging to farms integrating animal breeding programs of DeltaGen® and Paint® (CRV Lagoa), were used. Age at first calving (AFC), the occurrence of early pregnancy of heifers (EP) and scrotal circumference (SC) were used as traits associated with sexual precocity. After quality control and consistency of phenotypic data, information of 68,170; 72,675 and 83,911 animals with phenotype, and of 1,738; 1,770 and 1,680 genotypes for AFC, EP and SC, respectively, and 412,993 SNPs, remained for analysis. In chapter 2, the estimates of the SNP effects were obtained using the single-step method (WssGBLUP). All animals were used applying single trait animal model to predict the genetic values and, subsequently, the solutions of the SNP effects were obtained from these genetic values. The 10 windows of 150 SNPs that captured the greatest proportion of variance explained by markers were identified. The 10 windows with greater effect obtained for EP are located on chromosomes 5, 6, 7, 14, 18, 21 and 27 and together explained 7.91% of the total genetic variance. For SC, these windows are on chromosomes 4, 8, 11, 13, 14, 19, 22 and 23, explaining 6.78% of the total variance. With GWAS analysis it was possible to identify chromosomal regions associated with EP and SC. Identifying these regions enables better understanding and evaluation of these traits, besides indicating candidate genes for future research studies of causal mutations. In Chapter 3, two multi-step methods were used to estimate the marker effects - GBLUP and IBLASSO; besides the single-step method (ssGBLUP). Observed phenotype was used as the dependent variable to estimate the genomic value ... / Doutor

Orientador: Antônio Orlando Di Mauro / Coorientador: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Banca: Luís Fernando Alliprandini / Banca: Vanoli Fronza / Banca: Gustavo Vitti Moro / Banca: João Carlos de Oliveira / Resumo: Atualmente, a soja destaca-se como a mais importante oleaginosa cultivada no mundo. Os investimentos em pesquisa levaram à "tropicalização" da soja, permitindo, pela primeira vez na história, que o grão fosse plantado com sucesso, em regiões de baixas latitudes, entre o Trópico de Capricórnio e a linha do Equador. Em função disso tem-se buscado o desenvolvimento de genótipos com ampla adaptabilidade, o que implica em uma baixa interação genótipo x ambiente. O entendimento do tipo de interação permite um melhor posicionamento e indicação de regiões de plantio da cultivar em questão facilitando o trabalho do melhorista. A presença desse fenômeno pode acarretar uma redução da produtividade global de uma área para a qual se faça uma indicação geral de uma dada cultivar. Por outro lado, pode-se tirar proveito de sua existência usando-se procedimentos estatísticos que identifiquem o padrão dessa interação, e gerem informações que possibilitem o agrupamento de locais em zonas dentro das quais a magnitude da interação não seja significativa, permitindo indicações específicas de cultivares para tais zonas. O uso de ferramentas moleculares tem se apresentado como uma opção para seleção de características com base no genótipo e eliminando assim o efeito do ambiente na expressão da característica em questão. O melhoramento assistido por marcadores moleculares tem sido tema de inúmeros trabalhos de seleção assistida, cujos resultados variam de concretos e positivos a controversos e pouco significativos em termos de ganhos genéticos, econômicos e eficiência, quando comparados com a seleção fenotípica. Os capítulos seguintes permitem apresentar resultados de metodologias moleculares e convencionais aplicadas em um programa de melhoramento para seleção de genótipos superiores de soja. / Abstract: Nowadays, soybean highlights as the most important oilseed cultivated in the world. The investments in research led to soybean "tropicalization", allowing, for the first time in history, that the grain was seeded with success, in low latitudes, between the tropic of Capricorn and the Equator. Due to this, researchers have tried to develop wide adaptability genotypes, which implies in a low genotype x environment interaction. The comprehension of the type of interaction allows a better placement and indications of cultivar planting regions, facilitating the breeder's work. The presence of this phenomenon may result in a global productivity decrease of an area that make up an overall indication of a given cultivar. On the other hand, it is possible to take advantage of their existence using statistical procedures to identify the pattern of this interaction, and generate information that allow the grouping of local areas within which the magnitude of the interaction is not significant. Specific cultivar indication for these zones. The use o molecular tools have shown as an option for characteristics selection base on genotype and then eliminating the environment effect in the expression of the characteristic in question. The molecular marker-assisted breeding has been the subject of numerous works assisted selection, whose results varies from concrete and positive to controversial and little significant in terms of genetic gains, and economic efficiency compared to phenotypic selection. The following chapters present results provide molecular and conventional methodologies applied in a breeding program for superior genotypes selection. / Doutor

Orientador: Paulo Cezar Ceresini / Banca: Alcebíades Ribeiro Campos / Banca: Marco Antonio Basseto / Resumo: A brusone, causada por Pyricularia oryzae, é a doença mais importante do trigo em todo Centro-Sul do Brasil. Seu controle tem dependido, fortemente do uso de fungicidas estrobilurinas, inibidores de quinona oxidase, QoI. Resistência aos fungicidas QoI (QoI-R) já foram constatadas para diversos patossistemas em todo o mundo. Neste trabalho testou-se a hipótese principal de que as populações brasileiras de P. oryzae associadas com o trigo permanecem sensíveis aos fungicidas QoI. Em contraste, foi testada a hipótese alternativa de que o uso extensivo e consecutivo de fungicidas QoI nas duas últimas décadas para o manejo da brusone do trigo na região Centro-Sul do Brasil, levou à emergência e a distribuição generalizada de QoI-R em populações de P. oryzae associadas ao trigo nas principais áreas de cultivo do país. Determinou-se, também, se outras espécies de plantas poáceas adjacentes a campos de trigo hospedavam populações QoI-R de P. oryzae, servindo como um reservatório de inóculo do patógeno resistente. Os principais objetivos foram estudar a ocorrência e a distribuição da resistência aos fungicidas QoI em populações de P. oryzae associadas ao trigo e a outras espécies de plantas poáceas adjacentes a campos de trigo no Centro-Sul do Brasil, examinando as mutações no gene citocromo b (cyt b) e determinando a sensibilidade dos isolados de P. oryzae a azoxistrobina em experimentos in vitro. Foi analisada a distribuição generalizada de QoI-R em populações de P. oryzae em campos brasileiros de trigo de 325 isolados, dos quais 198 foram derivados de trigo e 91 de outras plantas poáceas amostradas nos mesmos campos de trigo, em 2012, e 36 isolados de trigo obtidos em 2005. O sequênciamento do gene cyt b distinguiu nove haplótipos, dois compartilhados entre trigo e outras plantas poáceas e sete exclusivos de outras plantas poáceas. Quatro desses haplótipos... / Abstract: Wheat blast disease caused by Pyricularia oryzae is the most important across central- southern Brazil. Its control has relied strongly on strobilurin fungicides (Quinone oxidase inhibitors, QoI). Resistance to QoI (QoI-R) has been reported for several pathosystems worldwide. In this study we tested the hypothesis that the main Brazilian populations of P. oryzae associated with wheat remain sensitive to QoI fungicides. In contrast, the alternative hypothesis that extensive and consecutive use of QoI fungicides in the last two decades for the management of wheat blast in the Center-South region of Brazil was tested, led to the emergence and widespread distribution QoI-R in populations P. oryzae associated with the wheat in the main growing areas of the country. It is determined also whether other species of grasses adjacent fields of wheat plants housed QoI R-populations of P. oryzae, serving as a resistant pathogen inoculum reservoir. The main objectives were to study the occurrence and distribution of resistance to QoI fungicides in P. oryzae populations associated with wheat and other species of plants grasses adjacent to wheat fields in South-Central Brazil, examining mutations in the cytochrome b gene (cyt b) and determining the sensitivity of the isolates of P. oryzae azoxystrobin in vitro experiments. In this study, we report the widespread distribution of QoI-R in populations of P. oryzae from Brazilian wheat fields of 325 isolates, of which 198 derived from wheat fields and 91 from weeds within wheat fields sampled in 2012, and 36 from wheat sampled in 2005. Sequencing of cytB gene distinguished nine haplotypes, two of which shared between wheat and weeds-derived isolates, and seven exclusive to weed isolates. Four of these haplotypes had the G143A mutation associated with resistance to QoI (QoI-R). While 90% of the wheat isolates of P. oryzae and 48% of the weed-derived ones sampled in 2012 ... / Mestre

Orientador: Antonio Orlando Di Mauro / Resumo: A utilização da abordagem Bayesiana pode permitir maior eficiência na aplicação de modelos complexos no melhoramento de plantas, tendo em vista a disponibilidade da computação com alto poder de processamento de dados. Objetivou-se neste estudo a obtenção de valores genéticos pela abordagem Bayesiana, comparando com a inferência frequentista (modelos mistos, lsmeans e médias aritméticas simples), em experimentos multiambientes na cultura da soja. Foram avaliadas 51 linhagens de soja e mais 4 testemunhas no delineamento em blocos casualizados em 6 ambientes com 3 repetições para a característica produtividade de grãos da soja kg.ha-1. Os parâmetros de interesse foram obtidos com o método de Monte Carlo via cadeias de Markov (MCMC) na obtenção de amostras da distribuição a posteriori conjunta. Como informação a priori foram utilizadas as distribuições half-normal a partir dos valores da variância de 18 genótipos de experimentos anteriores e relacionados, bem como a distribuição uniforme. Os valores genotípicos pela abordagem Bayesiana diferiram das médias com a inferência frequentista (modelos mistos, lsmeans e médias aritméticas simples), em experimentos multiambientes na cultura da soja, para os genótipos com alta e baixa produção de grãos. Para os demais casos os quatro métodos testados foram equivalentes. A abordagem Bayesiana com informações a priori derivadas de experimentos anteriores com soja pode ser utilizada nas análises no melhoramento genético dessa cultura. O métod... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Bayesian approach can allow higher efficiency in solving complex models in plant breeding especially with the availability of computing with high-powered data processing. This study aimed to obtain genetic values using Bayesian approach and to compare with frequentist inference (mixed models, lsmeans and simple arithmetic mean) to multienvironment trials in soybean. We evaluated 51 soybean lines and 4 more checks in a randomized complete block design in 6 environments with 3 replications to soybean grain yield kg.ha-1. The parameters of interest were obtained with the method of Monte Carlo Markov chains (MCMC) to obtain samples of the joint posterior distribution. As a priori information the half-normal distribution was used from the values of the variance of 18 genotypes from previous and related experiments as well as the uniform distribution. The genotypic values via Bayesian approach differed from the average with frequentist inference in multienvironment trials in soybean, for genotypes with high and low grain yield. In the other cases the four tested methods were equivalents. The Bayesian approach with priori information derived from previous experiments of soybean can be used in genetic breeding of this crop. The method of mixed models (REML/BLUP) showed slightly different values of means and genetic parameters of the Bayesian method to average heritability (h2mg), accuracy of genotypes selection (Acgen), coefficient of genetic variation (CVgi%) and coefficien... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Banca: Pedro Cesar dos Santos / Banca: Fernando Angelo Pioto / Resumo: A predição de ganhos genéticos em programas de melhoramento nem sempre é compatível com os observados na prática. Isso se deve principalmente à interação dos genótipos com os ambientes (G'A). O objetivo deste trabalho foi conhecer a variação genética, avaliar a significância da G'A e estudar simultaneamente a produtividade, estabilidade e adaptabilidade em cinco testes de progênies de Eucalyptus urophylla, localizados em Anhembi-SP, Itatinga-SP, Itamarandiba-MG, Uberaba-MG e Selvíria-MS. Os caracteres avaliados foram: altura de planta, diâmetro a altura do peito, volume de madeira e sobrevivência. Os parâmetros genéticos e componentes de variância foram obtidos pelo procedimento REML/BLUP e as metodologias MHPRVG (Média Harmônica da Performance Relativa dos Valores Genéticos) e AMMI (Additive Main effects and Multiplicative Interaction) foram utilizadas para estudo da produtividade, estabilidade e adaptabilidade. Os indivíduos apresentaram bom crescimento. Detectou-se variação genética para os caracteres e a interação G'A foi significativa. As metodologias permitiram identificar progênies produtivas, estáveis e adaptadas. Os parâmetros de MHVG, PRVG e MHPRVG foram eficientes como critérios para seleção de genótipos de E. urophylla e o modelo AMMI permitiu uma análise bastante visual do comportamento dos genótipos nos gráficos biplot's / Abstract: Prediction of genetic gains in breeding programs are not always compatible with those observed in practice and this is mainly due to the interaction of genotypes with environments (G'E). The aim of this study was to investigate the genetic variation, evaluate the significance of G'E and study the productivity , stability and adaptability simultaneously in five progeny trials of Eucalyptus urophylla, located at Anhembi-SP, Itatinga-SP, Itamarandiba-MG, Uberaba-MG and Selvíria-MS. The characters were: height, diameter at breast height, volume and survival. The genetic parameters and variance components were estimated by REML/BLUP procedure and methodologies HMRPGV (Harmonic Mean Relative Performance of Genetic Values) and AMMI (Additive Main effects and Multiplicative Interaction) were used to study the productivity, stability and adaptability. Individuals showed good growth. We detected genetic variation for characters and G'E interaction was significant. The methods allowed to identify productive, stable and adapted progenies. Parameters HMGV, RPGV and HMRPGV were efficient as standard for selection of genotypes of E. urophylla and the AMMI model allowed a very visual analysis of the behavior of genotypes in biplot's graphics / Mestre