Orientador: Iraê Amaral Guerrini / Coorientador: Léo Zimback / Banca: Dirceu Maximino Fernandes / Banca: Magali Ribeiro da Silva / Banca: Clarice Backes / Resumo: A cultura do eucalipto é de ampla distribuição mundial bem como no território nacional. A possibilidade de obtenção de genótipos superiores principalmente relacionado a questão nutricional, são os objetivos dos profissionais de melhoramento florestal. O uso de herbicidas proporcionou ganhos de produtividades para as culturas agrícolas, porém sua utilização direta e benéfica a uma espécie em questão, conhecido recentemente pelo termo hormese, pode ser associado a aplicação de reguladores vegetais. O herbicida 2,4-D possui este efeito e a utilização em uma cultura dicotiledônea e florestal, como a de Eucalyptus grandis, é o objetivo do presente trabalho, bem como mensurar parâmetros genéticos, utilizados em programas de melhoramento para a produção final de clones e na manutenção da variabilidade em futuros cruzamentos. O delineamento do experimento foram blocos ao acaso com 3 blocos de 20 progênies. As análises estatísticas foram teste t de Student, análise agrupamentos, análise de componentes principais scores e ranqueamento.Os nutrientes analisados foram: N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn e Zn. Os resultados demonstraram que houveram diferenças significativas nos nutrientes abordados, macro e micronutrientes bem como no principal caractere produtivo, matéria seca. P, B, Mn e K foram os nutrientes melhores correlacionados com matéria seca. Pela análise de variância de matéria seca as progênies 1, 18 e 17 foram as melhores, com herdabilidade de 0,89. As progênies 10, 15, 20 e ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The eucalyptus crop is widely distributed worldwide as well as in the national territory. The possibility of obtaining superior genotypes mainly related to nutritional question, are the objectives of professionals of forest improvement. The herbicides uses provided yield gains for agricultural crops, but their direct and beneficial use to a species in question, recently known by the term hormesis, may be associated with the application of growth regulators. The 2,4-D herbicide has this effect and has use in a dicotyledonous and forest crops, like Eucalyptus grandis, the aim of the present work is to measure genetic parameters, used in breeding programs to the final clones productions and the maintenance of variability in the future crossings. Statistical tests used were Student's t test, cluster analysis, principal component analysis scores and rank. The analyzed nutrients were: N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn. The results showed that there were significant differences between macro and micronutrients as well as in the main productive character, dry matter. P, B, Mn and K were the best nutrients correlated with dry matter. By the dry matter variance analysis progenies 1, 18 and 17 were the best, with a heritability of 0.89. Progenies 10, 15, 20 and two other groups would act to maintain future variability at future crosses. The best genetic correlations between dry matter and nutrients involved phosphorus, boron, manganese and potassium, in this respective order. Using the index ... / Doutor

Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.

O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos e fenotípicos para 21 características lineares de tipo bem como a pontuação final e as características de produção de leite (PL), gordura (PG) e proteína (PP) em rebanhos de bovinos leiteiros da raça holandesa no Brasil. Os 18,5 mil registros utilizados neste estudo foram coletados por técnicos da Associação Brasileira de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa entre os anos 1994 e 2004. As estimativas dos componentes de (co)variância e dos parâmetros genéticos e fenotípicos das características foram realizadas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivações por meio de modelos animal multicaráter. O processamento das análises com 22 características avaliadas simultaneamente foi realizado no Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho, São Paulo, através do ambiente operacional SGI Altix – 1350. As estimativas de herdabilidade para as características lineares de tipo variaram de 0,09 e 0,39 e para as PL, PG e PP variaram entre 0,17 e 0,24 indicando haver variabilidade genética aditiva suficiente para que ganhos genéticos moderados possam ser obtidos por seleção. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada, entretanto, as correlações genéticas variaram entre -0,44 e 0,85. As estimativas de correlações genéticas entre as características lineares de tipo com as características produtivas (PL, PG e PP) foram em geral de baixa magnitude. O antagonismo genético indesejável entre algumas características de tipo e produtivas deverá ser levado em consideração no momento da seleção, uma vez que a seleção para características produtivas pode levar à deteriorização de algumas características conformacionais. Quando o objetivo de seleção for melhorar as características lineares de tipo, a pontuação final poderá ser utilizada como critério de seleção por estar correlacionada geneticamente e de forma moderada com a maioria das características Entretanto, ao selecionar as vacas de maior pontuação final não se deve esperar aumento significativo no volume de PL, PG e PP, sendo a utilização de índices de seleção uma ferramenta indicada para o processo de seleção genética dos animais. / The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic parameters for 21 linear type traits over the final score and milk yield traits (MY), fat (FY) and protein (PP) in herds of Holstein dairy cattle in Brazil. The 18,500 records used in this study were collected by staff of the Brazilian Association of Cattle Breeders of Holstein between 1994 and 2004. Estimates of (co)variance and genetic and phenotypic parameters were determined by the method of maximum likelihood derivative-free restricted through multiple trait animal models. The analyses were processed in Sao Paulo through the operating environment SGI Altix - 1350 provided by the National Center for High Performance. The heritability estimates between linear type traits ranged between 0.09 and 0.39 and between PL, PG and PP between 0.17 and 0.24 indicating there sufficient genetic variability to obtain moderate genetic gains by selection. The phenotypic correlations between linear type traits were generally positive and of moderate magnitude, however, genetic correlations varied widely between -0.44 and 0.85 indicating that some could be excluded from the classification linear system currently adopted by the ABCBRH. Estimates of genetic correlations between linear type traits and yield traits (PL, PG and PP) were generally of low magnitude. The genetic antagonism between some type traits and yield should be taken into account at the time of selection, since, in many Brazilian herd, less productive cows are discarded. When the goal is to improve the selection of linear type traits the final score can be used as a selection tool to be genetically and correlated moderately with the most features, however, when the selection criterion is not the final score expect significant improvements in the characteristics of PL, PG and PP, with the use of selection indices indicated a tool for the process of genetic selection of animals.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Agroecossistemas. / Made available in DSpace on 2012-10-22T12:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 234075.pdf: 2570300 bytes, checksum: 8c27b0453f67f3f707a283607fcb7fef (MD5) / A região do Vale do Itajaí já foi uma das maiores produtoras de leite do Estado, chegando a ter uma média de produção de 2000 L/vaca/ano. A produção de leite a nível de Estado vem sofrendo incrementos, mas o número de produtores tem decaído ano após ano devido aos custos elevados de produção, principalmente pelo sistema produtivo utilizado. O melhoramento de pastagens apresenta-se como uma alternativa para a redução de desembolsos visando manter o agricultor na atividade. A produção de mudas em tubetes foi idealizada para maximizar o processo de melhoramento de pastagens com o objetivo de aumentar a velocidade de implantação e estabelecimento das leguminosas. O experimento foi implantado em uma pastagem de missioneira gigante (Axonopus catarinensis Valls), consistiu na comparação da implantação de mudas de leguminosas, maku (Lotus uliginosus Schkuhr) e amendoim forrageiro (Arachis pintoi Krapov & Gregory), produzidas em tubetes com a forma tradicional de implantação através de sementes. Os métodos de melhoramento foram avaliados através do estabelecimento das mudas e germinação das sementes a campo, percentual de sobrevivência a campo, composição botânica da pastagem, facilidade de implantação por agricultores. As mudas de maku apresentaram um maior percentual de estabelecimento e sobrevivência a campo comparado com os demais tratamentos obtendo um resultado de estabelecimento de 80,3 %, diferindo estatisticamente do tratamento maku semente. Os resultados obtidos nas avaliações de composição botânica nos métodos da transecta e do quadrado, foram respectivamente 3,7 % e 5,5 na média de notas ( as notas atribuídas variaram de zero a 100) para o tratamento maku introduzido via mudas sendo diferentes estatisticamente do tratamento maku introduzido via sementes, já método da freqüência amostral os resultados mostram a real situação do experimento . No desenvolvimento das leguminosas a campo, o maku via mudas teve o melhor desenvolvimento, em geral com 17,3 cm de diâmetro de touceira, sendo estatisticamente diferente dos demais tratamentos. Não houve diferenças estatísticas entre os tratamentos com amendoim forrageiro. Segundo os agricultores consultados, a metodologia de implantação reduz consideravelmente o trabalho de melhoramento, sendo o sacho um implemento multifuncional, podendo ser utilizado nas atividades hortícolas da propriedade. Com este método, são capazes de implantar mais de 3.000 mudas por dia. Os desembolsos com esta prática, quando não considerada a mão-de-obra de implantação, são menores do que o plantio direto de estolões. De forma geral, a espécie maku teve a tendência de ser melhor nas avaliações a campo devido ao seu hábito de crescimento e capacidade de competição com a grama missioneira gigante. Isso ocorre principalmente pelo fato da produção de mudas de maku em tubete ir a campo com um sistema radicular mais desenvolvido em relação ao método via sementes. Conclui-se, que os agricultores que utilizarem a produção de mudas de leguminosas em tubetes terão melhores resultados na redução de desembolsos. Há necessidade de mais avaliações ao longo do tempo, no mínimo 3 anos, os resultados são do ano de implantação. The area of Alto Vale do Itajaí was one of the largest producers of milk in the State of Santa Catarina, having an average production of 2000 L/Cow/Year. The milk production in the State is improving, but the number of producers has been declining year after year due to the high cost production, mainly because of the productive system. The improvement of pastures comes as an alternative to reduce the costs tryingto keep the farmer in this activity. The production of seedlings in test tubes was idealized to maximize the process of the pastures improvement with the objective to increase the speed implantation and establishment of the vegetables in the pasture. The experiment was developed in a pasture of missioneira gigante ( Axonopus catarinensis Valls), comparing the implantation of vegetables seedlings maku (Lotus uliginosus Schkuhr) and perennial peanut ( Arachis pintoi Krapov & Gregory), produced in test tubes with the traditional form of implantation through seeds. The methods of improvement were appraised through the establishment of the seedlings and germination of the seeds in the field, survival percentage in the field, botanical composition of the pasture and implantation facilities to the farmers. The maku seedlings presented the highest percentage of establishment and survival in the field comparing with the other treatments, obtaining a result of 80,3 %, differing statistically of the treatment of ther maku seed. The results obtained in the evalutions of botanical composition using the methods of transecta and the square, the result were 3,7 % and 5,5 % respectively in the average of notes (the attributed notes varied from zero to 100 %), for the treatment of the maku seed road seedling being different statistically of the treatment of maku implemented through seeds. However, the method of the amostral frequency show us the results of the real situation about the experiment. In the development of the vegetables in the field, the maku through seedlings had the best development, in general with 17,3 cm of diameter, being statistically different from the other treatments. There were not statistical differences among the treatments with perennial peanut. According to the consulted farmers, the implantation methodology reduces the work improvement considerably, being the #sacho# an multifunctional implement and could be used in the horticultural activities inn the property. With this method, they are able to implant more than 3.000 seedlings a day. The costs with this practice, when the implantation labor is not considered, are smaller than the direct planting of vegetable parts. In a general way, the species maku had the tendency of being better in the evaluations in the field due to its growth habit and competition capacity with the grass of missioneira gigante. That happens mainly for thje fact of the the production of vegetables seedlings in the test tubes will have better results inn the costs reduction. There is a necessity to have more evaluations along the time, at least 3 years, and these results are from one year of implantation.

Resumo não disponível

O êxito na seleção de plantas geneticamente superiores está diretamente relacionado à existência de variabilidade genética apresentada naturalmente ou artificialmente. No entanto, o melhoramento de espécies apomíticas é dificultado pela impossibilidade de ocorrer a união de gametas com plantas deste modo de reprodução. Por outro lado, a utilização de plantas sexuais compatíveis a cruzamentos com plantas apomíticas, podem gerar novas combinações gênicas e indivíduos com alta heterose podem ser selecionados já na primeira geração para lançamento como novas cultivares. A descoberta de plantas diplóides sexuais em populações naturais de Paspalum plicatulum e a posterior duplicação das mesmas possibilitaram um grande universo no desenvolvimento de novos genótipos a partir de cruzamentos entre espécies relacionadas. O objetivo do trabalho foi de: (i) avaliar a produção de forragem de genótipos nativos superiores de espécies do gênero Paspalum; (ii) caracterizar a estabilidade e adaptabilidade de produção destes genótipos; (iii) estimar através de técnicas da genética quantitativa, a herdabilidade e a associação entre caracteres de importância forrageira; (iv) obter variabilidade genética por meio de hibridizações interespecíficas, utilizando genótipos superiores nativos de P. lepton e de P. guenoarum como genitores masculinos (apomíticos) e um genótipo de P. plicatulum como genitor feminino (sexual); (v) analisar as progênies superiores quanto ao modo de reprodução selecionando plantas estáveis reprodutivamente para lançamento como cultivares e as de reprodução sexual para novos cruzamentos. Os genótipos das espécies de P. lepton e P. guenoarum apresentam variabilidade genética em caracteres de interesse forrageiro, bem como desempenho variável de acordo com o local e o ano de cultivo. A produção de matéria seca total e de folhas são os caracteres que mais contribuem para a detecção da variabilidade genética observada, independentemente do ano de avaliação. O ganho genético na produção de folhas se mostra eficiente via seleção indireta pela matéria seca total, caráter de alta herdabilidade e de mais fácil seleção e aferição. Houve ampla variabilidade nos caracteres ligados a produção de forragem e alguns híbridos apresentaram heterose para a maioria dos caracteres analisados. A maioria das progênies selecionadas apresentaram a apomixia como modo de reprodução, o que potencializa o lançamento como cultivar. Já as plantas sexuais superiores serão usadas para recombinação com os melhores híbridos para obtenção de novas constituições genéticas. Os dendrogramas obtidos em nível de campo e de DNA foram capazes de discriminar os genótipos e podem auxiliar na orientação em novas hibridizações com plantas sexuais compatíveis. Houve pouca variabilidade na composição química entre os genótipos. Mais estudos deverão ser realizados para viabilizar o desenvolvimento de cultivares no uso em pastagens naturais, assim como no emprego como pastagens cultivadas. / The successful selection of genetically superior plants is directly related to the existence of natural or artificial genetic variability. However, the breeding of apomictic species is hampered by the inability of the union of gametes with plants of this mode of reproduction. In another hand, the use of sexual plants compatible to crosses with apomictic plants can generate new genetic combinations, and individuals with high heterosis can be selected on the first generation and releasae as new cultivars. The discovery of sexual diploid plants in natural populations of Paspalum plicatulum and their subsequent duplication to do possible the development of new genotypes from crosses between closely related species. Thus, this study aimed to: (i) evaluate the forage yield of superior genotypes of native species of Paspalum, (ii) characterize the stability and adaptability of production of these genotypes; (iii) estimate using techniques of quantitative genetics, the heritability and its association between important forage characters; (iv) get a genetic variability through interspecific hybridization, using superior genotypes of native P. lepton and P. guenoarum as male parents (apomictic) and one genotype of P. plicatulum as female parent (sexual); (v) analyze the superior progenies to reproduction, selecting plants reproductively stable for releasing as cultivars and, of sexual reproduction for new crossings. The genotypes of the species P. lepton and P. guenoarum take a genetic variation in their traits of interest forage; furthermore, their performance depend of location and year of cultivation. The total dry matter production and leaf are the traits that most contribute to the detection of genetic variability, independent of the year of evaluation. The genetic gain in leaf production is efficient to indirect selection for total dry matter; this character present high heritability and, easier selection and estimation. There was wide variability in characters linked to forage production and some hybrids showed heterosis for most traits analyzed. Moreover, most of the selected progenies showed apomixis as reproductive mode, which enhances the release as cultivar. The sexual plants should be used for recombination with the best hybrids to get new genetic constitutions. The dendrograms obtained through field and DNA characteristics were able to discriminate genotypes and could help to get new sexual hybridizations with compatible plants. A little variability in chemical composition between genotypes was observed. Thus, more studies should be conducted to enable the development of cultivars to use on native rangelands, even as the employment as pastures.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:43Z : No. of bitstreams: 1 000857482.pdf: 1202216 bytes, checksum: 2f6b749b04bcfcd3b7645c54e8a516e7 (MD5) / Sendo uma planta originária das Américas, o cultivo de milho ocorre em todo território brasileiro, sendo que na maioria das regiões é realizado em duas épocas: primeira safra ou safra de verão e segunda safra ou safrinha. Embora o rendimento médio de milho no Brasil ainda seja considerado baixo em comparação com diversos países, tecnologias como o desenvolvimento de cultivares híbridas proporcionou aos produtores uma evolução considerável de rendimento. Entretanto, para que os níveis de rendimento possam continuar evoluindo gradativamente, o processo de obtenção de novas cultivares é continuamente executado pelos melhoristas. No caso do milho, os híbridos simples estão avançando rapidamente sobre os demais tipos de híbridos (triplos e duplos), em reconhecimento ao seu alto potencial de rendimento em cultivos tecnificados. O objetivo deste estudo foi identificar no final do processo completo da formação de híbridos, aqueles mais promissores e com características agronômicas de um híbrido moderno, entre 36 híbridos simples provenientes de linhagens de origem braquítica e de porte mais elevado. Os híbridos experimentais e mais seis testemunhas, foram avaliados em blocos casualizados com quatro repetições, na fazenda experimental da UNESP em Selvíria-MS em quatro épocas: primeira safra 2012/13 (primeira época), segunda safra 2012/2013 (segunda época), primeira safra 2013/14 (terceira época) e segunda safra 2013/2014 (quarta época). Foram avaliados os caracteres dias para florescimento feminino, altura de plantas, altura de espigas, comprimento de espigas, diâmetro de espigas, prolificidade, acamamento mais quebramento e rendimento de grãos. Para os híbridos comuns em todas as épocas, foi realizada uma análise de estabilidade e adaptabilidade de rendimento, pelo método de Herberhart e Russel (1966). Com base nas análises individuais e de estabilidade e... / Being a plant of the Americas, maize cultivation occurs throughout Brazil, and in most regions is carried out in two seasons: first crop or summer crop and second crop. Although the average of grain yield of maize in Brazil is still considered low, technologies such as the development of hybrid cultivars gave the producers a considerable increase of grain yield. However, so that grain yield can continue to evolve gradually, the process of obtaining new cultivars runs continuously by breeders. For maize, the single-cross hybrids are advancing rapidly over other types of hybrid (triple and double) in recognition of its high yield potential in technified crops. The objective of this study was to identify, at the end of the complete process of hybrids formation, those most promising and with agronomic characteristics of a modern hybrid, between 36 single-cross hybrids obtained from brachytic inbred lines and not brachytic inbred lines. The experimental hybrids and six checks were evaluated in a randomized block design with four replications, in Selvíria- MS in four seasons: 2012/13 first crop (season 1), 2012/2013 second crop (season 2), 2013/14 first crop (season 3) and 2013/2014 second crop (season 4). The evaluated traits were days to silking, plant height, ear height, ear length, ear diameter, prolificacy, lodged and broken plants and grain yield. For common hybrids in every season, an analysis of stability and adaptability for grain yield was carried out by the regression method of Heberhart and Rusell. Based on the individual and stability and adaptability analysis, there were identified the following hybrids with potential for evaluations in official testing for both first and second crop: IVF1-6/IVD1-3, 8F/9D, 8F/6D, IVF1- 5/IVD1-8, 5F/9D and 10F/9D. All showed good average for grain yield, stability and responded to the improvement of the environment, of which the first three are early. The ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-12-17Bitstream added on 2014-06-13T20:14:33Z : No. of bitstreams: 1 santoro_a_me_botib.pdf: 947565 bytes, checksum: 9b8b73aa8568ce2e4062e8221c067755 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Florestas de eucalipto no Brasil estão entre os ecossistemas mais produtivos do mundo. A madeira do eucalipto é principalmente utilizada pelas empresas de papel e celulose. Contudo, fatores abióticos e bióticos afetam a expansão dessas florestas. A disponibilidade de água é uma das maiores limitações para o desenvolvimento das espécies, afetando a produção de biomassa. O hormônio ácido abscísico (ABA) desencadeia respostas de resistência a estresses abióticos, em particular a seca. O objetivo deste trabalho foi identificar Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) no gene NCED (nove-cis-epoxicarotenóide dioxigenase), da rota biossintética do ácido abscísico (ABA), em Eucalyptus. Através da utilização da sequencia de aminoácido da enzima de Arabidopsis (AtNCED3) e do banco de dados de Expressed Sequence Tags (ESTs) de Eucalyptus foi possível o desenvolvimento de três oligonucleotídeos, os quais amplificaram a região desejada do gene. Então, primers específicos foram desenhados e os produtos de amplificação de diferentes indivíduos submetidos ao sequenciamento direto. O alinhamento e as análises das sequencias revelaram a ocorrência de sete SNPs no gene NCED, em uma região de 1230 pares de bases. A razão transição/transversão foi 1.33. Após a predição da proteína, no site Softberry e Expasy, foram verificados cinco SNPs presentes na região codificadora, os quais geraram mutações sinônimas. Através do software DnaSP, sete haplótipos foram encontrados na amostra de 65 indivíduos gerando 15 genótipos, distribuídos entre as espécies E. grandis, E. urophylla e no híbrido Urograndis. Para os sete sítios polimórficos foram desenhados conjuntos de primers específicos que permitirão a genotipagem em larga escala para estudos de genética de população e em programas de melhoramento assistido / Eucalyptus plantations in Brazil are among the most productive ecosystems in the world. The eucalyptus wood has its principal use in the paper and cellulose industry. However, abiotic and biotic factors affect the expansion of forest plantation. Water availability is the major limitation to development of species affecting biomass production. The plant hormone abscisic acid (ABA) triggers resistance responses to abiotic stresses, in particular to drought. The objective of this study was to identify Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) in nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase (NCED), enzyme of ABA biosynthetic pathway, in Eucalyptus. Through the utilization of amino acid sequence of this enzyme of Arabidopsis (AtNCED3) and using availability Expressed Sequence Tags (ESTs) database of Eucalyptus, as possible the development of three PCR primers that amplified the desirable regions of the gene. Thus, specifics primers were designed and amplification products of different individuals submitted to direct sequencing. The alignment and analysis of sequences revealed the occurence of seven SNPs in NCED gene, in a region of 1230 base pairs. The rate of transition/transversion was 1.33. After the prediction of protein, by the sites Softberry and Expasy, it was verified five SNPs, in coding region, that generated synonymous substitutions. Using the DnaSP program, seven haplotypes were found in a sample of 65 individuals, consisting of the species E. grandis, E. urophylla and the hybrid Urograndis. For these seven polymorphic sites were designed SNPs markers sets that will allow large-scale genotyping for population genetic studies and assisted breeding programs

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-12-20Bitstream added on 2014-06-13T19:21:40Z : No. of bitstreams: 1 bortoloto_tm_dr_botib.pdf: 469241 bytes, checksum: e1829e099d000d878f042860cfafcb9c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O grupo CAGEN em parceria com a empresa Suzano de Papel e Celulose vem desenvolvendo projetos de identificação de características relacionadas ao estresse abiótico em eucalipto. A presença de lignotuber é uma característica que confere a essas espécies maior tolerância a níveis de estresse. Em 2006 foi realizado um experimento que demonstrou uma correlação entre o aumento dos níveis de estresse e o aumento da formação de lignotuber em eucalipto, até atingir a proporção de 3:1, indicando a ação de um gene com efeito principal na formação do lignotuber. Através da técnica de BSA (Bulked Segregant Analyses) em conjunto com marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) foi possível detectar um marcador molecular que permitiu a identificação de indivíduos não portadores do lignotuber em eucalipto. Esse marcador foi convertido em SCAR e passou a ser chamado de ELig (Eucalyptus – Lignotuber). Diante do exposto, esse trabalho teve como objetivo a caracterização dessa região genômica relacionada à presença de lignotuber em eucalipto. O marcador ELig foi eficiente em identificar indivíduos de espécies de eucalipto sem lignotuber, podendo ser incorporado a programas de seleção assistida por marcadores moleculares. As espécies Eucalyptus grandis e E. urophylla apresentaram uma única cópia da sequência ELig em seus genomas. Essa sequência mostrou identidade a um contig de EST de eucalipto de 1918 nucleotídeos do banco de dados FORESTs-FAPESP, que apresenta o domínio de proteínas DnaJ, uma grande família de proteínas com membros relacionados à resposta da planta contra estresse abiótico, incluindo proteínas heat shock e chaperonas. A identidade do ELig ao contig restringe-se... / CAGEN group in association with Suzano Pulp and Paper has developed projects to identify characteristics related to abiotic stress in Eucalyptus. Lignotuber presence is a resource which gives to these species higher levels of stress tolerance. An experiment was performed in 2006 which showed a correlation between increased stress levels and the increment of lignotuber formation, until 3:1 proportion, indicating the gene action with major effect on the lignotuber formation. Using BSA (Bulked Segregant Analyses) technique with RAPD markers (Random Amplified Polymorphic DNA) was detected a molecular marker that allowed the identification of individuals without lignotuber in Eucalyptus. This marker was converted into a SCAR (Sequenced Characterized Amplified Region) marker and was named Elig (Eucalyptus - Lignotuber). The purpose of this study is characterize this genomic region related to the lignotuber presence in Eucalyptus. The Elig marker was effective in identifying Eucalyptus without lignotuber, and it can be incorporated into marker-assisted selection programs. Eucalyptus grandis and E. urophylla presented a single copy sequence ELig in their genomes. This sequence showed identity with a eucalypt EST contig with1918 nucleotides on the FORESTs-FAPESP database, the contig displays the protein domain DnaJ, a large proteins family with members related to plant response against abiotic stress, this domain includes heat shock proteins and chaperones. The ELig identity with the contig was restricted in the 5 'ELig region, in which was not possible to identify the polymorphism in the primers pairing site, indicating that this polymorphism is found in the 3' ELig region sequence. Through the RACE 3' (Rapid Amplification of cDNA Ends)... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-03-14Bitstream added on 2014-06-13T20:43:01Z : No. of bitstreams: 1 antonangelo_atbf_me_botib.pdf: 947571 bytes, checksum: 2289cbcd7df8db2d703a841907574c99 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / As doenças infecciosas e parasitárias causam perdas importantes em vários setores da produção da pecuária mundial. Estima-se que mais de 600 milhões de bovinos de países tropicais e subtropicais estejam expostos à infecção por Babesia spp., gerando um prejuízo econômico de mais de 1,3 bilhão de dólares por ano. Parte significativa dessa soma destina-se a defensivos e insumos veterinários, os quais poderiam ser substituídos por tecnologias mais eficazes e econômicas, como, por exemplo, animais geneticamente resistentes a parasitas. Os gêneros Babesia e Plasmodium são hemoparasitas pertencentes ao filo Apicomplexa e apresentam características comuns no processo de invasão eritrocitária. A babesiose bovina causada por Babesia bigemina e Babesia bovis apresenta sinais clínicos similares a malária humana causada por Plasmodium vivax e Plasmodium falciparum. O antígeno Duffy é o único receptor para o P. vivax em humanos. A maioria dos indivíduos negros africanos é resistente a este parasita devido a uma mutação que provoca a ausência de expressão deste antígeno na superfície das hemácias.Tendo em vista esse fato, e que animais da subespécie Bos taurus taurus são mais susceptíveis à babesiose quando comparados à animais Bos taurus indicus, este projeto foi desenvolvido com o objetivo de averiguar se essa maior resistência dos animais zebuínos está associada ao fato do antígeno Duffy estar ausente ou expresso em menor quantidade nas hemácias desses animais. Para detecção e quantificação do antígeno Duffy, na superfície das hemácias de bovinos dessas subespécies, foi produzido um anticorpo policlonal anti-Duffy bovino, visto que sua detecção não é possível pelos anticorpos desenvolvidos para a proteína humana, em função dessa diferir da proteína bovina, principalmente na seqüência de aminoácidos da região N-terminal. Para... / Cattle business worldwide has been affected by all sorts of infections. It´s estimated that more than 600 million bovines from tropical and sub-tropical areas are exposed to Babesia spp. infection causing loss of more than US$ 1,3 billion a year. An important part of this amount is spent on veterinarian drugs and vaccines. However this scenario could be changed if cheaper and more efficient technologies such as animal breeding for resistance to parasites were used. The genera Babesia and Plasmodium are hemoparasites which belong to phylum Apicomplexa and share features such as the RBCs invasion process. Clinic signs presented by cattle infected with Babesia bigemina and Babesia bovis are very similar to those presented by human beings infected with Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum. The glycoprotein Duffy is the only human erythrocyte receptor for P.vivax. The majority of black African people are resistant to this parasite due to a mutation which abolishes expression of the Duffy antigen on its erythrocytes surfaces. Detailed information on molecular interaction between Babesia parasite and its receptors on the bovine host cells surface is limited. Moreover, animals from subspecies Bos taurus taurus are more susceptible to babesiosis infection than those from Bos taurus indicus. This project investigated if this higher resistance of Bos taurus indicus animals is due to the fact that the Duffy antigen is absent or less expressed on its RBC surface. Aiming at detecting and quantifying Duffy antigen on erythrocyte surfaces of Bos taurus indicus and Bos taurus taurus, a polyclonal antibody against bovine Duffy was produced, because antibodies against human Duffy can not recognize this bovine protein which has different aminoacid sequence at N-terminal. Synthetic decapeptide (YNETDVEAAA) corresponding to aminoacid 34 to 43 of the N-terminal extracelullar domain of the bovine protein... (Complete abstract click electronic access below)