L'utilisation des fertilisants azotés et des herbicides de synthèse est aujourd'hui nécessaire pour assurer la productivité des systèmes de culture et répondre à la demande alimentaire d'une population mondiale en croissance démographique. Cependant, les effets potentiels de ces produits de synthèse sur les propriétés édaphiques et aériennes des agrosystèmes ont été décrits comme dépendants de l'environnement physico-chimique et biologique du sol sur lequel ils sont appliqués. En particulier, il semblerait que les sols non perturbés et sous couverture végétale permanente, caractérisés par des propriétés édaphiques très différenciées des sols gérés sous labour conventionnel, puissent modifier les effets non ciblés de certains herbicides. Plusieurs expérimentations en champ ainsi que deux études en conditions contrôlées ont permis de mettre en évidence que les systèmes gérés en semis-direct sous couverture végétale permanente étaient associés à une augmentation des teneurs en carbone et azote organique, des activités fonctionnelles microbiennes, de l'abondance en spores de champignons mycorhiziens arbusculaires, et de la colonisation racinaire du maïs par les champignons mycorhiziens. Deuxièmement, la fertilisation azotée a induit des effets négatifs sur certains indicateurs biologiques du sol comme l'activité de deshydrogénase alors qu'elle a permis d'augmenter la productivité végétale et la survie de certains parasites aériens des cultures. Troisièmement, le glyphosate, un herbicide total, a augmenté le temps de dégradation des substrats organiques, et n'a pas eu d'effet sur l'activité des champignons mycorhiziens lorsqu'il était appliqué seul ; par contre l'application d'azote en combinaison avec le glyphosate sur un sol fertilisé depuis 6 ans a entraîné une diminution du taux de colonisation du haricot par les champignons mycorhiziens. Les engrais azotés appliqués sur le long terme sont donc capables de modifier les effets non ciblés du glyphosate. Enfin, le S-Metolachlore, un herbicide sélectif, a augmenté la teneur en nitrates des sols cultivés en semis-direct, sans affecter ceux gérés en labour annuel, et a également augmenté la teneur en ammonium des turricules de vers de terre des sols conduits en semis-direct et fertilisés depuis 6 ans. Nous concluons que ce sont essentiellement les combinaisons de pratiques qui sont responsables des effets des herbicides sur les propriétés édaphiques et aériennes dans les agrosystèmes / Nowadays, the use of synthetic nitrogen fertilizers and herbicides is required to ensure cropping systems productivity and meet the demand for food of a growing population. However, the potential effects of these synthetic products on agrosystem’s below- and above-ground properties have been described to be dependent of soil physicochemical and biological characteristics on which they are applied. Especially, it seems that soils under no-till and continuous cover-cropping, characterized by contrasted edaphic properties as compared to soils managed under annual plowing, may change the non-target effects of certain herbicides. Several field experiments, as well as two mesocosm studies, evidenced that cropping systems conducted under no-till with continuous cover-cropping were associated to increased organic carbon and nitrogen contents, microbial functional activities, arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) spore density, and maize root colonization by AMF. Secondly, nitrogen fertilization induced negative effects on soil biological indicators such as dehydrogenase activity while it improved plant productivity and nymph survival of certain above-ground pests. Thirdly, glyphosate, a total herbicide, increased degradation time of organic substrates, while it did not change AMF activity when applied alone. However, the combinaison of glyphosate plus nitrogen fertilization in a soil fertilized over a 6-year period led to a decreased root colonization of bean by AMF. Thus, the long term nitrogen fertilization is capable to change the non-target effects of glyphosate. Finally, S-Metolachlor, a selective herbicide, increased nitrate content of soils subjected to no-till, while those conducted under annual plowing revealed no effect, and increased ammonium content of earthworm casts in soils managed under no-till with nitrogen fertilization for 6 years. We conclude that the effects of herbicides on agrosystem's above- and below-ground properties are mainly due to the combination with other agricultural practices such as nitrogen fertilization

Reproduction de : Thèse de doctorat : Biochimie et biologie moléculaire : Reims : 2005. / Résumé en français et en anglais. Titre provenant de l'écran titre. Bibliogr. f. 199-218.

Une pile microbienne (MFC) est un type de système bioélectrochimique (BES) dans lequel l'oxydation d'un large éventail de molécules organiques produit un courant électrique utilisable à travers un circuit externe. En tant que tel, ces biofilms respirant les anodes (BRA) ont établi les MFC comme une technologie d’énergie propre de nouvelle génération prometteuse, car ils peuvent produire de l’électricité tout en atteignant simultanément une biorestauration. Les MFC offrent également des solutions durables pour les systèmes d'alimentation distribués et le traitement des eaux usées pouvant être exploités localement àla source de la génération de celles-ci, telles que les maisons et les sites industriels, afin de réduire la dépendance aux installations centralisées. Les MFC ont même fait leurs preuves en tant que sources d'alimentation pour les dispositifs implantés autonomes et la détection à distance. Ce travail vise à améliorer l'efficacité des MFC en se concentrant sur les considérations à l'échelle microscopique. Les progrès techniques dans les électrodes microstructurées et la conception de MFC microfluidique sont démontrés. Ces développements ouvrent des possibilités d'optimisation et de recherche fondamentale sur les MFC et la technologie BES associée. Plus précisément, ces travaux démontrent des améliorations basées sur la structure et les matériaux des électrodes et leur intégration dans des canaux microfluidiques protégés contre les gaz présentant une configuration sans membrane. Le résultat est le MFC microfluidique le plus stable jamais décrit dans la littérature, capable de temps de fonctionnement les plus longs sur la plage de débit la plus large. Nous utilisons cette conception d'appareil robuste pour étudier l'effet du débit afin de surmonter les limitations de la disponibilité des nutriments sur les rendements de puissance, les problèmes de dépassement de puissance, ainsi que d'autres obstacles qui ont un impact plus large sur les MFC dans le secteur des énergies alternatives / A microbial fuel cell (MFC) is a type of bioelectrochemical system (BES) in which oxidation of a broad range of organic molecules produces a usable electric current through an external circuit. As such, such anode respiring biofilms (ARBs) have positioned MFCs as a promising next-generation clean energy technology because they can produce electricity while simultaneously achieving bioremediation. MFCs also offer sustainable solutions for distributed power systems and wastewater treatment that can be operated locally at the source of wastewater generation, such as homes and industrial sites, to reduce reliance on centralized facilities. MFCs have even been demonstrated as power sources for autonomous implanted devices and remote sensing. This work seeks to improve the efficiency of MFCs by focusing on the microscale considerations. Technical advancements in microstructured electrodes and microfluidic MFC design are demonstrated. These developments open up possibilities for optimization and fundamental research into MFCs and related BES technology. Specifically, this work demonstrates improvements based on electrode structure and materials and their integration into gas-protected microfluidic channels featuring a membraneless configuration. The result is the most stable microfluidic MFC yet reported in the literature, capable of the longest operating times over the largest range of flow rates. We use this robust device design in study of the effect of flow to overcome the limitations of nutrient availability on power outputs, the so-called power overshoot problems and other obstacles to achieving wider impact of MFCs in the alternative energy sector.

Ce mémoire présente un système de stockage de la puissance électrique à partir de piles à bactéries basé sur une approche à deux cycles pour alimenter deux capteurs intégrés : un capteur pH portatif à ultra-basse consommation électrique et un capteur de son. Deux cycles chargent et déchargent entre 1 à 7 piles à bactéries pour charger une super capacité. Cela permet au système de produire une puissance constante de 0.14 mW à une charge et une fréquence de 100 kΩ et 10 Hz respectivement. Ce système ne demande aucune énergie externe pour être alimenté. Effectivement, un module de démarrage a été intégré afin de permettre au système entier de démarrer après que les biopiles chargent la super capacité pendant trois jours. Le capteur de pH conçu présente des erreurs de mesure inférieures à 5% à 25⁰C et peut fonctionner continuellement lorsqu'il est alimenté par le système de stockage de puissance électrique conçu. Nous avons également utilisé ce système pour alimenter un capteur de son. / This thesis presents a Bacteria Energy Recovery System (BERS) based on a two cycle approach to power two embedded sensors : an ultra-low electrical power consumption portable pH meter and a sound sensor. The two cycle charge and discharge between 1 to 7 Microbial Fuel Cell (MFC) to charge a super capacitor. This allows the BERS to provide a constant 0.14 mW at a load and frequency of 100 kΩ and 10 Hz respectively. The BERS system requieres no outside energy to be powered on. Indeed a start up module has been integrated allowing the whole system to turn on after the MFCs charges the super capacitor for three days. The powered pH sensor has an error below 5% at 25⁰C and can function continously while being powered by the BERS. We also used the BERS to power a sound sensor.

Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2024 / Les systèmes bioénergétiques émergents offrent des voies innovantes pour passer des produits pétroliers à des alternatives plus durables. La branche de la bioélectrochimie axée sur l'énergie a un potentiel significatif pour influencer les secteurs de l'énergie verte et de la bioénergie. Les systèmes bioélectrochimiques (BES), utilisant des composants biologiques tels que les bactéries comme biocatalyseurs, sont en cours de développement et de miniaturisation pour de nouvelles biotechnologies. Le domaine des BES évolue rapidement avec de nouvelles applications, architectures de dispositifs et méthodologies de recherche. Cette thèse présente une enquête approfondie sur les propriétés hydrodynamiques et cinétiques des BES, en se concentrant particulièrement sur les performances et le comportement des biofilms électroactifs (EAB) sous différents débits et concentrations de nutriments. Des BES microfluidiques avancés ont été utilisés pour isoler et identifier les limitations cinétiques à différents stades de croissance des biofilms, fournissant une analyse approfondie de la cinétique des enzymes dans des conditions de flux. En outre, la thèse discute du développement et de l'optimisation des piles à combustible microbiennes sans membrane microfluidique (MFC), qui ont atteint des densités de puissance record. Cette étude améliore la compréhension de l'interaction entre l'hydrodynamique, la croissance des biofilms et la cinétique électrochimique, ouvrant la voie à de futures avancées dans la conception et l'application des technologies BES. / Emerging bioenergy systems offer innovative pathways to transition from petroleum products to more sustainable alternatives. The energy-focused branch of bioelectrochemistry holds significant potential to influence green energy and bioenergy sectors. Bioelectrochemical systems (BES), utilizing biological components such as bacteria as biocatalysts, are being developed and miniaturized for new biotechnologies. The BES field is rapidly evolving with new applications, device architectures, and research methodologies. This thesis presents a comprehensive investigation into the hydrodynamic and kinetic properties of BES, with a particular focus on the performance and behavior of electroactive biofilms (EABs) under varying flow rates and nutrient concentrations. Advanced microfluidic BES were employed to isolate and identify kinetic limitations at different stages of biofilm growth, providing an in-depth analysis of enzyme kinetics under flow conditions. Additionally, the thesis discusses the development and optimization of microfluidic membraneless microbial fuel cells (MFCs), which achieved record power densities. This study enhances the understanding of the interplay between hydrodynamics, biofilm growth, and electrochemical kinetics, paving the way for future advancements in the design and application of BES technologies.

Les systèmes bioélectrochimiques (BES) combinent la biologie et l'électrochimie pour produire de l'électricité ou synthétiser des produits chimiques. Les piles à combustible microbiennes (MFC), un type clé de BES, oxydent la matière organique des eaux usées pour générer de l'électricité, en utilisant des bactéries électrogènes comme biocatalyseurs pour le transfert d'électrons vers des électrodes solides. Leurs principales applications incluent le traitement des eaux usées et la production d'électricité. Cette thèse présente plusieurs MFC nouvellement conçues, en mettant l'accent sur leur rendement énergétique élevé et leur efficacité de conversion des substrats. Le chapitre 1 aborde les besoins énergétiques mondiaux, les BES et les principales techniques utilisées dans la recherche sur les BES, notamment les méthodes électrochimiques, la microfluidique, la spectroélectrochimie et la microscopie électronique à balayage (SEM). Le chapitre 2 détaille la fabrication de dispositifs microfluidiques, incluant des microcanaux en PDMS et des électrodes, ainsi que les protocoles biologiques, les méthodes spectroscopiques, les configurations électrochimiques et les mesures SEM utilisées dans nos projets. Les chapitres 3 à 6 couvrent quatre projets majeurs réalisés durant mon doctorat. Le chapitre 3 utilise la spectroélectrochimie (SEC) pour étudier un dispositif microfluidique à flux laminaire transportant une solution réactive depuis des électrodes en amont jusqu'à une zone de détection spectrale en aval. Cette technique permet de suivre avec succès l'oxydation de l'acide ascorbique (vitamine C) en présence d'interférences biomoléculaires d'une molécule présentant un potentiel redox similaire. Le chapitre 4 explore des expériences à long terme avec un design innovant de MFC à quatre électrodes empilées verticalement, permettant la culture de biofilms de *Geobacter sulfurreducens* sur des électrodes orientées vers le haut et vers le bas. À notre connaissance, il s'agit de la première étude comparant la croissance de biofilms électroactifs (EAB) sous l'influence de champs gravitationnels opposés, démontrant que la production d'énergie et la consommation d'acétate doublent lorsque les quatre électrodes fonctionnent en parallèle. Le chapitre 5 décrit la fabrication de MFC à microcanaux électrodes à l'aide d'une fraiseuse CNC, atteignant une production énergétique élevée et une grande efficacité de conversion d'acétate, notamment dans une MFC à micro-piliers. Le chapitre 6 présente trois MFC à micro-piliers empilées en configurations parallèle et série, fournissant une puissance élevée. L'empilement en série alimente un multisenseur environnemental (température, humidité) ainsi qu'une montre analogique. La thèse se conclut par un résumé des projets et propose des perspectives pour les travaux futurs. / Bioelectrochemical systems (BESs) integrate biology and electrochemistry to generate electricity or synthesize chemicals. Microbial fuel cells (MFCs), a key type of BES, oxidize organic matter in wastewater to produce electricity, with electrogenic bacteria acting as biocatalysts for electron transfer to solid electrodes. Their primary applications are wastewater treatment and electricity production. This thesis presents several newly designed MFCs, focusing on their high-power output and substrate conversion efficiency. Chapter 1 discusses global energy needs, BESs, and the key techniques used in BES research, including electrochemical methods, microfluidics, spectroelectrochemistry, and scanning electron microscopy (SEM). Chapter 2 details the fabrication of microfluidic devices, including PDMS and electrode-based microchannels, as well as biological protocols, spectroscopy, electrochemical setups, and SEM measurements used in our projects. Chapters 3 to 6 cover four major projects conducted during my PhD. Chapter 3 uses spectroelectrochemistry (SEC) to study a laminar flow microfluidic device that transports a reacted solution from upstream electrodes to a downstream spectral detection region. This technique successfully monitors the oxidation of ascorbic acid (vitamin C) in the presence of biomolecular interference from a molecule with overlapping redox potential. Chapter 4 explores long-term experiments with a vertically stacked, four-electrode microfluidic MFC design, which cultivates *Geobacter sulfurreducens* biofilms on upward- and downward-facing electrodes. To our knowledge, this is the first study comparing electroactive biofilm (EAB) growth under opposing gravitational fields, demonstrating that power output and acetate consumption double when four electrodes operate in parallel. Chapter 5 describes the fabrication of electrode-based microchannel MFCs using a CNC milling machine, achieving high-power output and acetate conversion efficiency, particularly in a micro-pillar MFC. Chapter 6 presents three micro-pillar MFCs stacked in parallel and series configurations to provide high-power output. The series stack powers an environmental multisensor (temperature, humidity) and an analog watch. The thesis concludes by summarizing the projects and offering perspectives on future work.

Les données présentées dans ce manuscrit de thèse sont principalement basées sur l'analyse de séquences d'ADN extraites directement de l'environnement (et en particulier du sol) en les comparant aux données cumulées au fil des siècles sur les microorganismes cultivés en laboratoire. Les objectifs, difficultés, résultats et perspectives de cette approche, que l'on nomme « métagénomique », sont décrits. Un métagénome représente la diversité génétique d'un habitat défini (par exemple un sol du champ agricole) dans sa globalité. Ainsi, générer un métagénome a notamment pour but d’accéder à la diversité génétique de la majorité d'espèces récalcitrantes à la culture. Elle permet aussi d'estimer le potentiel fonctionnel d'un jeu de données métagénomiques représentant un écosystème, puis de le comparer à d'autres jeux de données, représentant quant à eux d'autres environnements. Enfin, un autre intérêt de cette approche est la possibilité, dans certains cas, d'assembler partiellement ou entièrement un métagénome, et ainsi de permettre la reconstruction de structures génétiques complexes, qu'elles représentent des plasmides ou des génomes, circulaires ou non. Ce manuscrit de thèse présente ces aspects de la métagénomique (extraction, séquençage, annotation, comparaison, assemblage) sur l'environnement sol, en se basant sur une prairie anglaise (Park Grass, Rothamsted Research) étudiée depuis plus de 150 ans. Les communautés microbiennes prédominantes ont été partiellement caractérisées, leur potentiel fonctionnel comparé à d'autre environnements majeurs de notre planète (océans, sédiments, neige, etc.). Parce que l'assemblage de ces données est très limité dû à une trop grande diversité, des expérimentations ont été faites en microcosmes afin de stimuler une partie de la communauté avant de générer de nouveaux jeux de données, hautement simplifiés. Cette approche a permis l'assemblage et l'étude structurelle de génomes correspondant à des espèces résistant à des conditions extrêmes (par exemple un apport considérable de mercure, ou de métaux lourds).Lorsque l'on regarde la métagénomique dans sa globalité, les perspectives apparaissent clairement : usant d'outils de plus en plus performants (séquençage, annotation, assemblage, etc.), les microbiologistes peuvent d'ores et déjà récolter le fruit de plus de trois milliards d'années d'évolution et d'adaptation microbienne. / Microbial ecology is beginning to interact with metagenomics and many microbiologists are attracted to metagenomics in the hope of discovering novel relationships between microorganisms and/or confirming that work done on isolates applies to the remaining uncultured members of the different ecosystems. With a growing number of available metagenomic datasets, metagenomes can be intensively mined by microbial ecologists in search of previously undetected correlations (both structural and functional). Here, we provide a preliminary exploration of 77 publically available metagenomes corresponding to DNA samples extracted from oceans, atoll corals, deep oceans, Antarctic aquatic environments, Arctic snows, terrestrial environments (sediments, soils, sludges, microbial fuel cell anode biofilms, acid mine drainage biofilms), polluted air, and animal and human microbiomes (human feces, mouse and chicken cecum, and cow rumen). Results show well-defined environmental specificities that emphasize microbial adaptation and evolution capabilities. Unexpected observations were also made for several ecosystems, thus providing new hypotheses about the life style of their microbial communities. Available metagenomes are a gold mine of underexploited information that could be used to explore specific microbial structural and functional relationships. The statistical analysis provided here depends in part on replicates from the different ecosystems. With the continued emphasis on metagenomic sequencing, future analyses should support rigorous statistical treatment. This preliminary metagenomic decryption could represent a pilot-scale test for a future Earth microbiome global comparison

Dans un contexte de croissance de la productivité agricole, de réduction du coût des intrants, de valorisation des ressources et de cohabitation harmonieuse en milieu agri-urbain par une réduction des odeurs et des sources de pollution agroenvironnementales, il est primordial de développer des technologies agroenvironnementales de valorisation énergétique et de réduction de l'impact environnemental de l'industrie agricole. Les recherches sur les piles bio-électrochimiques connaissent un développement important ces dernières années. Les piles bio-électrochimiques produisent directement de l'électricité tout en traitant un effluent pour en réduire les nuisances environnementales contribuant ainsi à amener des solutions intéressantes à ces enjeux. Il reste cependant à accroître leurs performances afin de rendre cette technologie utilisable à grande échelle. Dans cette étude, nous avons pu identifier les populations microbiennes intervenant dans le processus électrique et ainsi pu définir des paramètres de fonctionnement permettant d'accroître notablement les performances électriques lorsque le lisier de porc est le substrat utilisé dans la pile. Ce succès, rencontré dans l'application du traitement et de la valorisation énergétique du lisier de porc, permet d'être grandement optimiste en vue d'une mise à l'échelle industrielle non seulement pour cette application, mais également pour d'autres effluents organiques.

Le domaine de l'écologie microbienne est en pleine effervescence grâce à l'avènement de la métagénomique et des techniques de séquençage de nouvelle génération (SNG), qui nous apportent une meilleure compréhension de la structure et du fonctionnement des communautés microbiennes de la biosphère. Cette thèse illustre ainsi une manière de tirer profit de l'utilisation de ces nouvelles technologies, dans le but d'étudier un écosystème qui a été très peu caractérisé jusqu'à maintenant, en l'occurrence les tapis microbiens polaires. Les analyses métagénomiques de différents tapis microbiens polaires ont permis dans un premier temps, de dresser une description générale de la taxonomie et du potentiel fonctionnel des communautés microbiennes en question, pour ensuite nous permettre d'examiner de façon plus exhaustive deux de leurs particularités métaboliques. L'existence éventuelle d'un système de recyclage des nutriments au sein même des tapis microbiens étudiés a été soulevée étant donné le caractère oligotrophique de leur milieu environnant. L'analyse des profils métagénomiques des tapis microbiens de l'Arctique a permis de mettre en évidence plusieurs groupes de gènes impliqués dans des mécanismes de décomposition et de récupération qui donneraient la possibilité à ces communautés de retenir et de recycler leurs nutriments au sein de leur microenvironnement benthique. Un autre aspect des tapis microbiens polaires sur lequel je me suis penché lors de ce doctorat, concerne la propension des membres peuplant ce type d'écosystème à s'acclimater à un large panel de stress découlant de la nature extrême de leur habitat. La présence de divers procédés métaboliques d'adaptation au froid et à d'autres stress a été observée à partir de l'analyse du métagénome des ces communautés arctiques et antarctiques, en concordance avec les différents niveaux de représentation des principaux groupes bactériens. Cette thèse démontre à quel point le recours aux disciplines « méta-omiques », peut nous amener vers une meilleure compréhension de l'écologie microbienne, et comment l'émergence de ces technologies a permis d'aborder différemment des thèmes aussi fondamentaux que celui de la biogéographie des microorganismes. / Over the last few years, metagenomics and next generation sequencing (NGS) have been revolutionizing the field of microbial ecology leading to a greater understanding of the structure and functions of the microbial communities in the biosphere. The work presented here applies these new technologies to study polar microbial mats, which are poorly-characterized ecosystems. Metagenomic analyses of distinct polar microbial mats provided an opportunity to, firstly obtain a general description of microbial community composition and metabolic activity, and subsequently, to more thoroughly study two specific metabolic processes. We hypothesized that microbial mats are nutrient-replete despite the oligotrophic conditions of the surrounding waters due to strong nutrient recycling within the polar microbial mats. Analyses of metagenomic profiles derived from arctic microbial mats revealed that several groups of genes involved in scavenging mechanisms provide these communities with the capacity to retain and recycle nutrients within the shallow benthic microenvironment. Another aspect of polar microbial mats which was examined during this PhD, addresses the ability of organisms in the mat to thrive despite varied environmental stresses. The presence of different metabolic processes involved in cold adaptation and other stresses was detected from metagenomic analyses of Arctic and Antarctic communities that were consistently proportional to their representation within major bacterial groups. This thesis demonstrates how metagenomics and associated « meta-omics » approaches can be informative to improve global comprehension of microbial ecology, and how the emergence of these disciplines enables us to tackle fundamental questions such as biogeography of microorganisms with a new vision.

La fibrose kystique est une maladie autosomale récessive multisystémique se manifestant principalement au niveau du système respiratoire et digestif. En raison d’une altération de la protéine régulatrice CFTR, l’équilibre ionique chez les cellules de l’hôte est déficient. Il en résulte, entre autres, une sécrétion et une accumulation d’un mucus pulmonaire très consistant. L’évacuation du mucus étant très fastidieuse chez les patients atteints de fibrose kystique, l’élimination des particules et bactéries des voies respiratoires est inadéquate. Cet aspect de la maladie participe grandement à sa progression, car l’établissement d’infections bactériennes chroniques contribue principalement à l’effet délétère sur la santé respiratoire des patients atteints de fibrose kystique. La colonisation du mucus pulmonaire par les bactéries pathogènes est le sujet de nombreuses recherches extensives dans le contexte de la fibrose kystique. La présence d’une diversité microbienne dans les voies respiratoires est connue depuis longtemps, mais avec les techniques récentes d’analyse moléculaire, il a été constaté que celle-ci peut présenter une très grande richesse qui était préalablement non détectée par les méthodes d’isolement classiques. Les interactions et comportements adoptés par les populations polymicrobiennes du microbiome FK dans la progression de la maladie sont maintenant de grand intérêt. La virulence des principaux pathogènes en FK a préalablement et exhaustivement été décrite de façon spécifique. Parmi les plus notoires, comme Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa et Burkholderia cepacia, certains utilisent des systèmes de communication cellulaire élaborés («quorum sensing») dans le but de réguler leur virulence. De nouvelles voies de recherche sont construites sur la suggestion qu’une population polymicrobienne peut être perçue comme un seul agent infectieux. Notre étude a été conduite afin de documenter les possibles réponses interespèces entre S. aureus et P. aeruginosa suite à l’échange de molécules sécrétées dans le cadre du «quorum sensing». Pour ce faire, nous avons caractérisé un éventail d’interactions existantes entre des isolats cliniques des deux pathogènes d’intérêt. Nous avons également développé un modèle nous permettant de mieux comprendre l’impact de la coexistence sur leur pathogenèse. Inévitablement, l’étude vise à définir l’instance de la présence simultanée des deux bactéries dans l’établissement d’infections chroniques chez les patients atteints de fibrose kystique ainsi que sur leur santé respiratoire. Cette étude tente ultimement de contribuer à l’effort visant à comprendre l’importance des interactions polymicrobiennes dans un contexte infectieux dans le but de trouver de nouveaux indices quant à l’élaboration de stratégies thérapeutiques.