Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-03-13T12:37:33Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) klaudia Tenório_dissert.pdf: 4614858 bytes, checksum: 021b1f22eed5af2baeddeff87f3c6556 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T12:37:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) klaudia Tenório_dissert.pdf: 4614858 bytes, checksum: 021b1f22eed5af2baeddeff87f3c6556 (MD5) Previous issue date: 2012 / O camarão de água doce Macrobrachium carcinus (LINAEUS, 1758) pode ser encontrado em regiões tropicais e subtropicais. No Brasil, está distribuído desde o Pará até Rio Grande do Sul, em rios que deságuam no oceano Atlântico. Esta espécie tem sofrido com a sobrepesca, a poluição ambiental, a destruição dos ambientes naturais, barramento dos rios e riachos, os quais impedem o acesso ao mar impossibilitando o desenvolvimento dos estágios larvais do animal, além da introdução de espécies exóticas, como o M. rosenbergii. Por essas razões, o Ministério do Meio Ambiente (MMA) inseriu o M. carcinus na lista oficial das espécies ameaçadas de extinção em vários estados do Nordeste. Visando fornecer informações para as iniciativas de repovoamento, este estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e estrutura genética, bem como aspectos da ecologia desta espécie em quatro estados do Nordeste (Ceará, Pernambuco, Sergipe/Alagoas e Bahia), utilizando seis marcadores de microssatélites, dados biométricos e análises de conteúdo estomacal. Um total de 143 animais foi coletado, sendo de 32 a 40 animais para cada um dos rios avaliados. Após as análises, o número de alelos variou de dois a 18 alelos, com heterozigosidades médias esperadas e observadas de 0,6256 e 0,5985 respectivamente. Três dos seis loci estão em desequilíbrio de Hardy-Weinberg e apresentam alelos nulos em todas as populações. O valor total de FST foi de 0, indicando ausência de estruturação genética. Os estudos biológicos mostram que o pico reprodutivo mais provável para esta espécie ocorra em fevereiro. A análise estomacal revelou predominância de itens de origem vegetal. Estes resultados sugerem que um único programa de repovoamento poderia fornecer pós-larvas a todos os rios da região Nordeste, diminuindo os custos de operação e garantido que rios distantes de laboratórios de multiplicação também sejam beneficiados.

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-13T15:04:42Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Marcos da Silveira Neto.pdf: 2631812 bytes, checksum: b75b5dd740260c8e5df8486b6a787c94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T15:04:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Marcos da Silveira Neto.pdf: 2631812 bytes, checksum: b75b5dd740260c8e5df8486b6a787c94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014 / FACEPE / No Brasil as espécies D. flavipennella e D. saccharalis tem uma grande importância para o setor sucroalcooleiro por causar danos em cana-de-açúcar. Os estágios de ovo, larva, pupa e adulto são muito parecidos entre essas espécies e a identificação pode ser confusa. O Espaçador Interno Transcrito 2 (ITS2) do locus DNA ribossomal, que tem um papel importante no processamento do DNAr, vem sendo aplicado em estudos filogenéticos e populacionais por ter como característica divergência evolutiva. Este trabalho tem como objetivo compreender o grau de divergência evolutiva entre as espécies D. flavipennella e D. saccharalis com base no marcador ITS 2, analisar sua estrutura e características funcionais. O DNA foi extraído de amostras de ovo, lagarta e adulto. Foi realizada PCR e os amplicons foram purificados e sequenciados. As sequências foram analisadas com o programa MEGA 5.01. O tamanho do ITS 2 foi de 410 pb em D. flavipennella e 448 pb em D. saccharalis. O conteúdo de GC foi similar entre as duas espécies. As sequências apresentaram regiões conservadas intercaladas por regiões variáveis. Algumas regiões conservadas apresentavam motivos presentes também em espécies de diferentes grupos, provavelmente associados às estruturas participantes no processamento do RNA pós-transcricional. Três repetições microssatélites estavam presentes em D. saccharalis e ausentes em D. flavipennella, contribuindo para a diferença de tamanho entre as duas espécies. Apesar da divergência existente entre as sequências das espécies, existem regiões que são conservadas em níveis taxonômicos mais altos.

O gado zebu (Bos indicus) é predominante em todo o mundo. Atualmente, no Brasil, o rebanho de bovinos e zebuínos é composto por aproximadamente 170 milhões de indivíduos, no qual, 80% são zebuínos ou animais de raças cruzadas com zebu. O principal objetivo deste estudo foi determinar a possibilidade da utilização de marcadores moleculares de bovinos na identificação genética de zebuínos. A confirmação desta possibilidade seria de extrema valia, já que a quantidade de informações sobre o genoma zebuíno é limitada e metodologias específicas de identificação de marcadores genéticos para raças zebuínas são raras. Assim, o DNA de 65 zebus, de 4 raças diferentes (Gir, Tabapuã, Nelore e Brahman), foi extraído a partir de sangue aplicado em papel filtro, utilizando o “kit” DNA IQTM SYSTEM (Promega®). Após a extração de DNA, foi feito um PCR Multiplex utilizando o “kit” StockMarks® (Applied Biosystems®), o qual amplifica um total de 11 loci (BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA122, TGLA126, TGLA227 e TGLA53). Os fragmentos gerados pela PCR foram analisados por eletroforese capilar utilizando o analisador genético ABI Prism 3100 (Applied Biosystems®) e o programa GeneScan® v.3.7 (Applied Biosystems®). A freqüência dos marcadores e os índices de variabilidade genética foram calculados utilizando o programa Microsatellite Toolkit v.3.1 e o equilíbrio de Hardy-Weinberg foi determinado através do programa GENEPOP v.3.4. Através destas técnicas foi possível demonstrar que os marcadores moleculares utilizados para identificação genética de bovinos podem também ser utilizados para a realização da técnica de identificação genética de zebuínos Além disso, foi possível demonstrar a freqüência alélica na população de zebuínos analisada como um todo, assim como foi determinada a freqüência alélica para os diferentes marcadores moleculares dentro das 4 raças estudas. Considerando o total de 100 diferentes alelos identificados entre os 11 STR (Short Tandem Repeats) analisados, foi possível observar que a heterozigosidade esperada (He) foi relativamente alta na população analisada, assim como na análise por raça. Estes dados indicam alto grau de diversidade genética nas diferentes raças. Neste sentido, a raça Brahman apresentou a menor diversidade (0,60) e a raça Tabapuã, a maior (0,69). Contudo, estudos complementares são necessários, a fim de confirmar as freqüências alélicas estabelecidas, uma vez que os resultados encontrados no presente trabalho referem-se a um número relativamente pequeno de zebuínos, quando comparados com o total de zebus encontrados no rebanho brasileiro.

Ctenomys lami é um roedor fossorial endêmico de uma região da Planície Costeira do Rio Grande do Sul, Brasil, conhecida como Coxilha das Lombas. Pouco se sabe, ainda, sobre a ecologia, comportamento e genética dessa espécie que foi descrita por Freitas (2001), considerando que esses conhecimentos são fundamentais no entendimento dos intrincados padrões evolutivos da mesma e principalmente do gênero do qual faz parte, tendo em vista que é um dos com maior diversidade de espécies entre os mamíferos. Além da importância na resolução de questões evolutivas, conhecimentos gerais sobre a espécie são necessários para o desevolvimento de planos de conservação e preservação. Este trabalho teve como objetivo identificar relações genéticas dentro e entre três possíveis subpopulações de C. lami através da análise do fluxo gênico (Fst, Fis, rst, Nm), de informações gerais como PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica), média de alelos por locus, heterozigosidade, deficiência de heterozigotos e das relações de paternidade e parentesco. Para isso foram utilizados 89 indivíduos da população (subpopulação A: n=19; B: n=37; C: n=33) de uma área localizada na região de Itapuã, mais exatamente na borda leste da Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), município de Viamão, RS. Para executar a análise genética foram utilizados marcadores de microssatélites descritos para espécies cogenéricas - Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8 desenvolvidas a partir de C. sociabilis e Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12 de C. haigi por Lacey (1999; 2001). Os resultados identificam que há um grande fluxo gênico, demonstrando assim, que não há uma subdivisão significativa entre as subpopulações sugeridas, mas também demonstram que parece haver uma estruturação incipiente, onde a distância e a baixa mobilidade dos indivíduos têm papel fundamental. A verificação da estrutura populacional através da análise de paternidade e parentesco indicou que a baixa variabilidade dos loci estudados impede uma definição real de paternidade e não oferecem dados suficientes para definir estruturação e comportamento dessa espécie. Sugere-se que essa baixa variabilidade seja resultado de um Efeito Fundador ocorrido recentemente na população. / Ctenomys lami was recently described by Freitas (2001) as a fossorial rodent, living only in Coxilha das Lombas, a region of the Coastal Plain of Rio Grande do Sul. The ecology, behavior and genetics of this species are not well known, although such knowledge is essential for understanding the intricate evolution patterns of this species as well as of the genus, which is one with the highest diversity among the mammals. Besides the importance of clarifying the evolution questions, general knowledge about this species is needed for developing conservation strategies. This work has the goal of identifying genetic relationships within and between three possible subpopulations of C. lami through the analysis of (i) genetic flow (Fst, Fis, rst, Nm), (ii) general information like PIC (Polymophic Information Content), allele mean per locus, heterozigosity, heterozygote deficiency and (iii) relatedness among individuals. Eighty-nine individuals from a population (subpopulation A: n=19; B: n=37; C: n=33) were analyzed in the area located in the region known as Itapuã, at the east banks of Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), in Viamão, RS. To execute the genetic analysis, we used microsatellite markers described to cogeneric species (Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12, developed from C. haigi; and Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8, from C. sociabilis) by Lacey (1999; 2001). Results showed that there is high gene flow, and thus the three suggested sub-populations are not significantly divided. However, the population is not structured and the distance and low motility of individuals play an important role in this situation. When verifying the population structure through relatedness analysis, we found that the low variability of the studied loci does not allow a correct definition of paternity, and does not provide enough data to define structure and behavior of this species. We thus suggest that this low variability is an effect of a recent founder effect in this population.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-05T18:20:11Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1164453 bytes, checksum: fdbc208493b147756c7fd84726536d71 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-05T18:20:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1164453 bytes, checksum: fdbc208493b147756c7fd84726536d71 (MD5) Previous issue date: 2003-05-30 / Uma amostra de 172 clones de cacau (Theobroma cacao L.), provenientes de amostras coletadas em populações espontâneas de 16 bacias hidrográficas da Amazônia Brasileira, foi caracterizada por meio de microssatélites visando identificar genótipos, estimar a diversidade genética e estruturas genéticas das populações de origem. Foram detectados 187 alelos a partir de 30 locos microssatélites, dos quais 29 apresentaram polimorofismo, seletivamente neutros e independentes, permitindo identificar 169 (98,3%) genótipos distintos e apenas três genótipos repetidos (CAB 731, CAB 732 e CAB 734), oriundos da bacia do Rio Uatumã-AM. Os genótipos agrupararam-se segundo suas origens geográficas, com a dissimilaridade variando de 0,0 a 0,79 e média de 0,59. Foram identificados 68 alelos raros, dos quais 23 exclusivos, destacando-se as bacias do Acre e do Alto Amazonas com maior número de alelos privados, corroborando suas maiores riquezas alélicas. Todas as subpopulações apresentaram boa diversidade genética, exceto as de Rondônia que mostraram menor variabilidade para todos os indicadores utilizados. A diversidade genética total foi 0,658 contra uma heterozigosidade observada de 0,295, observando-se défict de heterozigosidade em todas as amostras, caracterizado por um coeficiente de endogamia de 0,408 e taxa de fecundação cruzada de 42 %. As subpopulações apresentaram forte estruturação, com significativa diferenciação (G ST = 0,292 e F ST = 0,290) e alto coeficiente de parentesco (R EL = 0,367) dos indivíduos dentro das subpopulações. A análise das amostras agrupadas (Acre, Alto Amazonas, Rondônia e Baixo Amazonas) mostra 66,6% da variabilidade genética dentro das subpopulações, 14,9 % entre subpopulações dentro dos grupos e 18,5% entre os quatro grupos. As populações do Alto Amazonas se destacaram em termos de contribuição relativa à diversidade e riqueza alélica total. No acre, a despeito da alta diversidade e riqueza alélica, apenas a bacia do Rio Tarauacá apresenta contribuição relativa positiva. As demais demonstram redundância na composição alélica, com contribuições relativas negativas. O dendrograma de distância genética D de Nei apresentou topologia mais robusta que δμ 2 e D L (-ln(1-F ST ), confirmando o agrupamento das subpopulações do Acre e Alto Amazonas e destacando a elevada divergência da bacia do Rio Jamari em relação às demais. Os resultados realçam a importância de novas coletas na bacias hidrográficas do Amazonas e Acre (especialmente a do rio Tarauacá) e a necessiade de agregar o máximo de novas bacias visando reunir o máximo de novos alelos, alelos raros e/ou exclusivos, de modo a enriquecer as coleções de germoplasma e a minimizar perdas por erosão genética. / A sample of 172 clonal genotypes of the cacao tree (Theobroma cacao L.) representing germplasm collections from natural subpopulations collected in 16 river basins of the Brazilian Amazon region was characterized using microsatellites to identify genotypes, assess genetic diversity and population structure. From 30 loci microsatellites analyzed 29 showed polymorphism revealing 186 alleles selectively neutral and independent, which allowed to identify 169 (98.3%) distinct genotypes and only three repeated ones (CAB 731, CAB 732 and CAB 734) from Uatumã (AM) river basin. The genotypes were clustered in accordance with their geographic origins, their dissimilarities varying from 0.0 to 0.79 and mean 0.59. Sixty eight rare aleeles were identified from which 23 privates ones, which places the basins from Acre and Upper Amazon with higher number of private alleles according to their greater allelic richness. All subpopulations showed relatively high genetic diversity except those from Rondonia that presented low variability to all indicators used. The Total diversity was 0.658 for an observed heterozigosity 0.295, a result of a heterozigosity deficit in every sample, characterized by an endogamy coefficient 0.408 and an outcrossing rate 42%. The subpopulations showed a strong structuring with a significant differentiation (G ST = 0.293 and F ST = 0.290) and relatedness (R EL = 0.367) of the individuals within of the subpopulations. Analyses of grouped samples (Acre, Upper Amazon, Rondonia and Low Amazon) shoed 66.6% of the genetic variability within the subpopulations, 14.9% among subpopulations within the groups and 18.5% among the four groups. Upper Amazon populations produced the most relative contributions to the total diversity and allelic richness. In the Acre group, in spite of the high diversity and allelic richness, only the Tarauaca river basin presented positive relative contributions; the other Acre subpopulations showed redundant allelic composition with negative relative contribution to total diversity and allelic richness. The Nei-based distance tree (D) showed more robust topology than δμ 2 and D L [-ln(1-F ST )] ratifying the clustering of the subpopulations from Acre and from Upper Amazon, emphasizing the high divergence between Jamari (RO) river basin and the others. The results highlight the importance of new germplasm collects in the river basins from Amazonas and Acre States (especially the Tarauaca river basin) and the need of aggregating the maximum number of new basins to assemble the maximum number of new alleles, rare and/or private alleles in order to increase the diversity of germplasm collections and minimize the loss by genetic erosion. / Tese importada do Alexandria

Ctenomys lami é um roedor fossorial endêmico de uma região da Planície Costeira do Rio Grande do Sul, Brasil, conhecida como Coxilha das Lombas. Pouco se sabe, ainda, sobre a ecologia, comportamento e genética dessa espécie que foi descrita por Freitas (2001), considerando que esses conhecimentos são fundamentais no entendimento dos intrincados padrões evolutivos da mesma e principalmente do gênero do qual faz parte, tendo em vista que é um dos com maior diversidade de espécies entre os mamíferos. Além da importância na resolução de questões evolutivas, conhecimentos gerais sobre a espécie são necessários para o desevolvimento de planos de conservação e preservação. Este trabalho teve como objetivo identificar relações genéticas dentro e entre três possíveis subpopulações de C. lami através da análise do fluxo gênico (Fst, Fis, rst, Nm), de informações gerais como PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica), média de alelos por locus, heterozigosidade, deficiência de heterozigotos e das relações de paternidade e parentesco. Para isso foram utilizados 89 indivíduos da população (subpopulação A: n=19; B: n=37; C: n=33) de uma área localizada na região de Itapuã, mais exatamente na borda leste da Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), município de Viamão, RS. Para executar a análise genética foram utilizados marcadores de microssatélites descritos para espécies cogenéricas - Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8 desenvolvidas a partir de C. sociabilis e Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12 de C. haigi por Lacey (1999; 2001). Os resultados identificam que há um grande fluxo gênico, demonstrando assim, que não há uma subdivisão significativa entre as subpopulações sugeridas, mas também demonstram que parece haver uma estruturação incipiente, onde a distância e a baixa mobilidade dos indivíduos têm papel fundamental. A verificação da estrutura populacional através da análise de paternidade e parentesco indicou que a baixa variabilidade dos loci estudados impede uma definição real de paternidade e não oferecem dados suficientes para definir estruturação e comportamento dessa espécie. Sugere-se que essa baixa variabilidade seja resultado de um Efeito Fundador ocorrido recentemente na população. / Ctenomys lami was recently described by Freitas (2001) as a fossorial rodent, living only in Coxilha das Lombas, a region of the Coastal Plain of Rio Grande do Sul. The ecology, behavior and genetics of this species are not well known, although such knowledge is essential for understanding the intricate evolution patterns of this species as well as of the genus, which is one with the highest diversity among the mammals. Besides the importance of clarifying the evolution questions, general knowledge about this species is needed for developing conservation strategies. This work has the goal of identifying genetic relationships within and between three possible subpopulations of C. lami through the analysis of (i) genetic flow (Fst, Fis, rst, Nm), (ii) general information like PIC (Polymophic Information Content), allele mean per locus, heterozigosity, heterozygote deficiency and (iii) relatedness among individuals. Eighty-nine individuals from a population (subpopulation A: n=19; B: n=37; C: n=33) were analyzed in the area located in the region known as Itapuã, at the east banks of Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), in Viamão, RS. To execute the genetic analysis, we used microsatellite markers described to cogeneric species (Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12, developed from C. haigi; and Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8, from C. sociabilis) by Lacey (1999; 2001). Results showed that there is high gene flow, and thus the three suggested sub-populations are not significantly divided. However, the population is not structured and the distance and low motility of individuals play an important role in this situation. When verifying the population structure through relatedness analysis, we found that the low variability of the studied loci does not allow a correct definition of paternity, and does not provide enough data to define structure and behavior of this species. We thus suggest that this low variability is an effect of a recent founder effect in this population.

O gado zebu (Bos indicus) é predominante em todo o mundo. Atualmente, no Brasil, o rebanho de bovinos e zebuínos é composto por aproximadamente 170 milhões de indivíduos, no qual, 80% são zebuínos ou animais de raças cruzadas com zebu. O principal objetivo deste estudo foi determinar a possibilidade da utilização de marcadores moleculares de bovinos na identificação genética de zebuínos. A confirmação desta possibilidade seria de extrema valia, já que a quantidade de informações sobre o genoma zebuíno é limitada e metodologias específicas de identificação de marcadores genéticos para raças zebuínas são raras. Assim, o DNA de 65 zebus, de 4 raças diferentes (Gir, Tabapuã, Nelore e Brahman), foi extraído a partir de sangue aplicado em papel filtro, utilizando o “kit” DNA IQTM SYSTEM (Promega®). Após a extração de DNA, foi feito um PCR Multiplex utilizando o “kit” StockMarks® (Applied Biosystems®), o qual amplifica um total de 11 loci (BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA122, TGLA126, TGLA227 e TGLA53). Os fragmentos gerados pela PCR foram analisados por eletroforese capilar utilizando o analisador genético ABI Prism 3100 (Applied Biosystems®) e o programa GeneScan® v.3.7 (Applied Biosystems®). A freqüência dos marcadores e os índices de variabilidade genética foram calculados utilizando o programa Microsatellite Toolkit v.3.1 e o equilíbrio de Hardy-Weinberg foi determinado através do programa GENEPOP v.3.4. Através destas técnicas foi possível demonstrar que os marcadores moleculares utilizados para identificação genética de bovinos podem também ser utilizados para a realização da técnica de identificação genética de zebuínos Além disso, foi possível demonstrar a freqüência alélica na população de zebuínos analisada como um todo, assim como foi determinada a freqüência alélica para os diferentes marcadores moleculares dentro das 4 raças estudas. Considerando o total de 100 diferentes alelos identificados entre os 11 STR (Short Tandem Repeats) analisados, foi possível observar que a heterozigosidade esperada (He) foi relativamente alta na população analisada, assim como na análise por raça. Estes dados indicam alto grau de diversidade genética nas diferentes raças. Neste sentido, a raça Brahman apresentou a menor diversidade (0,60) e a raça Tabapuã, a maior (0,69). Contudo, estudos complementares são necessários, a fim de confirmar as freqüências alélicas estabelecidas, uma vez que os resultados encontrados no presente trabalho referem-se a um número relativamente pequeno de zebuínos, quando comparados com o total de zebus encontrados no rebanho brasileiro.

O gado zebu (Bos indicus) é predominante em todo o mundo. Atualmente, no Brasil, o rebanho de bovinos e zebuínos é composto por aproximadamente 170 milhões de indivíduos, no qual, 80% são zebuínos ou animais de raças cruzadas com zebu. O principal objetivo deste estudo foi determinar a possibilidade da utilização de marcadores moleculares de bovinos na identificação genética de zebuínos. A confirmação desta possibilidade seria de extrema valia, já que a quantidade de informações sobre o genoma zebuíno é limitada e metodologias específicas de identificação de marcadores genéticos para raças zebuínas são raras. Assim, o DNA de 65 zebus, de 4 raças diferentes (Gir, Tabapuã, Nelore e Brahman), foi extraído a partir de sangue aplicado em papel filtro, utilizando o “kit” DNA IQTM SYSTEM (Promega®). Após a extração de DNA, foi feito um PCR Multiplex utilizando o “kit” StockMarks® (Applied Biosystems®), o qual amplifica um total de 11 loci (BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA122, TGLA126, TGLA227 e TGLA53). Os fragmentos gerados pela PCR foram analisados por eletroforese capilar utilizando o analisador genético ABI Prism 3100 (Applied Biosystems®) e o programa GeneScan® v.3.7 (Applied Biosystems®). A freqüência dos marcadores e os índices de variabilidade genética foram calculados utilizando o programa Microsatellite Toolkit v.3.1 e o equilíbrio de Hardy-Weinberg foi determinado através do programa GENEPOP v.3.4. Através destas técnicas foi possível demonstrar que os marcadores moleculares utilizados para identificação genética de bovinos podem também ser utilizados para a realização da técnica de identificação genética de zebuínos Além disso, foi possível demonstrar a freqüência alélica na população de zebuínos analisada como um todo, assim como foi determinada a freqüência alélica para os diferentes marcadores moleculares dentro das 4 raças estudas. Considerando o total de 100 diferentes alelos identificados entre os 11 STR (Short Tandem Repeats) analisados, foi possível observar que a heterozigosidade esperada (He) foi relativamente alta na população analisada, assim como na análise por raça. Estes dados indicam alto grau de diversidade genética nas diferentes raças. Neste sentido, a raça Brahman apresentou a menor diversidade (0,60) e a raça Tabapuã, a maior (0,69). Contudo, estudos complementares são necessários, a fim de confirmar as freqüências alélicas estabelecidas, uma vez que os resultados encontrados no presente trabalho referem-se a um número relativamente pequeno de zebuínos, quando comparados com o total de zebus encontrados no rebanho brasileiro.

Ctenomys lami é um roedor fossorial endêmico de uma região da Planície Costeira do Rio Grande do Sul, Brasil, conhecida como Coxilha das Lombas. Pouco se sabe, ainda, sobre a ecologia, comportamento e genética dessa espécie que foi descrita por Freitas (2001), considerando que esses conhecimentos são fundamentais no entendimento dos intrincados padrões evolutivos da mesma e principalmente do gênero do qual faz parte, tendo em vista que é um dos com maior diversidade de espécies entre os mamíferos. Além da importância na resolução de questões evolutivas, conhecimentos gerais sobre a espécie são necessários para o desevolvimento de planos de conservação e preservação. Este trabalho teve como objetivo identificar relações genéticas dentro e entre três possíveis subpopulações de C. lami através da análise do fluxo gênico (Fst, Fis, rst, Nm), de informações gerais como PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica), média de alelos por locus, heterozigosidade, deficiência de heterozigotos e das relações de paternidade e parentesco. Para isso foram utilizados 89 indivíduos da população (subpopulação A: n=19; B: n=37; C: n=33) de uma área localizada na região de Itapuã, mais exatamente na borda leste da Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), município de Viamão, RS. Para executar a análise genética foram utilizados marcadores de microssatélites descritos para espécies cogenéricas - Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8 desenvolvidas a partir de C. sociabilis e Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12 de C. haigi por Lacey (1999; 2001). Os resultados identificam que há um grande fluxo gênico, demonstrando assim, que não há uma subdivisão significativa entre as subpopulações sugeridas, mas também demonstram que parece haver uma estruturação incipiente, onde a distância e a baixa mobilidade dos indivíduos têm papel fundamental. A verificação da estrutura populacional através da análise de paternidade e parentesco indicou que a baixa variabilidade dos loci estudados impede uma definição real de paternidade e não oferecem dados suficientes para definir estruturação e comportamento dessa espécie. Sugere-se que essa baixa variabilidade seja resultado de um Efeito Fundador ocorrido recentemente na população. / Ctenomys lami was recently described by Freitas (2001) as a fossorial rodent, living only in Coxilha das Lombas, a region of the Coastal Plain of Rio Grande do Sul. The ecology, behavior and genetics of this species are not well known, although such knowledge is essential for understanding the intricate evolution patterns of this species as well as of the genus, which is one with the highest diversity among the mammals. Besides the importance of clarifying the evolution questions, general knowledge about this species is needed for developing conservation strategies. This work has the goal of identifying genetic relationships within and between three possible subpopulations of C. lami through the analysis of (i) genetic flow (Fst, Fis, rst, Nm), (ii) general information like PIC (Polymophic Information Content), allele mean per locus, heterozigosity, heterozygote deficiency and (iii) relatedness among individuals. Eighty-nine individuals from a population (subpopulation A: n=19; B: n=37; C: n=33) were analyzed in the area located in the region known as Itapuã, at the east banks of Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), in Viamão, RS. To execute the genetic analysis, we used microsatellite markers described to cogeneric species (Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12, developed from C. haigi; and Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8, from C. sociabilis) by Lacey (1999; 2001). Results showed that there is high gene flow, and thus the three suggested sub-populations are not significantly divided. However, the population is not structured and the distance and low motility of individuals play an important role in this situation. When verifying the population structure through relatedness analysis, we found that the low variability of the studied loci does not allow a correct definition of paternity, and does not provide enough data to define structure and behavior of this species. We thus suggest that this low variability is an effect of a recent founder effect in this population.

A presença de microssatélites no genoma de Echinococcus granulosus foi verificada utilizando-se oito oligonucleotídeos com repetições como sondas (GT15, CT15, AT15, CG15, CAT10, CAA10, CGG10 e CATA10). Experimentos de hibridização revelaram que as repetições GT, CAA, CATA e CT são as mais frequentes no genoma de E. granulosus. As sondas AT e GC não apresentaram sinais de hibridização. Seis lócus contendo repetições CA/GT, quatro lócus contendo repetições GA/CT e oito lócus contendo repetições AAC/GGT foram clonados e sequenciados. O lócus Egmsca1 foi analisado em 73 isolados do Brasil e da Argentina cujas linhagens haviam sido previamente caracterizadas e em 27 isolados provenientes da Etiópia cujas linhagens ainda não foram identificadas. Os isolados brasileiros da linhagem bovina e os isolados argentinos da linhagem do camelo apresentaram-se monomórficos e compartilharam o alelo (CA)7. Isolados argentinos das linhagens da ovelha e da ovelha da Tasmânia compartilharam dois alelos [(CA)8 e (CA)10] com os isolados brasileiros da linhagem da ovelha. O alelo (CA)11 foi encontrado somente em isolados brasileiros da linhagem da ovelha em uma baixa frequência. O alelo (CA)9 ocorreu apenas em um isolado da Etiópia. As populações brasileira e argentina da linhagem da ovelha foram testadas em relação ao equilíbrio de Hardy-Weinberg e somente a primeira estava de acordo com as expectativas. Protoescólices isolados de um único cisto hidático não apresentaram polimorfismo, validando a utilização de protoescólices de um mesmo cisto, agrupados como um isolado, em estudos populacionais. Um microssatélite contendo repetições de pentanucleotídeos, contido no complexo gênico do snRNA U1, também foi isolado. Este estudo descreve pela primeira vez o isolamento e caracterização de microssatélites em E. granulosus.