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Avaliação da estrutura genética do camarão de água doce em extinção, pitu (Macrobrachium carcinus), no Nordeste como ferramenta para apoiar programas de repovoamento

Tenório, Kláudia Emanuela Ramos 31 January 2012 (has links)
Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-03-13T12:37:33Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) klaudia Tenório_dissert.pdf: 4614858 bytes, checksum: 021b1f22eed5af2baeddeff87f3c6556 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T12:37:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) klaudia Tenório_dissert.pdf: 4614858 bytes, checksum: 021b1f22eed5af2baeddeff87f3c6556 (MD5) Previous issue date: 2012 / O camarão de água doce Macrobrachium carcinus (LINAEUS, 1758) pode ser encontrado em regiões tropicais e subtropicais. No Brasil, está distribuído desde o Pará até Rio Grande do Sul, em rios que deságuam no oceano Atlântico. Esta espécie tem sofrido com a sobrepesca, a poluição ambiental, a destruição dos ambientes naturais, barramento dos rios e riachos, os quais impedem o acesso ao mar impossibilitando o desenvolvimento dos estágios larvais do animal, além da introdução de espécies exóticas, como o M. rosenbergii. Por essas razões, o Ministério do Meio Ambiente (MMA) inseriu o M. carcinus na lista oficial das espécies ameaçadas de extinção em vários estados do Nordeste. Visando fornecer informações para as iniciativas de repovoamento, este estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e estrutura genética, bem como aspectos da ecologia desta espécie em quatro estados do Nordeste (Ceará, Pernambuco, Sergipe/Alagoas e Bahia), utilizando seis marcadores de microssatélites, dados biométricos e análises de conteúdo estomacal. Um total de 143 animais foi coletado, sendo de 32 a 40 animais para cada um dos rios avaliados. Após as análises, o número de alelos variou de dois a 18 alelos, com heterozigosidades médias esperadas e observadas de 0,6256 e 0,5985 respectivamente. Três dos seis loci estão em desequilíbrio de Hardy-Weinberg e apresentam alelos nulos em todas as populações. O valor total de FST foi de 0, indicando ausência de estruturação genética. Os estudos biológicos mostram que o pico reprodutivo mais provável para esta espécie ocorra em fevereiro. A análise estomacal revelou predominância de itens de origem vegetal. Estes resultados sugerem que um único programa de repovoamento poderia fornecer pós-larvas a todos os rios da região Nordeste, diminuindo os custos de operação e garantido que rios distantes de laboratórios de multiplicação também sejam beneficiados.
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Avaliação da estrutura genética do camarão de água doce em extinção, pitu (Macrobrachium carcinus), no Nordeste como ferramenta para apoiar programas de repovoamento

TENÓRIO, Kláudia Emanuela Ramos January 2012 (has links)
Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-04-06T19:32:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-KlaudiaTenório_dissert.pdf: 4615109 bytes, checksum: fd3f355eef0c71a4e121182d43b7657b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-06T19:32:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2012-Dissertação-KlaudiaTenório_dissert.pdf: 4615109 bytes, checksum: fd3f355eef0c71a4e121182d43b7657b (MD5) Previous issue date: 2012 / O camarão de água doce Macrobrachium carcinus (LINAEUS, 1758) pode ser encontrado em regiões tropicais e subtropicais. No Brasil, está distribuído desde o Pará até Rio Grande do Sul, em rios que deságuam no oceano Atlântico. Esta espécie tem sofrido com a sobrepesca, a poluição ambiental, a destruição dos ambientes naturais, barramento dos rios e riachos, os quais impedem o acesso ao mar impossibilitando o desenvolvimento dos estágios larvais do animal, além da introdução de espécies exóticas, como o M. rosenbergii. Por essas razões, o Ministério do Meio Ambiente (MMA) inseriu o M. carcinus na lista oficial das espécies ameaçadas de extinção em vários estados do Nordeste. Visando fornecer informações para as iniciativas de repovoamento, este estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e estrutura genética, bem como aspectos da ecologia desta espécie em quatro estados do Nordeste (Ceará, Pernambuco, Sergipe/Alagoas e Bahia), utilizando seis marcadores de microssatélites, dados biométricos e análises de conteúdo estomacal. Um total de 143 animais foi coletado, sendo de 32 a 40 animais para cada um dos rios avaliados. Após as análises, o número de alelos variou de dois a 18 alelos, com heterozigosidades médias esperadas e observadas de 0,6256 e 0,5985 respectivamente. Três dos seis loci estão em desequilíbrio de Hardy-Weinberg e apresentam alelos nulos em todas as populações. O valor total de FST foi de 0, indicando ausência de estruturação genética. Os estudos biológicos mostram que o pico reprodutivo mais provável para esta espécie ocorra em fevereiro. A análise estomacal revelou predominância de itens de origem vegetal. Estes resultados sugerem que um único programa de repovoamento poderia fornecer pós-larvas a todos os rios da região Nordeste, diminuindo os custos de operação e garantido que rios distantes de laboratórios de multiplicação também sejam beneficiados. / The Macrobrachium carcinus (LINAEUS, 1758) can be found in tropical and subtropical regions. In Brazil, it is distributed from Pará to the Rio Grande do Sul, in rivers that empty into the Atlantic Ocean. This specie has suffered with overfishing, pollution, destruction of natural environments, rivers and streams dams that block the access to the sea, what inhibits the development of larval stages of the animal, and the introduction of exotic species such as M. rosenbergii. Because these reasons, the Brazilian Ministry of Environment (MMA) has inserted the M. carcinus in the official list of endangered species in several Northeastern states like Piauí, Cear, Pernambuco, Alagoas, Sergipe and Bahia. In order to provide information to restocking initiatives, the aim of this study was to assess the genetic diversity and structure, as well as aspects of ecology of this species in four regions of the Brazilian Northeast (Ceará, Pernambuco, Sergipe/Alagoas and Bahia), by the use of six microsatellite markers, biometric data and stomach content analysis. A total of 143 animals was collected, with 32-40 animals for each of the rivers evaluated. After the analyses, the number of alleles ranged from two to 18 alleles, with expected average heterozygosities from 0,6256 and observed average heterozygosities from 0,5985. Three of the six loci are in Hardy-Weinberg disequilibrium and present null alleles in all populations. The total value of FST was 0, what indicates no genetic structuration. Biological studies show that reproductive peak for this species most likely to occur in February. The stomach analysis revealed predominance of plant items.These results suggest that a single restocking program could provide post-larvae to all rivers of Brazilian Northeast, which reduce operating costs and ensure the benefit of the rivers that are distant from multiplication laboratories also.
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Aspectos morfométricos e metabólicos de ovos e larvas de Salminus hilarii (Teleostei: Characidae) provenientes de fêmeas de ambiente natural e cativeiro / Metabolic and morphometric aspects of eggs and larvae of Salminus hilarii (Teleostei: Characidae) from wild and captivity females

Araújo, Bruno Cavalheiro 25 May 2011 (has links)
A tabarana (Salminus hilarii), pertencente à classe Actinopterygii, família Characidae (ordem Characiformes) é uma espécie importante na bacia do Alto Tietê. Devido a suas características migratórias, e a construção de inúmeras barragens no curso de diversos rios desta bacia esta espécie vem sendo foco de diversos programas de repovoamento. Para o desenvolvimento de um programa de repovoamento, dados acerca da biologia e fisiologia reprodutiva da espécie são importantes, pois irão viabilizar uma maior produção de alevinos. Diversos fatores podem interferir diretamente no sucesso reprodutivo de peixes, como a condição alimentar, a temperatura, o fotoperíodo, mas pouco se conhece sobre a influência dos processos de domesticação e confinamento dos reprodutores no desenvolvimento da prole. Este trabalho teve como objetivo investigar possíveis alterações na morfologia, e nos processos de mobilização de substratos energéticos (lipídios, proteínas e ácidos graxos) da prole de Salminus hilarii provenientes de fêmeas de ambiente natural (G1) e de cativeiro (G2), para a condução de um programa de repovoamento na bacia do Alto do Tietê. Foram observadas alterações pontuais na morfologia dos grupos, com ovos e larvas do G1 apresentando um maior comprimento total e bucal quando comparado ao G2. Quantitativamente as larvas dos dois grupos apresentaram um padrão semelhante nas concentrações de lipídios e proteínas no decorrer do desenvolvimento, salvo algumas exceções. Já qualitativamente, foram observadas diversas alterações principalmente nos ácidos graxos das séries Omega 3 (n3) e Omega 6 (n6) da fração neutra, além de um maior sucesso na fertilização dos ovos do G1. Com seu estoque natural praticamente esgotado conclui-se que mesmo o G2 apresentando um resultado zootécnico inferior ao G1 a obtenção de fêmeas do ambiente natural para programas de repovoamento pode resultar em um impacto ainda maior para esta espécie. Desta forma, faz-se necessário um maior investimento em estudos de exigências nutricionais e de seleção genética, para que se aumente o desempenho zootécnico de larvas de fêmeas de cativeiro, sem que haja um dano na variabilidade genética de Salminus hilarii em futuros programas de repovoamento na bacia do Alto do Tietê. / Tabarana (Salminus hilarii) belonging to the Actinopterygii class, Characidae family (order Characiformes) is an important fish species in the Alto Tietê river basin. Due to their migratory characteristics and constructions of several dams on many rivers in this basin, this species has been the focus of several restocking programs. For the development of a restocking program, data on biology and reproductive physiology of the species are important because they will enable a higher production of fingerlings. Several factors may directly affect the reproductive success of fish, as the nutritional condition, temperature, photoperiod, but there are few data available on the influence of the process of broodstock domestication and confinement in the offspring development. This work aimed looking for possible changes in morphology and in the processes of mobilization of energetic substrates (lipids, proteins and fatty acids) in the Salminus hilarii offspring from females from wild (G1) and captivity (G2) for the conduction of a restocking program in the Alto Tietê river basin. Were observed only occasional changes were observed in the offspring morphology between both groups, with G1 eggs and larvae with a greater total and buccal length when compared with G2. Quantitatively the larvae from both groups showed a similar pattern in lipids and proteins concentration during development, with a few exceptions. In the other hand, qualitatively, several changes were observed, mainly in the omega 3 (n3) and omega 6 (n6) fatty acids from the neutral fraction, besides better results in the fertilization rate of G1 eggs. With its natural stock nearly exhausted, we concluded that even the G2 featuring lower zootechnical resulta than G1, obtaining females from natural environmental for restocjing programs can results in an even greater impact for this species. Therefore it is necessary greater investment in studies of nutritional requirements and genetic selection, in order to increase the zootechnical performance of larvae from domesticated females, without serious damage to the genetic variability of Salminus hilarii in future restocking programs in the Alto Tietê river basin.
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Re-introdução do dourado (salminus brasiliensis) nas cabeceiras do Rio dos Sinos: o efeito da densidade sobre a dispersão

Leal, Mateus Evangelista 24 July 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-05T16:20:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 24 / Bolsa para curso e programa de Pós Graduação / O principal objetivo de um programa de repovoamento é a restauração dos estoques naturais. O Rio dos Sinos está listado como um dos oito rios mais poluídos do país e atualmente programas de revitalização estão sendo desenvolvidos para recuperar os danos causados. O dourado (Salminus brasiliensis) é uma espécie ameaçada de extinção no Rio Grande do Sul amplamente estudada na bacia. O estudo tem como objetivo reintroduzir juvenis de dourado nas cabeceiras do Rio dos Sinos e testar o efeito da densidade na dispersão. Na avaliação foi utilizada radiotelemetria, onde nanotags foram introduzidos em 25 dourados, sub-amostra de 200 peixes liberados. Os peixes foram soltos em dois eventos um em menor densidade (0,017 peixes/m-2) e outro em maior densidade (0,040 peixes/m-2). Foram rastreados durante 120 dias. A taxa de permanência foi de 68%, inoperância 20% e emigração de 12%. O pico de deslocamento ocorreu nos dias iniciais à introdução. Os peixes do primeiro evento deslocaram-se menos que os do segundo. Pode-se / The main goal of restocking programs is the natural stocks restoration. The Sinos River are listed as one of the eight most polluted rivers in the country, and now, revitalization programs are being developed to recover the damages. The dorado (Salminus brasiliensis) is an endangered species in Rio Grande do Sul, widely studied in the basin. The objectives of that study is reintroduce dorado juvenile in headwaters of the Sinos River and test the effect of density on displacement. In the assessment was used radiotelemetry, where nanotags were introduced in 25 dorado, sub-sample of 200 fish released. The fish were released at two events, one in a lower density (0.017 peixes/m-2) and another at higher density (0.040 peixes/m-2). Were screened for 120 days. The site fidelity was 68%, 20% inefficiency and emigration 12%. The peak of displacement occurred in the early days of the introduction. The individual’s movements in the first event are less than those of the second. The reintroduction program results were a
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Aspectos morfométricos e metabólicos de ovos e larvas de Salminus hilarii (Teleostei: Characidae) provenientes de fêmeas de ambiente natural e cativeiro / Metabolic and morphometric aspects of eggs and larvae of Salminus hilarii (Teleostei: Characidae) from wild and captivity females

Bruno Cavalheiro Araújo 25 May 2011 (has links)
A tabarana (Salminus hilarii), pertencente à classe Actinopterygii, família Characidae (ordem Characiformes) é uma espécie importante na bacia do Alto Tietê. Devido a suas características migratórias, e a construção de inúmeras barragens no curso de diversos rios desta bacia esta espécie vem sendo foco de diversos programas de repovoamento. Para o desenvolvimento de um programa de repovoamento, dados acerca da biologia e fisiologia reprodutiva da espécie são importantes, pois irão viabilizar uma maior produção de alevinos. Diversos fatores podem interferir diretamente no sucesso reprodutivo de peixes, como a condição alimentar, a temperatura, o fotoperíodo, mas pouco se conhece sobre a influência dos processos de domesticação e confinamento dos reprodutores no desenvolvimento da prole. Este trabalho teve como objetivo investigar possíveis alterações na morfologia, e nos processos de mobilização de substratos energéticos (lipídios, proteínas e ácidos graxos) da prole de Salminus hilarii provenientes de fêmeas de ambiente natural (G1) e de cativeiro (G2), para a condução de um programa de repovoamento na bacia do Alto do Tietê. Foram observadas alterações pontuais na morfologia dos grupos, com ovos e larvas do G1 apresentando um maior comprimento total e bucal quando comparado ao G2. Quantitativamente as larvas dos dois grupos apresentaram um padrão semelhante nas concentrações de lipídios e proteínas no decorrer do desenvolvimento, salvo algumas exceções. Já qualitativamente, foram observadas diversas alterações principalmente nos ácidos graxos das séries Omega 3 (n3) e Omega 6 (n6) da fração neutra, além de um maior sucesso na fertilização dos ovos do G1. Com seu estoque natural praticamente esgotado conclui-se que mesmo o G2 apresentando um resultado zootécnico inferior ao G1 a obtenção de fêmeas do ambiente natural para programas de repovoamento pode resultar em um impacto ainda maior para esta espécie. Desta forma, faz-se necessário um maior investimento em estudos de exigências nutricionais e de seleção genética, para que se aumente o desempenho zootécnico de larvas de fêmeas de cativeiro, sem que haja um dano na variabilidade genética de Salminus hilarii em futuros programas de repovoamento na bacia do Alto do Tietê. / Tabarana (Salminus hilarii) belonging to the Actinopterygii class, Characidae family (order Characiformes) is an important fish species in the Alto Tietê river basin. Due to their migratory characteristics and constructions of several dams on many rivers in this basin, this species has been the focus of several restocking programs. For the development of a restocking program, data on biology and reproductive physiology of the species are important because they will enable a higher production of fingerlings. Several factors may directly affect the reproductive success of fish, as the nutritional condition, temperature, photoperiod, but there are few data available on the influence of the process of broodstock domestication and confinement in the offspring development. This work aimed looking for possible changes in morphology and in the processes of mobilization of energetic substrates (lipids, proteins and fatty acids) in the Salminus hilarii offspring from females from wild (G1) and captivity (G2) for the conduction of a restocking program in the Alto Tietê river basin. Were observed only occasional changes were observed in the offspring morphology between both groups, with G1 eggs and larvae with a greater total and buccal length when compared with G2. Quantitatively the larvae from both groups showed a similar pattern in lipids and proteins concentration during development, with a few exceptions. In the other hand, qualitatively, several changes were observed, mainly in the omega 3 (n3) and omega 6 (n6) fatty acids from the neutral fraction, besides better results in the fertilization rate of G1 eggs. With its natural stock nearly exhausted, we concluded that even the G2 featuring lower zootechnical resulta than G1, obtaining females from natural environmental for restocjing programs can results in an even greater impact for this species. Therefore it is necessary greater investment in studies of nutritional requirements and genetic selection, in order to increase the zootechnical performance of larvae from domesticated females, without serious damage to the genetic variability of Salminus hilarii in future restocking programs in the Alto Tietê river basin.
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Avaliação da estrutura genética do surubim, Pseudoplatystoma corruscans (Actinopterygii: Siluriformes) como subsídio para o repovoamento do submédio São Francisco

DANTAS, Hozana Leite 09 February 2010 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-13T14:39:22Z No. of bitstreams: 1 Hozane Leite Dantas.pdf: 728024 bytes, checksum: e578bad7a4f79d4fe9d1abd9c3ccc3d9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T14:39:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hozane Leite Dantas.pdf: 728024 bytes, checksum: e578bad7a4f79d4fe9d1abd9c3ccc3d9 (MD5) Previous issue date: 2010-02-09 / The São Francisco River is 2700 km long, draining areas of the States of Minas Gerais, Goias, Bahia, Pernambuco, Alagoas, and Sergipe, as well as part of the Federal District. Before the construction of Paulo Afonso Hydroeletric Power Plant, waterfalls of Paulo Afonso (north-eastern Brazil) and its respective lakes already constituted a natural obstacle to fish migration. Nowadays, the construction of hydroelectric dams between medium and submedium São Francisco River associated flooding along rivers, pollution and the introduction of exotic species can alter ecosystems and pose serious threats to native aquatic species, especially those that perform migration for reproduction. One of the most threatened fish migratory species is the Pseudoplatystoma corruscans, a catfish species, locally named surubim. The surubim is the first predator of São Francisco River and it is considered the most appreciated freshwater fish on the north-eastern Brazil. The conservation of freshwater fish species has traditionally been done thought restocking programs. Genetic variability is essential to maintain the capability of restocked fish to adapt to a changing environment. Therefore, if long term persistence of species is the goal that conservation biology is intending to achieve, genetic variability is of the utmost importance to preserve. One approach that have been successfully used in uncovering cryptic population structure in freshwater is microsatellite markers. Samples from three populations were analyzed for six different microsatellite markers. PCR products were separated by agarose gel electrophoresis and stained with silver nitrate. The results showed a wide diversity of alleles for all populations, where a total of 47 alleles were found. The expected heterozygosities showed an average of 0.7498 for the population of Remanso, 0.7142 for the population of Três Marias and 0.7372 for the population of Bom Jesus da Lapa. The average observed heterozygosity were 0.7170, 0.6643 and 0.7132 for the populations of Remanso, Três Marias and Bom Jesus da Lapa respectively. All populations showed loci in deviation from Hardy-Weinberg, but locus Pcor2 was the only one who showed deviation in all populations. The average values of FIS was 0.0348 in Remanso, 0.0583 in Três Marias and 0.0160 in Bom Jesus da Lapa. The fixation index FST obtained was 0.0246, indicating a small degree of differentiation between the populations studied. The universe of alleles shared among populations associated with the low value of FST indicates that this is a panmitic population. These results indicated that breeders can be São Francisco River basin, saving time in restocking programs in terms of growing fish. Hence, this study can now be used as a parameter for the construction of the founder stock to be used in restocking programs or in evaluating the genetic structure of existing stocks founders, as well as monitoring offspring from these programs. / O rio São Francisco apresenta 2700 km de extensão, percorre cinco estados brasileiros e é conhecido como “rio da integração nacional”. Construção de hidrelétricas associadas a outros fatores comprometem os peixes nesse ambiente, principalmente aqueles que efetuam piracema. Dentre esses se destaca o Pseudoplatystoma corruscans, conhecido como surubim ou pintado em algumas regiões, que vêm sofrendo com as problemáticas existentes nesta bacia comprometendo seriamente seus estoques naturais, especialmente na região do Submédio São Francisco. Diante disto se faz necessário investimentos em programas de propagação artificial para a recuperação deste recurso que mantenham a diversidade genética local. O presente trabalho objetivou avaliar a estrutura genética de populações selvagens de surubim do rio São Francisco, através da utilização de marcadores moleculares de microssatélite. Amostras de três populações foram analisadas para seis diferentes marcadores de microssatélite. Os produtos de PCR foram separados por eletroforese em gel de poliacrilamida e corados com nitrato de prata. Os resultados mostraram uma ampla diversidade de alelos para todas as populações sendo encontrados 47 alelos no total. As heterozigosidades esperadas apresentaram média de 0,7498 para a população de Remanso, 0,7142 para a população de Três Marias e 0,7372 para a população de Bom Jesus da Lapa. As médias da heterozigosidade observada foram 0,7170, 0,6643 e 0,7132 para as populações de Remanso, Três Marias e Bom Jesus da Lapa respectivamente. Todas as populações apresentaram loci em desvio do Equilíbrio de Hardy-Weinberg. Os valores médios de FIS encontrados foram 0,0348 para Remanso, 0,0583 para Três Marias e 0,0160 para Bom Jesus da Lapa. O índice de fixação FST obtido foi de 0,0246, indicando um pequeno grau de diferenciação entre as populações estudadas. O universo de alelos compartilhados entre as populações estudadas associados ao baixo valor do FST indicam que se trata de uma população panmítica. Com esse resultado, reprodutores poderiam ser capturados ao longo de toda a extensão do São Francisco reduzindo o tempo de manejo em programas de repovoamento. Este trabalho caracterizou as populações selvagens quanto a sua variabilidade genética, podendo agora ser utilizado como paramêtro para a construção do estoque fundador que será utilizado em programas de repovoamento ou na validação de estoques fundadores já existentes, bem como no monitoramento das progênies desses advindos desses programas.
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Desenvolvimento e validação de microssatélites para estudos genéticos do piau-verdadeiro, Leporinus elongatus (Valenciennes, 1850), na bacia do São Francisco

OLIVEIRA, Karine Kelly Cavalcanti 28 August 2012 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-15T13:46:56Z No. of bitstreams: 1 Karine Kelly Cavalcanti Oliveira.pdf: 775211 bytes, checksum: a252b067bc8c7be94d94fe9b48509a38 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T13:46:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Karine Kelly Cavalcanti Oliveira.pdf: 775211 bytes, checksum: a252b067bc8c7be94d94fe9b48509a38 (MD5) Previous issue date: 2012-08-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The piau-verdadeiro (Leporinus elongatus) is a freshwater fish that inhabits rivers of Paraná-Paraguai and São Francisco basins. Along these regions were built huge dams for power generation, which is hindering the reproductive migration of many species. Populations of L. elongatus have decreased, with greater decline in the region of sub-middlle São Francisco. Many electric companies and government are restocking perform without worrying about ecological principles, so little genetic. These management actions, in the long run, may lead to a decrease in the genetic diversity of these stocks, which can aggravate the adaptation of these populations. In this study, microsatellite markers of L. elongatus were constructed through a genomic library enriched for tetranucleotide motifs (GACA)4 and (GATA)7. Of a total of 14 markers that consistently amplified, seven were monomorphic and seven polymorphic. All markers successfully amplified for L. elongatus, however, for species of the same genus, L. reinhardt and L. taeniatus, only the marker Lelo 12 amplified to L. reinhardt. The seven polymorphic markers were assessed in a wild population of 44 individuals caught in the Upper São Francisco (MG). The number of alleles varied between five (Lelo 20) to 29 (Lelo 13), the observed and expected heterozygoties ranged from 0.568 to 0.977 and from 0.533 to 0.964, respectively. All the markers studied are in Hardy-Weinberg equilibrium and null alleles were not detected, however, two markers, Lelo 4 and Lelo 14 are connected on the same chromosome. These are the first microsatellite markers developed for this species and its characteristics allow it to be used in studies of population genetics, conservation and monitoring of restocking programs of the São Francisco River. / O piau-verdadeiro (Leporinus elongatus) é um peixe de água doce que habita rios das bacias do Paraná-Paraguai e do São Francisco. Ao longo destas regiões foram construídos imensos barramentos para geração de energia, o que vem prejudicando a migraçao reprodutiva de muitas espécies. As populações de L. elongatus têm diminuído, com maior declínio na região do submédio São Francisco. Muitas empresas hidrelétricas e governamentais realizam repovoamento sem a preocupação com princípios ecológicos, tão pouco genéticos. Estas ações de manejo, em longo prazo, podem provocar uma diminuição na diversidade genética destes estoques, o que pode agravar a adaptação destas populações. Neste trabalho, marcadores de microssatélites de L. elongatus, foram construídos através de uma biblioteca genômica enriquecida para motivos tetranucleotídeos (GACA)4 e (GATA)7. De um total de 14 marcadores que amplificaram consistentemente, sete foram monomórficos e sete, polimóficos. Todos os marcadores amplificaram com sucesso para o L. elongatus, no entanto, para espécies do mesmo gênero, L. reinhardt e L. taeniatus, apenas o marcador Lelo 12 amplificou para o L. reinhardt. Os sete marcadores polimórficos foram avaliados em uma população selvagem de 44 indivíduos capturados no Alto São Francisco (MG). O número de alelos variou de cinco a 29, as heterosigozidades observadas e esperadas variaram de 0,568 a 0,977 e de 0,533 a 0,964, respectivamente. Todos os marcadores estudados estão em equilíbrio de Hardy-Weinberg e não apresentaram alelos nulos, entretanto, dois marcadores, Lelo 4 e Lelo 14 estão ligados em um mesmo cromossomo. Esses são os primeiros marcadores de microssatélite desenvolvidos para esta espécie e suas características permitem que sejam usados em estudos de genética populacional, conservação e monitoramento de programas de repovoamento do rio São Francisco.
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Avaliação genética do estoque fundador de surubim, Pseudoplatystoma corruscans (Spix & Agassiz, 1829), para o repovoamento do submédio Rio São Francisco

SANTOS NETO, Miguel Arcanjo dos 29 July 2008 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-16T16:50:10Z No. of bitstreams: 1 Miguel Arcanjo dos Santos Neto.pdf: 268842 bytes, checksum: ffc97fe7f597d810577265479d03c8e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T16:50:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Miguel Arcanjo dos Santos Neto.pdf: 268842 bytes, checksum: ffc97fe7f597d810577265479d03c8e2 (MD5) Previous issue date: 2008-07-29 / The surubim, Pseudoplatystoma corruscans, is one of the most important native fish species in South American hydrographic basins, especially in São Francisco River, where it is considered a top chain predator. Different aspects have contributed to the decline of this species populations, especially at the submedium São Francisco, thus raising the necessity of a restocking program to recover the resource. A basic principle in such programs is that a large number of unrelated wild fish should ideally be used as founders, when possible or, alternatively, a small number of unrelated wild fish with few genetic relatedness could be used. Therefore, the genetic structure of the founder stock constitutes an essencial information to the success of such programs. This project aimed to evaluate the genetic structure of the founder stock of the restocking program of surubim maintained by Chesf in Paulo Afonso city, through the use of microsatellite molecular markers. DNA of 80 breeders were genotyped for 5 different microsatellite markers. PCR products were separated by polyacrylamide gel electrophoresis stained with silver nitrate. Statistical analysis were carried out using GENEPOP software, in which parameters such as number of alleles (A), observed (Ho) and expected heterozygosities (He), Hardy-Weinberg deviation, linkage disequilibrium and inbreeding coefficient (FIS) were calculated. GenAlEx 6.1 was used to calculate the number of effective alleles and relatedness coefficient (rxy). Results showed that the number of alleles ranged between from 6 to 18 and the number of effective alleles, from 3.28 to 9.25. Average observed and expected heterozygosities were 0.63 and 0.84, respectively. All loci, except Pcor5, showed deviation from Hardy-Weinberg equilibrium (P<0,001). Average inbreeding coefficient (FIS) for the 5 loci was 0.24. The analysis of linkage disequilibrium, when corrected by Bonferroni, were significant for loci Pcor21 and Pcor10 (P<0.05). The average relatedness coefficient (rxy) was -0.008 for a total number of 2926 possible pairwise combinations. A great genetic diversity, expressed in number of alleles and in a low value of average relatedness, was obtained despite a deficit of heterozygotes was observed in this stock. Such deficit seems to reflect the strategy adopted in the composition of this stock, in which individuals caught at the medium and lower São Francisco River, separated by two dams, were mixed together. It is feasible to conclude that this founder stock retained genetic diversity comparable to those found in the wild stocks and could be used in a restocking program. / Pseudoplatystoma corruscans (surubim) é um peixe encontrado nas principais bacias hidrográficas sul-americanas, sendo considerado o primeiro predador da bacia do Rio São Francisco. Diversos fatores vêm comprometendo seriamente as populações de surubim no São Francisco, especialmente no submédio, despertando a necessidade de se investir em programas de propagação artificial que recuperem este recurso. Uma premissa básica de tais programas é utilizar um grande número de indivíduos selvagens como estoque fundador, quando possível, ou alternativamente, um número menor de indivíduos selvagens, mas com pouca relação genética de parentesco. A estrutura genética do plantel de fundadores constitui, portanto, uma informação essencial para o sucesso de um programa de repovoamento. O presente trabalho objetivou avaliar a estrutura genética do plantel de fundadores do programa de repovoamento do surubim, a ser desenvolvido pela Chesf em Paulo Afonso, através da utilização de marcadores moleculares de microssatélite. DNA de 80 reprodutores foram analisados para 5 diferentes marcadores de microssatélite. Os produtos de PCR foram separados por eletroforese em gel de poliacrilamida corados com nitrato de prata. As análises estatísticas foram realizadas utilizando-se o programa computacional GENEPOP, onde parâmetros como número de alelos (A), heterozigosidades observada (Ho) e esperada (He), desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg, desequilíbrio de ligação e coeficiente de consangüinidade (FIS) foram calculados. O programa GenAlEx 6.1 foi utilizado para calcular o número de alelos efetivos e o estimador de relação genética (rxy). Os resultados mostraram que o número de alelos variou de 6 a 18 e o de alelos efetivos (Ae), de 3,28 a 9,25. As heterozigosidades médias observadas e esperadas encontradas foram de 0,63 e 0,84, respectivamente. Todos os loci, a exceção do Pcor5, mostraram desvio do equilíbrio de Hardy-Weinberg (P<0,001). O coeficiente de consangüinidade (FIS) médio calculado para os 5 loci foi de 0,24. As análises de desequilíbrio de ligação, quando corrigidas pelo método de Bonferroni, mostraram-se significativas apenas para os loci Pcor21 e Pcor10 (P<0,05). O valor médio do coeficiente de relação genética (rxy) foi de -0,008 para um total de 2926 combinações de possíveis casais. Uma grande diversidade alélica caracterizou o estoque fundador e, muito embora um déficit de heterozigotos tenha sido registrado, uma baixa relação de parentesco foi encontrada para o plantel em questão. Tal déficit parece refletir a estratégia de composição deste plantel em que indivíduos, oriundos do médio e do baixo São Francisco, separados por duas barragens, foram unidos. É possível concluir que o plantel fundador manteve uma diversidade alélica comparável àquela encontrada em estoques selvagens e poderá ser usado em um programa de repovoamento.

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