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Associação dos polimorfismos Gln27, Glu27, Arg16 e Gly16 do gene ADRB2R com asma / Association of the polymorphisms Gln27, Glu27, Arg16 e Gly16 from ADRB2R gene with asthma

Paiva, Ana Carolina Zimiani de 02 December 2007 (has links)
Orientador: Carmen Silvia Bertuzzo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-10T08:44:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paiva_AnaCarolinaZimianide_M.pdf: 1547364 bytes, checksum: 2eadb25c166c68e374144663ac431576 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A asma atópica é uma doença com prevalência média na população brasileira de 20%. Estima-se que 60% dos casos de asma sejam intermitentes ou persistentes leves, 25% a 30% moderados e 5% a 10% graves. O receptor beta-2-adrenérgico, quando ativado, provoca o relaxamento da musculatura lisa das vias aéreas. Os polimorfismos Arg -> Gly 16 (46 A->G) e Gln -> Glu27 (79C->G) do gene ADRB2 provocam uma mudança nos aminoácidos situados ao lado do sítio ligante do receptor. Estes receptores não são responsáveis pela presença da asma, mas agem como moduladores de gravidade da doença. Desse modo, o estudo dos polimorfismos do gene ADRB2 é muito importante para prever a resposta ao uso de broncodilatadores beta-adrenérgicos no tratamento da asma atópica. Os objetivos do trabalho foram: 1) Determinar o genótipo de pacientes asmáticos e voluntários sadios quanto aos polimorfismos Gln27, Glu27, Arg16 e Gly16. 2) Verificar se existe correlação entre o genótipo estudado e a gravidade da asma. Foram genotipados 87 pacientes com asma atópica, de acordo com o critério GINA, e 141 voluntários sadios. Após a extração de DNA do sangue periférico foi efetuada PCR-alelo específica (ARMS). No método de ARMS-PCR é utilizado um primer comum a todas as reações e outro alelo específico,isto é, apenas uma base nitrogenada é diferente. Além disso é utilizado um par de primers como controle interno da reação. Os resultados encontrados foram analisados através do teste de qui-quadrado. Amostra de pacientes quanto ao códon 16 não está em equilíbrio de Hardy-Weinberg, entretanto a amostra controle está. No códon 27, ambas as amostras estão em desequilíbrio. A diferença na freqüência dos alelos no códon 16 entre os pacientes e o grupo controle foi significativa, enquanto no códon 27 não. Na comparação entre os diferentes genótipos no códon 16 dos asmáticos e do grupo controle foi observada diferença significativa, modtrando que o alelo Arg 16 pode estar envolvido na etiologia da asma. Comparando-se os pacientes com asma grave e grupo controle, foi encontrada uma diferença significativa, assim como quando comparados os pacientes com moderada, também sendo encontrada diferença significativa quando comparados os pacientes leve. No códon 27 verificou-se diferença significativa entre os genótipos dos pacientes e voluntários sadios. Comparando-se os pacientes com asma grave e grupo controle foi encontrado uma diferença significativa, assim como quando comparados os pacientes com moderada, também sendo encontrada diferença significativa quando comparados os pacientes leve. Na verificação dos genótipos do grupo controle e do total de pacientes temos uma diferença significativa. Na comparação entre os grupos de asmáticos só tivemos diferença significativa entre o grupo de asma grave e leve. Na comparação de asma grave e moderada não tivemos diferença significativa assim como moderada e leve. Os genótipo homozigotos Arg 16 parece estar relacionada à presença da asma e homozigotos Gln 27 parecem estar associados com a gravidade da asma / Abstract: The atopic asthma is an illness with 20% of average prevalence in the Brazilian population. It?s estimated that 60% of the asthma cases are intermittent or persistent light, 25% to 30% moderate and 5% to 10% serious. The receptor beta-2-adrenergic, when activated, causes the relaxation of the aerial ways' smooth muscle. The polymorphisms Arg -> Gly 16 (46 A->G) and Gln -> Glu27 (79C->G) from the ADRB2 gene cause a change on amino acids situated beside the receptor?s linking place. These receptors are not responsible for the asthma?s occurrence, but they act as modulators of the illness? severity. In this way, the study of the ADRB2 gene's polymorphisms is very important to foresee the reply of using beta-adrenergic bronchodilators in the treatment of the atopic asthma. The objectives of the proceeding were: 1) Determinate the genotype of healthy and asthmatic voluntary patients in respect of the polymorphisms Gln27, Glu27, Arg16 and Gly16. 2) Verify if there is a correlation between the studied genotype and asthma?s severity. 87 patients with atopic asthma were genotyped, in accordance with the healthy criterion GINA, and 141 volunteers. After the extraction of peripheral blood's DNA, an specific PCR-allele (ARMS) was made. In the ARMS-PCR method, it is used a common primer for all the reactions and another specific allele, that means, only one base is different. Moreover, a pair of primers is used as internal control of the reaction. The achieved results were analyzed through the qui-square test. The patients' sample, according to codon 16, is not in Hardy-Weinberg equilibrium, while the control sample is. In codon 27, both of the samples are in disequilibrium. The difference in the frequency of alleles in codon 16 between the patients and the control group was significant, while in codon 27 not. In the comparison between the different genotypes in codon 16 of the asthmatic and the control group, significant difference was observed, showing that the Arg 16 allele can be involved in the asthma's etiology. Comparing the patients with serious asthma and the control group, significant difference was found, as well as when compared the patients with moderate, also being found significant difference when compared the patients with light. In codon 27, significant difference was verified between the genotypes of patients and healthy volunteers. Verifying the genotypes of the control group and the total of patients, we have a significant difference. In the comparison between the asthmatic groups, we only had significant difference between the serious asthma group and the light one. In the comparison between serious and moderate asthma, we didn?t have significant difference, as well as between moderate and light. The genotype homozygote Arg 16 seems to be related to the asthma's occurrence and homozygote Gln 27 seems to be associated with the asthma?s severity / Mestrado / Mestre em Farmacologia
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Constructing confidence regions for the locations of putative trait loci using data from affected sib-pair designs

Papachristou, Charalampos. January 2005 (has links)
Thesis (Ph. D.)--Ohio State University, 2005. / Title from first page of PDF file. Document formatted into pages; contains xv, 122 p.; also includes graphics. Includes bibliographical references (p. 117-122). Available online via OhioLINK's ETD Center
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Diferenças etnicas na distribuição de variantes geneticos da sintase endotelial do oxido nitrico / Ethinic differences in the distribution of nitric oxide endothelial synthase genetic variants

Marroni, Aline Saldanha 18 January 2006 (has links)
Orientador: Jose Eduardo Tanus dos Santos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-08T15:28:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marroni_AlineSaldanha_M.pdf: 1836719 bytes, checksum: 5a5cf29a17694aeb363b6061e74f525c (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: O óxido nítrico (NO) é um gás solúvel com importantes papéis fisiológicos. Alterações na biodisponibilidade de NO contribuem para o desenvolvimento de vários estados fisiopatológicos, tais como hipertensão arterial, aterosclerose, doença coronariana e hipertensão pulmonar. A importância do NO no controle cardiovascular levou a estudos visando avaliar se polimorfismos do gene da eNOS estão associados com doenças cardiovasculares. Três polimorfismos de interesse clínico do gene da eNOS têm sido estudados: T ?786C na região promotora, 4a/4b no íntron 4 e Glu298Asp no éxon 7. Diversos estudos têm apresentado resultados contraditórios sobre a associação desses polimorfismos com doenças cardiovasculares. Demonstrou-se que numa população dos EUA, estes variantes genéticos apresentam acentuada diferença étnica em sua distribuição. Não se sabe se na população brasileira ocorrem essas mesmas diferenças étnicas na distribuição de variantes da eNOS observadas na população americana. O objetivo desse trabalho foi avaliar a freqüência desses polimorfismos em voluntários diferentes etnicamente (136 negros e 154 brancos) na população brasileira. Também foi estimada a frequência haplotípica e a associação entre os variantes genéticos. A amplificação do DNA genômico foi feita por Reação de Polimerase em Cadeia (PCR) e os genótipos foram determinados por eletroforese em gel de poliacrilamida. O variante Asp298 foi mais comum em brancos (32.8%) que em negros (15.1%)(P<0.004). De modo similar, o variante C-786 foi mais comum em brancos (41.9%) que em negros (19.5%)(P<0.0004). Já o variante 4a foi mais comum em negros (32%) que em brancos (17.9%)(P<0.003). O haplótipo mais comum em ambos grupos étnicos era aquele que combinava os variantes comuns. O segundo haplótipo mais comum em negros incluía o variante 4a e os variantes não polimórficos para os outros dois polimorfismos. Nos indivíduos brancos, entretanto, o segundo haplótipo mais comum incluía os variantes Asp298 e C-786 e o variante comum para o polimorfismo do íntron. Essa acentuada diferença é similar àquela demonstrada na população americana. Esses achados sugerem haver uma consistente diferença interétnica na distribuição desses variantes genéticos da eNOS em negros e brancos da população brasileira. Essas diferenças podem estar associadas às disparidades étnicas observadas com relação às doenças cardiovasculares e resposta a drogas / Abstract: Nitric oxide (NO) is a soluble gas with fundamental physiologic role. Alterations in NO bioavalability contribute to the development of many diseases such as hypertension, atherosclerosis, coronary artery disease and pulmonary hipertension. The pivotal role of NO in the regulation of the cardiovascular system has motivated studies to assess whether polymorphisms in the eNOs gene are associated with cardiovascular diseases. Three specific polymorphisms in the eNOS gene have been widely studied : T-786C in the promoter region, 4a/4b in intron 4 and Glu298Asp in exon 7. Several studies have associated inconsistently these polymorphisms with cardiovascular diseases. In an American population these variants show interethnic differences in their distribution. However, we don?t know whether there are the same differences in the brazilian population. To test this possibility, we examined the distribution of genetic variants in 136 black and 154 white subjects from a Brazilian population. We also estimated the haplotype frequency, and evaluated associations between these variants. The Asp298 variant was more common in in whites (32.8 %) than in blacks (15.1%)(P<0.004). Similarly, the C-786 variant was more common in whites (41.9%) than in blacks (19.5%)(P<0.0004). However, the 4a variant was more common in blacks (32.0%) than in whites (17.9%)(P<0.003). The most common predicted haplotype in both ethnic groups combined only wild type variants. While the second most common haplotype in blacks includes the variant 4a and the wild-type variants for the remaining polymorphisms, the second most common haplotype in whites includes the variants Asp298 and C-786 and the wild-type variant for polymorphism in intron 4. The marked interethnic differences that we found in Brazilians are very similar to that previously reported in Americans. These findings strongly suggest a consistent difference in the distribution of eNOS genetic variants in blacks compared with whites in brazilian population. These findings may explain in part the ethnic disparities in cardiovascular risk and response to drugs / Mestrado / Mestre em Farmacologia
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A correlation of genotype and phenotype in myositis

Chinoy, Hector January 2007 (has links)
Aims: To elucidate the aetiopathological mechanisms underlying the IIMs, through a combination of genotyping, serotyping and clinical phenotyping in a large cohort of Caucasian idiopathic inflammatory myopathy (IIM) patients. Methods: A cross-sectional study of prevalent IIM cases, ascertained through the Adult Onset Myositis Immunogenetic Collaboration, was performed. Cases were confirmed as possessing myositis according to Bohan and Peter (Bohan and Peter 1975a; Bohan and Peter 1975b). IIM clinical subtypes studied included polymyositis (PM), dermatomyositis (DM) and myositis associated with other connective tissue disease (myositis/CTD-overlap). Genotyping of major histocompatibility complex genes, including HLA-B, -DR, -DQ, tumour necrosis factor alpha (TNF-α), was performed using commercial kits. Serotyping of a comprehensive range of myositis specific/associated antibodies (MSA/MAAs) was undertaken. Results: Clinical subsets are described within the serological groupings, suggesting that the classification of the IIMs appears to be better served by the serotype than by the clinical subgrouping of disease. The IIMs possess HLA class I and II haplotype associations and genetic differences observed between PM and DM are accounted for by serological differences. The TNF-308A association is not independent of HLA class I, due to the strong LD within the MHC, but does form part of a haplotype with these factors. An absence of routinely tested for MSA/MAAs makes cancer associated myositis (CAM) more likely, especially in the DM subgroup. An antibody against a 155 and 140kDa doublet is associated with the development of CAM. Outcome measures in the IIMs show construct validity. HLA-DRB1*07 appears to predict a milder clinical phenotype with less disability. No convincing gene-environmental interaction was found capable of altering disease susceptibility or clinical phenotype. Conclusions: Myositis disease subtypes therefore appear to be defined by specific haplotypes acting as risk factors for the development of various MSAs and MAAs.
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Avaliação clinico-laboratorial e estudo da associação entre dois polimorfismos na região promotora do gene VEGF em pacientes diabeticos tipo 1 com e sem retinopatia diabetica proliferativa / Diabetes Mellitus Type 1, proliferative diabetic retinopathy, vascular endothelial growth factor, single nucleotide polymorphisms

Assis, Nilma Almeida de 31 August 2006 (has links)
Orientador: Carlos Eduardo Steiner / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-07T13:53:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Assis_NilmaAlmeidade_M.pdf: 1405023 bytes, checksum: 12e3861c31dae0e759ab571d2d029476 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A retinopatia diabética é uma complicação freqüente no diabetes melito tipo 1, acometendo quase a totalidade de pacientes, em graus variados, após 20 anos de doença. A interferência de fatores ambientais como a manutenção de um estado hiperglicêmico na sua fisiopatologia já foi comprovada, mas ainda não foi esclarecido porque alguns pacientes desenvolvem essa complicação de maneira grave e precoce. Nos últimos anos, diversos estudos têm sugerido a participação de fatores genéticos nesse processo. O fator de crescimento endotelial vascular (VEGF), potente indutor da angiogênese, foi associado à retinopatia diabética por alguns autores, pelo aumento da sua expressão, em virtude de mutações em sua região promotora. Neste trabalho foi realizada uma avaliação clínico-laboratorial, a análise do SNP rs833061 (- 460) e a pequisa da deleção de 18 pares de bases em -2549, ambas na região promotora do gene VEGF em 114 pacientes com diabetes melito tipo 1, de três centros de referência em diabetes no Brasil ¿ Hospital das Clínicas da Unicamp, Instituto Estadual de Diabetes e Endocrinologia Luiz Capriglione (RJ) e Santa Casa da Misericórdia de São Paulo (SP). Houve associação entre retinopatia diabética proliferativa e nefropatia, porém nenhum paciente apresentou a deleção em -2549, nem o alelo -460 C em homozigose. Tais resultados sugerem que esses polimorfismos na região promotora do gene VEGF não interferem na predisposição à retinopatia diabética na população estudada e que outros agentes ambientais e/ou genéticos devem ser significativos / Abstract: Diabetic retinopathy is a frequent complication of diabetes mellitus type 1 and almost all patients develop it after twenty years of disease. The causes of these complications are not clear, but several environmental factors such as chronic hyperglicaemia may act in this predisposition, however, it is not clearly understood why some individuals develop it in a severe and precocious way. The participation of genetic factors as the vascular endothelial growth factor (VEGF), a potent angiogenic mediator, was already confirmed for some authors. In this study we investigate whether polymorphisms in VEGF gene are associated with proliferative diabetic retinopathy. One hundred-fourteen patients with diabetes mellitus type 1 underwent a clinical and laboratorial study, as well as the analysis of two polymorphisms: rs833061 and the deletion of 18 bp at -2549 both on the promoter region of the VEGF gene. There was an association between nephropathy and retinopathy in our patients but none of the individuals presented the deletion at -2549 or the allele C in rs833061 in homozygous state. These results suggest that such polymorphisms in the promoter region of the VEGF gene do not interfere in the predisposition to diabetic retinopathy in our population and that other environmental and/or genetic factor may be more relevant / Mestrado / Genetica Medica / Mestre em Ciências Médicas
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Investigação da associação de polimorfismos em genes do metabolismo lipídico com o estado periodontal e perfil bioquímico do paciente /

Nicchio, Ingra Gagno. January 2020 (has links)
Orientador: Raquel Mantuaneli Scarel Caminaga / Resumo: Globalmente continua-se a buscar evidências de suscetibilidade genética à periodontite (P), pois as variações genéticas entre as diferentes etnias costumam influenciar em tal suscetibilidade. Também há grande interesse em compreender melhor as inter-relações da periodontite com patologias como o Diabetes Mellitus tipo 2 (T2DM, type 2 Diabetes Mellitus) e a Dislipidemia. Devido a similaridades na etiopatiogenia dessas doenças, levantamos a hipótese que genes do metabolismo lipídico estão associados com o desenvolvimento da P e do T2DM. O objetivo deste estudo foi investigar polimorfismos em genes do metabolismo lipídico relacionando-os com o estado periodontal e perfil glicêmico e lipídico do paciente para avaliar se estes estão associados com a P na presença ou não de T2DM. Considerando o cálculo amostral, foram investigados: pacientes com T2DM e periodontite severo ou moderada (Grupo T2DM_P, n=205 pacientes); pacientes sem T2DM com periodontite severo ou moderada (Grupo Periodontitis, n=345); e pacientes sem T2DM e sem periodontite, ou seja, sistemicamente e periodontalmente saudáveis (Grupo Healthy, n= 343). Assim, o Grupo Periodontitis foi considerado controle para o T2DM e o Grupo Healthy foi considerado controle para a T2DM e P. Após o exame periodontal completo, aos participantes deste estudo foi oferecida a realização de exames bioquímicos (perfil glicêmico e lipídico), mesmo para os pacientes diagnosticados pelo seu médico como afetados pelo T2DM. Foram obtidas célula... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Globally, we continue to seek detection of genetic susceptibility to periodontitis (P), as genetic changes between different ethnicities tend to influence susceptibility. Also, there a strong interest from the scientific community to better understand interrelationships between periodontitis and conditions such as Diabetes Mellitus Type 2 (T2DM) and Dyslipidemia. Due to similarities in the etiopathogenesis of these diseases, we hypothesized that genes of lipid metabolism are associated with the development of P and T2DM. This study aimed to investigate polymorphisms in the lipid metabolism genes, relating them to the periodontal state and the patient's glycemic and lipid profile to assess whether these associated are associated with a presence or not of T2DM. For sample calculation, we investigated: patients with T2DM and severe or moderate periodontitis (T2DM_P Group, n = 205 patients); patients without T2DM with severe or moderate periodontitis (Periodontitis Group, n = 345); and patients without T2DM and without periodontitis, or periodontally healthy (Group Healthy, n = 343), which are systemically and periodontally healthy. Thus, the Periodontitis Group was considered control for T2DM and the Healthy Group was considered control for T2DM and P. After a complete periodontal exam of the contributors, they were offered biochemical exams (glycemic and lipid profiles) even for that patients that were diagnosed by their doctor as affected by T2DM. Oral mucosa cells were obtain... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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