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Ce travail avait pour objectif d'évaluer la perception catégorielle de la parole (PC) et les liens qu'elle entretient avec l'apprentissage de la lecture et les difficultés de cet apprentissage. Les études ont porté sur des continua de voisement (VOT) et de lieu d'articulation (transitions de F2 et F3). Trois critères ont été utilisés pour évaluer la PC : la perception catégorielle relative, l'effet de frontière phonémique et la précision catégorielle. Cinq études ont été effectuées, 3 sur le voisement (études 1, 2 et 3), 1 sur le lieu d'articulation (étude 4) et 1 sur voisement et lieu (étude 5). L'étude 1, dans laquelle ont été suivis de 6 à 8 ans des enfants qui étaient non lecteurs à 6 ans, a permis de relever un effet de l'âge et/ou de l'apprentissage de la lecture sur la PC. L'effet du niveau de lecture sur la PC a été également relevé dans l'étude 2, qui a permis de constater que des dyslexiques de 10 ans, comparativement à des normolecteurs de même âge, présentaient un déficit de PC, et plus spécifiquement un mode de perception allophonique. L'étude 3 a en plus mis en relief le fait que le déficit de PC était persistant, étant donné qu'il a été observé chez des dyslexiques relativement âgés (17 ans). Les travaux sur le trait de voisement suggèrent que la perception allophonique résulterait d'un déficit de couplage entre prédispositions phonétiques au cours du développement perceptif. Nous avons confirmé cette hypothèse pour le trait de lieu d'articulation dans l'étude 4, qui a porté sur des adultes. Dans la dernière étude, nous avons proposé à des dyslexiques de 8 à 10 ans des entraînements qui avaient pour objectif de « corriger » leur déficit de perception allophonique. Cette tentative a échoué, ce qui indique que ce déficit est résistant à la remédiation. Ces résultats suggèrent que la perception allophonique serait à l'origine des difficultés de lecture des dyslexiques, ce mode de perception entravant l'établissement des correspondances graphèmes-phonèmes, condition sine qua non de l'apprentissage de la lecture.

L’identification des mutations constitutionnelles à l’origine d’une prédisposition génétique au cancer est essentielle à la prise en charge médicale des patients et de leurs familles. Depuis l’implémentation des technologies de séquençage à haut-débit dans les laboratoires diagnostiques, le principal défi n’est plus la détection des variations génétiques mais leur interprétation et leur classification. La question de l’interprétation de la variation est particulièrement cruciale lorsqu’elle conditionne la stratégie thérapeutique. Ainsi, il est essentiel de disposer de tests simples adaptables en routine diagnostique pour faciliter l’interprétation des variations génétiques. Dans ce contexte, nous avons utilisé un test fonctionnel développé par notre équipe pour classer des variations dans le gène TP53 à l’origine du syndrome de Li-Fraumeni et pour appréhender la corrélation génotype - phénotype chez les patients LFS. Dans un deuxième temps, nous avons évalué la pertinence d’une approche multi-omique (RNA-Seq et métabolomique) pour discriminer les cellules sauvages des cellules avec mutation hétérozygote du gène TP53 ou des gènes BRCA impliqués dans la prédisposition génétique aux cancers du sein et de l’ovaire. Sur la base des données de transcriptome, un modèle mathématique a été développé pour détecter les variants correspondant à des mutations délétères. Nous avons ensuite sélectionné les biomarqueurs les plus discriminants pour les intégrer dans un test fonctionnel de RT-MLPA dédié à la voie p53. Nous avons enfin adapté cet essai pour qu’il soit réalisable sur une simple prise de sang, sans immortalisation des lymphocytes du patient. / The identification of the constitutional mutation responsible for a genetic predisposition to cancer is essential to the clinical management of the patient and its relatives. With the implementation of high-throughput sequencing to the diagnostic routine of these pathologies, the challenge no longer lies within the detection of alterations but in their biological and clinical interpretation. While specific treatments are emerging, simple functional assays to help with the interpretation of the detected variants are needed. In this context, we used a functional test developed by our team to classify variations in the TP53 gene responsible for Li-Fraumeni syndrome and to understand the genotype-phenotype correlation in LFS patients. On the other hand, we assessed the relevance of a multi-omic approach (RNA-Seq and metabolomics) to discriminate wild-type cells from cells with a deleterious heterozygous mutation in TP53 or in the BRCA genes implicated in genetic predisposition to breast and ovarian cancers. Based on the transcriptomic data, a mathematical model has been developed to detect variants corresponding to deleterious mutations. Then we selected the most discriminating biomarkers and integrated them into a RT-MLPA functional assay dedicated to the p53 pathway. We finally adapted this test to be feasible on a simple blood test, without immortalization of the patient's lymphocytes.