Orientadores: Luiz Octavio Marcondes Machado, Gabriel Corrêa Costa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-19T15:46:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Araujo_CarlosBarrosde_D.pdf: 15759383 bytes, checksum: 3888b2cb944f52bf1ab91fa7eb9cebb4 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: O bioma Cerrado é um hotspot de conservação que se encontra em grande risco devido à agricultura ou pastagens. Levando-se em conta que alguns grupos têm maior risco de extinção, e este parece ser o caso dos Psittacidae, e ainda que por muito tempo não havia informações disponíveis sobre essas espécies, a situação era crítica. Isso, no entanto, vem lentamente mudando, e graças ao trabalho de algumas universidades brasileiras já existem informações disponíveis sobre o grupo. Neste trabalho usamos dados adquiridos em campo no Cerrado Central (DF e GO), e também dados presentes na literatura para investigar a alimentação, distribuição de potencial e também a comunicação sonora do grupo. Examinamos a existência de padrões de alimentação entre estas espécies, e também se a dieta pode ser um bom preditor da sua distribuição. Investigamos também a comunicação sonora quanto a presença de chamados específicos para a espécie, dado o grande número de espécies presentes no Cerrado. Também investigamos o alcance de comunicação destas espécies, bem como o impacto que o ruído humano pode ter nesse alcance / Abstract: The Cerrado biome is a conservation hotspot that is currently at great risk, due to agriculture or pasture. On the other hand, some groups have more risk of extinction. That seems to be the case of Psittacidae, as they are one of the most threatened bird groups of the world. For a long time there were no information available on these species, so that the situation was critical. This is slowly changing, and thanks to the work of some Brazilian universities there are now some information available on the group. In this work we use new data acquired at the Central Cerrado, and also data present in literature, to further investigate the feeding, potential distribution and also the sound communication of the group. We examine the existence of feeding patterns among these species, and also if diet may be a good predictor of the species distributions. We also investigate the sound communication. We examine the presence of specific calls for the species, the range of communication of these species, and also the impact that human noise may have in their sound communication / Doutorado / Ecologia / Doutor em Ecologia

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Andrea de M Carvalho.pdf: 1444862 bytes, checksum: 3bf8e2770c660abde140e4d1818cf624 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / The investigation of pathogens in wild animals can be considered an important tool for conservation of species and ecosystem. Chlamydiosis was first identified and is a common disease in psittacines. It is considered the most important zoonosis spread by these birds. Due to its infectious nature, this disease is studied all around the world. The mycoplasmosis is a common respiratory disease in pigeons, chickens and birds. However, parrots can be affected if they get in contact with the agent, and they can become a source of infection for the environment and for other birds. This study aimed to identify, through the polymerase chain reaction PCR technique, bacteria Chlamydophila spp., Mycoplasma gallisepticum and M. synoviae in captivity parrots in three different facilities in Goiás state: CETAS Centro de Triagem de AnimaisSilvestres, a conservation and a comercial captivity. The results were compared in order to determine wich facility is more perserved or contaminated by pathogens. For Chlamydophilaspp, CETAS facility showed 25.6% of positive samples, while the commercial captivity showed 26.4%, and the conservation captivity had no positive samples (0%). For the presence of Mycoplasma gallisepticum, CETAS presented 21.62% of positive samples, while the commercial and conservation captivity showed 15.7% and 14% of positive samples, respectively. M. synoviae was almost absent in CETAS (2.7%) and in conservation captivity (1.3%), and absent in commercial captivity (0%). The results found were compared using Fischer s exact test, where CETAS and commercial captivity were more infected than conservation captivity. The bacteria studied were present in different species of parrots, especially on the genera Ara, Aratinga and Amazonas. The presence of Chlamydophila and Mycoplasma sp. should be investigated in captive birds, since it reveals the presence of the agents in the population, allowing its control. / A investigação de agentes patológicos em animais silvestres é uma importante ferramenta na conservação das espécies e do ecossistema. A clamidiose é uma doença frequente em psitacídeos, onde foi isolada pela primeira vez, considerada a zoonose de maior importância transmitida por essas aves. Devido a seu caráter infeccioso essa enfermidade é estudada em todo o mundo. A micoplasmose é uma doença respiratória frequente em pombos, galinhas e pássaros. No entanto, psitacídeos podem ser acometidos caso entrem em contato com o agente, podendo se tornar fonte de infecção para o ambiente e para outras aves. Esse trabalho teve como objetivo a identificação, pela técnica da reação em cadeia da polimerase PCR, dos agentes bacterianosChlamydophila spp.,Mycoplasma gallisepticum e M. Synoviae, em psitacídeos de cativeiro em três estabelecimentos diferentes no estado de Goiás: o CETAS Centro de Triagem de Animais Silvestres, um criadouro comercial e outro conservacionista. Para a presença de Chlamydophila as amostras do CETAS foram reagentes em 25,6% das amostras enquanto o criadouro comercial 26,4%, o conservacionista (0,0%) não teve amostras positivas. Para a presença de Mycoplasma gallisepticum as aves do CETAS reagiram em 21,62% das amostras, enquanto aves do criadouro comercial e do conservacionista reagiram em 15,7% e 14%, respectivamente. A presença deM. synoviae foi baixa nos cativeiros estudados, sendo essa de 2,7% para o CETAS, 1,3% para o criadouro conservacionista e 0,0% para o comercial. A diferença entre os resultados encontrados por propriedade foi comparada utilizando o Teste Exato de Fisher, sendo que o CETAS e o criadouro comercial apresentaram mais animais infectados do que o criadouro conservacionista. As bactérias estudadas estiveram presentes em diferentes espécies de psitacídeos com destaque para os gêneros Ara,Amazonase Aratinga. A presença de Chlamydophilae Mycoplasmasp. deve ser investigada em aves em cativeiro, uma vez que revela a ocorrência dos agentes na população, permitindo o seu controle.

Anodorhynchus leari é uma ave endêmica do Bioma Caatinga e um dos psitacídeos mais ameaçados de extinção na região neotropical. Ela se reproduz apenas em formações rochosas de arenito-calcário, localizadas em dois sítios protegidos no norte do estado da Bahia; a Estação Biológica de Canudos (Toca Velha) e a Estação Ecológica do Raso da Catarina (Serra Branca). Este estudo teve por objetivo agregar informações sobre a história natural da arara-azul-de-lear, com ênfase em suas atividades reprodutivas. No Capítulo 1 descreve-se a estrutura e a disposição das cavidades encontradas nos paredões da Estação Biológica de Canudos, as quais foram acessadas internamente por meio do método de rapel. Verificou-se que os ninhos das araras estão em túneis ou salões/galerias amplos e profundos, locais formados naturalmente por ações de intempéries nas formações rochosas de 53m de altura vertical em média. Definitivamente as cavidades com ninhos não são confeccionadas ou alteradas pelas araras, para fins reprodutivos. Na área estudada existem muitas cavidades com as mesmas condições ambientais internas. No mesmo sítio, entre os anos de 2008 e 2011, foram localizadas 38 cavidades ativas. No Capítulo 2 buscou-se descrever detalhadamente a biologia reprodutiva da arara-azul-de-lear, monitorando-se internamente 18 destas cavidades. Ao final da quarta temporada reprodutiva 42 ninhadas foram estudadas. O período reprodutivo ocorreu entre os meses de dezembro e julho e a maior parte das ninhadas possuía três ovos. Por meio de ovoscopia verificou-se uma média de dois ovos embrionados por ninhada. Em quatro anos, 68 ninhegos eclodiram e destes, 83% sobreviveram até o primeiro vôo. Apesar de ser possível gerar e criar três filhotes por ninhada, em média apenas um filhote foi criado. O sucesso reprodutivo nos quatro anos amostrados foi de 71%, conforme o Protocolo de Mayfield e considerando-se 14 semanas como tempo médio de desenvolvimento dos ninhegos. Apesar de ocorrerem em casos isolados e serem pouco significativas, as causas da não ocupação de ninhos ou mortalidade no desenvolvimento estiveram relacionadas à presença de abelhas Apis sp. dentro das cavidades, perturbação causada por competição intra-específica associada à assincronia de eclosão, e à queda de ninhegos dos ninhos. No capítulo 3 infere-se sobre o recrutamento nos dois sítios reprodutivos conhecidos, Toca Velha e Serra Branca, com base em avistamentos de 118 ninhegos na entrada dos ninhos. Foram identificadas 114 cavidades potencialmente reprodutivas entre os anos de 2009 e 2010. A maioria dos ninhegos foi avistada no mês de abril nas duas temporadas reprodutivas. Sugere-se que um máximo de 228 indivíduos esteja em atividade reprodutiva, o que representa 20,17% da população de araras estimada em 2010. Conclui-se que a espécie deva ser categorizada como \"em perigo de extinção - EN\", segundo a aplicação dos critérios da IUCN. A ameaça mais importante para a espécie reside na falta de proteção nas áreas de alimentação. É fundamental ainda a continuidade de ações educativas e da rigorosa proteção dos sítios reprodutivos já conhecidos, além de esforços para buscar novas áreas potenciais para a reprodução, e que podem justificar o aumento populacional observado ao longo dos anos. Os dados obtidos possibilitam criar estratégias de manejo para incrementar a taxa reprodutiva, e também contribuir para a proteção dos sítios de nidificação da arara-azul-de-lear. / Anodorhynchus leari is endemic to the Caatinga and one of the most endangered psitacidae in the Neotropics. It reproduces only in sandstone/limestone formations, located in two protected sites in the northern region of the state of Bahia, the Biological Station of Canudos (Toca Velha) and the Ecological Station of Raso da Catarina (Serra Branca). This study aimed to gather information about the natural history of Lear\'s, with emphasis on their reproductive activities. In Chapter 1 it is described the structure and arrangement of cavities found in the walls of the Canudos Biological Station (Toca Velha), which were accessed internally by the method of rappelling. It was found that the nests of the macaws are in tunnels or rooms/galleries large and deep, naturally formed by local actions of weathering rock formations in the vertical height of 53 m on average. Definitely the nest cavities are not made or altered by macaws, for reproductive purposes. In the study area there are many holes with the same environmental conditions inside. In the same place, between the years 2008 and 2011, 38 active cavities were located. In Chapter 2 we sought to describe in detail the reproductive biology of Lear\'s Macaw, by monitoring these 18 internal cavities. At the end of the fourth breeding season 42 were studied. The reproductive period occurred between the months of July and December and most nests had three eggs. An average of two fertilized eggs per clutch. In four years, 68 nestlings hatched and of these, 83% survived until the first flight. Although it is possible to generate and create three chicks per nest on average only one chick was raised. The reproductive success in the four sampled years was 71%, following the Mayfield Protocol and considering 14 weeks as the average time of nestlings\' development. Although isolated, not significant cases occurred, the causes of non-occupation of nests in the development or mortality were related to the presence of bees, Apis into the cavities, a disruption caused by intraspecific competition associated with hatching asynchrony, and the fall of nestlings from the nest. In chapter 3 we infer about the recruitment in the two known breeding sites, Toca Velha and Serra Branca, based on sightings of nestlings in the nest entrance. We identified 114 potentially reproductive cavities between the years 2009 and 2010. Most nestlings were sighted in the month of April in the two reproductive seasons. It is suggested that a maximum of 228 individuals are in reproductive activity, which represents 20.17% of the estimated population of macaws in 2010. It is concluded that this species should be categorized as \"endangered - EN,\" according to the application of the IUCN criteria. The most important threat to the species is the lack of protection in the feeding areas. It is also essential the continuity of educational activities and rigorous protection of known breeding sites, and efforts to seek new potential areas for reproduction, which may justify the observed increase in population over the years. The data obtained allow creating management strategies to increase the reproductive rate, and also contribute to the protection of nesting sites of Lear\'s Macaw.

Dentre os psitacídeos criados como pets, destacam-se as calopsitas (Nymphicus hollandicus), os periquitos-australianos (Melopsittacus undulatus) e agapornis (Agapornis spp.). Os benefícios decorrentes da presença destas aves em ambiente doméstico são reconhecidos, porém pouco se conhece sobre os riscos de transmissão de zoonoses. E. coli pode ser isolada em diversos sítios do corpo humano e animal. Alguns sorotipos são considerados patogênicos e, nestes casos, a infecção pode estar associada à ocorrência de diversas manifestações clínicas. O presente estudo tem como objetivo a caracterização fenotípica e genotípica de Escherichia coli diarreiogênicas isoladas de pequenos psitacídeos mantidos como pets. 171 amostras de fezes de aves domiciliadas na cidade de São Paulo foram colhidas com auxílio de suabes estéreis, sendo 67 de calopsitas, 59 de periquitos australianos e 45 agapornis. Das 171 amostras, foram identificadas 42 colônias de Escherichia coli (22 de calopsitas, 10 de periquitos e 10 de agapornis), submetidas à extração de DNA e pesquisa dos genes eae, bfpA, stx1, stx2, LT, ST e aggR ; aaiA ; aatA ; aaiG pela Reac?a?o em Cadeia da Polimerase (PCR). Os resultados apontaram positividade em dez isolados: eae+, bfpA+, Stx2f+ de três calopsitas e cinco periquitos australianos (8/10); ST de uma calopsita (1/10) e eae+ de um periquito australiano (1/10). As oito estirpes de STEC/tEPEC foram classificadas como O137:HNM e nenhuma das estirpes exibiu um perfil de multirresistência. Apenas um isolado foi positivo para formação de biofilme (DO de 0,064), sendo classificado como fracamente aderente. A análise filogenética dos 4 grupos de Clermont et al. (2013) classificou três estirpes como B2, duas como F, e uma como Clado II. Duas estirpes foram classificadas como \"não tipável\". Os resultados para o AFLP foram: 7/8 estirpes (três de calopsitas e quatro de periquitos) foram agrupadas em um mesmo cluster, apresentando 90-100% de similaridade. Os resultados do sequenciamento de fragmentos internos de genes house-keeping - Multi-locus Sequence Typing (MLST) revelou que as oito estirpes pertenciam ao ST 3072. Neste estudo, nenhuma das estirpes apresentou atividade hemolítica, mas produziram toxinas in vitro. Aderiram in vitro em células HeLa e causaram lesões A/E em modelo de alça intestinal de coelho. As estirpes induziram processo inflamatório e aumento de muco intestinal. Os dados deste trabalho revelaram o potencial zoonótico dos híbridos STEC/tEPEC sorogrupo O137:HNM; ST 3072 isolados de psitacídeos de pequeno porte criados como \"pet\". / Among the parrots (psittacidae family) kept as pets, the cockatiels (Nymphicus hollandicus), budgerigars (Melopsittacus undulatus) and lovebirds (Lovebirds spp.) stand out. Although the benefits from the presence of these birds in a household environment are acknowledged, little is known about the risks of transmission of zoonoses. E. coli can be isolated in various sites of the human and animal body. Some serotypes are considered as pathogenic, and in such cases, the infection may be associated with the occurrence of several clinical manifestations. The aim of the present study is to characterize, phenotypically and genotypically, diarrheagenic Escherichia coli, isolated from the small parrots kept as pets. One hundred and seventy-one fecal samples of birds living in households in the city of Sa?o Paulo were collected with the aid of sterile swabs, with 67 being from cockatiels, 59 from budgerigars, and 45 from lovebirds. From the 171 samples, 42 (22 from cockatiels, 10 from budgerigars and 10 from lovebirds) Escherichia coli colonies were identified, which had their DNA extracted, and the eae, bfpA, stx1, stx2, LT, ST and aggR; aaiA; aatA; aaiG genes were investigated, through Polymerase Chain Reaction (PCR). The results indicated positivity in ten isolates: eae+, bfpA+, Stx2f+ from three cockatiels and five budgerigars (8/10), ST from one cockatiel (1/10), and eae+ from one budgerigar (1/10). The eight STEC/tEPEC lineages were classified as O137:HNM, and none of the lineages showed a multiresistance antibiotic profile. Only one isolate was positive for biofilm formation (DO, 0.064), which was classified as weakly adherent. The phylogenetic analysis of the 4 groups by Clermont et al. (2013) classified three lineages as B2, two as F, and one as Clade II. Two lineages were classified as \"non-typeable.\" The results for AFLP were: 7/8 lineages (three of cockatiels and four of budgerigars) were clustered together, with 90-100% of similarity being observed. The results of the internal fragment sequencing of house- keeping genes - Multi-locus Sequence Typing (MLST) revealed that the eight lineages belonged in to ST 3072. In this study, although none of the lineages showed hemolytic activity, they produced toxins in vitro. They adhered, in vitro, to HeLa cells and caused A/E lesions in an intestinal loop model of rabbits. The lineages induced an inflammatory process and an increase of intestinal mucus. This study data revealed the zoonotic potential of STEC/tEPEC hybrids, O137:HNM; ST 3072 serogroup, isolated from small-sized parrots kept as pets

Dentre os psitacídeos criados como pets, destacam-se as calopsitas (Nymphicus hollandicus), os periquitos-australianos (Melopsittacus undulatus) e agapornis (Agapornis spp.). Os benefícios decorrentes da presença destas aves em ambiente doméstico são reconhecidos, porém pouco se conhece sobre os riscos de transmissão de zoonoses. E. coli pode ser isolada em diversos sítios do corpo humano e animal. Alguns sorotipos são considerados patogênicos e, nestes casos, a infecção pode estar associada à ocorrência de diversas manifestações clínicas. O presente estudo tem como objetivo a caracterização fenotípica e genotípica de Escherichia coli diarreiogênicas isoladas de pequenos psitacídeos mantidos como pets. 171 amostras de fezes de aves domiciliadas na cidade de São Paulo foram colhidas com auxílio de suabes estéreis, sendo 67 de calopsitas, 59 de periquitos australianos e 45 agapornis. Das 171 amostras, foram identificadas 42 colônias de Escherichia coli (22 de calopsitas, 10 de periquitos e 10 de agapornis), submetidas à extração de DNA e pesquisa dos genes eae, bfpA, stx1, stx2, LT, ST e aggR ; aaiA ; aatA ; aaiG pela Reac?a?o em Cadeia da Polimerase (PCR). Os resultados apontaram positividade em dez isolados: eae+, bfpA+, Stx2f+ de três calopsitas e cinco periquitos australianos (8/10); ST de uma calopsita (1/10) e eae+ de um periquito australiano (1/10). As oito estirpes de STEC/tEPEC foram classificadas como O137:HNM e nenhuma das estirpes exibiu um perfil de multirresistência. Apenas um isolado foi positivo para formação de biofilme (DO de 0,064), sendo classificado como fracamente aderente. A análise filogenética dos 4 grupos de Clermont et al. (2013) classificou três estirpes como B2, duas como F, e uma como Clado II. Duas estirpes foram classificadas como \"não tipável\". Os resultados para o AFLP foram: 7/8 estirpes (três de calopsitas e quatro de periquitos) foram agrupadas em um mesmo cluster, apresentando 90-100% de similaridade. Os resultados do sequenciamento de fragmentos internos de genes house-keeping - Multi-locus Sequence Typing (MLST) revelou que as oito estirpes pertenciam ao ST 3072. Neste estudo, nenhuma das estirpes apresentou atividade hemolítica, mas produziram toxinas in vitro. Aderiram in vitro em células HeLa e causaram lesões A/E em modelo de alça intestinal de coelho. As estirpes induziram processo inflamatório e aumento de muco intestinal. Os dados deste trabalho revelaram o potencial zoonótico dos híbridos STEC/tEPEC sorogrupo O137:HNM; ST 3072 isolados de psitacídeos de pequeno porte criados como \"pet\". / Among the parrots (psittacidae family) kept as pets, the cockatiels (Nymphicus hollandicus), budgerigars (Melopsittacus undulatus) and lovebirds (Lovebirds spp.) stand out. Although the benefits from the presence of these birds in a household environment are acknowledged, little is known about the risks of transmission of zoonoses. E. coli can be isolated in various sites of the human and animal body. Some serotypes are considered as pathogenic, and in such cases, the infection may be associated with the occurrence of several clinical manifestations. The aim of the present study is to characterize, phenotypically and genotypically, diarrheagenic Escherichia coli, isolated from the small parrots kept as pets. One hundred and seventy-one fecal samples of birds living in households in the city of Sa?o Paulo were collected with the aid of sterile swabs, with 67 being from cockatiels, 59 from budgerigars, and 45 from lovebirds. From the 171 samples, 42 (22 from cockatiels, 10 from budgerigars and 10 from lovebirds) Escherichia coli colonies were identified, which had their DNA extracted, and the eae, bfpA, stx1, stx2, LT, ST and aggR; aaiA; aatA; aaiG genes were investigated, through Polymerase Chain Reaction (PCR). The results indicated positivity in ten isolates: eae+, bfpA+, Stx2f+ from three cockatiels and five budgerigars (8/10), ST from one cockatiel (1/10), and eae+ from one budgerigar (1/10). The eight STEC/tEPEC lineages were classified as O137:HNM, and none of the lineages showed a multiresistance antibiotic profile. Only one isolate was positive for biofilm formation (DO, 0.064), which was classified as weakly adherent. The phylogenetic analysis of the 4 groups by Clermont et al. (2013) classified three lineages as B2, two as F, and one as Clade II. Two lineages were classified as \"non-typeable.\" The results for AFLP were: 7/8 lineages (three of cockatiels and four of budgerigars) were clustered together, with 90-100% of similarity being observed. The results of the internal fragment sequencing of house- keeping genes - Multi-locus Sequence Typing (MLST) revealed that the eight lineages belonged in to ST 3072. In this study, although none of the lineages showed hemolytic activity, they produced toxins in vitro. They adhered, in vitro, to HeLa cells and caused A/E lesions in an intestinal loop model of rabbits. The lineages induced an inflammatory process and an increase of intestinal mucus. This study data revealed the zoonotic potential of STEC/tEPEC hybrids, O137:HNM; ST 3072 serogroup, isolated from small-sized parrots kept as pets

Interactions between nesting birds and invertebrates are a common, yet poorly understood ecological phenomenon. Many of these types of interactions are close and prolonged, and therefore potentially critical to one or both of the species involved in the interaction. However it is unusual for the nature of the interaction to be evaluated in a manner that reveals the impact of the relationship on both parties to the interaction. This study examines two relationships between nesting birds and invertebrates, both of which involve the hooded parrot (Psephotus dissimilis), a small grass parrot that inhabits the tropical savannas of northern Australia. ¶ The field-work for this project was conducted over two parrot breeding seasons in 2006 and 2007 near Katherine, Northern Territory, in the Australian dry tropics. In chapter II, I present data on the breeding biology of the hooded parrot as background for the study that follows. Nest building commenced in January, with peak activity in February and the last chicks fledged in April. Fifty three active nests were located. The mean number of eggs laid per nest was 4.5 (s.d. ± 0.9), of which 3.0 (± 1.79) hatched and 2.0 (± 2.0) fledged. Clutches were laid asynchronously over a period of a week and chicks remained in eggs for 18.6 (± 1.95 days). Chicks were 29.2 (± 2.9) days old when they fledged from the nest. These data are typical for Australian parrots. ¶ In chapter III, the unusual nature of the parrot’s nest site is examined. Many species of bird nest in natural cavities or those they excavate. Whilst cavity nesters as a whole experience increased nesting success, the greatest success is experienced by species that can excavate their own nests. Certain arboreal cavity nesters, such as woodpeckers, require extensive morphological adaptation for this behaviour, but this has not occurred in Australia, despite competition among birds and a suite of arboreal mammals for naturally occurring cavities. Some species, however, have adapted their behaviour to make use of substrates that are not as hard as wood. Hooded parrots excavate nests in terrestrial termitaria, releasing them from competition for limited arboreal cavities. However, I show that only termitaria with a high level of termite activity, and which are more than two metres tall, are suitable, and that the parrots exhibit a strong preference for the cathedral mounds of Nasutitermes triodiae. Nests placed in highly active mounds had a significantly higher success rate than those in mounds where activity was somewhat lower, suggesting that the behaviour is adaptive. ¶ The thesis then shifts focus from the parrot to its nest symbiont, first describing the species involved in the interaction in chapter IV, and then its behaviour in the nests of hooded parrots in chapter V. Trisyntopa neossophila sp. n. (Lepidoptera: Oecophoridae) was reared from the nest of the hooded parrot and described using morphological characters. Aspects of its biology are reported and similarities to the biology of Trisyntopa scatophaga found in the nests of the golden-shouldered parrot (Psephotus chrysopterygius) are discussed. The possibility that a moth was associated with the extinct paradise parrot (Psephotus pulcherrimus) is considered in the light of the phylogenetic relationships between the parrots. ¶ Trisyntopa neossophila is an unusual moth whose breeding cycle is shown to be closely synchronised with the hooded parrot. T. neossophila is one of three coprophagous, nest dwelling moths in the genus Trisyntopa. True coprophagy is rare in the Lepidoptera, although some species occasionally consume faeces to gain rare nutrients. T. neossophila lays its eggs in the nest of hooded parrots so that larvae hatch in synchrony with the hatching of the parrot’s eggs. The larvae spend their larval period in the nest and exclusively consume the excrement of the nestling parrots. When the parrot chicks fledge, the larvae move to the walls of the nest cavity to pupate, emerging the following wet season to repeat the process during the next parrot breeding season. ¶ With a description of the ecology of both species involved in the nesting symbiosis, chapter VI reviews the literature surrounding other interactions between nesting birds and invertebrates. A large number of birds are shown to nest in, or in close proximity to, structures made by invertebrates and avian nesting material provides a reliable shelter for many invertebrate species. However, the nature of such relationships has rarely been experimentally demonstrated. I propose that in order to understand the nature of these relationships they need to be explored within the theoretical framework of community ecology. Putative commensal and parasitic relationships have all been documented in the bird/invertebrate nesting literature, yet researchers, with few exceptions, repeatedly overlook the impact that these relationships are having on the invertebrate, at best assuming the nature of its impact, but more often ignoring its impact entirely. Here I present a framework for formulating hypotheses to ensure that the nature of the relationship can be identified. Only by explicitly stating the level of organisation at which the experiment is to occur (individual or population), identifying the net cost or benefit of the interaction, the range of conditions under which such costs or benefits would apply and the spatial and temporal context in which they apply, can an investigator expect to recognise and describe the often complex nature of these relationships. ¶ While parasitic and commensal relationships between nesting birds and invertebrates are commonly reported, mutualisms between birds and invertebrates have not been reported. Despite this, candidates for this type of relationship exist. Chapter VII uses the framework outlined in the literature review (chapter VI) to experimentally examine the relationship between the hooded parrot and Trisyntopa neossophila. By manipulating the populations of moth larvae in a sample of hooded parrot nests, we sought to establish the impact of the relationship on each species. The moth depends on the parrot for provision of shelter and a reliable food source. The parrot however, was neither benefited nor harmed by the interaction in terms of short term reproductive output or chick growth, although differences between the experimental and control nests were noted. The relationship between the hooded parrot and T. neossophila, at least during the study period, is therefore concluded to be commensal. ¶ Collectively, the chapters of this thesis explore the complicated interactions between species. The dependence of the moth on the parrot and the parrot on the termite, demonstrate the importance of understanding interactions between species in a manner that reveals the impacts of the interactions, the range of conditions under which they would apply and the level of organisation at which they apply, as outlined in chapter VI. The dependence of the animals in this study on each other makes them more vulnerable to extinction than previously thought. Whilst this may not be immediately significant for the hooded parrot/T. neossophila system, which is thought to be secure, the ecologically similar system on the Cape York Peninsula, involving the golden-shouldered parrot and its nest attendant moth Trysintopa scatophaga, is vulnerable to extinction and subject to intensive management to ensure its persistence. This study brings new information to the management of the golden-shouldered parrots and urgently recommends increased protection for Trysintopa scatophaga.

Anodorhynchus leari é uma ave endêmica do Bioma Caatinga e um dos psitacídeos mais ameaçados de extinção na região neotropical. Ela se reproduz apenas em formações rochosas de arenito-calcário, localizadas em dois sítios protegidos no norte do estado da Bahia; a Estação Biológica de Canudos (Toca Velha) e a Estação Ecológica do Raso da Catarina (Serra Branca). Este estudo teve por objetivo agregar informações sobre a história natural da arara-azul-de-lear, com ênfase em suas atividades reprodutivas. No Capítulo 1 descreve-se a estrutura e a disposição das cavidades encontradas nos paredões da Estação Biológica de Canudos, as quais foram acessadas internamente por meio do método de rapel. Verificou-se que os ninhos das araras estão em túneis ou salões/galerias amplos e profundos, locais formados naturalmente por ações de intempéries nas formações rochosas de 53m de altura vertical em média. Definitivamente as cavidades com ninhos não são confeccionadas ou alteradas pelas araras, para fins reprodutivos. Na área estudada existem muitas cavidades com as mesmas condições ambientais internas. No mesmo sítio, entre os anos de 2008 e 2011, foram localizadas 38 cavidades ativas. No Capítulo 2 buscou-se descrever detalhadamente a biologia reprodutiva da arara-azul-de-lear, monitorando-se internamente 18 destas cavidades. Ao final da quarta temporada reprodutiva 42 ninhadas foram estudadas. O período reprodutivo ocorreu entre os meses de dezembro e julho e a maior parte das ninhadas possuía três ovos. Por meio de ovoscopia verificou-se uma média de dois ovos embrionados por ninhada. Em quatro anos, 68 ninhegos eclodiram e destes, 83% sobreviveram até o primeiro vôo. Apesar de ser possível gerar e criar três filhotes por ninhada, em média apenas um filhote foi criado. O sucesso reprodutivo nos quatro anos amostrados foi de 71%, conforme o Protocolo de Mayfield e considerando-se 14 semanas como tempo médio de desenvolvimento dos ninhegos. Apesar de ocorrerem em casos isolados e serem pouco significativas, as causas da não ocupação de ninhos ou mortalidade no desenvolvimento estiveram relacionadas à presença de abelhas Apis sp. dentro das cavidades, perturbação causada por competição intra-específica associada à assincronia de eclosão, e à queda de ninhegos dos ninhos. No capítulo 3 infere-se sobre o recrutamento nos dois sítios reprodutivos conhecidos, Toca Velha e Serra Branca, com base em avistamentos de 118 ninhegos na entrada dos ninhos. Foram identificadas 114 cavidades potencialmente reprodutivas entre os anos de 2009 e 2010. A maioria dos ninhegos foi avistada no mês de abril nas duas temporadas reprodutivas. Sugere-se que um máximo de 228 indivíduos esteja em atividade reprodutiva, o que representa 20,17% da população de araras estimada em 2010. Conclui-se que a espécie deva ser categorizada como \"em perigo de extinção - EN\", segundo a aplicação dos critérios da IUCN. A ameaça mais importante para a espécie reside na falta de proteção nas áreas de alimentação. É fundamental ainda a continuidade de ações educativas e da rigorosa proteção dos sítios reprodutivos já conhecidos, além de esforços para buscar novas áreas potenciais para a reprodução, e que podem justificar o aumento populacional observado ao longo dos anos. Os dados obtidos possibilitam criar estratégias de manejo para incrementar a taxa reprodutiva, e também contribuir para a proteção dos sítios de nidificação da arara-azul-de-lear. / Anodorhynchus leari is endemic to the Caatinga and one of the most endangered psitacidae in the Neotropics. It reproduces only in sandstone/limestone formations, located in two protected sites in the northern region of the state of Bahia, the Biological Station of Canudos (Toca Velha) and the Ecological Station of Raso da Catarina (Serra Branca). This study aimed to gather information about the natural history of Lear\'s, with emphasis on their reproductive activities. In Chapter 1 it is described the structure and arrangement of cavities found in the walls of the Canudos Biological Station (Toca Velha), which were accessed internally by the method of rappelling. It was found that the nests of the macaws are in tunnels or rooms/galleries large and deep, naturally formed by local actions of weathering rock formations in the vertical height of 53 m on average. Definitely the nest cavities are not made or altered by macaws, for reproductive purposes. In the study area there are many holes with the same environmental conditions inside. In the same place, between the years 2008 and 2011, 38 active cavities were located. In Chapter 2 we sought to describe in detail the reproductive biology of Lear\'s Macaw, by monitoring these 18 internal cavities. At the end of the fourth breeding season 42 were studied. The reproductive period occurred between the months of July and December and most nests had three eggs. An average of two fertilized eggs per clutch. In four years, 68 nestlings hatched and of these, 83% survived until the first flight. Although it is possible to generate and create three chicks per nest on average only one chick was raised. The reproductive success in the four sampled years was 71%, following the Mayfield Protocol and considering 14 weeks as the average time of nestlings\' development. Although isolated, not significant cases occurred, the causes of non-occupation of nests in the development or mortality were related to the presence of bees, Apis into the cavities, a disruption caused by intraspecific competition associated with hatching asynchrony, and the fall of nestlings from the nest. In chapter 3 we infer about the recruitment in the two known breeding sites, Toca Velha and Serra Branca, based on sightings of nestlings in the nest entrance. We identified 114 potentially reproductive cavities between the years 2009 and 2010. Most nestlings were sighted in the month of April in the two reproductive seasons. It is suggested that a maximum of 228 individuals are in reproductive activity, which represents 20.17% of the estimated population of macaws in 2010. It is concluded that this species should be categorized as \"endangered - EN,\" according to the application of the IUCN criteria. The most important threat to the species is the lack of protection in the feeding areas. It is also essential the continuity of educational activities and rigorous protection of known breeding sites, and efforts to seek new potential areas for reproduction, which may justify the observed increase in population over the years. The data obtained allow creating management strategies to increase the reproductive rate, and also contribute to the protection of nesting sites of Lear\'s Macaw.

Esse trabalho oferece uma avaliação da abundância do papagaio-de-peito-roxo (Amazona vinacea) para 2016 e 2017, combinando contagens em dormitórios ao longo de toda a distribuição da espécie, em escala global, com amostragens replicadas em dormitórios na região oeste de Santa Catarina (WSC), em escala local, Brasil. As contagens em escala global resultaram em 3888 e 4066 indivíduos em 2016 e 2017, respectivamente. As estimativas para o WSC foram de 945 ± 50 e 1393 ± 40 para os mesmos dois anos. Não foi observada nenhuma evidência de crescimento populacional de 2016 para 2017, pois o acréscimo no número de indivíduos foi acompanhado por aumento do esforço amostral em ambas escalas. Quando extrapolamos a abundância no WSC para toda a área de distribuição da espécie, segundo a IUCN, e pressupondo densidade homogênea, obtivemos valores que estão acima da contagem na escala global, mas dentro da mesma ordem de magnitude. Nosso resultado oferece uma base sólida para afirmar que o tamanho populacional global de A. vinacea é de milhares de indivíduos, mas não dezenas de milhares. Realizamos um esforço sistemático para considerar as principais fontes de incerteza na estimativa de abundância da espécie. Cada contagem, tanto na escala local quanto na global, incluíram visitas em todos os dormitórios conhecidos dentro de um intervalo de 10 dias, evitando duplas contagens devido ao movimento dos papagaios entre dormitórios. No WSC, a abundância foi estimada usando um N-Mixture Model implementado em contexto Bayesiano. Apesar de nossa estimativa de tamanho populacional e de área de distribuição serem maiores do que as consideradas pela IUCN, sugerimos que A. vinacea permaneça na categoria “Em Perigo”, até que sejam realizados estudos sobre tendência populacional. / We offer an assessment of Vinaceous parrot (Amazona vinacea) abundance in 2016 and 2017, combining roost counts over the whole range of the species, with a replicated survey of roosts at the local scale, in western Santa Catarina state (WSC), Brazil. The whole range counts amounted to 3888 and 4066 individuals in 2016 and 2017, respectively. The WSC estimates were 945 ± 50 and of 1393 ± 40 individuals, for the same two years. We found no evidence of population growth from 2016 to 2017 because the increase in numbers is accompanied by an increase in observation effort both in WSC and at the whole-range scale. When extrapolating the WSC abundance estimate to the whole IUCN extant range of the species under the simplifying assumption of homogenous population density, we obtain values above the whole-range counts, but within the same order of magnitude. Such result offers a sound basis for putting the global population size of A. vinacea in the thousands of individuals, but not in the tens of thousands of individuals. We made a systematic effort to address key sources of uncertainty in parrot abundance estimation. Each count, at the local or whole-range scale, includes visits to all relevant roosts within less than ten days time to avoid double counting due to movement between roosts. At the local scale, we estimated abundance using an N-Mixture Model of replicated count data, implemented in a Bayesian framework. Even though we estimate a larger population size and a bigger geographic range that those currently reported by the IUCN, we suggest that A. vinacea should remain in the ‘Endangered’ IUCN threat category, pending further investigation of population trends.

Esse trabalho oferece uma avaliação da abundância do papagaio-de-peito-roxo (Amazona vinacea) para 2016 e 2017, combinando contagens em dormitórios ao longo de toda a distribuição da espécie, em escala global, com amostragens replicadas em dormitórios na região oeste de Santa Catarina (WSC), em escala local, Brasil. As contagens em escala global resultaram em 3888 e 4066 indivíduos em 2016 e 2017, respectivamente. As estimativas para o WSC foram de 945 ± 50 e 1393 ± 40 para os mesmos dois anos. Não foi observada nenhuma evidência de crescimento populacional de 2016 para 2017, pois o acréscimo no número de indivíduos foi acompanhado por aumento do esforço amostral em ambas escalas. Quando extrapolamos a abundância no WSC para toda a área de distribuição da espécie, segundo a IUCN, e pressupondo densidade homogênea, obtivemos valores que estão acima da contagem na escala global, mas dentro da mesma ordem de magnitude. Nosso resultado oferece uma base sólida para afirmar que o tamanho populacional global de A. vinacea é de milhares de indivíduos, mas não dezenas de milhares. Realizamos um esforço sistemático para considerar as principais fontes de incerteza na estimativa de abundância da espécie. Cada contagem, tanto na escala local quanto na global, incluíram visitas em todos os dormitórios conhecidos dentro de um intervalo de 10 dias, evitando duplas contagens devido ao movimento dos papagaios entre dormitórios. No WSC, a abundância foi estimada usando um N-Mixture Model implementado em contexto Bayesiano. Apesar de nossa estimativa de tamanho populacional e de área de distribuição serem maiores do que as consideradas pela IUCN, sugerimos que A. vinacea permaneça na categoria “Em Perigo”, até que sejam realizados estudos sobre tendência populacional. / We offer an assessment of Vinaceous parrot (Amazona vinacea) abundance in 2016 and 2017, combining roost counts over the whole range of the species, with a replicated survey of roosts at the local scale, in western Santa Catarina state (WSC), Brazil. The whole range counts amounted to 3888 and 4066 individuals in 2016 and 2017, respectively. The WSC estimates were 945 ± 50 and of 1393 ± 40 individuals, for the same two years. We found no evidence of population growth from 2016 to 2017 because the increase in numbers is accompanied by an increase in observation effort both in WSC and at the whole-range scale. When extrapolating the WSC abundance estimate to the whole IUCN extant range of the species under the simplifying assumption of homogenous population density, we obtain values above the whole-range counts, but within the same order of magnitude. Such result offers a sound basis for putting the global population size of A. vinacea in the thousands of individuals, but not in the tens of thousands of individuals. We made a systematic effort to address key sources of uncertainty in parrot abundance estimation. Each count, at the local or whole-range scale, includes visits to all relevant roosts within less than ten days time to avoid double counting due to movement between roosts. At the local scale, we estimated abundance using an N-Mixture Model of replicated count data, implemented in a Bayesian framework. Even though we estimate a larger population size and a bigger geographic range that those currently reported by the IUCN, we suggest that A. vinacea should remain in the ‘Endangered’ IUCN threat category, pending further investigation of population trends.

Submitted by Caroline Periotto (carol@ufscar.br) on 2016-10-10T15:06:40Z No. of bitstreams: 1 DissGRF.pdf: 3437375 bytes, checksum: 6462dc22eaf7cf1e73ecf9875bbef4d9 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T19:50:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissGRF.pdf: 3437375 bytes, checksum: 6462dc22eaf7cf1e73ecf9875bbef4d9 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T19:50:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissGRF.pdf: 3437375 bytes, checksum: 6462dc22eaf7cf1e73ecf9875bbef4d9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-20T19:50:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissGRF.pdf: 3437375 bytes, checksum: 6462dc22eaf7cf1e73ecf9875bbef4d9 (MD5) Previous issue date: 2016-06-22 / Outra / The Lear's Macaw (Anodorhyncus leari) is an endemic parrot of northeastern Bahia state, classified as endangered mainly due to the destruction of their habitats and wildlife trade. It was recently discovered in the wild, and few studies are known for this species. Understanding behavioral patterns of species threatened by extinction is essential for developing effective conservation strategies. Here we describe the behavioral repertoire of a group of this species maintained by the São Paulo Zoological Park Foundation. We carried out observations between October 2014 and February 2015, totaling 348 hours of sampling effort through ad libitum continuous record, in two different environmental conditions, both in in pairs and in flock. We described 60 behavioral states, grouped in categories maintenance, locomotion, feeding, social, stereotyped, reproductive and alert. We also found five patterns of vocalization (alarm, contact, cohesion, reproduction and imitation). Most of the behaviors described for other species is also reported here to A. leari, more similar to A. hyacinthinus. We discuss the differences in order to contribute to the formulation of a behavioral profile for this species, and with information that may assist in maintaining normal behavior in captivity. / A arara-azul-de-lear (Anodorhyncus leari) é um psitacídeo endêmico da caatinga do nordeste do estado da Bahia, classificada como em perigo de extinção em decorrência principalmente da destruição do seu habitat e do tráfico de animais silvestres. Foi descoberta na natureza a relativamente pouco tempo, sendo escassos estudos sobre a espécie. A compreensão de padrões comportamentais de espécies ameaçadas é fundamental para a elaboração de estratégias conservacionistas eficientes. O presente trabalho teve como objetivo o levantamento do repertório comportamental de um grupo de indivíduos da espécie mantidos pela Fundação Parque Zoológico de São Paulo. As observações ocorreram entre outubro de 2014 e fevereiro de 2016, totalizando 348 horas de esforço amostral através de amostragem ad libitum de registro contínuo com caráter qualitativo em duas condições ambientais distintas, tanto na manutenção dos indivíduos em pares quanto em bando, resultando na descrição de 60 condutas comportamentais dentro das categorias manutenção, locomoção, alimentação, social, estereotipado, reprodutivo e alerta, além de cinco padrões de vocalização (alarme, contato, coesão, reprodução e imitação). A maioria dos comportamentos descritos para outras espécies é relatada para A. leari, com maior semelhança com A. hyacinthinus. Porém as diferenças são discutidas com o objetivo de contribuir com a formulação de um perfil comportamental para a espécie e com informações que possam auxiliar na manutenção de comportamentos naturais em cativeiro.