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Avaliação da colonização e resistência antimicrobiana de Enterococcus sp. isolados de "swabs" cloacais de frangos de corte / Colonization and antimicrobial resistance evaluation of Enterococcus sp. Isolated from cloacal swabs of broiler chickens

Cassenego, Ana Paula Vaz January 2010 (has links)
Bactérias comensais do intestino de frangos tornaram-se objeto frequente de estudos, pois a alta taxa de exportação desses produtos tem aumentado a preocupação com a qualidade e a sanidade de granjas no que se refere à nutrição animal, ganho de peso e doenças infecciosas. O objetivo do presente estudo foi verificar a influência de diferentes dietas para frangos de corte na colonização, assim como no fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados Enterococcus sp. Amostras de “swabs” cloacais de frangos de corte foram utilizadas para isolamento de Enterococcus sp. Os frangos foram submetidos a diferentes dietas contendo promotores de crescimento, probióticos, óleos essenciais e coccidiostáticos ionóforos, e divididos em grupos conforme o tratamento empregado. Foram obtidos 240 isolados de Enterococcus sp. confirmados para gênero através da técnica de Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR), submetidos a testes bioquímicos e moleculares para identificação de espécie, determinados os perfis de susceptibilidade a diversos antimicrobianos e testados para a presença de genes de resistência tet(M), tet(L) e erm(B) por PCR. Observou-se uma alteração na composição ou no número de espécies de Enterococcus sp. de acordo com as dietas empregadas. Todas as dietas, independentes da presença ou não de coccidiostático ionóforo, apresentaram um aumento na freqüência de Enterococcus resistentes quando comparados com o grupo controle. No entanto, nos grupos que os frangos receberam coccidiostático ionóforo, a taxa de Enterococcus sp. isolados foi menor quando comparada aos isolados dos grupos que não receberam essa composição. Do total de isolados resistentes à tetraciclina, 94% e 30%, continham os genes tet(M) e tet(L), respectivamente. Dos isolados resistentes a eritromicina, 97,9% possuíam o gene de resistência erm(B). Não houve correlação das diferentes dietas para frangos de corte na colonização, fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados de Enterococcus sp. / Commensal bacteria from the gut of chickens have been frequently object of studies because the high rate of exportation of these products the concern with the quality and health of poultry, in relation to animal nutrition, weight gain and infectious diseases has been increasing. The principal aim of this study was to verify the influence of different diets treated to broilers, in the colonization of Enterococcus strains, and as well the phenotype and genotype of resistance strains. Samples from cloacal swabs of broiler chickens were used for the isolation of strains of Enterococcus sp. The broilers were subjected to diets with growth promoter, probiotics, essential oils and ionophore coccidiostat and divided into groups according to treatment used. Two hundred forty isolates of Enterococcus sp. were confirmed the genus using the polymerase chain reaction (PCR), subjected to biochemical and molecular species identification, antibiotic susceptibility profile and verification of antibiotic resistance genes tet(M), tet(L) e erm(B) by PCR. Accordingly to the diets employed to the chickens a changing the composition or the number of Enterococcus sp. was observed. All diets, regardless to the presence or absence of ionophore coccidiostat showed an increase in the frequency of Enterococcus resistant when compared with the control group. However, the groups that received ionophore coccidiostat, the rate of resistant Enterococcus sp. was lower than the groups that did not administered this composition. The isolates that presented resistant to tetracycline, 94% and 30%, contained the genes tet(M) and tet(L), respectively. In the isolates resistant to erythromycin, 97.9% had the gene erm(B). There was no correlation of different diets for broiler chickens on colonization, phenotype and genotype resistance in the Enterococcus sp strains.
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Caracterização de isolados clínicos e ambientais de Acinetobacter sp : presença de ISAba 1 e diversidade de blaOXA-51-like / Characterization of clinical and environmental isolates of Acinetobacter sp.: ISAba1 presence and diversity of blaOXA-51-like

Gusatti, Carolina de Souza January 2011 (has links)
A capacidade de adquirir, com facilidade, resistência à terapia antimicrobiana torna-se uma das características mais estudadas em Acinetobacter sp., mundialmente conhecido por estar relacionado a surtos de infecções associadas à assistência a saúde (IAAS) e por ser apontado como um grave problema de saúde pública. Embora isolados clínicos desse gênero sejam extensivamente estudados quanto à presença e a diversidade de genes do tipo OXA-carbapenemases,existem poucos estudos sobre essa relação em isolados ambientais. Este trabalho teve como objetivo determinar a presença de carbapenemases do tipo OXA (e sua diversidade), de ISAba1 e de sua relação com as carbapenemases em isolados clínicos e de esgoto hospitalar de Acinetobacter sp. na cidade de Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Um total de 310 isolados (145 clínicos e 165 ambientais) foram submetidos a análise por PCR das regiões genéticas de interesse. A diversidade dos genes do tipo blaOXA-51 foi realizada por DGGE. Os resultados indicam a presença do gene blaOXA-58 em um isolado, pela primeira vez no Brasil. A sequência ISAba1 foi frequentemente encontrada (92,9%), porém, a sua associação com blaOXA-51 foi baixa e encontrada em 9,8% dos isolados clínicos e em 6,5% dos isolados ambientais. A análise de diversidade revelou uma baixa freqüência de alelos de OXA-51 entre os isolados estudados, sendo blaOXA-65 a variante mais encontrada. Contudo, podemos afirmar que o esgoto hospitalar analisado constitui-se de uma fonte de contaminação de bactérias patogênicas e que as precárias políticas de saneamento podem proporcionar a disseminação de multirresistência para o meio ambiente. / The ability of easily acquiring resistance to antimicrobial therapy becomes one of the most studied features in Acinetobacter sp., world renowned for being related to outbreaks of infection associated with health care and for being appointed as a serious public health problem. Although clinical isolates of this genus are extensively studied for the presence and diversity of OXAcarbapenemase genes, there are few studies about this relationship in environmental isolates. This study aimed to determine the presence of OXAtype carbapenemases (and yours diversity), of ISAba1 and its relationship with carbapenemases in clinical and hospital sewage isolates of Acinetobacter sp. in Porto Alegre, Rio Grande do Sul. A total of 310 strains (145 of clinical origin and 165 of environmental origin) were subjected to PCR analysis of genetic regions of interest. The diversity of blaOXA-51-like genes was performed by DGGE. The results indicate the presence of the gene blaOXA-58 in an isolated, for the first time in Brazil. ISAba1 was frequently found (92.9%) but its association with blaOXA-51-like was low and was found in 9.8% of clinical isolates and in 6.5% of environmental isolates. The diversity analysis showed that there is a low frequency of alleles of OXA-51 among the studied isolates being blaOXA-65 variant the most often found. However, we can state that the hospital sewage is considered to be a source of pathogenic bacteria contamination and that the poor sanitation politics contributes to the spread of multidrug resistance in the environment.
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Amostras de Pseudomonas aeruginosa resistentes a carbapenens isoladas em hospitais brasileiros: perfil de sensibilidade, detecção de metalo-beta-lactamase e análise da similaridade genética / Pseudomonas aeruginosa resistant to carbapenens isoleted from btaziliam hospitals: susceptibility, metallo-beta-lactamase detection, and genetic similarity

Menezes, Liana Carballo [UNIFESP] January 2005 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-12-06T23:05:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005 / As infecções causadas por P. aeruginosa são freqüentemente de difícil tratamento devido à virulência e a resistência a vários antimicrobianos apresentados por este patógeno. Os carbapenens são geralmente o tratamento de escolha para infecções causadas por P. aeruginosa multirresistentes, porém, a resistência a estes compostos tem aumentado rapidamente, principalmente, devido ao surgimento de amostras produtoras de metalo-ß-lactamases. Os objetivos deste estudo foram: i) avaliar o perfil de sensibilidade a antimicrobianos das amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens isoladas de hospitais brasileiros; ii) avaliar a freqüência da produção de MPL entre as amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens; iii) avaliar o perfil de sensibilidade a antimicrobianos das amostras de P. aeruginosa produtoras de MβL pela técnica de microdiluição em caldo; iv) detectara presença dos genes biasSPM-1, blaIMP-1, blaVIM-1, e blaVIM-2 entre as amostras de P. aeruginosa produtoras de MßL; v) avaliar a presença de variantes alélicos do gene blasIPM-1, entre as amostras de P. aeruginosa produtoras da MPL do tipo SPM-1, e vi) avaliar a similaridade genética entre as amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens produtoras de MßL. Foram avaliadas 206 amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens isoladas entre 2001 e 2003, de 25 centros médicos. As 206 amostras foram testadas pelo método de disco-difusão. Os testes de sensibilidade foram realizados de acordo com a padronização do "National Committee for Clinical Laboratory Standards" (NCCLS). Os isolados resistentes aos carbapenens foram triados para a produção de metalo-ß-lactamases pelo teste de aproximação de discos utilizando dois inibidores enzimáticos (EDTA e ácido 2mercaptopropiônico). A produção de MßL foi confirmada pela metodologia do Etest® (fita Etest©MBL). Em seguida foi realizada a técnica de PCR para a pesquisa dos genes blaIMP-1, blaVIM-1, bIaVIM-2 e blaSPM-1. A avaliação da similaridade genética entre as amostras produtoras de MßL foi realizada pela técnica da ribotipagem automatizada e PFGE. Para fins comparativos, também foram selecionadas para análise da similaridade genéticaamostras não produtoras de MßL isoladas em centros médicos, que apresentavam amostras de P. aeruginosa produtoras de MPL. Altas taxas de resistência a maioria dos antimicrobianos foram observadas entre as amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenes…(au). / Infections caused by Pseudomonas aeruginosa are often difficult to treat because of its virulence and antimicrobial resistance. Carbapenems are usually active against multiresistant P. aeruginosa, but resistant to these compounds has been increasing rapidly. High-level resistance to carbapenems is still uncommon in P. aeruginosa and is usually indicative of metallo-β-lactamases (MβL). The purpose of the study were to evaluate the antimicrobial susceptibility profiles of carbapenems resistant P. aeruginosa isolated from Brazilian Hospitals, were to detect the presence of gene blaSPM-1, blaIMP-1, blaVIM-1 e blaVIM-2 and to evaluate the genetic similarity of P. aeruginosa resistant to carbapenems. Were evaluated 206 P. aeruginosa resistant to carbapenems collected during 2001 – 2003 from 25 medical centers. Antimicrobial susceptibilities testing to selected agents were determined by disk diffusion to 206 strains. The suscepptibility testing were to using the reference “National Committee for Clinical Laboratory Standards” (NCCLS). Carbapenems resistant isolates were screened for MβL production by disk approximation test using 2 enzyme inhibitors (EDTA and 2-mercaptopropionic acid). The procedure was confirmed by Etest (Etest MBL strip) and also by PCR assays using the following primers blaIMP-1, blaVIM-1, blaVIM-2 e blaSPM-1. The genetic similarity was performed in MβL producers strains and one negative-MβL strains for medical centers by automated ribotyping and PFGE. High resistance rates to majority of the antimicrobial agents were demonstrated. The polymyxins were the most active antimicrobial agents evaluated with 100,0% of susceptibility rate to all strains. The MβL production was detected in 98 (47,6%) of 206 strains. The blaSPM-1 gene was detected in 82 strains (83,7%) and blaIPM-1 gene in 3 strains (16,3%). Thirteen isolates did not show PCR amplification for none of the primers used. The analysis of genetic similarity showed a clonal diversity among the 98 carbapenems-resistant strains (46 ribogroups). CONCLUSION: This study indicates high prevalence of MβL producing in carbapenems-resistant P. aeruginosa and clonal dissemination these microrganism to a wide geographic area of Brazil. / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Caracterização de isolados clínicos e ambientais de Acinetobacter sp : presença de ISAba 1 e diversidade de blaOXA-51-like / Characterization of clinical and environmental isolates of Acinetobacter sp.: ISAba1 presence and diversity of blaOXA-51-like

Gusatti, Carolina de Souza January 2011 (has links)
A capacidade de adquirir, com facilidade, resistência à terapia antimicrobiana torna-se uma das características mais estudadas em Acinetobacter sp., mundialmente conhecido por estar relacionado a surtos de infecções associadas à assistência a saúde (IAAS) e por ser apontado como um grave problema de saúde pública. Embora isolados clínicos desse gênero sejam extensivamente estudados quanto à presença e a diversidade de genes do tipo OXA-carbapenemases,existem poucos estudos sobre essa relação em isolados ambientais. Este trabalho teve como objetivo determinar a presença de carbapenemases do tipo OXA (e sua diversidade), de ISAba1 e de sua relação com as carbapenemases em isolados clínicos e de esgoto hospitalar de Acinetobacter sp. na cidade de Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Um total de 310 isolados (145 clínicos e 165 ambientais) foram submetidos a análise por PCR das regiões genéticas de interesse. A diversidade dos genes do tipo blaOXA-51 foi realizada por DGGE. Os resultados indicam a presença do gene blaOXA-58 em um isolado, pela primeira vez no Brasil. A sequência ISAba1 foi frequentemente encontrada (92,9%), porém, a sua associação com blaOXA-51 foi baixa e encontrada em 9,8% dos isolados clínicos e em 6,5% dos isolados ambientais. A análise de diversidade revelou uma baixa freqüência de alelos de OXA-51 entre os isolados estudados, sendo blaOXA-65 a variante mais encontrada. Contudo, podemos afirmar que o esgoto hospitalar analisado constitui-se de uma fonte de contaminação de bactérias patogênicas e que as precárias políticas de saneamento podem proporcionar a disseminação de multirresistência para o meio ambiente. / The ability of easily acquiring resistance to antimicrobial therapy becomes one of the most studied features in Acinetobacter sp., world renowned for being related to outbreaks of infection associated with health care and for being appointed as a serious public health problem. Although clinical isolates of this genus are extensively studied for the presence and diversity of OXAcarbapenemase genes, there are few studies about this relationship in environmental isolates. This study aimed to determine the presence of OXAtype carbapenemases (and yours diversity), of ISAba1 and its relationship with carbapenemases in clinical and hospital sewage isolates of Acinetobacter sp. in Porto Alegre, Rio Grande do Sul. A total of 310 strains (145 of clinical origin and 165 of environmental origin) were subjected to PCR analysis of genetic regions of interest. The diversity of blaOXA-51-like genes was performed by DGGE. The results indicate the presence of the gene blaOXA-58 in an isolated, for the first time in Brazil. ISAba1 was frequently found (92.9%) but its association with blaOXA-51-like was low and was found in 9.8% of clinical isolates and in 6.5% of environmental isolates. The diversity analysis showed that there is a low frequency of alleles of OXA-51 among the studied isolates being blaOXA-65 variant the most often found. However, we can state that the hospital sewage is considered to be a source of pathogenic bacteria contamination and that the poor sanitation politics contributes to the spread of multidrug resistance in the environment.
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Streptococcus pneumoniae: sensibilidade a antimicrobianos e detecção de genes de resistência em isolados de crianças com pneumonia adquirida na comunidade em Fortaleza, Ceará. / Streptococcus pneumoniae: antimicrobial sensitivity and detection of resistance genes in children with isolated acquired pneumonia in community in Fortaleza, Ceará.

Oliveira, Nayara Santos de 10 December 2013 (has links)
OLIVEIRA, N. S. Streptococcus pneumoniae: sensibilidade a antimicrobianos e detecção de genes de resistência em isolados de crianças com pneumonia adquirida na comunidade em Fortaleza, Ceará. 2013. 83 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2016-06-23T12:51:16Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_nsoliveira.pdf: 1681873 bytes, checksum: c62b8c7f03d7d8081b4975a923cd4dae (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2016-06-23T12:51:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_nsoliveira.pdf: 1681873 bytes, checksum: c62b8c7f03d7d8081b4975a923cd4dae (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-23T12:51:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_nsoliveira.pdf: 1681873 bytes, checksum: c62b8c7f03d7d8081b4975a923cd4dae (MD5) Previous issue date: 2013-12-10 / Acute respiratory infection (ARI) is a clinical syndrome, in which about 80% of deaths attributed to pneumonia, a serious disease that affects the lower respiratory tract. The common etiologic agent in community-acquired pneumonia (CAP) is Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae). Pneumococcal diseases begin with colonization of S. pneumoniae in the nasopharynx and may progress to invasive disease. In recent decades, the increasing number of strains of S. pneumoniae resistant to β-lactam antibiotics and macrolides has hindered the treatment of pneumococcal infections. The objectives of this study were to determine the prevalence of carriers of S. pneumoniae in children with CAP, the sensitivity profile to antibiotics and serotype distribution in Fortaleza, Brazil. The strains of S. pneumoniae were isolated from nasopharyngeal aspirates of children with CAP treated at Children's Hospital Albert Sabin (HIAS). For the determination of minimum inhibitory concentration (MIC) was used the E-test method for the following antibiotics: penicillin, ceftriaxone, sulfamethoxazole / trimethoprim, amoxicillin, clindamycin and erythromycin. Genotyping of strains of S. pneumoniae was performed by multiplex PCR technique. 527 samples of children with CAP were isolated S. pneumoniae in 30.17%. 126 isolates from patients found a resistance rate of 25.8% for penicillin, 81.2% to sulfamethoxazole / trimethoprim, from 21.4% to erythromycin, 19% to clindamycin and 0.8% for ceftriaxone and amoxicillin. Of the 102 genotyped strains, the most commonly found serotypes were 6A / 6B, followed by 14, 19A and 19F. They selected 29 strains resistant to penicillin for detection of protein modifications penicillin binding (PBP). Found change in PBP 1a in 69%, while for the PBP 2b and PBP 2x all tested strains showed change. As for clindamycin and erythromycin were selected 24 strains for the detection of gene ermB. Of the 24 strains tested, 79.2% had ermB gene. This study generated data on the prevalence of children with CAP S. pneumoniae revealed phenotypic and genotypic data on the resistance of the isolated front to antimicrobials used in clinical and distribution of serotypes of pneumococcus in children with CAP treated at HIAS. / A infecção respiratória aguda (IRA) é uma síndrome clínica, em que cerca de 80% das mortes são atribuídas à pneumonia, uma doença grave que atinge o trato respiratório inferior. O agente etiológico comumente isolado na pneumonia adquirida na comunidade (PAC) é o Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae). As doenças pneumocócicas começam com a colonização do S. pneumoniae na nasofaringe, podendo progredir para doença invasiva. Nas últimas décadas, o aumento do número de cepas de S. pneumoniae resistentes a antibióticos β-lactâmicos e a macrolídeos tem dificultado o tratamento das infecções pneumocócicas. Os objetivos desse estudo foram determinar à prevalência de portadores de S. pneumoniae em crianças com PAC, o perfil de sensibilidade a antimicrobianos e distribuição dos sorotipos, em Fortaleza, Brasil. As cepas de S. pneumoniae foram isoladas de aspirados de nasofaringe de crianças com PAC atendidas no Hospital Infantil Albert Sabin (HIAS). Para a determinação das Concentrações Inibitórias Mínimas (CIM) foi utilizado o método de E-test para os seguintes antimicrobianos: penicilina, ceftriaxona, sulfametoxazol/trimetoprim, amoxicilina, clindamicina e eritromicina. A genotipagem das cepas de S. pneumoniae foi realizada pela técnica de multiplex PCR. De 527 amostras de crianças com PAC, foram isolados S. pneumoniae em 30,17%. De 126 isolados de portadores foi encontrada uma taxa resistência de 25,8% para penicilina, de 81,2% para sulfametoxazol/trimetoprim, de 21,4% para eritromicina, de 19% para clindamicina e de 0,8% para ceftriaxona e amoxicilina. Das 102 cepas genotipadas, os sorotipos mais comumente encontrados foram 6A/6B, seguido do 14, 19A e 19F. Foram selecionadas 29 cepas resistentes à penicilina para detecção das alterações proteínas de ligação a penicilina (PBP). Foi encontrada alteração na PBP 1a em 69%, já para as PBP 2b e PBP 2x todas as cepas testadas apresentaram alteração. Já para clindamicina e eritromicina, foram selecionados 24 cepas para detecção do gene ermB. Das 24 cepas testadas, 79,2% possuíam o gene ermB. O presente trabalho gerou dados sobre a prevalência de crianças portadoras com PAC de S. pneumoniae, revelou dados fenotípicos e genotípicos acerca da resistência dos isolados frente aos antimicrobianos utilizados na clínica e a distribuição dos sorotipos do pneumococo de crianças com PAC atendidas no HIAS.
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Resistência antimicrobiana, genotipagem capsular e deteção de genes de resistência de Streptococcus pneumoniae isolados de crianças não vacinadas usuárias de creches em Fortaleza

Laranjeira, Bruno Jaegger January 2014 (has links)
LARANJEIRA, Bruno Jaegger. Resistência antimicrobiana, genotipagem capsular e deteção de genes de resistência de Streptococcus pneumoniae isolados de crianças não vacinadas usuárias de creches em Fortaleza. 2014. 95 f. Tese (Doutorado em Microbiologia Médica) – Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2016-03-15T11:20:19Z No. of bitstreams: 1 2014_tese_bjlaranjeira.pdf: 5609827 bytes, checksum: 2006edd7762a610c0d9005923ea51ce0 (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2016-03-15T12:39:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_tese_bjlaranjeira.pdf: 5609827 bytes, checksum: 2006edd7762a610c0d9005923ea51ce0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-15T12:39:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_tese_bjlaranjeira.pdf: 5609827 bytes, checksum: 2006edd7762a610c0d9005923ea51ce0 (MD5) Previous issue date: 2014 / Streptococcus ( S. ) pneumoniae is considered the principal causative agent of mor bidity and mortality in children younger than five years of ag e. All pneumococcal diseases are initiated by establishing a S. pneumoniae colonization in nasopharynx. The main risk factor for colonization is crowding, as in children attending day care. During the last decades, the increasing amount of resistant S. pneumoniae strains to β -lactams and other classes of antimicrobials has modified the treatment of pneumo coccal infection. At present, nearly 13 serotypes respond for more than 85% of invasive iso lates. The 10-valent pneumococcal polysaccharide-conjugated vaccine (PCV-10) has rece ntly been included in the national vaccination schedule. The aims of this study were t o determine the prevalence, antimicrobial resistance and genotypes of S. pneumoniae isolated of carriage children attending day care centers in Fortaleza, Brazil, as well as to assess the potential coverage of the PCV-10. Between January and December of 2011, isolates from carrier children were recovered by nasopharyngeal swabs. Susceptibility to penicillin, amoxicillin, erythromycin, sulfamethoxazole-trimethoprim, clindamycin, were de termined by e-test method. Detection of penicillin resistance genes was performed by PCR as say. Capsular genotyping of carriage isolates was performed by multiplex PCR assay. S. pneumoniae were isolated in 165 (87.3 %) of 291 samples of children attending day care cente rs. Of the 162 isolates from carriage was found a resistance rate of 27.8% for penicillin, 75 .3% to trimethoprim / sulfamethoxazole, 13.6% to erythromycin and 10.5% to clindamycin. No resistance was detected to ceftriaxone and amoxicillin. The percentage of S. pneumoniae isolates at least one mutation in the penicillin resistance genes was 68.2%. Capsular Gen otypes was indentified in 115 isolates, of 129 tested. Genotypes most common were 6A/6B, 14, 1 5B/15C, 19F and 23F, with serotypes 6A/6B, 14, 19F and 23F more associated with resista nce. The estimated coverage for VPC-10 was 74.4%. This study showed that the rate of S. pneumoniae carriers is high, as well as resistance to antibiotics penicillin and sulfametho xazole / trimethoprim, and the potential cover of VPC-10 is raised against S. pneumoniae genotypes identified isolated from children attending day care centers in Fortaleza. / O Streptococcus (S.) pneumoniae é considerado como o principal agente causador de morbidade e mortalidade em crianças menores de cinco anos de idade. As doenças pneumocócicas começam com o estabelecimento da colonização do S. pneumoniae na nasofaringe. O principal fator de risco para colonização é o confinamento, como em crianças que frequentam creches. Nas últimas décadas, o aumento do número de cepas de S. pneumoniae resistentes à antibióticos β-lactâmicos e a outras classes de antimicrobianos tem dificultado o tratamento da infecção pneumocócica. Atualmente cerca de 13 sorotipos de S. pneumoniae respondem por mais de 85% dos isolados invasivos. A vacina pneumocócica polissacarídica conjugada 10-valente (VPC-10) foi recentemente incluída no calendário de vacinação nacional. Os objetivos desse estudo foram determinar a prevalência, a resistência antimicrobiana, os genótipos de S. pneumoniae que colonizam a nasofaringe de crianças usuárias de creches em Fortaleza, Brasil, bem como para avaliar a cobertura potencial da VPC-10. Entre janeiro e dezembro de 2011, os isolados de crianças portadores foram recuperados a partir de swabs de nasofaringe. Foram determinadas as sensibilidades para penicilina, ceftriaxona, sulfametoxazol/trimetoprim, amoxilina, clindamicina e eritromicina, das cepas isoladas utilizando-se o método de e-test.. A detecção dos genes de resistência à penicilina foi realizada por PCR. A genotipagem capsular dos isolados de portadores foi realizada pela técnica de multiplex PCR. Foram isolados S. pneumoniae em 165 (56,7%) das 291 crianças saudáveis usuárias de creches. Dos 162 isolados de portadores, submetidos à determinação da concentração inibitória mínima, foi encontrada uma taxa resistência de 27,8% para penicilina, 75,3% para sulfametoxazol/trimetoprim, 13,6% para eritromicina e 10,5% para clindamicina. Não foi detectada resistência à ceftriaxona e à amoxicilina. A porcentagem de isolados de S. pneumoniae com mutação em pelo menos um dos genes que determinam resistência à penicilina foi de 68,2%. Os genótipos capsulares de 115 isolados foram identificados em 129 viáveis. Os genótipos mais comuns foram 6A/6B, 14, 15B/15C, 19F e 23F, com os sorotipos 6A/6B, 14, 19F e 23F mais associados com a resistência. A cobertura estimada para VPC-10 foi de 74.4%. O presente estudo verificou que a taxa de portadores de S. pneumoniae é alta, assim como a resistência aos antimicrobianos penicilina e sulfametoxazol/trimetoprima, e que a cobertura potencial da VPC-10 é elevada frente aos genótipos de S. pneumoniae identificados, isolados de crianças usuárias de creches em Fortaleza.
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Avaliação da colonização e resistência antimicrobiana de Enterococcus sp. isolados de "swabs" cloacais de frangos de corte / Colonization and antimicrobial resistance evaluation of Enterococcus sp. Isolated from cloacal swabs of broiler chickens

Cassenego, Ana Paula Vaz January 2010 (has links)
Bactérias comensais do intestino de frangos tornaram-se objeto frequente de estudos, pois a alta taxa de exportação desses produtos tem aumentado a preocupação com a qualidade e a sanidade de granjas no que se refere à nutrição animal, ganho de peso e doenças infecciosas. O objetivo do presente estudo foi verificar a influência de diferentes dietas para frangos de corte na colonização, assim como no fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados Enterococcus sp. Amostras de “swabs” cloacais de frangos de corte foram utilizadas para isolamento de Enterococcus sp. Os frangos foram submetidos a diferentes dietas contendo promotores de crescimento, probióticos, óleos essenciais e coccidiostáticos ionóforos, e divididos em grupos conforme o tratamento empregado. Foram obtidos 240 isolados de Enterococcus sp. confirmados para gênero através da técnica de Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR), submetidos a testes bioquímicos e moleculares para identificação de espécie, determinados os perfis de susceptibilidade a diversos antimicrobianos e testados para a presença de genes de resistência tet(M), tet(L) e erm(B) por PCR. Observou-se uma alteração na composição ou no número de espécies de Enterococcus sp. de acordo com as dietas empregadas. Todas as dietas, independentes da presença ou não de coccidiostático ionóforo, apresentaram um aumento na freqüência de Enterococcus resistentes quando comparados com o grupo controle. No entanto, nos grupos que os frangos receberam coccidiostático ionóforo, a taxa de Enterococcus sp. isolados foi menor quando comparada aos isolados dos grupos que não receberam essa composição. Do total de isolados resistentes à tetraciclina, 94% e 30%, continham os genes tet(M) e tet(L), respectivamente. Dos isolados resistentes a eritromicina, 97,9% possuíam o gene de resistência erm(B). Não houve correlação das diferentes dietas para frangos de corte na colonização, fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados de Enterococcus sp. / Commensal bacteria from the gut of chickens have been frequently object of studies because the high rate of exportation of these products the concern with the quality and health of poultry, in relation to animal nutrition, weight gain and infectious diseases has been increasing. The principal aim of this study was to verify the influence of different diets treated to broilers, in the colonization of Enterococcus strains, and as well the phenotype and genotype of resistance strains. Samples from cloacal swabs of broiler chickens were used for the isolation of strains of Enterococcus sp. The broilers were subjected to diets with growth promoter, probiotics, essential oils and ionophore coccidiostat and divided into groups according to treatment used. Two hundred forty isolates of Enterococcus sp. were confirmed the genus using the polymerase chain reaction (PCR), subjected to biochemical and molecular species identification, antibiotic susceptibility profile and verification of antibiotic resistance genes tet(M), tet(L) e erm(B) by PCR. Accordingly to the diets employed to the chickens a changing the composition or the number of Enterococcus sp. was observed. All diets, regardless to the presence or absence of ionophore coccidiostat showed an increase in the frequency of Enterococcus resistant when compared with the control group. However, the groups that received ionophore coccidiostat, the rate of resistant Enterococcus sp. was lower than the groups that did not administered this composition. The isolates that presented resistant to tetracycline, 94% and 30%, contained the genes tet(M) and tet(L), respectively. In the isolates resistant to erythromycin, 97.9% had the gene erm(B). There was no correlation of different diets for broiler chickens on colonization, phenotype and genotype resistance in the Enterococcus sp strains.
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Avaliação da colonização e resistência antimicrobiana de Enterococcus sp. isolados de "swabs" cloacais de frangos de corte / Colonization and antimicrobial resistance evaluation of Enterococcus sp. Isolated from cloacal swabs of broiler chickens

Cassenego, Ana Paula Vaz January 2010 (has links)
Bactérias comensais do intestino de frangos tornaram-se objeto frequente de estudos, pois a alta taxa de exportação desses produtos tem aumentado a preocupação com a qualidade e a sanidade de granjas no que se refere à nutrição animal, ganho de peso e doenças infecciosas. O objetivo do presente estudo foi verificar a influência de diferentes dietas para frangos de corte na colonização, assim como no fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados Enterococcus sp. Amostras de “swabs” cloacais de frangos de corte foram utilizadas para isolamento de Enterococcus sp. Os frangos foram submetidos a diferentes dietas contendo promotores de crescimento, probióticos, óleos essenciais e coccidiostáticos ionóforos, e divididos em grupos conforme o tratamento empregado. Foram obtidos 240 isolados de Enterococcus sp. confirmados para gênero através da técnica de Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR), submetidos a testes bioquímicos e moleculares para identificação de espécie, determinados os perfis de susceptibilidade a diversos antimicrobianos e testados para a presença de genes de resistência tet(M), tet(L) e erm(B) por PCR. Observou-se uma alteração na composição ou no número de espécies de Enterococcus sp. de acordo com as dietas empregadas. Todas as dietas, independentes da presença ou não de coccidiostático ionóforo, apresentaram um aumento na freqüência de Enterococcus resistentes quando comparados com o grupo controle. No entanto, nos grupos que os frangos receberam coccidiostático ionóforo, a taxa de Enterococcus sp. isolados foi menor quando comparada aos isolados dos grupos que não receberam essa composição. Do total de isolados resistentes à tetraciclina, 94% e 30%, continham os genes tet(M) e tet(L), respectivamente. Dos isolados resistentes a eritromicina, 97,9% possuíam o gene de resistência erm(B). Não houve correlação das diferentes dietas para frangos de corte na colonização, fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados de Enterococcus sp. / Commensal bacteria from the gut of chickens have been frequently object of studies because the high rate of exportation of these products the concern with the quality and health of poultry, in relation to animal nutrition, weight gain and infectious diseases has been increasing. The principal aim of this study was to verify the influence of different diets treated to broilers, in the colonization of Enterococcus strains, and as well the phenotype and genotype of resistance strains. Samples from cloacal swabs of broiler chickens were used for the isolation of strains of Enterococcus sp. The broilers were subjected to diets with growth promoter, probiotics, essential oils and ionophore coccidiostat and divided into groups according to treatment used. Two hundred forty isolates of Enterococcus sp. were confirmed the genus using the polymerase chain reaction (PCR), subjected to biochemical and molecular species identification, antibiotic susceptibility profile and verification of antibiotic resistance genes tet(M), tet(L) e erm(B) by PCR. Accordingly to the diets employed to the chickens a changing the composition or the number of Enterococcus sp. was observed. All diets, regardless to the presence or absence of ionophore coccidiostat showed an increase in the frequency of Enterococcus resistant when compared with the control group. However, the groups that received ionophore coccidiostat, the rate of resistant Enterococcus sp. was lower than the groups that did not administered this composition. The isolates that presented resistant to tetracycline, 94% and 30%, contained the genes tet(M) and tet(L), respectively. In the isolates resistant to erythromycin, 97.9% had the gene erm(B). There was no correlation of different diets for broiler chickens on colonization, phenotype and genotype resistance in the Enterococcus sp strains.
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Caracterização de isolados clínicos e ambientais de Acinetobacter sp : presença de ISAba 1 e diversidade de blaOXA-51-like / Characterization of clinical and environmental isolates of Acinetobacter sp.: ISAba1 presence and diversity of blaOXA-51-like

Gusatti, Carolina de Souza January 2011 (has links)
A capacidade de adquirir, com facilidade, resistência à terapia antimicrobiana torna-se uma das características mais estudadas em Acinetobacter sp., mundialmente conhecido por estar relacionado a surtos de infecções associadas à assistência a saúde (IAAS) e por ser apontado como um grave problema de saúde pública. Embora isolados clínicos desse gênero sejam extensivamente estudados quanto à presença e a diversidade de genes do tipo OXA-carbapenemases,existem poucos estudos sobre essa relação em isolados ambientais. Este trabalho teve como objetivo determinar a presença de carbapenemases do tipo OXA (e sua diversidade), de ISAba1 e de sua relação com as carbapenemases em isolados clínicos e de esgoto hospitalar de Acinetobacter sp. na cidade de Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Um total de 310 isolados (145 clínicos e 165 ambientais) foram submetidos a análise por PCR das regiões genéticas de interesse. A diversidade dos genes do tipo blaOXA-51 foi realizada por DGGE. Os resultados indicam a presença do gene blaOXA-58 em um isolado, pela primeira vez no Brasil. A sequência ISAba1 foi frequentemente encontrada (92,9%), porém, a sua associação com blaOXA-51 foi baixa e encontrada em 9,8% dos isolados clínicos e em 6,5% dos isolados ambientais. A análise de diversidade revelou uma baixa freqüência de alelos de OXA-51 entre os isolados estudados, sendo blaOXA-65 a variante mais encontrada. Contudo, podemos afirmar que o esgoto hospitalar analisado constitui-se de uma fonte de contaminação de bactérias patogênicas e que as precárias políticas de saneamento podem proporcionar a disseminação de multirresistência para o meio ambiente. / The ability of easily acquiring resistance to antimicrobial therapy becomes one of the most studied features in Acinetobacter sp., world renowned for being related to outbreaks of infection associated with health care and for being appointed as a serious public health problem. Although clinical isolates of this genus are extensively studied for the presence and diversity of OXAcarbapenemase genes, there are few studies about this relationship in environmental isolates. This study aimed to determine the presence of OXAtype carbapenemases (and yours diversity), of ISAba1 and its relationship with carbapenemases in clinical and hospital sewage isolates of Acinetobacter sp. in Porto Alegre, Rio Grande do Sul. A total of 310 strains (145 of clinical origin and 165 of environmental origin) were subjected to PCR analysis of genetic regions of interest. The diversity of blaOXA-51-like genes was performed by DGGE. The results indicate the presence of the gene blaOXA-58 in an isolated, for the first time in Brazil. ISAba1 was frequently found (92.9%) but its association with blaOXA-51-like was low and was found in 9.8% of clinical isolates and in 6.5% of environmental isolates. The diversity analysis showed that there is a low frequency of alleles of OXA-51 among the studied isolates being blaOXA-65 variant the most often found. However, we can state that the hospital sewage is considered to be a source of pathogenic bacteria contamination and that the poor sanitation politics contributes to the spread of multidrug resistance in the environment.
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Análise da ocorrência do gene da betalactamase em isolados clínicos de staphylococcus spp. resistentes à meticilina procedentes de hospital universitário da cidade do Recife-PE

SILVA, Natália Regina Souza da 24 February 2015 (has links)
Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-06-10T18:51:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Natália Final.pdf: 1682940 bytes, checksum: 561b828b32fcd807e7f34e4daee835f6 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-10T18:51:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertação Natália Final.pdf: 1682940 bytes, checksum: 561b828b32fcd807e7f34e4daee835f6 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Staphlylococcus desenvolveu a resistência aos betalactâmicos através de dois principais mecanismos, a expressão das betalactamases e a produção de PBP2a, codificadas pelos genes blaZ e mecA, respectivamente. Apesar da detecção do gene mecA por técnicas moleculares ser considerado o padrão ouro para a identificação das cepas de Staphlylococcus resistentes à meticilina (MRS), alguns estudos têm verificado discrepância entre a apresentação fenotípica da resistência à meticilina nessas cepas e a presença do gene mecA.O presente estudo teve como objetivo verificar se existe diferença de frequência do gene blaZ entre isolados clínicos de Staphylococcus spp. resistentes à meticilina portadores do gene mecA e os não portadores do gene. Foram estudados 47 isolados provenientes de amostras clínicas de hospital universitário da cidade do Recife. Essas amostras foram submetidas aos testes de susceptibilidade antimicrobiana, detecção do gene mecA para separação dos grupos de comparação e posterior detecção da presença de betalactamase através dos testes de cefinase em disco, Clover-Leaf e detecção do gene blaZ por PCR. Desta forma, foram observadas diferenças na frequência quando utilizados os testes fenotípicos para detecção. No teste de cefinase em disco, foram positivos 33,3% dos isolados portadores do gene mecA e 56,25% dos não portadores. No teste de Clover-Leaf, foi detectada a produção de betalactamase em 33,3% dos isolados portadores do gene mecA e 65,62% dos não portadores. Na pesquisa do gene blaZ, no entanto, não foi verificada diferença significativa nas frequências de detecção entre os grupos. Desta forma, indica-se o uso dos testes fenotípicos de detecção de produção de betalactamase, por apresentarem baixo custo e fácil operação, além de demonstrarem boa sensibilidade. / Staphlylococcus developed resistance to beta-lactam via two major mechanisms of beta-lactamase expression and production of PBP2a encoded by gene mecA and blaZ, respectively. Although the detection of the mecA gene by molecular techniques be considered the gold standard for identifying Staphlylococcus of methicillin-resistant strains (MRS), some studies have found discrepancies between the phenotypic presentation of methicillin resistance in these strains and the presence of the mecA gene. This study aimed to verify if there is frequency difference of blaZ gene among clinical isolates of Staphylococcus spp. methicillin-resistant carriers of mecA gene and non-carriers of the gene.47 isolates from clinical samples of University Hospital in Recife were studied.These samples were subjected to antimicrobial susceptibility tests and subsequent detection of mecA gene by PCR for separation of the comparison groups. After this, was performed to detect the production of beta-lactamase using the disk Cefinase tests, Clover Leaf and detection of blaZ gene by PCR. Thus, diferences in frequency were observed when phenotypics tests were used for detection. In Cefinase test disk,were positive 33.3% of the isolates carrying the mecA gene and 56.25% of non-carriers. In Clover-Leaf assay, the production of beta-lactamase was detected in 33.3% of isolates carrying the mecA gene and 65.62% of non-carriers.In search of blaZ gene, however, there was no significant difference in the frequency detection between groups. In this way, it indicates the use of phenotypic tests for detection of beta-lactamase production for having low cost and easy operation as well as demonstrating good sensitivity.

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