Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-08-08Bitstream added on 2014-06-13T19:42:47Z : No. of bitstreams: 1 costa_mm_dr_jabo.pdf: 539143 bytes, checksum: 38e4165c8bd5de4a8cf35184bd7ea3a7 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A seleção assistida por marcadores moleculares têm contribuído com os estudos para o desenvolvimento de cultivares resistentes. Os ganhos mais evidentes podem ocorrer em doenças como a ferrugem asiática da soja, onde a alta variabilidade do patógeno e a busca por novas fontes de resistência têm dificultado o sucesso dos melhoristas. Assim, os objetivos deste trabalho foram estudar a herança da resistência à ferrugem em diferentes fontes e desenvolver marcadores SCAR ligados a um loco de resistência para seleção assistida. Populações F2 oriundas dos cruzamentos PI 459025 x CD 208 (1), PI 200526 x CD 205 (2), PI 200456 x Conquista (3) e GC 84058-21-4 x IAC Foscarin 31 (4) foram submetidas à inoculação com a ferrugem e avaliadas quanto ao tipo de lesão (RB – resistente ou TAN – suscetível). O teste de Qui-quadrado indicou a presença de um gene dominante para os cruzamentos 1 e 2, enquanto no 3 e 4 observou-se a presença de um gene recessivo. A análise multivariada agrupou os genótipos mais similares, com base nos caracteres severidade da doença, número de vagens, número de sementes e ciclo, avaliados nos cruzamentos 2 a 4. Diferenças significativas foram encontradas em número de lesões e esporulação para genótipos RB e TAN. Dois bulks de DNA foram obtidos de plantas homozigotas resistentes e suscetíveis no cruzamento 1, para a análise de BSA. Dos 600 iniciadores RAPD testados, três foram discriminativos e localizam-se a 4,5, 6,2 e 10,2 cM do loco de resistência, em fase de repulsão. Um desses marcadores foi convertido a SCAR e se manteve discriminativo, podendo ser indicado para seleção assistida de genótipos resistentes com a mesma fonte. / Assisted selection by molecular markers has contributed to development studies of resistant cultivars. The most evident gains may occur for diseases like the Asian soybean rust, where the high variability of pathogen and the search for new resistance sources has difficult the breeder success. Thus, the aims of this work were to study the rust resistance inheritance in different sources and develop SCAR markers linked to a rust resistance locus for assisted selection. F2 populations from crosses PI 459025 x CD 208 (1), PI 200526 x CD 205 (2), PI 200456 x Conquista (3) and GC 84058-21-4 x IAC Foscarin 31 (4) were submitted to rust inoculation and evaluated by the lesion type reaction (RB – resistant or TAN – susceptible). Chi-square test indicated the presence of a single dominant gene for crosses 1 and 2, whereas the 3 and 4 crosses showed a single recessive gene. Multivariate analysis has grouped the most similar genotypes based on disease severity, number of pods, number of seeds and cycle for 2 to 4 crosses. Significant differences were observed in lesions number and sporulation rate for RB and TAN genotypes. Two DNA bulks were obtained, for BSA analysis, on cross 1, from resistant and susceptible homozygous plants. From the 600 tested RAPD primers, three of them were discriminative and located in repulsion phase at 4.5, 6.2 and 10.2 cM from the resistance locus. One of the RAPD markers was converted to SCAR and confirmed its discriminative nature. So it can be indicated for assisted selection of genotypes with the same resistance source.

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV12MA067.pdf: 824912 bytes, checksum: 361d8ffed5b35ef045437bfc7b0cdc47 (MD5) Previous issue date: 2012-04-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In view of the climate changes that have been intensified, especially water stress, this way, is extremely important to create cultivars that shows greater tolerance to this deficiency. This tolerance is acquired through a dense and deep root system. In this sense the selection of plants with promising root systems in segregating populations is one of the primordial steps in the process of the obtainment in a new cultivar. Another factor with extreme importance is the study of characters of the aerial part with shows the highest correlation with the root system. Thus the objective of this study was to: i) to identify three depths in the soil profile, genotypes in the first segregating generation with higher root system and verify the occurrence of heterosis for the root system. character. ii) identify the phenotypic correlation and yours direct and indirect effects of aerial part characters with the highest correlation with the root distribution, to facilitate the indirect selection for this character. The evaluations were carried out in segregating genotypes (F2) of beans from the crossing in full diallel of the three accessions of the Bean Active Germplasm Bank IMEGEM / UDESC: (BAF 07, BAF 09, BAF 50 and a commercial cultivar IPR Uirapuru). The evaluation of the root system was performed by BOHM (1979) method at three depths (0-10, 10-20 and 20-30 cm) with binary counting form. The components of the aerial part were evaluated when the plants reached the point of harvest. The characters stem diameter, plant height and first pod for having the highest correlation with the root distribution may help in the indirect selection. The low coefficients of determination indicate that the breeder should not be based only on indirect selection for genotypes with higher root system. At the conditions of this work, the selection of plants aiming to increase the root distribution and yield concurrently has not viable, since plants with high production of grains tend to have smaller root distribution. The genotypes measured not present a complete list of your characters, so that indirect selection only by single characters does not guarantee good results in the selection of plants. The propitiate genotypes to the advancement of generations are: two, seven and three for up to 20 cm depth and three for the depth up to 30 cm. The crossing between the parents BAF 07 (black group) and BAF 50 (Rio Group) showed wide genetic diversity, providing a significant increase of the root system in its progenies. The selection of superior genotypes in the 20-30 cm layer is limited because the majority genotypes has a similar distribution and less pronounced. In virtue of the high efect of dominance component occurred heterosis for root distribution in early generations, this could complicate the selection in autogamous species for the character / Tendo em vista as variações climáticas que vem se intensificando, principalmente a deficiência hídrica, é de extrema importância a criação de cultivares que apresentem maior tolerância a esta deficiência. Esta tolerância é adquirida através de um sistema radicular profundo e com melhor distribuição perante a outros genótipos. A seleção de plantas com sistema radicular promissor em populações segregantes é uma das etapas primordiais no processo de obtenção do novo cultivar. Outro fator de extrema importância, é o estudo dos caracteres da parte aérea que apresentam maior correlação com o sistema radicular. Deste modo o objetivo deste trabalho foi: i) identificar em três camadas no perfil do solo, genótipos na primeira geração segregante com sistema radicular superior e verificar a ocorrência da heterose para o caráter sistema radicular. ii) identificar a correlação fenotípica e seus efeitos diretos e indiretos dos caracteres da parte aérea que apresentam maior correlação com a distribuição radicular, visando facilitar a seleção indireta para este caráter. As avaliações foram realizadas em genótipos segregante (F2) de feijão oriundos do cruzamento em dialélo completo de três acessos pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma de Feijão do IMEGEM/UDESC: (BAF 07, BAF 09, BAF 50 e um cultivar comercial IPR Uirapuru). A avaliação do sistema radicular foi realizada pelo método do perfil descrito por (BOHM 1979) em três camadas (0-10; 10-20 e 20-30 cm) com contagem de forma binária. Os componentes da parte aérea foram avaliados quando as plantas atingiram o ponto de colheita. Os caracteres diâmetro do caule, estatura de planta e inserção do primeiro legume por apresentarem as maiores correlações com a distribuição radicular podem auxiliar na seleção indireta. Os baixos coeficientes de determinação indicam que o melhorista não deve basear-se apenas na seleção indireta para obter genótipos com sistema radicular superior. A seleção de plantas visando aumento da distribuição radicular e produção de grãos concomitantemente não se apresenta viável, uma vez que plantas com alta produção de grãos tendem a apresentar menor distribuição radicular. Os genótipo avaliados não apresentam relação completa entre seus caracteres, de maneira que a seleção indireta apenas por caracteres isolados não garante resultados promissores na seleção. Os genótipos propícios para o avanço de gerações são: dois, sete e três para camada até 20 cm e três para a camada até 30 cm. O cruzamento entre os genitores BAF 07 (grupo preto) e BAF 50 (grupo carioca) tem ampla divergência genética, proporcionando incremento significativo do sistema radicular nas suas progênies avaliadas. A seleção de genótipos superiores na camada de 20-30 cm é limitada, pois a maioria dos genótipos apresenta distribuição similar e pouco pronunciado. Em virtude do elevado efeito do componente de dominância ocorreu heterose para a distribuição radicular em gerações iniciais, tal fato pode dificultar a seleção em espécies autógamas para o caráter

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_gaspar_malone.pdf: 1014335 bytes, checksum: f4f5efb929d6388495d76e99a23969c2 (MD5) Previous issue date: 2007-03-09 / In this work, a collection of red rice ecotypes, with promising physiological characteristics associated to seed vigor, was used to conduct three studies to understand the germination/emergence process in rice. In the first study, a biochemical and molecular characterization of the collection was performed to identify the parent s with the best hybrid potential to obtain segregant mapping populations. In the second study, the AMY1 α-amylase gene of rice, involved in the breakdown of endosperm starch during germination, was analyzed by DNA sequencing, to identify mutants to this gene from red rice ecotypes. The mutation effects were analyzed thought physiological performance of ecotypes. In the last study, an segregant population from FFS-45 red rice ecotype (with germination/emergence character) and BRS 7 taim cultivar (without the character), was used to identify molecular markers linked to the trait by DNA Pooling methodology. The molecular markers identified were used to gene prospection in the respective genomics regions. Five SSR markers were identified linked to germination/emergence process. Results of these researches generated a great amount of data that can be contribute to understand the physiological/molecular process involved in rice seed germination/emergence process. / No presente trabalho, uma coleção de ecótipos de arroz vermelho, com promissoras características fisiológicas associadas aos componentes de vigor de sementes, foi utilizada como fonte de trabalho para a execução de três trabalhos de pesquisa que visam melhor entender o processo de germinação/emergência em arroz. Num primeiro trabalho, foi realizada uma caracterização bioquímica e molecular desta coleção com o objetivo de identificar aqueles que apresentaram melhor potencial de hibridização para a obtenção de populações segregantes de mapeamento genético. Num segundo trabalho de pesquisa, um dos genes da α-amilase do arroz, fortemente ligado ao processo de degradação das reservas do endosperma durante o processo de germinação, foi analisado através de estudos de Seqüenciamento de DNA, para a identificação de mutantes para este gene entre os membros da coleção de ecótipos de arroz vermelho. Os efeitos das mutações foram assim, analisados em relação ao desempenho fisiológico dos ecótipos. No terceiro trabalho, uma população segregante proveniente do cruzamento entre o ecótipo de arroz vermelho FFS-45 (com o caráter germinação/emergência em grandes profundidades do solo) e a cultivar BRS 7 taim (sem o caráter), foi utilizada para a realização de estudos de associação de marcadores moleculares ligados ao caráter, utilizando a técnica de análise de DNA em bulk. Ao todo, cinco marcadores foram identificados como associados ao caráter germinação/emergência. Os resultados geraram informações que contribuíram para o entendimento do processo fisiológico/molecular de germinação/emergência em sementes de arroz.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_ Igor_ Valerio.pdf: 990885 bytes, checksum: 6b9bd709ded7ec022e6445c220d43a98 (MD5) Previous issue date: 2008-05-20 / Many selection strategies have contributed for the continuous progress in wheat breeding programs. On the other hand, the main yield component (number of fertile tillers), has still been underexploited. In this sense, in order to investigate this issue, this work was planned to report the state of the art processes involved in tiller production and development. This information was crucial to the design of the next experiments on genotypes contrasting for tiller number and their response in segregating generations, when subjected to artificial crosses. The seeding density influences greatly grain yield, since it is directly related to fertile tiller production potential, and has a direct effect on number of ears per unit area. Likewise, the genotype and environment effects were important for the adjustment of seeding density and maximum yield obtained. It is essential that the best seeding rate be found for a given genotype at a given location. Genotypes with reduced tillering potential, revealed a larger buffering effect. However, only at seeding density higher than 400 seeds m-2. The genotypes with high tillering potential revealed the best grain production performance at low seeding density. However, these genotypes have a long developing cycle, with high tillering senescence rate when subjected to high seeding density. The use of genotypes contrasting for tillering ability enabled one to find in the segregating generations, wide genetic variability for tillering ability and consequently for the yield components. The selection for high or low number of tillers and the bulk selection vary their efficiency with the crop management system to which the segregating population is subjected. The best grain yield performance is achieved in the selection for low number of tillers, with high average grain weight under competition. / Diversas estratégias de seleção têm contribuído para o contínuo progresso da cultura do trigo nos programas de melhoramento. Por outro lado, o principal componente do rendimento (número de afilhos férteis), ainda revela severos questionamentos sobre o seu real aproveitamento em condições de lavoura. Neste sentido, por entender a fundamental importância deste assunto, foi buscado neste trabalho, primeiramente, relatar o estado da arte dos processos envolvidos na produção e desenvolvimento de afilhos, o que permitiu trazer, posteriormente, contribuições importantes para o desenvolvimento dos demais trabalhos em genótipos contrastantes para afilhamento e a resposta destes, em gerações segregantes, quando submetidos a cruzamentos artificiais. A densidade de semeadura revela a maior variação na produtividade da cultura, uma vez que está diretamente relacionada ao potencial do genótipo em produzir afilhos férteis, com efeito direto no número de espigas produzidas por unidade de área. Da mesma forma, o efeito do genótipo e do ambiente foram determinantes na densidade de semeadura obtida com o máximo rendimento de grãos, destacando a necessidade de implementar, para cada condição de cultivo e genótipo utilizado, uma densidade ideal. Genótipos com reduzido potencial de afilhamento revelam o maior efeito compensatório, porém, com aproveitamento somente em densidade superior a 400 sementes m-2. Os genótipos com elevado potencial de afilhamento revelam o melhor comportamento para rendimento de grãos em reduzidas densidades, porém, evidenciam um longo ciclo de desenvolvimento, com senescência elevada de afilhos quando submetidos a elevadas densidades. O uso de genótipos contrastantes para o afilhamento, possibilitou encontrar em gerações segregantes, ampla variabilidade genética para o caráter e consequentemente para os componentes do rendimento. A seleção para elevado ou reduzido número de afilhos e a seleção em bulk são dependentes do sistema de manejo em que a população segregante for submetida. O melhor desempenho em rendimento de grãos é alcançado na seleção para reduzido número de afilhos, com média elevada para massa de grãos em competição.