Made available in DSpace on 2017-07-25T19:30:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Danilo Fernando Silva.pdf: 2153350 bytes, checksum: 98ff37c94e2ac6b2c024e233ffbea127 (MD5) Previous issue date: 2014-05-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objectives were to evaluate the potential of half sib progenies of maize for the ability to produce green maize, estimate through statistical multivariate procedures the genetic divergence and select maize progenies with the highest number of characteristics of interest. The 96 progenies were evaluated in two experiments in a randomized block design with three replications, using the variety Cativerde 02 (CATI - SP) and the hybrid AG 1051 (AGROCERES) as commercial control. 18 phenotypic characteristics were measured associated with agronomic adaptation, the potential yield and the commercial aspect of the ears of maize. The data were submitted the individual and joint analyses of variance of the experiments. The means of phenotypic variables were grouped according to Scott and Knott test. The genetic parameters were estimated using the mathematical expectation of the mean squares of the sources of variation, were considered random the effects of treatments (progenies) and experiments. The genetic divergence between treatments was obtained from the Generalized Mahalanobis Square Distance. The genotypes were grouped by genetic dissimilarity through UPGMA and Tocher Optimization methods. To check the consistency of groups Fisher discriminant analysis (1936) was applied. The phenotypic variables were submitted to principal component analysis aiming to reduce the data dimension and selection high progenies for ability to produce green maize. The results of the 18 characteristics confirmed the genetic potential of the majority half sib progenies as function the productive precocity, high yield and commercial quality of the ears of green maize when compared to commercial control. The genetic parameters estimates showed high variability among the progenies, indicating the possibility of genetic gains with artificial selection. The UPGMA cluster analysis and Tocher were effective in identifying dissimilarity genotypes groups. The UPGMA method was more sensitive than the Tocher optimization, because it enabled the formation of 11 genetically dissimilar groups. The principal component analysis (PC) reduced set of 18 variables on three principal components explaining 70 % of the total phenotypic variance. The coefficients of the eigenvectors indicated that PC1 was more related to the productive potential of green maize ears. The PC2 was more influenced by the characteristics associated with the ears commercial aspect and PC3 for adaptive characteristics of maize genotypes. The eigenvectors of the PC1 showed the characteristics RENDC, NEC, %EC, REND, PE, % EE and PEC were the most important in defining the productive potential and as well as to attend the demands of the consumer market, allowing through the scores of this the selection of 30 half sib progenies highly favorable to this ability. / Os objetivos do trabalho foram avaliar o potencial de progênies de meios irmãos de milho quanto à aptidão para produção de milho verde, estimar através de procedimentos estatísticos multivariados a divergência genética e selecionar progênies de milho com o maior número de características de interesse. As 96 progênies foram avaliadas em dois experimentos no delineamento aleatorizado em blocos com três repetições, utilizando a variedade Cativerde 02 (CATI-SP) e o híbrido AG 1051 (AGROCERES) como testemunhas comerciais. Foram mensuradas 18 características fenotípicas associadas à adaptação agronômica, ao potencial de rendimento e ao aspecto comercial das espigas de milho verde. Os dados foram submetidos às análises de variância individuais e conjunta dos experimentos. As médias das variáveis fenotípicas foram agrupadas pelo teste de Scott e Knott. Os parâmetros genéticos foram estimados através da esperança matemática dos quadrados médios das fontes de variação, sendo considerados aleatórios os efeitos de tratamentos (progênies) e de experimentos. A divergência genética entre os tratamentos foi obtida a partir da Distância Quadrada Generalizada de Mahalanobis. Os genótipos de milho foram agrupados pela dissimilaridade genética através dos métodos UPGMA e de Otimização de Tocher. Para verificar a consistência dos grupos foi aplicada a análise discriminante de Fisher (1936). As variáveis fenotípicas foram submetidas a análise de componentes principais visando a redução da dimensão dos dados e a seleção de progênies superiores para a aptidão de milho verde. Os resultados das 18 características confirmaram o potencial genético da maioria das progênies de meios irmãos em função da precocidade produtiva, elevado rendimento e qualidade comercial das espigas de milho verde quando comparadas as testemunhas comerciais. As estimativas dos parâmetros genéticos evidenciaram elevada variabilidade entre as progênies, indicando a possibilidade de ganho genético com a seleção artificial. Os métodos de agrupamento UPGMA e Tocher foram eficazes na identificação de grupos de genótipos dissimilares. O método UPGMA foi mais sensível que o de Otimização de Tocher, pois possibilitou a formação de 11 grupos geneticamente dissimilares. A análise de componentes principais (CP) reduziu o conjunto de 18 variáveis em três componentes principais explicando 70% da variância fenotípica total. Os coeficientes dos autovetores indicaram que o CP1 foi mais relacionado ao potencial produtivo de espigas de milho verde. O CP2 mais influenciado pelas características associadas ao aspecto comercial das espigas e o CP3 pelas características adaptativas dos genótipos de milho. Os autovetores do CP1 evidenciaram que as características RENDC, NEC, %EC, REND, PE, %EE e PEC foram as mais importantes para a definição do potencial produtivo bem como para atender as exigências do mercado consumidor, possibilitando através dos escores deste a seleção de 30 progênies de meios irmãos com características altamente favoráveis a esta aptidão.

O presente estudo objetivou estimar parâmetros genéticos visando quantificar a variabilidade genética de uma população de café robusta (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) introduzida da Costa Rica e analisar o seu potencial genético para o desenvolvimento de futuras cultivares clonais para o estado de São Paulo. Outro intuito foi verificar a possibilidade de submeter essa população à seleção recorrente, tornando-a, assim, fonte de alimentação e sustentação de programas de melhoramento genético do café robusta. O experimento foi composto por 25 tratamentos, sendo 21 progênies de C. canephora e quatro cultivares de C. arabica, plantados em Mococa (SP). O delineamento experimental utilizado foi em látice balanceado 5x5 quadruplicado, com seis repetições e uma planta por parcela. Foram realizadas doze colheitas e após a sexta colheita as plantas foram podadas. Em 2004, foi realizada uma seleção fenotípica dessa população a fim de clonar os melhores indivíduos. Essa seleção resultou em novo experimento, instalado em Campinas, seguindo o delineamento de blocos ao acaso, com três repetições, 28 clones e quatro plantas por parcela, sendo realizadas cinco colheitas consecutivas. As análises estatísticas e biométricas foram realizadas considerando os modelos lineares mistos (procedimento REML/BLUP), por meio do software Selegen, cujos componentes de variância são estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML) e os valores genotípicos preditos pela melhor predição linear não viesado (BLUP). As análises mostraram que, na população em estudo, observou-se elevada variabilidade genética, passível de ser explorada tanto para a extração de clones quanto para a seleção recorrente. As adversidades climáticas severas fizeram com que a seleção fosse prejudicada. Nessa situação é preferível não considerar o período afetado e analisar os dados após a recuperação das plantas. A seleção baseada em seis colheitas forneceu estimativas de parâmetros e ganhos genéticos similares aos obtidos na seleção baseada em duas colheitas de alta produção. Os ganhos genéticos esperados nas duas formas de propagações foram elevados e a seleção clonal proporcionou maiores ganhos do que a sexual. No experimento clonal foi possível identificar materiais com potencial produtivo e que poderão vir a ser recomendados para o cultivo no estado de São Paulo. Apesar de a interação genótipos x colheitas ter sido do tipo complexa, devido ao veranico ocorrido, esta não afetou significativamente o ordenamento dos melhores clones e nem comprometeu as estimativas dos parâmetros genéticos. Os coeficientes de variação experimental e genético bem como seu valor relativo deverão ser analisados conjuntamente com o número de repetições e a acurácia seletiva. A seleção recorrente deverá ser conduzida concomitantemente com o programa de seleção clonal, a fim de evitar o esgotamento da variabilidade genética e o comprometimento do programa de melhoramento genético visando o desenvolvimento de cultivares clonais. Tendo em vista que a população inicial foi constituída por um pequeno número de progênies, é aconselhável o monitoramento do tamanho efetivo populacional e do grau de endogamia ao longo dos ciclos de seleção recorrente. / The objective of this research was to estimate genetic parameters to quantify the variability of a population of robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) introduced into Brazil from Costa Rica in 1974 aiming at determining its genetic potential for the development of clonal or seedling cultivars for the state of São Paulo, Brazil. The feasibility has also been studied to submit this population to recurrent selection, making it a continuous source of improved base material in support of varietal improvement of robusta. An experiment consisting of 21 open pollinated seedling progenies of robusta and four cultivars of arabica was established in Mococa (SP) in 1975. Yield was observed for twelve harvests and after the sixth harvest the plants were pruned. The experimental lay out was a balanced 5x5 quadruple lattice design, with six replicates and one plant per plot. In 2004 a phenotypic selection of this population for yield was carried out aiming at cloning the best individuals. These 28 clones were planted in an experiment in Campinas in 2005, following a completely randomized block design, with 28 treatments (clones), three replications and four plants per plot. In total, yields were collected over five harvests. Statistical and biometrical analyzes were performed considering the linear mixed models (REML/BLUP), through software Selegen, where the variance components are estimated by restricted maximum likelihood (REML) and genotypic values predicted by best linear unbiased prediction (BLUP). The analyzes showed that the population had high genetic variability, which can be exploited for the extraction of both clones and seedling progenies, used for recurrent selection. Selection was impaired by severe adverse weather conditions. In such situations it is preferable not to consider the affected period and analyze the data after recovery of the plants. Due to the moisture stress that occurred in the clonal trial, genotype x environment interaction was complex. However this did not affect the ranking of superior clones nor compromised the genetic parameter estimates. Selection for yield based on six yield resulted in genetic parameters and genetic gains similar to those obtained by selection based on two high yielding harvesting periods. The expected genetic gains both for clones as for open pollinated progenies were high. However, clonal selection resulted in higher genetic gains for yield than the seedling selection. In the clonal experiment it was possible to identify materials with high yield potential that may become to be recommended for cultivation in São Paulo State. The experimental, genetics and relative coefficients of variation, should be analyzed together with the number of replications and selective accuracy. Recurrent selection should be conducted concurrently with the clonal selection program in order to avoid depletion of genetic variability and to impairthe breeding program aiming at the development of clonal cultivars. Considering that the initial population was composed of a small number of progeny, it will be important monitoring adequately the effective size and the inbreeding coefficient during recurrent selection cycles.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 164176 bytes, checksum: b14dc96758addd4c516b427d913d7a6c (MD5) Previous issue date: 2009-05-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The BLUP methodology, which is widely used in animal and forestry genetic evaluation, can also be applied to annual crop breeding. The objective of this study was to compare the accuracy and efficiency of among- and within-half-sib family selection through the use of multi-trait BLUP, single-trait BLUP and phenotypic selection. Expansion volume and yield data from two recurrent selection cycles of a popcorn population were analyzed. Progeny tests were designed as a lattice. In order to maximize accuracy of the prediction of breeding values, the BLUP analyses included phenotypic values of the two cycles. All statistical analyses were performed using the ASREML software. The multi-trait BLUP method demonstrated greater accuracy and efficiency in family selection. In the case of within-family selection, both accuracy and efficiency of multi-trait or single-trait BLUP methods were equivalent. The selection efficiency of the multi-trait BLUP was dependent on the estimated genetic parameters, particularly the difference between the genetic and environmental correlations of the traits. / A metodologia BLUP, que é amplamente utilizada na avaliação genética animal e florestal também pode ser aplicada no melhoramento de culturas anuais. O objetivo deste estudo foi comparar a acurácia e a eficiência da seleção entre e dentro de famílias de meios-irmãos através da utilização do BLUP multicaracterística, BLUP unicaracterística e seleção fenotípica. Dados de capacidade de expansão e produção de dois ciclos de seleção recorrente em uma população de milho-pipoca foram analisados. Os testes de progênies foram delineados como um látice. Visando maximizar a acurácia da predição dos valores genéticos as análises BLUP incluíram valores fenotípicos dos dois ciclos. Todas as análises estatísticas foram realizadas utilizando o software ASREML. O método BLUP multicaracterística apresentou maior acurácia e eficiência de seleção de famílias. No caso da seleção dentro de famílias a acurácia e a eficiência dos métodos BLUP multicaracterística e BLUP unicaracterística foram equivalentes. A eficiência de seleção do BLUP multicaracterística foi dependente dos parâmetros genéticos estimados, particularmente da diferença entre as correlações genéticas e ambientais das características.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Leticia da Silveira Pinheiro.pdf: 1061417 bytes, checksum: d3b6dccd4e5c363bd8b7c9da2c672cc0 (MD5) Previous issue date: 2008-03-07 / Recurrent Selection is a population inbreed method that is not traditionally used in autogamous species as rice. However, it is still an interesting methodology to the implementation of recurrent selection populations, due to the possibility of obtaining genotypes with wide genetic base and adequate agronomical traits. It is even more attractive when a great genetic variability is easily available, as it is for rice and could be largely used in the development of more productive elite cultivars and with a better production stability even under low input agricultural systems. Two recurrent selection irrigated rice populations, developed by Embrapa Arroz e Feijão, were synthetized using different recombination methods. The CNA-IRAT 4 population was developed in field conditions using male-sterelity, while the CNA 12 population originated from manual crosses in a circulant partial diallel scheme. The aim of this work was the evaluation of the genetic variability among cycles of the two recurrent selection populations using fourteen SSR markers. Hundred and eighty genotypes of the cycles 1, 2 and 5 of CNA-IRAT 4 population and cycles 1 and 2 of CNA 12, were evaluated. The AMOVA did not indicate any genetic structure among the cycles of selection, meaning that the greater variation was attributed between individuals within cycles, in both studied populations. Unexpected alleles, which means alleles that not belong to the genetic pool of the genitors, were identified in both populations and in all cycles evaluated, mostly of these alleles were observed on CNA-IRAT 4 population. These alleles were probably a result of undesired crosses of genotypes which did not belong to both populations. Parameters Fis and Fit of Wright s statistics indicated that the genetic variability of the manually conducted population (CNA 12) were increased while the population using male-sterelity recombination (CNA-IRAT 4) were reduced. The mean reason for this particular situation was due to the directionally crosses that promoted a greater combination between the alleles of all genitors, while male-sterelity methodology pollination the alleles from plants with major height and more capable of producing more pollen were privileged. To avoid the genetic drift in CNA-IRAT 4, genotypes genetically divergent, with more General Capacity of Combination and with good agronomic attributes, should be introduced on this population. / Seleção recorrente é um método de melhoramento populacional ainda pouco empregado em espécies autógamas, como o arroz. Contudo, a possibilidade de obter genótipos de ampla base genética e com bons atributos agronômicos, é um atrativo interessante para a implementação de populações de seleção recorrente, sobretudo pela necessidade de utilizar a grande variabilidade genética disponível para enfrentar o desafio de desenvolver cultivares elite mais produtivas e capazes de manter a estabilidade de produção. Foram utilizadas, neste estudo, duas populações de seleção recorrente de arroz irrigado, desenvolvidas pelo programa de melhoramento genético da Embrapa Arroz e Feijão. A população CNA-IRAT 4 portadora do gene da macho-esterilidade genética, permitindo assim que a sua recombinação seja feita à campo, e a população CNA 12 recombinada manualmente através do esquema de cruzamento em dialelo ciculante por não possuir este gene. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética entre os ciclos de seleção das duas populações por meio de 14 marcadores SSR. Foram avaliados 180 indivíduos dos ciclos 1, 2 e 5 na CNA-IRAT 4, e ciclos 1 e 2 na CNA 12. O estudo da análise de variância molecular (AMOVA) não indicou nenhum tipo de estruturação entre os ciclos de seleção definindo que a maior parte da variação foi encontrada entre os indivíduos dentro dos ciclos do que entre os ciclos em ambas as populações. Foram identificados alelos não provenientes dos genitores nas duas populações, e em todos os ciclos, principalmente para a CNA-IRAT 4. Estes alelos foram provavelmente resultantes da fecundação indesejada a partir de genótipos que não faziam parte das populações. Os parâmetros Fis e Fit da estatística F de Wright indicaram que a recombinação manual está ampliando a variabilidade genética da população CNA 12, enquanto que a recombinação via gene da macho-esterilidade está reduzindo a variabilidade genética da CNA-IRAT 4, e o principal motivo é que os cruzamentos dirigidos estão promovendo uma maior combinação entre os alelos de todos os genitores, enquanto que a polinização via macho-esterilidade vêm privilegiando os alelos dos genótipos com maior porte e capacidade de produção de pólen e do macho-estéril. Para evitar a deriva genética na CNA-IRAT 4, genótipos de arroz geneticamente divergentes das progênies, com maior Capacidade Geral de Combinação e com bons atributos agronômicos, deverão ser introduzidos nesta população.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:24:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Janine M Guedes.pdf: 986675 bytes, checksum: 0cc34cd9a835050bc20a4f5c99b5b4a5 (MD5) Previous issue date: 2012-03-15 / Rice (Oryza sativa) stands out in Brazil for its economic and social importance, being an important source of protein and energy. Selecting lines of upland rice adapted to different environments is critical to the success of breeding programs targeted to family farmers in the state of Goiás, The objective of this work was to evaluate S0:2 families drawn from CNA9 population of the upland rice breeding program in greenhouse and in the field, aiming to select families for recombination and obtainment of a new selecting cycle. 50 families from CNA9 population from recurrent selection were used, in four experiments, with N, P, and inoculant combinations, in a randomized bloc design arrangement with two replicates in greenhouse. Traits evaluated were: plant height, chlorophyll content, canopy dry matter, roots dry matter and volume. The field experiment was arranged in a 14 X 14 square lattice, with 194 families, two controls, and three replicates. Traits evaluated were: plant height, flowering and yield, besides the following diseases: leaf and neck blast, scald, brown spot, grain spot, and narrow leaf spot. Results obtained from greenhouse indicate that families studied performed similarly in the absence of the inoculant, but responded differently for plant height, dry matter, and root volume, regarding nitrogen and phosphorus combinations. Field data showed that the families drawn from CNA9 population showed superior performance when compared to controls and to the original population, especially regarding neck blast and yield. It was possible to select 48 families from the field to recombine in the next breeding cycle. / O arroz (Oryza sativa) destaca-se no Brasil por sua importância econômica e, sobretudo social, sendo uma importante fonte de proteína e energia. Selecionar linhagens de arroz de terras altas adaptadas a ambientes diversos é de extrema importância para o sucesso dos programas de melhoramento direcionados para os agricultores familiares do estado de Goiás. O objetivo desse trabalho foi avaliar famílias S0:2 da população CNA9 do programa de melhoramento de arroz de terras altas em casa de vegetação e no campo, visando a seleção de famílias para recombinação e obtenção de um novo ciclo de seleção. Foram utilizadas 50 famílias da população CNA9 de seleção recorrente em quatro experimentos, utilizando combinações de N, P e inoculante, no delineamento blocos casualizados com duas repetições, em casa de vegetação. Os caracteres avaliados foram altura de plantas, teor de clorofila, matéria seca da parte aérea, matéria seca de raiz e volume. O experimento em campo foi um látice quadrado 14 x 14 com 194 famílias e 2 testemunhas, com três repetições. Foram avaliados os caracteres altura de plantas, floração e produtividade, além das principais doenças: brusone na folha, brusone no pescoço, escaldadura, mancha parda, mancha de grãos e mancha estreita. Dos resultados obtidos para casa de vegetação, pode-se concluir que as famílias mostraram comportamento semelhante na ausência ou presença do inoculante e houve resposta diferenciada das famílias para os caracteres altura de plantas, matéria seca e volume de raiz para as combinações de nitrogênio e fósforo. Os resultados obtidos no campo mostraram que as famílias avaliadas da população CNA9 apresentaram desempenho superior às testemunhas e a população original principalmente em relação a brusone no pescoço e a produtividade de grãos. Foi possível selecionar 48 famílias no campo para recombinação e obtenção do próximo ciclo.