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Geographic characteristics of circulation patterns and features in the South Atlantic and South Indian Oceans using satellite remote sensing

Meeuwis, June Myrtle 10 April 2014 (has links)
D.Litt. et Phil. / Please refer to full text to view abstract
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The United States, the South Atlantic, and Antarctica : interests and challenges /

McNaught, Pamela J. January 1990 (has links) (PDF)
Thesis (M.A. National Security Affairs)--Naval Postgraduate School, 1990. / Thesis Advisor(s): Bruneau, Thomas C. Second Reader: Breemer, Jan S. "June 1990." DTIC Identifier(s): International politics, Treaties, Security, Cooperation, South America, South Africa, Competition, Natural resources, Sea lanes of communication, Naval operations, Foreign policy, Balance of power, Sovereignty, Spheres of influence, National interests. Author(s) subject terms: U.S. Interests, South Atlantic, Southern Cone, Antarctica. Includes bibliographical references (p. 101-104). Also available online.
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Submesoscale coherent vortices in the deep Brazil Basin

Kassis, Patricia January 2000 (has links)
Thesis (S.M.)--Joint Program in Physical Oceanography (Massachusetts Institute of Technology, Dept. of Earth, Atmospheric, and Planetary Sciences and the Woods Hole Oceanographic Institution), 2000. / Includes bibliographical references (p. 65-67). / With Lagrangian and hydrographic data taken in the deep Brazil Basin, we identify several submesoscale coherent vortices (SCVs). These features contrast with SCV paradigms in that float data indicate approximately equal populations of cyclonic and anticyclonic vortices, and hydrographic data suggest that roughly half exhibit the convex lens shape generally associated with SCVs, while half are instead shaped like a concave lens, with isopycnal surfaces pinched together. There is some evidence that the vortex cores may be enriched in warm, salty North Atlantic Deep Water, suggesting formation in the north or northwest regions of the basin. Data is available from 153 floats which were ballasted for 2500 and 4000 db pressures. They tracked 34 eddies, which are believed to be roughly 30 km in diameter, and rotate with apparent periods of about 30 days. Many floats experienced formation or entrainment events, and destruction or detrainment events, near seamounts. / by Patricia Kassis. / S.M.
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Dinâmica sazonal do ictioplâncton em uma área costeira subtropical - Ubatuba, São Paulo / Ichthyoplankton sazonal dynamics in a subtropical coastal area - Ubatuba, São Paulo

Aguilar, Tulia Isabel Martinez 21 August 2018 (has links)
Os estudos sobre a ecologia de ovos e larvas de peixes em áreas costeiras desempenham um papel relevante para o entendimento da biologia das espécies, visto que essa fase de desenvolvimento é o mais crítico do seu ciclo de vida. Este trabalho tem como objetivo principal descrever a variação temporal da comunidade ictioplanctônica em estação fixa localizada em Ubatuba-SP (23º 36,79’ S; 44º 53,46’ W), e analisar sua relação com a hidrografia local, entre fevereiro/2014 e fevereiro/2015. Para o melhor entendimento da área de estudo foi realizado: análise de percentuais de massa de água, composição, densidade, distribuição temporal das larvas de peixes e uma análise multivariada de componentes principais (ACP). Os principais resultados mostram a alta influência da Água Costeira (≥ 50%) nos primeiros 10 m de profundidade em todos os meses de coleta. A Água Tropical não foi identificada com altos percentuais (≥ 50%), com exceção de junho e julho . A Água Central do Atlântico Sul (ACAS) comparece com altos percentuais (≥ 50%) em fevereiro, outubro, novembro e dezembro/2014. A concentração média de Clorofila a, nas campanhas com alta influência da ACAS, foi de 1,98±1,25 mg m-3 e, nas campanhas com baixa influência da ACAS, foi de 1,04±0,71 mg m-3. A biomassa total do zooplâncton foi maior na rede de malha 50 μm e menor na de 200 μm. Foram coletadas 2.446 larvas de peixes, sendo que 1.906 foram identificadas em 17 ordens, 25 famílias, 23 gêneros e 26 espécies. Paralichthyidae e Sciaenidae tiveram frequência de ocorrência (FO) superior a 80% e densidade superior a 40 larvas 100 m-3; a FO de Ophidiidae e Carangidae foi de 58 e 67%, respetivamente. A análise de PCA evidenciou a formação de três grupos de espécies, cuja densidade e frequência de ocorrência variam no decorrer do ano, especialmente em função da maior ou menor influência da ACAS. / Studies on the ecology of fish eggs and larvae in coastal regions are important to understand the biology of species, since this developmental stage is the most critical in its life cycle. This study aims to describe the temporal variation of ichthyoplankton community in a fixed sampling station at Ubatuba-SP (23º 36.79’ S; 44º 53.46’ W), and to evaluate its relation with the local hydrographical regime along a year, February/2014 to February/2015. To better understand the study area, we performed: an analysis of water masse percentages, composition, density and temporal distribution of larval fishes and a principal component analysis (PCA). The main results show the high influence of Coastal Water (≥50%) in the first 10 m depth on all sampling months. The Tropical Water was not recognized with high percentages (≥50%), with exception on June and July. ACAS occurs with high percentages (≥50%) on February, October, November and December /2014. Chlorophyll-a was 1.98±1.25 mg m-3, in campaigns with high ACAS influence, while under low ACAS influence the average chlorophyll-a was 1.04±0.71 mg m-3. Total biomass was highest for 50μm zooplankton and lowest for 200μm ones. A total of 2,446 larvae were collected and 1,906 were identified, totaling 17 orders, 25 families, 23 genera and 26 species. Occurrence frequency of Paralichthyidae and Sciaenidae was superior than 80% and density higher than 40 larvae 100 m-3. For Ophidiidae and Carangidae, occurrence frequency was 58 and 67%, respectively. According the PCA, three groups of species were formed, whose occurrence frequence and density vary during the year, especially in light of the greater or lesser influence of the ACAS.
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Dinâmica sazonal do ictioplâncton em uma área costeira subtropical - Ubatuba, São Paulo / Ichthyoplankton sazonal dynamics in a subtropical coastal area - Ubatuba, São Paulo

Tulia Isabel Martinez Aguilar 21 August 2018 (has links)
Os estudos sobre a ecologia de ovos e larvas de peixes em áreas costeiras desempenham um papel relevante para o entendimento da biologia das espécies, visto que essa fase de desenvolvimento é o mais crítico do seu ciclo de vida. Este trabalho tem como objetivo principal descrever a variação temporal da comunidade ictioplanctônica em estação fixa localizada em Ubatuba-SP (23º 36,79’ S; 44º 53,46’ W), e analisar sua relação com a hidrografia local, entre fevereiro/2014 e fevereiro/2015. Para o melhor entendimento da área de estudo foi realizado: análise de percentuais de massa de água, composição, densidade, distribuição temporal das larvas de peixes e uma análise multivariada de componentes principais (ACP). Os principais resultados mostram a alta influência da Água Costeira (≥ 50%) nos primeiros 10 m de profundidade em todos os meses de coleta. A Água Tropical não foi identificada com altos percentuais (≥ 50%), com exceção de junho e julho . A Água Central do Atlântico Sul (ACAS) comparece com altos percentuais (≥ 50%) em fevereiro, outubro, novembro e dezembro/2014. A concentração média de Clorofila a, nas campanhas com alta influência da ACAS, foi de 1,98±1,25 mg m-3 e, nas campanhas com baixa influência da ACAS, foi de 1,04±0,71 mg m-3. A biomassa total do zooplâncton foi maior na rede de malha 50 μm e menor na de 200 μm. Foram coletadas 2.446 larvas de peixes, sendo que 1.906 foram identificadas em 17 ordens, 25 famílias, 23 gêneros e 26 espécies. Paralichthyidae e Sciaenidae tiveram frequência de ocorrência (FO) superior a 80% e densidade superior a 40 larvas 100 m-3; a FO de Ophidiidae e Carangidae foi de 58 e 67%, respetivamente. A análise de PCA evidenciou a formação de três grupos de espécies, cuja densidade e frequência de ocorrência variam no decorrer do ano, especialmente em função da maior ou menor influência da ACAS. / Studies on the ecology of fish eggs and larvae in coastal regions are important to understand the biology of species, since this developmental stage is the most critical in its life cycle. This study aims to describe the temporal variation of ichthyoplankton community in a fixed sampling station at Ubatuba-SP (23º 36.79’ S; 44º 53.46’ W), and to evaluate its relation with the local hydrographical regime along a year, February/2014 to February/2015. To better understand the study area, we performed: an analysis of water masse percentages, composition, density and temporal distribution of larval fishes and a principal component analysis (PCA). The main results show the high influence of Coastal Water (≥50%) in the first 10 m depth on all sampling months. The Tropical Water was not recognized with high percentages (≥50%), with exception on June and July. ACAS occurs with high percentages (≥50%) on February, October, November and December /2014. Chlorophyll-a was 1.98±1.25 mg m-3, in campaigns with high ACAS influence, while under low ACAS influence the average chlorophyll-a was 1.04±0.71 mg m-3. Total biomass was highest for 50μm zooplankton and lowest for 200μm ones. A total of 2,446 larvae were collected and 1,906 were identified, totaling 17 orders, 25 families, 23 genera and 26 species. Occurrence frequency of Paralichthyidae and Sciaenidae was superior than 80% and density higher than 40 larvae 100 m-3. For Ophidiidae and Carangidae, occurrence frequency was 58 and 67%, respectively. According the PCA, three groups of species were formed, whose occurrence frequence and density vary during the year, especially in light of the greater or lesser influence of the ACAS.
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The South Atlantic radiation anomaly

Van Rooyen, H O January 1964 (has links)
Part I. (1) An elementary treatment of the motion of charged particles in a magnetic field is presented. The concept of guiding centre motion is introduced, and is used in outlining the theory of particle drifts. (2 ) The motion of charged particles in the geomagnetic field is discussed, and the concept of adiabatic invariance introduced. (3) Mc Iliwains coordinates for mapping the distribution of charged particles trapped in the geometric field are defined and briefly discussed. (4) A survey of present knowledge of the Van Allen radiation zones is made. Particular attention is given to the distribution, characteristics, and variability of the trapped radiation. (5) The Cape Town magnetic anomaly, the Brazil radiation anomaly and the South Atlantic radiation anomaly are discussed. The electrons entering the South Atlantic radiation anomaly are shown to be those monitored over Iowa by the US satellite Injun I. Part 11. (1) It is shown how the geomagnetic field can, at high altitudes and over relatively short distances, be approximated by the field of a monopole. A new method is developed which enables one to plot the energy absorbed from an electron (which moves in a monopole field in the atmosphere) against altitude, given the initial energy and pitch angle of the electron. Some numerical computations using this method are described, and the results discussed. These results are used, in conjunction with US satellite Injun I for the Iowa region, to estimate the energy inout to the atmosphere in the South Atlantic radiation anomaly. The main approximations and simplifying assumptions made in this treatment, are discussed. (2) Geophysical effects generally recognized to be connected with the precipitation of charged particles are discussed. In the course of this discussion the two main theories of the connection between the radiation zones and the auroras are examined. (3) A preliminary discussion, based on the work summarized in point (1) of detectable geophysical events associated with the precipitation of electrons into the South Atlantic radiation anomaly is given. It is concluded that auroral emission, X-ray bursts, and ionospheric ionization in the E region should be more frequent and pronounced in the South Atlantic radiation anomaly than in any other region of comparable invariant latitudes and that the effects of atmospheric heating by precipitated electrons should be detectable over the anomaly. (4) An assessment is made of the value of the method referred to in point (1). Suggestions for its modification and extension are put forward. It is suggested that if more extensive rocket and satellite data on the low energy component of the electron flux become available, this method can be employed in a rigorous theoretical investigation of the South Atlantic radiation anomaly. Summary, p. 98-100.
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Caracterização dos parâmetros acústicos do golfinho-rotador: registro na quebra da plataforma continental sul Brasileira

Moron, Juliana Rodrigues 30 March 2015 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2015-12-08T14:30:37Z No. of bitstreams: 1 julianarodriguesmoron.pdf: 5395147 bytes, checksum: 0f2d0052bd8730bc31eb9bf590e8a739 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2015-12-09T13:42:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 julianarodriguesmoron.pdf: 5395147 bytes, checksum: 0f2d0052bd8730bc31eb9bf590e8a739 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-09T13:42:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 julianarodriguesmoron.pdf: 5395147 bytes, checksum: 0f2d0052bd8730bc31eb9bf590e8a739 (MD5) Previous issue date: 2015-03-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Apesar de investigações bioacústicas de golfinhos-rotadores já terem sido abordadas e descritas na literatura, a região do Oceano Atlântico Sul Ocidental só abrangeu a população do arquipélago de Fernando de Noronha. Portanto, a fim de contribuir para um melhor conhecimento desta espécie cosmopolita, este estudo teve como objetivo descrever os sons através de seus parâmetros acústicos de uma gravação oportunista realizada ao longo da quebra da plataforma continental Brasileira. Um grupo de aproximadamente 400 golfinhos Stenella longirostris foi registrado através de uma matriz de arrasto composta por um hidrofone realizando gravação mono contínua a 96kHz / 24bits. Após uma seleção de 12 minutos a partir do registro, 1.100 assobios foram extraídos e classificados em sete tipos de contornos, juntamente com outras dez variáveis extraídas. Os assobios dos golfinhos-rotadores foram constituídos em sua maioria por contorno ascendente (41,2%). O grupo apresentou ainda assobios com maior índice de modulação de frequência do que já havia sido descrito na literatura, apresentando uma frequência máxima de 26,4 kHz. Apesar da curta duração desses assobios, variando de 0,03 s a 2,56 s (média = 0,67 s), esses valores também foram mais altos do que a maioria dos estudos havia relatado. Apesar de diferenças estatisticamente significativas, a comparação a partir da média dos valores dos parâmetros extraídos apontou que dois estudos anteriores realizados no Oceano Pacífico Norte são mais semelhantes em relação a este estudo. Dessa forma, as possibilidades a partir das comparações discutidas no presente trabalho não só auxiliam a identificar a variabilidade nas emissões de forma a melhorar as classificações de detecção acústica em pesquisas e mitigação de impacto; como também contribuem para a compreensão de populações distintas e / ou espécies distribuídas em diferentes regiões oceânicas. / Spinner dolphins’ bioacoustics have already been described in literature, meanwhile the Western South Atlantic Ocean was only approached inside Fernando de Noronha Archipelago. Therefore, in order to contribute to a better knowledge of this cosmopolitan species, this study aimed to describe the sounds through their acoustic parameters detected during an opportunistic recording carried out at the Brazilian continental shelf break. A group of approximate 400 Stenella longirostris dolphins was recorded through a one-element hydrophone array performing continuous mono recording at 96 kHz/24 bits. After a 12 minutes selection of the record, 1,100 whistles were extracted and classified into seven contours shapes, along with other ten variables extracted. The spinner dolphins whistles was mostly comprised by upsweep (41.2%) contour. The group produced higher pitch frequency modulated whistles than what has been previously described, presenting a maximum frequency of 26.4 kHz. Despite the short whistle durations, ranging from 0.03 s to 2.56 s (mean = 0.67 s), those values were also higher than most of previous works had reported. Despite statistically significant differences, the comparison from the average of the extracted parameters pointed out that two previous studies in the North Pacific Ocean are more similar in relation to this study. Thereby, the possibilities from the comparisons discussed in this paper not only assist in identifying the variability in the emissions in order to improve acoustic detection classifications in research and impact mitigation; but also contribute to the understanding of distinct populations and/or species distributed in different ocean basins.
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Contribuição da interação troposfera-estratosfera nas ciclogêneses em superfície sobre a América do Sul / Contribution of the troposphere-stratosphere interaction on surface cyclogenesis over South America

Crespo, Natália Machado 29 April 2015 (has links)
A interação entre troposfera e estratosfera tem grande influência e é de grande importância nos processos de ciclogênese em superfície. Entretanto, não se conhece exatamente a frequência destas interações e nem como podem influenciar na intensidade de ciclones em geral. Este trabalho tem como objetivo geral estudar como os altos níveis da atmosfera afetam o desenvolvimento de ciclones em superfície na América do Sul e Oceano Atlântico Sul, utilizando o conceito de vorticidade potencial (VP). Através de dados de ciclones rastreados em superfície e VP em 300 hPa desenvolveu-se um algoritmo que associa automaticamente os ciclones em superfície com anomalias de vorticidade potencial (AVP). Para o período 1998-2003, fez-se então a separação dos ciclones em associados (AAVP) e não-associados (NAVP) a AVP. De forma geral, observou-se que a maior parte dos ciclones AAVP concentra-se na região oceânica extratropical e os NAVP preferencialmente na região continental próximo de 30°S e em latitudes subtropicais. Para todo o período analisado, o número total de ciclones AAVP (55%) superou o número de NAVP (45%), sendo o ano de 2002 o único que apresentou número maior de eventos NAVP. Quanto à distribuição sazonal, os ciclones AAVP são mais frequentes nos meses de inverno e primavera, enquanto que os NAVP nos meses de verão. O tempo de vida dos NAVP é menor que dos AAVP, além de possuírem menor intensidade (de acordo com a pressão central média). Além destes fatores, a distância percorrida e a velocidade médias dos ciclones NAVP são menores do que dos AAVP. As composições dos campos sinóticos mostram que nos eventos NAVP, independente da estação do ano, a troposfera é mais quente que nos AAVP. Nos NAVP a forçante térmica é essencial para a formação do ciclone, enquanto que nos AAVP a AVP induz vorticidade ciclônica primeiro em altos níveis, que então se propaga para baixos níveis. Através da análise dos campos sinóticos, notou-se maior baroclinia nos casos NAVP, pois tanto os cavados em altos e médios níveis quanto a corrente de jato permanecem favorecendo o desenvolvimento do ciclone em superfície, enquanto que nos AAVP o centro do ciclone em superfície está verticalmente quase alinhado ao cavado. Centros de vorticidade relativa ciclônica em 500 hPa desprendem-se do escoamento de oeste em todas as estações para os casos AAVP, porém, no verão, isto também é visto nos NAVP. / The process of troposphere-stratosphere interaction has influence and is very important on surface cyclogenesis. However, the frequency of these interactions and how they influence the intensity of cyclones is not known exactly. The main objective of this work is to study how the upper levels affect the development of surface cyclones in South America and South Atlantic Ocean using the concept of potential vorticity (PV). Cyclone tracking data and 300 hPa PV were used to develop an algorithm that automatically associates the surface cyclones with potential vorticity anomaly (PVA). For the period 1998-2003, the cyclones were separated as associated (APVA) and non-associated (NPVA) with PVA. In general, it was observed that most of the APVA cyclone was concentrated in extratropical oceanic region, while NPVA cyclones form over the continent preferably around 30°S and subtropics. The total number of APVA cyclones (55%) exceeds the number of NPVA (45%), except for 2002. In regard to seasonal distribution, the APVA cyclones are more frequent in winter and spring months while NPVA in summer months. The lifetime of NPVA cyclones is shorter and they are less intense than APVA (according to the average central pressure). In addition to these factors, the mean traveled distance and mean velocity are smaller in the NPVA than in APVA. The composites of the synoptic fields show that in NPVA events, regardless of the season, the troposphere is warmer than in APVA. In NPVA cases the thermal forcing is essential to the cyclogenesis, while in the APVA the cyclonic vorticity induced by PVA at upper levels propagating to low levels is more important. The NPVA cases present more baroclinic characteristics which the upper and mid-level troughs accompanied by the jet stream favoring the surface cyclone development, whereas in the APVA the surface cyclone center remains almost vertically aligned with these troughs. For APVA cases, the centers of cyclonic vorticity at 500 hPa detach from westerly flow in all seasons however in summer this is also seen in NPVA.
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Padrões de diversidade microbiana em sedimentos marinhos profundos influenciados por uma exsudação de asfalto. / Microbial diversity patterns in deep-sea sediments influencied by asphalt seep.

Queiroz, Luciano Lopes 26 May 2015 (has links)
Sedimentos de mar profundo são ambientes estáveis e homogêneos, apesar disso, eles apresentam uma grande variedade de habitats disponíveis, possibilitando uma alta diversidade microbiana. A distribuição espacial dos micro-organismos é influenciada por fatores locais e regionais. Os fatores locais são associados à estrutura do ambiente e os fatores regionais, a limitação na dispersão dos micro-organismos que compõem as comunidades e eventos históricos que eventualmente podem modificar o ambiente. Eventos como a liberação de hidrocarbonetos das camadas mais profundas do sedimento para superfície podem alterar os padrões de distribuição espacial das comunidades microbianas, devido o aumento na disponibilidade de carbono e consequentemente selecionando as espécies capazes de degradá-los. Esses eventos são denominados de exsudações de asfalto e foram encontradas na região de estudo. Considerando a falta de conhecimento e a importância dos micro-organismos em sedimentos de mar profundo do oceano Atlântico Sul, o objetivo desse estudo foi compreender os padrões de diversidade microbiana nessas regiões e também investigar como o óleo proveniente da exsudação de asfalto influência as comunidades de micro-organismos no seu entorno. Esse estudo foi realizado na região do Platô de São Paulo que foi dividido em duas regiões, norte e sul. A diversidade microbiana foi estudada em 14 amostras de sedimento de mar profundo, nove amostras na região norte e cinco na sul. A exsudação de asfalto foi encontrada na região norte, influenciando diretamente três das nove amostras. As comunidades foram estudadas através dos métodos de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE), PCR quantitativa (qPCR) e sequenciamento de última geração (Ion Torrent). A distribuição espacial das comunidades foi analisada em diferentes escalas espaciais: verticalmente, variando com a profundidade do sedimento (≤ 4 cm), localmente, em cada uma das regiões amostradas (1-34 Km) e regionalmente, comparando as regiões norte e sul (> 250 Km). O perfil da comunidade obtido com a técnica de DGGE mostrou que as comunidades microbianas foram menos similares entre as regiões e apresentaram relação com a distância geográfica para arqueia e bactéria. Os valores de similaridade foi maior localmente do que regionalmente. A similaridade obtida nas camadas de profundidade analisadas foi alta e não houve relação com a distância geográfica. O número de células entre as camadas de profundidades foi diferente, com tendência de diminuição com o aumento da profundidade. As classes bacterianas mais abundantes foram Alphaproteobacteria (30%), Acidimicrobiia (18%), Gammaproteobacteria (16%), Deltaproteobacteria e Gemmatimonadetes (3%). A composição das comunidades influenciadas pela exsudação de asfalto não teve relação com a presença do óleo ou com as camadas de profundidade. A distância geográfica e a exsudação de asfalto foram importantes fatores para determinação da distribuição geográfica das comunidades microbianas em sedimento marinhos profundos do Platô de São Paulo. Apesar da ausência de relação entre o óleo proveniente da exsudação de asfalto e a composição das comunidades, a alta abundância de Alphaproteobacteria e a importância da distância dentro da região norte são indicativos do aumento da heterogeneidade causado pela exsudação de asfalto. Mais estudos procurando compreender a composição geoquímica dos sedimentos e do óleo são necessários para explicar como esses fatores influenciam a estruturação das comunidades microbianas estudadas. / Deep-sea sediments are stable and homogeneous environments, however, they have a high variety of available habitats, allowing a high microbial diversity to occur. Microbial spatial distribution is determined by local and regional factors. Local factors are associated to environment structure and regional factors, to microbial dispersal limitation and historical events that may cause environmental changes. Historical events such as hydrocarbon emanation from sub-seafloor to seafloor may change the patterns of microbial spatial distribution, due to an increase of carbon, thus, selecting species capable to degrade them. These events are denominated as asphalt seep and they were found on the studied region. Considering the lack of knowledge and the importance of microorganisms on deep-sea sediments from South Atlantic ocean, this study aims to understand the patterns of microbial spatial distribution and how the oil from asphalt seep influence the microbial communities. This study was realized in São Paulo Plateau region. The plateau was divided in two regions, north and south. Microbial diversity was studied from 14 deep-sea sediment samples, nine samples from north region and five from south region. The asphalt seep was found in north region from São Paulo Plateau, directly affecting three of the nine samples. The communities were studied through denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), quantitative PCR (qPCR) and next generation sequencing (Ion Torrent). The spatial distribution of the communities was analyzed at different spatial scales: sediment depth (≤ 4 cm), local (1-34 Km) and regional (> 250 Km). Microbial communities were less similar between regions and showing relation with geographic distance to achaea and bacteria. Similarity values within regions were higher then between them, but the geographic distance was also important to both domains, despite samples being closer. Similarity values between sediment depths were high and have no relation with geographic distance. The cell number between sediment depths was different, with tendency to decrease with depth increase. The most abundant classes were Alphaproteobacteria (30%), Acidimicrobiia (18%), Gammaproteobacteria (16%), Deltaproteobacteria e Gemmatimonadetes (3%). The communities composition influenced by asphalt seep have no relation with oil presence and sediment depths. Geographic distance and asphalt seep were important factors to determine the spatial distribution of microbial communities in deep-sea sediments from São Paulo Plateau. Despite the absence of relation between oil from asphalt seep and communities composition, the high abundance of Alphaproteobacteria and the importance of distance within north region are indicative of heterogeneity increase caused by asphalt seep. More studies aiming to understand the geochemical composition from sediments and oil are necessary to explain how these factors influence the communities structure.
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Padrões de diversidade microbiana em sedimentos marinhos profundos influenciados por uma exsudação de asfalto. / Microbial diversity patterns in deep-sea sediments influencied by asphalt seep.

Luciano Lopes Queiroz 26 May 2015 (has links)
Sedimentos de mar profundo são ambientes estáveis e homogêneos, apesar disso, eles apresentam uma grande variedade de habitats disponíveis, possibilitando uma alta diversidade microbiana. A distribuição espacial dos micro-organismos é influenciada por fatores locais e regionais. Os fatores locais são associados à estrutura do ambiente e os fatores regionais, a limitação na dispersão dos micro-organismos que compõem as comunidades e eventos históricos que eventualmente podem modificar o ambiente. Eventos como a liberação de hidrocarbonetos das camadas mais profundas do sedimento para superfície podem alterar os padrões de distribuição espacial das comunidades microbianas, devido o aumento na disponibilidade de carbono e consequentemente selecionando as espécies capazes de degradá-los. Esses eventos são denominados de exsudações de asfalto e foram encontradas na região de estudo. Considerando a falta de conhecimento e a importância dos micro-organismos em sedimentos de mar profundo do oceano Atlântico Sul, o objetivo desse estudo foi compreender os padrões de diversidade microbiana nessas regiões e também investigar como o óleo proveniente da exsudação de asfalto influência as comunidades de micro-organismos no seu entorno. Esse estudo foi realizado na região do Platô de São Paulo que foi dividido em duas regiões, norte e sul. A diversidade microbiana foi estudada em 14 amostras de sedimento de mar profundo, nove amostras na região norte e cinco na sul. A exsudação de asfalto foi encontrada na região norte, influenciando diretamente três das nove amostras. As comunidades foram estudadas através dos métodos de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE), PCR quantitativa (qPCR) e sequenciamento de última geração (Ion Torrent). A distribuição espacial das comunidades foi analisada em diferentes escalas espaciais: verticalmente, variando com a profundidade do sedimento (≤ 4 cm), localmente, em cada uma das regiões amostradas (1-34 Km) e regionalmente, comparando as regiões norte e sul (> 250 Km). O perfil da comunidade obtido com a técnica de DGGE mostrou que as comunidades microbianas foram menos similares entre as regiões e apresentaram relação com a distância geográfica para arqueia e bactéria. Os valores de similaridade foi maior localmente do que regionalmente. A similaridade obtida nas camadas de profundidade analisadas foi alta e não houve relação com a distância geográfica. O número de células entre as camadas de profundidades foi diferente, com tendência de diminuição com o aumento da profundidade. As classes bacterianas mais abundantes foram Alphaproteobacteria (30%), Acidimicrobiia (18%), Gammaproteobacteria (16%), Deltaproteobacteria e Gemmatimonadetes (3%). A composição das comunidades influenciadas pela exsudação de asfalto não teve relação com a presença do óleo ou com as camadas de profundidade. A distância geográfica e a exsudação de asfalto foram importantes fatores para determinação da distribuição geográfica das comunidades microbianas em sedimento marinhos profundos do Platô de São Paulo. Apesar da ausência de relação entre o óleo proveniente da exsudação de asfalto e a composição das comunidades, a alta abundância de Alphaproteobacteria e a importância da distância dentro da região norte são indicativos do aumento da heterogeneidade causado pela exsudação de asfalto. Mais estudos procurando compreender a composição geoquímica dos sedimentos e do óleo são necessários para explicar como esses fatores influenciam a estruturação das comunidades microbianas estudadas. / Deep-sea sediments are stable and homogeneous environments, however, they have a high variety of available habitats, allowing a high microbial diversity to occur. Microbial spatial distribution is determined by local and regional factors. Local factors are associated to environment structure and regional factors, to microbial dispersal limitation and historical events that may cause environmental changes. Historical events such as hydrocarbon emanation from sub-seafloor to seafloor may change the patterns of microbial spatial distribution, due to an increase of carbon, thus, selecting species capable to degrade them. These events are denominated as asphalt seep and they were found on the studied region. Considering the lack of knowledge and the importance of microorganisms on deep-sea sediments from South Atlantic ocean, this study aims to understand the patterns of microbial spatial distribution and how the oil from asphalt seep influence the microbial communities. This study was realized in São Paulo Plateau region. The plateau was divided in two regions, north and south. Microbial diversity was studied from 14 deep-sea sediment samples, nine samples from north region and five from south region. The asphalt seep was found in north region from São Paulo Plateau, directly affecting three of the nine samples. The communities were studied through denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), quantitative PCR (qPCR) and next generation sequencing (Ion Torrent). The spatial distribution of the communities was analyzed at different spatial scales: sediment depth (≤ 4 cm), local (1-34 Km) and regional (> 250 Km). Microbial communities were less similar between regions and showing relation with geographic distance to achaea and bacteria. Similarity values within regions were higher then between them, but the geographic distance was also important to both domains, despite samples being closer. Similarity values between sediment depths were high and have no relation with geographic distance. The cell number between sediment depths was different, with tendency to decrease with depth increase. The most abundant classes were Alphaproteobacteria (30%), Acidimicrobiia (18%), Gammaproteobacteria (16%), Deltaproteobacteria e Gemmatimonadetes (3%). The communities composition influenced by asphalt seep have no relation with oil presence and sediment depths. Geographic distance and asphalt seep were important factors to determine the spatial distribution of microbial communities in deep-sea sediments from São Paulo Plateau. Despite the absence of relation between oil from asphalt seep and communities composition, the high abundance of Alphaproteobacteria and the importance of distance within north region are indicative of heterogeneity increase caused by asphalt seep. More studies aiming to understand the geochemical composition from sediments and oil are necessary to explain how these factors influence the communities structure.

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