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Variabilidade genética molecular em uma coleção de germoplasma de Hymenaea stigonocarpa (Fabaceae) / Molecular genetic variability in a germplasm collection of Hymenaea stigonocarpa (Fabaceae)

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Previous issue date: 2016-03-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The study of genetic variation in plant populations, especially in native Brazilian savanna, is
fundamental to understanding the magnitude of biodiversity in ecosystems. Understanding how
this variability is structured, gives us evidence of how evolution is acting in these populations,
bringing subsidies to trace relevant conservation strategies for these species. Its economic potential
is significant, mainly due to its nutritional value. The extractive use of native plants is a warning,
because the genetic resources of these plants can be exhausted without even discover their full
potential. Given this, the germplasm collections that conserve genetic resources ex situ and in vivo,
are an alternative to access information about the species at the same time helps conserve their
genetic variability. This study was therefore to characterize, genotypically, individuals of the
collection of germplasm Hymenaea stigonocarpa, located in the Escola de Agronomia of the
Universidade Federal de Goiás. For this, we used ten microsatellite markers with detection methods
by capillary electrophoresis. Individuals in the collection are from fruit collections occurred in 24
locations spanning the Brazilian savanna. In total, were evaluated 353 individuals in 119 progenies.
Subpopulations showed moderate level of genetic diversity for the evaluated loci and mean
heterozygosity was 0,59. Significant genetic structure was detected on subpopulations (𝜃𝑃 = 0,14),
with intrapopulation inbreeding coefficient (f) of 0,12 and total inbreeding (F) 0,25. These results
suggest that these subpopulations are not behaving as a panmitic population. Analyses of genetic
diversity through the genetic distance of Nei (1972), showed two distinct groups subdivided. The
correlation between genetic and geographic distances, doesn’t show a strong relationship between
these arrays (r = 0.27), suggesting that the physical distance between subpopulations is not
sufficient to differentiate them genetically. The germplasm collection has an effective size of 60,
an amount considered sufficient to conduct breeding programs (minimum 50), and presents an
allelic representation of 78.84% compared to 32 natural subpopulations. Thus, it can be concluded
that the collection of germplasm,satisfactorily, represents the genetic variability of H. stigonocarpa
while preserving their diversity, which is essential to support future work of conservation and
improvement of the species. / O estudo da variabilidade genética em populações de plantas é fundamental para a compreensão
da magnitude da biodiversidade nos ecossistemas. Entender como essa variabilidade está
estruturada fornece evidências de como a evolução está atuando nessas populações, trazendo
subsídios para traçar estratégias de conservação pertinentes àquela espécie. Uma das espécies
nativas do Cerrado que vem sendo alvo de estudos em diversas áreas é Hymenaea stigonocarpa
(Fabaceae). Seu potencial econômico é significativo, principalmente graças a seu valor nutricional.
O uso extrativista de plantas nativas serve de alerta, pois os recursos genéticos dessas plantas
podem se esgotar, sem ao menos descobrirmos seu total potencial. Diante disto, as coleções de
germoplasma, que conservam os recursos genéticos de organismos ex situ e in vivo, são uma
alternativa para ter acesso às informações sobre a espécie, ao mesmo tempo em que auxilia na
conservação de sua variabilidade genética. Este trabalho teve o objetivo de caracterizar, do ponto
de vista molecular, os indivíduos que compõem a coleção de germoplasma de H. stigonocarpa,
localizada na Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás. Para tanto, foram utilizados
dez marcadores microssatélites com métodos de detecção por eletroforese capilar. Os indivíduos
da coleção são provenientes de coletas de frutos ocorridas em 24 localidades de abrangência no
Cerrado. No total, foram avaliados 353 indivíduos distribuídos em 119 progênies. As
subpopulações apresentaram nível moderado de diversidade genética, para os locos avaliados, com
heterozigosidade média esperada de 0,59. Foi detectada estruturação genética significativa nas
subpopulações (𝜃𝑃 = 0,14), com coeficiente de endogamia intrapopulacional (𝑓) de 0,12 e
endogamia total (𝐹) de 0,25. Estes resultados sugerem que essas subpopulações não estão se
comportando como uma população panmítica. As análises de divergência genética, por meio da
distância genética de Nei (1972), apresentaram dois grupos distintos subdivididos. A correlação
entre as distâncias genética e geográfica, demonstra que não há uma relação muito forte entre essas
matrizes (𝑟 = 0,27), sugerindo que a distância física entre as subpopulações não é suficiente para
diferenciá-las geneticamente. A coleção de germoplasma detém um tamanho efetivo de 60, valor
considerado suficiente para a condução de programas de melhoramento (mínimo 50), além de
apresentar uma representatividade alélica de 78,84% com relação a 32 subpopulações naturais.
Assim, pode-se concluir que a coleção de germoplasma representa satisfatoriamente a variabilidade
genética de H. stigonocarpa, preservando sua diversidade, o que é fundamental para subsidiar
futuros trabalhos de conservação e melhoramento da espécie.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/6016
Date22 March 2016
CreatorsGonçalves, Ariany Rosa
ContributorsTelles, Mariana Pires de Campos, Telles, Mariana Pires de Campos, Almeida, Luciane Madureira de, Chaves, Lázaro José
PublisherUniversidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Genetica e Melhoramentode Plantas, UFG, Brasil, Escola de Agronomia e Engenharia de Alimentos - EAEA (RG)
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG
Rightshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess
Relation1167494949003462214, 600, 600, 600, 600, 4500684695727928426, -7397920248419280716, 2075167498588264571

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