Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / No presente trabalho à feita a descriÃÃo de trÃs genes distintos que codificam lectinas ou proteÃnas relacionadas à lectina de Vatairea macrocarpa. As sequÃncias foram obtidas pela amplificaÃÃo de DNA genÃmico e cDNA de folhas utilizando primers semi-degenerados construÃdos a partir da informaÃÃo da sequÃncia de aminoÃcidos da lectina VML depositada no GenBank. O resultado do sequenciamento revelou a presenÃa de trÃs contigs. O contig1 corresponde à lectina VML desde que se assuma que a lectina depositada VML contenha heterogeneidades ou ambiguidades decorrentes na degradaÃÃo de Edman. A traduÃÃo dos contigs 2 e 3 mostram identidade de sequÃncia de 77% quando comparadas com VML. As sequÃncias, apesar de apresentar regiÃes conservadas, mostram diferenÃas de aminoÃcidos nos sÃtios de N-glicosilaÃÃo, sÃtios de ligaÃÃo a carboidrato e metais alÃm da presenÃa de resÃduos de cisteÃna sugerindo que tais proteÃnas podem ter outras atividades biolÃgicas. A anÃlise da sequÃncia obtida pelo 3â RACE se mostrou complementar ao contig3. Sendo assim, a sequÃncia hÃbrida contig3/contigA possui 2 resÃduos de cisteÃna alÃm de revelar diferenÃas de aminoÃcidos na regiÃo C-terminal quando alinhada com outras lectinas de leguminosas. AnÃlises filogenÃticas revelaram que os contigs observados formam um grupo monofiletico e tem alta similaridade com as lectinas de Sohora japonica e Robinia pseudoacacia, alÃm da proteÃna relacionada à lectina de Cladrastis lutea. / In this paper is made a description of three distinct genes that encode
Vatairea
macrocarpa
lectin
and related proteins.
The sequences were obtained by
amplification of genomic DNA and cDNA of leaves using semi
-
degenerate primers
constructed from the information of the amino acid sequence of VML lectin deposited
in GenBank. The result of sequencing rev
eals the presence of three
different genes,
called contig 1, 2 and 3
.
The
VML
lectin
corresponds to
contig1
long as one
assumes
that the lectin
contains
heterogeneities
deposited
VML
or ambiguities
arising
in the
Edman degradation
.
The translation of cont
igs 2 and 3 show sequence
identity of 77% compared to VML. Sequences, despite having conserved regions
show differences in amino acid N
-
glycosylation sites, carbohydrate binding sites and
metals and the presence of cysteine residues suggests that these pro
teins may have
other biological activities
.
The analysis of the sequence obtained by 3 'RACE proved
complementary to contig3. Thus, the sequence contig3/contigA hybrid has two
cysteine residues in addition to revealing differences in amino acid C
-
terminal
region
when aligned with other legume lectins.
Phylogenetic analysis revealed that the
observed contigs form a monophyletic group and has high similarity with lectins from
Robinia pseudoacacia
Sohora japonica
and, in addition to the lectin
-
related protein
Cladrastis lutea
.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.teses.ufc.br:5757 |
| Date | 01 July 2008 |
| Creators | JoÃo Garcia Alves Filho |
| Contributors | Benildo Sousa Cavada, Cristiane Cunha Frota, JoÃo Paulo Matos Santos Lima |
| Publisher | Universidade Federal do CearÃ, Programa de PÃs-GraduaÃÃo em BioquÃmica, UFC, BR |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC, instname:Universidade Federal do Ceará, instacron:UFC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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