Deux types de problématiques différentes peuvent motiver l'approche structurale d'une macromolécule. Soit la fonction de cette macromolécule est inconnue et l'on détermine sa structure afin de mieux connaître sa fonction ; cette démarche était l'un des défis du développement de la génomique structurale. Soit la fonction est connue et la structure va permettre de comprendre comment cette molécule remplit son rôle biologique.<br />Durant ma thèse, j'ai eu l'occasion de pouvoir aborder deux projets structuraux très différents, qui correspondent à ces deux approches de biologie structurale. C'est pourquoi mon manuscrit décrit ces deux projets dont la démarche scientifique est différente et complémentaire pour ma formation en biologie structurale. <br />Dans un premier temps, je décrirai les résultats obtenus sur le projet PAB0955, débuté en stage de DEA et poursuivi pendant les deux premières années de ma thèse. Ce projet avait pour objectif de déterminer la fonction de la protéine d'après sa structure. La protéine PAB0955 est de fonction biologique inconnue, elle hydrolyse le GTP et elle n'a pas de proche homologue dont la structure est connue. La démarche scientifique de ce projet a été de déterminer la structure de cette protéine, puis d'analyser sa structure en la comparant de manière systématique à l'ensemble des protéines ATPases et GTPases. Notre étude a été conduite dans l'objectif extraire un maximum d'information fonctionnelle à partir des données structurales.<br />Dans une deuxième partie, je décrirai notre étude sur des protéines du système immunitaire humain débuté en troisième année de thèse. Nous nous sommes intéressés à des molécules impliquées dans la reconnaissance d'antigène : le récepteur du lymphocyte T (TCR) et la molécule du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH). L'objectif de ce projet est de comprendre comment un complexe antigène-CMH sélectionne un répertoire de lymphocyte T spécifique. L'objectif étant de déterminer le lien entre les caractéristiques structurales d'un complexe antigène-CMH et la diversité et la fréquence des lymphocytes T activés par ce complexe. En résumé corréler les observations structurales avec les données immunologiques dont nous disposons. En déterminant les bases structurales du caractère antigénique d'un peptide présenté par une molécule CMH nous pourrons, à plus long terme, produire des peptides efficaces dans le cadre d'une vaccination
| Identifer | oai:union.ndltd.org:CCSD/oai:tel.archives-ouvertes.fr:tel-00140708 |
| Date | 07 July 2006 |
| Creators | Gras, Stéphanie |
| Source Sets | CCSD theses-EN-ligne, France |
| Language | French |
| Detected Language | French |
| Type | PhD thesis |
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