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Previous issue date: 2013-06-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / As raízes possuem uma grande variedade de funções nas plantas,
incluindo absorção de água, nutrientes e suporte estrutural. A combinação de
métodos clássicos de genética e melhoramento com tecnologias moleculares de
análise genômica abre uma nova perspectiva para a ampliação do conhecimento
das bases genéticas e aceleração de programas de melhoramento. A maioria dos
conhecimentos sobre as redes gênicas envolvidas no desenvolvimento radicular
vem sendo acumuladas na espécie Arabidopsis thaliana, modelo de planta
dicotiledônea. O entendimento dos mecanismos envolvidos na regulação da
expressão dos genes é essencial para compreender a forma e a função dos
sistemas. Os elementos cis-acting são regiões do DNA que atuam como
interruptores moleculares envolvidos na regulação da transcrição de uma rede
gênica dinâmica. Embora freqüentemente tenham somente cinco a 20 pb de
tamanho, os elementos cis-acting são críticos para o entendimento da regulação
gênica. O conhecimento destes elementos presentes na região promotora de
famílias gênicas, poderá contribuir para a compreensão dos sistemas reguladores
da expressão da rede gênica envolvida na formação do sistema radicular. O
objetivo desse trabalho é identificar os elementos cis-acting presentes na região
promotora de genes de arroz (Oryza sativa subsp japonica cv. Nipponbare)
similares aos genes das famílias Argonauta, Cullin e Ara de Arabidopsis thaliana.
A região promotora dos genes destas famílias no arroz foi investigada quanto à
abundância destes elementos. As seqüências foram analisadas utilizando o
programa “Signal Scan Search” do portal “Plant Cis-acting Regulatory DNA
Elements” (PLACE) para a identificação dos diferentes elementos cis-acting.
Foram detectados 96 diferentes elementos, sendo cinco destes (GAREAT
(TAACAAR), TGACGTVMAMY (TGACGT), CCAATBOX1 (CCAAT),
LECPLEACS2 (TAAAATAT) e SV40COREENHAN (GTGGWWHG), comuns as
famílias gênicas Argonauta, Cullin e Ara. / The roots have a large range of functions in plants, including acquisition of
water and nutrients, as well as structural support. The combination of classical
methods of genetics and breeding with molecular technologies for genomic
analysis opens a new perspective to expand the knowledge of the genetic basis
and to accelerate breeding programs. The most advanced knowledge regarding
gene networks involved in root development has been obtained in the model
dicotyledon plant species Arabidopsis thaliana. Understanding the mechanisms
involved in regulation of gene expression is essential to predict the form and
function of systems. Cis-acting elements are DNA regions that act as molecular
switches involved in the regulation of transcription of dynamic gene network.
Although often having only five to 20 bp in size, cis-acting elements are critical to
the understanding of gene regulation. Knowledge of the cis-acting elements
present in the promoter region of gene families, can contribute to the
understanding of the expression regulatory systems of these genes and others,
involved with the root system. The objective of this study is to identify the cisacting elements present in the upstream region of rice (Oryza sativa subsp
japonica cv. Nipponbare) genes, similar to gene families Argonauta, Cullin and Ara
in Arabidopsis thaliana. The promoter region of these rice gene families were
investigated for the abundance of cis-acting elements. The sequences were
analyzed using the software “Signal Scan Search” of the website “Plant Cis-acting
Regulatory DNA Elements” (PLACE) to the identification of different cis-acting
elements. It were detected 96 different cis-acting elements, and five of these,
(GAREAT (TAACAAR), TGACGTVMAMY (TGACGT), CCAATBOX1 (CCAAT),
LECPLEACS2 (TAAAATAT) e SV40COREENHAN (GTGGWWHG) were common
to the gene families Argonauta, Cullin and Ara.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpel.edu.br:prefix/3073 |
| Date | 28 June 2013 |
| Creators | Farias, Daniel da Rosa |
| Contributors | 43725678049, http://lattes.cnpq.br/2717555680999191, Oliveira, Antonio Costa de |
| Publisher | Universidade Federal de Pelotas, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, UFPel, Brasil, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPEL, instname:Universidade Federal de Pelotas, instacron:UFPEL |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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