Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-05-19T20:50:13Z
No. of bitstreams: 2
Dissertação - Warita Alves de Melo - 2014.pdf: 2324180 bytes, checksum: ceadfecb6355d48562897ba5ed60e072 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-05-20T14:02:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2
Dissertação - Warita Alves de Melo - 2014.pdf: 2324180 bytes, checksum: ceadfecb6355d48562897ba5ed60e072 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-20T14:02:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2
Dissertação - Warita Alves de Melo - 2014.pdf: 2324180 bytes, checksum: ceadfecb6355d48562897ba5ed60e072 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
Previous issue date: 2014-09-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Tabebuia roseoalba (RIDL.) Sandwith (Bignoniaceae) is widely distributed in Neotropical
seasonally dry forests, occurring mainly from Northeast towards the Central West and
Southeast Brazil, and also in Paraguay, Bolivia and Peru. The phylogeography of this
species may help us to understand how historical events influenced its genetic diversity
and in the current geographic distribution of seasonally dry forests. The results were based
on the sequencing of three chloroplast intergenic spacers (psbA-trnH, trnC-ycf6 and trnStrnG2S)
and the nuclear ribosomal region (nrDNA) (ITS1 + 5.8S + ITS2). We sampled 18
populations (235 individuals) in North, Central West and Southeast. The three chloroplast
regions generated a fragment of 1,519 base pairs and 37 haplotypes. We found high
haplotype diversity (h = 0.839) and low nucleotide diversity (π = 0.00610 SD = 0.00311)
and were found. A fragment of 506 base pairs was generated for nrDNA and 14 haplotypes
were identified. The haplotype diversity (h = 0.336) was lower than chloroplast diversity
but nucleotide diversity (π = 0.01669 SD = 0.00857) was higher. Populations of Tabebuia
rosealba are highly differentiated (FST = 0. 684; p = 0.001) with low gene flow (Nm < 1.0)
among all population pairs. Our results also showed significant population reduction
followed by expansion (Mismatch Distribution SSD = 0.20746; p = 0.0002, Tajima D = -
1.766; p = 0.008, Fs = - 23.702; p = 0.001), and the Extended Bayesian Skyline
Plot (EBSP) also showed population reduction. Coalescent dated tree showed an ancient
time to most recent ancestor (TMRCA) dated from ~4.9 Ma (CI 95% 1.9 Ma) in the
Pliocene. Both the median-joining network and the coalescent tree showed evidences of
incomplete lineage sorting. Our data show that the current pattern of diversity found so far
is in consonance with a wide distribution of this species in the past, strongly suggesting
that the climate changes of the Quaternary Period had strongly influenced the genetic
diversity pattern and the geographical distribution of the species. / Tabebuia roseoalba (RIDL.) Sandwith (Bignoniaceae) é amplamente distribuída em
florestas estacionais semideciduais e deciduais neotropicais, do Nordeste para o Centro-
Oeste e Sudeste do Brasil, sendo também encontrada no Paraguai, Bolívia e Peru.
Conhecer o padrão filogeográfico desta espécie nos ajuda a entender quais eventos
históricos influenciaram na atual distribuição geográfica das florestas estacionais. Sendo
assim, estamos interessados em compreender os efeitos das mudanças climáticas do
período quaternário sobre os atuais padrões de diversidade genética e distribuição
geográfica da espécie T. roseoalba e das florestas estacionais. Os nossos resultados foram
baseados em três regiões intergênicas cloroplastidiais (psbA-trnH, trnC-ycf6 e trnStrnG2S)
e uma região ribossômica nuclear (nrDNA) (ITS1 + 5.8S + ITS2). Foram
amostrados 235 indivíduos distribuídos em 18 populações coletadas nas regiões Norte,
Centro-Oeste e Sudeste. As três regiões cloroplastidiais concatenadas geraram um
fragmento de 1519 pares de bases, a diversidade haplotípica foi alta (h = 0,839) e a
diversidade nucleotídica foi baixa (π = 0,00610 +/- 0,00311) e foram encontrados 37
haplótipos. Obteve-se um fragmento de 506 pares de bases para a região nuclear, uma
diversidade haplotípica menor (h = 0,336) uma diversidade nucleotídica maior (π =
0,01669+/-0,00857) e 14 haplótipos foram identificados. Encontrou-se uma alta
diferenciação entre as populações (FST = 0,684; p = 0,001), demonstrando insignificativo
fluxo gênico. Foi encontrado sinal de retração seguido de expansão populacional
(Distribuição de diferenças par a par SSD = 0,20746, p = 0,0002; D de Tajima D = -1,766,
p = 0,008; teste de Fu FS = -23,706, p = 0,001), a análise de Extended Bayesian Skyline
Plot (EBSP) também foi significativa, porém o índice de Raggedness não foi significativo
(r = 0,029; p = 0,999). O ancestral comum mais recente entre as linhagens foi datado a
cerca de ~4,9 ± 1,9 Ma (Ma) antes do presente no Plioceno. As redes de haplótipos e a
árvore de coalescência mostraram não haver relação filogenética das linhagens e o espaço
geográfico, evidenciando possivelmente arranjo incompleto de linhagem. Os nossos dados
mostram que o atual padrão de diversidade encontrado é condizente com uma ampla
distribuição desta espécie no passado, sugerindo que as oscilações climáticas do período
Quaternário teriam influenciado grandemente o padrão da diversidade genética encontrada,
a distribuição geográfica da espécie e das florestas estacionais neotropicais.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/5594 |
| Date | 29 September 2014 |
| Creators | Melo, Warita Alves de |
| Contributors | Collevatti, Rosane Garcia |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Genetica e Biologia Molecular, UFG, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas - ICB (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -7235106986317239737, 600, 600, 600, 600, -3872772117827373404, -7397920248419280716, 2075167498588264571 |
Page generated in 0.1798 seconds