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Identificação da Variabilidade genética de Brachiaria ruziziensis por marcadores molecular / Genetic variability identification in Brachiaria ruziziensis by molecular marckers

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Previous issue date: 2009-11-27 / Knowledge of the genetic variability of Brachiaria ruziziensis is required before you start a breeding program. This study investigated the genetic variability of 37 samples of Brachiaria ruziziensis, from the collection held by EMBRAPA Dairy Cattle by molecular markers and long primers. The DNA was extracted from leaves by CTAB method, we used 14 decamer primers and primers 9 long. The data were used for analysis of molecular variance (AMOVA) using the squared distances (Excoffier et al., 1992) using the program Arlequin (Excoffier et al., 2006). We found variation between species of 47.42% and 36.07% for RAPD primers and long, respectively and within the species observed variation of 52.58% and 63.93%. A dendrogram was constructed with the UPGMA clustering algorithm (Unweighted Pair-Group Method using an Arithmetic Average) using this analysis to the program NTSYS 2.0 (ROHLF 1998). Both markers were able to group the samples where genotypes 1 to 5 the most similar to each other. RAPD using primers short and long primers are effective to estimate the variability in Brachiaria ruziziensis. / O conhecimento da variabilidade genética de Brachiaria ruziziensis é necessário antes de iniciar-se um programa de melhoramento. Este trabalho objetivou estudar a variabilidade genética de 37 amostras de Brachiaria ruziziensis, provenientes de coleta realizada pela EMBRAPA Gado de leite por meio de marcadores moleculares RAPD e primers longos. O DNA das folhas foi extraído pelo método CTAB, utilizaram-se 14 primers decâmeros e 9 primers longos. Os dados foram utilizados para análise de variância molecular (AMOVA) utilizando-se as distâncias ao quadrado (EXCOFFIER et al., 1992) com auxílio do programa Arlequin (EXCOFFIER et al., 2006). Encontrou-se variação entre espécies de 47,42% e 36,07% para RAPD e primers longos, respectivamente e dentro da espécies observou-se variação de 52,58% e 63,93%. Foi construído um dendrograma com o algoritmo de agrupamento UPGMA (Unweighted Pair-Group Method Using an Arithmetic Average) utilizando-se para essa análise o programa NTSYS 2.0 (ROHLF, 1998).Ambos marcadores conseguiram agrupar os genótipos onde as amostras 1 a 5 foram as mais semelhantes entre si. RAPD utilizando-se primers curtos e primers longos são eficientes para estimar a variabilidade em Brachiaria ruziziensis.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:bdtd.unoeste.br:tede/528
Date27 November 2009
CreatorsGuaberto, Luciana Machado
ContributorsMachado Neto, Nelson Barbosa, Poletine, Juliana Parisotto, Silva, Matheus Gustavo da
PublisherUniversidade do Oeste Paulista, Mestrado em Agronomia, UNOESTE, BR, Ciências Agrárias
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UNOESTE, instname:Universidade do Oeste Paulista, instacron:UNOESTE
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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