Orientador : Prof. Dr. Marco Aurelio Krieger / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Defesa: Curitiba, 15/05/2009 / Inclui bibliografia / A infecção pelo vírus da hepatite C acomete cerca de 3% da população mundial e a
prevalência no Brasil está próxima deste valor. Seu impacto social é enorme, tanto
na morbidade e mortalidade, quanto nos custos que seu tratamento demanda. O
tratamento baseado no uso de interferon é efetivo em uma fração dos casos. Uma
vez que a determinação do genótipo do HCV é fundamental para a condução do
tratamento, métodos diagnósticos com esta finalidade fazem-se necessários.
Este trabalho publica pela primeira vez na literatura, ao menos pelo conhecimento do
autor, a utilização da metodologia de microarranjo líquido na determinação do
genótipo e subtipo do HCV. Na avaliação de oitenta amostras positivas para a
presença do HCV, o ensaio foi capaz de determinar o genótipo em setenta e seis
(76/80, sensibilidade de 95%). A avaliação de sua concordância com outros
métodos: seqüenciamento da região NS5b , Versant HCV genotype 1.0 e RT-PCR
"in house",foi realizada. A concordância em relação à determinação do genótipo foi
total em relação aos demais métodos, sendo o de seqüenciamento o padrão ouro. A
determinação do subtipo foi possível em cinqüenta e duas amostras com genótipos
determinados (52/76, 68%). Uma vez que para o tratamento da hepatite somente a
determinação do genótipo, e não do subtipo é necessária, conclui-se que o teste
baseado em microarranjo pode ser utilizado para esta finalidade; sendo sensível,
específico, de alto rendimento e de relação custo benefício favorável. / Worldwide 3% of the population is infected by hepatitis C virus, and a number next to
this is believed do occur in Brazil as well. Its social impact is huge, when morbidity
and mortality are considered, also treatment associated costs. Interferon based
treatment is favorable in a fraction of cases. Since it was established the importance
of HCV genotyping regarding treatment, diagnostics methods are in high demand.
The present work is the first to publish on liquid microarray utilization for HCV
genotyping, at least to the author knowledge. Eighty positive samples for HCV
presence evaluated showed seventy six to have their genotypes determined by the
microarray test (76/80, sensitivity of 95%). Agreement evaluation with other
methods: NS5b sequencing, Versant HCV genotype 1.0 and RT-PCR "in house"
was performed. When genotyping is considered, total agreement was found
compared to the other methods; sequencing being considered the "gold standard" .
Subtyping determination was possible in fifty two of those genotyped (52/76, 68%).
Once considered that only genotyping matters to treatment decision, and not
subtyping, it is concluded that microarray can be utilized to this goal; find to be
sensitive, specific, of high throughput and cost effective.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:dspace.c3sl.ufpr.br:1884/18866 |
| Date | January 2009 |
| Creators | Duarte, Cesar Augusto Barros |
| Contributors | Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Microbiologia, Parasitologia e Patologia Básica, Krieger, Marco Aurelio |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | 83f. : il. algumas color., application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPR, instname:Universidade Federal do Paraná, instacron:UFPR |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | Disponível em formato digital |
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