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Previous issue date: 2014-07-16 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Manioc (Manihot esculenta Crantz) is the fifth most important food produced in the world. Its
center of domestication is in southwestern Amazonia. After the initial domestication,
divergent selection pressures yielded two groups of varieties: sweet and bitter. The variation
generated in farmers’ fields serves as a source of enrichment for germoplasm banks of the
species. Efficient use requires morphologic and genetic characterization. Generally, molecular
markers directly reflect genetic variation in germplasm at the DNA level, without interference
from the environment, and offer valuable information to assess genetic diversity. The
Embrapa manioc germplasm bank contains 470 accessions that were analyzed with 10
microsatellite loci to assess genetic diversity and structuring within the bank. Through the
bayesian analysis it was possible to find four clusters of the genetic structure of the 470
accessions, and the grouping in K = 2 corresponded roughly to the bitter and sweet manioc
groups. However, for geographic structuring none of the K = 2, 3, 5, 7 identified interpretable
geographical groups. Data from the genotyped SSR were implemented by the Powercore
software, which indicated a core collection with 56 accessions that was able to capture the
maximum of allelic variation (113). The Shannon index was 1.74 in the core collection and
1.53 in the germplasm bank. The analysis of molecular variance showed that almost 100% of
the genetic diversity is within the two groups CN and BAG. / A cultura da mandioca (Manihot esculenta Crantz) é a quinta produtora de alimentos mais
importante no mundo. Seu centro de domesticação está no sudoeste da Amazônia. Em
mandiocas cultivadas depois da domesticação inicial, pressões seletivas divergentes deram
origem a dois grupos de variedades: amargas e mansas. A variação gerada nas roças dos
mandiocultores serve como fonte de enriquecimento para os bancos de germoplasma da
espécie. Para que seja eficientemente utilizado necessita de caracterização morfológica e
genética. Os marcadores moleculares podem refletir diretamente a variabilidade genética de
germoplasma em nível de DNA, sem a interferência do meio ambiente, e tornaram-se dados
valiosos para avaliar a diversidade genética. Foram utilizados 470 acessos que compõem o
banco de germoplasma da Embrapa. Dez loci de microssatélites foram utilizados para avaliar
a diversidade genética e verificar a estruturação dentro do banco. Através da análise bayesiana
foi possível encontrar 4 agrupamentos da estruturação genética dos 470 acessos, sendo que o
agrupamento em K = 2 correspondeu aproximadamente com os grupos de mandioca amarga e
mansa. No entanto, para estruturação geográfica nenhum dos K = 2, 3, 5 e 7 identificaram
grupos geográficos interpretáveis. Os dados dos SSR genotipados foram implementados pelo
software Powercore, o qual indicou uma coleção nuclear com 56 acessos que foi capaz de
capturar o máximo de variação alélica (113). O índice de Shannon foi de 1,74 na coleção
nuclear e 1,53 no banco de germoplasma. A análise de variância molecular mostrou que quase
100% da diversidade genética está dentro dos dois grupos CN e BAG.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:tede/2326 |
| Date | 16 July 2014 |
| Creators | Sousa, Sandra Barbosa de |
| Contributors | Clement, Charles R., Sousa, Nelcimar R. |
| Publisher | Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv), INPA, Brasil, Coordenação de Pós Graduação (COPG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPA, instname:Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, instacron:INPA |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -5829914500254207356, 600, 600, 600, 3806999977129213183, -4671505905809893211 |
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