Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-10-23T13:30:15Z
No. of bitstreams: 1
carlos_a_p_nascimento_ioc_bcm_0045_2011.pdf: 1006058 bytes, checksum: e670c764b773d1d5bd9fa107d877a76b (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-23T13:30:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1
carlos_a_p_nascimento_ioc_bcm_0045_2011.pdf: 1006058 bytes, checksum: e670c764b773d1d5bd9fa107d877a76b (MD5)
Previous issue date: 2011 / CNPq
FAPERJ / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / O Torque teno virus (TTV) é um vírus de DNA do gênero Alphatorquevirus
da família Anelloviridae. O TTV é altamente prevalente em populações de todo
o mundo. Isolados foram classificados em cinco grupos filogenéticos (1-5) com
grande distância genética entre eles. A presença do TTV já foi detectada nas
fezes, porém, não se sabe se todos os cinco genogrupos do TTV são
excretados nas fezes, e qual a distribuição do TTV entre os genogrupos. A fim
de avaliar a presença, a diversidade genômica e a carga viral do TTV em fezes,
135 amostras de pacientes com gastroenterite foram analisadas. O DNA do
TTV foi extraído de suspensão fecal e três diferentes métodos de reação em
cadeia da polimerase (PCR), dois qualitativos e um quantitativo, foram
avaliados. Nas amostras de fezes estudadas, 123 (91,1%) foram positivas em
pelo menos um dos três métodos. O DNA do TTV pertencente aos genogrupos
de 1 a 5 foi detectado em 37 (27,4%), 27 (20,0%), 57 (42,2%), 29 (21,5%) e
33 (24,4%) amostras, respectivamente. Co-infecções com dois, três, quatro e
cinco genogrupos do TTV foram encontradas em 23 (17,0%), 15 (11,1%), 7
(5,2%) e 7 (5,2%) amostras fecais, respectivamente. Assim, 52 (38,5%)
amostras continham mais de um genogrupo de TTV. A carga viral variou de 2,6
a 6,5 log de genoma equivalentes por grama de fezes. No entanto, variações
de carga viral foram observadas em função do genogrupo detectado e do
número de genogrupos presentes simultaneamente. Os resultados encontrados
são os primeiros a mostrar a alta prevalência e a diversidade de TTV nas fezes
humanas. / Torque teno virus (TTV) is a DNA virus of the genus Alphatorquevirus of
Anelloviridae family. The TTV is highly prevalent in populations from around the
world. Isolates have been classified into at least five main phylogenetic groups
(1-5) showing a large genetic distance between them. The presence of TTV has
been detected in feces. However, are presently unknown whether all five TTV
genogroups are excreted in feces and the genogroup distribution. To evaluate
the presence and the genomic distribution of TTV DNA in feces, 135 samples of
patients with gastroenteritis were analyzed. The DNA was extracted of fecal
suspension and three different PCR methods, two qualitative and one
quantitative, were used. One hundred and twenty three (91.1%) samples were
positive with at least one method. The TTV DNA belonging to the genogroups 1
to 5 was detected in 37 (27.4%), 27 (20.0%), 57 (42.2%), 29 (21.5%) and 33
(24.4%) fecal samples, respectively. Coinfections with two, three, four and five
TTV genogroups were found in 23 (17.0%), 15 (11.1%), 7 (5.2%) and 7 (5.2%)
fecal samples, respectively. Thus, 52 (38.5%) samples contained more than
one TTV genogroup. Viral loads ranged from 2.6 to 6.5 log genome equivalents
per gram of feces. However, variations of viral load were noted depending on
genogroup and number of coinfecting TTV genogroups. These results are the
first to show high prevalence and the diversity of TTV isolates in human feces.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/5715 |
| Date | January 2011 |
| Creators | Nascimento, Carlos Augusto Pinho do |
| Contributors | Paula, Vanessa Salete de, Miagostovich, Marize Pereira, Silva, Claudia Maria Dornelles da, Niel, Christian Maurice Gabriel |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Page generated in 0.0025 seconds