Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2014-10-08T21:49:25Z
No. of bitstreams: 2
Dissertação de Mestrado Mônica Reis19_07.d oc.pdf: 1532492 bytes, checksum: b88a88ff0daba799bc2fd5e3082c7928 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2014-10-09T11:13:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2
Dissertação de Mestrado Mônica Reis19_07.d oc.pdf: 1532492 bytes, checksum: b88a88ff0daba799bc2fd5e3082c7928 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-09T11:13:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2
Dissertação de Mestrado Mônica Reis19_07.d oc.pdf: 1532492 bytes, checksum: b88a88ff0daba799bc2fd5e3082c7928 (MD5)
license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
Previous issue date: 2013-02-25 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Among pregnant women infected with HIV-1, drug resistance mutations to
antiretroviral drugs (ARV) represent a challenge for the prevention to HIV-1 mother-to
child-transmission (MTCT) and for future maternal treatment options. The goal of this
study was to assess the presence of mutations in gp41 associated with natural resistance
to the fusion inhibitor T-20, polymorphisms and HIV-1 subtypes among pregnant
women never treated with T-20 and under different exposure levels to other ARV. A
total of 153 pregnant women infected with HIV-1 (ARV naive, under MTCT
prophylaxis or under ARV treatment/HAART) was recruited from june/2008-june/2010.
The env gene gp41 fragment of 766 bp (FP, HR1, HR2, TM regions) was amplified by
“nested”-PCR from cDNA and sequenced among 110 patients (Big Dye Terminator
Sequencing v. 3.1, Applied Biosystems, EUA; ABI Prism 3130). HIV-1 subtypes were
assigned by REGA tool and by phylogenetic analyses (Neighbor-Joining, Kimura 2-P).
T-20 resistance mutations were analyzed according to the IAS/USA, Stanford online
HIV Drug Resistance Database and other sources. The median age of pregnant women
(n=110) was 26 years (16-42 years), 16% were AIDS cases. The frequency of natural
resistance (N42D, L44M and R46M) to T-20 was 5.4% (6/110). All resistance
mutations were identified in HIV-1 subtype B isolates within the HR1 region of the
gp41 fragment. The prevalence of compensatory mutations in HR2 region of gp41 was
20.9% (23/110): S138A (n=11), E137K (n=10) e N126K (n=2). All 110 isolates
presented several polymorphisms. The following polymorphisms were observed in FP
of gp41: M24I/L/V, I7M/V, and I4A/F/L/M. In 42.7% (47/110) of isolates many indels
within the gp41 FP fragment were observed. Polymorphisms identified in HR1 were:
K77E/L/Q/R/V, I69V, L54M, R46K/Q, N42S and Q32L/N. Polymorphisms in HR2
gp41 region were: S157D/N, E151A/K/Q, E148D, I135L, S133D/E/N/Q/R/T,
H132F/Y, L130E/I/T, S129D/G/N/Q, N125A/D/E/S, R122K, N121E/D and E119Q.
Moderate rate of natural resistance for T-20 and higher prevalence of polymorphisms in
env gp41 region were described. Moreover higher prevalence of HIV-1 “non- B
subtypes” C and F1 was observed. These molecular data may contribute to better
therapeutic and MTCT preventive strategies for pregnant women infected with HIV-1. / Nas gestantes infectadas pelo HIV-1, a presença de mutações associadas à resistência
aos antirretrovirais (ARV) representa um desafio para a prevenção da transmissão
materno-infantil do HIV-1 e para futuras opções de tratamento materno. Este estudo
teve como objetivo avaliar a presença de mutações na gp41 associadas à resistência
natural ao inibidor de fusão T-20, polimorfismos e subtipos do HIV-1 em gestantes
nunca tratadas com T-20 e com diferentes níveis de exposição a outros ARVs. Um total
de 153 gestantes infectadas pelo HIV-1 (virgens de tratamento ARV, em profilaxia para
TV ou em tratamento com ARV) foi recrutado entre junho/2008-junho/2010. O
fragmento de 766 pb da gp41 do gene env (porções PF, HR1, HR2 e TM) foi
amplificado por “nested”-PCR a partir de cDNA e sequenciado em 110 pacientes (Big
Dye Terminator Sequencing v. 3.1, Applied Biosystems, EUA; ABI Prism 3130). Os
subtipos do HIV-1 foram identificados pelos softwares REGA HIV-1 e por inferência
filogenética (Neighbor-Joining, Kimura 2-P). Mutações associadas à resistência natural
ao T-20 foram analisadas por comparação com o banco de dados da IAS-USA, Stanford
HIV Drug Resistance Database e outras fontes. A mediana de idade das gestantes
(n=110) foi de 26 anos (variação 16-42 anos), 16% eram casos sintomáticos. Mutações
associadas à resistência natural para T-20 (N42D, L44M, R46M) foram encontradas em
5,4% (6/110). Todas as mutações associadas à resistência foram descritas nos isolados
do subtipo B no fragmento HR1 da gp41. A prevalência de mutações compensatórias
foi de 20,9% (23/110): S138A (n=11), E137K (n=10) e N126K (n=2). Todos os 110
isolados apresentaram vários polimorfismos. Os polimorfismos encontrados no
fragmento PF da gp41 foram: M24I/L/V, I7M/V e I4A/F/L/M. Em 42,7% (47/110) dos
isolados apresentaram várias inserções e deleções dentro do fragmento FP da gp41. Os
polimorfismos na região HR1 foram: K77E/L/Q/R/V, I69V, L54M, R46K/Q, N42S e
Q32L/N. Polimorfismos na região HR2 da gp41 foram: S157D/N, E151A/K/Q, E148D,
I135L, S133D/E/N/Q/R/T, H132F/Y, L130E/I/T, S129D/G/N/Q, N125A/D/E/S,
R122K, N121E/D e E119Q. Moderada prevalência de resistência natural ao T-20 e
elevada frequência de polimorfismos na região da gp41 foram descritas. Além disso,
uma alta prevalência de “subtipos não-B” C e F1 de HIV-1 foram observados. Estes
dados moleculares podem contribuir para estratégias terapêuticas e profiláticas mais
eficazes para gestantes infectadas pelo HIV-1.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/3301 |
| Date | 25 February 2013 |
| Creators | Reis, Mônica Nogueira da Guarda |
| Contributors | Stefani, Mariane Martins de Araújo, Cardoso, Ludimila Paula Vaz, Stefani, Mariane Martins de Araújo, Kipnis, André, Fonseca, Simone Gonçalves da |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Medicina Tropical e Saúde Publica (IPTSP), UFG, Brasil, Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 6085308344741430434, 600, 600, 600, 600, -7769011444564556288, -3854583469976220812, -961409807440757778 |
Page generated in 0.0026 seconds