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Previous issue date: 2014-02-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Hepatitis C represents a public health problem worldwide. Hepatitis C virus (HCV) is
classified into seven genotypes and many subtypes. Besides their epidemiological
importance, these genotypes have influence on the response to hepatitis C treatment, as
well as other factors related to the virus and its host, such as polymorphisms upstream
of interleukin (IL) 28B locus. Despite the importance of these factors in the response to
treatment of hepatitis C, there are no data regarding the subject in the Midwest Region
of Brazil. The present study aimed to identify the genotypes of HCV among patients
attended at a reference laboratory in Goiânia-GO, and also to assess response to
treatment of patients infected with genotype 1 with pegylated interferon (PEG-IFN) and
ribavirin (RBV), with emphasis on the polymorphism upstream of IL28B gene (rs
12979860). For HCV genotyping, a cross-sectional study was conduct in an anti-HCV
positive patients in a reference laboratory in Goiânia-GO, during in a period of 10 years
(2003 to 2012) (n = 1300). From January/2012 to December/2013 (n = 101), a cohort
was conduct among patients infected with HCV genotype 1 treated with PEG-IFN and
RBV in order to evaluate treatment response. Patients were interviewed and blood
samples collected for detection of viral RNA by polymerase chain reaction (PCR) with
primers complementary to the region 5’ noncoding (NC) of HCV. All HCV RNA
positive samples were genotyped by line probe assay – LiPA, and the samples typed as
1a/1b, 2 and 4 were sequenced in the NS5B region of the viral genome. The analysis of
single nucleotide polymorphism (SNP) rs12979860 C/T was performed by restriction
fragment length polymorphism (RFLP). Of the 1300 samples tested for HCV RNA, 894
were positive. Among these, genotypes 1 (76.3%), 2 (1.9%), 3 (21.6%) and 4 (0.2%)
were found. These data show the predominance of genotype 1, followed by 3 and 2, and
support the results of other studies in Goiânia. In addition, genotype 4 was found in the
studied population. Regarding to SNP rs12979860 C/T, the TC genotype was the most
common (57.4%), followed by CC (23.8%) and TT (18.8%). The rate of sustained
virologic response (SVR) was 28.7%, being higher in individuals with the CC genotype
(54.2%) when compared to those with CT and TT genotypes (22.4% and 15.8%,
respectively). These results indicate that analysis of SNP rs12979860 is an important
predictor of SVR following PEG-IFN and RBV treatment in patients infected with HCV
genotype 1 in our region. / A hepatite C representa um problema de saúde pública mundial. O vírus da hepatite C
(HCV) é classificado em sete genótipos e vários subtipos. Além da importância
epidemiológica, os genótipos desse vírus influenciam a resposta ao tratamento da
hepatite C, assim como outros fatores relacionados ao vírus e ao hospedeiro, como o
polimorfismo relacionado ao gene da interleucina (IL) 28B. Apesar da importância
desses fatores na resposta ao tratamento da hepatite C, não existem dados sobre o tema
na Região Centro-Oeste. O presente estudo teve como objetivos identificar os genótipos
do HCV em pacientes atendidos em laboratório de referência em Goiânia-GO e avaliar
a resposta ao tratamento com interferon peguilado (PEG IFN) e ribavirina (RBV) em
portadores do genótipo 1, com ênfase no polimorfismo relacionado ao gene IL28B (rs
12979860). Foi realizado um estudo de corte transversal para genotipagem do HCV em
pacientes anti-HCV reagentes atendidos em laboratório de referência em Goiânia-GO,
em um período de 10 anos (2003 a 2012) (n = 1300). Entre janeiro/2012 e
dezembro/2013 (n = 101), foi formada uma coorte de portadores do genótipo 1 do HCV
submetidos ao tratamento da hepatite C com PEG IFN e RBV, para avaliação de sua
resposta. Os pacientes foram entrevistados e amostras sanguíneas coletadas para
detecção do RNA viral por reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores
complementares a região 5’ não codificante (NC) do HCV. Todas as amostras RNAHCV
positivas foram genotipadas por line probe assay – LiPA, e as tipadas como
1a/1b, 2 e 4 foram sequenciadas para a região NS5B do genoma viral. A análise do
single nucleotide polymorphism (SNP) rs12979860 C/T foi realizada por restriction
fragment length polymorphism (RFLP). Das 1300 amostras testadas para RNA-HCV,
894 foram positivas, sendo identificados os genótipos 1 (76,3%), 2 (1,9%), 3 (21,6%) e
4 (0,2%). Estes dados mostram o predomínio do genótipo 1, seguido do 3 e 2, e
corroboram os de outros estudos realizados em Goiânia, com a adição do genótipo 4 na
população estudada. Em relação ao SNP rs12979860 C/T, o genótipo TC foi o mais
frequente (57,4%), seguido por CC (23,8%) e TT (18,8%). A taxa de resposta virológica
sustentada (RVS) foi de 28,7%, sendo superior nos portadores do genótipo CC (54,2%)
em relação aos genótipos TC e TT (22,4% e 15,8%, respectivamente). Estes resultados
indicam que a análise do SNP rs12979860 é importante preditor de RVS ao tratamento
com PEG IFN e RBV em pacientes infectados com o genótipo 1 do HCV em nossa
região.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/3710 |
| Date | 28 February 2014 |
| Creators | Silva, Ágabo Macêdo da Costa e |
| Contributors | Martins, Regina Maria Bringel, Martins, Regina Maria Bringel, Lopes, Carmen Luci Rodrigues, Aires, Rodrigo Sebba |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Medicina Tropical e Saúde Pública (IPTSP), UFG, Brasil, Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 8197219506590464977, 600, 600, 600, 600, -7769011444564556288, -3854583469976220812, -961409807440757778 |
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