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Análise transcricional de Physcomitrium Acutifolium Broth. por meio da técnica de rna-seq: um enfoque sobre o estresse por frio em plantas / Transcriptional analysis Physcomitrium acutifolium Broth. By RNA-Seq technology: focusing About stress Cold FOR IN plants

Submitted by Francine Silva (francine.silva@unipampa.edu.br) on 2016-09-28T20:54:58Z
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Análise Transcricional de Physcomitrium Acutifolium Broth. Por meio da Técnica de RNA-SEG um enfoque sobre o estresse por frio em plantas.pdf: 2456403 bytes, checksum: f125855c91a08aa6e84cb53239871aa3 (MD5)
Previous issue date: 2015-05-29 / Os estresses abióticos são responsáveis pela indução de adaptações em
plantas. Estas quando submetidas ao estresse, respondem através de mecanismos
de sinalização nas rotas fisiológicas, desencadeando um processo de aclimatação.
Entretanto, nem sempre este potencial de adaptação é expresso, mas se persistir ao
longo do desenvolvimento da planta, torna-se uma adaptação oriunda de mudança
genética. Consequentemente, essas alterações incipientes possam ser identificadas
em nível transcricional, os precursores de algumas alterações genéticas importantes
tais como splicing alternativo. Em ambientes polares a expressão de genes permitiu
a adaptação das plantas a temperaturas de congelamento. Entre estas plantas estão
os musgos, presentes nos ambientes de climas contrastantes, isto sugere que estes
organismos tenham plasticidade fenotípica e genotípica. Ainda que haja poucos
estudos destes organismos em relação a diferentes agentes estressores, é
amplamente difundido que estes possuem potenciais de resistência aos estresses
ambientais. Para descobrir estes potenciais de resistências é necessário estudar os
genes relacionados especificamente com o fator estressor em questão, neste caso o
estresse ao frio. Para tanto é necessário um processo de sequenciamento dos
genes expressos quando a planta é submetida ao estresse. Neste estudo foram
realizados testes com explantes cultivados in vitro do musgo Physcomitrium
acutifolium Broth. em diferentes temperaturas, com 6 tratamentos variando de 0 a 25
ºC, seguidos das análises fenotípicas e posteriormente genômicas, incluindo
processo de sequenciamento e identificação de genes expressos. Os resultados
sugerem relação do estresse por baixas temperaturas e o potencial de expressão de
genes relacionados ao estresse por frio neste musgo, principalmente por uma
identificação de maiores ocorrências de splicing alternativo nas plantas cultivadas a
temperatura mais baixa testada. Assim, o uso potencial de espécies de musgo em
estudos relacionados à resistência ao congelamento em plantas, torna-se como uma
alternativa interessante em processos de biotecnologia vegetal. / The abiotic stresses are responsible for inducing adaptations in plants. When
subjected to stress, plants respond by signaling mechanisms in physiological
pathways, starting a process of acclimatization. However, not every adaptation
potential is identified in phenotypic level, but if the selection pressure led by the
stress persist over plant development, there may be a change in genotypic level.
Consequently, these incipient changes can be identified in transcriptional level, the
precursors of some important genetic changes such as alternative splicing. In polar
environments are noted that the plants were adapted to survive at low temperatures,
this adjustment is related to the expression of genes, which confer them resistance to
freezing. Among these plants are mosses, present in the environments of contrasting
climates, this suggests that these organisms have phenotypic and genotypic
plasticity. Even if there are few studies of these organisms in relation to different
stressors, we know that these have the potential for resistance to environmental
stresses. To discover these potential resistance is necessary to study the genes
specifically related to the stressor in question, this study is the cold stress. Then you
need a sequencing process is necessary genes expressed when the plant is
subjected to stress. In this study were performed tests with cultured explants in vitro
moss Physcomitrium acutifolium Broth. at different temperatures, with 6 treatments
ranged from 0°C to 25°C, followed by phenotypic analysis and subsequently
transcriptome analysis based in RNA sequencing process aiming to identify a
differential gene expression. The results suggest stress relationship for low
temperatures and the potential for expression of genes related to cold stress in this
moss, mainly by an identification of a higher occurrences of alternative splicing in
plants growing at lowest temperature tested. Thus, the potential use of moss species
in studies related to plant resistance to freeze temperatures becomes as an
interesting alternative in plant biotechnology processes.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:10.1.0.46:riu/559
Date29 May 2015
CreatorsMinozzo, Mônica Munareto
ContributorsVictória, Filipe de Carvalho
PublisherUniversidade Federal do Pampa, UNIPAMPA, Campus São Gabriel
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UNIPAMPA, instname:Universidade Federal do Pampa, instacron:UNIPAMPA
RightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess

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