Avaliação da variabilidade genética e agrupamento de acessos e cultivares de Brachiaria por marcadores de RAPD. / RAPD grouping of accesses and cultivars of three Brachiaria species

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Previous issue date: 2007-07-18 / The aim of this work was the determination of intra and intergenetic similarity between three Brachiaria species among germplasm accesses and commercial materials throughout RAPD markers. Seeds were used as DNA source. 10 decamers primers were selected between 120 primers assayed and 107 polymorphic bands were used to perform the molecular variance analysis (AMOVA), Jaccard similarity and species fixation index. 24.4% of the total variability was contained between species and 75.6% inside the species, with a species fixation index (FST) of 0.24. The tree showed that two major branches were formed, one with the three outgroup species and other with the species, this one split in three minor branches one with all B. ruziziensis samples; other with all B. decumbens accessions and three of B. brizantha and the last with two B. brizantha accesses, all commercial cultivars and B. decumbens cv. Basilisk . It was possible to group, throughout RAPD, Brachiaria accesses and cultivars. The genetic variability index between species was considered low and somehow low when faced with autogamous species. B.brizantha showed the highest genetic variability and the lowest FST what means that there is a higher genetic flux intra specific than the others. / O propósito deste trabalho foi determinar a similaridade genética de entre acessos de germoplasma e cultivares comerciais três espécies de Brachiaria (inter e intraespecífica), através de marcadores RAPD. Sementes foram utilizadas como fonte de DNA. 10 primers decâmeros foram selecionados de 120 primers avaliados, produzindo 107 bandas polimórficas, as quais foram utilizados para a análise de variância molecular (AMOVA), o coeficiente de similaridade de Jaccard e índices de fixação gênica. 24,40% da variabilidade genética total está contida entre as espécies e 75,60% dentro destas, com índice de fixação gênica (FST) 0,24. No dendrograma houve a formação de dois ramos, um formado por P. maximum e B. arrecta e o outro subdividido em três: todas amostras de B. ruziziensis; todos os acessos de B. decumbens e três acessos de B. brizantha e o último com dois acessos de B. brizantha mais as B. brizantha comerciais e a B. decumbens cv Basilisk . Foi possível agrupar os acessos e cultivares de Brachiaria através de RAPD. O índice de variabilidade genética entre espécies foi considerado baixo, sendo inferior a valores determinados em algumas espécies autógamas. B. brizantha apresenta maior variabilidade genética e menor FST indicando maior fluxo gênico intra-específico do que as outras.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:bdtd.unoeste.br:tede/450
Date18 July 2007
CreatorsAmbiel, Ana Claudia
ContributorsMachado Neto, Nelson Barbosa, Foloni, José Salvador Simoneti, Souza, Rogério Fernandes de
PublisherUniversidade do Oeste Paulista, Mestrado em Agronomia, UNOESTE, BR, Ciências Agrárias
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UNOESTE, instname:Universidade do Oeste Paulista, instacron:UNOESTE
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