Made available in DSpace on 2014-06-12T15:59:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4851_1.pdf: 9220141 bytes, checksum: cefb66cdefb3c1a635055960a42bba0b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / O agrupamento de dados é uma das operações mais importantes na análise de informações. Esta operação consiste em, dada uma massa de informações a respeito de uma população de indivíduos, procurar grupos de elementos semelhantes entre si e diferentes dos outros. Essa técnica encontra aplicações em praticamente todas as áreas, desde análise de imagens até bioinformática. Quando o volume de dados é considerável, o problema se torna computacionalmente muito difícil. Recentemente foi estabelecida uma analogia entre o problema de agrupamento e a procura de configurações típicas de um modelo físico, o modelo de Potts. Dado que existem algoritmos eficientes para a localização dessas configurações, como por exemplo a dinâmica de Swendsen-Wang, é possível aplicar essas técnicas para um grande volume de dados e em uma grande diversidade de situações. Para verificar essa analogia foi desenvolvido o programa SPC, em linguagem C, pelo Professor Eytan Domany, do Departamento de Física de Sistemas Complexos, do Instituto de Ciência de Weizmann, em Israel. A função principal desse programa é a geração de agrupamentos de dados utilizando uma nova técnica de agrupamento baseada na analogia citada. Essa técnica ficou conhecida como superparamagnética e se baseia na procura de ocorrências de um certo modelo de Potts não-homogêneo em um estágio intermediário entre duas fases do magnetismo, a ferromagnética e a paramagnética. O programa SPC utiliza a dinâmica de Swendsen-Wang para simular os estados típicos do modelo de Potts. Esta dissertação estuda essa técnica de agrupamento e apresenta proposta, construção e avaliação de um sistema amigável para sua aplicação em diversas situações. O resultado deste trabalho é uma interface amigável, desenvolvida em IDL, que permite tanto a especificação dos parâmetros que determinam o funcionamento do algoritmo SPC quanto a análise dos resultados por ele produzidos. Esta análise permite a visualização dos agrupamentos superparamagnéticos através de gráficos hierárquicos (dendrogramas). Esses dendrogramas oferecem ao usuário mecanismos de interação para descoberta de informações, bem como análises quantitativas (média, variância, mediana, curtose, coeficiente e assimetria, entre outras) e qualitativas (Brushplots) dos dados. A junção desse sistema com o programa SPC foi empregada com sucesso na análise de dados

Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-23T14:01:55Z No. of bitstreams: 5 23.pdf: 695049 bytes, checksum: f10d086518436baec21fc294fdf00c09 (MD5) license_url: 52 bytes, checksum: 3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9 (MD5) license_text: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-02-10T12:48:17Z (GMT) No. of bitstreams: 5 23.pdf: 695049 bytes, checksum: f10d086518436baec21fc294fdf00c09 (MD5) license_url: 52 bytes, checksum: 3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9 (MD5) license_text: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-10T12:48:17Z (GMT). No. of bitstreams: 5 23.pdf: 695049 bytes, checksum: f10d086518436baec21fc294fdf00c09 (MD5) license_url: 52 bytes, checksum: 3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9 (MD5) license_text: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) license.txt: 2109 bytes, checksum: aa477231e840f304454a16eb85a9235f (MD5) Previous issue date: 2013 / Considerado como um ?hotspot? mundial de biodiversidade, o Cerrado apresenta alta abund?ncia de esp?cies end?micas e possui mais de 11.627 esp?cies de plantas nativas j? catalogadas. Dentre elas, o pequizeiro (Caryocar brasiliense), esp?cie que possui grande import?ncia ambiental e social neste bioma. A expans?o da fronteira agr?cola e a intensiva explora??o do Cerrado, por?m, t?m colocado em risco a preserva??o e a variabilidade gen?tica da esp?cie. Al?m disso, o extrativismo intensivo do pequizeiro pode gerar perdas de material gen?tico, j? que quase todos os frutos de qualidade, oriundos de gen?tipos superiores, s?o coletados. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho foi analisar o banco de matrizes de pequi, utilizando marcadores moleculares microssat?lites, com fins de melhoramento e conserva??o da esp?cie. Para a extra??o do DNA gen?mico, foram utilizadas amostras foliares de 20 matrizes de Caryocar brasiliense, das quais 16 oriundas do Parque Estadual do Rio Preto (S?o Gon?alo do Rio Preto ? MG) e as demais oriundas da Fazenda Experimental da UFVJM ? Campus Moura (Curvelo ? MG). Para a amplifica??o do DNA, foram testados dez oligonucleot?deos espec?ficos para o pequi. Ap?s a amplifica??o, os fragmentos de DNA foram separados em gel desnaturante de poliacrilamida 10% e ureia 6 M em TBE 1x.A partir da leitura dos g?is gerou-se uma matriz bin?ria em que os indiv?duos foram genotipados quanto ? presen?a (1) e aus?ncia (0) de bandas. Com essa matriz, atrav?s do programa estat?stico R, calcularam-se as dist?ncias gen?ticas de Jaccard e obteve-se o dendrograma. As dist?ncias gen?ticas variaram de 0,15 a 0,70. A an?lise de agrupamento, representada pelo dendrograma, permitiu inferir que as matrizes foram divididas em quatro grupos distintos. Dessa forma, o programa de melhoramento do pequizeiro poder? utilizar esses dados para o estabelecimento e avalia??o de testes de prog?nies, com fins de produ??o ou conserva??o. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncia Florestal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2013

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This work aimed at building a management dendrogram and determining the appropriate density for management of stands of Pinus elliottii in central region of the Rio Grande do Sul. To do that, stands in maximum stock, in different ages, located in the campus of Universidade Federal de Santa Maria and neighborhoods, were used. The dendrometric variables used in the calculation process were obtained from sample units with temporary characteristic, considering the method of determination of the punctual density proposed by Spurr, and isolated trees, with crowns in free growth. The maximum population density was estimated by the Reineke method, with an angular coefficient of -1,92009. The density in number of trees for the beginning of the total occupation of the dossal was estimated taking into account the crown areas, which were obtained from a lineal model estimator of crown diameter in function of the dap, fit for variables from trees in free growth. The construction of the dendrogram was in function of the basal area, the number of trees per hectare and the tree diameter with medium basal area. The density levels were determined proportionally to the maximum density for stands density index (IDP), in clusters of index 200, from the maximum IDP, 1200, to the minimum, 400. The appropriate density for management was found by calculation process and adjusted by the observation of two stands. Results indicate the maintenance of the density between IDP 600 and 840 for the production of wood of great dimensions. Plans of management with different initial densities and number of self-thinning interventions were elaborated, showing that the dendrogram is an efficient tool, able to assist the elaboration of the management plan, with production estimates for self-thinning and final cut. / Este trabalho teve como objetivos construir um dendrograma de manejo e determinar a densidade adequada para manejo de povoamentos de Pinus elliottii para a região Central do Rio Grande do Sul. Para tanto, foram utilizados povoamentos em estoque máximo, em diferentes idades, localizados no campus da Universidade Federal de Santa Maria e proximidades. As variáveis dendrométricas foram obtidas de unidades amostrais de caráter temporário pelo método de determinação da densidade pontual proposto por Spurr, e de árvores isoladas, com copa em crescimento livre. A máxima densidade populacional foi estimada pelo modelo de Reineke, com um coeficiente angular de -1,92009. A densidade em número de árvores para o início da ocupação total do dossel foi obtida através de um modelo linear estimador de diâmetro de copas em função do dap, ajustado com variáveis obtidas de árvores em crescimento livre. O dendrograma foi construído em função da área basal, do número de árvores por hectare e do diâmetro da árvore de área basal média. Os níveis de densidade foram determinados, proporcionalmente, à máxima densidade por índice de densidade do povoamento (IDP), em classes de índice 200, desde o IDP máximo, 1200, até o mínimo, 400. A densidade adequada para manejo foi ajustada por processo de cálculo e pela observação de dois povoamentos. Os resultados obtidos indicam a manutenção da densidade entre o IDP 600 e 840 para a produção de madeira de grandes dimensões. Foram elaborados planos de manejo com diferentes densidades iniciais e número de intervenções de desbaste, demonstrando que o dendrograma é uma ferramenta eficiente, capaz de auxiliar na elaboração de planos de manejo, com estimativas de produção para desbastes e corte final.

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2015-11-11T23:45:15Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o Soniane.pdf: 4275209 bytes, checksum: ccb64680a02e7e062aaddf493949e519 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-11T23:45:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o Soniane.pdf: 4275209 bytes, checksum: ccb64680a02e7e062aaddf493949e519 (MD5) Previous issue date: 2013-01-25 / The objectives of this study were to obtain and evaluate interspecific hybrids of the genus Psidiumto resistance to M. enterolobii and analyze the genetic variability of accessions of guava and ara?azeiros of the active germplasm bank of Embrapa Semi-Arid based on microsatellites, to guide genetic resources and breeding programs, emphasizing crosses of guava with other Psidium species.The crosses were performed when the calyx ruptured on the flower buds. When the plants reached15 to 20 cm tall, they were inoculated with a suspension containing 10,000 nematode eggs. Four months after inoculation, the soils were removed from the plants for individual evaluation of the number of galls, number of eggs and reproduction factor (RF). Genotyping was performed with two and 13 microsatellite loci in hybrids and Psidium accessions, respectively. Total DNA was extracted by the CTAB 2x method and PCR products were analyzed by denaturing polyacrylamide gel 6%, stained with silver nitrate. Interspecific hybrids between GUA 161 PE P guajava x ARA 138 RR P. guineensewere highly tolerant to nematodes, with growth similar to the guava, and demonstrated high compatibility when grafted with the cultivar 'Paluma'. The 61 accessionsPsidiumaccessions showed similarity coefficient ranging from 0.75 to 1.00 and the dendrogram presented co-phenetic value of 0.85. Genetic variability was considered high ?ST=0.238 and it was observed formation of five groups at a cutoff of 83% similarity. The genetic similarity among P.guineense and some guava accessions were above 80%, suggesting greater possibility to obtain interespecific hybrids among these two species. / Os objetivos deste trabalho foram obter e avaliar h?bridos interespec?ficos do g?nero Psidium para resist?ncia ao M. enterolobii e analisar a variabilidade gen?tica de acessos de goiabeiras e ara?azeiros do banco ativo de germoplasma da Embrapa Semi?rido, com base em microssat?lites, para fornecer subs?dios para programas de recursos gen?ticos e de melhoramento com ?nfase para cruzamentos de goiabeira com outras esp?cies do g?nero Psidium.Os cruzamentos foram realizados quando os bot?es florais apresentavam ruptura do c?lice.Quando as plantas atingiram 15 a 20 cm de altura, foi realizada a inocula??o com suspens?o contendo 10.000 ovos do nematoide. Quatro meses ap?s a inocula??o, foi removido o solo das plantas para avalia??o individual para n?mero de galhas, n?mero de ovos e fator de reprodu??o (FR). A genotipagem foi feita com dois e 13 locos de microssat?lites, nos h?bridos e nos acessos de Psidium. O DNA total foi extra?do pelo m?todo CTAB 2x e os produtos de PCR foram analisados em gel de poliacrilamida desnaturante 6% e corados com nitrato de prata. H?bridos interespec?ficos entre GUA 161 PE de P. guajava x ARA 138 RR de P. guineense foram altamente resistentes ao nematoide, apresentando crescimento similar ao da goiabeira, e demonstrado alta compatibilidade quando enxertada com a cultivar ?Paluma?.Os 61 acessos de Psidium apresentaram coeficiente de similaridade variando de 0,75 a 1,00. O dendrograma apresentou valor co-fen?tico de 0,85. A variabilidade gen?tica foi considerada alta 0,238(?ST)e observou-se forma??o de cinco grupos no ponto de corte de 83% de similaridade.A similaridade gen?tica entre P. guineense e alguns acessos de goiabeira foi superior a 80%, indicando maior possibilidade de sucesso em cruzamentos interespec?ficos entre essas duas esp?cies.

Apesar da ampla diversidade de línguas indígenas no Brasil, poucas pesquisas estudam estas línguas e suas relações. Inúmeros esforços têm sido dedicados a procurar similaridades entre as palavras das línguas indígenas e classificá-las em famílias de línguas. Seguindo a classificação mais aceita das línguas indígenas do Brasil, esta pesquisa propõe comparar palavras de 10 línguas indígenas brasileiras. Para isso, considera-se que estas palavras são sinais de fala e estima-se a função de distribuição de probabilidade (PDF) de cada palavra, usando um modelo de mistura de gaussianas (GMM). A PDF foi considerada um modelo para representar as palavras. Os modelos foram comparados utilizando medidas de distância para construir estruturas hierárquicas que evidenciaram possíveis relações entre as palavras. Seguindo esta linha, a hipótese levantada nesta pesquisa é que as PDFs baseadas em GMM conseguem caracterizar as palavras das línguas indígenas, permitindo o emprego de medidas de distância entre elas para estabelecer relações entre as palavras, de forma que tais relações confirmem algumas das classificações. Os parâmetros do GMM foram calculados utilizando o algoritmo Maximização da Expectância (em inglês, Expectation Maximization (EM)). A divergência Kullback Leibler (KL) foi empregada para medir semelhança entre as PDFs. Esta divergência serve de base para estabelecer as estruturas hierárquicas que ilustram as relações entre os modelos. A estimativa da PDF, baseada em GMM foi testada com o auxílio de sinais simulados, sendo possível confirmar que os parâmetros obtidos são próximos dos originais. Foram implementadas várias medidas de distância para avaliar se a semelhança entre os modelos estavam determinadas pelos modelos e não pelas medidas adotadas neste estudo. Os resultados de todas as medidas foram similares, somente foi observada alguma diferença nos agrupamentos realizados pela distância C2, por isso foi proposta como complemento da divergência KL. Estes resultados sugerem que as relações entre os modelos dependem das suas características, não das métricas de distância selecionadas no estudo e que as PDFs baseadas em GMM, conseguem fazer uma caracterização adequada das palavras. Em geral, foram observados agrupamentos entre palavras que pertenciam a línguas de um mesmo tronco linguístico, assim como se observou uma tendência a incluir línguas isoladas nos agrupamentos dos troncos linguísticos. Palavras que pertenciam a determinada língua apresentaram um comportamento padrão, sendo identificadas por esse tipo de comportamento. Embora os resultados para as palavras das línguas indígenas sejam inconclusivos, considera-se que o estudo foi útil para aumentar o conhecimento destas 10 línguas estudadas, propondo novas linhas de pesquisas dedicadas à análise destas palavras. / Although there exists a large diversity of indigenous languages in Brazil, there are few researches on these languages and their relationships. Numerous efforts have been dedicated to search for similarities among words of indigenous languages to classify them into families. Following the most accepted classification of Brazilian indigenous languages, this research proposes to compare words of 10 Brazilian indigenous languages. The words of the indigenous languages are considered speech signals and the Probability Distribution Function (PDF) of each word was estimated using the Gaussian Mixture Models (GMM). This estimation was considered a model to represent each word. The models were compared using distance measures to construct hierarchical structures that illustrate possible relationships among words. The hypothesis in this research is that the estimation of the PDF, based on GMM can characterize the words of indigenous languages, allowing the use of distance measures between the PDFs to establish relationships among the words and confirm some of the classifications. The Expectation Maximization algorithm (EM) was implemented to estimate the parameters that describe the GMM. The Kullback Leibler (KL) divergence was used to measure similarities between two PDFs. This divergence is the basis to establish the hierarchical structures that show the relationships among the models. The PDF estimation, based on GMM was tested using simulated signals, allowing confirming the useful approximation of the original parameters. Several distance measures were implemented to prove that the similarities among the models depended on the model of each word, and not on the distance measure adopted in this study. The results of all measures were similar, however, as the clustering results of the C2 distances showed some differences from the other clusters, C2 distance was proposed to complement the KL divergence. The results suggest that the relationships between models depend on their characteristics, and not on the distance measures selected in this study, and the PDFs based on GMM can properly characterize the words. In general, relations among languages that belong to the same linguistic branch were illustrated, showing a tendency to include isolated languages in groups of languages that belong to the same linguistic branches. As the GMM of some language families presents a standard behavior, it allows identifying each family. Although the results of the words of indigenous languages are inconclusive, this study is considered very useful to increase the knowledge of these types of languages and to propose new research lines directed to analyze this type of signals.

Apesar da ampla diversidade de línguas indígenas no Brasil, poucas pesquisas estudam estas línguas e suas relações. Inúmeros esforços têm sido dedicados a procurar similaridades entre as palavras das línguas indígenas e classificá-las em famílias de línguas. Seguindo a classificação mais aceita das línguas indígenas do Brasil, esta pesquisa propõe comparar palavras de 10 línguas indígenas brasileiras. Para isso, considera-se que estas palavras são sinais de fala e estima-se a função de distribuição de probabilidade (PDF) de cada palavra, usando um modelo de mistura de gaussianas (GMM). A PDF foi considerada um modelo para representar as palavras. Os modelos foram comparados utilizando medidas de distância para construir estruturas hierárquicas que evidenciaram possíveis relações entre as palavras. Seguindo esta linha, a hipótese levantada nesta pesquisa é que as PDFs baseadas em GMM conseguem caracterizar as palavras das línguas indígenas, permitindo o emprego de medidas de distância entre elas para estabelecer relações entre as palavras, de forma que tais relações confirmem algumas das classificações. Os parâmetros do GMM foram calculados utilizando o algoritmo Maximização da Expectância (em inglês, Expectation Maximization (EM)). A divergência Kullback Leibler (KL) foi empregada para medir semelhança entre as PDFs. Esta divergência serve de base para estabelecer as estruturas hierárquicas que ilustram as relações entre os modelos. A estimativa da PDF, baseada em GMM foi testada com o auxílio de sinais simulados, sendo possível confirmar que os parâmetros obtidos são próximos dos originais. Foram implementadas várias medidas de distância para avaliar se a semelhança entre os modelos estavam determinadas pelos modelos e não pelas medidas adotadas neste estudo. Os resultados de todas as medidas foram similares, somente foi observada alguma diferença nos agrupamentos realizados pela distância C2, por isso foi proposta como complemento da divergência KL. Estes resultados sugerem que as relações entre os modelos dependem das suas características, não das métricas de distância selecionadas no estudo e que as PDFs baseadas em GMM, conseguem fazer uma caracterização adequada das palavras. Em geral, foram observados agrupamentos entre palavras que pertenciam a línguas de um mesmo tronco linguístico, assim como se observou uma tendência a incluir línguas isoladas nos agrupamentos dos troncos linguísticos. Palavras que pertenciam a determinada língua apresentaram um comportamento padrão, sendo identificadas por esse tipo de comportamento. Embora os resultados para as palavras das línguas indígenas sejam inconclusivos, considera-se que o estudo foi útil para aumentar o conhecimento destas 10 línguas estudadas, propondo novas linhas de pesquisas dedicadas à análise destas palavras. / Although there exists a large diversity of indigenous languages in Brazil, there are few researches on these languages and their relationships. Numerous efforts have been dedicated to search for similarities among words of indigenous languages to classify them into families. Following the most accepted classification of Brazilian indigenous languages, this research proposes to compare words of 10 Brazilian indigenous languages. The words of the indigenous languages are considered speech signals and the Probability Distribution Function (PDF) of each word was estimated using the Gaussian Mixture Models (GMM). This estimation was considered a model to represent each word. The models were compared using distance measures to construct hierarchical structures that illustrate possible relationships among words. The hypothesis in this research is that the estimation of the PDF, based on GMM can characterize the words of indigenous languages, allowing the use of distance measures between the PDFs to establish relationships among the words and confirm some of the classifications. The Expectation Maximization algorithm (EM) was implemented to estimate the parameters that describe the GMM. The Kullback Leibler (KL) divergence was used to measure similarities between two PDFs. This divergence is the basis to establish the hierarchical structures that show the relationships among the models. The PDF estimation, based on GMM was tested using simulated signals, allowing confirming the useful approximation of the original parameters. Several distance measures were implemented to prove that the similarities among the models depended on the model of each word, and not on the distance measure adopted in this study. The results of all measures were similar, however, as the clustering results of the C2 distances showed some differences from the other clusters, C2 distance was proposed to complement the KL divergence. The results suggest that the relationships between models depend on their characteristics, and not on the distance measures selected in this study, and the PDFs based on GMM can properly characterize the words. In general, relations among languages that belong to the same linguistic branch were illustrated, showing a tendency to include isolated languages in groups of languages that belong to the same linguistic branches. As the GMM of some language families presents a standard behavior, it allows identifying each family. Although the results of the words of indigenous languages are inconclusive, this study is considered very useful to increase the knowledge of these types of languages and to propose new research lines directed to analyze this type of signals.

Since the 60´s a group of searchers in front of same aspects as: geographic growing, food production, etc, looking for analyze the future situation of the man kind in related to Environment. In this aspect, in consequence of the environmental worry there is the Conference in Rio de Janeiro named Rio 92, with main subject the approval of 21st agenda, whose main objective is to stimulate the environmental conservation and preservation. In this context, the state of Paraná became the first in the creation and implementation of Ecological ICMS, an economic instrument that has as main functions: the compensatory function and stimulating function. This way, foundated in the Federal and State Constitution, in the study executed about the Sergipe´s ICMS and through the stimulating function, the present work has as objectives: the implementation and establishing of the Ecological ICMS in the semi-arid region in the Sergipe state. This way, we will search for identify groups of towns that present similitude and still establish tendency functions through the years in the resort available in the piece ICMS. / A partir da década de 60 um grupo de pesquisadores diante de aspectos como: crescimento geográfico, produção de alimentos, dentre outros, procura analisar a situação futura do homem em relação ao Meio Ambiente. Nesse aspecto, como reflexo dessa preocupação com o meio ambiente acontece a Conferência no Rio de Janeiro intitulada Rio 92, tendo como ponto principal à aprovação da Agenda XXI, cujo principal objetivo é incentivar a conservação e preservação ambiental. Nesse contexto, o Estado do Paraná torna-se precursor na criação e implementação do ICMS Ecológico, instrumento econômico que possui como principais funções: a função compensatória e a função incentivadora. Nesse sentido, embasado nas Constituições Federal e Estadual, no estudo realizado sobre o ICMS de Sergipe e através da função incentivadora, o presente trabalho tem como objetivo principal propor o ICMS Ecológico como uma política de gestão ambiental que possa vir a ser implantado e implementado na região do Semi-Árido. Dessa forma, buscou-se identificar grupos de municípios que apresentem similitude, e ainda estabelecer funções de tendência ao longo dos anos da disponibilidade de recursos através da cota-parte do ICMS.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3610.pdf: 381494 bytes, checksum: 801cdcfd0eb82f33c299301532707d13 (MD5) Previous issue date: 2011-03-04 / Financiadora de Estudos e Projetos / Assuming that traditional measures of diversity are rough predictors of functioning and that measures that incoporate information about functional traits are better predictors than the traditional ones, functional diversity measures are intensely used nowadays. However, whether the inclusion of functional traits in biodiversity estimation indeed increases our predictive power is rarely tested. Moreover, dendrogram-based functional diversity measures usually do not take abundance into account. By sampling a southern cerrado site in Brazil, we tested whether, when compared to traditional diversity measures, the inclusion of functional traits leads to an increased predictive power in relating functional diversity to community functioning. We demonstrated that it is possible to include abundance in dendrogram-based functional diversity, and tested whether, when compared to functional diversity as usually calculated, the inclusion of abundance leads to an increased predictive power. No diversity measure was related to community functioning, including functional diversity. Nevertheless, we showed that it is possible to include abundance in dendrogram16 based functional diversity measures, even if most indices were correlated with each other. / Assumindo que medidas de diversidade tradicionais são estimativas grosseiras do funcionamento de comunidades e que medidas que incorporam informações dos traços funcionais são melhores do que as tradicionais, medidas de diversidade funcional são bastante utilizadas atualmente. Contudo, raramente é testado se, de fato, a inclusão dos traços funcionais em estimativas de biodiversidade aumenta nosso poder preditivo. Além disso, medidas de diversidade funcional baseadas em dendrogramas geralmente não consideram a abundância. Em uma área de cerrado no sudeste brasileiro, testamos se a inclusão dos traços funcionais leva a um aumento no poder preditivo ao relacionar a diversidade funcional ao funcionamento da comunidade quando comparada a medidas de diversidade tradicionais. Demonstramos que é possível incluir a abundância em medidas de diversidade funcional baseadas em dendrogramas e testamos se a inclusão da abundância eleva o poder preditivo da diversidade funcional em comparação à comumente calculada. Nenhuma medida de diversidade relacionou-se ao funcionamento da comunidade, inclusive a diversidade funcional. Porém, mostramos que é possível incluir a abundância em medidas de diversidade funcional baseadas em dendrogramas, apesar da maioria dos índices estar correlacionada.

Made available in DSpace on 2016-01-26T18:56:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ANA CLAUDIA AMBIEL_Dissertacao Agro.pdf: 1588101 bytes, checksum: 47a54fc705f03fc7d27cd4e4abfdb183 (MD5) Previous issue date: 2007-07-18 / The aim of this work was the determination of intra and intergenetic similarity between three Brachiaria species among germplasm accesses and commercial materials throughout RAPD markers. Seeds were used as DNA source. 10 decamers primers were selected between 120 primers assayed and 107 polymorphic bands were used to perform the molecular variance analysis (AMOVA), Jaccard similarity and species fixation index. 24.4% of the total variability was contained between species and 75.6% inside the species, with a species fixation index (FST) of 0.24. The tree showed that two major branches were formed, one with the three outgroup species and other with the species, this one split in three minor branches one with all B. ruziziensis samples; other with all B. decumbens accessions and three of B. brizantha and the last with two B. brizantha accesses, all commercial cultivars and B. decumbens cv. Basilisk . It was possible to group, throughout RAPD, Brachiaria accesses and cultivars. The genetic variability index between species was considered low and somehow low when faced with autogamous species. B.brizantha showed the highest genetic variability and the lowest FST what means that there is a higher genetic flux intra specific than the others. / O propósito deste trabalho foi determinar a similaridade genética de entre acessos de germoplasma e cultivares comerciais três espécies de Brachiaria (inter e intraespecífica), através de marcadores RAPD. Sementes foram utilizadas como fonte de DNA. 10 primers decâmeros foram selecionados de 120 primers avaliados, produzindo 107 bandas polimórficas, as quais foram utilizados para a análise de variância molecular (AMOVA), o coeficiente de similaridade de Jaccard e índices de fixação gênica. 24,40% da variabilidade genética total está contida entre as espécies e 75,60% dentro destas, com índice de fixação gênica (FST) 0,24. No dendrograma houve a formação de dois ramos, um formado por P. maximum e B. arrecta e o outro subdividido em três: todas amostras de B. ruziziensis; todos os acessos de B. decumbens e três acessos de B. brizantha e o último com dois acessos de B. brizantha mais as B. brizantha comerciais e a B. decumbens cv Basilisk . Foi possível agrupar os acessos e cultivares de Brachiaria através de RAPD. O índice de variabilidade genética entre espécies foi considerado baixo, sendo inferior a valores determinados em algumas espécies autógamas. B. brizantha apresenta maior variabilidade genética e menor FST indicando maior fluxo gênico intra-específico do que as outras.

Made available in DSpace on 2016-07-18T17:51:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ANA CLAUDIA AMBIEL_Dissertacao Agro.pdf: 1588101 bytes, checksum: 47a54fc705f03fc7d27cd4e4abfdb183 (MD5) Previous issue date: 2007-07-18 / The aim of this work was the determination of intra and intergenetic similarity between three Brachiaria species among germplasm accesses and commercial materials throughout RAPD markers. Seeds were used as DNA source. 10 decamers primers were selected between 120 primers assayed and 107 polymorphic bands were used to perform the molecular variance analysis (AMOVA), Jaccard similarity and species fixation index. 24.4% of the total variability was contained between species and 75.6% inside the species, with a species fixation index (FST) of 0.24. The tree showed that two major branches were formed, one with the three outgroup species and other with the species, this one split in three minor branches one with all B. ruziziensis samples; other with all B. decumbens accessions and three of B. brizantha and the last with two B. brizantha accesses, all commercial cultivars and B. decumbens cv. Basilisk . It was possible to group, throughout RAPD, Brachiaria accesses and cultivars. The genetic variability index between species was considered low and somehow low when faced with autogamous species. B.brizantha showed the highest genetic variability and the lowest FST what means that there is a higher genetic flux intra specific than the others. / O propósito deste trabalho foi determinar a similaridade genética de entre acessos de germoplasma e cultivares comerciais três espécies de Brachiaria (inter e intraespecífica), através de marcadores RAPD. Sementes foram utilizadas como fonte de DNA. 10 primers decâmeros foram selecionados de 120 primers avaliados, produzindo 107 bandas polimórficas, as quais foram utilizados para a análise de variância molecular (AMOVA), o coeficiente de similaridade de Jaccard e índices de fixação gênica. 24,40% da variabilidade genética total está contida entre as espécies e 75,60% dentro destas, com índice de fixação gênica (FST) 0,24. No dendrograma houve a formação de dois ramos, um formado por P. maximum e B. arrecta e o outro subdividido em três: todas amostras de B. ruziziensis; todos os acessos de B. decumbens e três acessos de B. brizantha e o último com dois acessos de B. brizantha mais as B. brizantha comerciais e a B. decumbens cv Basilisk . Foi possível agrupar os acessos e cultivares de Brachiaria através de RAPD. O índice de variabilidade genética entre espécies foi considerado baixo, sendo inferior a valores determinados em algumas espécies autógamas. B. brizantha apresenta maior variabilidade genética e menor FST indicando maior fluxo gênico intra-específico do que as outras.