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Previous issue date: 2016-04-26 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The common bean (Phaseolus vulgaris) is grown in Brazil in various locations, soil and climatic
conditions. The diseases are among the leading causes of losses in productivity of this
legume, and the common bacterial blight (CBB) is the most important bacterioses that affects
the culture. The resistance of CBB in common bean is a complex quantitative trait that results
from the interaction of several genes. Genetic maps are tools that optimize the search for loci
associated with this type of feature, and the most commonly used molecular markers
available for this type of study are the SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). In this sense,
this study aimed to: (i) develop a robust genetic map for common bean using SNP markers
and the RIL (Recombinant Inbreed Lines) mapping population derived from Ruda × AND 277;
(ii) characterize this RIL population and their parents about the reaction to common bacterial
blight in field and greenhouse; and (iii) identifying genomic regions (major genes and/or QTL)
that control the bacterial blight in this population. We used 393 individuals of the Ruda × AND
277 RIL population, evaluated for reaction to CBB in two field trials in Ponta Grossa - PR, in
the rain growing season of 2012 and 2014 and in an inoculation test at the greenhouse, in
Santo Antônio de Goiás - GO. The population was genotyped with 5,398 SNP markers and
mapping was performed using the R-OneMap and MapDisto programs. Statistical analyzes
were performed in the Genes program, and the Scott-Knott method was used for averages
groupingin R platform. The QTL analysis was conducted in QTLCartographer program. Using
the chi-square test (1:1), 2,062 markers were selected for mapping. Three genetic maps with
high strengt, saturation and resolution were built. Statistical analysis showed that there is
genetic variability for the CBB resistance in the population of RILs. The QTL analysis identified
10 QTLs linked to resistance of CBB in the Ruda × AND 277 RIL mapping population, in the
chromosomes PV01, PV02, Pv07, Pv09 and PV11, based on results from evaluations carried
out in the field and greenhouse. The maps constructed for this population have high strength
and resolution and may be used for future work on integrative mapping. The statistical
analysis evidenced the quantitative character of resistance to CBB in common bean and
showed that the parent Rudá has the CBB resistance alleles. It is expected that the markers
linked to these QTLs identified can be used in future studies of marker assisted selection. / O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris) é cultivado no Brasil em vários locais e diversas
condições edafoclimáticas. As doenças estão entre as principais causas de prejuízos na
produtividade dessa leguminosa, sendo o crestamento bacteriano comum (CBC) a principal
bacteriose que afeta essa cultura. A resistência ao CBC no feijoeiro-comum é uma
característica complexa, quantitativa, que resulta da interação de vários genes. Os mapas
Genéticos são ferramentas que otimizam a busca de locos associados a esse tipo de
característica, e os marcadores moleculares mais utilizados disponíveis para esse tipo de
estudo são os SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). Neste sentido, o presente trabalho
teve como objetivos: (i) construir um mapa genético robusto para o feijoeiro-comum,
utilizando marcadores SNP e a população de RILs (Recombinant Inbred Lines, ou linhagens
endogâmicas recombinantes) derivada do cruzamento Rudá × AND 277; (ii) caracterizar esta
população de RILs e seus genitores quanto à reação ao crestamento bacteriano comum, em
campo e em casa de vegetação; e (iii) identificar regiões genômicas (genes de efeito principal
e/ou QTLs) que controlam a reação ao crestamento bacteriano comum nesta população.
Foram utilizados 393 indivíduos da população de RILs Rudá × AND 277, avaliados quanto à
reação ao CBC em dois ensaios de campo em Ponta Grossa – PR, nas águas de 2012 e 2014,
e em um ensaio de inoculação em casa de vegetação, em Santo Antônio de Goiás - GO. A
população foi genotipada com 5.398 marcadores SNP e o mapeamento das RILs foi realizado
utilizando os programas R-OneMap e MapDisto. As análises estatísticas foram realizadas no
programa Genes, sendo o agrupamento de médias de Scott-knott realizado na plataforma R.
A análise de QTL foi realizada no programa QTLCartographer. Por meio do teste de quiquadrado
(1:1) foram selecionados 2.062 marcadores para o mapeamento. Foram construídos
três mapas genéticos com elevada robustez, saturação e resolução. As análises estatísticas
evidenciaram que há variabilidade genética para a característica de resistência ao CBC na
população de RILs. A análise de QTL identificou 10 QTLs ligados à resistência ao CBC na
população de RILs Rudá × AND 277 nos cromossomos Pv01, Pv02, Pv07, Pv09 e PV11 com
base em dados obtidos a partir de avaliações em campo e casa de vegetação. Os mapas
construídos para essa população apresentam elevada robustez e resolução e poderão ser
utilizados para futuros trabalhos de mapeamento integrativo. As análises estatísticas
evidenciaram o caráter quantitativo da resistência ao CBC em feijoeiro-comum e mostraram
que o genitor Rudá possui alelos de resistência ao CBC. Espera-se que os marcadores ligados
a esses QTLs identificados possam ser utilizados em futuros trabalhos de seleção assistida por
marcadores.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/7319 |
| Date | 26 April 2016 |
| Creators | Passos, Ana Laura Pereira |
| Contributors | Souza, Thiago Lívio Pessoa Oliveira de, Melo, Patrícia Guimarães Santos, Souza, Thiago Lívio Pessoa Oliveira de, Vianello, Rosana Pereira, Sousa, Lorenna Lopes de, Melo, Patrícia Guimarães Santos |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EAEA), UFG, Brasil, Escola de Agronomia e Engenharia de Alimentos - EAEA (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -3325099404361873119, 600, 600, 600, 600, 4500684695727928426, -3091138714907603907, -961409807440757778 |
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