Made available in DSpace on 2016-08-29T15:36:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_7176_Rafael Fonseca Zanotti.pdf: 3157606 bytes, checksum: dfee1d183b6d161da963b1a9f35e3303 (MD5) Previous issue date: 2015-08-28 / O feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) é uma cultura agrícola muito importante economicamente e nutricionalmente para a população brasileira e necessita de metodologias simples e eficazes que auxiliem o processo de melhoramento genético. As técnicas empregadas devem minimizar os efeitos indesejáveis da multicolinearidade entre as características estudadas durante o processo de seleção. A produção de sementes de feijão, normalmente, é limitada pela escassez hídrica e solos salinos. No entanto, devido a grande variabilidade genética, característica da espécie, é possível encontrar materiais genéticos mais tolerantes a esses estresses osmóticos. A germinação e o desenvolvimento inicial da plântula são fases críticas e desta maneira é importante selecionar os matérias genéticos mais tolerantes nestas fases. Além de selecionar genótipos tolerantes é necessário selecionar materiais genéticos que sejam ricos nutricionalmente, principalmente, em relação à composição mineralógica. Os principais objetivos almejados com este trabalho foram reduzir a multicolinearidade e selecionar genótipos para a tolerância ao estresse osmótico e a biofortificação dos grãos do feijoeiro, com base nos valores genéticos. Desta maneira, foram utilizadas duas técnicas para reduzir a influência da multicolinearidade: o descarte de variáveis redundantes pelas variáveis canônicas, e o uso das análises de fatores para reduzir o número de variáveis. As variáveis analisadas foram: porcentagem de germinação e de plântulas normais, tempo médio de germinação, índice de velocidade de germinação, comprimentos de raiz e de hipocótilo, massas seca de raiz e da parte aérea, razão raiz/parte aérea e o produto da porcentagem de plântulas normais pelo comprimento das plântulas. Avaliou-se também a composição mineralógica dos grãos em relação à concentração de cálcio, ferro, zinco, potássio, magnésio, manganês e fósforo. Adicionalmente, para estimar os parâmetros e os valores genéticos realizou-se análise via modelos mistos, utilizando-se a técnica de REML/BLUP. Os genótipos foram selecionados com base da média genética, estabilidade e adaptabilidade, utilizando-se a técnica da média harmônica da performance relativa dos valores genéticos. Os genótipos que apresentaram as maiores tolerâncias, adaptabilidade e estabilidade quanto aos estresses osmóticos foram: CNFC 15466, CNFC 15462, CNFC 15630, BRS Valente, Capixaba Precoce, CNFP 15290, CNFP 15292 e CNFP 15302. Enquanto os genótipos mais ricos e divergentes geneticamente do grupo comercial carioca foram: CNFC 15475 e CNFC 15625, e do grupo comercial preto foram: CNFP 15310 e CNFP 15304. Conclui-se que a utilização de técnicas multivariadas facilita a seleção de genótipos promissores como parentais na formação de linhagens tolerantes ao estresse osmótico e biofortificados. Palavras-chave: feijoeiro comum; seleção de genótipos; estresse hídrico e salino; multicolinearidade; composição mineral.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-12-20T18:58:02Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leniany Patrícia Moreira - 2015.pdf: 1645373 bytes, checksum: 6b0d185814dfdfc0f4ba2612f6b87c40 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-12-26T14:13:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leniany Patrícia Moreira - 2015.pdf: 1645373 bytes, checksum: 6b0d185814dfdfc0f4ba2612f6b87c40 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-26T14:13:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Leniany Patrícia Moreira - 2015.pdf: 1645373 bytes, checksum: 6b0d185814dfdfc0f4ba2612f6b87c40 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-02-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is a leguminous plant of great importance for the Brazilian population, especially for the poorer population by representing the main source of protein. Common bean can establish symbiosis with nitrogen-fixing bacteria to obtain N from the atmosphere through Biological Nitrogen Fixation (BNF) process. This work aimed to evaluate the agronomic efficiency of rhizobia isolates under field conditions in two sites: Guapó and Santo Antônio de Goiás, by comparison of their results with the commercial strains SEMIA 4077, 4080 and SEMIA SEMIA 4088 of Rhizobium tropici. We evaluated the number of nodules (NN), nodules dry weight (NDW), root dry weight (RDW), shoot dry weight (SDW), stand (S), leaf area (LA), number of pods (NP), number of grains (NG), 100 grains dry weight (100GDW), grain yield (GY) and levels of macro and micronutrients in the shoots of common bean plants. The results revealed significant differences for NN, SDW, NP, NG and GY among the treatments evaluated in Guapó. In the experiment carried out in Santo Antônio de Goiás significant differences were observed among treatments for NDW, RDW, LA, SDW, NP, NG and GY. The content of micro and micronutrients varied significantly among all of the isolates while in Santo Antônio de Goiás no significant differences were found for Fe and Mn. About 70% of the isolates evaluated in Guapó showed relative efficiency of grain yield similar to the strains SEMIA 4077, SEMIA 4080 and SEMIA 4088. In Santo Antônio de Goiás all of the evaluated isolates showed the same efficiency of those strains. The inoculation with the isolates contributed on a significant way for the grain yield increasing with results similar to the N treatment and commercial strains. These results indicate that is possible to find isolates more efficient than the commercial strains on the BNF process. / O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L) é uma leguminosa de grande importância para a população brasileira, principalmente as mais carentes por representar a principal fonte de proteínas. O feijoeiro tem capacidade de se beneficiar da Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), através da simbiose com bactérias fixadoras pertencentes ao grupo dos rizóbios. No presente trabalho avaliou-se a eficiência agronômica de isolados de rizóbio em condição de campo, comparados às três estirpes comerciais de Rhizobium tropici SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088. Foi avaliado o número de nódulos (NN), massa seca de nódulos (MSN), massa seca de raiz (MSR), massa seca da parte aérea (MSPA), estande (E), área foliar (AF), número de vagens (NV), número de grãos (NG), massa seca de 100 grãos (MS100G), produção de grãos (PG) e teores para macro e micronutrientes na parte aérea de plantas de feijoeiro-comum. Os resultados revelaram que houve diferenças significativas para os tratamentos testados em Guapó para os parâmetros de NN, MSPA, NV, NG e PG. Em Santo Antônio de Goiás houve diferenças significativas para MSN, MSR, AF, MSPA, NV, NG e PG. Foi verificado, na avaliação de macro e micronutrientes no experimento em Guapó, diferenças significativas para todos os nutrientes avaliados. Em Santo Antônio de Goiás não foram verificadas diferenças significativas apenas para Fe e Mn. Cerca de 70% dos isolados testados em Guapó apresentaram eficiência relativa de produção de grãos iguais às estirpes SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088, enquanto em Santo Antônio de Goiás todos os isolados apresentaram a mesma eficiência verificada para as estirpes padrão. A inoculação com isolados de rizóbio contribuiu de forma significativa para o aumento de rendimento de grãos no feijoeiro-comum, com resultados semelhantes ao tratamento TN e às estirpes SEMIA 4077, SEMIA 4080 e SEMIA 4088, sendo um indicativo de que é possível encontrar isolados mais eficientes no processo da FBN que as estirpes comerciais utilizadas atualmente.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:21:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Paula Simplício Mota - 2015.pdf: 2622408 bytes, checksum: 964fc3216d1a8c8e5e27bc1ef2a5d5be (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:21:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Paula Simplício Mota - 2015.pdf: 2622408 bytes, checksum: 964fc3216d1a8c8e5e27bc1ef2a5d5be (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T13:21:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Paula Simplício Mota - 2015.pdf: 2622408 bytes, checksum: 964fc3216d1a8c8e5e27bc1ef2a5d5be (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-10-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of this study was to validate molecular markers specifically associated with alleles of the Co-4 gene that controls the reaction to anthracnose of common bean, in particular the Co- 42 allele, and foment the integration of these markers in breeding programs aimed at developing resistant cultivars. For this, we evaluated 261 individuals F2 and 197 F2:3 progenies coming from crosses between SEL 1308 (carrier of Co-42 allele) and BRS Cometa. The studies confirm that the inheritance of reaction to anthracnose in SEL1308, using race 73 of Colletotrichum lindemuthianum, it is conditioned by an allele with complete dominance. In all, 15 markers were analyzed, ten STS (Sequence-Tagged Sites) and two SSR (Simple Sequence Repeat), recently identified by the Embrapa research group, and three SCAR (Sequence Characterized Amplified Regions) previously reported in the literature. Of these, 13 were polymorphic between the parents and segregated in the expected proportions to generations analyzed (3:1 or 1:2:1). Among the markers linked in repulsion phase, six STS (P8283-V1, P8284 -V1, P8285-V2, P8286-V1, P8286-V2 and P8286-V3) co-segregated at a distance of 2,64 cM from the allele Co-42 and 0,0 cM apart. As regards the SCAR markers, it was found that all are linked in coupling phase of the Co-42 allele at distances ranging from 2,93 cM (SAS13) at 6,42 cM (SH18). Of codominant markers, the STS P8286-V6 was mapped closest to Co-42 allele at a distance of 2,58 cM. Thus, the STS tested are excellent tools markers for assisted selection of genotypes resistant to anthracnose, since that present the highest selection efficiency estimates (84 - 99%) and the detection of plants carriers of different alleles of the Co-4 gene. However, only the SCAR SH18 possible the specific breakdown of Co- 42 allele, despite having less selection efficiency (85%) compared to the other analyzed markers. Therefore, it is recommend the combined or sequential use of P8286-V6 and SH18 markers for Co-42 selection at the expense of other alleles of the Co-4 gene. As for the selection of resistant genotypes in populations in which only the Co-42 allele is present, it is suggested to use only the P8286-V6 marker, which stands out for being codominant and strongly associated with the resistance allele. From a practical standpoint, the molecular markers validated in this study have shown great potential for use in the development of common bean cultivars resistant to anthracnose, being affordable to laboratories with different levels of infrastructure and highly efficient in monitoring genotypes carriers of resistance alleles of the loco Co-4. / O objetivo desse estudo foi validar marcadores moleculares especificamente associados aos alelos do gene Co-4 que controla a reação à antracnose do feijoeiro-comum, em particular ao alelo Co-42, e fomentar a integração destes marcadores a programas de melhoramento visando ao desenvolvimento de cultivares resistentes. Para isso, foram avaliados 261 indivíduos F2 e 197 progênies F2:3, provenientes de cruzamentos entre SEL 1308 (portadora do alelo Co-42) e BRS Cometa. Os estudos confirmaram que a herança da reação à antracnose em SEL 1308, usando a raça 73 de Colletotrichum lindemuthianum, é condicionada por um alelo com dominância completa. Ao todo, foram analisados 15 marcadores, sendo dez Sequence-Tagged Sites (Sítios Marcados por Sequências) e duas Simple Sequence Repeat (Sequências simples repetidas), identificadas recentemente pelo grupo de pesquisa da Embrapa, e três Sequence Characterized Amplified Regions (Regiões Amplificadas Caracterizadas por Sequências) previamente relatados na literatura. Destes, 13 foram polimórficos entre os genitores e segregaram nas proporções esperadas para as gerações analisadas (3:1 ou 1:2:1). Dentre os marcadores ligados em fase de repulsão, seis STS (P8283-V1, P8284-V1, P8285-V2, P8286-V1, P8286-V2 e P8286-V3) co-segregaram a uma distância de 2,64 cM do alelo Co-42 e a 0,0 cM entre si. No que se refere aos marcadores SCAR, constatou-se que todos estão ligados em fase de acoplamento ao alelo Co-42, a distâncias que variaram de 2,93 cM (SAS13) a 6,42 cM (SH18). Dos marcadores codominantes, o STS P8286-V6 foi mapeado como mais próximo do alelo Co-42, a uma distância de 2,58 cM. Dessa forma, os marcadores STS testados constituem excelentes ferramentas para a seleção assistida de genótipos resistentes à antracnose, visto que apresentaram as maiores estimativas de eficiência de seleção (84 a 99%) e a detecção de plantas portadoras dos diferentes alelos do gene Co-4. Contudo, somente o SCAR SH18 possibilitou a discriminação específica do alelo Co-42, apesar de apresentar menor eficiência de seleção (85%) em comparação aos demais marcadores analisados. Diante disso, recomenda-se a utilização combinada ou sequencial dos marcadores P8286-V6 e SH18 para seleção do Co-42 em detrimento dos demais alelos do gene Co-4. Já para a seleção de genótipos resistentes em populações nas quais somente o alelo Co-42 está presente, sugerese a utilização apenas do marcador P8286-V6, que se destaca por ser codominante e fortemente associado ao alelo de resistência. Do ponto de vista prático, os marcadores moleculares validados neste estudo demonstraram grande potencial para utilização no desenvolvimento de cultivares feijoeiro-comum resistentes à antracnose, por serem acessíveis a laboratórios com diferentes níveis de infraestrutura e altamente eficientes no monitoramento de genótipos portadores de alelos de resistência para o loco Co-4.

Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-08-29T20:03:12Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) AGENORCORREA.pdf: 4200877 bytes, checksum: 9bbd91a7ee4fb6d49631c8ad58345c05 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-29T20:03:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) AGENORCORREA.pdf: 4200877 bytes, checksum: 9bbd91a7ee4fb6d49631c8ad58345c05 (MD5) Previous issue date: 2008-02-22 / In this work were studied two main aspects of the common bean breeding: a) - Genotype by environment interaction (Chapter 1) and; b) – Genetic divergence (Chapter 2). The trials were carried out at the experimental Campus at the Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul, in Aquidauana and at the Universidade Federal da Grande Dourados, in Dourados-MS, in the period from 2000/2001 to 2005/2006, in the “dry” and “rain” harvest, composing a total of 12 environments, where each environment was characterized by the combination of local x year x crop season. There were thirteen genotypes of common bean assessed in randonized blocks, with three replications per treatment, where each genotype became a treatment. In the study of the genotype by environment interaction the parameters of adaptability and stability of the genotypes were estimated by traditional and multivariate analysis methods, in each trial experimental environment, searching to compare results and efficiency of these methodologies in discrimination of genotypes face to variation of the environment. The pattern analysis was used to identify and group genotypes with similar responses in all environments as well as environments that discriminate similarly the genotypes. The study allowed discriminate genotypes whit high performance, broad adaptation and good predictability of response that may be recommended to favorable and unfavorable environment, in general, and genotypes of less predictability behaviour, whith specific adaptation to certain environments. Multivariate analysis techniques were also used in the study of genetic divergence aiming the formation of genotypes groups based on the genetic distance among them. The study of genetic divergence identified dissimilar groups of genotypes that based on agronomic characters of interest, may be employed in hybridizations, in breeding programs, that are designated to acquisition of hybrids with heterosis, which in combination, can generate populations of broad genetic base. / Neste trabalho foram estudados dois aspectos fundamentais do melhoramento genético do feijoeiro: a) Interação genótipos por ambientes (Capítulo 1) e b) Divergência genética (Capítulo 2). Os ensaios foram desenvolvidos nas áreas experimentais da Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul, Unidade Universitária de Aquidauana, e da Universidade Federal da Grande Dourados, em Dourados, durante os anos agrícolas 2000/2001 a 2005/2006, nas épocas de cultivo “da seca” e “das águas”, perfazendo um total de 12 ambientes sendo cada ambiente caracterizado pela combinação de local x época de cultivo x ano agrícola. Foram avaliados 13 genótipos de feijoeiro comum no delineamento experimental de blocos ao acaso, com três repetições para cada tratamento, constituindo-se cada genótipo num tratamento. No estudo da interação genótipos por ambientes os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade dos genótipos foram estimados por técnicas tradicionais e técnica de análise multivariada, em cada um dos ambientes experimentais, procurando-se comparar resultados e eficiência dessas metodologias na discriminação de genótipos face às variações de ambientes. A análise de padrões foi empregada para identificar e agrupar genótipos com respostas similares em todos os ambientes e ambientes que discriminam de forma semelhante os genótipos. O estudo permitiu discriminar genótipos com bom desempenho, ampla adaptação e previsibilidade de comportamento que poderão ser recomendados, de forma generalizada, para os locais e épocas de cultivos avaliados e, genótipos de comportamento menos previsível, com adaptação específica para certas condições de cultivo. Técnicas de análise multivariada foram também empregadas no estudo da divergência genética objetivando a formação de grupos de genótipos com base na distância genética entre eles. Este estudo permitiu identificar grupos dissimilares de genótipos que, em função dos caracteres de interesse agronômico, poderão ser empregados em hibridações em programas de melhoramento que visem obter híbridos com maior efeito heterótico, que, em combinações, possam gerar populações de base genética ampla.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-27T17:21:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 301848 bytes, checksum: 965b4a5e98b835e25f72696745c97da7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-27T17:21:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 301848 bytes, checksum: 965b4a5e98b835e25f72696745c97da7 (MD5) Previous issue date: 2004-04-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O presente trabalho objetivou investigar o potencial de uso do controle biológico no patossistema F. oxysporum f. sp. phaseoli e feijão a partir das seguintes etapas: 1-Selecionar um isolado de F. oxysporum não-patogênico (FO), um isolado de Trichoderma sp. (TR) e outro de Pseudomonas fluorescentes (PF) mais competentes e com alta competitividade rizosférica. 2-Estudar o efeito do tratamento de sementes de feijão com isolados selecionados de Pseudomonas fluorescentes, no desenvolvimento da murcha-vascular. 3-Estudar a relação entre a densidade de inóculo de F. oxysporum f. sp. phaseoli e de F. oxysporum não- patogênicos adicionada no solo para supressão da forma patogênica. 4-Estudar, em solo infestado com F. oxysporum f. sp. phaseoli, o efeito combinado de sementes de feijão tratadas com a bactéria e plantadas em solo infestado com F. oxysporum não-patogênico em casa de vegetação, no desenvolvimento da murcha-vascular. 5-Estudar, em solo infestado com F. oxysporum f. sp. phaseoli, o efeito combinado de sementes de feijão tratadas ou não-tratadas com a bactéria e plantadas em solo infestado com F. oxysporum não-patogênico ou Trichoderma sp. e o efeito de cada potencial antagonista sozinho, no campo, no desenvolvimento da murcha-vascular. Foram testados três isolados de FO, 11 de TR e 150 de PF, obtidos da rizosfera (80), rizoplano (30) e internamente as raízes (40). Nos testes de antibiose “in vitro” foram selecionados 22 isolados de PF e nos testes posteriores de competência e competitividade selecionou-se o isolado PF22 (Pseudomonas putida). Testando-se a competência e competitividade de FO e TR foram selecionados os isolados TR11 de Trichoderma (T harzianum) e FO3 de Fusarium não patogênico. Observou-se que não teve diferença entre as concentrações de FO para um mesmo isolado, no entanto, foi observada diferença entre os isolados e destes com o controle. O isolado FO3 teve uma maior área abaixo da curva de decréscimo da clorofila (AACDCL) para as clorofilas A, B e total (5,38, 1,71 e 7,10, respectivamente), menor severidade da doença (2,37) e maior produção de grãos (6,65g) em relação ao FOPm sozinho, com AACDCL de 2,41, 0,87 e 3,25, respectivamente, severidade 4,25 e produção de grãos de 2,23g. O isolado PF22 sozinho não reduziu a severidade da doença. Quando FO3 e PF22 foram usados em conjunto obteve-se uma maior AACDCL paras as clorofilas A, B e total (4,52, 1,05 e 5,57, respectivamente), maior produção de grãos (12,59g) e redução da severidade da doença (2,50) enquanto que FOPm sozinho teve AACDCL de 0,92, 0,23 e 1,16, respectivamente, severidade de 4,30 e produção de 5,71g de grãos. No campo, os isolados TR11 e FO3 sozinhos ou em conjunto com PF22, não diferiram entre si quanto a AACDCL, mas diferiram do FOPm sozinho. Quanto à produção, observou-se que a associação dos microrganismos FO3 + PF22 e TR11 + PF22 não diferiram entre si, com uma produção de 15 e 14 vagens e 14,7 e 13,1 g de grãos, respectivamente. A produção do tratamento apenas com FOPm foi de 8,3 vagens e 4,5 g de grãos. Esses valores mostram um aumento de aproximadamente 200% na produção de grãos quando utilizados os microrganismos em conjunto no controle da doença no campo. A ação conjunta dos microrganismos usados neste trabalho mostrou-se uma estratégia de controle biológico promissora para a redução no solo da densidade de inóculo de F. oxysporum f. sp. phaseoli e, com isso, propiciar uma redução da ocorrência e dos danos causados por essa doença. / This study aimed to investigate the potential of the biological control upon the pathosystem F. oxysporum f. sp. phaseoli and bean, by the following procedure: 1) Selecting an isolate of non-pathogenic F. oxysporum (FO), an isolate of Trichoderma sp. (TR) and one of fluorescent Pseudomonas (FP), which should be more competent and have a higher degree of rhizosphere competitiveness; 2) Studying the effect of the seed treatment with those selected fluorescent Pseudomonas isolates upon the development of the vascular wilt; 3) Studying the relationship between the inoculum densities of the non-pathogenic F. oxysporum and pathogenic F. oxysporum f. sp. phaseoli added to the soil in order to suppress the pathogenic form. 4) Studying the combined effect of bean seed treatment with F. oxysporum f. sp. phaseoli and sowing in a non-pathogenic F. oxysporum-infested soil upon the development of the vascular wilt, under greenhouse conditions. 5) Comparing the combined effect of bean seed treatment with F. oxysporum f. sp. phaseoli or no treatment followed by sowing in soil infested by either non-pathogenic F. oxysporum or Trichoderma sp., as well as the effect of each antagonistist alone upon the development of the vascular wilt under field conditions. The following isolates were tested: three from FO, 11 from TR and 150 from PF [which were obtained from the rhizosphere (80), rhizoplane (30) and internally from the roots (40)]. In the in vitro antibiosis test, twenty two PF isolates were selected, whereas in the following tests for competence and competitiveness the isolate PF22 (Pseudomonas putida) was selected. When testing FO and TR for competence and competitiveness, the isolates TR11 from Trichodema (T. harzianum) and FO3 from the non-pathogenic Fusarium were selected. No differences were observed among the FO concentrations for the same isolate, but differences between the isolates as well as between these and the control were significant. The FO3 isolate occupied a higher area below the chlorophyll decreasing curve (AACDCL) for A, B and total chlorophylls (5.38, 1.71 and 7.10, respectively), as well as a lower disease severity (2.37) and higher bean yields (6.65g) in relation to FOPm alone, with the respective values of 2.41, 0,87 and 3,25 for AACDCL, 4.25 severity, and 2.23g for bean yield. The isolate PF22 did not reduce by itself the severity of the disease. When using FO3 and PF22 together, a higher AACDCL was obtained for the chlorophylls A, B and total (4.52, 1.05 and 5.57, respectively), as well as higher bean yields (12.59g) and reduced severity of the disease (2.50), whereas FOPm alone showed an AACDCL of 0.92, 0.23 and 1.16, respectively, 4.30 severity, and bean yield of 5.71g. Under field conditions, both the isolates TR11 and FO3 by themselves or combined with PF did not differ from each other for AACDCL, but from the FOPm alone. In relation to the yield, no differences were found for the combination of the microorganisms FO3 + PF22 and TR11 + PF22, since a total of 15 and 14 pods and 14.7 and 13.1 beans were yielded, respectively. In the treatment with FOPm alone, a total of 8.3 pods and 4.5 beans were yielded. These values show an increase of around 200% in bean yield, when the microorganisms were used in combination to control the disease in the field. In this study, the combined action of the microorganisms showed to be a promising biological control strategy for reducing the density of the F. oxysporum f. sp. phaseoli inoculum in the soil providing a reduction in both occurrence and damages caused by this disease. / Tese importada do Alexandria

A cultura do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) se destaca como fonte protéica e mineral para as populações humanas, principalmente, para populações de baixa renda. Dentre os agentes patogênicos, o fungo Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magnus) Lams. Scrib., causador da antracnose, é considerado o de maior importância devido aos seus efeitos destrutivos para o feijoeiro. Este estudo teve como objetivo avaliar a expressão de genes candidatos a atuarem na defesa da planta durante a interação incompatível do feijoeiro SEL 1308 e raça 73 do C. lindemuthianum, considerando diferentes tecidos (folhas, epicótilo e hipocótilo) e períodos de interação (24, 48, 72 e 96 horas). Além disso, o trabalho visou a validação de bibliotecas de ESTs (Expressed Sequence Tags) de feijoeiro (MELOTTO et al., 2005) e a análise da estabilidade de possíveis genes de referência para as análises de expressão por RT-qPCR. Foram utilizados 20 genes no estudo: 12 possivelmente responsivos ao patógeno e oito candidatos a genes de referência. A eficiência média das curvas de amplificação e valores dos ciclos e de quantificação (Cq) foram definidos no programa LinRegPCR. A estabilidade dos genes de referência foi avaliada nos programas geNorm e NormFinder. A expressão relativa dos genes alvos e normalizadores e as análises estatísticas foram determinadas no programa REST. As combinações de genes de referência Act2/Ukn2 e InsDeg/Act2 foram utilizadas para normalização dos genes-alvo por RT-qPCR. Os dados de expressão relativa dos transcritos entre as bibliotecas de ESTs foram validados pelo RT-qPCR. Os genes-alvo analisados foram todos responsivos ao sistema fitopatogênico avaliado, revelando perfil transcricional específico nos tecidos e período de interação com o patógeno. Os dados permitiram a disponibilização de genes de referência importantes para análise de expressão por RTqPCR em feijoeiro sob estresse biótico; e indícios para melhor entendimento dos processos envolvidos nos mecanismos de defesa do feijoeiro ao patógeno da antracnose / Common bean crop (Phaseolus vulgaris L.) highlight as protein and mineral source to the human population, especially, for low-income populations. Among the pathogens, Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magnus) Lams. - Scrib., which causes anthracnose, is considered the most important due to its destructive effects to common bean. This study aimed to evaluate the expression of candidate genes to act in defense of the plant during the incompatible interaction between common bean SEL 1308 and race 73 of C. lindemuthianum, considering different tissues (leaves, epicotyl and hypocotyl) and periods of interaction (24, 48, 72 and 96 hours). Also, this study attempted the validation of ESTs (Expressed Sequence Tags) libraries of common bean (MELOTTO et al., 2005) and the evaluation of candidate reference genes stability for expression analysis in RT-qPCR. Twenty genes were used: 12 candidate genes responsive to the pathogen and eight candidate reference genes. The average efficiency of amplification curves and the values of quantification cycles (Cq) were defined in LinRegPCR software. The stability of reference genes was evaluated using geNorm and NormFinder softwares. Relative expression of target and normalizer genes and statistical analysis were determined by REST software. The Act2/Ukn2 and InsDeg/Act2 reference genes combinations were used for normalization of target genes by RT-qPCR. The data of relative expression of transcripts between the libraries of ESTs were validated by RT-qPCR. All target genes analyzed were responsive to the pathogenic system evaluated, revealing specific transcriptional profiles in tissues and periods of interaction with the pathogen. The data provided the availability of normalizers important for expression analysis by RTqPCR in beans under biotic stress; and evidences to understand the processes involved in defense mechanisms of common bean against the anthracnose pathogen

A cultura do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) se destaca como fonte protéica e mineral para as populações humanas, principalmente, para populações de baixa renda. Dentre os agentes patogênicos, o fungo Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magnus) Lams. Scrib., causador da antracnose, é considerado o de maior importância devido aos seus efeitos destrutivos para o feijoeiro. Este estudo teve como objetivo avaliar a expressão de genes candidatos a atuarem na defesa da planta durante a interação incompatível do feijoeiro SEL 1308 e raça 73 do C. lindemuthianum, considerando diferentes tecidos (folhas, epicótilo e hipocótilo) e períodos de interação (24, 48, 72 e 96 horas). Além disso, o trabalho visou a validação de bibliotecas de ESTs (Expressed Sequence Tags) de feijoeiro (MELOTTO et al., 2005) e a análise da estabilidade de possíveis genes de referência para as análises de expressão por RT-qPCR. Foram utilizados 20 genes no estudo: 12 possivelmente responsivos ao patógeno e oito candidatos a genes de referência. A eficiência média das curvas de amplificação e valores dos ciclos e de quantificação (Cq) foram definidos no programa LinRegPCR. A estabilidade dos genes de referência foi avaliada nos programas geNorm e NormFinder. A expressão relativa dos genes alvos e normalizadores e as análises estatísticas foram determinadas no programa REST. As combinações de genes de referência Act2/Ukn2 e InsDeg/Act2 foram utilizadas para normalização dos genes-alvo por RT-qPCR. Os dados de expressão relativa dos transcritos entre as bibliotecas de ESTs foram validados pelo RT-qPCR. Os genes-alvo analisados foram todos responsivos ao sistema fitopatogênico avaliado, revelando perfil transcricional específico nos tecidos e período de interação com o patógeno. Os dados permitiram a disponibilização de genes de referência importantes para análise de expressão por RTqPCR em feijoeiro sob estresse biótico; e indícios para melhor entendimento dos processos envolvidos nos mecanismos de defesa do feijoeiro ao patógeno da antracnose / Common bean crop (Phaseolus vulgaris L.) highlight as protein and mineral source to the human population, especially, for low-income populations. Among the pathogens, Colletotrichum lindemuthianum (Sacc. & Magnus) Lams. - Scrib., which causes anthracnose, is considered the most important due to its destructive effects to common bean. This study aimed to evaluate the expression of candidate genes to act in defense of the plant during the incompatible interaction between common bean SEL 1308 and race 73 of C. lindemuthianum, considering different tissues (leaves, epicotyl and hypocotyl) and periods of interaction (24, 48, 72 and 96 hours). Also, this study attempted the validation of ESTs (Expressed Sequence Tags) libraries of common bean (MELOTTO et al., 2005) and the evaluation of candidate reference genes stability for expression analysis in RT-qPCR. Twenty genes were used: 12 candidate genes responsive to the pathogen and eight candidate reference genes. The average efficiency of amplification curves and the values of quantification cycles (Cq) were defined in LinRegPCR software. The stability of reference genes was evaluated using geNorm and NormFinder softwares. Relative expression of target and normalizer genes and statistical analysis were determined by REST software. The Act2/Ukn2 and InsDeg/Act2 reference genes combinations were used for normalization of target genes by RT-qPCR. The data of relative expression of transcripts between the libraries of ESTs were validated by RT-qPCR. All target genes analyzed were responsive to the pathogenic system evaluated, revealing specific transcriptional profiles in tissues and periods of interaction with the pathogen. The data provided the availability of normalizers important for expression analysis by RTqPCR in beans under biotic stress; and evidences to understand the processes involved in defense mechanisms of common bean against the anthracnose pathogen

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:16:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ariane_Castro_Mendes_Leao[1].pdf: 899082 bytes, checksum: 0b19f24baa0e56f0caae9f29a959bb7a (MD5) Previous issue date: 2006-12-15 / The common bean besides being one of the basic meals of brazilian´s population, it is one of the main products that provide protein in the nutritional diet from the society share which is economically less favorable. The identification of molecular markers linked to controlling genes of the protein content in common beans (Phaseolus vulgaris L.) is a very important tool to help breeding programs, raising the efficiency and agility. This way, this work was made with two main goals: a) to map SSR and RAPD markers linked to loci (QTLs) that control protein content in two generations of a segregating population of common beans and b) to compare detection procedures of markers linked to QTLs using the ANOVA method and the process of interval mapping. For that reason, 94 families were taken from the F2 generation and 90 families from the F2:3 generation derived from the cross of genitors CNFC 7812 e CNFC 8056. Results indicated that there is the possibility of identifying molecular markers related to protein content in common beans, utilizing both detection procedures. The ANOVA method identified a greater number of QTLslinked markers than the process of interval mapping in both generations. There was coincidence between the identified loci obtained with the two methods for each generation. Loci that were associated with protein content were different for the F2 and F2:3 generations. However, there was a stable detection of a genomic region of the linkage group 4, indicating a possible role of this region of the common bean genome in the control of seed protein content. The proportion of the trait s phenotypic variation explained by QTLs varied from 5,5% to 9,5%, considering both generation. / O feijão, além de se constituir um dos alimentos básicos da população brasileira, é um dos principais produtos fornecedores de proteína na dieta alimentar dos estratos sociais economicamente menos favorecidos. A identificação de marcadores moleculares ligados a genes controladores de teor de proteína em feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma importante ferramenta para auxiliar os programas de melhoramento, aumentando sua eficiência e agilidade. Desta forma, este trabalho foi realizado com os objetivos: a) mapear marcadores SSR e RAPD ligados aos locos gênicos (QTLs) controladores de teor de proteína em duas gerações de uma população segregante de feijoeiro-comum e b) comparar os processos de detecção dos marcadores ligados aos QTLs utilizando o método de ANOVA e o método de mapeamento por intervalo. Para tanto, foram utilizadas 94 famílias da geração F2 e 90 famílias da geração F2:3 provenientes do cruzamento entre os genitores CNFC 7812 e CNFC 8056. Os resultados mostraram a possibilidade de identificar marcadores moleculares ligados ao teor de proteína em feijoeiro, utilizando ambos os métodos. O método de ANOVA identificou mais marcadores ligados a QTLs do que o processo de mapeamento por intervalo em ambas as gerações. Houve concordância entre os locos identificados pelos dois métodos para cada geração. Os locos que foram associados com o teor de proteína foram distintos para as gerações F2 e F2:3. Entretanto, houve uma detecção estável de uma região genômica do grupo de ligação 4, indicando um possível papel desta região do genoma do feijoeiro no controle do teor de proteína no grão. A proporção da variância fenotípica desta característica explicada pelos QTLs variou de 5,5% a 9,5%, considerando as duas gerações.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:58:20Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Laura Pereira Passos - 2016.pdf: 6140952 bytes, checksum: 715de51ee1d8b3b7ffd295f5d7121216 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:58:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Laura Pereira Passos - 2016.pdf: 6140952 bytes, checksum: 715de51ee1d8b3b7ffd295f5d7121216 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-15T13:58:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Laura Pereira Passos - 2016.pdf: 6140952 bytes, checksum: 715de51ee1d8b3b7ffd295f5d7121216 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-04-26 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The common bean (Phaseolus vulgaris) is grown in Brazil in various locations, soil and climatic conditions. The diseases are among the leading causes of losses in productivity of this legume, and the common bacterial blight (CBB) is the most important bacterioses that affects the culture. The resistance of CBB in common bean is a complex quantitative trait that results from the interaction of several genes. Genetic maps are tools that optimize the search for loci associated with this type of feature, and the most commonly used molecular markers available for this type of study are the SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). In this sense, this study aimed to: (i) develop a robust genetic map for common bean using SNP markers and the RIL (Recombinant Inbreed Lines) mapping population derived from Ruda × AND 277; (ii) characterize this RIL population and their parents about the reaction to common bacterial blight in field and greenhouse; and (iii) identifying genomic regions (major genes and/or QTL) that control the bacterial blight in this population. We used 393 individuals of the Ruda × AND 277 RIL population, evaluated for reaction to CBB in two field trials in Ponta Grossa - PR, in the rain growing season of 2012 and 2014 and in an inoculation test at the greenhouse, in Santo Antônio de Goiás - GO. The population was genotyped with 5,398 SNP markers and mapping was performed using the R-OneMap and MapDisto programs. Statistical analyzes were performed in the Genes program, and the Scott-Knott method was used for averages groupingin R platform. The QTL analysis was conducted in QTLCartographer program. Using the chi-square test (1:1), 2,062 markers were selected for mapping. Three genetic maps with high strengt, saturation and resolution were built. Statistical analysis showed that there is genetic variability for the CBB resistance in the population of RILs. The QTL analysis identified 10 QTLs linked to resistance of CBB in the Ruda × AND 277 RIL mapping population, in the chromosomes PV01, PV02, Pv07, Pv09 and PV11, based on results from evaluations carried out in the field and greenhouse. The maps constructed for this population have high strength and resolution and may be used for future work on integrative mapping. The statistical analysis evidenced the quantitative character of resistance to CBB in common bean and showed that the parent Rudá has the CBB resistance alleles. It is expected that the markers linked to these QTLs identified can be used in future studies of marker assisted selection. / O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris) é cultivado no Brasil em vários locais e diversas condições edafoclimáticas. As doenças estão entre as principais causas de prejuízos na produtividade dessa leguminosa, sendo o crestamento bacteriano comum (CBC) a principal bacteriose que afeta essa cultura. A resistência ao CBC no feijoeiro-comum é uma característica complexa, quantitativa, que resulta da interação de vários genes. Os mapas Genéticos são ferramentas que otimizam a busca de locos associados a esse tipo de característica, e os marcadores moleculares mais utilizados disponíveis para esse tipo de estudo são os SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). Neste sentido, o presente trabalho teve como objetivos: (i) construir um mapa genético robusto para o feijoeiro-comum, utilizando marcadores SNP e a população de RILs (Recombinant Inbred Lines, ou linhagens endogâmicas recombinantes) derivada do cruzamento Rudá × AND 277; (ii) caracterizar esta população de RILs e seus genitores quanto à reação ao crestamento bacteriano comum, em campo e em casa de vegetação; e (iii) identificar regiões genômicas (genes de efeito principal e/ou QTLs) que controlam a reação ao crestamento bacteriano comum nesta população. Foram utilizados 393 indivíduos da população de RILs Rudá × AND 277, avaliados quanto à reação ao CBC em dois ensaios de campo em Ponta Grossa – PR, nas águas de 2012 e 2014, e em um ensaio de inoculação em casa de vegetação, em Santo Antônio de Goiás - GO. A população foi genotipada com 5.398 marcadores SNP e o mapeamento das RILs foi realizado utilizando os programas R-OneMap e MapDisto. As análises estatísticas foram realizadas no programa Genes, sendo o agrupamento de médias de Scott-knott realizado na plataforma R. A análise de QTL foi realizada no programa QTLCartographer. Por meio do teste de quiquadrado (1:1) foram selecionados 2.062 marcadores para o mapeamento. Foram construídos três mapas genéticos com elevada robustez, saturação e resolução. As análises estatísticas evidenciaram que há variabilidade genética para a característica de resistência ao CBC na população de RILs. A análise de QTL identificou 10 QTLs ligados à resistência ao CBC na população de RILs Rudá × AND 277 nos cromossomos Pv01, Pv02, Pv07, Pv09 e PV11 com base em dados obtidos a partir de avaliações em campo e casa de vegetação. Os mapas construídos para essa população apresentam elevada robustez e resolução e poderão ser utilizados para futuros trabalhos de mapeamento integrativo. As análises estatísticas evidenciaram o caráter quantitativo da resistência ao CBC em feijoeiro-comum e mostraram que o genitor Rudá possui alelos de resistência ao CBC. Espera-se que os marcadores ligados a esses QTLs identificados possam ser utilizados em futuros trabalhos de seleção assistida por marcadores.