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Avaliação do rendimento da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) no isolamento de micobactérias em amostras teciduais de bovinos

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Previous issue date: 2012 / A tuberculose bovina é uma doença de caráter granulomatoso e crônica, sendo que no Brasil apresenta alto índice de morbidade nos rebanhos. O objetivo deste estudo foi avaliar o rendimento da reação em cadeia da polimerase (PCR) no isolamento de micobactérias em amostras teciduais congeladas de bovinos. As amostras teciduais foram descongeladas e semeadas em meios de cultura Ogawa-Kudoh contendo piruvato de sódio, e outro contendo glicerol por 42 dias a 37ºC. Foram submetidas à PCR as amostras de tecido e os isolados das culturas, com primers específicos para M. tuberculosis e M. bovis. Foram analisadas 69 amostras teciduais de bovinos, das quais 81,2% constituíram-se de linfonodos. Tomando-se o resultado combinado das culturas como padrão áureo, identificou-se a presença de micobactérias em 17 amostras teciduais (24,6%), 12 delas (70,6%) pertencentes ao Complexo Mycobacterium tuberculosis (Complexo MTB), e 5 (29,4%) identificadas como Micobactérias Não Tuberculosas (MNT). O melhor rendimento diagnóstico foi alcançado pela cultura específica Ogawa-Kudoh com Piruvato e com descontaminação. O rendimento da PCR realizada nas amostras teciduais com o gene alvo hsp65 em comparação com o padrão áureo, foi de 17,6% de sensibilidade (IC95%:-0,005-0,36), especificidade de 98,1% (IC95%:0,94-1,02), valor preditivo positivo de 75% (IC95%:0,33-1,17), valor preditivo negativo de 78,5% (IC95%:0,68-1,19), e acurácia de 78,3%. A razão de verossimilhança positiva foi de 9,18 e a negativa foi de 0,8. A PCR hsp65 realizada diretamente do tecido acometido apresentou alta especificidade e valor preditivo positivo, porém baixa sensibilidade, sendo desejável a otimização desta técnica para que possa ser utilizada na rotina laboratorial. / Brazilian cattle herds have high morbidity rates due to bovine tuberculosis, which is a chronic granulomatous disease. The aim of this study was to evaluate the performance of the polymerase chain reaction (PCR) in the recovery of mycobacteria from frozen tissue samples of cattle. The tissue samples were frozen-thawed and seeded into Ogawa-Kudoh culture media, one containing sodium pyruvate and another containing glycerol for 42 days at 37° C. Tissue samples and culture isolates with primers specific for M. tuberculosis and M. bovis were subjected to PCR. In total, 69 tissue samples of cattle were analyzed, 81.2% of which consisted of lymph nodes. Taking the combined results of cultures as the gold standard, the presence of mycobacteria was identified in 17 (24.6%) tissue samples, of which 12 (70.6%) belonged to the Mycobacterium tuberculosis complex (MTB complex), and 5 (29.4%) were identified as nontuberculous mycobacteria (NTM). The best diagnostic yield was achieved by Ogawa-Kudoh specific culture with Pyruvate and decontamination. The yield of PCR performed on tissue samples with the hsp65 gene as the target compared with the gold standard showed a sensitivity of 17.6% (95% CI: -0.005-0.36), specificity of 98.1% (95% CI: 0.94-1.02), positive predictive value of 75% (95% CI: 0.33-1.17), negative predictive value of 78.5% (95% CI: 0.68-1.19), and accuracy of 78.3%. The positive likelihood ratio was 9.18, and the negative likelihood ratio was 0.8. The hsp65 PCR performed directly on the affected tissue showed high specificity and positive predictive value, but low sensitivity. Optimization of this technique is highly desirable, so it can be used for laboratory routine monitoring.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:riuni.unisul.br:12345/510
Date January 2012
CreatorsMachado, Tairone
ContributorsSilva, Rosemeri Maurici da
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UNISUL, instname:Universidade do Sul de SC, instacron:UNISUL
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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