Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Coorientador: Victor Goyannes Dill Orrico / Banca: Paulo Christiano de Anchietta Garcia / Banca: Délio Pontes Baêta da Costa / Resumo: O gênero Elachistocleis é composto atualmente por 16 espécies além de Elachistocleis ovalis, considerada espécie inquirenda. Diversos autores indicam a necessidade de uma revisão taxonômica do gênero em seus trabalhos, alegando a presença de complexos de espécies ainda a serem descritos e, apesar do avanço da genética como ferramenta taxonômica nas últimas duas décadas, nenhum trabalho desse tipo foi realizado para as espécies do gênero. Nesse estudo foi avaliada a diversidade genética de Elachistocleis cesarii com considerações taxonômicas, além de buscar entender suas relações com as demais espécies do gênero. Uma abordagem integrativa, usando dados moleculares e morfológicos, foi utilizada. Foram encontrados baixos valores de divergência genética dentro da espécie e em comparação com as demais de ventre manchado, assim como uma sobreposição geográfica e de caracteres morfológicos, nos levando a crer que o gênero Elachistocleis contém espécies que devem ser sinonimizadas / Abstract: The genre Elachistocleis is currently composed of 16 species aside from Elachistocleis ovalis, considered species inquirenda. Several authors indicate the necessity of an taxonomic revision in their work, citing the presence of complex of species to be described and, despite the advance of genetic and taxonomic tools in the last two decades, no such work was carried out from this genre. In this study we evaluated the genetic diversity of Elachistocleis cesarii with taxonomic considerations, and seek to understand it relationship with the other species of the genus. An integrative approach, using molecular and morphological data was used. Low genetic diversity values were found within species and compared with other spotted belly, as well as geographical and morphological characters overlap, leading us to believe that the Elachistocleis genus contains species that should be synonymized / Mestre

Orientador: Erick da Cruz Castelli / Banca: Celso Teixeira Mendes-Júnior / Banca: Ramon Kaneno / Resumo: HLA-F é um gene de classe I não clássico do Complexo Principal de Histocompatibilidade humano. Este locus difere-se dos genes clássicos pelo baixo polimorfismo e diferente padrão de expressão. A exata função do gene HLA-F ainda permanece desconhecida. Acredita-se que o HLA-F possua uma função tolerogênica e imunomodulatória. Atualmente, há pouca informação acerca da variabilidade do gene HLA-F e os estudos disponíveis avaliaram apenas pequenos segmentos do gene e/ou buscaram por variantes já conhecidas. Neste estudo apresentamos uma estratégia para a avaliação completa da variabilidade do gene HLA-F, incluindo suas regiões regulatórias, usando sequenciamento de segunda geração (ou nova geração). Esta estratégia foi aplicada para descrever a variabilidade de uma amostra de 196 indivíduos oriundos do estado de São Paulo. Os resultados indicam que o gene HLA-F é muito conservado, considerando-se as diferentes moléculas codificadas, sendo que todas as sequências encontradas codificam apenas 4 moléculas HLA-F distintas. Uma dessas moléculas, associada ao grupo de alelos F*01:01, representa 82,45% das proteínas codificadas pelas sequências de HLA-F encontradas no Brasil. No entanto, a variabilidade nucleotídica e haplotípica encontrada no presente estudo mostrou-se muito superior a já descrita na literatura, embora a maioria das sequências detectadas apresenta mutações sinônimas ou intrônicas. A região 3' não traduzida do gene HLA-F mostrou-se pouco variável, com haplótipos bem definidos associados aos alelos de região codificadora. Esta baixa variabilidade proteica está provavelmente associada ao papel crítico do HLA-F na fisiologia do sistema imunitário / Abstract: HLA-F is a non-classical HLA class I gene and is distinguished from its classical counterparts by low allelic polymorphism and distinctive expression patterns. The exact function of HLA-F remains unknown. It is believed that HLA-F has tolerogenic and immune modulatory features. Currently, there is little information regarding the HLA-F allelic variation among humans and the available studies have evaluated only a fraction of the HLA-F gene segment and/or have searched for known alleles only. Here we present a strategy to evaluate the complete HLA-F variability including its regulatory segments (promoter and 3'UTR) by using massive parallel sequencing (or second generation sequencing) procedures. HLA-F variability was surveyed on 196 individuals from the Southeast of Brazil. The results indicate that the HLA-F gene is indeed conserved at the protein level, in which the three coding haplotypes detected encode for only four different HLA-F molecules, and one of these molecules represent 82.45% of all. However, HLA-F worldwide haplotype variability is much higher than our current knowledge. The 3'UTR presented few variable sites and well-defined haplotypes that are usually associates with the same coding alleles. This protein conservation is probably a consequence of the HLA-F's key role in the immune system physiology / Mestre

Orientador: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Fernanda de Alexandre Sebastião / Banca: Danielly Veloso Blanck / Resumo: Pacu (Piaractus mesopotamicus) é uma espécie de peixe Neotropical amplamente distribuída nas bacias dos rios Paraná e Paraguai, e uma das espécies de peixe neotropicais de maior valor para a aquicultura. Uma melhor compreensão do genoma do pacu é necessária para o manejo genético na conservação dos estoques naturais e cultivados. O principal objetivo foi identificar SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) gene-associados no transcriptoma de fígado do pacu e, em seguida, aplicar em análises de variabilidade genética e de parentesco visando um manejo adequado desta importante espécie não modelo na aquicultura. O sequenciamento do transcriptoma foi realizado por meio da plataforma Roche/454, que resultou na formação de 4.110 contigs não redundantes. Destes, 2.051 genes foram identificados e funcionalmente anotados a fim de revelar genes relacionados às características econômicas interessantes para a aquicultura. Foram encontrados 464 SNPs localizados em 5'UTR (10.0%), 3'UTR (17.2%) e em regiões CDS (71,1%), e classificados como sinônimos (70,6%) e não sinônimos (29,4%). Foram genotipados 32 SNPs por meio da técnica Sequenom MassARRAY, dos quais alguns estavam relacionados com sistema imune. A variabilidade genética foi estimada em populações de indivíduos selvagens (Rio Paraná) e de indivíduos cultivados em sete pisciculturas do estado de São Paulo (FF1, FF2, FF3, FF4, FF5, FF6 e FF7). Não foram observadas diferenças significativas entre heterozigosidade observada (Hobs) e esperada (Hexp) para cada população. Análises de diferenciação genética mostraram baixo nível de estruturação genética entre as populações (Fst = 0.064, AMOVA = 93,59% da variação dentro de populações, P<0,05). Análises de parentesco mostraram que a maioria das estações de piscicultura possuíam pelo menos 40% de indivíduos aparentados, com risco de endogamia e necessidade de realização de um programa de acasalamentos... / Abstract: Pacu (Piaractus mesopotamicus) is a Neotropical freshwater fish widely distributed in Parana, Paraguay Basin. Wild populations of pacu are threatened by overfishing and it is one of the fish species of highest commercial value for aquaculture. An understanding of the pacu genome is appropriate to genetic management in the conservation of wild and cultivated stocks. The main objective was identify gene-associated SNPs in liver transcriptome of pacu. We used SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) to perform genetic variability and kinship analysis for suitable management of this important non-model species in aquaculture. Transcriptome sequencing was done with the Roche/454 technology and yielded 4,110 non-redundant contigs. Of these, 2,051 genes were identified and functionally annotated to reveal genes correlated to economical traits in aquaculture. We found 464 SNPs in 5'UTR (10.0%), 3'UTR (17.2%) and CDS (71,1%), classified in synonymous (70,6%) and non-synonymous (29,4%). We genotyped 32 feasible SNPs through Sequenom MassARRAY platform and we obtained some SNPs related to immune system. Genetic diversity was estimated in wild individuals (Parana river) and in seven farm fish populations (FF1, FF2, FF3, FF4, FF5, FF6 and FF7). There were no significant differences between observed heterozygosity (Hobs) and expected (Hexp) for each population; and also between observed heterozygosity, expected heterozygosity and minimum allele frequency (MAF), when the population averages were compared (P <0.05). In addition, genetic differentiation analyzes showed low genetic structure of wild and cultivated populations of pacu (Fst = 0.064; AMOVA = 93.59% of the variation within populations; P<0,05). Kinship analysis showed most hatchery stations had at least 40% of related individuals, at risk of inbreeding and the need to perform a directed mating program. Our results showed unprecedented genomic resources for pacu / Mestre

Orientador: Mauricio Dutra Zanotto / Banca: Tammy Aparecida Manabe Kiihl / Banca: Rogerio Oliveira de Sá / Banca: Liv Soares Severino / Banca: Rogério Pers Soratto / Resumo: Em decorrência da grande demanda mundial por espécies bioenergéticas, a cultura cártamo, surge como uma importante alternativa. No Brasil, porém, esta espécie ainda não é explorada comercialmente, por isso foram introduzidos 926 acessos provenientes dos Estados Unidos. Estes materiais foram avaliados preliminarmente em 2010 na fazenda experimental do Lageado e São Manuel, ambos pertencentes à UNESP - Campus Botucatu-SP. As características avaliadas foram: altura de plantas, número de capítulos por planta e massa de sementes por planta. Na etapa seguinte, os 19 acessos potencialmente mais promissores e uma cultivar comercial foram avaliados entre abril e setembro de 2011 em Botucatu-SP. Na ocasião, foram avaliadas: produtividade de grãos (kg ha-1), massa de mil grãos (g), número de capítulos por planta, número de ramos primários por planta, altura de plantas (m), diâmetro de capítulos (cm), índice de colheita (g g-1), produtividade de matéria seca (kg ha-1 ), teor de óleo (%) e produtividade de óleo (kg ha-1). As médias de cada característica foram agrupadas através do teste Scott-Knott a 5% de probabilidade. As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas baseadas nas esperanças de quadrados médios da análise de variância. Considerando-se todos os caracteres simultaneamente, foi estimada a divergência genética pela distância generalizada de Mahalanobis e os acessos mais similares foram agrupados pelo método de Tocher. A diversidade genética existente entre os acessos estudados e aliada ao grande potencial produtivo sugere boas expectativa para obtenção de genótipos promissores / Abstract: Currently there is a huge demand for bioenergetics species. Safflower is as an important alternative. In Brazil, however, this species is not commercially exploited. Were introduced 926 accesses from the United States. These materials were preliminarily evaluated in 2010 at the experimental farms of the Lageado in Botucatu and São Manuel, both in São Paulo State. Characteristics evaluated were: plant height (m), number of capitulum and seed weight per plant (g) . In the next stage, 19 of the most promising accesses and a commercial cultivar were evaluated between April and September 2011 in Botucatu-SP. The characteristics evaluated were: grain yield (kg ha-1), thousand grain weight (g), Capitulum number , branches number , plant height (m), capitulum diameter, harvest index (gg-1), dry matter yield (kg ha-1), Oil yield (kg ha-1) and oil content (%). Mean were grouped by the test Scott-Knott at 5% probability. Considering all the characters simultaneously, the genetic divergence was estimated by the Mahalanobis distance and the accesses more similar, were grouped with the Tocher method. The genetic diversity among accesses in all characteristics associated with the yield potential suggests a high potential to obtain promising genotype / Doutor

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:02:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000413258-Texto+Completo-0.pdf: 7765401 bytes, checksum: f707e0d9b6cbc13bfb25ed8fdd4d3638 (MD5) Previous issue date: 2009 / El presente estudio se inserta en el área temática de la Variación Lingüística. Su objetivo es describir y analizar el proceso de elevación de las vocales medias /e/ y /o/, finales y no finales, en el portugués hablado en Rincão Vermelho – RS, comunidad ubicada en la frontera con la Argentina. La muestra para la realización de la investigación, constituída por catorce informantes, fue obtenida a partir de entrevistas de experiencia personal y de la aplicación de un instrumento con cuestiones directas, destinado a la obtención de palabras proparoxítonas. Los resultados del análisis revelaron que el alzamiento de las vocales medias /e/ y /o/ en posición final y no final es una ocurrencia variable, siendo que el alzamiento de /o/ es más frecuente que el alzamiento de /e/ en ambas las posiciones. Fueron selecionadas como relevantes para el alzamiento de /e/ en posición final las variables Contexto Vocálico de la Tónica, Contexto Precedente, Tipo de Sílaba, Contexto Siguiente, Localización de la Postónica, Clase Gramatical, Sexo y Escolaridad. Para la vocal /o/, en esa misma posición, se mostraron relevantes las variables Contexto Vocálico de la Tónica, Contexto Precedente, Tipo de Sílaba, Contexto Siguiente, Localización de la Postónica, Clase Gramatical, Sexo, Edad y Escolaridad.Entre los condicionantes lingüísticos y sociales, se mostraron más relevantes al alzamiento de ambas las vocales la variable Contexto Vocálico de la Tónica y la variable social Escolaridad. En lo que respecta a las vocales en posición postónica no final, fueron selecionadas como relevantes las variables Tipo de Postónica, Contexto Precedente, Contexto Siguiente, Contexto Vocálico de la Tónica, Localización de la Postónica, Tipo de Entrevista y Sexo. Los resultados indican aún que el alzamiento en posición no final atinge más la vocal media /o/ que la vocal media /e/. Hay indicios de que la variación no es regular y ocurre más facilmente en determinados vocablos. spa / O presente estudo insere-se na área temática de Variação Lingüística e tem por objetivo descrever e analisar o processo de elevação das vogais médias átonas /e/ e /o/, finais e não finais, no português falado em Rincão Vermelho - RS, comunidade que faz fronteira com a Argentina. A amostra para a realização da pesquisa, constituída por catorze informantes, foi obtida a partir de entrevistas de experiência pessoal e da aplicação de um instrumento com perguntas diretas, destinado à coleta de proparoxítonas. Os resultados da análise estatística revelaram que o alçamento das vogais médias /e/ e /o/ em posição final e não final ocorre variavelmente, sendo que o alçamento de /o/ é mais freqüente que o alçamento de /e/ em ambas as posições. Foram selecionadas como relevantes para o alçamento de /e/ em posição final as variáveis Contexto Vocálico da Tônica, Contexto Precedente, Tipo de Sílaba, Contexto Seguinte, Localização da Postônica, Classe Gramatical, Sexo e Escolaridade. Para a vogal /o/, nessa mesma posição, mostraram-se relevantes as variáveis Contexto Vocálico da Tônica, Contexto Precedente, Tipo de Sílaba, Contexto Seguinte, Localização da Postônica, Classe Gramatical, Sexo, Idade e Escolaridade.Entre os condicionadores lingüísticos e sociais, mostraram-se mais relevantes ao alçamento de ambas as vogais a variável lingüística Contexto Vocálico da Tônica e a variável social Escolaridade. No que refere-se às vogais em posição postônica não final, foram selecionadas como relevantes as variáveis Tipo de Postônica, Contexto Precedente, Contexto Seguinte, Contexto Vocálico da Tônica, Localização da Postônica, Tipo de Entrevista e Sexo. Os resultados indicam ainda que o alçamento em posição não final atinge mais a vogal média /o/ do que a vogal média /e/. Há indícios de que a variação das vogais nessa posição não é regular e ocorre mais facilmente em determinados vocábulos.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:02:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000402308-Texto+Completo-0.pdf: 3474014 bytes, checksum: 69f5f3e06e83ec21de65939e22edbe62 (MD5) Previous issue date: 2007 / This paper has the intent to find correspondence between the first and second formants behavior and a set of linguistic and non-linguistic variables. We have recorded eight male speakers of the Portuguese dialect used in Porto Alegre, RS, Brazil, in formal and casual speech. Our results were compared with other results from analogous researches and let some contribution on describing Brazilian Portuguese. / Esta pesquisa investigou a relação entre o comportamento dos dois primeiros formantes das vogais /a/ e /i/ e variáveis, lingüísticas e não lingüísticas, definidas para o estudo. Foram coletadas amostras da fala de oito indivíduos portoalegrenses, do sexo masculino, através de entrevistas de experiência pessoal e da aplicação de instrumento especificamente elaborado para esse fim. Nossos resultados foram comparados com estudos anteriores de mesma natureza e contribuem para a descrição do português brasileiro.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:02:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000400385-Texto+Completo-0.pdf: 581993 bytes, checksum: 1e4361372adeca21d097367f96179220 (MD5) Previous issue date: 2008 / This work aims at studying the elision rule involving the vowel /o/ in V-V sequences, when the first vowel is at a final word stressless position and the second vowel, of a different quality, is at the beginning of the following word. The corpus of the study is consisted of interviews with speakers from Porto Alegre, Rio Grande do Sul, and Curitiba, Paraná, taken from VARSUL Bank Data. The data were submitted to VARBRUL 2S statistical analysis. Describing the process of the vowel /o/ elision under the perspective of Linguistic Variation Theory, Labovian model, while estalishing conditioning linguistic and social factors and concluding the description of the close-mid vowels in the South of Brazil are the aims of this research. The elision of /o/ vowel is the dependent variable and this embraces three variants: elision, diphthongization, and hiatuses. The variant elision was not the one of highest application, but diphtongization, in both regions analyzed. The linguistic variables selected as statistically relevant were Morphosyntactic Classification of Position 1, Type of lexical item in Position 1, Number of syllables in Position 1, Morphosyntactic Classification of Position 2, Type of lexical item in Position 2, Number of syllables in Position 2, and prosodic constituents. The only social variable selected as statiscally relevant was Region. / O presente estudo trata da elisão da vogal média /o/, fenômeno de sândi externo do qual resulta o apagamento variável de vogais átonas em seqüências V-V na fronteira de vocábulos, em que a primeira, candidata ao apagamento, encontra-se na posição átona final e a segunda, de qualidade distinta, é a vogal inicial da palavra seguinte. A amostra foi composta pelas entrevistas do banco de dados do projeto VARSUL, referentes às cidades de Porto Alegre, no Estado do Rio Grande do Sul e Curitiba, no Estado do Paraná. Os dados coletados foram submetidos à análise estatística dos programas do pacote VARBRUL 2S. Descrever o processo de elisão da vogal /o/ à luz dos pressupostos teóricos da Teoria da Variação, modelo laboviano, estabelecendo condicionadores lingüísticos e sociais à regra, e concluir a descrição do processo de elisão de vogais médias na região Sul são os objetivos desta pesquisa. A elisão da vogal /o/ é, portanto, a variável dependente, que considerou três variantes, a saber: elisão, ditongação e hiato. A variante elisão não foi a forma de maior aplicação, posição ocupada pela ditongação em ambas as regiões estudadas. Foram selecionadas como condicionadores lingüísticos do processo as variáveis Classificação Morfossintática da Posição, Tipo de Item Lexical na Posição 1, Número de Sílabas na Posição 1, Classificação Morfossintática da Posição 2, Tipo de Item Lexical na Posição 2, Número de Sílabas na Posição 2 e Constituintes Prosódicos. A variável social Região também foi selecionada como estatisticamente relevante.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-04-13Bitstream added on 2014-06-13T20:39:55Z : No. of bitstreams: 1 arruda_fpr_me_botib.pdf: 683871 bytes, checksum: 4179b0fc6e0ecd821f2c41c42ac2a66e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O conhecimento da ictiofauna pode ser utilizado como uma importante ferramenta para a adoção de medidas de manejo e conservação, sendo que os estudos de caso podem acelerar o desenvolvimento de metodologias necessárias à adoção destas medidas. Os conhecimentos adquiridos neste estudo constituirão uma importante fonte de informações sobre a fauna da Fazenda Experimental Edgárdia, a qual representa um dos poucos fragmentos naturais remanescentes do município de Botucatu (SP), servindo de refúgio para diversas espécies animais. Dados como os apresentados neste trabalho visam somar informações com outros diversos estudos realizados nesta área, para a adoção de medidas de conservação e manejo adequadas, visando a preservação do ecossistema como um todo. Além disso, são escassos os trabalhos que comparam a composição e a estrutura trófica da ictiofauna presente em riachos com usos diferentes das margens dos corpos d água, o que foi priorizado neste trabalho. O presente trabalho teve por objetivo o estudo da história natural da ictiofauna de três riachos pertencentes à Microbacia da Fazenda Edgárdia, que apresentam uso diferencial de suas áreas marginais, a saber, com mata ciliar (Córrego da Mata), em área de pastagem (Córrego do Pasto) e em área de várzea (Córrego da Várzea), nas estações seca e chuvosa. Neste trabalho foram abordados os seguintes tópicos: a) diversidade de espécies (composição, riqueza e abundância relativa), b) variação espacial e sazonal na estrutura das comunidades e c) variação espacial e sazonal na partilha de recursos alimentares. A variação espacial foi analisada em escala de meso-habitat, comparando os três riachos da mesma microbacia, e em escala de micro-habitat, comparando no Córrego da Mata a partilha dos recursos entre as espécies de peixes de trechos de corredeira, rápido e poção.

O fenômeno de sândi vocálico externo apresenta três realizações possíveis: a elisão, a degeminação e a ditongação. Este trabalho tem como proposta analisar o fenômeno de ditongação como processo de resolução de hiato em fronteira de palavras (camisa usada ~ cami[zaw]sada), baseado na amostra da cidade de Lages, em Santa Catarina, incluída no banco de dados do projeto VARSUL (Variação linguística na região sul do Brasil). O embasamento teórico se apoia em Bisol (1996, 2002 e 2005) para a descrição do processo; em Labov (2008) para fundamentos de teoria da variação; além de teorias fonológicas, como Fonologia Prosódica e Fonologia Lexical. Os objetivos específicos são os que seguem: a) identificar, em nossa amostra, fatores linguísticos que possam favorecer ou bloquear a aplicação da ditongação como processo de sândi externo; b) a partir dos resultados obtidos, corroborar ou não resultados de pesquisas já realizadas a respeito deste processo; c) ampliar a compreensão do fenômeno e oferecer subsídios para uma descrição geral do processo do sândi externo e do português falado no sul do Brasil. As hipóteses que procuramos confirmar são as seguintes: a) quanto à tonicidade, o contexto ideal para a aplicação da ditongação é o de atonicidade máxima (casa escura ~ ca[zaj]scura) (conforme Bisol, 1996; Bisol, 2002); b) o contexto interno à frase fonológica é mais favorecedor na aplicação do fenômeno (velho exemplo ~ velh[we]zemplo) (conforme Bisol, 1996). A análise estatística dos dados foi realizada pelo pacote de programas VARBRUL/GoldvarbX. A amostra, constituída de 16 informantes, mostrou, dentre outros fatores, que a ditongação crescente e a ditongação decrescente têm diferentes contextos favorecedores em relação ao acento e à categoria das vogais e têm contextos favorecedores semelhantes em outras variáveis em comum. Para a ditongação, confirmamos nossas hipóteses: a atonicidade máxima e o contexto interior à frase fonológica se mostraram favorecedores. A seleção das variáveis relevantes não foi idêntica para as duas realizações. / The external vowel sandhi phenomenon presents three possible ways of realization: the elision, the degemination and the diphthongization. This work analyzes the diphthongization phenomenon as a gap resolution process in words boundary (camisa usada ~ cami[zaw]sada) based on the sample of the city of Lages, Santa Catarina, included in the project database VARSUL (linguistic variation in southern Brazil). The theoretical basis is Bisol (1996, 2002 and 2005) for the description of the process; Labov (2008) for the variation theory fundamentals; and Brescancini (2005) for variational research methodology. The specific objectives are the following: a) to identify, in our sample, linguistic factors that may favor or block the application of external vowel sandhi processes; b) from the results obtained, to prove or disprove results of previous studies regarding this process; c) to increase the understanding of the phenomenon and provide support for a general description of the process of external sandhi and Portuguese spoken in southern Brazil. The hypotheses we intend to confirm are the following: a) the ideal context for the three external sandhi processes is an unstressed vowel + an unstressed vowel (casa escura ~ ca[zaj]scura) (as Bisol, 1996; Bisol, 2002; Ludwig-Gayer, 2008; Vianna, 2009); b) the internal context to phonological phrase is more favorable to the application of the phenomenon (velho exemplo ~ velh[we]zemplo) (as Bisol, 1996). Statistical analysis of data was performed by VARBRUL / GoldvarbX software. The sample consisted of 16 informants showed that rising diphthongization and decreased diphthongization have different favorable contexts related to stress and vowel category, and they have similar favorable contexts in same variables. Related to diphthongization, we confirmed our hypotheses: the sequence of unstressed vowels and the phonological phrase are favorable to the process. The selection of the variable was not exactly the same for both processes.

Tese (doutorado)–Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2014. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-07-07T14:05:04Z No. of bitstreams: 1 2014_GracieleBellon.pdf: 2226132 bytes, checksum: 7ad237037f4c039b3925b4f3697ddfc8 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-07-09T11:12:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_GracieleBellon.pdf: 2226132 bytes, checksum: 7ad237037f4c039b3925b4f3697ddfc8 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-09T11:12:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_GracieleBellon.pdf: 2226132 bytes, checksum: 7ad237037f4c039b3925b4f3697ddfc8 (MD5) / O trabalho teve como objetivo estudar a filogenia, a variabilidade genética e caracterizar espécies silvestres, comerciais e híbridos interespecíficos de maracujazeiro como fontes de resistência à antracnose, bacteriose e virose. A análise filogenética foi utilizada para verificar a identidade de 48 acessos de um banco ativo de germoplasma de Passiflora, representando 43 diferentes espécies de interesse para o melhoramento genético do maracujazeiro azedo, doce e ornamental. As regiões de DNA utilizadas foram um loco ITS de DNA nuclear ribossomal e quatro locos do DNA de cloroplasto (matK, espaço intergênico psbA-trnH, rbcL e trnL-F). Correlacionando os dados obtidos de filogenia com as informações do programa de melhoramento de espécies de Passiflora, observou-se que a compatibilidade dos cruzamentos interespecíficos é maior quando os genitores foram selecionados a partir do mesmo subgênero. Tais análises permitiram também a obtenção de importantes informações taxonômicas, evolutivas e filogenéticas. No estudo da variabilidade genética de genótipos elites de maracujazeiro obtidos por programas de retrocruzamento, envolvendo espécies silvestres e comerciais com base em marcadores moleculares RAPD, foram analisados 32 genótipos de Passiflora. Os marcadores evidenciaram variabilidade genética entre os genótipos estudados e confirmaram a eficiência da recuperação do genoma recorrente dentro do programa de retrocruzamento. Também foi avaliado meios de cultura e métodos de inoculação artificial de Colletotrichum gloeosporioides em maracujazeiro azedo. Foram avaliados quatro meios de cultura (Aveia, BD, V8 e Ágar) e 3 três metodologias de inoculação baseadas em ferimentos com furador de couro adaptado, agulhas e atomização da suspensão de conídios. O meio de aveia (farinha de aveia Quaker© 6% + ágar 1,2% em água) apresentou a melhor condição para a produção de conídios de C. gloeosporioisdes e o método de inoculação que proporcionou maior desenvolvimento de sintomas e maior precisão na avaliação da antracnose em mudas de maracujazeiro foi o ferimento por agulhas no caule. No estudo da caracterização e quantificação da resistência de cultivares comerciais de maracujazeiro azedo à antracnose foram caracterizados os cultivares BRS Gigante Amarelo, BRS Sol do Cerrado, BRS Ouro Vermelho, Sol Amarelo Azedo Graúdo Brilhante (Feltrin) e BRS Rubi do Cerrado. As cultivares que apresentaram maior resistência a antracnose foram BRS Rubi do Cerrado seguido das cultivares BRS Sol do Cerrado e BRS Ouro Vermelho. A cultivar com maior susceptibilidade a antracnose foi BRS Gigante Amarelo seguido da cultivar Sol Amarelo Azedo Graúdo Brilhante (Feltrin). No estudo da caracterização e quantificação da resistência de espécies silvestres de maracujazeiro e genótipos obtidos por retrocruzamento à antracnose, o acesso da espécie silvestre Passiflora maliformes foi o que apresentou menor comprimento de lesão. Entre os genótipos obtidos por retrocruzamento, EC4-121 EC4-128 e a cultivar BRS Rubi do Cerrado apresentaram resistência à antracnose com comprimento de lesão estatisticamente iguais às obtidas pelo P. maliformes. No estudo da caracterização e quantificação da resistência de genótipos obtidos por retrocruzamento e de cultivares de maracujazeiro azedo à bacteriose, a cultivar BRS Rubi do Cerrado foi a mais resistente à bacteriose, e a cultivar BRS Gigante Amarelo foi a mais suscetível. Entre os genótipos obtidos por retrocruzamento, destacam-se EC4-223, ES4-239, EC4-325, EC4-124 e ERE-476 que apresentaram níveis de resistência iguais à cultivar BRS Rubi do Cerrado em pelo menos uma das características avaliadas. No estudo da caracterização e quantificação de espécies silvestres de maracujazeiro e genótipos obtidos por retrocruzamento à virose do endurecimento dos frutos, considerando apenas a incidência no estudo das espécies silvestres, verificou-se que P. misera e P. suberosa não manifestaram sintomas. Os acessos das espécies Passiflora cerradense, P. coccinea e P. setacea apresentaram resistência moderada com incidência de 10%, 25% e 30% respectivamente. Na avaliação da resistência dos genótipos obtidos por retrocruzamento à virose, observou-se 100% de incidência, porém com diferentes níveis de resistência com base na severidade. As cultivares comerciais apresentaram maior severidade da doença quando comparadas com os genótipos obtidos por retrocruzamento. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The work aimed to study the phylogeny, genetic variability and to characterize wild and commercial species and interspecific hybrids of passion fruit as sources of resistance to anthracnose, bacterial disease and viruses. Phylogenetic analysis was used to verify the identity of 48 accessions of Passiflora active germplasm bank, representing 43 different species of potential interest for the improvement of sour, sweet and ornamental passionfruit. The DNA loci used were nuclear ribosomal ITS and four chloroplast loci, matK, psbA-trnH intergenic spacer, rbcL and trnL-trnF. Correlating the obtained phylogenies with data from breeding programs, Passiflora species were much more likely to be compatible in interspecific crosses if the parents were selected from the same subgenus. These analyzes also allowed us to obtain important taxonomic, evolutionary and phylogenetic informations. In the study of genetic variability of elite genotypes of passion fruit obtained in backcross programs involving wild and commercial species based on RAPD markers, we analyzed 32 genotypes of Passiflora. Cluster analysis showed that the elite genotypes were grouped with the commercial cultivars used as recurrent parent. The markers showed genetic variability among genotypes and confirmed the efficiency of recurrent genome recovery within the backcross program. In the evaluation of the culture media and inoculations methods of C. gloeosporioides in passionfruit plants, we analyzed four culture media (Oatmeal, BDA, V8 and Agar) and three inoculation methods based on injuries by adapted leather puncher and needles and leaves atomization with conidia suspension. The culture media Quaker© oatmeal 6% + Agar 1.2% in water showed the best condition for conidia production of C. gloesporioisdesand the inoculation method based on injuries in the stem by needles proportioned the best results. In the characterization and quantification of the resistance of passion fruit cultivars to anthracnose were characterized BRS Gigante Amarelo, BRS Sol Cerrado, BRS Ouro Vermelho, Sol Amarelo Azedo Graúdo Brilhante (Feltrin) and BRS Rubi do Cerrado Cerrado cultivars. The cultivar with highest resistance to anthracnose was BRS Rubi do Cerrado followed by BRS Sol do Cerrado and BRS Ouro Vermelho. The cultivar more susceptible to anthracnose was BRS Gigante Amarelo followed by Sol Amarelo Azedo Graúdo Brilhante (Feltrin) cultivar. In the study of characterization and quantification of the resistance of passion fruit wild species and genotypes to anthracnose obtained by backcrossing,. the access of P. maliformes showed the lowest mean of lesion length. Among the genotypes obtained by backcrossing EC4-121, EC4-128 and BRS Rubi do Cerrado cultivar, showed the same level of resistance to that obtained by P. maliformes access. In the study of characterization and quantification of the resistance genotypes obtained by backcrossing and passionfruit cultivars to bacterial, the BRS Rubi do Cerrado cultivar was the most resistant to bacterial disease and BRS Gigante Amarelo was the most susceptible. Among the genotypes obtained by backcrossing CPAC-EC4-223, CPAC-ES4-239, CPAC-EC4-325, CPAC-EC4-124 e CPAC-ERE-476 showed the same resistance level of the BRS Rubi do Cerrado at least one of the characteristic analyzed. In the evaluation of the resistance of accessions of wild species of passion fruit and backcrossing genotypes to the CABMV, considering only the disease incidence, P. misera and P. suberosa did not express symptom the virus. Passiflora cerradence, P. coccinia and P. setacea showed moderate resistance with disease incidence of 10%, 25% and 30% respectively. In the backcross breeding study, 12 genotypes were evaluated and showed 100% of CABMV incidence, but with different resistance levels considering the disease severity. The cultivars showed more disease severity compared with the genotypes obtained by backcrossing.