Objetivo: Evaluar el método directo en la identificación y antibiograma de Enterobacterias en pacientes con bacteriuria significativa atendidos en el Hospital Docente Madre Niño San Bartolomé. Materiales y Método: Estudio descriptivo de corte transversal. Se procesó 173 muestras de orina con sospecha de bacteriuria significativa, inoculándose directamente la muestra en medios diferenciales y en dos placas de agar Mueller Hinton al que se le colocó 10 antibióticos; paralelamente, se procesó las muestras según el protocolo estandarizados para urocultivo, identificando el uropatógeno por las reacciones presentadas en la serie bioquímica y categorizando los halos de inhibición antibiótica según los puntos de corte vigentes señalada por la CLSI. Finalmente se comparó los resultados por ambos métodos y se calculó el nivel de concordancia mediante el índice Kappa. Resultados: 154 muestras fueron analizadas y comparadas por ambos métodos, hallándose un índice Kappa de 0.89, siendo considerada una concordancia “Casi perfecta”. En el caso del antibiograma, muestras fueron evaluadas obteniéndose un índice Kappa para el antibiótico Trimetoprim-Sulfametoxazol de 0.97, Ciprofloxacina, 0.82, Gentamicina, 0.94, Ampicilina, 0.92 y Ceftriaxona,0.93 categorizados como una correlación “Casi perfecta”; en el caso de la Cefalotina presentó un índice de 0.64 y Amoxicilina – Ac. Clavulánico de 0.74 que se valoran como una concordancia “Considerable”, para la Nitrofurantoína, se halló un índice de correlación de 0.56 considerada como una concordancia “Moderada” y para la Amikacina, se obtuvo un índice de 0.28 categorizada como “Aceptable”. Conclusión: El método directo es un protocolo alternativo válido y confiable, que permite reportar en menos tiempo el agente infeccioso y el patrón de susceptibilidad con el cual puede iniciarse una terapia antibiótica adecuada, sin embargo es imprescindible valorar el resultado según la pureza y recuento de colonias, así como también confírmalo con la identificación y antibiograma convencional. / Objetive: Assess the direct method in the identification and susceptibility of Enterobacteriaceae in patients with significant bacteriuria treated at Hospital Madre Niño San Bartolomé. Materials and Methods: Descriptive cross-sectional study. 173 urine samples with suspected significant bacteriuria were directly processed, by inoculating the sample in differential media and two Mueller-Hinton agar plates to which was placed 10 antibiotic disks in parallel, the samples were processed according to the standardized protocol for urine culture, identifying the uropathogen through the reactions outlined in bacterial biochemistry and categorizing series of antibiotic inhibition halos breakpoints as indicated by the CLSI. Finally the results are compared for both methods and the level of agreement was calculated using the Kappa index. Results: 154 samples were analyzed and compared by the two methods for the identification, obtaining a Kappa index of 0.89, being considered as an "Almost perfect" agreement. In the case of the susceptibility test, 149 samples were compared by the two methods, obtaining a Kappa index of 0.97 for the antibiotic Trimethoprim-sulfamethoxazole, 0.82 for Ciprofloxacin, 0.94 for Gentamicin, 0.92 for Ampicillin and 0.93 for Ceftriaxone, being considered as an "Almost perfect" correlation; Cephalothin present a Kappa index of 0.64 and Amoxicillin - clavulanate 0.74 being considered as a "Substancial" agreement, as well as Nitrofurantoin Kappa index of 0.56 was considered to have as a "Moderate" agreement. On the other hand, Amikacin had a “Fair” agreement (Kappa index of 0.28). Conclusion: The direct method is a valid and reliable alternative protocol, which allows to identify the bacterial infectious agent and find the pattern of antibiotic susceptibility in less time, which can be initiated with appropriate therapy. However, it is essential to evaluate the results according to the purity and counting colonies, as well as identify and confirm the results with conventional susceptibility. Keywords: direct method, standardized method, kappa coefficient, urine.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 862787 bytes, checksum: b23a777918d630895ac6bf3d64e985c8 (MD5) Previous issue date: 2012-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In recent years Geostatistics has been widely used in the field of precision agriculture, this is due to being a tool to analyze the spatial variability exists in the area of agricultural production, enabling assess the need for creation of subareas or zones where they are handlings performed differently. One focus of precision agriculture is to identify management zones within the field based on the variability, and through Geostatistics is possible to produce thematic maps that assist in the establishment of management zones through adjustments of models of spatial dependence. The objective of this study was to analyze the influence of models of spatial dependence in the definition of thematic maps of management zones, using different models and different semivariogram sampling grids. To conduct the study, we analyzed simulated data generated in SAS software, where he held various structures of spatial dependence (DE) and different sampling grids (grid), with different sizes and densities of points, with a total of 9 data set simulated. To analyze the spatial dependence structure experimental semivariograms were used and adjusted three theoretical models to experimental semivariogram: exponential, spherical and Gaussian for each data set under study, according to the parameters set forth by autotune software ArcGis 9.3. Were adjusted 27 different semivariogram models using the method of ordinary kriging and through cross-validation technique checked the fit of the models semivariográficos. Thematic maps management zones were generated from the technique of kriging, and with the aid of software Idrisi was performed to compare the maps using Kappa Index of agreement, which was tested by testing their significance Z. From the analyzes, it was concluded that the model of spatial dependence does not influence the definition of thematic maps of management zones. / Nos últimos anos a Geoestatística vem sendo amplamente utilizada na área de agricultura de precisão, isso se deve ao fato de ser uma ferramenta que permite analisar a variabilidade espacial existente na área de produção agrícola, possibilitando avaliar a necessidade de criação de subáreas ou zonas onde serão realizados manejos de forma diferenciada. Um dos focos da agricultura de precisão é a identificação de zonas de manejo dentro do campo baseadas na variabilidade existente, e por meio da Geoestatística é possível produzir os mapas temáticos que auxiliam no estabelecimento das zonas de manejo através de ajustes de modelos de dependência espacial. Assim, o objetivo geral deste estudo foi analisar a influência de modelos de dependência espacial na definição de mapas temáticos de zonas de manejo, usando diferentes modelos de semivariogramas e diferentes grades de amostragem. Para a realização do estudo foram analisados dados simulados gerados no software SAS, onde se considerou diferentes estruturas de dependência espacial (DE) e diferentes grades de amostragens (grid), com diferentes tamanhos e densidades de pontos, sendo um total de 9 conjunto de dados simulados. Para a análise da estrutura de dependência espacial foram utilizados semivariogramas experimentais e ajustados três modelos teóricos ao semivariograma experimental: exponencial, esférico e gaussiano, para cada conjunto de dados em estudo, conforme os parâmetros estipulados pelo auto-ajuste do software ArcGis 9.3. Foram ajustados 27 diferentes modelos de semivariogramas através do método da krigagem ordinária e através da técnica de validação-cruzada verificados os ajustes dos modelos semivariográficos. Mapas temáticos de zonas de manejo foram gerados a partir da técnica de krigagem ordinária, e com o auxilio do software Idrisi foi realizada a comparação dos mapas através do Índice Kappa de concordância, o qual foi testado sua significância através do teste Z. A partir das análises realizadas, concluindo-se que o modelo de dependência espacial não influencia na definição de mapas temáticos de zonas de manejo.

Submitted by BRUNO TIMÓTEO RODRIGUES null (brunogta21@gmail.com) on 2016-09-28T19:47:11Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Mestrado Bruno.pdf: 17780320 bytes, checksum: 9ae4b184379c35c8b718ffc683ad0b0f (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-09-30T18:20:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rodrigues_bc_me_bot.pdf: 17780320 bytes, checksum: 9ae4b184379c35c8b718ffc683ad0b0f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-30T18:20:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rodrigues_bc_me_bot.pdf: 17780320 bytes, checksum: 9ae4b184379c35c8b718ffc683ad0b0f (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os novos sensores orbitais e a aquisição contínua de imagens da superfície terrestre têm oferecido um volume e variedade cada vez maior de dados a comunidade de sensoriamento remoto. Como exemplo desse novo segmento da modelagem ambiental, o projeto SRTM assim como o ASTER, obtendo como produtos Modelos Digitais de Terreno (MDT) de até 80% da área terrestre do planeta. Este trabalho teve como objetivo avaliar a qualidade e precisão de dados altimétricos obtidos em Modelos Digitais de Elevação (MDEs). Para tanto, foi elaborado um mapa altimétrico base (Verdade terrestre), o qual foi comparado, por analise do Indice Kappa, com três modelos digitais de terreno (MDT) obtidos dos projetos TOPODATA, SRTM 30 metros e ASTER. De acordo com a avaliação expressa pela Matriz de Confusão gerada a partir da Altimetría do TOPODATA cruzada a Verdade Terrestre, 19 das 26 classes de informações altimétricas apresentadas não tiveram os seus maiores valores expressos nos respectivos eixos principais das classes confrontadas com a verdade terrestre da área, constatando um bom grau de acuracidade nos dados classificados do cruzamento do TOPODATA com a Verdade Terrestre. Observou-se que as classes que apresentaram os maiores valores um nível abaixo do eixo principal da matriz de confusão se localizam exatamente na região que corresponde à área com declividade muito acentuada, se tratando da feição geomorfológica da Cuesta. Desta forma considera-se que a resolução espacial das imagens provenientes dos sensores de radar, neste caso o arquivo do TOPODADA, está diretamente ligada com a baixa acurácia em áreas de grandes declividades, pois quanto maior o tamanho do pixel, maior a dificuldade de capturar diferenças abruptas de declividade. No Modelo digital de elevação do sensor de Radar SRTM 30m, apenas 2 das 26 classes de informações altimétricas apresentadas não tiveram os seus maiores valores expressos nos respectivos eixos principais das classes confrontadas com a verdade terrestre da área. Dessa forma, pode-se verificar um bom grau de acuracidade nos dados classificados. Para os dados analisados do sensor ASTER confrontados com a Verdade Terrestre, assim como os dados do SRTM 30m, somente 2 das 26 classes de informações altimétricas apresentadas não tiveram os seus maiores valores expressos nos respectivos eixos principais das classes confrontadas com a verdade terrestre. Desta forma, também considera um bom grau de acuracidade do cruzamento do dados classificados dos sensores ASTER com a Verdade Terrestre. Por fim, observou-se que o sensor de radar SRTM 30 metros exibiu o melhor dos MDEs analisados, por apresentar resultados de índice Kappa, com 3,798% de acertos a mais em relação ao sensor ASTER e 6,43% a mais que o dados do TOPODATA. / The new orbital sensors and continuous acquisition of land surface images have offered a volume and increasing variety of data to remote sensing community. As an example of this new segment of the environmental modeling, SRTM project as well as ASTER, obtaining as products Digital Terrain Models (DTM) of up to 80% of the Earth's land area. To evaluate the quality and accuracy of altimetry data from Digital Elevation Models (DEMs). Thus, a altimetry basemap (terrestrial Truth) was prepared which was compared by analysis of Kappa Index, with three digital terrain models (DTM) obtained from TOPODATA projects, SRTM and ASTER 30 meters. According to the evaluation expressed by the confusion matrix generated from the altimetry of cross TOPODATA Truth Land, 19 of the 26 classes presented altimetric information did not have their greatest values expressed in the respective main axes of the classes faced with the ground truth area , finding a good degree of accuracy in the data classified as TOPODATA the intersection with Road Truth. It was observed that the classes that showed the highest values one level below the main confusion matrix axis is located exactly in the region that corresponds to the area with very steep slopes, in the case of geomorphological feature of Cuesta. Thus it is considered that the spatial resolution from images of the radar sensors, in this case TOPODADA file is directly connected with the low accuracy in areas of great slope, because the larger the pixel size, the more difficult to capture sharp differences in steepness. In the digital elevation model of the radar sensor SRTM 30m, only 2 of the 26 classes of altimetric information submitted have not had their highest values expressed in the respective main axes of the classes faced with the ground truth of the area. Thus, it can be seen a good degree of accuracy in the data sorted. For the analyzed data ASTER faced with the Earth Truth, as well as data from SRTM 30m, only 2 of the 26 classes of altimetric information submitted have not had their highest values expressed in the respective main axes of the classes faced with the ground truth. Thus, also considers a good degree of accuracy of the data crossing the classified ASTER sensors with the Earth Truth. Finally, there was the SRTM 30 meters radar sensor exhibited the best of MOUs analyzed by presenting the results of Kappa index, 3.798% of the more hits against the ASTER and 6.43% more than the data the TOPODATA.

Made available in DSpace on 2017-05-12T14:46:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Claudio Leones Bazzi.pdf: 3343114 bytes, checksum: 3fa53d5262ab876ffddc75c68048a730 (MD5) Previous issue date: 2007-01-25 / The precision agriculture comes in the last years enlarging its application in the country, seeking the increase of the productivity and profitability, also reducing the environmental impact with the appropriate application of fertilizers and agricultural inputs. The impediment for larger expansion of the technology is mainly the high cost of the equipments to be used. The generation of yield maps is the phase that presents larger execution easiness inside of the cycle of AP. However when several combines are working in a certain area, not always it is possible to have monitors in each one of them. In this context this work had as objective finds the step maximum number that it can be eliminated by the combine not equipped with yield monitor without quality loss in the yield and moisture maps generated. It was also looked for to accomplish a comparison among the interpolation methods inverse square root and Kriging. In the comparison between the simulated maps and the original, the coefficient of relative deviation was used - CDR and the index kappa. He/she was proven that the eliminated last number reduces the precision of the maps in both interpolation methods. The amount monitors that it should be had in a combine group, are relative at the level of precision that one want to have. The monitored combine should be inserted so that the samples are collected in an uniform way by the whole area to be crop. / A agricultura de precisão (AP) vem, nos últimos anos, ampliando sua aplicação no País, a fim de aumentar a produtividade e lucratividade, bem como diminuir o impacto ambiental com a aplicação adequada de insumos agrícolas. O entrave para a maior expansão da tecnologia está principalmente no elevado custo dos equipamentos a serem utilizados. A geração de mapas de produtividade é a fase que apresenta maior facilidade de execução dentro do ciclo da AP. Entretanto, quando várias colhedoras estão colhendo em uma determinada área, nem sempre é possível a presença de monitores de colheita em cada uma delas. Nesse contexto, este trabalho teve como objetivo encontrar o número máximo de passadas que podem ser eliminadas pela utilização de colhedoras não equipadas com monitor de colheita sem que haja perda de qualidade nos mapas de produtividade e de teor de água gerados. Buscou-se também realizar um comparativo entre os métodos de interpolação inverso da distância ao quadrado e Krigagem . Na comparação entre os mapas simulados e o original, utilizaram-se o coeficiente de desvio relativo CDR - e o índice kappa. Comprovou-se que o número de passadas eliminadas diminui a precisão dos mapas em ambos métodos de interpolação. A quantidade de monitores que deve haver em um conjunto de colhedoras é relativa ao nível de precisão que se deseja ter, devendo-se intercalá-las de maneira que as amostras sejam coletadas uniformemente por toda a área a ser colhida.

Made available in DSpace on 2017-07-10T19:23:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Claudio Leones Bazzi.pdf: 3343114 bytes, checksum: 3fa53d5262ab876ffddc75c68048a730 (MD5) Previous issue date: 2007-01-25 / The precision agriculture comes in the last years enlarging its application in the country, seeking the increase of the productivity and profitability, also reducing the environmental impact with the appropriate application of fertilizers and agricultural inputs. The impediment for larger expansion of the technology is mainly the high cost of the equipments to be used. The generation of yield maps is the phase that presents larger execution easiness inside of the cycle of AP. However when several combines are working in a certain area, not always it is possible to have monitors in each one of them. In this context this work had as objective finds the step maximum number that it can be eliminated by the combine not equipped with yield monitor without quality loss in the yield and moisture maps generated. It was also looked for to accomplish a comparison among the interpolation methods inverse square root and Kriging. In the comparison between the simulated maps and the original, the coefficient of relative deviation was used - CDR and the index kappa. He/she was proven that the eliminated last number reduces the precision of the maps in both interpolation methods. The amount monitors that it should be had in a combine group, are relative at the level of precision that one want to have. The monitored combine should be inserted so that the samples are collected in an uniform way by the whole area to be crop. / A agricultura de precisão (AP) vem, nos últimos anos, ampliando sua aplicação no País, a fim de aumentar a produtividade e lucratividade, bem como diminuir o impacto ambiental com a aplicação adequada de insumos agrícolas. O entrave para a maior expansão da tecnologia está principalmente no elevado custo dos equipamentos a serem utilizados. A geração de mapas de produtividade é a fase que apresenta maior facilidade de execução dentro do ciclo da AP. Entretanto, quando várias colhedoras estão colhendo em uma determinada área, nem sempre é possível a presença de monitores de colheita em cada uma delas. Nesse contexto, este trabalho teve como objetivo encontrar o número máximo de passadas que podem ser eliminadas pela utilização de colhedoras não equipadas com monitor de colheita sem que haja perda de qualidade nos mapas de produtividade e de teor de água gerados. Buscou-se também realizar um comparativo entre os métodos de interpolação inverso da distância ao quadrado e Krigagem . Na comparação entre os mapas simulados e o original, utilizaram-se o coeficiente de desvio relativo CDR - e o índice kappa. Comprovou-se que o número de passadas eliminadas diminui a precisão dos mapas em ambos métodos de interpolação. A quantidade de monitores que deve haver em um conjunto de colhedoras é relativa ao nível de precisão que se deseja ter, devendo-se intercalá-las de maneira que as amostras sejam coletadas uniformemente por toda a área a ser colhida.