本研究從經營效率的觀點，以國內接受政府補助的62所育成中心為對象，採用資料包絡分析法（DEA）、單因子變異數分析、二元羅吉特斯迴歸分析及Tobit迴歸分析進行評估，以探討不同組織型態及所在地區之育成中心經營效率之差異及影響育成中心經營效率之因子並探討育成中心經營效率與進駐企業之關連性。DEA部分以投入面導向衡量，並以單因子變異數分析檢視育成中心地理區位與育成中心母體組織類型的經營效率差別，二元羅吉特斯部分以將育成中心效率值進一步分類為「經營無效率」及「經營有效率」，並納入資金取得及企業回饋變項，以探討不同組織型態及所在地區之育成中心經營效率之差異。Tobit迴歸分析則分別以育成中心整體效率值及純技術效率值為應變項，測試企業獲獎數、企業獲得補助之金額、企業回饋金額對效率的影響。實證的結果顯示，不同母體組織類型及不同地理區位的育成中心其效率表現並無顯著差異，而且資金取得及企業回饋亦未能證明影響育成中心之經營效率，但育成中心可藉由企業獲獎數及企業回饋金額的增加，來提升其純技術效率或藉由企業回饋金額的增加，來提升其整體技術效率。