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Photocatalysis for organic synthesis

O'Rourke, Christopher January 2014 (has links)
A wide range of commercially available self-cleaning materials/products are now available, from architectural materials, such as; glass, paint, plastics, and concrete, to water and air purification systems. These products exploit the destructive oxidative nature of SPC to purify air and water. In contrast, this thesis introduces the less well studied use of SPC to mediate the synthesis of a range of useful organic species, and aims to develop a fast screening process for monitoring such reactions to aid future developments in SPC mediated organic synthesis. It is demonstrated that NMR is a very effective way to monitor SPC mediated organic reactions. By coating the inside of an NMR tube with a sol-gel titania film, and performing SPC reactions in-situ, inside a sealed NMR tube on a 1 mL scale, the need for sample-taking and pre-treatment is negated. The small scale also allows for much faster reaction times. For example, it is shown for the SPC oxidation of toluene, that the use of this NMR/sol-gel titania method is ca. 10 times faster than the more conventional large scale (100 mL) reaction utilising a titania dispersion, whilst still providing similar product yields, thus, demonstrating a new rapid screening method for SPC mediated organic synthesis reactions. Using the new fast screening NMR tube method, the SPC C-C coupling of phenoxyacetic acid (PAA) with N-methylmaleimide (NMI) to produce adduct and cyclic products in yields up to 67% and 15% respectively after only 15 min of UVA irradiation was assessed in detail. Despite the well-known photochemical feature of NMI to form dimers efficiently, the background photochemistry and photocatalysis associated with the individual reactants are shown to be minimal due to the faster SPC kinetics for the coupling reaction. Acrylamide (ACM) was also used in the SPC C-C coupling with PAA, gaving rise to only one product, 4-phenoxybutanamide, in high yields (78%). This efficient reaction was then used to assess the robustness and reusability of the titania coated NMR tubes.
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La función del plancton y los tapetes microbianos en el Parque Nacional Las Tablas de Daimiel

Barón Rodríguez, María Mercedes 13 May 2011 (has links)
No description available.
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mRNA secondary structure melting during translation elongation in yeast

Innes, Shona L. January 2002 (has links)
Two assay systems were designed and constructed in this study in order to investigate mRNA secondary structure melting during translation elongation in <i>S. cerevisiae</i>. The first, where stable secondary structures were placed within a <i>lacZ</i> reporter mRNA, was used to demonstrate that such structures are resolved efficiently, as the insertion of a stable stem-loop of -66 kcal/mol into the <i>lacZ</i> coding region only reduced translation efficiency by 40%. It was further demonstrated that the effect of secondary structures in open reading frames are not additive, as two stem-loops of -45 kcal/mol adjacent to one another did not decrease translation efficiency, to the extent expected of a single stem-loop of -90 kcal/mol. The L-A d.s. RNA virus RNA pseudoknot had no effect on translation elongation. A second assay, based on -1 frameshifting upstream of RNA secondary structure elements was used to test candidate genes for a role in mRNA secondary structure melting during translation elongation. It was demonstrated that two cytoplasmic RNA helicases, Ded1p and Dbp5p are not involved in this process. In contrast to previous work (Cui, <i>et. al</i>., 1996; EMBO 15:5726-5736) this study revealed that Upf1p, an RNA helicase involved in nonsense-mediated decay, played no role in -1 ribosomal frameshifting. Environmental effects on mRNA secondary structure melting were investigated by measuring secondary structure melting at 18<sup>o</sup>C, using the -1 frameshift assay. Contrary to expectations, -1 frameshifting was not enhanced by low temperature, perhaps because a helicase-like activity is induced at 18<sup>o</sup>C. Proteomic analysis revealed that increased levels of Gdh1p are associated with polyribosomes at 18<sup>o</sup>C compared to 37<sup>o</sup>C. Gdh1p interacts with Lsm1p, a component of an mRNA decapping complex, in a two-hybrid screen.
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毛詩正義文藝思想硏究. / "Mao shi zheng yi" wen yi si xiang yan jiu.

January 1995 (has links)
李貴生. / 書名原題: 《毛詩正義》文藝思想硏究. / 論文(碩士) -- 香港中文大學硏究院中國語言及文學學部,1995. / 參考文獻: leaves i-viii (2nd group) / Li Guisheng. / 前言 --- p.1 / Chapter 第一章 --- 硏究《毛詩正義》文藝思想的意義 --- p.4 / Chapter 一. --- 《五經正義》與唐代科舉 --- p.6 / Chapter 二 ´Ø --- 《五經正義》與唐代敎育 --- p.14 / Chapter 三´Ø --- 硏究《毛詩正義》文藝思想的意義 --- p.18 / Chapter 第二章 --- 《毛詩正義》詩歌功能論 --- p.25 / Chapter 一 ´Ø --- 箴刺論 --- p.25 / Chapter 二 ´Ø --- 敎化論 --- p.32 / Chapter 三´Ø --- 結語 --- p.36 / Chapter 第三章 --- 《毛詩正義》詩言志論 --- p.39 / Chapter 一 ´Ø --- 詩歌的起源 --- p.39 / Chapter 二 ´Ø --- 詩人志意 --- p.44 / Chapter 三´Ø --- 「志」的普遍性與個別性 --- p.53 / Chapter 第四章 --- 《毛詩正義》文勢論 --- p.67 / Chapter 一´Ø --- 由「勢」、「筆勢」到「文勢」 --- p.68 / Chapter 二 ´Ø --- 文勢析論 --- p.85 / Chapter 三´Ø --- 與文勢相關的其他技巧問題 --- p.104 / Chapter 四´Ø --- 總結 --- p.117 / Chapter 第五章 --- 《毛詩正義》詩歌體用論 --- p.122 / Chapter 一 ´Ø --- 六義總論 --- p.122 / Chapter 二 ´Ø --- 風雅頌論 --- p.124 / Chapter 三´Ø --- 賦比興論 --- p.136 / 結語 --- p.161 / 參考書目 / 附錄
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Theoretical and practical aspects of parallel numerical algorithms for initial value problems, with applications

January 1992 (has links)
Andrew Lumsdaine. / Includes bibliographical references (p. 80-82). / Supported by IBM Corp., and by a AEA/Dynatech faculty development fellowship. Supported by the Defense Advanced Research Projects Agency, under the Office of Naval Research. N00014-91-J-1698 Supported by a National Science Foundation. MIP-88-14612
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Introducción de la tecnología de transferencia génica en lubina (Dicentrarchus labrax)

Muñoz Forcada, Iciar 07 November 2005 (has links)
Este trabajo abarca distintos aspectos de la metodología de la transferenciagénica en lubina, tanto in vitro como in vivo. Por una parte, se ha centrado en el estudioy evaluación de la transferencia génica somática como posible sustitución a latransgénesis estable en distintas aplicaciones. Por otra parte, se ha evaluado el sistemade regulación por tetraciclina para la regulación exógena de genes en peces. Por último,se ha probado que una línea celular de lubina puede utilizarse como sistema deexpresión de genes exógenos.Por primera vez se demuestra que la inyección de DNA plasmídico es eficientepara transferir genes exógenos a músculo de lubina. Los factores que favorecen laexpresión son, dosis altas de plásmido, el uso de un promotor adecuado, y un estadometabolicamente activo del músculo. La expresión que se obtiene es transitoria,alcanzándose el máximo cinco días después de la inyección. Una limitación de estatécnica es la incapacidad de reproducir en los distintos individuos inyectados, lamanera exacta en que la aguja de inyección entra en el paquete muscular, lo queorigina una gran variabilidad en cuanto a la toma de DNA por parte de las células, ypor tanto en el nivel de expresión del transgen. Esto se puede mejorar aumentando elnúmero de animales inyectados para disminuir así el error debido a la técnica, o usandouna segunda construcción para normalizar la transfección.La técnica de inyección de DNA en músculo se ha ensayado como método devacunación en peces. Sin embargo, ésta es la primera vez, que se prueba esta técnica enpeces para secretar una hormona en sangre. Como gen a inyectar se ha diseñado yconstruido un gen híbrido que codifica una hormona gonadotropa de cadena única delubina. Tras su inyección en músculo de lubina se pudo detectar la proteína en plasma.Para sistemas de origen piscícola, no se dispone hasta el momento de un métodoque permita controlar la expresión de genes exógenos de manera fiable. Por primeravez, hemos probado la utilidad del sistema de regulación por tetraciclina para estamisión. Tras valorar diferentes versiones del sistema en células de pez in vitro y enmúsculo in vivo, podemos concluir que la opción más eficiente es el uso deltransactivador tTA bajo el control de un promotor estable.Al igual que en células de mamíferos, hemos comprobado que las células de peztambién presentan dificultades para mantener el sistema de regulación por tetraciclinade una manera funcional; como resultado, encontrar clones con un grado de regulaciónóptimo y un nivel bajo de expresión basal es difícil. Sin embargo, el uso de unaestrategia basada en el uso del plásmido nuevo pTet-luc+-pur/GFP facilita esta tarea, ypermite obtener un alto porcentaje de clones regulables.A lo largo de este trabajo se han comparado los promotores CMV, de origenviral, y el promotor de la actina ß de carpa, para dirigir la expresión de distintos genestanto en las líneas celulares EPC y SBL, como en músculo de lubina in vivo. Losresultados nos permite concluir que el promotor de la actina ß de carpa, es más débil encuanto al nivel de expresión génica que logra promover, y menos estable a la hora demantenerse en una línea celular que el promotor CMV.Por último, los resultados obtenidos con la línea celular SBL permiten señalar aesta línea como un sistema de lubina apto para la expresión de genes exógenos. Estascélulas son capaces de secretar los productos de los genes introducidos, con lo quepodrían ser utilizadas para la producción de proteínas recombinantes. / This work focuses on different aspects of the gene transfer methodology in sea bass.On one hand, the use of the somatic gene transfer has been evaluated as an alternative to theuse of stable transgenesis in different applications. Somatic gene transfer has been used asmethod of delivery of a recombinant single-chain gonadotropin into the blood stream in seabass. On the other hand, we have evaluated the use of the tetracycline regulated system tocontrol exogenous gene expression in fish. The results showed that the best choice was the useof the rtTA transactivator under the control of a stable promoter. Finally, a sea bass cell linehas proven to be an efficient system for the expression of exogenous gene.
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Interrelaciones entre el estrés, inmunidad y parasitismo en el herrerillo común (Parus caeruleus).

Tomás Gutiérrez, Gustavo 18 November 2005 (has links)
Cada vez es mayor el conocimiento existente sobre las interacciones entre parásitos y hospedadores en condiciones naturales. Sin embargo, aún no están bien establecidos los costes y compromisos a que se enfrentan los hospedadores que padecen infecciones parasitarias crónicas. Los parásitos sanguíneos pueden causar estrés fisiológico a sus hospedadores mediante la destrucción celular y el consumo de hemoglobina. El importante papel que las proteínas de estrés (heat shock proteins, HSPs) tienen en la regulación de toda una pléyade de procesos fisiológicos en todos los seres vivos ha suscitado un creciente interés desde su descubrimiento, y diversos estudios han sugerido su importancia en respuesta al parasitismo. Evidencias recientes indican que ciertas HSPs tienen un papel clave en la modulación del sistema inmune. La evaluación conjunta de la inmunidad humoral y la respuesta de estrés puede ayudarnos a comprender mejor los mecanismos fisiológicos que subyacen a las historias vitales de los hospedadores que hacen frente a las infecciones parasitarias.El objetivo general que se aborda en esta Tesis es profundizar en el conocimiento de los costes y compromisos que los organismos parásitos infringen en sus hospedadores en condiciones naturales. Utilizando como modelo una población de herrerillo común (Parus caeruleus) y mediante aproximaciones experimentales principalmente, se investiga el papel que el sistema inmunitario y la respuesta al estrés juegan en la defensa de las aves frente a las infecciones parasitarias, y en la modulación de la inversión en la reproducción, los costes reproductivos y de sus estrategias vitales.En una primera fase de la Tesis, se establecen y validan dos protocolos metodológicos, uno para la obtención y análisis de muestras sanguíneas destinado a la cuantificación de los niveles de HSPs y otro para la cuantificación de los niveles de inmunoglobulinas, ambos para su aplicación en especies silvestres de aves.Se aportan evidencias experimentales que demuestran que la infección por parásitos sanguíneos induce una respuesta de estrés en aves en condiciones naturales, y se detecta la existencia de costes del parasitismo o de las defensas fisiológicas frente a él sobre la eficacia biológica. Una disminución experimental de las parasitosis sanguíneas y la reducción asociada de los niveles de inmunoglobulinas permiten a las hembras destinar más recursos hacia el cuidado parental, resultando en beneficios para los polluelos. Además, un experimento de manipulación del tamaño de la nidada permitió detectar disminuciones de los niveles de HSP60 en las hembras que atendieron nidadas reducidas, y de los niveles de inmunoglobulinas en las que atendieron nidadas aumentadas. Los resultados obtenidos sugieren que el estrés fisiológico podría ser un factor limitante del esfuerzo parental durante la reproducción de los herrerillos.Por otra parte, los herrerillos que reutilizan cavidades que contienen nidos viejos de la estación anterior pagan un coste causado por la presencia de ectoparásitos. Este coste surgió en términos de un menor éxito reproductor y un menor peso corporal de las hembras tras la reproducción. Se detectó un coste adicional en forma de mayor infección por parásitos sanguíneos en las hembras cuanto mayor fue la abundancia de ectoparásitos. Los resultados indicaron que los costes de reutilización de los nidos podrían verse reducidos en aquellas áreas y/o años con baja incidencia del ectoparasitismo.Finalmente, se exploran las causas de la variabilidad intraespecífica en un carácter implicado en la reproducción como es el tamaño del nido. Los resultados indican que determinadas medidas de la salud de la hembra están relacionadas con el esfuerzo de construcción del nido en algunos años, dependiendo probablemente de las condiciones ambientales, por lo que el tamaño del nido en esta especie podría ser un carácter sujeto a selección sexual. / The general aim of this Thesis is to deepen our understanding of the costs and tradeoffs that parasites impose on their hosts in the wild. The main model system is a blue tit (Parus caeruleus) population. Primarily with experimental approaches, I study the role played by immune system and stress responses in birds facing parasite infections. I also study their implications in the modulation of reproductive investment, reproductive costs and life histories.As a first step, I establish and validate two methodological procedures, one for the collection and analysis of blood samples for the quantification of HSP levels, and other for the quantification of immunoglobulin levels, both to be applied in wild bird populations.I report the first experimental evidence relating blood parasite infection to the physiological stress response in a wild avian population. The results show the existence of fitness costs of parasitism or physiological defences against it. An experimental reduction of blood parasitism and the associated reduction in immunoglobulin levels allowed females to allocate more resources towards parental effort, resulting in benefits for the offspring. In addition, a brood size manipulation experiment allowed us to detect a reduction in HSP60 level in females attending reduced broods, and a reduction in immunoglobulin levels in females attending enlarged broods. Results suggest that physiological stress may limit parental effort during reproduction in blue tits.Blue tits reusing cavities with old nests from the previous season pay costs caused for the presence of ectoparasites. These costs arose as a lower reproductive success and a lower female body weight after reproduction. I detected an additional cost expressed as higher blood parasite infection in females as ectoparasitim increases. Results show that the costs of nest reuse would be lower in areas and/or seasons with low incidence of ectoparasitism.Finally, I explored the causes of intraspecific variability in nest size, a character involved in reproduction. Results show that certain measures of female health are related to nest-building effort in some years, probably depending on environmental conditions. Thus, nest size in this species may be a sexually selected trait.
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Taxonomy of the Haploporinae Nicoll, 1914 and Bunocotylinae Dollfus, 1950 (Digenea) from Mediterranean mullets (Teleostei): morphological and molecular approaches

Blasco Costa, Mª Isabel 21 April 2009 (has links)
The thesis aimed at developing a modern taxonomic framework of two major groups ofmullet digeneans, the subfamily Bunocotylinae of the Hemiuridae and the subfamilyHaploporinae of the Haploporidae, by combining morphological and molecular data.Saturnius is revised, three new species are described: S. minutus n. sp., S. dimitrovi n.sp. and S. overstreeti n. sp.; S. papernai is redescribed, a new diagnosis and a key to thespecies is provided.A taxonomic revision of the Mediterranean haploporid genera Haploporus, Dicrogaster,Forticulcita, Lecithobotrys and Saccocoelium was carried out. New generic diagnosesare provided for all genera. Haploporus and Lecithobotrys are considered monotypicMediterranean genera and their type-species are redescribed. Dicrogaster perpusilla andD. contracta are redescribed and distinguished. A key to the valid species is given.Forticulcita gibsoni n. sp., is described. A key to Forticulcita spp. is presented.Saccocoelium obesum and S. tensum are redescribed. Three new species, Saccocoeliumcephali n. sp., S. brayi n. sp. and S. currani n. sp., are described. A key to therecognised species is presented.Three new haploporine genera are established: Ragaia n. g. for R. lizae n. sp.;Pseudolecithobotrys n. g. and Pseudodicrogaster n. g. for Lecithobotrys stomachicola n.comb. and Dicrogaster japonica n. comb., respectively. A key to the ten recognisedgenera of the Haploporinae is presented. Molecular phylogenetic analyses are applied toevaluate the taxonomic framework of the Haploporinae based on morphology and itssystematic position within the phylogeny of the Digenea. / El propósito de esta tesis es desarrollar un marco taxonómico moderno para dos gruposmayoritarios de digénidos de mugílidos, la subfamilia Bunocotylinae, de la familiaHemiuridae y la subfamilia Haploporinae, de la familia Haploporidae; utilizando datosmorfológicos y moleculares.El género Saturnius ha sido revisado y tres nuevas especies han sido descritas: S.minutus n. sp., S. dimitrovi n. sp. y S. overstreeti n. sp.; S. papernai ha sido redescrita, yuna nueva diagnosis y una clave de identificación de las especies han sido presentadas.Se llevo a cabo la revisión taxonómica de los géneros de haplopóridos mediterráneosHaploporus, Dicrogaster, Forticulcita, Lecithobotrys y Saccocoelium. Se presentannuevas diagnosis para cada género. Haploporus y Lecithobotrys han sido consideradosgéneros monotípicos mediterráneos y sus especies tipo han sido redescritas. Dicrogasterperpusilla y D. contracta se han redescrito y diferenciado, y una clave de identificaciónpara todas las especies del género ha sido presentada. Se ha descrito Forticulcitagibsoni n. sp. y se presenta una clave de identificación para las especies de este género,Forticulcita. Saccocoelium obesum y S. tensum se han redescrito. Tres especies nuevas,Saccocoelium cephali n. sp., S. brayi n. sp. y S. currani n. sp., han sido descritas y sepresenta una clave de identificación de las especies consideradas validas.Se han erigidos tres nuevos géneros de haploporinos: Ragaia n. g. para R. lizae n. sp.;Pseudolecithobotrys n. g. y Pseudodicrogaster n. g. para Lecithobotrys stomachicola n.comb. y Dicrogaster japonica n. comb., respectivamente. Se presenta una clave deidentificación para los diez géneros de Haploporinae considerados válidos. Métodos deanálisis filogenéticos moleculares han sido aplicados para evaluar el marco taxonómicode Haploporinae basado en la morfología, y su posición sistemática dentro de lafilogenia de los digeneos.
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Contribution of antioxidant enzymes to toxicity assessment in fluvial biofilms

Bonnineau, Chloé 23 June 2011 (has links)
Per tal d’avaluar l’impacte de la contaminació en els ecosistemes aquàtics, aquesta tesi es centra en una aproximació multi-biomarcador en els biofilms. En complement dels biomarcadors clàssics, es va demostrar que les activitats dels enzims antioxidants (AEA): catalasa, ascorbat peroxidasa i glutatió reductasa eren biomarcardors d'estrès oxidatiu en els biofilms. Tot i que les AEA poden veure's influenciades amb la mateixa mesura per factors naturals (edat del biofilm, llum de colonització o d'exposició) i contaminants (herbicides i farmacèutics), aquestes AEA permeten entendre millor l'efecte dels contaminants. Cal remarcar que assajos de toxicitat aguda es poden utilitzar per comparar la capacitat antioxidant entre comunitats i conèixer la seva pre-exposició a l'estrès oxidatiu. Aquesta aproximació multi-biomarcador a nivell de comunitat és especialment interessant per avaluar la toxicitat dels contaminants emergents (β-blockers) sobre espècies no-diana. Per tal de millorar-la, també es va verificar la possibilitat de mesurar l'expressió gènica en biofilms. / To evaluate the impact of contamination on aquatic ecosystem, this thesis focused on a multi-biomarker approach, including molecular biomarkers, in biofilms. To complete the traditional tool-box of biofilm biomarkers, antioxidant enzymes activities (AEA) of catalase, ascorbate peroxidase and glutathione reductase were shown to be biomarkers of oxidative stress in biofilms. Though AEA can be influenced in the same extent by natural factors (biofilm age, colonization or exposure light) and toxicants (herbicides and pharmaceuticals), they provided valuable information to understand the chemicals effects. In particular, short-term toxicity tests are of interest to compare communities capacity to cope with oxidative stress and to know their exposure history to such stress. This multi-biomarker approach at community-level was found to be especially interesting to assess toxicity of emerging pollutants (β-blockers) on non-target communities. To improve this approach, the feasibility of measuring gene expression in biofilms using a functional gene array was also shown.
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Stream biofilm responses to flow intermittency

Timoner Amer, Xisca 05 May 2014 (has links)
Streams experiencing a recurrent non-flow phase (i.e., flow intermittency) are characteristic of world regions with arid and semi-arid climates, where Mediterranean regions are part of. During non-flow streambed sediments, and consequently, microorganisms inhabiting these sediments are exposed to desiccation. These microorganisms, assembled in biofilms, lead a substantial part of the ecosystem processes. They recycle the carbon materials, intervene in the nutrient cycles and are on the base of the food web, fueling energy to the higher trophic levels. The aim of this tesis is to understand how biofilms respond to flow intermittency in order to unravel the consequences of the increasing spatial and temporal extent of flow intermittency, as a consequence of the global change, on the biogeochemical cycles and on the ecosystem functions in temporary streams. Structural and functional biofilm responses were analyzed at the cellular level (algae and bacteria), as well as at the whole biofilm responses (autotrophic vs heterotrophic processes) in two different field studies / Els rius que experimenten una fase sense cabal (intermitència fluvial) són característics de les regions del món amb climes àrids i semi-àrids, com ara les regions de la Mediterrànies. Durant la fase seca es produeix la dessecació de la llera del riu i conseqüentment els microorganismes que creixen sobre aquests sediments estan exposats a la dessecació. El conjunt d’aquests microorganismes es coneix com a biofilm, el qual juga un paper clau en el processament de la matèria orgànica i en els cicles del carboni i nutrients, A més són a la base de la xarxa tròfica aportant energia als nivells tròfics superiors. L'objectiu principal d'aquesta tesi és entendre el funcionament del biofilm quan es dona la fase seca, pas clau per entendre i predir les implicacions que tenen els períodes creixents sense cabal en els cicles biogeoquímics i en el funcionament de l’ecosistema. Les respostes estructurals i funcionals del biofilm des d’un punt de vista cel·lular (algues i bacteris), així com també en el conjunt del biofilm (processos autotròfics i heterotròfics) es van investigar mitjançant dos estudis de camp

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