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Caracterização agromorfológica, adaptabilidade e estabilidade de populações e divergência genética entre linhagens de soja / Agromorphological characterization, adaptability and stability of populations and genetic divergence among lines of soybeanSousa, Iradenia da Silva 12 January 2016 (has links)
Este trabalho objetivou caracterizar e estimar a adaptabilidade e a estabilidade de 24 populações e quantificar a divergência genética entre 480 (20 linhagens x 24 populações) linhagens de soja, por meio de caracteres agromorfológicos. Os experimentos foram conduzidos em três locais (Anhumas, Areão e ESALQ), localizados no município de Piracicaba - SP. Nos anos agrícolas 2007/08, 2008/09, 2009/10 e 2011/12 foram realizados dois experimentos por ano, delineados em blocos ao acaso e constituídos por repetições estratificadas em dois conjuntos experimentais, formados por 12 populações e duas testemunhas comuns (BRS 133 e Monsoy 8001 ou Conquista). Em 2011/12, de cada uma das 24 populações, foram colhidas, trilhadas e pesadas as sementes de 36 plantas individuais; a seguir, foram selecionadas as 20 plantas (linhagens F15:16) mais produtivas para compor os experimentos de 2012/13; em 2013/14, foram avaliadas as linhagens F15:17; foram realizados dois experimentos por ano, no delineamento de blocos aumentados de Federer, estratificando-se as 480 linhagens em 24 conjuntos experimentais; cada conjunto recebeu as 20 linhagens de uma dada população, mais as duas testemunhas comuns (BRS 133 e Monsoy 8001), totalizando 22 parcelas. Em todos os anos agrícolas foram conduzidos dois experimentos vizinhos, um com manejo FAS, que recebeu aplicações sucessivas de fungicidas para controle da ferrugem asiática e outras doenças de fim de ciclo (DFC); e, outro experimento com manejo DFC, no qual foram feitas aplicações de um fungicida que controla as DFC, exceto a ferrugem. Vinte caracteres agromorfológicos foram avaliados e também foram estimadas as taxas de reação à ferrugem baseada na produtividade de grãos (FP) e no tamanho das sementes (FT, representado pelo peso de cem sementes); FP e FT foram estimadas para cada genótipo, calculando-se a diferença entre as médias ajustadas nos manejos DFC e FAS, dividindo-se pela média DFC e multiplicando por 100. Para a análise de adaptabilidade e estabilidade, foram utilizados os métodos de Eberhart e Russel e AMMI. No estudo de divergência genética foi usada a distância Euclidiana Média, e os agrupamentos foram obtidos pelo Método de Tocher. Com exceção da cor do tegumento, uniformemente amarelo, foi observada variabilidade genética para todos os demais 19 caracteres, incluindo-se as FP e FT. A população USP 98-13.009 (P21) destacou-se por apresentar médias relativamente altas para produtividade de grãos e para peso de cem sementes e níveis satisfatórios de tolerância à ferrugem. As metodologias Eberhart & Russel e AMMI foram capazes de identificar populações comuns, com médias elevadas para produtividade de grãos, com estabilidade de produtividade e adaptadas aos 16 ambientes em estudo. Os ambientes, principalmente os locais, foram bem distinguidos pela metodologia AMMI. Na análise de divergência, a variabilidade genética, permitiu a observação de linhagens dissimilares. Foram observados diferentes tipos de agrupamento para os experimentos com manejo de doenças (manejos FAS, DFC e combinação FAS + DFC), o que pode ser explicado pela interação genótipos x anos. O agrupamento realizado com os dados obtidos nos experimentos combinados dos manejos (FAS + DFC) foi o mais conciso e adequado com a dissimilaridade entre as linhagens. / This work aimed to characterize and to estimate adaptability and stability of 24 populations, besides to quantify the genetic divergence between 480 (20 lines x 24 populations) lines of soybean, through agromorphological characters. The experiments were conducted in three locations (Anhumas, Areão, ESALQ), located in Piracicaba - SP. In the crop years 2007/08, 2008/09, 2009/10 and 2011/12, were performed two experiments per year in randomized complete block design, consisting of replications stratified in two experimental sets, constituted by 12 populations and two common checks (BRS 133 and Monsoy 8001 or Conquista). In 2011/12, in each of the 24 populations were harvested, trashed and weighted the seeds of 36 individual plants; then, the most productive 20 plants were selected for obtaining F15:16 lines and composing the experiments of 2012/13; in 2013/14, were evaluated the F15:17 lines. There were conducted two experiments per year designed in augmented block of Federer, by stratifying the 480 soybean lines in 24 experimental sets. Each set consisted of 20 lines of a given population and two common checks (BRS 133 and Monsoy 8001), totaling 22 plots. In each year, there were conducted two experiments, one with FAS management which received successive applications of fungicides for controlling the Asian soybean rust and other late season leaf diseases (DFC); the other experiment received the DFC management in which it was made applications of a fungicide to control the DFC, except rust. Twenty agromorphological characters were evaluated and also estimated the rate of reaction to rust based on seed yield (FP) and seed size (FT, represented by the weight of one hundred seeds or PCS); FP and FT were estimated for each genotype, by calculating the difference between the adjusted means in DFC and FAS managements, dividing by DFC mean and multiplying by 100. For the analysis of adaptability and stability were used Eberhart & Russell and AMMI methods. In the study of genetic divergence was used the Average Mean Euclidean distance, and the clusters was obtained by Tocher method. With exception of color of seed coat, with an uniform yellow color, it was observed genetic variability for the other 19 traits, including FP and FT. The USP 98-13.009 (P21) population highlighted by present relatively high averages for seed yield and weight of one hundred seeds, besides the satisfactory levels of rust tolerance. Both methodologies, Eberhart & Russell and AMMI, were able to identify common populations with high means of seed yield, yield stability and adaptation to of the 16 environments in study. The environments, mainly locations, were well distinguished by the AMMI methodology. In the divergence analysis, the genetic variability allowed the observation of dissimilar lines. Different types of clusters were observed for disease managements (FAS, DFC, and FAS + DFC) which could be explained by the genotypes x years interaction. The grouping performed with the combination FAS + DFC data was the more concise and appropriate to estimate the dissimilarity among lines.
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Alternativas de análise para experimentos G × E multiatributo / Alternatives of analysis of G×E trials multi-attributePeña, Marisol Garcia 04 February 2016 (has links)
Geralmente, nos experimentos genótipo por ambiente (G × E) é comum observar o comportamento dos genótipos em relação a distintos atributos nos ambientes considerados. A análise deste tipo de experimentos tem sido abordada amplamente para o caso de um único atributo. Nesta tese são apresentadas algumas alternativas de análise considerando genótipos, ambientes e atributos simultaneamente. A primeira, é baseada no método de mistura de máxima verossimilhança de agrupamento - Mixclus e a análise de componentes principais de 3 modos - 3MPCA, que permitem a análise de tabelas de tripla entrada, estes dois métodos têm sido muito usados na área da psicologia e da química, mas pouco na agricultura. A segunda, é uma metodologia que combina, o modelo de efeitos aditivos com interação multiplicativa - AMMI, modelo eficiente para a análise de experimentos (G × E) com um atributo e a análise de procrustes generalizada, que permite comparar configurações de pontos e proporcionar uma medida numérica de quanto elas diferem. Finalmente, é apresentada uma alternativa para realizar imputação de dados nos experimentos (G × E), pois, uma situação muito frequente nestes experimentos, é a presença de dados faltantes. Conclui-se que as metodologias propostas constituem ferramentas úteis para a análise de experimentos (G × E) multiatributo. / Usually, in the experiments genotype by environment (G×E) it is common to observe the behaviour of genotypes in relation to different attributes in the environments considered. The analysis of such experiments have been widely discussed for the case of a single attribute. This thesis presents some alternatives of analysis, considering genotypes, environments and attributes simultaneously. The first, is based on the mixture maximum likelihood method - Mixclus and the three-mode principal component analysis, these two methods have been very used in the psychology and chemistry, but little in agriculture. The second, is a methodology that combines the additive main effects and multiplicative interaction models - AMMI, efficient model for the analysis of experiments (G×E) with one attribute, and the generalised procrustes analysis, which allows compare configurations of points and provide a numerical measure of how much they differ. Finally, an alternative to perform data imputation in the experiments (G×E) is presented, because, a very frequent situation in these experiments, is the presence of missing values. It is concluded that the proposed methodologies are useful tools for the analysis of experiments (G×E) multi-attribute.
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Adaptabilidade e estabilidade de progênies de soja tipo hortaliça nos estádios R6 e R8 em gerações avançadas de endogamia / Adaptability and stability of vegetable soybean (edamame) progenies in R6 and R8 stages and advanced generations of inbreedingNelson Enrique Casas Leal 03 March 2015 (has links)
A soja é um dos alimentos mais completos conhecidos pelo homem. A soja hortaliça ou \"edamame\" pertence à mesma espécie da soja cultivada para grãos, Glycine max (L.) Merrill. Edamame é um nome de origem japonesa usado para um tipo de soja consumida no estádio imaturo R6 e, também, caracterizada por terem vagens e grãos de tamanho grande, melhor textura e sabor. Apresenta grande potencial nutracêutico, favorecendo a manutenção da saúde e a redução dos riscos de diversas doenças crônicas. Os principais objetivos deste trabalho foram: a) estimar parâmetros genéticos úteis ao melhoramento, especialmente a interação genótipos x ambientes; b) avaliar adaptabilidade e estabilidade dos genótipos e a representatividade de ambientes; c) caracterizar os cruzamentos e suas progênies visando-se à extração de linhagens superiores. Os genótipos compreendem 42 progênies nas gerações F6:10 a F6:13 de 23 cruzamentos e três testemunhas (BRS 257, BRS 267 e IAC 100). As avaliações experimentais foram feitas em dois estádios de desenvolvimento, soja imatura R6 (dois anos agrícolas, 2011/12 e 2012/13) e soja matura R8 (quatro anos agrícolas, de 2009/10 a 2012/13). Os quatro anos agrícolas e três locais (Anhumas, Areão e ESALQ) foram combinados em nove ambientes. Em cada ambiente foram realizados dois experimentos envolvendo manejos distintos de fungicidas; no primeiro experimento foram feitas aplicações sucessivas de fungicidas para controle da ferrugem asiática da soja (FAS) e das doenças de final de ciclo (DFC), enquanto que no segundo experimento foram aplicados fungicidas para controle somente das DFC. Cada experimento foi delineado em blocos ao acaso, com três repetições. Cada repetição foi estratificada em dois conjuntos experimentais com testemunhas comuns, cada um deles conformando um bloco aumentado de Federer. A parcela experimental foi uma fileira com 5 metros x 0,50 m. As fontes de variação \"anos\", \"locais\" e \"fungicidas\" contribuíram significativamente na interação entre genótipos e ambientes, em ambos os estádios R6 e R8. Para a produtividade de vagens (PV) em R6, o método de Eberhart e Russell destacou quatro cruzamentos (19-005: USP 98-06.005 x J-75, 19-006: USP 98-06.005 x Hakucho, 19-045: USP 98-06.031 x Hakucho e 19-111: USP 98-06.029 x OCEPAR-4), gerando 15 progênies (destaques para 19-045-03-01 e 19-111-02-06) com alto potencial para uso como genitores e ou cultivares. A análise AMMI revelou que a grande maioria dos genótipos mostraram-se estáveis e com PV em torno de 150 g/2plantas. O maior destaque ficou com a progênie 19-111-01-09, com desempenho muito favorável para os caracteres de R6, alta produtividade de grãos (PG) e tolerância à ferrugem em R8. Para o estádio R8, o efeito de locais determinou que Areão foi o melhor local, para PG e peso de cem sementes (PSC). Para o estádio R6, o efeito de anos indicou que o ano agrícola 2012/13 foi o que mais favoreceu o desempenho das progênies para todos os caracteres. Foram detectadas correlações altas e significativas entre os caracteres PCS em R8 e peso de cem vagens em R6 (0,808**), bem como entre PCS e largura das vagens em R6 (0,725**). / Soybean is one of the most complete food known by the human being. The vegetable soybean or \"edamame\" belongs to the same species of the soybean cultivated as commodity, Glycine max (L.) Merrill. Edamame is a name with Japanese origin used for maintenance and reduction of the risks of several chronic diseases. The main objectives of this study were: a) to estimate useful genetic parameters to the breeding program of soybean vegetable, specially the genotype x environment interaction; b) to evaluate adaptability and stability of the genotypes and the representativeness of the environments; c) to characterize crosses and their progenies aiming the extraction of superior inbred lines. The genotypes corresponded to 23 crosses and their 42 progenies in advanced generations of inbreeding, that is from F6:10 to F6:13 generation, besides three common checks (BRS 257, BRS 267, and IAC 100). They were evaluated in two developmental stages, immature R6 and mature R8 soybean, during two (2011/12 and 2012/13) and four (2009/10 to 2012/13) growing seasons, respectively. The four crop years and three locations (Anhumas, Areão and ESALQ) were combined in nine environments. In each environment, there were carried out two experiments involving two fungicide managements; in the first experiment, there were made successive fungicide applications for controlling Asian soybean rust (FAS) and late season leaf diseases (DFC), whereas in the second experiment there were made fungicide applications for controlling only DFC. Each experiment was designed in a randomized complete-block design with three replications. Each repetition was divided into two experimental sets with common checks, forming an augmented design (Federer). The experimental plot was a row with 5 m x 0.50 m. The \"crop years\", \"locations\" and \"fungicides\" contributed significantly to the genotypes x environments interactions in both R6 and R8 stages. For pod yield (PV) in the R6 stage, the Eberhart and Russell method highlighted four crossings (19-005: USP 98-06005 x J-75, 19- 006: USP 98-06005 x Hakucho, 19-045: USP 98-06031 x Hakucho and 19 -111: USP 98- 06029 OCEPAR-4), generating 15 progenies (especially the numbers 19-045-03-01 and 19- 111-02-06) with the highest potential to be used as parents and or as new cultivars. The biggest highlight was the progeny 19-111-01-09, with very favorable performance for R6 traits, high seed yield (PG) and tolerance to rust in R8. The AMMI analysis revealed that almost all genotypes were stable and with PV around 150 g/2plants. For the R8 stage, the location effect determined that Areão was the best location for PG and one hundred seed weight (PCS). For the R6 stage, the year effect indicated that the crop year 2012/13 was the most favorable for the progeny performance for all traits. There were estimated highly significant correlation between PCS in R8 and one hundred pod weight in R6 (0.808 **), as well as between PCS and pod width in R6 stage (0.725**).
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Adaptabilidade e estabilidade de progênies de soja tipo hortaliça nos estádios R6 e R8 em gerações avançadas de endogamia / Adaptability and stability of vegetable soybean (edamame) progenies in R6 and R8 stages and advanced generations of inbreedingLeal, Nelson Enrique Casas 03 March 2015 (has links)
A soja é um dos alimentos mais completos conhecidos pelo homem. A soja hortaliça ou \"edamame\" pertence à mesma espécie da soja cultivada para grãos, Glycine max (L.) Merrill. Edamame é um nome de origem japonesa usado para um tipo de soja consumida no estádio imaturo R6 e, também, caracterizada por terem vagens e grãos de tamanho grande, melhor textura e sabor. Apresenta grande potencial nutracêutico, favorecendo a manutenção da saúde e a redução dos riscos de diversas doenças crônicas. Os principais objetivos deste trabalho foram: a) estimar parâmetros genéticos úteis ao melhoramento, especialmente a interação genótipos x ambientes; b) avaliar adaptabilidade e estabilidade dos genótipos e a representatividade de ambientes; c) caracterizar os cruzamentos e suas progênies visando-se à extração de linhagens superiores. Os genótipos compreendem 42 progênies nas gerações F6:10 a F6:13 de 23 cruzamentos e três testemunhas (BRS 257, BRS 267 e IAC 100). As avaliações experimentais foram feitas em dois estádios de desenvolvimento, soja imatura R6 (dois anos agrícolas, 2011/12 e 2012/13) e soja matura R8 (quatro anos agrícolas, de 2009/10 a 2012/13). Os quatro anos agrícolas e três locais (Anhumas, Areão e ESALQ) foram combinados em nove ambientes. Em cada ambiente foram realizados dois experimentos envolvendo manejos distintos de fungicidas; no primeiro experimento foram feitas aplicações sucessivas de fungicidas para controle da ferrugem asiática da soja (FAS) e das doenças de final de ciclo (DFC), enquanto que no segundo experimento foram aplicados fungicidas para controle somente das DFC. Cada experimento foi delineado em blocos ao acaso, com três repetições. Cada repetição foi estratificada em dois conjuntos experimentais com testemunhas comuns, cada um deles conformando um bloco aumentado de Federer. A parcela experimental foi uma fileira com 5 metros x 0,50 m. As fontes de variação \"anos\", \"locais\" e \"fungicidas\" contribuíram significativamente na interação entre genótipos e ambientes, em ambos os estádios R6 e R8. Para a produtividade de vagens (PV) em R6, o método de Eberhart e Russell destacou quatro cruzamentos (19-005: USP 98-06.005 x J-75, 19-006: USP 98-06.005 x Hakucho, 19-045: USP 98-06.031 x Hakucho e 19-111: USP 98-06.029 x OCEPAR-4), gerando 15 progênies (destaques para 19-045-03-01 e 19-111-02-06) com alto potencial para uso como genitores e ou cultivares. A análise AMMI revelou que a grande maioria dos genótipos mostraram-se estáveis e com PV em torno de 150 g/2plantas. O maior destaque ficou com a progênie 19-111-01-09, com desempenho muito favorável para os caracteres de R6, alta produtividade de grãos (PG) e tolerância à ferrugem em R8. Para o estádio R8, o efeito de locais determinou que Areão foi o melhor local, para PG e peso de cem sementes (PSC). Para o estádio R6, o efeito de anos indicou que o ano agrícola 2012/13 foi o que mais favoreceu o desempenho das progênies para todos os caracteres. Foram detectadas correlações altas e significativas entre os caracteres PCS em R8 e peso de cem vagens em R6 (0,808**), bem como entre PCS e largura das vagens em R6 (0,725**). / Soybean is one of the most complete food known by the human being. The vegetable soybean or \"edamame\" belongs to the same species of the soybean cultivated as commodity, Glycine max (L.) Merrill. Edamame is a name with Japanese origin used for maintenance and reduction of the risks of several chronic diseases. The main objectives of this study were: a) to estimate useful genetic parameters to the breeding program of soybean vegetable, specially the genotype x environment interaction; b) to evaluate adaptability and stability of the genotypes and the representativeness of the environments; c) to characterize crosses and their progenies aiming the extraction of superior inbred lines. The genotypes corresponded to 23 crosses and their 42 progenies in advanced generations of inbreeding, that is from F6:10 to F6:13 generation, besides three common checks (BRS 257, BRS 267, and IAC 100). They were evaluated in two developmental stages, immature R6 and mature R8 soybean, during two (2011/12 and 2012/13) and four (2009/10 to 2012/13) growing seasons, respectively. The four crop years and three locations (Anhumas, Areão and ESALQ) were combined in nine environments. In each environment, there were carried out two experiments involving two fungicide managements; in the first experiment, there were made successive fungicide applications for controlling Asian soybean rust (FAS) and late season leaf diseases (DFC), whereas in the second experiment there were made fungicide applications for controlling only DFC. Each experiment was designed in a randomized complete-block design with three replications. Each repetition was divided into two experimental sets with common checks, forming an augmented design (Federer). The experimental plot was a row with 5 m x 0.50 m. The \"crop years\", \"locations\" and \"fungicides\" contributed significantly to the genotypes x environments interactions in both R6 and R8 stages. For pod yield (PV) in the R6 stage, the Eberhart and Russell method highlighted four crossings (19-005: USP 98-06005 x J-75, 19- 006: USP 98-06005 x Hakucho, 19-045: USP 98-06031 x Hakucho and 19 -111: USP 98- 06029 OCEPAR-4), generating 15 progenies (especially the numbers 19-045-03-01 and 19- 111-02-06) with the highest potential to be used as parents and or as new cultivars. The biggest highlight was the progeny 19-111-01-09, with very favorable performance for R6 traits, high seed yield (PG) and tolerance to rust in R8. The AMMI analysis revealed that almost all genotypes were stable and with PV around 150 g/2plants. For the R8 stage, the location effect determined that Areão was the best location for PG and one hundred seed weight (PCS). For the R6 stage, the year effect indicated that the crop year 2012/13 was the most favorable for the progeny performance for all traits. There were estimated highly significant correlation between PCS in R8 and one hundred pod weight in R6 (0.808 **), as well as between PCS and pod width in R6 stage (0.725**).
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Alternativas de análise para experimentos G × E multiatributo / Alternatives of analysis of G×E trials multi-attributeMarisol Garcia Peña 04 February 2016 (has links)
Geralmente, nos experimentos genótipo por ambiente (G × E) é comum observar o comportamento dos genótipos em relação a distintos atributos nos ambientes considerados. A análise deste tipo de experimentos tem sido abordada amplamente para o caso de um único atributo. Nesta tese são apresentadas algumas alternativas de análise considerando genótipos, ambientes e atributos simultaneamente. A primeira, é baseada no método de mistura de máxima verossimilhança de agrupamento - Mixclus e a análise de componentes principais de 3 modos - 3MPCA, que permitem a análise de tabelas de tripla entrada, estes dois métodos têm sido muito usados na área da psicologia e da química, mas pouco na agricultura. A segunda, é uma metodologia que combina, o modelo de efeitos aditivos com interação multiplicativa - AMMI, modelo eficiente para a análise de experimentos (G × E) com um atributo e a análise de procrustes generalizada, que permite comparar configurações de pontos e proporcionar uma medida numérica de quanto elas diferem. Finalmente, é apresentada uma alternativa para realizar imputação de dados nos experimentos (G × E), pois, uma situação muito frequente nestes experimentos, é a presença de dados faltantes. Conclui-se que as metodologias propostas constituem ferramentas úteis para a análise de experimentos (G × E) multiatributo. / Usually, in the experiments genotype by environment (G×E) it is common to observe the behaviour of genotypes in relation to different attributes in the environments considered. The analysis of such experiments have been widely discussed for the case of a single attribute. This thesis presents some alternatives of analysis, considering genotypes, environments and attributes simultaneously. The first, is based on the mixture maximum likelihood method - Mixclus and the three-mode principal component analysis, these two methods have been very used in the psychology and chemistry, but little in agriculture. The second, is a methodology that combines the additive main effects and multiplicative interaction models - AMMI, efficient model for the analysis of experiments (G×E) with one attribute, and the generalised procrustes analysis, which allows compare configurations of points and provide a numerical measure of how much they differ. Finally, an alternative to perform data imputation in the experiments (G×E) is presented, because, a very frequent situation in these experiments, is the presence of missing values. It is concluded that the proposed methodologies are useful tools for the analysis of experiments (G×E) multi-attribute.
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Caracterização agromorfológica, adaptabilidade e estabilidade de populações e divergência genética entre linhagens de soja / Agromorphological characterization, adaptability and stability of populations and genetic divergence among lines of soybeanIradenia da Silva Sousa 12 January 2016 (has links)
Este trabalho objetivou caracterizar e estimar a adaptabilidade e a estabilidade de 24 populações e quantificar a divergência genética entre 480 (20 linhagens x 24 populações) linhagens de soja, por meio de caracteres agromorfológicos. Os experimentos foram conduzidos em três locais (Anhumas, Areão e ESALQ), localizados no município de Piracicaba - SP. Nos anos agrícolas 2007/08, 2008/09, 2009/10 e 2011/12 foram realizados dois experimentos por ano, delineados em blocos ao acaso e constituídos por repetições estratificadas em dois conjuntos experimentais, formados por 12 populações e duas testemunhas comuns (BRS 133 e Monsoy 8001 ou Conquista). Em 2011/12, de cada uma das 24 populações, foram colhidas, trilhadas e pesadas as sementes de 36 plantas individuais; a seguir, foram selecionadas as 20 plantas (linhagens F15:16) mais produtivas para compor os experimentos de 2012/13; em 2013/14, foram avaliadas as linhagens F15:17; foram realizados dois experimentos por ano, no delineamento de blocos aumentados de Federer, estratificando-se as 480 linhagens em 24 conjuntos experimentais; cada conjunto recebeu as 20 linhagens de uma dada população, mais as duas testemunhas comuns (BRS 133 e Monsoy 8001), totalizando 22 parcelas. Em todos os anos agrícolas foram conduzidos dois experimentos vizinhos, um com manejo FAS, que recebeu aplicações sucessivas de fungicidas para controle da ferrugem asiática e outras doenças de fim de ciclo (DFC); e, outro experimento com manejo DFC, no qual foram feitas aplicações de um fungicida que controla as DFC, exceto a ferrugem. Vinte caracteres agromorfológicos foram avaliados e também foram estimadas as taxas de reação à ferrugem baseada na produtividade de grãos (FP) e no tamanho das sementes (FT, representado pelo peso de cem sementes); FP e FT foram estimadas para cada genótipo, calculando-se a diferença entre as médias ajustadas nos manejos DFC e FAS, dividindo-se pela média DFC e multiplicando por 100. Para a análise de adaptabilidade e estabilidade, foram utilizados os métodos de Eberhart e Russel e AMMI. No estudo de divergência genética foi usada a distância Euclidiana Média, e os agrupamentos foram obtidos pelo Método de Tocher. Com exceção da cor do tegumento, uniformemente amarelo, foi observada variabilidade genética para todos os demais 19 caracteres, incluindo-se as FP e FT. A população USP 98-13.009 (P21) destacou-se por apresentar médias relativamente altas para produtividade de grãos e para peso de cem sementes e níveis satisfatórios de tolerância à ferrugem. As metodologias Eberhart & Russel e AMMI foram capazes de identificar populações comuns, com médias elevadas para produtividade de grãos, com estabilidade de produtividade e adaptadas aos 16 ambientes em estudo. Os ambientes, principalmente os locais, foram bem distinguidos pela metodologia AMMI. Na análise de divergência, a variabilidade genética, permitiu a observação de linhagens dissimilares. Foram observados diferentes tipos de agrupamento para os experimentos com manejo de doenças (manejos FAS, DFC e combinação FAS + DFC), o que pode ser explicado pela interação genótipos x anos. O agrupamento realizado com os dados obtidos nos experimentos combinados dos manejos (FAS + DFC) foi o mais conciso e adequado com a dissimilaridade entre as linhagens. / This work aimed to characterize and to estimate adaptability and stability of 24 populations, besides to quantify the genetic divergence between 480 (20 lines x 24 populations) lines of soybean, through agromorphological characters. The experiments were conducted in three locations (Anhumas, Areão, ESALQ), located in Piracicaba - SP. In the crop years 2007/08, 2008/09, 2009/10 and 2011/12, were performed two experiments per year in randomized complete block design, consisting of replications stratified in two experimental sets, constituted by 12 populations and two common checks (BRS 133 and Monsoy 8001 or Conquista). In 2011/12, in each of the 24 populations were harvested, trashed and weighted the seeds of 36 individual plants; then, the most productive 20 plants were selected for obtaining F15:16 lines and composing the experiments of 2012/13; in 2013/14, were evaluated the F15:17 lines. There were conducted two experiments per year designed in augmented block of Federer, by stratifying the 480 soybean lines in 24 experimental sets. Each set consisted of 20 lines of a given population and two common checks (BRS 133 and Monsoy 8001), totaling 22 plots. In each year, there were conducted two experiments, one with FAS management which received successive applications of fungicides for controlling the Asian soybean rust and other late season leaf diseases (DFC); the other experiment received the DFC management in which it was made applications of a fungicide to control the DFC, except rust. Twenty agromorphological characters were evaluated and also estimated the rate of reaction to rust based on seed yield (FP) and seed size (FT, represented by the weight of one hundred seeds or PCS); FP and FT were estimated for each genotype, by calculating the difference between the adjusted means in DFC and FAS managements, dividing by DFC mean and multiplying by 100. For the analysis of adaptability and stability were used Eberhart & Russell and AMMI methods. In the study of genetic divergence was used the Average Mean Euclidean distance, and the clusters was obtained by Tocher method. With exception of color of seed coat, with an uniform yellow color, it was observed genetic variability for the other 19 traits, including FP and FT. The USP 98-13.009 (P21) population highlighted by present relatively high averages for seed yield and weight of one hundred seeds, besides the satisfactory levels of rust tolerance. Both methodologies, Eberhart & Russell and AMMI, were able to identify common populations with high means of seed yield, yield stability and adaptation to of the 16 environments in study. The environments, mainly locations, were well distinguished by the AMMI methodology. In the divergence analysis, the genetic variability allowed the observation of dissimilar lines. Different types of clusters were observed for disease managements (FAS, DFC, and FAS + DFC) which could be explained by the genotypes x years interaction. The grouping performed with the combination FAS + DFC data was the more concise and appropriate to estimate the dissimilarity among lines.
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Estratégias para o posicionamento de genótipos de trigo visando a produção de sementes de alta performance / Strategies for the positioning of wheat genotypes aiming the production of high performance seedsSzareski, Vinícius Jardel 06 April 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-04-06 / O presente estudo constou de dois experimentos onde teve como objetivo estimar a adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos de trigo para o caráter produção de sementes através de técnicas univariadas, multivariadas e modelos mistos, assim como, empregar um índice fenotípico de vigor das sementes (IFV) e proceder a adaptabilidade e estabilidade multicaráter para o vigor das sementes de trigo produzidas em regiões do Estado do Rio Grande do Sul. O primeiro estudo foi constituído de 42 genótipos de trigo cultivados em cinco ambientes, durante duas safras agrícolas. No segundo, foram utilizadas sementes de 30 genótipos cultivados em sete ambientes de cultivo. Em ambos estudos utilizou-se delineamento de blocos ao acaso organizado em esquema fatorial. Os dados foram submetidos às análises de adaptabilidade e estabilidade pelos métodos de Annicchiarico (1992), AMMI (Additive main effects and multiplicative interaction analysis), MHVG (média harmônica dos valores genotípicos), PRVG (adaptabilidade dos valores genotípicos) e MHPRVG (adaptabilidade e estabilidade através da média harmônica da performance relativa dos valores genotípicos) assim como foram aplicados os método baseado na máxima verossimilhança restrita (REML) e as predições foram obtidas pelo melhor preditor não viesado (BLUP). Verificou-se no primeiro estudo como ambientes favoráveis expressos pelo método univariado São Gabriel (I e II), Cachoeira do Sul (II), Passo Fundo (II) Santo Augusto (II) e São Luiz Gonzaga (II), para o método multivariado apenas Santo Augusto (I). Os genótipos CD 121 e TBIO Tibagi foram adaptados especificamente e estáveis pelos métodos univariado e multivariado. Os genótipos TBIO Sinuelo, Quartzo, BRS 327, Mirante, Topázio, Guamirim, TBIO Seleto, Ametista, TBIO Mestre e BRS Louro foram superiores através da abordagem por modelos mistos. No segundo estudo o método de AMMI expressa estabilidade específica ao ambiente de cultivo Cachoeira do Sul - RS para os genótipos Marfim e Marcante. Determina adaptabilidade específica aos genótipos ORS 1403, TBIO Sossego, Estrela Atria, ORS Vintecinco, ORS 1401, Esporão, LG Prisma, CD 1440, BRS 331, Celebra e TBIO Mestre para o índice fenotípico de vigor das sementes de trigo. A máxima verossimilhança restrita define que 51,8% do índice fenotípico de vigor das sementes é decorrente da interação genótipo x ambiente. / The present study consisted of two experiments that aimed to estimate the adaptability and phenotypic stability of wheat genotypes for the grain yield character through univariate, multivariate and mixed models, as well as to use a seed vigor phenotype index (IFV) and to proceed adaptability and multicarter stability for the vigor of wheat seeds produced in the state of Rio Grande do Sul. The first study consisted of 42 wheat genotypes grown in five environments during two crop seasons. For the second one, seeds from 30 wheat genotypes grown in seven growing environments were used. In both studies, a randomized block design was arranged in a factorial scheme. The data were submitted to the analyzes of adaptability and stability by the methods of Annicchiarico (1992), AMMI (Additive main effects and multiplicative interaction analysis), MHVG (the armonic mean no of the genotypic values), PRVG (adaptability of genotypic values) and MHPRVG (adaptability and stability through the harmonic mean relative performance of the genotypic values), as well as the methods based on the maximum restricted likelihood (REML) and the predictions were obtained by the best linear unibased predictor (BLUP). For the first study it was verified that the favorable environments expressed by the univariate method refer to São Gabriel (I and II), Cachoeira do Sul (II), Passo Fundo (II) and Santo Augusto (II) and São Luiz Gonzaga , for the multivariate method, only Santo Augusto (I) was favorable for wheat grain yield. The genotypes CD 121 and TBIO Tibagi were specifically adapted and stable by univariate and multivariate methods. The genotypes TBIO Sinuelo, Quartzo, BRS 327, Mirante, Topázio, Guamirim, TBIO Seleto, Amethyst, TBIO Mestre and BRS Louro were superior through the mixed models approach. In the second study the AMMI method expresses specific stability to the cultivation environment Cachoeira do Sul for the genotypes Marfim and Marcante. It determines specific adaptability to genotypes ORS 1403, TBIO Sossego, Estrela Atria, ORS Vintecinco, ORS 1401, Esporão, LG Prisma, CD 1440, BRS 331, Celebra and TBIO Master for the phenotype index of vigor of wheat seeds. The restricted maximum likelihood defines that 51,8% of the seed vigor phenotype index is due to the interaction genotypes x environments.
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"Seizing The Power to Define!" Afrocentric Inquiry and the African Hebrew Israelites of JerusalemYehudah, Miciah Z. January 2014 (has links)
Seizing the Power to Define!" Afrocentric Inquiry and the African Hebrew Israelites of Jerusalem Miciah Z. Yehudah Doctoral Dissertation Doctoral Committee Advisory Chair: Iyelli Ichile; Ph.D. Temple University, Philadelphia Pennsylvania, United States of America This dissertation critically examines the African Hebrew Israelites of Jerusalem, a group of African American Hebrews from Chicago that migrated to Liberia in 1967 and Israel in 1969. The greater part of the scholarship engaging the group since 1967 has consistently labeled them along four lines: as a people seeking constant external acceptance; as a cultic or "new religious movement"; as an oppressed and downtrodden people seeking success in any way in which it could be achieved; or as a people with a strange affinity towards Jewish people so extreme that they intend not only to emulate and eradicate them but to serve as their replacements. In the literature reviewed it was rare that the actual philosophy of the African Hebrew Israelites of Jerusalem was interrogated. In the rare cases in which their philosophies were examined they were situated only in regards to their relationship with an already assumed universal White normativity. In studying the group, methodological concerns arise, as do questions with regards to who the African Hebrew Israelites of Jerusalem truly are. To investigate the methodological parameters of studying the African Hebrew Israelites of Jerusalem the Afrocentric Paradigm is employed. Afrocentric inquiry's focus on agency and the privileging of the voice of the African subjects within its own narrative differs drastically from the methodology underlying those scholars that have studied the group previously. In order to explore who the African Hebrew Israelites of Jerusalem identify with (orientation), how they navigate the issue of epistemology as both a people of African and Israelite heritage (grounding), and how they define freedom and its parameters in conversation with the larger African world they claim to be amongst (location) this dissertation analyzes major publications of the African Hebrew Israelites of Jerusalem since the 1980s. This work challenges the argument that the Afrocentric Paradigm is ill suited to appropriately study the African Hebrew Israelites of Jerusalem. / African American Studies
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Contribution à l'étude des P450 impliqués dans la biosynthèse des furocoumarines / Study of P450 involved in furocoumarin biosynthesisLarbat, Romain 30 May 2006 (has links)
Les furocoumarines sont des phytoalexines offrant un potentiel thérapeutique important. Les travaux présentés ici portent sur les cytochromes P450 participant à leur voie de biosynthèse. Une étude «structure-fonction» de la cinnamate-4-hydroxylase (C4H) a été réalisée pour identifier les déterminants de la faible sensibilité de la C4H de Ruta graveolens (CYP73A32) au psoralène. Deux régions protéiques semblent impliquées dans l’inactivation différentielle entre CYP73A32 et CYP73A1. L’une, entre les résidus 31 et 58, est responsable de l’affinité pour le psoralène. L’autre, entre les résidus 229 et 379, contrôle la vitesse d’inactivation. La caractérisation de nouveaux P450 de la biosynthèse des furocoumarines a été entreprise. D’une part, plusieurs ADNc partiels ont été clonés chez Ruta graveolens. D’autre part, CYP71AJ1 isolé chez Ammi majus, a été caractérisé comme étant une psoralène synthase. La spécificité de CYP71AJ1 pour la marmésine a été approchée par l’étude d’un modèle 3D. Mots clés : cytochrome P450, psoralène synthase, cinnamate-4-Hydroxylase, C4H, métabolite secondaire, Ruta graveolens, Ammi majus, inactivation autocatalytique, furocoumarines, psoralène, (+)-marmésine, Modélisation 3D, (+)-columbianetine / Furocoumarins are phytoalexins known as efficient therapeutic agents. The work reported here focuses on cytochromes P450 involved in their biosynthesis pathway. A “structure-function” study was realized to understand how C4H from Ruta graveolens (CYP73A32) can resist to psoralen mechanism-based inactivation. Two parts of the protein seems involved in the differential susceptibility of CYP73A32 and CYP73A1 to psoralen. The first, between amino acids 31 and 58, defines differential affinity to psoralen. The second between residues 229 and 379 controls inactivation kinetic. The second part of this work was devoted to cloning and identification of new P450 involved in furocoumarin biosynthesis. On the one hand, several partial cDNA were cloned from Ruta graveolens. On the other hand, CYP71AJ1, cloned from Ammi majus, was identified as a psoralen synthase. The specificity of CYP71AJ1 for marmesin was approached by the study of a 3D model.
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