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Interruption de la communication bactérienne dans la rhizosphère par la dégradation enzymatique des signaux quorum sensing / Disruption of bacterial communication in rhizosphere by enzymatic degradation of quorum sensing signals

Tannières, Mélanie 23 March 2012 (has links)
L’identification, chez divers organismes, d’enzymes de dégradation des N-acyl homosérineslactones (NAHLs) impliquées dans la signalisation QS pose la question de leurs rôles dans lesinteractions bactéries-eucaryotes. Dans une première partie, une synthèse bibliographique analyse lesconnaissances acquises sur ces enzymes dégradant les NAHLs. Dans une seconde partie, la croissancedes bactéries dégradant les signaux NAHLs a été stimulée par l’application de g-caprolactone (GCL)dans la rhizosphère de plants de pommes de terre à des fins de phytoprotection. L’effet de cetraitement sur la diversité des communautés bactériennes rhizosphériques a été évalué en combinantdifférentes approches d’écologie microbienne moléculaire comme la DGGE, le pyroséquençaged’amplicons rrs, et la métagénomique fonctionnelle. Cette dernière approche appliquée à une banquede 30 000 clones environ a conduit à l’identification d’un gène qsdB codant la dégradation des signauxNAHL. Ce travail révèle ainsi l’existence d’une nouvelle classe d’enzymes de dégradation des NAHLsappartenant à la famille des enzymes possédant une signature amidase (AS) dont des membres sontpar ailleurs impliqués dans la dégradation de composés xénobiotiques. Dans une troisième partie, unsystème expérimental a été développé afin de mesurer le transfert conjugatif du plasmide de virulenceTi (tumor inducing) chez des dérivés du pathogène Agrobacterium tumefaciens, appelés «tricheurs»,incapables de produire des signaux NAHLs mais utilisateurs de ceux produits par les autres bactéries.Ce modèle a permis de montrer l’effet modérateur de lactonases dégradant les NAHLs exprimées chezdes agrobactéries produisant les NAHLs, chez des bactéries réceptrices du plasmide Ti, ou des planteshôtes des agrobactéries sur le transfert conjugatif initié par les tricheurs. L’ensemble de ce travailrévèle à la fois une nouvelle famille d’enzymes impliquées dans la dégradation des NAHLs, ainsiqu’un nouveau rôle de ces enzymes dans la modulation des flux de gènes entre bactériesphytopathogènes en interaction avec une plante hôte. / Identification of bacterial and eukaryotic enzymes that degrade N-acyl homoserine lactones(NAHLs) involved in QS signaling raises the question of their roles in bacteria-eucaryotesinteractions. In a first part of this study, a bibliographic report analyzes the current data on thoseNAHL-degrading enzymes. In a second part, the growth of NAHL-degrading bacteria was stimulatedby g-caprolactone (GCL) amendment in potato rhizosphere to protect this plant against the soft-rotpathogen Pectobacterium. The effect of the GCL treatment on rhizospheric bacterial communities wasevaluated by a combination of different molecular microbial ecology techniques such as DGGE,pyrosequencing and functional metagenomic. This last approach was applied to generate ametagenomic library of ca. 30,000 clones and lead to the identification of the qsdB gene that encodesNAHL degradation, This work revealed the occurrence of a novel class of NAHL-degrading enzymesthat belong to the amidase signature (AS) family, some members of which being involved inxenobiotic compound degradation. In a third part, an experimental system was developed to measurethe conjugative transfer of Ti plasmid in various strains of the pathogen Agrobacterium tumefaciens,including “cheaters”, i.e. bacteria unable to produce NAHL signals but capable to use signals producedby other bacteria. Using this model; variations of the plasmid transfer of cheaters were measured whenNAHL-degrading lactonases were expressed in agrobacteria that produce NAHL signals, in recipientbacteria of Ti plasmid, or in agrobacterial host plant. Taken together, thesis experiments revealed anovel class of enzymes involved in NAHL-degradation and a new role for thoses enzymes in themodulation of gene transfer between pathogenic bacteria interacting with host plants.
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Interruption de la communication bactérienne dans la rhizosphère par la dégradation enzymatique des signaux quorum sensing

Tannières, Mélanie 23 March 2012 (has links) (PDF)
L'identification, chez divers organismes, d'enzymes de dégradation des N-acyl homosérineslactones (NAHLs) impliquées dans la signalisation QS pose la question de leurs rôles dans lesinteractions bactéries-eucaryotes. Dans une première partie, une synthèse bibliographique analyse lesconnaissances acquises sur ces enzymes dégradant les NAHLs. Dans une seconde partie, la croissancedes bactéries dégradant les signaux NAHLs a été stimulée par l'application de g-caprolactone (GCL)dans la rhizosphère de plants de pommes de terre à des fins de phytoprotection. L'effet de cetraitement sur la diversité des communautés bactériennes rhizosphériques a été évalué en combinantdifférentes approches d'écologie microbienne moléculaire comme la DGGE, le pyroséquençaged'amplicons rrs, et la métagénomique fonctionnelle. Cette dernière approche appliquée à une banquede 30 000 clones environ a conduit à l'identification d'un gène qsdB codant la dégradation des signauxNAHL. Ce travail révèle ainsi l'existence d'une nouvelle classe d'enzymes de dégradation des NAHLsappartenant à la famille des enzymes possédant une signature amidase (AS) dont des membres sontpar ailleurs impliqués dans la dégradation de composés xénobiotiques. Dans une troisième partie, unsystème expérimental a été développé afin de mesurer le transfert conjugatif du plasmide de virulenceTi (tumor inducing) chez des dérivés du pathogène Agrobacterium tumefaciens, appelés "tricheurs",incapables de produire des signaux NAHLs mais utilisateurs de ceux produits par les autres bactéries.Ce modèle a permis de montrer l'effet modérateur de lactonases dégradant les NAHLs exprimées chezdes agrobactéries produisant les NAHLs, chez des bactéries réceptrices du plasmide Ti, ou des planteshôtes des agrobactéries sur le transfert conjugatif initié par les tricheurs. L'ensemble de ce travailrévèle à la fois une nouvelle famille d'enzymes impliquées dans la dégradation des NAHLs, ainsiqu'un nouveau rôle de ces enzymes dans la modulation des flux de gènes entre bactériesphytopathogènes en interaction avec une plante hôte.
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The mission of the church as family: implementing the ecclesiology of the African Synod (1994) in the Catholic Diocese of Masvingo

Basera, Michael 02 1900 (has links)
Bibliography: leaves 221-244 / The purpose of this thesis is to examine the mission of the ‘Church as family’ and to explore its implications in terms of levels of inclusion and participation of church members in the Catholic Diocese of Masvingo. The background of the study is the 1994 African Synod that suggests the ecclesiology of the mission of the ‘Church as family.’ The study helps the Catholic Diocese of Masvingo to evaluate the implementation of the ideal of the mission of the ‘Church as family’ and draw implications for nuclear, single parent, child-headed, reconstituted and extended families within the church. The study explores Shorter’s culture model to examine how cultural practices, symbols, values and belief systems can be used as an analytic framework for the human dimension of the church. A qualitative research methodology that involves 36 participants in semi-structured interviews, three focus group discussions in urban, semi-urban and rural parishes and participant observation was used to collect data from parishioners, priests and religious of the Catholic Diocese of Masvingo. The study reveals that each family type contributes to Evangelisation as proclamation of the Good News and inculturation differently thereby enriching the ideal of the mission of the ‘Church as family.’ Furthermore, the study shows that guilds, associations and commissions help to strengthen families through spiritual, psychological, social and economic support. Findings also indicate that the Trinity is the theological foundation of the family and it finds acceptance in African communal setup. Family types in Masvingo Diocese are analysed using the notion of the Trinity to show that dignity, equality and respect among family types can be used to strengthen the ideal of the mission of the ‘Church as family.’ At pastoral level, economic, social and cultural obstacles to family ministry stand as a challenge to the full implementation and realisation of the ideal of the mission of the ‘Church as family’. In the light of the research, recommendations for mission strategies were suggested at different levels that involve Diocesan administration, priests, religious, catechists and parish leaders. Recommendations for further researches were also suggested for areas that seem to be important yet outside the scope of this study. The theological, pastoral, and cultural issues raised in this study combine to help the Catholic Diocese of Masvingo to become an authentic expression of the mission of the ‘Church as family’ of God. / Christian Spirituality, Church History and Missiology / D. Th. (Missiology)

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