Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Coorientador: Márcia Cristina de Sena Oliveira / Banca: Simone Cristina Méo Niciura / Banca: Rodrigo Giglioti / Resumo: A bovinocultura é um setor com importante destaque no agronegócio brasileiro. O carrapato Ripicephalus (Boophilus) microplus é responsável por perdas econômicas significativas aos pecuaristas e é vetor de hemoparasitoses como Anaplasma spp e Babesia spp. Sabe-se que os bovinos Bos taurus taurus são mais susceptíveis à infestação por carrapatos do que Bos taurus indicus. Acredita-se que o mesmo ocorra para a infecção por Babesia bovis. Neste trabalho, foram avaliados, em duas colheitas, 355 bovinos da raça Angus, pertencentes a uma fazenda de Uruguaiana-RS, nos quais foram realizadas contagens de carrapatos e colheitas de amostras de sangue para quantificação de B. bovis, pela técnica de qPCR, e genotipagem com chip de 150.000 marcadores SNP. Para qPCR utilizaram-se sequências iniciadoras que flanqueiam um fragmento do gene do citocromo B (mt-cytB), como oligonucleotídeos iniciadores. Após genotipagem dos bovinos com o chip Gene Seek Genomic Profiler™ (GGP-HD) da Illumina Infinium®, foi realizado imputação de genótipos, para recuperação de genótipos faltantes, e controle de qualidade. Foi realizada análise de associação genômica ampla (GWAS), para cada uma das características, infecção por B. bovis e resistência a carrapatos, através do método denominado "Single Step Genomic BLUP" (ssGBLUP). Todos os animais apresentaram infestação por carrapatos e infecção por B. bovis, determinada pela qPCR, e altos valores médios para ambas as características. Algumas regiões cromossômicas ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The cattle industry is a sector with importance in the Brazilian agribusiness. The Ripicephalus (Boophilus) microplus is responsible for economic losses and is a vector for hemoparasitoses, such as Anaplasma spp and Babesia spp. It is known that the Bos tauros animals are more susceptible to infestation by ticks when compared with infestation in Bos indicus animals. It is believed that the same behavior keeps for infection by Babesia bovis. They were evaluated, in two collections, 355 Angus cattle, from a farm in Uruguaiana city, estate of Rio Grande do Sul, where were performed tick counts, quantification of B. bovis by qPCR and genotyping with a 150K chip. Were used as primers, in the qPCR, sequences that flanking the fragment of the cytochrome b gene. The technique was standardized and optimized using specimens of isolates of B. bovis. After genotyping, imputation was carried out, for recovery of missing genotypes, and quality control. Genome association analysis was performed (GWAS), to each of the characteristics, through the method called "Single Step Genomic BLUP" (ssGBLUP). All animals showed tick infestation and infection by B. bovis and high average values for both characteristics. Some regions on chromosomes were identified as significant to the characteristics tick infestation and infection by B. bovis, and seven chromosomes, identified in the present study, were already described in other studies. The present study agrees with other results indicating that the qP... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Elton Eustáquio Casagrande / Manoel Fernando Martins / Ana Claudia Fernandes Terence / Resumo: A cadeia de carne bovina possui posição de destaque no contexto da economia rural brasileira, ocupando vasta área do território nacional e respondendo pela geração de emprego e renda de milhões de brasileiros. Contudo, para atender as demandas da sociedade moderna, é preciso avançar na produção de produtos mais diferenciados. Neste sentido, ganham relevância as estratégias empresariais nos diversos elos da cadeia produtiva da carne bovina, sobretudo no subsistema de industrialização. Na cadeia produtiva da carne bovina brasileira, um dos programas de destaque com essa finalidade é o Programa Carne Angus Certificada. Este trabalho, classificado como uma pesquisa aplicada, de natureza exploratória, de abordagem qualitativa, no contexto de uma análise de interação setorial, feita através de um procedimento de estudo multicaso, descreveu e analisou a estrutura competitiva e o comportamento estratégico dos frigoríficos participantes do Programa Carne Angus Certificada em São Paulo, com suporte das teorias do Modelo das Cinco Forças de Porter e das Tipologias Estratégicas de Miles e Snow. A coleta de dados se deu através de entrevista semiestruturada, realizada com quatro indústrias frigoríficas participantes do programa no estado, que contou com roteiro pré-determinado e perguntas avaliativas feitas após as respostas dadas com auxílio de itens da escala Likert (estrutura competitiva) e respostas às questões de múltipla escolha (comportamento estratégico). Os resultados para a estr... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The beef production chain has a prominent position in the context of the Brazilian rural economy, occupying a large area of the national territory and responding to the generation of employment and income for millions of Brazilians. However, to meet the modern society demands, it is necessary to move forward in the production of differentiated products. In this sense, corporate strategies gain importance in the beef production chain channels, especially in the industrialization subsystem. In the Brazilian beef production chain, one of the main programs for this purpose is the Certified Angus Beef Program. This work, classified as an applied research, of an exploratory nature, with a qualitative approach, in the context of a sectorial interaction analysis, made through a multicase study procedure, described and analyzed the competitive structure and strategic behavior of the meatpackers participating in the Program Angus Beef Certified in São Paulo, with support from Porter's Five Forces Model theories and Miles and Snow Strategic Typologies. Data were collected through a semistructured interview, conducted with four meatpacking industries participating in the program in the state, which had a predetermined script and evaluative questions made after the answers given using Likert scale items (competitive structure) and responses to multiple choice issues (strategic behavior). The results for the competitive structure indicated that the threat of new competitors and the power o... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Roberto de Oliveira Roça / Coorientador: Marcelo Henrique Faria / Banca: Cyntia Ludovico Martins / Banca: Pedro Eduardo de Felício / Resumo: A qualidade da carne está diretamente ligada as exigências do consumidor, que considera dureza, amora, sabor, suculência e coloração. Desta forma o presente trabalho tem por objetivo verificar o efeito da imunocastração na composição centesimal, análise sensorial e perfil de ácidos graxos da carne de bovinos Nelore e cruzados ½Nelore x ½Aberdeen-Angus, 60 animais distribuídos em um delineamento em esquema fatorial 2 x 3, sendo grupos genéticos e condições sexuais, com castração cirúrgica, imunocastração e não castrados, totalizando 6 tratamentos com 10 animais . Os animais foram abatidos e as carcaças resfriadas. Após 24 horas, foram utilizadas amostras do M. longissimus thoracis da 11ª à 13ª costela da carcaça direita, embaladas a vácuo e congeladas. Entre as condições sexuais estudadas, não foram encontradas diferenças nos valores médios de proteína, extrato etéreo e resíduo mineral fixo, sendo apenas a umidade diferente. Entre os grupos genéticos, os valores médios da composição centesimal apresentaram diferença para umidade, extrato etéreo e resíduo mineral fixo, sendo a umidade elevada para a carne dos animais cruzados, o extrato etéreo e o resíduo mineral fixo com maiores teores para a carne dos animais Nelore. As variáveis, sabor, maciez, mastigabilidade e suculência apresentaram melhores valores para a carne de animais cruzados. No perfil de ácidos graxos, entre as condições sexuais, foram encontradas diferenças no ácido miristoléico (C14:1), no ω6 (ômega 6) e na proporção de ácidos graxos poliinsaturados/ácidos graxos saturados, com maiores resultados... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The quality of meat is directly linked to consumer demands, which considers hardness, blackberry, flavor, juiciness and color. Thus, the present study aims to determine the effect of immunocastration proximate composition, sensory analysis and fatty acid profile of meat from Nellore and is crossed Nellore x ½ Aberdeen-Angus, 60 animals were allotted to a factorial 2 x 3 with genetic conditions and sex groups, with surgical castration, immunocastration and unneutered, totaling 6 treatments with 10 animals. The animals were slaughtered and the carcasses chilled. After 24 hours, samples were used of M. longissimus thoracis from the 11th to the 13th rib on the right casting, vacuum packed and frozen. Between sexual conditions studied, no differences were found in mean values of protein, lipids and fixed mineral, with just different humidity. Among genetic groups, the mean values of centesimal composition showed differences for moisture, ether extract and fixed mineral residue, and high humidity for the meat of crossbred animals, ether extract and fixed mineral with higher levels for the meat of Nellore . Variables , taste, tenderness , juiciness and chewiness showed better values for beef and crossbred animals . In the fatty acid profile between sexual conditions , differences were found in myristoleic acid ( C14 : 1 ) , the ω6 ( omega 6 ) and the ratio of polyunsaturated / saturated fatty acids fatty acids with greater results found in the flesh of animals not castrated . Among genetic groups the results differed due to the influence of racial characteristics , with the best values in meat from Nellore , because the selection of forage taken by animals . The use of immunocastration proved effective in aspects related to composition , sensory analysis and meat fatty acid profile when compared with surgically... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Ciro Moraes Barros / Banca: Ronaldo Luiz Ereno / Banca: João Carlos Ferreira / Resumo: O crescimento folicular em bovinos ocorre em um padrão de ondas que pode variar de 2 a 3 por ciclo estral e caracteriza-se pelo crescimento sincrônico de um grupo de folículos antrais, onde apenas um se tornará dominante. A quantidade de folículos recrutados é variável entre os animais, porém apresenta alta repetibilidade entre os indivíduos. Animais Bos indicus apresentam maior quantidade de folículos recrutados por onda que animais Bos taurus. Objetivou-se com o presente trabalho, (1) identificar fêmeas das raças Nelore (Bos indicus) e Aberdeen Angus (Bos taurus), que possuam elevado ou reduzido número de folículos recrutados por onda e relacionar o número de folículos à concentração plasmática do hormônio anti-mulleriano (AMH); (2) relacionar o numero de folículos antrais à fertilidade de fêmeas Nelore e; (3) determinar se o tratamento superestimulatório altera as concentrações plasmáticas de AMH em vacas Nelore. No experimento 1, contagem do numero de folículos antrais das fêmeas Nelore (n=20) e Angus (n=30) foi feita por duas avaliações ultrassonográficas (US). Considerando a média  EPM da contagem de folículos antrais de cada raça, as novilhas foram classificas em alta contagem folicular (ACF; n= 9 novilhas Nelore e 15 Angus) ou baixa contagem folicular (BCF; n= 11 novilhas Nelore e 15 Angus). O AMH foi mensurado por Elisa em uma amostra de sangue coletada durante a ultima US. No experimento 2, foram utilizadas novilhas da raça Nelore (n=86) submetidas a um protocolo de inseminação artificial em tempo fixo (IATF). As novilhas foram classificadas (avaliação US no D0 da IATF) em 3 grupos: ACF (>40 folículos; n=29), intermediário (ICF;>20 e <40 folículos; n=34) e BCF (<20 folículos; n=23). No experimento 3, foram utilizadas 20 vacas da raça Nelore de ICF e ACF. Os animais foram separados pela contagem folicular e distribuídos em 2 grupos: Grupo controle IATF (n=9) e grupo P36 (superestimuladas ... / Abstract: In bovines follicular development happens in a wave pattern that can vary from two to three waves per estral cycle with a group of follicles growing simultaneously but with only ano becoming the dominat follicle. The number of recruited follicle is highly variable between animal; however it is highly repeatable within an animal. Bos indicus animals present greater number of follicles per wave than Bos taurus animals. The objective of the present study was 1) identify animals from the Nelore and Abeerden Angus breed that have high or low number of follicles recruited per follicle wave and relate the number of follicles with AMH concentration; 2) to relate the number of antral follicles with the fertility of Nelore females; 3) to determine if the superstimulatory treatment alters the plasmatic concentrations of AMH. In experiment 1 the follicle count in Nelore and Angus heifers was done through two ultrasound examinations (US). Considering the mean + SEM of the follicle count in each breed, the heifers were grouped in high (HFC) or low (LFC) follicle count. Plasmatic AMH was measured in a blood smple drawn at the last US. In Experiment 2, there were used Nelore heifers submitted to a TFAI protocol. Heifers were grouped in HFC (>40 follicles), intermediary (>20 an <40 follicle) and LFC (<20 follicle). In experiment 3, Nelore cows with high and intermediary follicles counts were used. Animals were separated in control TFAI group and P36 group. Blood samples for AMH measurement were collected on day 5 (P36) and on day 8 (TFAI and P36). Result from experiment 1 were analyzed using ANOVA. Experiment 2 was analyzed using a logistic regression and experiment 3 was ... / Mestre

Orientador: Ciro Moraes de Barros / Coorientador: Anthony César de Souza Castilho / Banca: Mário Binelli / Banca: Luiz Gustavo de Almeida Chuffa / Resumo: O oviduto possui papel essencial na reprodução de mamíferos, promovendo um microambiente favorável para a maturação oocitária, estocagem e capacitação do espermatozoide, fertilização, transporte dos gametas e desenvolvimento inicial do embrião. Anatomicamente e funcionalmente, o oviduto é dividido em três regiões principais: infundíbulo, ampola e istmo. O oócito e o espermatozoide entram nos lados opostos do oviduto, respectivamente no infundíbulo e istmo, e são transportados até a ampola, local onde ocorre a fertilização. O sucesso reprodutivo está diretamente ligado a temporização apropriada do transporte dos gametas ao local da fertilização, bem como, a precisão no tempo de transporte do embrião até o útero, para a aquisição da capacidade de implantação. A coordenação e regulação das funções do oviduto são complexas e estão sob efeitos endócrinos, parácrinos e autócrinos, os quais alteram temporalmente e espacialmente a transcrição e tradução de diversos fatores. Diante disso, o presente trabalho visou avaliar o efeito de biotecnologias reprodutivas, especificamente da superestimulação ovariana, bem como de características genéticas e fisiológicas reprodutivas no perfil transcricional de diversos fatores no oviduto bovino. Para tanto, foram avaliados os efeitos da indução de múltiplas ovulações em vacas da raça Nelore (dados apresentados no primeiro manuscrito), bem como os efeitos da influência da seleção genética de animais com alta contagem folicular em novilhas da raça Nelore e Aberdeen Angus, no período inicial pós ovulação (dados apresentados no segundo manuscrito), na expressão de genes relacionados ao transporte de gametas e fertilização. Os resultados demonstram que a superestimulação ovariana modula a expressão de alguns genes relacionados à contratilidade do oviduto em vacas da raça Nelore e que a ovulação é principal fator responsável por controlar ... / Abstract: The oviduct has an important role in mammal reproduction, promoting a favorable microenvironment for oocyte maturation, sperm storage and capacitation, fertilization, transport of gametes and early embryo development. Anatomically and functionally, the oviduct is divided in three regions: infundibulum, ampulla and isthmus. The oocyte and the sperm enter in opposite sides of the oviduct, respectively infundibulum and isthmus, and are transported to the fertilization site, the ampulla. Reproductive success is directly related to appropriate timing of gamete transport to the fertilization site, as well as a precise time of embryo transport to the uterus, to obtain the capacity of implantation. The coordination and regulation of oviductal functions are complex and under endocrine, paracrine and autocrine effects, which temporally and spatially alter the transcription and translation of several factors. Therefore, this study aimed to evaluate the effect of reproductive biotechnologies, specifically ovarian superstimulation, as well as genetic and physiological reproductive characteristics in the transcriptional profile of several factors in the bovine oviduct. To do so, we evaluated the effects of inducing multiple ovulation in Nelore cows (data presented in the first manuscript), and the effects of the influence of genetic selection of animals with high follicle count in Nellore and Aberdeen Angus heifers, in the initial period post-ovulation (data presented in the second manuscript), in gene expression related to gametes transport and fertilization. The results demonstrated that ovarian superstimulation modulates the expression of some genes related to oviductal contractility in Nelore cows and ovulation is the main factor responsible for transcriptional control in bovine oviduct, with less or no impact of breed and ovarian follicle count / Mestre

Orientador: Ciro Moraes Barros / Banca: José Buratini / Banca: Valéria Sandrim / Banca: Roberto Sartori / Banca: Mario Binelli / Banca: Anthony Cezar Souza Castilho / Resumo: Animais com alta população folicular (APF) antral possuem melhor desempenho reprodutivo quando comparados a animais de baixa população folicular (BPF). Essa variação no número de folículos antrais pode estar associada a diferentes perfis hormonais e de expressão de genes reguladores da ativação e crescimento folicular. Objetivou-se com o presente trabalho: 1) avaliar o perfil global de expressão gênica de folículos antrais em animais com APF e BPF nas raças Nelore (Bos indicus) e Aberdeen Angus (Bos taurus) e 2) identificar diferenças genotípicas através de um estudo de associação genômica (GWAS - Genome Wide Association Study) usando polimorfismos de nucleotídeo de sítio único (SNPs). Inicialmente foram avaliadas 155 novilhas da raça Nelore e 132 da raça Angus com idade e peso semelhantes. Os animais foram sincronizados e a contagem dos folículos realizada através de ultrassonografia 24 a 48 horas após o início do estro. Os grupos APF e BPF foram formados com base na média do número de folículos ± desvio padrão nas duas raças. Para avaliar o perfil global de expressão gênica usou-se a técnica do microarranjo. Um total de 15 novilhas Nelore (6 APF e 9 BPF) e 17 novilhas Angus (9 APF e 8 BPF) foram abatidas 12 a 24 horas após a ovulação e os ovários transportados ao laboratório. Foi realizado um pool de RNA extraído de três folículos (≤ 4 mm) individualmente (um pool por animal) dissecados do ovário. A análise dos dados procedeu-se no FlexArray 1.6.1.1 e os genes com "fold change" > 1,5 e P ≤ 0,05 foram considerados diferencialmente expressos. Para o estudo de GWAS 72 novilhas da raça Nelore (32 APF e 40 BPF) e 48 da raça Angus (21APF e 27 BPF) foram selecionadas. O DNA foi extraído do sangue e/ou bulbo capilar e a genotipagem foi realizada com o chip 777 HD bovine Illumina®. Os SNPs foram submetidos ao controle de qualidade usando como critérios de exclusão: call rate (IDCR) ≤ 90%,... / Abstract: Animals with high antral follicle count (HFC) have a better reproductive performance when compared with animals with low follicle count (LFC). This variation in the number of antral follicles can be associated with different hormonal profiles and expression of genes regulating activation and follicular growth. The objective of the present work was: 1) to evaluate the global gene expression of antral follicles in animals with HFC and LFC in Nelore (Bos indicus) and Aberdeen Angus (Bos taurus) heifers and 2) to identify genotypic differences through a genomic wide association study (GWAS) using single nucleotide polymorphisms (SNP). Initially, 155 Nelore heifers and 132 Angus heifers with similar body weight and age were selected. The animals were synchronized and follicle count was done through ultrasound 24 to 48 h after estrus. The groups LFC and HFC were formed using the average of follicles ± standard deviation in both breeds. To evaluate the global gene expression profile we use a microarray chip. A total of 15 Nelore heifers (6 HFC and 9 LFC) and 17 Angus heifers (9 HFC and 8 LFC) were slaughter 12 to 24 h after ovulation and ovaries were transported to the laboratory. A pool of RNA from three follicles (< 4 mm) from each animal was used to the analysis using FlexArray 1.6.1.1 and the genes with fold change > 1.5 and P ≤ 0.05 were considered differentially expressed. For the GWAS study 72 Nelore heifers (32 HFC and 40 LFC) and 48 Angus heifers (21 HFC and 27 LFC) were selected. The DNA was extracted from blood and hair bulb and genotyping was done using the 777 HD Illumina chip. The SNPs were submitted to a quality control test using an exclusion criteria: call rate (IDCR) ≤ 90%, MAF ≤ 0.02, call rate (SNPCR) ≤ 0.98 and HWE ≤ 1 x 10-5. After the quality control test the SNPs were submitted to the Cochran-Armitage test to the association of phenotype/genotype in both breeds. The genes differentially expressed and the genes ... / Doutor

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:47Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-05-23Bitstream added on 2014-08-13T18:00:35Z : No. of bitstreams: 1 000758023_20160523.pdf: 340042 bytes, checksum: 9282dceda721f0696e2c05e88b75c33d (MD5) Bitstreams deleted on 2016-05-23T16:38:29Z: 000758023_20160523.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-05-23T16:39:07Z : No. of bitstreams: 1 000758023.pdf: 922794 bytes, checksum: bee1fddc26f377d60fa6ac89017b5dc1 (MD5) / O crescimento folicular em bovinos ocorre em um padrão de ondas que pode variar de 2 a 3 por ciclo estral e caracteriza-se pelo crescimento sincrônico de um grupo de folículos antrais, onde apenas um se tornará dominante. A quantidade de folículos recrutados é variável entre os animais, porém apresenta alta repetibilidade entre os indivíduos. Animais Bos indicus apresentam maior quantidade de folículos recrutados por onda que animais Bos taurus. Objetivou-se com o presente trabalho, (1) identificar fêmeas das raças Nelore (Bos indicus) e Aberdeen Angus (Bos taurus), que possuam elevado ou reduzido número de folículos recrutados por onda e relacionar o número de folículos à concentração plasmática do hormônio anti-mulleriano (AMH); (2) relacionar o numero de folículos antrais à fertilidade de fêmeas Nelore e; (3) determinar se o tratamento superestimulatório altera as concentrações plasmáticas de AMH em vacas Nelore. No experimento 1, contagem do numero de folículos antrais das fêmeas Nelore (n=20) e Angus (n=30) foi feita por duas avaliações ultrassonográficas (US). Considerando a média  EPM da contagem de folículos antrais de cada raça, as novilhas foram classificas em alta contagem folicular (ACF; n= 9 novilhas Nelore e 15 Angus) ou baixa contagem folicular (BCF; n= 11 novilhas Nelore e 15 Angus). O AMH foi mensurado por Elisa em uma amostra de sangue coletada durante a ultima US. No experimento 2, foram utilizadas novilhas da raça Nelore (n=86) submetidas a um protocolo de inseminação artificial em tempo fixo (IATF). As novilhas foram classificadas (avaliação US no D0 da IATF) em 3 grupos: ACF (>40 folículos; n=29), intermediário (ICF;>20 e <40 folículos; n=34) e BCF (<20 folículos; n=23). No experimento 3, foram utilizadas 20 vacas da raça Nelore de ICF e ACF. Os animais foram separados pela contagem folicular e distribuídos em 2 grupos: Grupo controle IATF (n=9) e grupo P36 (superestimuladas ... / In bovines follicular development happens in a wave pattern that can vary from two to three waves per estral cycle with a group of follicles growing simultaneously but with only ano becoming the dominat follicle. The number of recruited follicle is highly variable between animal; however it is highly repeatable within an animal. Bos indicus animals present greater number of follicles per wave than Bos taurus animals. The objective of the present study was 1) identify animals from the Nelore and Abeerden Angus breed that have high or low number of follicles recruited per follicle wave and relate the number of follicles with AMH concentration; 2) to relate the number of antral follicles with the fertility of Nelore females; 3) to determine if the superstimulatory treatment alters the plasmatic concentrations of AMH. In experiment 1 the follicle count in Nelore and Angus heifers was done through two ultrasound examinations (US). Considering the mean + SEM of the follicle count in each breed, the heifers were grouped in high (HFC) or low (LFC) follicle count. Plasmatic AMH was measured in a blood smple drawn at the last US. In Experiment 2, there were used Nelore heifers submitted to a TFAI protocol. Heifers were grouped in HFC (>40 follicles), intermediary (>20 an <40 follicle) and LFC (<20 follicle). In experiment 3, Nelore cows with high and intermediary follicles counts were used. Animals were separated in control TFAI group and P36 group. Blood samples for AMH measurement were collected on day 5 (P36) and on day 8 (TFAI and P36). Result from experiment 1 were analyzed using ANOVA. Experiment 2 was analyzed using a logistic regression and experiment 3 was ...

Made available in DSpace on 2016-05-17T16:51:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-05-17T16:54:36Z : No. of bitstreams: 1 000863483.pdf: 1230854 bytes, checksum: 5f969e218afa238395f61e6225eb65c2 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Animais com alta população folicular (APF) antral possuem melhor desempenho reprodutivo quando comparados a animais de baixa população folicular (BPF). Essa variação no número de folículos antrais pode estar associada a diferentes perfis hormonais e de expressão de genes reguladores da ativação e crescimento folicular. Objetivou-se com o presente trabalho: 1) avaliar o perfil global de expressão gênica de folículos antrais em animais com APF e BPF nas raças Nelore (Bos indicus) e Aberdeen Angus (Bos taurus) e 2) identificar diferenças genotípicas através de um estudo de associação genômica (GWAS - Genome Wide Association Study) usando polimorfismos de nucleotídeo de sítio único (SNPs). Inicialmente foram avaliadas 155 novilhas da raça Nelore e 132 da raça Angus com idade e peso semelhantes. Os animais foram sincronizados e a contagem dos folículos realizada através de ultrassonografia 24 a 48 horas após o início do estro. Os grupos APF e BPF foram formados com base na média do número de folículos ± desvio padrão nas duas raças. Para avaliar o perfil global de expressão gênica usou-se a técnica do microarranjo. Um total de 15 novilhas Nelore (6 APF e 9 BPF) e 17 novilhas Angus (9 APF e 8 BPF) foram abatidas 12 a 24 horas após a ovulação e os ovários transportados ao laboratório. Foi realizado um pool de RNA extraído de três folículos (≤ 4 mm) individualmente (um pool por animal) dissecados do ovário. A análise dos dados procedeu-se no FlexArray 1.6.1.1 e os genes com fold change > 1,5 e P ≤ 0,05 foram considerados diferencialmente expressos. Para o estudo de GWAS 72 novilhas da raça Nelore (32 APF e 40 BPF) e 48 da raça Angus (21APF e 27 BPF) foram selecionadas. O DNA foi extraído do sangue e/ou bulbo capilar e a genotipagem foi realizada com o chip 777 HD bovine Illumina®. Os SNPs foram submetidos ao controle de qualidade usando como critérios de exclusão: call rate (IDCR) ≤ 90%,... / Animals with high antral follicle count (HFC) have a better reproductive performance when compared with animals with low follicle count (LFC). This variation in the number of antral follicles can be associated with different hormonal profiles and expression of genes regulating activation and follicular growth. The objective of the present work was: 1) to evaluate the global gene expression of antral follicles in animals with HFC and LFC in Nelore (Bos indicus) and Aberdeen Angus (Bos taurus) heifers and 2) to identify genotypic differences through a genomic wide association study (GWAS) using single nucleotide polymorphisms (SNP). Initially, 155 Nelore heifers and 132 Angus heifers with similar body weight and age were selected. The animals were synchronized and follicle count was done through ultrasound 24 to 48 h after estrus. The groups LFC and HFC were formed using the average of follicles ± standard deviation in both breeds. To evaluate the global gene expression profile we use a microarray chip. A total of 15 Nelore heifers (6 HFC and 9 LFC) and 17 Angus heifers (9 HFC and 8 LFC) were slaughter 12 to 24 h after ovulation and ovaries were transported to the laboratory. A pool of RNA from three follicles (< 4 mm) from each animal was used to the analysis using FlexArray 1.6.1.1 and the genes with fold change > 1.5 and P ≤ 0.05 were considered differentially expressed. For the GWAS study 72 Nelore heifers (32 HFC and 40 LFC) and 48 Angus heifers (21 HFC and 27 LFC) were selected. The DNA was extracted from blood and hair bulb and genotyping was done using the 777 HD Illumina chip. The SNPs were submitted to a quality control test using an exclusion criteria: call rate (IDCR) ≤ 90%, MAF ≤ 0.02, call rate (SNPCR) ≤ 0.98 and HWE ≤ 1 x 10-5. After the quality control test the SNPs were submitted to the Cochran-Armitage test to the association of phenotype/genotype in both breeds. The genes differentially expressed and the genes ... / FAPESP: 11/17370-0

Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-06-03Bitstream added on 2015-01-26T13:30:31Z : No. of bitstreams: 1 000795832.pdf: 314304 bytes, checksum: b6077bd7a50cb6eb686277acd319024f (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O oviduto possui papel essencial na reprodução de mamíferos, promovendo um microambiente favorável para a maturação oocitária, estocagem e capacitação do espermatozoide, fertilização, transporte dos gametas e desenvolvimento inicial do embrião. Anatomicamente e funcionalmente, o oviduto é dividido em três regiões principais: infundíbulo, ampola e istmo. O oócito e o espermatozoide entram nos lados opostos do oviduto, respectivamente no infundíbulo e istmo, e são transportados até a ampola, local onde ocorre a fertilização. O sucesso reprodutivo está diretamente ligado a temporização apropriada do transporte dos gametas ao local da fertilização, bem como, a precisão no tempo de transporte do embrião até o útero, para a aquisição da capacidade de implantação. A coordenação e regulação das funções do oviduto são complexas e estão sob efeitos endócrinos, parácrinos e autócrinos, os quais alteram temporalmente e espacialmente a transcrição e tradução de diversos fatores. Diante disso, o presente trabalho visou avaliar o efeito de biotecnologias reprodutivas, especificamente da superestimulação ovariana, bem como de características genéticas e fisiológicas reprodutivas no perfil transcricional de diversos fatores no oviduto bovino. Para tanto, foram avaliados os efeitos da indução de múltiplas ovulações em vacas da raça Nelore (dados apresentados no primeiro manuscrito), bem como os efeitos da influência da seleção genética de animais com alta contagem folicular em novilhas da raça Nelore e Aberdeen Angus, no período inicial pós ovulação (dados apresentados no segundo manuscrito), na expressão de genes relacionados ao transporte de gametas e fertilização. Os resultados demonstram que a superestimulação ovariana modula a expressão de alguns genes relacionados à contratilidade do oviduto em vacas da raça Nelore e que a ovulação é principal fator responsável por controlar ... / The oviduct has an important role in mammal reproduction, promoting a favorable microenvironment for oocyte maturation, sperm storage and capacitation, fertilization, transport of gametes and early embryo development. Anatomically and functionally, the oviduct is divided in three regions: infundibulum, ampulla and isthmus. The oocyte and the sperm enter in opposite sides of the oviduct, respectively infundibulum and isthmus, and are transported to the fertilization site, the ampulla. Reproductive success is directly related to appropriate timing of gamete transport to the fertilization site, as well as a precise time of embryo transport to the uterus, to obtain the capacity of implantation. The coordination and regulation of oviductal functions are complex and under endocrine, paracrine and autocrine effects, which temporally and spatially alter the transcription and translation of several factors. Therefore, this study aimed to evaluate the effect of reproductive biotechnologies, specifically ovarian superstimulation, as well as genetic and physiological reproductive characteristics in the transcriptional profile of several factors in the bovine oviduct. To do so, we evaluated the effects of inducing multiple ovulation in Nelore cows (data presented in the first manuscript), and the effects of the influence of genetic selection of animals with high follicle count in Nellore and Aberdeen Angus heifers, in the initial period post-ovulation (data presented in the second manuscript), in gene expression related to gametes transport and fertilization. The results demonstrated that ovarian superstimulation modulates the expression of some genes related to oviductal contractility in Nelore cows and ovulation is the main factor responsible for transcriptional control in bovine oviduct, with less or no impact of breed and ovarian follicle count / FAPESP: 12/09498-9

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:30Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-12-12Bitstream added on 2014-06-13T20:56:42Z : No. of bitstreams: 1 santos_ct_me_botfmvz.pdf: 295424 bytes, checksum: 2c14969a0776e097a0cbbffb9d4632d0 (MD5) / A qualidade da carne está diretamente ligada as exigências do consumidor, que considera dureza, amora, sabor, suculência e coloração. Desta forma o presente trabalho tem por objetivo verificar o efeito da imunocastração na composição centesimal, análise sensorial e perfil de ácidos graxos da carne de bovinos Nelore e cruzados ½Nelore x ½Aberdeen-Angus, 60 animais distribuídos em um delineamento em esquema fatorial 2 x 3, sendo grupos genéticos e condições sexuais, com castração cirúrgica, imunocastração e não castrados, totalizando 6 tratamentos com 10 animais . Os animais foram abatidos e as carcaças resfriadas. Após 24 horas, foram utilizadas amostras do M. longissimus thoracis da 11ª à 13ª costela da carcaça direita, embaladas a vácuo e congeladas. Entre as condições sexuais estudadas, não foram encontradas diferenças nos valores médios de proteína, extrato etéreo e resíduo mineral fixo, sendo apenas a umidade diferente. Entre os grupos genéticos, os valores médios da composição centesimal apresentaram diferença para umidade, extrato etéreo e resíduo mineral fixo, sendo a umidade elevada para a carne dos animais cruzados, o extrato etéreo e o resíduo mineral fixo com maiores teores para a carne dos animais Nelore. As variáveis, sabor, maciez, mastigabilidade e suculência apresentaram melhores valores para a carne de animais cruzados. No perfil de ácidos graxos, entre as condições sexuais, foram encontradas diferenças no ácido miristoléico (C14:1), no ω6 (ômega 6) e na proporção de ácidos graxos poliinsaturados/ácidos graxos saturados, com maiores resultados... / The quality of meat is directly linked to consumer demands, which considers hardness, blackberry, flavor, juiciness and color. Thus, the present study aims to determine the effect of immunocastration proximate composition, sensory analysis and fatty acid profile of meat from Nellore and is crossed Nellore x ½ Aberdeen-Angus, 60 animals were allotted to a factorial 2 x 3 with genetic conditions and sex groups, with surgical castration, immunocastration and unneutered, totaling 6 treatments with 10 animals. The animals were slaughtered and the carcasses chilled. After 24 hours, samples were used of M. longissimus thoracis from the 11th to the 13th rib on the right casting, vacuum packed and frozen. Between sexual conditions studied, no differences were found in mean values of protein, lipids and fixed mineral, with just different humidity. Among genetic groups, the mean values of centesimal composition showed differences for moisture, ether extract and fixed mineral residue, and high humidity for the meat of crossbred animals, ether extract and fixed mineral with higher levels for the meat of Nellore . Variables , taste, tenderness , juiciness and chewiness showed better values for beef and crossbred animals . In the fatty acid profile between sexual conditions , differences were found in myristoleic acid ( C14 : 1 ) , the ω6 ( omega 6 ) and the ratio of polyunsaturated / saturated fatty acids fatty acids with greater results found in the flesh of animals not castrated . Among genetic groups the results differed due to the influence of racial characteristics , with the best values in meat from Nellore , because the selection of forage taken by animals . The use of immunocastration proved effective in aspects related to composition , sensory analysis and meat fatty acid profile when compared with surgically... (Complete abstract click electronic access below)