Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2016-01-12T18:25:55Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) luiza_rodrigues_alves_abreu.pdf: 1513134 bytes, checksum: 72f00ac39b70f10a1e7718494968d97a (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2016-01-12T18:26:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) luiza_rodrigues_alves_abreu.pdf: 1513134 bytes, checksum: 72f00ac39b70f10a1e7718494968d97a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-12T18:26:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) luiza_rodrigues_alves_abreu.pdf: 1513134 bytes, checksum: 72f00ac39b70f10a1e7718494968d97a (MD5) Previous issue date: 2014 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Objetivou-se com este estudo estimar as (co)vari?ncias e as associa??es gen?ticas para as caracter?sticas de pesos corporais, per?metro escrotal e os escores de avalia??o visual em bovinos da ra?a Guzer?. Foram utilizados dados de animais nascidos entre os anos de 1960 e 2013 de cinco estados brasileiros, registrados na ABCZ (Associa??o Brasileira de Criadores de Zebu). As caracter?sticas avaliadas foram: peso corporal ao nascimento (PN), pesos corporais aos 120, 205, 365, 450 e 550 dias de idade (P120, P205, P365, P450 e P550) e per?metros escrotais PE205, PE365, PE450 e PE550, al?m dos escores de avalia??o visual da conforma??o corporal (E ? estrutura corporal, P ? precocidade, M ? musculosidade, U ? umbigo, R ? ra?a, A ? aprumos e S - sexualidade). Os componentes de (co)vari?ncias foram estimados por modelo animal, uni e bi caracter?stica usando a infer?ncia bayesiana e assumindo modelo linear para os dados com distribui??o cont?nua e modelo limiar para as caracter?sticas com distribui??o discreta. As m?dias a posteriori para a herdabilidade direta, obtidas por an?lises unicaracter?sticas, foram: 0,38 (PN); 0,45 (P120), 0,41 (P205), 0,39 (P365), 0,40 (P450), 0,43 (P550), 0,15 (PE205), 0,62 (PE365), 0,32 (PE450), 0,60 (PE550), 0,33 (E), 0,30 (P), 0,32 (M), 0,38 (U), 0,34 (R), 0,39 (A) e 0,46 (S). As tend?ncias gen?ticas e fenot?picas indicam que houve evolu??o nos valores gen?ticos e fenot?picos dos animais ao longo dos anos. As correla??es gen?ticas estimadas entre peso corporal ? desmama (P205), peso corporal ajustado aos 450 dias de idade (P450), estrutura corporal (E), precocidade (P) e musculosidade (M) e as demais caracter?sticas foram positivas variando de m?dia a alta magnitude. Os resultados sugeriram que sele??o com base em pesos corporais ? desmama e aos 450 dias de idade, e escores visuais de estrutura corporal, precocidade e musculosidade resultaria como resposta direta ou correlacionada ? sele??o, em animais mais pesados em todas as idades, com maiores per?metros escrotais e com incremento nos escores visuais. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2014. / ABSTRACT The objective was to estimate the (co) variance and genetic associations for characteristics such as body weights, scrotal circumference, and visual appraisal scores in Guzerat cattle. Data of animals born between 1960 and 2013 in five Brazilian states, registered in the ABCZ (Brazilian Association of Zebu Breeders) were utilized. Evaluated characteristics were: body weight at birth (BWB); body weight at 120, 205, 365, 450, and 550 days of age (BW120, BW205, BW365, BW450, and BW550); scrotal circumference (SC) at day 205, 365, 450, and 550; and visual scores of body conformation (E - body structure, P - precocity, M - muscularity, U - umbilicus, R - breed, A - angulation and S - sexuality). The (co) variances were estimated by animal model, uni- and bi-characteristic using the Bayesian inference and assuming a linear model to the data with continuous distribution and threshold model for characteristics with discrete distribution. The a posteriori average for direct heritability obtained by univariate analysis were: 0.38 (BWB); 0.45 (BW120), 0.41 (BW205), 0.39 (BW365), 0.40 (BW450), 0.43 (BW550), 0.15 (SC205), 0.62 (SC365), 0.32 (SC450), 0.60 (SC550), 0.33 (E) 0.30 (P), 0.32 (M), 0.38 (U), 0.34 (R) 0.39 (A) and 0.46 (S). The genetic and phenotypic trends indicate an evolution in genetic and phenotypic values ??of animals over the years. Genetic correlation estimates between body weight at weaning (BW205), adjusted body weight at 450 days of age (BW450), body structure (E), precocity (P) and muscularity (M) and other characteristics were positive, ranging from average to high magnitude. The results suggested that selection based on body weight at weaning and 450 days of age, and visual scores of body structure, precocity and muscularity would result in direct response or correlated with selection in heavier animals at all ages, with greater SC and improved visual scores.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2014-02-03T21:25:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EstudoInteracaoGenotipo.pdf: 386149 bytes, checksum: e9a5e00bd658830d2afbabddf3d52048 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2014-02-04T15:21:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EstudoInteracaoGenotipo.pdf: 386149 bytes, checksum: e9a5e00bd658830d2afbabddf3d52048 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-04T15:21:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_EstudoInteracaoGenotipo.pdf: 386149 bytes, checksum: e9a5e00bd658830d2afbabddf3d52048 (MD5) Previous issue date: 2008 / Verifica a presença de heterogeneidade de variâncias sobre a produção de leite na primeira lactação de fêmeas da raça Pardo-Suíço e, seu impacto sobre a avaliação genética dos reprodutores, utilizando a inferência Bayesiana por meio de amostrador de Gibbs, foram utilizados 2981 registros referentes às produções de leite e idade da vaca ao parto, em primeiras lactações de vacas da raça Pardo-Suíço, distribuídos em 62 rebanhos. Os registros foram provenientes do serviço de controle leiteiro da Associação Brasileira de Criadores de Gado Pardo Suíço, com os partos ocorridos entre os anos de 1980 a 2002. Foram estabelecidas duas classes de desvio-padrão fenotípico para produção de leite. Posteriormente, os dados foram analisados desconsiderando e considerando as classes de desvio-padrão. As médias observadas e desvio-padrão para produção de leite nas classes de alto e baixo desviopadrão e em análise geral foram iguais a 5802,02 ± 1929,96, 4844,37 ± 1592,99, 5373,47 ± 1849,13, respectivamente. As médias posteriores para os componentes de variâncias foram maiores na classe de alto desvio-padrão. A herdabilidade obtida na classe de alto desviopadrão foi próxima do valor observado na análise geral e inferior ao valor encontrado na classe de baixo desvio-padrão fenotípico. A correlação genética para a produção de leite entre as classes de desvio-padrão foi igual a 0,48. As correlações de Pearson e Spearman entre os valores genéticos para a produção de leite obtidos na análise geral, com os valores obtidos em cada classe de desvio-padrão foram todas maiores que 0,80, quando se considerou todos os reprodutores. Porém, refinando a amostra de reprodutores verifica-se que, as correlações diminuem em magnitude. Existindo uma maior variabilidade nos rebanhos presentes na classe de alto desvio-padrão e, o impacto dessa heterogeneidade de variância sobre a avaliação genética de reprodutores, é pequeno, pois a fonte principal dessa heterogeneidade é decorrente de fatores genéticos confirmando a presença de heterogeneidade de variâncias. / Checks for the presence of heterogeneity of variances on milk production in first lactation of females of Brown Swiss and, impact on genetic evaluation of breeding, using the Bayesian inference using Gibbs sampling we used 2981 records on milk yield and age at calving in first lactation of Holstein Brown Swiss, distributed in 62 herds. The records were from the service of dairy control of the Brazilian Association of Breeders of Brown Swiss cattle, with births occurring between the years 1980 to 2002. Established two classes of phenotypic standard deviation for milk production. Subsequently, the data were analyzed ignoring and considering the classes of standard deviation. The means and standard deviations for milk production in the classes of high and low standard deviation and analysis were generally equal to 5802.02 ± 1929.96, 4844.37 ± 1592.99, 5373.47 ± 1849.13 respectively. The averages for the later components of variance were higher in the high standard deviation. The heritability obtained in the high standard deviation was close to the value observed in the overall analysis and less than the value found in the low phenotypic standard deviation. The genetic correlation for milk production between the classes of standard deviation was equal to 0.48. Pearson and Spearman correlation coefficients and coefficient between breeding values for milk production obtained in the overall analysis, with the values obtained for each class of standard deviation were all higher than 0.80, when considering all breeding. However, refining the sample of players shows that the correlations decrease in magnitude. If there is a greater variability present in flocks in the high standard deviation, and the impact of this heterogeneity of variance on genetic evaluation of breeding is small because the main source of this heterogeneity is due to genetic factors confirming the presence of heterogeneity of variances.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this study was to estimate the (co) variances and genetic associations between the visual scores of conformation and precocity at weaning and at yearling, respectively WC, WP and YC, YP with the characteristics of average daily gain (BWG: from birth to weaning and WYG: from weaning to yearling) and rate of weight gain (BWR: from birth to weaning and BYR: from weaning to yearling) for Angus cattle. The (co)variances components were estimated by multi-traits analysis using an animal model by Bayesian Inference Method, assuming a linear model for average daily gain and for rate of weight gain and a non-linear (threshold) for WC, WP, YC and YP. The a posteriori means for direct heritability were 0.12 (WC), 0.17 (WP), 0.15 (BWG and BWR), 0.17 (YC), 0.19 (YP) and 0.16 (WYG and BYR). The genetic correlation between the weaning and yearling scores with the direct effect for the average daily gain and rate of weight gain traits ranged from -0.05 to 0.60 for conformation and -0.15 to 0.60 for precocity; the genetic correlation of the scores with average daily gain and rate of weight gain presented similar behavior. Therefore, correlated response of equal magnitude is expected for scores, if the selection was directed to average daily gain or rate of weight gain. / O objetivo deste estudo foi estimar as (co)variâncias e as associações genéticas entre os escores visuais de conformação e precocidade à desmama ao sobreano, respectivamente CD, PrD e CS, PrS, com as características de ganho médio diário de peso (GMD: do nascimento à desmama; GMS: da desmama ao sobreano) e velocidade de ganho de peso (VD: do nascimento à desmama e VS: da desmama ao sobreano) para bovinos da raça Angus. Os componentes de (co)variâncias foram estimados por um modelo animal tetra-característica usando o Método de Inferência Bayesiana, assumindo um modelo linear para o ganho médio diário e velocidade de ganho de peso e um modelo não-linear (de limiar) para CD, CS, PrD e PrS. As médias a posteriori para a herdabilidade direta foram: 0,12 (CD); 0,17 (PrD); 0,15 (GMD e VD); 0,17 (CS); 0,19 (PrS) e 0,16 (GMS e VS). As correlações genéticas estimadas entre os escores à desmana e ao sobreano com o efeito direto para as caracteristicas de crescimento variaram de -0,05 a 0,60 para conformação e de -0,15 a 0,60 para precocidade; a correlação genética dos escores com ganho médio diário ou com velocidade de ganho de peso apresentou comportamento semelhante. Portanto, resposta correlacionada de igual magnitude é esperada para os escores, se a selação for direcionada para ganho médio diario de peso ou velocidade de ganho de peso.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The aimed of this work was to study the adjustment of classical non linear models, Von Bertalanffy, Brody, Gompertz, Logistic to growing records of buffaloes of Murrah breed, raised on lowlands in the State of Rio Grande do Sul, and to estimate covariance components by Bayesian focus, for growing curve parameters with biological interpretation. In paper 01 there were studied the adjustment of the classical non linear models already mentioned to growing data for a group of 66 buffaloes females, born from 1982 to 1989, sired by three males and 38 females. There were evaluated the traits Asymptotic weight (A) and Maturity rate (K). The total pair of records weight-age was 26 weighting/female and 1,638 observations. The criterions utilized to select the model that better adjust the growing curve were: asymptotic standard deviation (DPA); the determination coefficient (R2); the residual absolute average deviation (DMA) and asymptotic index (AI). It was concluded that all the models overestimated the birth weight (PN) in bigger or smaller magnitude. In crescent order, the models Von Bertalanffy, Gompertz, Logistic and Brody overestimated PN by 28.55; 32.74; 42.70 and 43.45 kg, respectively. The Logistic model underestimated A (-2.09 kg) and Von Bertalanffy, Gompertz, and Brody overestimated A in crescent order 8.04, 17.7 and 280.33 kg, respectively. Based on the adjustment criterions and in the predicted curves behavior, the Gompertz model, followed by Logistic and Von Bertalanffy were the best adjustment. In Paper 2 there were studied the adjustments of the same models and for the same traits in Paper 01 for a group of 67 buffaloes, born from 1982 to 1989 sired by three males and 42 females. It was concluded that all the models overestimated PN. Von Bertalanffy and Brody models overestimated A, and Gompertz and Logistic models underestimated it. The smaller DPA was obtained by Brody model characterizing a bigger R2 but this model presented the bigger DMA. Considering all the criterions, Gompertz model presented the best adjustment followed by Logistic and Von Bertalanffy. It is suggested do not use Brody model to describe the growing curve for animals of Murrah breed raised in the conditions of this work. In Paper 3 there were estimated covariance components and genetic parameters by Bayesian focus, using the Family BLUPF90, for the parameters A and K, estimated by Gompertz model and adopting an animal model. The heritability coefficients presented elevated values for A and for K (0.57 and 0.34, respectively), indicating that selection can be used as an instrument for change the curve shape of this population. However, the use of this information must be done with to much attention because these traits are negatively correlated. In this case a restricted selection index should be used with more success. / Objetivou-se com este trabalho estudar o ajuste de modelos não-lineares Von Bertalanffy, Brody, Gompertz e Logístico aos dados de crescimento de búfalos(as) da raça Murrah criados em terras baixas no Estado do Rio Grande do Sul e estimar os componentes de (co)variâncias, sob enfoque Bayesiano, para os parâmetros da curva de crescimento com interpretação biológica. No Capítulo 01 foram estudados os ajustes dos modelos não-lineares, supracitados, aos dados de crescimento para um grupo de 63 búfalas, nascidas no período de 1982 a 1989, filhas de três reprodutores e 38 matrizes. Foram avaliadas as características Peso Assintótico (A) e a Taxa de Maturação (K). Os pares de registro peso-idade totalizaram 26 pesagens/fêmea e 1.638 observações. Os critérios utilizados para selecionar o modelo de melhor ajuste à curva de crescimento foram: desvio padrão assintótico (DPA); o coeficiente de determinação (R2); o desvio médio absoluto dos resíduos (DMA) e o índice assintótico (IA). Em ordem crescente, os modelos Von Bertalanffy, Gompertz, Brody e Logístico superestimaram o PN em 28,55; 32,74; 42,70 e 43,45 kg, respectivamente. O modelo Logístico subestimou o A (-2,09 kg) e os demais modelos (Gompertz, Von Bertalanffy e Brody) superestimaram este parâmetro, em: 8,04; 17,7 e 280,33 kg, respectivamente. Com base nos critérios de ajuste e na visualização das curvas preditas, o modelo Gompertz, seguido dos modelos Logístico e Von Bertalanffy seriam os de melhor ajuste. No Capítulo 02 estudaram-se os ajustes dos mesmos modelos para as mesmas características referenciados no Capítulo 01, aos dados de crescimento para um grupo de 64 búfalos, nascidos no período de 1982 a 1989, filhos de três reprodutores e 42 matrizes. Concluiu-se que todos os modelos superestimaram o PN. Os modelos Von Bertalanffy e Brody superestimaram o A em 14,7 e 167,22 kg, respectivamente, ao passo que os modelos Gompertz e Logístico o subestimaram em 5 e 13 kg, respectivamente. Considerando todos os critérios, o modelo Logístico apresentou o melhor ajuste seguido dos modelos Gompertz e Von Bertalanffy. Sugere-se que o modelo Brody não seja utilizado para descrever a curva de crescimento de búfalos(as) da raça Murrah, criados sob as condições deste trabalho. No Capítulo 03, foram estimados os componentes de (co)variâncias e os parâmetros genéticos sob enfoque Bayesiano, utilizando os programas da Família BLUPF90, dos parâmetros A e K, estimados pelo modelo Gompertz, adotando um modelo animal. Os coeficientes de herdabilidade foram de elevada magnitude tanto para A quanto para K (0,57 e 0,34, respectivamente), indicando que a seleção pode ser usada como instrumento para alterar a forma da curva de crescimento desses animais. Entretanto, o uso dessas informações deve ser feito com grande cautela, uma vez que as características a serem trabalhadas na modificação do formato da curva de crescimento são negativamente correlacionadas, além também, da grande variabilidade das estimativas. Neste caso, os índices de seleção restritos poderiam ser utilizados com maior sucesso.

The objective of this study was to estimate the values of the (co)variance components and genetic parameters for reproductive traits in Santa Inês sheep raised in different states and registered with the Associação Sergipana dos Criadores de Caprinos e Ovinos (Goat and Sheep Breeders Association of Sergipe). The database used was provided by the Association and comprised pedigree observations originating from 11,483 registered individuals, out of which 2,238 were born in the program and had calving records, being part of the relationship matrix. After restriction application, there remained 843 animals for analysis which had data related to the age at first calving (IPP1), 151 with data related to the median calving interval (IPM2), and 151 to the interval between first and second calvings (IPS3). To obtain the values of (co)variance components and genetic parameters, we used the Bayesian inference under an animal model with the Gibbs sampling algorithm aided by the MTGSAM program. The two-trait linear model used considered the contemporary group as the fixed effect for IPP1, IPM2, and IPS3, and the type of calving and the age of the animal at calving as the covariate effect. The estimated values of h2 for IPP1, IPM2, and IPS3 were equal to 0.19 ± 0.0459, 0.0169 ± 0:36, and 0:35 ± 0.016 respectively. The estimated heritability for IPP1is considered average and the values for IPM2 and IPS3 were considered high, which leads to the conclusion that these characteristics can be used as selection criteria in a breeding program of Santa Inês sheep. The estimated value for the correlation between IPP1 and IPM2, and IPP1 and IP2, were negative and equal to rg12 = -0.2569 ± 0.0546, rg13= -0.1134 ± 0.0553, which were physiological expected low values that represent a trend which suggests individual selection for those traits. However, the rg23 shows a positive and high trend of 0.9601 ± 0.0091 for IPM2 and IPS3 suggesting indirect selection as the best option for these traits. / Objetivou-se estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para características reprodutivas de ovinos Santa Inês, criados em diferentes estados e registrados na Associação Sergipana dos Criadores de Caprinos e Ovinos. O banco de dados utilizado foi fornecido por esta associação, composto por observações de pedigree originadas de 11.483 indivíduos registrados dos quais 2.238 eram nascidos no programa e tinham registro de parto, permanecendo na matriz de parentesco. Após a aplicação das restrições, foram mantidas na análise 843 animais com dados referentes a característica idade ao primeiro parto (IPP1), 151 referentes a intervalo médio ao parto (IPM2) e 151 para intervalo entre primeiro e segundo parto (IPS3). Para obter os valores dos componentes de (co)variância e parâmetros genéticos utilizou-se analise bayesiana sob modelo animal mediante o algorismo Amostrador de Gibbs com o auxilio do programa MTGSAM. O modelo linear bicaracterística utilizado considerava como efeito fixo o grupo contemporâneo para as características IPP1, IPM2 e IPS3, considerou-se o efeito do tipo de parto e a idade do animal ao parto como efeito (co)variável. Os valores de h2 estimados para IPP1, IPM2 e IPS3 foram iguais a 0.19±0.0459, 0.36±0.0169 e 0.35±0.016 respectivamente. O valor estimado da herdabilidade para IPP1 é considerado médio e os valor para IPM2 e IPS3 alto, fato que leva a concluir que estas característica podem ser usadas como critério de seleção em um programa de melhoramento de ovinos da raça Santa Inês. O valor estimado para a correlação entre características IPP1 e IMP2; IPP1 e IPS2 foram negativos e iguais a rg12= -0.2569 ± 0.0546, rg13= -0.1134 ± 0.0553 valores fisiologicamente esperados de baixa magnitude que sugerem seleção individual para essas características, entretanto para IPM2 e IPS3 a rg23 mostra tendência positiva e muito elevada igual a rg23= 0.9601 ± 0.0091 valor que indica a seleção indireta o melhor caminho.