A classificação de sementes de milho pelas dimensões de comprimento e largura é importante para um bom desempenho de semeadoras de precisão, contribuindo em muito para a obtenção da adequada distribuição espacial e população de plantas, com reflexos sobre o rendimento da cultura. No Brasil, uma das limitações enfrentadas pelas empresas produtoras de sementes de milho é a falta de padrões oficiais mais específicos para a classificação, principalmente em relação ao comprimento das sementes. Provavelmente a carência de padrões oficiais advêm da inexistência de métodos práticos, exatos e repetitivos para medir as sementes. Por esta razão, amostras de lotes de sementes classificados em 18C, 18L, 20C, 20L, 22C, 22L, 24C, 24L foram submetidas ao teste de retenção de peneiras e longuímetro. Em amostras de sementes retidas pelas peneiras e determinadas pelo longuímetro, foram determinadas as dimensões de comprimento e largura empregando-se o projetor de perfil. A seguir, foram comparadas às medidas determinadas com o projetor de perfil, com e entre si, as medidas determinadas pelos métodos tradicionais e as medidas estimadas com emprego do sistema SIARCS 3.0 ® (métodos do retângulo circunscrito e da elipse que melhor representa o objeto) em imagens digitalizadas com um scanner de mesa nas resoluções de 100, 150, 200 e 250 ppi com as sementes em várias ordenações. Foram estudados os seguintes parâmetros e procedimentos: resolução de digitalização da imagem, tamanho da amostra em função da precisão requerida, procedimento computacional (método do retângulo circunscrito e da elipse que melhor representa o objeto, disponíveis no sistema SIARCS 3.0 ®) e disposição das sementes durante a digitalização das imagens (posição dorsal e ventral, e disposição). Em função da adequação dos parâmetros e dos procedimentos estudados, conclui-se que o emprego da técnica de análise de imagens é viável para determinar o comprimento e a largura de sementes de milho, apresentando alta precisão e exatidão satisfatória, bem como vantagens adicionais em relação aos métodos tradicionais. / Com seeds classification by their length and width is important for a good performance of precision drills, in order to obtain an adequate arrangement of the plant population, with reflex on the yield. One of the limitations found in Brazilian seed industries is the lack of an specific official pattern for seed classification, specially for its length. Probably the lack of an official pattern is due to an absence of a practical, precise and accurate method for this evaluation, which encourages seed industries to develop their own tests. For that reason, samples of eight com seed lots, classified by their length and width as 18C, 18L, 20C, 20L, 22C, 22L, 24C and 24L, were submitted to retention sieve and to a practical test used to measure seed length; those are some methods usually used to evaluate the classification of com seeds. In the seeds retained by the sieves and classified by length, their length and width were measured using an overhead projector, a measuring instrument known by its precision and accuracy. The measures determined with overhead were compared, with and among themselves, to the respectives measures determined with methods traditionally utilized to evaluate the classification of com seeds and to the measures estimated applying the SIARCS 3.0® software in images of seeds made in resolutions of 100, 150,200 and 250 ppi, and with those seeds in different arrangements. The following parameters and procedures were studied: resolution of digitalization, size of the sample in function of the required precision, proceeding of the software (model of rectangle circumscribed and the ellipse, availables in SIARCS 3.0® software) and arrangements of the seeds while digitalization of the images were been made. This present research concluded that the image analysis technique is exact and accurate to estimate measures of length and width in com seeds, and has advantages in relation to the other methods usually used to evaluate com seeds classification.

A caracterização de objetos de dimensões finitas é uma das áreas de aplicação do processamento de imagens [2]. Esta caracterização contribui para o estudo de dinâmicas de crescimento por modelagem matemática e simulação computacional [3, 4, 5]. Existem medidas que inicialmente foram criadas para quantificar certas características de objetos auto-similares, como as formas fractais, que são muito utilizadas em estudos de física. Uma das medidas mais conhecidas é a dimensão fractal, que está associada a complexidade do objeto. A dimensão fractal tem sido utilizada em estudos de objetos como os gerados pelo modelo DLA (Diflusion-Limited-Aggregation) (6, 7), que é um modelo que gera formas por meio de agregação de partículas. Mesmo que poderosa, a dimensão fractal é uma medida degenerada, ou seja, objetos com geometrias distintas podem apresentar mesma dimensão fractal. Com o intuito de contornar esta característica e melhor caracterizar uma forma geométrica uma nova medida denominada lacunaridade foi sugerida por Mandelbrot [8], de tal forma que objetos com mesma dimensão fractal possuíssem lacunaridade distinta. A medida de lacunaridade está relacionada com a textura do objeto e informa o quanto o objeto desvia de ser invariante a translação [9, 10, 11]. Valores baixos de lacunaridade indicam maior invariância translacional, enquanto valores altos indicam o contrário, ou seja, um objeto mais heterogêneo. Existem vários modelos para o cálculo da lacunaridade [12, 13, 14, 9], contudo, ainda restam algumas arbitrariedades que dificultam a aplicação destes no estudo de objetos finitos [15]. O objetivo deste estudo é justamente adaptar a medida de lacunaridade a análise seqüencial de imagens de objetos com auto-similaridade restrita, como por exemplo, neurônios, de forma a remover as arbitrariedades características dos algoritmos convencionais / The shape characterization of objects is an application of image processing [2] which has been applied to the understand of natural phenomena as well as growth dynamics by mathematical modeling and computational simulation [3, 4, 5]. There are many kinds of measures that were designed to quantify auto-similar features, such as fractal forms, which are largely applied in physical studies. The fractal dimension is one of these measures associated to object complexity, used to investigate features of objects, for instance, generated by DLA (Diffusion-Limited-Aggregation) models [6, 7]. These models generate ramified structures by means of particle aggregation. Although powerful, the measure presents degeneracy, e.g., some distinct fractals may present the same fractal dimension. Intended to overlook this feature and better characterize geometrical forms, a new measure has been proposed by Mandelbrot, namely the lacunarity [8], in order to distinguish between objects whit same fractal dimensions. This measure is related to object texture and provides information about translational invariance [9, 10, 11]. Low values of lacunarity mean high translational invariance while high values mean the opposite situation, e.g., more heterogeneous objects. Although, there are severa1 ways to calculate lacunarity [12, 13, 14, 9], some arbitrary parameters remains which make it difficult to apply these methods to finite size objects analysis [15]. The present study intends to adapt the lacunarity measure to finite size objects in order to achieve translation an rotational invariance

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-24T14:33:02Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3887893 bytes, checksum: 1c7789d1af719425cbe711fa65367199 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T14:33:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3887893 bytes, checksum: 1c7789d1af719425cbe711fa65367199 (MD5) Previous issue date: 2003-12-05 / Foi desenvolvido o software QUANT para processamento, segmentação e mensuração em imagens digitais. Realizaram-se três estudos para avaliar a acurácia e precisão do QUANT. No primeiro estudo, três experimentos foram conduzidos com imagens obtidas por meio de um digitalizador de imagens tipo mesa (scanner). No primeiro, imagens de um disco de metal de 50 cm 2 foram obtidas em diferentes posições no scanner e em seis resoluções (75 a 300 dpi). No segundo experimento foram utilizadas imagens com resolução de 75 a 300 dpi, de oito botões redondos com área conhecida (0,5 a 5,1 cm 2 ), e no terceiro, imagens digitalizadas a 100 e 300 dpi, de 40 diagramas de papel com tamanho aproximado de 50 cm 2 . Cada diagrama apresentava de um a 40 orifícios circulares e de mesmo tamanho. Em todos os três experimentos, as imagens foram processadas pelo software QUANT e as áreas do disco de metal, dos botões, dos diagramas de papel e de seus orifícios foram segmentadas e mensuradas. No primeiro experimento, as áreas foram segmentadas pelo procedimento de intervalo de coordenadas de cores. No segundo e terceiro experimentos, utilizou-se o procedimento de seleção de áreas do QUANT. As áreas também foram mensuradas com o uso do medidor de área da Li-cor® , modelo LI – 3100. No primeiro experimento, o QUANT apresentou acurácia de 98,7% para imagens com 200 dpi e acurácia superior a 99,7% para as imagens nas demais resoluções. No segundo experimento, O QUANT apresentou acurácia superior a 98% e precisão de 99,99%. No terceiro experimento, na estimativa das áreas dos orifícios, o QUANT apresentou acurácia de 98,4% e o medidor de área, 87%. Esses resultados evidenciam que o QUANT possui alto potencial de uso na segmentação e mensuração de áreas em imagens digitais. No segundo estudo, foram avaliadas a acurácia e a precisão do software QUANT na mensuração da área foliar total, da área desfolhada (consumida) e da severidade da desfolha (percentagem da área foliar desfolhada) por besouros crisomelídeos, em 99 folhas de pimentão (Capsicum annuum), usando imagens digitais, com resolução de 100 e 300 dpi. Também foram feitas mensurações com o medidor de área Li-cor® modelo LI-3100, por meio de estimativa visual por seis avaliadores. A área desfolhada também foi estimada por dois avaliadores observando- se as imagens digitais obtidas com papel milimetrado como fundo, por meio de contagem direta de cada quadrado de 1mm 2 de área. A resolução da imagem não afetou as estimativas de área pelo QUANT. As estimativas de área com o uso do QUANT e com o LI-3100 apresentaram concordância de 97,8%, 77,0% e 80,8%, para área foliar, área desfolhada e severidade, respectivamente. Compararam-se as mensurações de área desfolhada do QUANT e do LI-3100 com mensurações realizadas por dois avaliadores, por meio de contagem de quadrículas em papel milimetrado. O QUANT apresentou maior acurácia (89,0 a 93,1%) e precisão (97,0%) que o medidor de área foliar, o qual apresentou acurácia de 86 a 88% e precisão de 77%. Todos os seis avaliadores visuais superestimaram a severidade. Apenas um avaliador apresentou alta acurácia (92%). A precisão dos avaliadores variou de 22,3 a 92,1%. No terceiro estudo, utilizaram-se diferentes procedimentos do software QUANT na mensuração da área foliar total, da área lesionada e da severidade da mancha parda (Cercospora coffeicola) em 58 folhas de cafeeiro (Coffea arabica), usando imagens digitais, com resolução de 150 dpi. A severidade foi estimada visualmente por cinco avaliadores. A área lesionada foi mensurada com o medidor de área Li-cor® modelo LI-3100 e por meio de contagem direta observando-se as imagens digitais obtidas com papel milimetrado como fundo. Para tanto, as lesões foram previamente retiradas da folha com o auxilio de um bisturi. As estimativas de áreas com o procedimento de seleção de áreas com a varinha mágica foi arbitrariamente considerado o padrão do QUANT. Essas estimativas de área foliar apresentaram 99,3% de concordância com as do LI-3100. Nas estimativas das áreas lesionadas, quando comparados com o método do papel milimetrado, o QUANT apresentou acurácia de 97,9% e o LI 3100, de 83,7%. Imagens com contraste previamente alterado, segundo três protocolos, tiveram as áreas foliares estimadas por meio de três procedimentos do QUANT, que quando comparados com o procedimento padrão, apresentaram acurácia de 98,6 a 100% e precisão de 99,99%. Com relação à área lesionada, os procedimentos de limiar preto e branco, função discriminante e redução para 32 cores, apresentaram alta acurácia (96,6 a 99,6%) e precisão (≥ 99,3%). Nas estimativas de severidade o procedimento de redução para 32 cores apresentou acurácia superior a 99%, enquanto as função discriminantes e o intervalo de coordenadas de cores apresentaram acurácia inferior. As estimativas de severidade do QUANT (padrão) não apresentaram boa concordância com as do medidor de área foliar LI-3100. Dos cinco avaliadores que estimaram visualmente a severidade de doença, somente um apresentou acurácia (97%) e precisão (94%) elevadas. Quatro usuários do QUANT estimaram área foliar em 16 folhas, usando o procedimento de seleção de área com a varinha mágica, obtendo acurácia superior a 99%. Três usuários estimaram área lesionada usando este procedimento, e também o procedimento de limiarização, obtendo acurácia entre 96 e 98%. O QUANT disponibiliza vários algoritmos para melhorar o contraste da imagem, Com isso, mesmo os sintomas de doenças onde o sistema visual humano tem dificuldade de distinguir entre área foliar sadia e doente, podem ser quantificados com o uso do QUANT. Propõe-se que o QUANT seja adotado como padrão na mensuração de severidade de doenças de plantas e área foliar injuriada (consumida) por insetos. Palavras-chaves: imagens digitais, fitopatometria, herbivoria. / The software QUANT was developed for processing, segmentation and mensuration in digital images. It was accomplished three set of trials to evaluate the accuracy and precision of the QUANT. In the first trial set, images were obtained through a scanner. In the first trial, images of a steel disk of 50 cm 2 were obtained in different positions on the scanner and with six resolutions (75 to 300 dpi). In the second trial, images of eight round buttons with known area (0.5 to 5.1 cm 2 ) had resolutions from 75 to 300 dpi, and in the third trial, images at 100 and 300 dpi, of 40 diagrams of paper, each having from one to 40 rounded holes. In all trials, the images were processed by the software QUANT and the areas of the metal disk, buttons, diagrams, and of the holes were segmented and measured. In the first trial, the areas were segmented by the procedure of interval of coordinates of colour. In the second and third trials, the procedure for selection of areas was used. The areas were also measured with the area meter Li-cor, model LI-3100. In the first trail, QUANT showed accuracy of 98.7% for images with 200 dpi and 99.7% for others. In the second trial, QUANT showed accuracy of 98%. In the third experiment, in the estimate of the areas of the holes, QUANT showed accuracy of 98.4% and the area meter, 87%. The results have evidenced that the QUANT has high potential for segmentation and mensuration of areas in digital images. In the second trial set, It was evaluated the accuracy and precision of the software QUANT in the mensuration of the foliar area, defoliated area for beetles and of the severity (percentage of the eaten foliar area), in 99 leaves of green pepper (Capsicum annuum), using digital images, at 100 and 300 dpi. Mensuration with the area meter Li-cor, model LI-3100, and through visual estimate of six evaluators were accomplished too. The defoliated area was also measured by two evaluators counting on graph paper squared 1 mm. The image resolution didn't affect the mensuration by QUANT. The mensuration by QUANT and by LI-3100 showed agreement of 97.8%, 77.0% and 80.8%, for foliar area, defoliated area and severity, respectively. The mensuration of defoliated area by Quant and by LI-3100 were compared with mensuration accomplished by two evaluators, through counting on graph paper squared 1 mm. QUANT presented accuracy > 89 % and precision 97%. The LI-3100 showed accuracy > 86% and precision of 77%. All the six visual evaluators overestimated the severity. Just an evaluator showed high accuracy (92%). The evaluators’ precision varied from 22 to 92%. In the third trial set, it was evaluated the accuracy and precision of the different procedures of the software QUANT in the mensuration of the foliar area, diseased area and severity of Cercospora leaf spot (Cercospora coffeicola) in 58 leaves of coffee (Coffea arabica), using digital images at dpi. The severity was visually estimated by five evaluators. The diseased area was estimated with the meter of area Li-cor model LI- 3100 and through direct counting being observed the digital images obtained with graph paper squared 1 mm as bottom. The lesions were previously removed of the leaf. The estimates of areas with the procedure selection of areas with the magic rod were arbitrarily considered the standard of QUANT. These estimates of foliar area showed 99,3% of agreement with the ones of the LI-3100. In the estimates of the diseased areas, when compared with the method of the graph paper squared 1 mm, QUANT and the LI-3100 showed accuracy of 97.9% and 83.7%, respectively. Images with contrast previously challenged, according to three protocols, had the foliar areas estimated by three procedures of QUANT, that when compared with the standard procedure, they presented accuracy from 98.6 to 100% and precision of 99.99%. The procedures of threshold, discriminant functions and reduction for 32 colours showed high accuracy (96.6 to 99.6%) and precision (99.3%) on the estimations of diseased area. Estimating severity, the procedure reduction for 32 colours showed higher accuracy (99%) than discriminant functions and the interval of colour coordinates. The standard estimates of severity by QUANT didn't show good agreement with the ones of the LI-3100. Among five visual evaluators, only one showed high accuracy (97%) and precision (94%). Four users of QUANT estimated foliar area in 16 leaves, using the procedure of area selection with the magic rod, obtaining accuracy > 99%. Three users estimated diseased area using this procedure, and also the threshold, obtaining accuracy between 96 and 98%. QUANT makes available several algorithms to improve the contrast of the image, which allow that, even the symptoms where the eye human system has difficulty of distinguishing among healthy and diseased foliar area, they can be quantified by QUANT. It is proposed that QUANT should be adopted as standard method (golden method) in the mensuration of severity of plant diseases and defoliated (eaten) foliar area. Key words: herbivory, digital image, phytopathometry. / Tese importada do Alexandria

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2017. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2017-04-13T15:12:13Z No. of bitstreams: 1 2017_ErichBarrosBrandani.pdf: 816859 bytes, checksum: c82bdfbfcbb6ed9289cdc280861d5c21 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2017-04-17T15:02:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_ErichBarrosBrandani.pdf: 816859 bytes, checksum: c82bdfbfcbb6ed9289cdc280861d5c21 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-17T15:02:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_ErichBarrosBrandani.pdf: 816859 bytes, checksum: c82bdfbfcbb6ed9289cdc280861d5c21 (MD5) / A análise de imagens de plântulas vem sendo estudada com o objetivo de minimizar as limitações existentes nos testes tradicionais, sendo uma técnica com amplo potencial de utilização no controle de qualidade de sementes de diversas culturas. O GroundEye é um equipamento que pode ser utilizado na avaliação da qualidade fisiológica de sementes. O objetivo foi adequar uma metodologia de análise de imagens de plântulas de soja pelo GroundEye, bem como verificar a potencialidade de utilização deste equipamento na avaliação do vigor de sementes de soja. Foram utilizados oito lotes de duas variedades de soja caracterizados pelos testes de germinação, envelhecimento acelerado, teste de frio, tetrazólio, condutividade elétrica e emergência de plântulas em campo. Foi realizada análise de imagens das plântulas de soja pelo software GroundEye sem correção manual e os resultados comparados com as medições manuais e o teste de vigor de envelhecimento acelerado. A caracterização mostrou que os lotes das duas variedades apresentavam diferença quanto à qualidade fisiológica. A avaliação de vigor realizada pelo envelhecimento acelerado e o índice de vigor do GroundEye foi igual na comparação dos lotes de soja. O mesmo foi verificado com a comparação da medição manual e a do GroundEye quanto ao comprimento de plântula e raiz. A avaliação do vigor de sementes de soja por meio da análise de imagem com o software GroundEye pode ser realizada em plântulas obtidas em semeadura em papel de germinação, a temperatura de 25 ºC com avaliação ao terceiro dia, sem necessidade de correção da imagem das plântulas. O GroundEye demonstrou ser um equipamento promissor na avaliação do vigor de sementes de soja, podendo ser adotado como teste complementar no controle de qualidade de empresas produtoras de sementes. / The analysis of seedling images has been studied with the objective of minimizing the existing limitations in the traditional tests, being a technique with wide potential of use in the quality control of seeds of diverse cultures. GroundEye is an equipment that can be used to evaluate the physiological quality of seeds. The objective was to adapt a methodology of soybean seedlings image analysis by GroundEye, as well as verify the potential use of this equipment in the evaluation of soybean seed vigor. Eight lots of two varieties of soybean were used, characterized by the tests of germination, accelerated aging, cold test, tetrazolium, electrical conductivity and emergence of field seedlings. Soybean seedlings were analyzed by the GroundEye software without manual correction and the results compared with the manual measurements and the accelerated aging vigor test. The characterization showed that the lots of the two varieties had differences in the physiological quality. The vigor evaluation performed by accelerated aging and GroundEye's vigor index was the same in the comparison of soybean lots. The same was verified by comparing the manual measurement and the GroundEye measurement for seedling and root length. The evaluation of the vigor of soybean seeds by means of the image analysis with the software GroundEye can be carried out in seedlings obtained in sowing in germination paper, the temperature of 25 ºC with evaluation in the third day, without need of correction of the image of the seedlings. GroundEye has been shown to be a promising equipment in the evaluation of the vigor of soybean seeds, and can be adopted as a complementary test in the quality control of seed companies.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2013. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2014-05-27T13:56:17Z No. of bitstreams: 1 2013_LucianaLilianLouzadaMartini.pdf: 1613486 bytes, checksum: 5a2c731dc3cdf67e75cc5e0465edd787 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-05-27T14:11:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LucianaLilianLouzadaMartini.pdf: 1613486 bytes, checksum: 5a2c731dc3cdf67e75cc5e0465edd787 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-05-27T14:11:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LucianaLilianLouzadaMartini.pdf: 1613486 bytes, checksum: 5a2c731dc3cdf67e75cc5e0465edd787 (MD5) / Introdução: As técnicas usadas para medição volumétrica em uso com execução mais simples ou complexa incluem métodos manuais, semiautomáticos e automáticos com diferentes programas e protocolos. Apesar do avanço tecnológico nesta área, o traçado manual continua sendo o método mais eficaz e de menor custo, entretanto, é o que mais consome tempo, limitando sua aplicação clínica. O programa Osirix é um visualizador DICOM (Comunicação de Imagens Digitais em Medicina), baseado em plataforma Apple, distribuído em várias versões, incluindo uma de 32bits que é gratuita. É uma aplicação com bom desempenho e amplamente difundida entre os radiologistas e demais especialistas que utilizam imagens na sua prática diária. Objetivo: Desenvolver uma técnica de medição volumétrica manual do hipocampo utilizando o visualizador Osirix, versão 5,6 e realizar a comparação interobservador da medição do hipocampo com a mesma técnica. Materiais e Métodos: Foi utilizado o visualizador Osirix gratuito, com imagens de sequência volumétrica SPGR ponderadas em T1, com cortes de 1mm de espessura; intervalo de 0,1mm, obtidas em aparelho de ressonância magnética (RM) GE de 1,5T, com bobina de 8 canais. Foi usada uma delimitação visual específica do hipocampo. No mínimo dez cortes foram escolhidos para o traçado manual das regiões de interesse (ROI), preferencialmente quando houvesse uma mudança na sua conformação visual. Em seguida, selecionou-se na barra de ferramentas o comando ROI, opção ROI volume (volume da área de interesse) e generate missing ROI (gerar áreas de interesse), para gerar as áreas subsequentes automaticamente podendo ser corrigidas manualmente em caso de erros do programa. Finalmente, repetiu-se a sequência ROI e ROI volume, mas dessa vez com o comando compute volume (computar volume) para calcular o volume total de todas as áreas de interesse e gerar uma imagem correspondente em três dimensões (3D). Os coeficientes de correlação intraclasse foram calculados, com um intervalo de 95% de confiança, como uma medida de confiabilidade relativa entre as volumetrias dos leitores. Estes coeficientes foram calculados para uma análise de variância (ANOVA) a dois fatores baseado em concordância absoluta. A técnica foi aplicada em 12 pacientes com idade média de 75 anos, sexo feminino, cognitivamente normal e que realizaram RM devido a outras queixas, como cefaleia, e não apresentavam anormalidades estruturais. As medidas foram realizadas por dois médicos residentes do terceiro ano (R3) de radiologia e uma geriatra, esta sem experiência prévia em manipular imagens de RM. Resultados: Após a análise estatística, verificou-se que todos os coeficientes de correlação intraclasse apresentaram valores abaixo de 0,40 que indica uma baixa concordância entre os avaliadores. Conclusão: A medição volumétrica do hipocampo utilizando o visualizador Osirix tem a vantagem de ser acessível e ter um custo baixo comparado com as técnicas automáticas. Contudo, o procedimento é trabalhoso, demanda tempo e não houve uma correção para a atrofia relacionada ao envelhecimento e a variabilidade individual. A análise estatística evidenciou uma baixa concordância entre os avaliadores o que reforça a necessidade de maior treinamento na delimitação do hipocampo relatado na literatura. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Introduction: The techniques used for volume measurement from simple to more complex methods include manual, semiautomatic and automatic measurements with a variety of programs and protocols. Despite technological advances, manual tracing remains the most effective and least costly, however it’s more time-consuming and this limits its clinical use. Osirix™ is a DICOM™ (Digital Imaging and Communications in Medicine), viewer, based on an Apple™ platform, available in several versions, including a 32 bits that is free of charge. It performs well and is widespread among radiologists and other specialists who use images in their daily practice. Objective: To develop a technique for hippocampal manual volumetric measurement using the DICOM viewer Osirix™ version 5.6 and compare the interater measurement of the hippocampus with the same technique. Materials and Methods: We used the free viewer Osirix™, with images obtained by T1-weighted gradient echo SPGR volumetric sequence, 1mm thick slices with 0.1mm interval on a 1.5 T MRI (magnetic resonance imaging) GE with an 8 channel head coil. A specific delineation of the hippocampus was used. At least ten slices were chosen to manually trace the region of interest (ROI), preferably where there were changes in its visual conformation. Next, in the toolbar, we selected the following sequence of commands: “ROI”, “ROI volume” and “generate missing ROI” and the software generated automatically the missing ROI that was corrected manually in case of errors. Finally, the sequence was repeated, “ROI”, “ROI volume”, but this time with the final command being “compute volume” to calculate the total volume of all the areas of interest and generate a corresponding three dimensional (3D) image. The Intraclass Correlation Coefficient (ICC) was calculated with 95% confidence interval, 10 as a measure of the reliability between volumetric ratings. These coefficients were calculated on a two-way ANOVA model based on absolute agreement. This technique was applied in 12 patients with mean age of 75, female, cognitively normal and who had MRI performed due to other complaints, such as headache, that showed no structural abnormalities. Two third year radiology residents and 1 geriatrician with limited MRI experience performed the measurements. Results: The statistical analysis found that all ICC had values below 0.40, indicating a weak correlation among raters. Conclusion: The manual volumetric hippocampus measurement with Osirix™ has the advantage of being accessible and of low cost compared to automatic techniques. This technique is time consuming and there was no correction for aging atrophy or individual variability. Statistical analysis demonstrated a weak correlation among raters which confirms the importance of training the researchers on the delineation of the hippocampus.

Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Faculdade de Comunicação, Programa de pós-graduação em Comunicação, 2010. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-05-09T18:09:52Z No. of bitstreams: 1 2010_RobertaSimon.pdf: 14302796 bytes, checksum: aa5567f0fd4d1c5fc2e7c68abf15215f (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-05-09T18:10:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_RobertaSimon.pdf: 14302796 bytes, checksum: aa5567f0fd4d1c5fc2e7c68abf15215f (MD5) / Made available in DSpace on 2011-05-09T18:10:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_RobertaSimon.pdf: 14302796 bytes, checksum: aa5567f0fd4d1c5fc2e7c68abf15215f (MD5) / Pesquisamos o processo receptivo de leituras de imagens. Buscamos refletir a desconstrução e construção de sentidos e realidades das imagens fotográficas de projetos sócio-culturais. Adotamos como objeto empírico dois livros impressos: Arte de Transformação..., com fotografias de Mila Petrillo, e Do Avesso ao Direito, com fotografias de Iolanda Huzak. As leituras ocorrem a partir da potencialidade da comunicação ficcional e poética dessas imagens. Nesse momento, percebemos um jogo de conexão estético-afetiva entre homem, mundo e imagem. A potencialidade ficcional acontece pela narrativa de formação de novos sentidos, pelos silêncios de internalização, pelas transformações da imagem em palavras e pelas encruzilhadas de imaginários. A potencialidade poética percebemos pela compreensão do invisível, do onírico, do conteúdo sensível e das metáforas visuais. Por fim, pelo processo de compartilhamento de narrativas e poéticas, a experiência do sagrado se revela e reconstrói imaginários, religando homem, mundo e imagem. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Our research deals with the reception process regarding image reading. We aim to reflect the deconstruction and construction of the senses and realities in photographic images of sociocultural projects. We employ two books as empirical objects: Arte de Transformação... (Art of Transformation...), with photographs by Mila Petrillo, and Do Avesso ao Direito (Turning Wrongs into Rights), with photographs by Iolanda Huzak. Image reading stems from the potential of fictional communication and from the poetics of the images concerned. The fictional potential is fulfilled by means of narratives in the formation of new senses, by means of silences in the internalization process, by means of the transformation of images into words and of the crossroads of imaginaries. We perceive the poetic potential as stemming from nonvisual comprehension of the images, from their oneiric aspect, from their sensitive core and from their visual metaphors. Finally, as a consequence of the joint process of narrative and poetics, a holy experience is revealed and rebuilds imaginaries, reconnecting man, world and image.

A caracterização de objetos de dimensões finitas é uma das áreas de aplicação do processamento de imagens [2]. Esta caracterização contribui para o estudo de dinâmicas de crescimento por modelagem matemática e simulação computacional [3, 4, 5]. Existem medidas que inicialmente foram criadas para quantificar certas características de objetos auto-similares, como as formas fractais, que são muito utilizadas em estudos de física. Uma das medidas mais conhecidas é a dimensão fractal, que está associada a complexidade do objeto. A dimensão fractal tem sido utilizada em estudos de objetos como os gerados pelo modelo DLA (Diflusion-Limited-Aggregation) (6, 7), que é um modelo que gera formas por meio de agregação de partículas. Mesmo que poderosa, a dimensão fractal é uma medida degenerada, ou seja, objetos com geometrias distintas podem apresentar mesma dimensão fractal. Com o intuito de contornar esta característica e melhor caracterizar uma forma geométrica uma nova medida denominada lacunaridade foi sugerida por Mandelbrot [8], de tal forma que objetos com mesma dimensão fractal possuíssem lacunaridade distinta. A medida de lacunaridade está relacionada com a textura do objeto e informa o quanto o objeto desvia de ser invariante a translação [9, 10, 11]. Valores baixos de lacunaridade indicam maior invariância translacional, enquanto valores altos indicam o contrário, ou seja, um objeto mais heterogêneo. Existem vários modelos para o cálculo da lacunaridade [12, 13, 14, 9], contudo, ainda restam algumas arbitrariedades que dificultam a aplicação destes no estudo de objetos finitos [15]. O objetivo deste estudo é justamente adaptar a medida de lacunaridade a análise seqüencial de imagens de objetos com auto-similaridade restrita, como por exemplo, neurônios, de forma a remover as arbitrariedades características dos algoritmos convencionais / The shape characterization of objects is an application of image processing [2] which has been applied to the understand of natural phenomena as well as growth dynamics by mathematical modeling and computational simulation [3, 4, 5]. There are many kinds of measures that were designed to quantify auto-similar features, such as fractal forms, which are largely applied in physical studies. The fractal dimension is one of these measures associated to object complexity, used to investigate features of objects, for instance, generated by DLA (Diffusion-Limited-Aggregation) models [6, 7]. These models generate ramified structures by means of particle aggregation. Although powerful, the measure presents degeneracy, e.g., some distinct fractals may present the same fractal dimension. Intended to overlook this feature and better characterize geometrical forms, a new measure has been proposed by Mandelbrot, namely the lacunarity [8], in order to distinguish between objects whit same fractal dimensions. This measure is related to object texture and provides information about translational invariance [9, 10, 11]. Low values of lacunarity mean high translational invariance while high values mean the opposite situation, e.g., more heterogeneous objects. Although, there are severa1 ways to calculate lacunarity [12, 13, 14, 9], some arbitrary parameters remains which make it difficult to apply these methods to finite size objects analysis [15]. The present study intends to adapt the lacunarity measure to finite size objects in order to achieve translation an rotational invariance

Submitted by João Arthur Martins (joao.arthur@ufpe.br) on 2015-03-10T18:45:31Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao Gilliard Lopes.pdf: 2357528 bytes, checksum: fd0913ca03078329224a12a6dd90a678 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T17:47:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao Gilliard Lopes.pdf: 2357528 bytes, checksum: fd0913ca03078329224a12a6dd90a678 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-08-13 / FACEPE / Esta dissertação apresenta um novo algoritmo para segmentação de sinais de voz baseado em técnicas de processamento de imagem, tais como análise de espectrograma, morfologia matemática, componentes conectados, análise de projeção e binarização. O algoritmo proposto opera em dois ciclos: o primeiro age separando o sinal de voz do fundo (silêncio ou ruído). O segundo utiliza esse sinal de voz segmentado para realizar a segmentação de sílabas fonéticas (agrupamento de fonemas). A base de dados de áudio MIT (MIT Mobile Device Speaker Verification Corpus) e a TIMIT (Texas Instruments/Massachussets Institute of Technology) foram utilizadas para validação do algoritmo proposto. Os sinais de voz escolhidos variam desde o gênero do locutor, a regionalidade (sotaque), tipos de fonemas e ruídos de fundo, como: ruídos de apito, chuva, vento e de um cruzamento de ruas com tráfego intenso. A técnica proposta mostrou eficiência na segmentação, no que diz respeito aos segmentos fonéticos, em ambientes com ausência e presença de ruídos, utilizando os mesmos parâmetros em ambas as situações

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:04:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo8874_1.pdf: 1552701 bytes, checksum: ca1f64cd2a9ab7f1dd8b3732c2cc688d (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / O bacilo Helicobacter pylori é atualmente considerado como o agente etiológico mais importante das gastrites em seres humanos e como um fator de risco para o surgimento das doenças ulcerativas do carcinoma gástrico. Estima-se que 50% da população mundial está infectada por esta bactéria. Atualmente, apenas estudos subjetivos e qualitativos têm sido realizados na análise da colonização do H. pylori. O objetivo deste estudo foi avaliar quantitativamente, através de análise morfométrica, a colonização pelo H. pylori em biópsia de pacientes com diferentes lesões gástricas (gastrites e úlcera). Para o estudo utilizou-se biópsias gástricas de 239 pacientes (95 homens e 144 mulheres) com idade média de 45 anos, provenientes de diferentes municípios do estado de Pernambuco. Os cortes histológicos (4μm) foram corados pelo Giemsa e analisado através de microscopia óptica. O estudo morfométrico foi realizado por meio de um sistema digital de análise de imagens onde as áreas de interesse obtidas foram processadas utilizando-se o software OPTIMAS®. Os resultados indicam uma incidência de 39% de lesões inflamatórias gástricas associadas à infecção por Hp com maior ocorrência (60,3%) no gênero feminino e com faixa etária entre 31-45 anos. Quanto às lesões gástricas mais freqüentes observou-se que a gastrite crônica ativa foi a mais evidente em cerca de 90,2% dos casos estudados. Houve uma correlação positiva entre a análise qualitativa (semi-quantitativa) e a análise morfométrica (número médio de bacilos Hp, por área), principalmente quando se comparou os parâmetros numerosos bacilos com os moderados e raros . A partir destes dados pode-se concluir que os estudos referentes aos aspectos da infecção da mucosa gástrica pelo Hp, e mais especificamente os níveis de infecção quanto ao número de bacilos e extensão das áreas afetadas são de sua importância para que se possa conhecer melhor a evolução das lesões gástricas resultantes deste quadro infeccioso e em que situações e grupos humanos podem representar fatores de risco para o desenvolvimento de lesões mais graves como o câncer

Este trabalho faz um estudo do uso da entropia como ferramenta para o reconhecimento de padrões em imagens. A entropia é um conceito utilizado em termodinâmica para medir o grau de organização de um meio. Entretanto, este conceito pode ser ampliado para outras áreas do conhecimento. A adoção do conceito em Teoria da Informação e, por consequência, em reconhecimento de padrões foi introduzida por Shannon no trabalho intitulado \"A Mathematical Theory of Communication\", publicado no ano de 1948. Neste mestrado, além da entropia clássica de Boltzman-Gibbs-Shannon, são investigadas a entropia generalizada de Tsallis e suas variantes (análise multi-escala, múltiplo índice q e seleção de atributos), aplicadas ao reconhecimento de padrões em imagens. Utilizando bases de dados bem conhecidas na literatura, realizou-se estudos comparativos entre as técnicas. Os resultados mostram que a entropia de Tsallis, através de análise multi-escala e múltiplo índice q, tem grande vantagem sobre a entropia de Boltzman-Gibbs-Shannon. Aplicações práticas deste estudo são propostas com o intuito de demonstrar o potencial do método. / This work studies the use of entropy as a tool for pattern recognition in images. Entropy is a concept used in thermodynamics to measure the degree of organization of a system. However, this concept can be extended to other areas of knowledge. The adoption of the concept in information theory and, consequently, in pattern recognition was introduced by Shannon in the paper entitled \"A Mathematical Theory of Communication\", published in 1948. In this master thesis, the classical Boltzmann-Gibbs-Shannon entropy, the generalized Tsallis entropy and its variants (multi-scale analysis, multiple q index, and feature selection) are studied, applied to pattern recognition in images. Using well known databases, we performed comparative studies between the techniques. The results show that the Tsallis entropy, through multiscale analysis and multiple q index has a great advantage over the classical Boltzmann-Gibbs- Shannon entropy. Practical applications of this study are proposed in order to demonstrate the potential of the method.