Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-01-30Bitstream added on 2014-06-13T19:35:45Z : No. of bitstreams: 1 haddad_sr_me_botfmvz.pdf: 305893 bytes, checksum: 02ff7e2de8b8a9ad8c10e7f22f207754 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O presente trabalho objetivou comparar, utilizando dados de um experimento de Microarray com um delineamento simples, os resultados de diferentes testes estatísticos a fim de verificar suas características na detecção de diferenças no nível de expressão dos genes. Os dados foram provenientes da South Dakota State University-EUA, do Department of Biology and Microbiology, Department of Animal Science, onde toda a parte experimental foi realizada. O material biológico envolveu quatro aves infectadas e quatro não infectadas com o vírus de bronquite infecciosa (IBV). O RNA utilizado foi extraído da camada epitelial da traquéia de animais controle e infectados com o vírus da IBV e, após a transcrição reversa foi marcado com os corantes fluorescentes (Cy3 e Cy5) e hibridizados com o microarray 13k cDNA de aves (FHCRC, Seattle, WA). A análise de dados dos resultados do experimento de microarray englobou dois estágios, sendo o primeiro denominado de Normalização, em que os dados foram pré-processados utilizando o procedimento Loess. A seguir foram realizadas as análises estatísticas propriamente ditas com testes de significância. Utilizou-se um modelo simples de ANOVA e aplicaram-se diferentes metodologias de análise. A análise das imagens revelou que dos 16192 spots em cada slide, apenas 10.926 puderam ser lidos sem defeitos no primeiro slide, 11.633 no segundo slide, 12577 no terceiro e 13.154 no quarto slide. A grande maioria dos spots em branco e controles negativos apresentou defeitos que determinaram sua eliminação. Um total de 13.597 spots foi lido no conjunto dos quatro slides, mas apenas 9.853 spots estavam representados em todos os slides. Concluiu-se que os experimentos de microarray, por tratarem de um conjunto muito grande de observações a serem analisados requerem análises estatísticas específicas. O método de Cui et al. (2005) reduziu... / The aim of this research was to compare, using real data of an experiment of Microarray with a simple design, the results of different statistical tests in order to verify their characteristics in the detection of differences in the level of expression of the genes. The data were coming of South Dakota State University-EUA, of the Department of Biology and Microbiology, Department Animal of Science, where the whole experimental part was accomplished. The biological material involved four infected animals and four no infected with the virus of infectious bronchitis (IBV). Used RNA was extracted of the layer epitelial of the windpipe of animals control and infected with the virus of IBV and, after the reverse transcription it was marked with the fluorescent colors (Cy3 and Cy5) and hybridization with the microarray 13k cDNA of birds (FHCRC, Seattle, WA). The analysis of data of the results of the microarray experiment included two apprenticeships, being the first denominated of Normalization, in that the data were pre-processed using the procedure Loess. To follow the statistical analyses they were accomplished properly said through real data with significant tests. A simple model of ANOVA was used and different analysis methodologies were applied. The analysis of the images revealed that of the 16192 spots in each slide, only 10.926 could be read without defects in the first slide, 11.633 in the second slide, 12577 in the third slide and 13.154 in the fourth slide. The great majority of the spots in white and negative controls presented defects that determined it elimination. A total of 13.597 spots was read in the group of the four slides, but only 9.853 spots were represented in all of the slides. It was ended that the microarray experiments, for they treat of a very big group of observations to be analyzed request specific statistical analyses. The method of Cui et al. (2005) it reduced... (Complete abstract click electronic access below)

[pt] O processo de medição é constituído por um conjunto de sub processos no qual seu início está na seleção da amostra até o final da marcha analítica. Para melhor compreensão, estabeleceu-se que a incerteza proveniente do processo de medição é constituída pela associação da incerteza proveniente do conjunto desses sub processos. A literatura organizou esse conjunto em duas grandes vertentes, o processo de amostragem e o processo analítico, cada um com suas incertezas características. Visando melhor estimar a incerteza de medição, é necessário considerar integralmente a incerteza proveniente de ambos os processos, sem antecipadamente determinar qual componente será mais significativo para a incerteza de medição. Este trabalho teve como motivação o desconhecimento da contribuição da incerteza da amostragem na incerteza de medição. Uma vez que o processo de amostragem é normalmente realizado por profissionais pouco experientes, sem ter conhecimento do quanto a incerteza da amostragem pode impactar na incerteza de medição. O objetivo desta dissertação foi avaliar o quão significativa é a incerteza da amostragem na incerteza de medição, além de estimular a disseminação da cultura desta prática em medições físico-químicas. As metodologias utilizadas para o desenvolvimento deste trabalho foram a análise do estado da arte da incerteza da amostragem e o tratamento de um conjunto de dados por quatro diferentes técnicas estatísticas: análise de variância clássica, análise de variância robusta, e dois modelos diferentes da Range Statistics. Os resultados mostraram que não há um padrão de comportamento no que tange à incerteza da amostragem versus a incerteza analítica, bem como a ausência de metodologias que leve em consideração as características dos dados. Conclui-se que a incerteza da amostragem pode impactar a incerteza de medição, independente da matriz e/ou grandeza em questão. / [en] The measurement process consists of a set of sub-processes where the beginning is in the selection of the sample until the end of the analytical steps. In a simplified way, it can be established that the uncertainty coming from the measurement process is constituted by the association of the uncertainty coming from the set of these sub-processes. The literature has organized this set of subprocesses into two important areas, the sampling process and the analytical process, each one with its own uncertainties characteristics. In order to better estimate the measurement uncertainty, it is necessary to fully consider the uncertainty arising from both processes without firstly determining which component will be most significant for the measurement uncertainty. This work project was motivated by the indifference to the sampling process, which is usually carried out by little experienced professionals, without knowledge of how much uncertainty of sampling can affect the measurement uncertainty. The objective of this dissertation was to evaluate how much uncertainty is the uncertainty of the measurement uncertainty in addition to stimulating the dissemination of the culture of this practice in physicochemical measurements; since, actually, only analytical uncertainty is privileged. The methodologies used were the analysis of the state of art of sampling uncertainty and the treatment of a data set by four different statistical techniques: classical variance analysis, robust variance analysis, and two different models of the Range Statistics. The results showed that there is no behavior pattern regarding to sampling uncertainty versus analytical uncertainty, as well as the absence of methodologies that take into consideration the characteristics of the data. It is concluded that the sampling uncertainty can impact the uncertainty of measurement, regardless of the matrix and / or quantity in question.

Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Raysildo Barbosa Lobo / Banca: Danísio Prado Munari / Resumo: O presente trabalho objetivou comparar, utilizando dados de um experimento de Microarray com um delineamento simples, os resultados de diferentes testes estatísticos a fim de verificar suas características na detecção de diferenças no nível de expressão dos genes. Os dados foram provenientes da South Dakota State University-EUA, do Department of Biology and Microbiology, Department of Animal Science, onde toda a parte experimental foi realizada. O material biológico envolveu quatro aves infectadas e quatro não infectadas com o vírus de bronquite infecciosa (IBV). O RNA utilizado foi extraído da camada epitelial da traquéia de animais controle e infectados com o vírus da IBV e, após a transcrição reversa foi marcado com os corantes fluorescentes (Cy3 e Cy5) e hibridizados com o microarray 13k cDNA de aves (FHCRC, Seattle, WA). A análise de dados dos resultados do experimento de microarray englobou dois estágios, sendo o primeiro denominado de Normalização, em que os dados foram pré-processados utilizando o procedimento Loess. A seguir foram realizadas as análises estatísticas propriamente ditas com testes de significância. Utilizou-se um modelo simples de ANOVA e aplicaram-se diferentes metodologias de análise. A análise das imagens revelou que dos 16192 spots em cada slide, apenas 10.926 puderam ser lidos sem defeitos no primeiro slide, 11.633 no segundo slide, 12577 no terceiro e 13.154 no quarto slide. A grande maioria dos spots em branco e controles negativos apresentou defeitos que determinaram sua eliminação. Um total de 13.597 spots foi lido no conjunto dos quatro slides, mas apenas 9.853 spots estavam representados em todos os slides. Concluiu-se que os experimentos de microarray, por tratarem de um conjunto muito grande de observações a serem analisados requerem análises estatísticas específicas. O método de Cui et al. (2005) reduziu... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this research was to compare, using real data of an experiment of Microarray with a simple design, the results of different statistical tests in order to verify their characteristics in the detection of differences in the level of expression of the genes. The data were coming of South Dakota State University-EUA, of the Department of Biology and Microbiology, Department Animal of Science, where the whole experimental part was accomplished. The biological material involved four infected animals and four no infected with the virus of infectious bronchitis (IBV). Used RNA was extracted of the layer epitelial of the windpipe of animals control and infected with the virus of IBV and, after the reverse transcription it was marked with the fluorescent colors (Cy3 and Cy5) and hybridization with the microarray 13k cDNA of birds (FHCRC, Seattle, WA). The analysis of data of the results of the microarray experiment included two apprenticeships, being the first denominated of Normalization, in that the data were pre-processed using the procedure Loess. To follow the statistical analyses they were accomplished properly said through real data with significant tests. A simple model of ANOVA was used and different analysis methodologies were applied. The analysis of the images revealed that of the 16192 spots in each slide, only 10.926 could be read without defects in the first slide, 11.633 in the second slide, 12577 in the third slide and 13.154 in the fourth slide. The great majority of the spots in white and negative controls presented defects that determined it elimination. A total of 13.597 spots was read in the group of the four slides, but only 9.853 spots were represented in all of the slides. It was ended that the microarray experiments, for they treat of a very big group of observations to be analyzed request specific statistical analyses. The method of Cui et al. (2005) it reduced... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre