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Utilização de técnicas multivariadas na avaliação da divergência genética de populações de girassol (Helianthus annuus L.) /

Messetti, Ana Vergínia Libos, 1964- January 2007 (has links)
Orientador: Carlos Roberto Padovani / Banca: Adriano Wagner Ballarin / Banca: José Carlos Martinez / Banca: Jacinta Ludovico Zamboti / Banca: Marie Oshiiwa / Resumo: Este trabalho foi desenvolvido com os objetivos de avaliar a divergência genética de 12 populações de girassol do Banco de Germoplasma da EMBRAPA /Soja de Londrina por meio de técnicas multivariadas; divulgar tópicos recentes e interessantes das técnicas multivariadas que não são explorados nos trabalhos científicos de melhoramento de plantas e orientar a escolha de populações para cruzamentos nos programas de melhoramento genético da cultura de girassol. O modelo experimental constitui-se de delineamento bloco casualizado envolvendo 12 variedades de girassol avaliadas sob cinco caracteres morfoagronômicos. Por meio da análise univariada foi verificada diferença significativa (p<0,05) dos tratamentos para todos caracteres. A aplicação dos componentes principais permitiu a redução bidimensional, com a explicação de 82,5% da variação total. O número de componentes foi avaliado pelo critério de Kaiser e critério Scree-test. A visualização da divergência genética proporcionada pelos escores das duas primeiras variáveis canônicas, evidenciaram grupos geneticamente diferentes. Ambas técnicas apontaram concordância nos resultados. Com base nas estimativas da distância Mahalanobis e distância euclideana foi realizada a análise de agrupamento adotando-se três algoritmos hierárquicos. Para determinar o número de grupos adotou-se o dendrograma, a análise do nível de fusão e a análise do comportamento de similaridade. Para validação utilizou-se o critério de Wilks dentro de cada grupo e gráficos multivariados auxiliaram na interpretação dos resultados. Pode-se concluir pela existência da divergência genética, detectando-se quatro grupos geneticamente diferentes e caracterizado pelos escores médios. / Abstract: The objective of this work was to evaluate genetic divergence in 12 sunflower populations from EMBRAPA/ Londrina Soybean Germplasm Bank, using multivariate techniques, to discuss recent and interesting topics related to the multivariate techniques donþt found in plant improvement scientific papers, and to offer guidelines on how to choose populations for sunflower genetic improvement crossing programs. The experiment included a totally block casualized design, with twelve sunflower varieties, evaluated according to 5 morphoagronomics traits. The univariate analysis showed a significant difference (p<0,05) among treatments for all the traits. Application of main components allowed for a bi-dimensional reduction, with 82,5% of the total variation. The number of components were evaluated by the Kaiser and Scree-test criteria. Genetic divergence visualization provided by the two first canonical variables showed genetically different groups. Both techniques showed the same results. Based on Mahalanobis and Euclidean distance estimates, a clustering analysis was carried out using three hierarchicals algorithms. A dendrogram, a fusion level analysis and a similarity behavior analysis were conducted to determine the number of groups. Validation used the Wilks criteria inside each group, while multivariate graphs helped with data interpretation. Results from this study showed genetic divergence in four groups characterized by average/mean scores. / Doutor
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Estudo da influência da ciclagem mecânica sobre a resistência de união ao cisalhamento entre uma cerâmica de recobrimento estético e duas cerâmicas infiltradas por vidro /

Landim, Karine Tenório. January 2006 (has links)
Orientador: Renato Sussumu Nishioka / Banca: Osvaldo Daniel Andreatta Filho / Banca: Lafayette Nogueira Junior / Resumo: Este estudo avaliou a influência da ciclagem mecânica na resistência de união ao cisalhamento entre cerâmicas infiltradas por vidro para infra-estrutura (In-Ceram Alumina - Vita Zahnfabrik e In-Ceram Zircônia - Vita Zahnfabrik) e uma cerâmica vítrea de recobrimento (VITA VM7 - Vita Zahnfabrik). Foram preparadas vinte e quatro amostras cilíndricas nas dimensões de 4mm de diâmetro por 5mm de altura para cada cerâmica de infra-estrutura. Posteriormente, a cerâmica de recobrimento estético foi aplicada, resultando em corpos-de-prova com 4mm de diâmetro e 9mm de altura, os quais foram divididos em 4 grupos: ICA; ICAM; ICZ e ICZM. Os grupos ICAM e ICZM receberam ciclagem mecânica, com força de 50N, freqüência de 1Hz, durante 20000 ciclos. O ensaio de cisalhamento foi realizado em máquina de ensaio universal (modelo DL - 1000, EMIC - Equipamentos e Sistemas LTDA., São José dos Pinhais - PR - Brasil) com velocidade de 0,5mm/min e as amostras carregadas até a fratura. As interfaces das amostras pós-fratura foram analisadas em estereomicroscópio (20x) e microscopia eletrônica de varredura. As médias e desvios padrão obtidos foram: ICA (30,04 l 11,74); ICAM (32,17 l 9,59); ICZ (44,33 l 11,47); ICZM (43,52 l 8,33). Os dados obtidos (MPa) foram analisados estatisticamente por meio de análise de variância (ANOVA) dois fatores e teste de Tukey (P<0,05). Os resultados mostraram diferença estatisticamente significante entre os grupos In-Ceram Alumina e In-Ceram Zircônia, porém a ciclagem mecânica não influenciou na resistência de união entre as cerâmicas de infra-estrutura e de recobrimento estético estudadas / Abstract: This study evaluated the influence of cyclic loading on shear bond strength between two glass-infiltrated ceramics for substructure (In-Ceram Alumina - Vita Zahnfabrik and In-Ceram Zirconia - Vita Zahnfabrik) and one glass veneer ceramic (VITA VM7 - Vita Zahnfabrik). Twenty four cylindrical samples with 4mm diameter per 5mm high was to prepare for each ceramics for substructure. Subsequently, the venner ceramic was applied to ceramic substructure, resulting in 4mm diameter per 9mm high specimens. They were divided in four groups ICA; ICAM; ICZ and ICZM. The groups ICAM and ICZM where cyclic loadind from 50N, 1Hz during 20000 cycles. Shear bond testing was performed in a universal testing machine (DL - 1000 model, EMIC - Equipamentos e Sistemas LTDA., São José dos Pinhais - PR - Brasil), with crosshead speed of 0,5mm/min and the specimens were loaded until failure. The interfaces of representative fractured specimens of each group were examined with microscopy (20x) and scanning electron microscopy. The mean values and standard deviations were: ICA (30,04 l 11,74); ICAM: (32,17 l 9,59); ICZ: (44,33 l 11,47); ICZM: (43,52 l 8,33). Data for shear bond strength (MPa) where statistically analysed by variance analysis (ANOVA) two factors and Tukey's test (P<0,05). The results showed statistically significant differences between the groups In-Ceram Alumina and In-Ceram Zirconia, however the cyclic loading effect was not influenced on bond strength between ceramics for substructure and veneer ceramic studied / Mestre
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Aplicação de modelos lineares para análise de expressão gênica em experimentos de microarrays /

Haddad, Samia Ramos, 1978- January 2007 (has links)
Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Raysildo Barbosa Lobo / Banca: Danísio Prado Munari / Resumo: O presente trabalho objetivou comparar, utilizando dados de um experimento de Microarray com um delineamento simples, os resultados de diferentes testes estatísticos a fim de verificar suas características na detecção de diferenças no nível de expressão dos genes. Os dados foram provenientes da South Dakota State University-EUA, do Department of Biology and Microbiology, Department of Animal Science, onde toda a parte experimental foi realizada. O material biológico envolveu quatro aves infectadas e quatro não infectadas com o vírus de bronquite infecciosa (IBV). O RNA utilizado foi extraído da camada epitelial da traquéia de animais controle e infectados com o vírus da IBV e, após a transcrição reversa foi marcado com os corantes fluorescentes (Cy3 e Cy5) e hibridizados com o microarray 13k cDNA de aves (FHCRC, Seattle, WA). A análise de dados dos resultados do experimento de microarray englobou dois estágios, sendo o primeiro denominado de Normalização, em que os dados foram pré-processados utilizando o procedimento Loess. A seguir foram realizadas as análises estatísticas propriamente ditas com testes de significância. Utilizou-se um modelo simples de ANOVA e aplicaram-se diferentes metodologias de análise. A análise das imagens revelou que dos 16192 spots em cada slide, apenas 10.926 puderam ser lidos sem defeitos no primeiro slide, 11.633 no segundo slide, 12577 no terceiro e 13.154 no quarto slide. A grande maioria dos spots em branco e controles negativos apresentou defeitos que determinaram sua eliminação. Um total de 13.597 spots foi lido no conjunto dos quatro slides, mas apenas 9.853 spots estavam representados em todos os slides. Concluiu-se que os experimentos de microarray, por tratarem de um conjunto muito grande de observações a serem analisados requerem análises estatísticas específicas. O método de Cui et al. (2005) reduziu... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this research was to compare, using real data of an experiment of Microarray with a simple design, the results of different statistical tests in order to verify their characteristics in the detection of differences in the level of expression of the genes. The data were coming of South Dakota State University-EUA, of the Department of Biology and Microbiology, Department Animal of Science, where the whole experimental part was accomplished. The biological material involved four infected animals and four no infected with the virus of infectious bronchitis (IBV). Used RNA was extracted of the layer epitelial of the windpipe of animals control and infected with the virus of IBV and, after the reverse transcription it was marked with the fluorescent colors (Cy3 and Cy5) and hybridization with the microarray 13k cDNA of birds (FHCRC, Seattle, WA). The analysis of data of the results of the microarray experiment included two apprenticeships, being the first denominated of Normalization, in that the data were pre-processed using the procedure Loess. To follow the statistical analyses they were accomplished properly said through real data with significant tests. A simple model of ANOVA was used and different analysis methodologies were applied. The analysis of the images revealed that of the 16192 spots in each slide, only 10.926 could be read without defects in the first slide, 11.633 in the second slide, 12577 in the third slide and 13.154 in the fourth slide. The great majority of the spots in white and negative controls presented defects that determined it elimination. A total of 13.597 spots was read in the group of the four slides, but only 9.853 spots were represented in all of the slides. It was ended that the microarray experiments, for they treat of a very big group of observations to be analyzed request specific statistical analyses. The method of Cui et al. (2005) it reduced... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

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