Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-05-27Bitstream added on 2014-06-13T20:07:22Z : No. of bitstreams: 1 penna_mah_dr_rcla.pdf: 3149372 bytes, checksum: c0ff1245fef00ae9478342001dbbe584 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O estudo das características microscópicas dos pêlos de mamíferos tem sido desenvolvido com o propósito de utilizá-las como critério taxonômico, especialmente para a identificação de restos presentes em fezes, conteúdos estomacais e bolotas de regurgitação de predadores. Os pêlos são menos danificados no processo digestivo, e são freqüentemente a única prova para identificação da presa em estudos de hábito alimentar, já que ossos e dentes sofrem intensa fragmentação durante a mastigação apresentando baixo valor diagnóstico, portanto um conhecimento maior da estrutura do pêlo facilita esses estudos e oferece uma base para estudos mais completos de predação e seus efeitos sobre as espécies de presa. Assim, os objetivos do presente projeto foram o desenvolvimento de técnicas de preparação de lâminas de pêlos para coleções e observações diretas; o desenvolvimento de uma chave de identificação de alguns roedores de mata atlântica baseada em pêlos; e a análise morfométrica dos pêlos de algumas espécies de roedores para a comparação com dados biométricos. Foram desenvolvidas 3 novas técnicas para a preparação de lâminas para a observação da medula de pêlos e outras 3 para a observação do padrão cuticular. Essas técnicas proporcionam um maior índice de sucesso na preparação de lâminas, aumentando também a visibilidade dos padrões e consequentemente as possibilidades de pesquisas na área. / The mammal hair identification has been used across the world for studies in forensics, in the field of public health, in textile fibers research, and in mammals feeding ecology, being useful on the identification of leftovers on feces and stomach contents. Hairs are the less damaged structures by digestive processes and nonetheless are the only clue for the identification of the prey in studies of feeding ecology of predators, since bones and tooth suffer heavy damage during the chewing process, being of a low diagnostic value. These factors show the importance of a better knowledge of the hair structure for prey or predator ecology studies. Also the hair trapping and identification has a important value in animal research bioethics, since the mammal surveys can be developed with hair-traps or scats/pellets without any harm or interference for the animals which have no risk to get addicted to the bait, which usually bias surveys, and minimizing the stress for being caught. The aim of the present thesis were the development of better techniques for the preparation of hair plates for collections and direct observations; the development of a identification key for Rain Forest rodents; and the morphometrical analysis of those mammals hairs for further comparison and analysis with biometrical data. There were developed 6 new techniques, being 3 for medulla pattern observation, and another 3 for cuticular impressions. Those techniques showed a higher success index on plate preparation, enabling the development of high level research on this field.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:56Z : No. of bitstreams: 1 000856906_20200330.pdf: 252372 bytes, checksum: 02c2741a36d6004e8b4bc263260ac6f2 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O gênero Adenomera é composto por 16 espécies, das quais seis possuem distribuição restrita à Mata Atlântica. O grupo apresenta uma taxonomia complicada por apresentar espécies crípticas, com alto grau de polimorfismo intraespecífico e interespecífico. Recentemente, uma análise filogenética extensa, abrangendo grande parte da distribuição das espécies do gênero, 35 espécies candidatas foram propostas; 16 na Mata Atlântica. No presente trabalho, propomos testar se as espécies candidatas distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético. Usando uma abordagem interativa com dados diretos de morfologia externa e bioacústica, pudemos delimitar espécies dentro dos clados Thomei e Marmorata. A maior amostragem dados fenotípicos e de um fragmento do gene 16S de indivíduos da Mata Atlântica na análise, permitiu inferir com maior confiança que as espécies distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético (clados Thomei + Marmorata), irmão do clado Hylaedactyla + Martinezi. O material adicional nos permitiu delimitar e redescrever duas espécies previamente consideradas como um complexo de espécies (Adenomera marmorata e A. bokermanni). Das 16 espécies candidatas do clado Mata Atlântica previamente sugeridas, pudemos delimitar apenas 10 espécies sendo sete já conhecidas e três novas para a Ciência. / The genus Adenomera has 16 species, six of which are Atlantic Forest dwellers. The genus has a difficult taxonomy, mostly due to the high levels of intra and interspecific polymorphism. Recently, a phylogenetic analysis using samples collected through the whole geographic distribution of the genus (roughly tropical and temperate cis-Andean South America) suggested the existence of 35 candidate species; 16 of which being Atlantic Forest dwellers.The present contribution intends to test whatever the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit. An integrative approach with directly observed data on morphology and bioacoustics allowed species delimitation within the Thomei and Marmorata Clades. Based on a denser sampling of phenotipic and 16S rRNA fragments, we recovered the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit, with two major clades (Thomei + Marmorata) and sister to the Hylaedactyla + Martinezi clade. The additional material allowed the delimitation and redescritpion of two species previously understood as species complexes (Adenomera marmorata and A. bokermanni). Of the 16 Atlantic Forest dwellers candidate species, we could delimit only 10; seven of those assignable to previously described species / FAPESP: 10/515606-8

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-06Bitstream added on 2014-06-13T19:25:17Z : No. of bitstreams: 1 berneck_bm_dr_rcla_parcial.pdf: 206641 bytes, checksum: 22c62228324e8fe9decc6bf29dfd355e (MD5) Bitstreams deleted on 2015-07-02T12:35:57Z: berneck_bm_dr_rcla_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-02T12:37:25Z : No. of bitstreams: 1 000726221_20300206.pdf: 188726 bytes, checksum: eedea7388fc1cbd09142a4a27ca8114c (MD5) / O gênero Aplastodiscus é composto por 15 espécies, principalmente florestais, que se distribuem na Mata Atlântica desde o estado de Alagoas ao Rio Grande do Sul, incluindo Goiás (DF), NE da Argentina e leste do Paraguai. Doze destas quinze espécies foram descritas há mais de 20 anos, as outras três foram descritas no início do século XXI. Nos últimos vinte anos muito material novo foi coletado e houve um incremento quantitativo e qualitativo nas coleções de Anfíbios do Brasil. Este novo material, agora disponível, permitiu observar a variação intra-específica de determinadas espécies e cunhar o projeto que culminou na presente tese de doutorado. Além disso, o conhecimento das relações filogenéticas de Aplastodiscus até o momento é parcial, pois não existem análises que integrem simultaneamente evidências moleculares e fenotípicas para todas as espécies. Foi realizada uma análise molecular para todo o material de tecido biológico obtido, onde investigamos principalmente os limites interespecíficos em Aplastodiscus e sua distribuição geográfica além de uma análise filogenética com base em dados moleculares e fenotípicos das espécies atualmente reconhecidas e das espécies propostas como novas pelo presente estudo. Para tanto, a partir de dados moleculares e fenotípicos fizemos uma busca heurística no programa TNT (Tree analysis using New Techology) atingindo 15 vezes a longitude mínima. Dentre todas espécies atualmente reconhecidas apenas Aplastodiscus musicus não pode ser incluída. O critério para determinação de novas espécies foi a monofilia e a presença de evidências fenotípicas que sustentassem a hipótese de uma nova espécie. As árvores mais parcimoniosas permitiram recuperar sete espécies ainda não descritas, além de sugerir a sinonímia entre A. callipygius e A. albosignatus... / Aplastodiscus includes 15 species from Atlantic Forest from State of Alagoas to Rio Grande do Sul, in Goiás (DF), NE of Argentina and East of Paraguai. Twelve of these species were described in the 80’s, only three of them were described recently. Over the past twenty years, lots of fresh material were incorporated in zoological collections allowing a better understanding of the morphological variation of Aplastodiscus species. Furthermore, the knowledge of the phylogenetic relationships is partial, there is no available data that integrate molecular and phenotypic evidence for all species. In this thesis will be presented an analysis for all tissue material where we investigate the species limits in Aplastodiscus and the geographical distribuition of these species, and a phylogenetic analysis on basis in molecular and phenotypic data... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Julián Faivovich / Coorientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Mariana Lucio Lyra / Banca: Paulo Christiano de Anchietta Garcia / Banca: Helio Ricardo da Silva / Banca: Luciana Barreto Nascimento / Resumo: O gênero Aplastodiscus é composto por 15 espécies, principalmente florestais, que se distribuem na Mata Atlântica desde o estado de Alagoas ao Rio Grande do Sul, incluindo Goiás (DF), NE da Argentina e leste do Paraguai. Doze destas quinze espécies foram descritas há mais de 20 anos, as outras três foram descritas no início do século XXI. Nos últimos vinte anos muito material novo foi coletado e houve um incremento quantitativo e qualitativo nas coleções de Anfíbios do Brasil. Este novo material, agora disponível, permitiu observar a variação intra-específica de determinadas espécies e cunhar o projeto que culminou na presente tese de doutorado. Além disso, o conhecimento das relações filogenéticas de Aplastodiscus até o momento é parcial, pois não existem análises que integrem simultaneamente evidências moleculares e fenotípicas para todas as espécies. Foi realizada uma análise molecular para todo o material de tecido biológico obtido, onde investigamos principalmente os limites interespecíficos em Aplastodiscus e sua distribuição geográfica além de uma análise filogenética com base em dados moleculares e fenotípicos das espécies atualmente reconhecidas e das espécies propostas como novas pelo presente estudo. Para tanto, a partir de dados moleculares e fenotípicos fizemos uma busca heurística no programa TNT (Tree analysis using New Techology) atingindo 15 vezes a longitude mínima. Dentre todas espécies atualmente reconhecidas apenas Aplastodiscus musicus não pode ser incluída. O critério para determinação de novas espécies foi a monofilia e a presença de evidências fenotípicas que sustentassem a hipótese de uma nova espécie. As árvores mais parcimoniosas permitiram recuperar sete espécies ainda não descritas, além de sugerir a sinonímia entre A. callipygius e A. albosignatus... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Aplastodiscus includes 15 species from Atlantic Forest from State of Alagoas to Rio Grande do Sul, in Goiás (DF), NE of Argentina and East of Paraguai. Twelve of these species were described in the 80's, only three of them were described recently. Over the past twenty years, lots of fresh material were incorporated in zoological collections allowing a better understanding of the morphological variation of Aplastodiscus species. Furthermore, the knowledge of the phylogenetic relationships is partial, there is no available data that integrate molecular and phenotypic evidence for all species. In this thesis will be presented an analysis for all tissue material where we investigate the species limits in Aplastodiscus and the geographical distribuition of these species, and a phylogenetic analysis on basis in molecular and phenotypic data... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor