The main aim of this thesis is to consider some consequences of the relevance theory of Sperber and Wilson (1986) for explaining a number of phenomena relating to verbal aspect. Chapter one introduces some basic notions relating to aspect and illustrates the interaction of aspect and tense and gives an outline of the main tenets of relevance theory. Chapter two considers the aspectual categories (simple-progressive) of English and (perfective-imperfective) of Serbo- Croat in relation to each other, and also in relation to the the classification of verbs according to the situation types they denote. Problems of defining the aspectual categories of these two languages are examined, and the suggestion is put forward that relevance theory provides the framework which makes it possible to maintain a fairly austere semantics of aspectual categories as well as to explain aspectual choice. Chapter three examines the treatment of aspectual categories in terms of subjectivity. It is argued that speakers' intuitions about the aspectual categories being expressive of subjectivity can be explained pragmatically, in terms of the notions of loose use and interpretive use. In Chapter four, I argue that in addition to the feature of completion, the semantics of aspectual categories of both English and Serbo-Croat needs to be characterised in terms of reference to particular events instantiating the property denoted by the predicate. I show how this assumption makes it possible to explain a number of uses of the English progressive. I then proceed to argue that the progressive of English and the perfective of Serbo-Croat differ with regard to completion but that they both point indexically, as it were, to a particular event instantiating the property denoted by the predicate. This assumption is shown to be crucial in explaining aspectual choice in the two languages. Although the data discussed are drawn solely from English and Serbo-Croat, the central ideas presented should carry over to Slavonic languages in general. Chapter five looks at situation type aspect in the light of Sperber and Wilson's (1986) view that conceptual information is stored in three types of entries. It is shown that the difference in the behaviour of verbs which intuitively seems to correlate with dynamicness and stativity, is best explained in terms of a three-way distinction determined by meaning postulate-like rules in the logical entries of concepts for individual verbs. I also give evidence in support of the view that accomplishment VPs fall into two classes depending on whether or not they grammaticalise completion, and I show that the grammaticalisation of completion in some predicates of this type is pragmatically explained.

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This thesis is a study of one aspectual construction, the "te-i(ru)" construction, in Japanese. This construction posed a serious problem for the study of Aspect in Semantics. That is, it seems to allow two contradictory interpretations: progressive and perfect of result. We argue that the the two distinct readings are the result of the syntactic interaction of the morpheme "te", the aspectual predicate, and the aspectual auxiliary verb "i-(ru)". Adopting the framework proposed by Travis (1991, 1994), we argue that the semantic operators, "BECOME" and "CAUSE", originally proposed by Dowty (1979), are actually generated in Syntax as the aspectual predicate, Asp$ sp0$, and the higher V$ sp0$ of a double VP structure, respectively. The event argument (Higginbotham 1985) is, we claim, subcategorized for and $ theta$-marked by the aspectual predicate. Further, we demonstrate that a morpheme "te" is an imperfective marker, and show that the two readings, progressive type and perfect type, arise because this morpheme is generated in the higher aspectual category, EP, in Japanese. The auxiliary verb "i-(ru)" connects the embedded event noted by EP to an interval time through the control of the event argument. Our analysis supports the hypothesis that Aspect is a syntactic category.

Diss.--Fachbereich 23 Angewandte Sprachwissenschaft--Mainz--Johannes Gutenberg-Universität, 1988.

Nous essayons de trouver de nouvelles interactions géniques pouvant donner une résistance ou une susceptibilité pour développer la schizophrénie. Nous avons donc fait l’enrichissement de voies en utilisant GSEA et Biofilter. Nous avons ensuite cherché de nouvelles interactions avec la méthode JE et la régression logistique parmi les paires de gènes identifiées. De plus, nous avons obtenu plus de résultats statistiquement significatifs qu’une sélection se basant sur les valeurs d’association marginale. Par ailleurs, les résultats pointent certains candidats intéressants comme le gène NRXN1 qui code pour une protéine d’adhésion cellulaire du système nerveux et qui aurait une interaction causant une susceptibilité avec le gène ROBO1, un gène impliqué dans la guidance des axones, et une autre avec le gène CDH13, un gène jouant le rôle de régulateur négatif dans la croissance des axones. Ces trois gènes sont déjà liés à la schizophrénie dans la littérature et pourraient servir de biomarqueurs.

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Durant les dernières décennies, la recherche sur le microbiome intestinal a positionné ce dernier comme important régulateur de nombreux processus physiologiques chez l'humain. Propulsée par les technologies de séquençage à haut débit, la recherche sur l'écologie microbienne a connu un important changement de paradigme. Les méthodes d'isolation et de mise en culture de bactéries d'intérêt sont maintenant, de manière générale, remplacées par le séquençage génétique de communautés microbiennes complètes directement dans leur environnement. Ce type d'analyse, la métagénomique, a révélé l'immense catalogue de gènes bactériens présents dans l'environnement intestinal et a levé le voile sur la majorité silencieuse du microbiote : les microorganismes non-cultivables. Ce vaste catalogue de gènes microbiens représente une véritable mine d'information dans un contexte où la recherche tente de trouver des mécanismes moléculaires expliquant la relation entre le microbiome et la santé des individus. Dans ce contexte, l'apprentissage automatique, qui permet l'analyse de données complexes, peut être utilisé pour pointer vers des effecteurs microbiens d'intérêt. L'objectif du projet est d'utiliser les données métagénomiques d'individus malades et en santé dans une tâche de classification. Plus précisément, notre but est de comparer le pouvoir prédictif de différentes représentations du microbiome, toutes dérivées des données de séquençage en métagénomique non-ciblée. Notre étude a démontré que dans un contexte de classification de phénotype de l'hôte, les méthodes de représentation qui utilisent toute l'information génique séquencée permettent de meilleures performances de prédiction que celles qui utilisent exclusivement l'information contenue dans les banques de données de référence, comme les profils taxonomique et fonctionnel. Nos résultats suggèrent que l'utilisation exclusive de l'information a priori dans un contexte d'apprentissage automatique limite, d'une certaine façon, la possibilité de trouver de nouveaux effecteurs microbiens inconnus des banques de données. / During the last decades, research positioned the gut microbiome as a major regulator of numerous physiological processes in humans. Propelled by next-generation sequencing technologies, the research on microbial ecology has undergone a significant paradigm shift; generally, bacteria isolation and cultivation are now being replaced by genetic sequencing of whole bacterial communities directly from their environment. This type of analysis, referred as metagenomics, revealed the large catalog of microbial genes comprised in the gut environment and lifted the veil on the microbiota's silent majority: non-cultivable microorganisms. This vast catalog of genes represents a real mine of information in a context where research aims at finding molecular mechanisms to explain the relation between microbiome and host health. In this context, machine learning, which allows the analysis of complex data, can be used to point toward promising microbial features. The objective of this project is to use metagenomics data from healthy and diseased individuals in a classification task. More precisely, our goal is to compare the predictive power of different microbiome representations, all derived from untargeted metagenomics data. Our study has shown that in a context of host phenotype classification, representation methods that use all the available sequenced information allow better prediction performances than those that are based on reference databases, like the taxonomic and functional profiles. Our results suggest that the exclusive use of a priori information, in a machine learning context, limits, in a way, the possibility of finding new microbial effectors unknown from reference databases.

La pratique régulière de l'activité physique contribue à prévenir l'apparition de nombreux problèmes de santé. Pourtant, environ deux personnes sur cinq sont suffisamment actives pour en retirer des bienfaits. Il est donc justifié de comprendre ce qui motive les gens à adopter un mode de vie physiquement actif Pour ce faire, une approche théorique intégrée, principalement appuyée sur la théorie du comportement planifié, a été employée. Selon cette approche, les déterminants de l'adoption d'un comportement sont l'intention et la perception du contrôle. Les effets modérateurs des relations intention-comportement et perception du contrôle-comportement ont donc été investigués auprès d'adultes volontaires, à l'intérieur d'un plan longitudinal d'une période de trois mois. L'analyse de régression logistique a révélé que le comportement passé (RC : 2,93, ICgs»/»: 1,65-5,23), l'interaction intention x âge (RC : 2,08, ICQ5% : 1,15- 3,79) et perception du contrôle x revenu annuel (RC : 2,05, IC95o/„ : 1,04 - 4,04) étaient les déterminants de l'adoption du comportement. Ces résultats, qui devront être reproduits, soulèvent l'importance de l'utilisation d'interventions promotionnelles dans le domaine de l'activité physique qui ne doivent pas seulement s'intéresser qu'à augmenter la motivation des individus non-motivés. Ces interventions auraient avantage à cibler les facteurs qui modèrent les relations intention-comportement et perception du contrôle-comportement.

Aujourd’hui encore, l’obésité touche de plus en plus d’individus, et sa complexité reflète son aspect multifactoriel. Parmi les facteurs impliqués dans le développement de l'obésité, on compte la génétique qui expliquerait notamment la susceptibilité de certains êtres humains à devenir obèse. D'un point de vue moléculaire, la cascade adipogénique permettant à des préadipocytes de devenir des adipocytes matures est un phénomène dynamique et bien caractérisé. En revanche, les facteurs définissant le potentiel adipogénique des préadipocytes ainsi que le renouvellement des adipocytes demeurent encore inconnus. Notre objectif a été d’identifier et de caractériser de nouveaux gènes définissant l’identité des préadipocytes et pouvant influencer le développement du tissu adipeux. Par dilutions sériées d’une culture de 3T3-L1, nous avons isolé et amplifié 23 nouvelles lignées cellulaires que nous avons classées selon leur potentiel adipogénique. Une puce à ADN nous a permis d’identifier les gènes s’exprimant différemment entre les lignées à fort et à faible potentiel adipogénique. Nous avons identifié un nouveau gène inconnu de la littérature nommé V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a). Les travaux réalisés dans le cadre de ma thèse ont été de comprendre l’implication de ce gène dans le développement de l’adipocyte in vitro et dans la formation du tissu adipeux in vivo. Nous avons d’abord identifié Vstm2a comme le gène le plus différentiellement exprimé entre les différentes lignées cellulaires, son expression étant très élevée dans les lignées à fort potentiel adipogénique. Une corrélation positive s’est dessinée entre l’expression de Vstm2a et Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ2 (Pparγ2) dans les préadipocytes. Lors du développement de l’adipocyte in vitro, l’expression de Vstm2a précède toujours l’activation de Pparγ2, un facteur clé régulant l’adipogenèse. Cette expression précoce est retrouvée in vivo, lors de la formation et de l’expansion du tissu adipeux. Les cellules exprimant Vstm2a au stade développemental se retrouvent à proximité de vaisseaux sanguins et de cellules musculaires, une caractéristique de précurseurs adipeux. Chez l’adulte, ces cellules s’apparentent à la population de précurseurs adipeux identifiée à partir des marqueurs de surface LIN⁻CD29⁺CD34⁺SCA1⁺PDGFRα⁺. Nous avons découvert que VSTM2A est une protéine glycosylée et abondamment sécrétée par des cellules ayant un fort potentiel adipogénique. La surexpression de VSTM2A intracellulaire suffit à favoriser la différenciation adipocytaire de cellules fibroblastiques, entre autres par l’induction de Pparγ2. À l’inverse, sa sous-expression dans les préadipocytes entraine un défaut adipogénique, réduisant l’expression de Pparγ2. Nous avons montré que VSTM2A agit en amplifiant la réponse aux Bone Morphogenetic Protein (BMP) favorisant ainsi l’expression de Pparγ2. Nous proposons un modèle dans lequel VSTM2A est essentiel pour maintenir et amplifier le potentiel adipogénique des préadipocytes. Une meilleure compréhension des facteurs régulant les phases précoces de l'adipogenèse pourrait permettre le développement de nouveaux outils régulant la formation du tissu adipeux. / Obesity affects the life of millions of humans worldwide and is the result of complex interactions between genes and environment. Factors involved in the development of obesity include genetics, which may explain why some humans are more susceptible to become obese. From a molecular point of view, the adipogenic cascade allowing preadipocytes to differentiate into mature adipocytes is a dynamic and well characterized phenomenon. However, the factors defining the adipogenic potential of the preadipocytes as well as the renewal of the adipocytes remain unknown. Our objective was to identify and characterize new genes defining the identity of preadipocytes capable of influencing the development of adipose tissue. By performing serial dilutions of a culture of 3T3-L1 preadipocytes, we have isolated and amplified 23 new cell lines that we have classified according to their adipogenic potential. A microarray allowed us to identify the genes differently expressed between high and low adipogenic lines. We have identified a new gene, unknown from the literature, named V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a). The objective of my thesis was to understand the implication of this gene in the development of the adipocytes in vitro and in the formation of adipose tissue in vivo. We first identified that Vstm2a was the most differentially expressed gene between the Low and High adipogenic lines, its expression being elevated in lines with a high adipogenic potential. A positive correlation emerged between the expression of Vstm2a and Pparγ2 in the preadipocytes. During adipocyte development in vitro, the expression of Vstm2a always precedes PPARγ2 activation, a key factor regulating adipogenesis. This expression pattern was also found in vivo during adipose tissue formation and expansion. VSTM2A-expressing cells at the developmental stage are found in the vicinity of the vasculature and muscle cells, a characteristic of adipose precursors. In adults, Vstm2a expression is enriched in the adipose precursor population identified with the surface markers LIN⁻CD29⁺CD34⁺SCA1⁺PDGFRα⁺. We found that VSTM2A is a glycosylated protein that is abundantly secreted by cells with a high adipogenic potential. Overexpression of intracellular VSTM2A is sufficient to promote the adipogenic potential of fibroblastic cells, an effect associated with a rise in basal Pparγ2 expression. Conversely, VSTM2A knockdown impairs adipogenesis by reducing the expression of Pparγ2. We found that VSTM2A promotes Pparγ2 expression by amplifying BMP signaling. Here, we propose a model in which VSTM2A is expressed to maintain and amplify the adipogenic potential of adipose precursors. A better understanding of the factors regulating early steps in adipogenesis could allow the development of new tools to regulate adipose tissue formation.