Made available in DSpace on 2014-06-12T16:27:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2056_1.pdf: 4920655 bytes, checksum: 06c6cac9b9148ad756c4d9654d7b2d77 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O entendimento e a representação da realidade são essenciais para a elaboração de documentos cartográficos que são formados por Base de Dados Espaciais. A pesquisa desenvolvida surgiu da necessidade de se abstrair informações do mundo real de forma organizada e estruturada para que pudessem ser utilizadas nos documentos cartográficos. A construção do conhecimento foi elaborada utilizando as técnicas de mapeamento de informação. O objetivo da pesquisa foi investigar a utilização de mapas cognitivos, identificando as necessidades dos usuários e discutindo a importância para geração de Bases de Dados Espaciais, além de apresentar os procedimentos para sua construção. Para demonstrar as metodologias estudadas, foram desenvolvidos mapas cognitivos (mental e conceitual), em programas computacionais específicos, sobre o Processo de Regularização de Territórios Quilombolas, considerando documentações e entrevistas

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:31:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo523_1.pdf: 2315962 bytes, checksum: 9d0d1f0d0ede92c731ca98c2ae78d498 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / O entendimento da realidade para representá-la em documentos cartográficos é fundamental para a elaboração da Base de Dados Espaciais. A pesquisa desenvolvida surgiu da necessidade de abstrair o mundo real de forma organizada e estruturada para elaboração dos documentos cartográficos. O objetivo da pesquisa foi investigar a utilização de mapas cognitivos na fase da Abstração do Mundo Real para a construção de documentos cartográficos no planejamento turístico, apresentando os procedimentos para a construção, identificando e discutindo as variáveis relevantes para a geração da Base de Dados Espaciais. Para demonstrar a metodologia aplicada foi desenvolvido o mapa cognitivo causal para o planejamento turístico do município do Conde, Paraíba, em programa computacional específico, considerando os dados documentais e entrevistas

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Os avanços tecnológicos têm aumentado drasticamente a magnitude dos dados armazenados em diversos domínios de aplicação. Esta abundância de dados tem excedido a capacidade de análise humana. Como conseqüência, algumas informações valiosas escondidas nestes grandes volumes de dados não são descobertas. Este cenário impulsionou a criação de várias técnicas capazes de extrair conhecimento de grandes volumes de dados. Algumas dessas técnicas são resultantes do emergente campo de Descoberta de Conhecimento em Bases de Dados (Knowledge Discovery in Databases - KDD). O processo de KDD é composto de várias etapas. A etapa de preparação dos dados consome de 50% a 90% do tempo e esforço necessário para a realização de todo o processo. Quanto mais completa e consistente for a preparação, melhor será o resultado da mineração de dados. Uma forma de garantir a completude e a consistência dos dados é utilizar uma metodologia que aborde detalhadamente todas as atividades relacionadas à preparação dos dados. Muitas metodologias foram propostas para o desenvolvimento de projetos de KDD. Apesar da maioria citar o processo de preparação dos dados, poucas metodologias específicas para montagem de visão de dados têm sido propostas. Diante deste cenário, esta dissertação tem como objetivos investigar as metodologias para o desenvolvimento de projetos de KDD, enfatizando os aspectos relacionados à preparação dos dados, e como resultado da investigação, propor uma metodologia para montagem de visões em bases de dados dirigidas a problemas de Mineração de Dados. Esta metodologia engloba, de forma detalhada, todo processo de preparação dos dados, desde o entendimento do problema até a geração da base. A viabilidade prática da metodologia proposta, DMBuilding, é demonstrada através da realização de um estudo de caso que utiliza uma base de dados de um problema real de larga escala no domínio da análise de risco crédito. Os resultados ilustram os benefícios da metodologia, comprovando sua relevância para a montagem de visão em bases de dados

A recente evolução das doenças crônicas não transmissíveis (DCNT), possivelmente associadas às mudanças de hábitos alimentares, tem sido um desafio para a promoção da alimentação saudável em vários países, inclusive no Brasil, onde o sódio tem sido o foco de atenção, pela possibilidade da redução da sua elevada ingestão ser uma das medidas com melhor custo benefício para saúde pública. É necessário conhecer o conteúdo de sódio e de componentes específicos, relacionados às DCNT nos alimentos comercializados no país, para orientar o consumidor na seleção adequada dos alimentos e mesmo para modificar sua composição; no entanto, nas bases de dados, o conteúdo desse mineral está presente em um número reduzido de alimentos. O objetivo da presente pesquisa foi a elaboração de uma base de dados de alimentos processados com componentes específicos associados às DCNT, dando ênfase ao sódio, e avaliar o uso dessa base de dados para estimar a sua ingestão. Informações nutricionais de rótulos e de websites de indústrias de alimentos foram coletadas para inclusão na base de dados, elaborada de acordo com as diretrizes do International collaborative project to compare and monitor the nutritional composition of processed foods, coordenado pelo The George Institute for Global Health (Austrália). A avaliação da variação do conteúdo de sódio foi realizada para alguns alimentos processados presentes na base de dados, considerando os de maior consumo nacional. O conteúdo de sódio em refeições de restaurantes populares de São Paulo foi analisado por espectrofotometria de absorção atômica de chama e estimado pela base de dados elaborada para comparação. Na base de dados estão incluídas informações de 2.319 alimentos distribuídos em 14 grupos. Foi observada grande variação no conteúdo de sódio entre diferentes tipos de pães de forma industrializados, de salsichas, de linguiças, de queijos e iogurtes. O conteúdo de sódio analisado nas refeições (base integral) variou de 215,9 mg a 427,9 mg por 100 kcal, enquanto que o conteúdo de sódio estimado variou de 204,2 mg a 486,8 mg por 100 kcal (418 kJ). A análise do coeficiente de correlação entre valores analíticos e estimados do conteúdo de sódio em refeições mostrou forte correlação entre esses dados para dois restaurantes (r=0,703 e 0,897) e moderada correlação para outros dois (r=0,513 e 0,622) dos cinco restaurantes estudados, indicando que através da base de dados elaborada é possível obter uma estimativa da ingestão de sódio. A importância de se conhecer o conteúdo de sódio de refeições e/ou alimentos está na possibilidade de uso dessas informações para orientar a redução do sal empregado no preparo da refeição, e ampliar para o consumidor informações que permitam identificar alternativas para redução do consumo de sal. / The recent evolution of non transmissible chronic diseases (NTCD), possibly associated to changes in eating habits, has been a great challenge against the promotion of health around the world, including Brazil, where sodium has been the focus of attention, and reducing its intake is one of the best cost-benefit actions for public health. It is necessary to know the content of sodium and specific components, related to NTCD, in foods nationally commercialized, in order to modify their composition and also to advise consumers on adequate food choice; however, food composition databases contain little information on this nutrient. The aim of this work was to elaborate a database containing processed foods with specific components associated to NTCD, emphasizing sodium, and to evaluate the use of this database to estimate sodium intake. Nutritional information from product labels and food industry websites were collected to be included in the database, which was developed according to the guidelines of the \"International collaborative project to compare and monitor the nutritional composition of processed foods\", coordinated by The George Institute for Global Health (Australia). The evaluation of the sodium content variation was done in some processed foods existing in the database, considering the ones that are more frequently consumed by the Brazilian population. The sodium content of meals served in popular restaurants in Sao Paulo was analyzed by flame atomic absorption spectrophotometry and estimated by the database, for comparison. The database contains information on 2,319 foods, distributed in 14 groups. Great variation in sodium content was observed among different kinds of industrialized bread, hot dogs, sausages, cheese and yoghurt. The sodium content analyzed in the meals varied between 215.9 mg and 427.9 mg/100 kcal (418kJ), whereas the sodium content estimated varied between 204.2 mg and 486.8 mg/100 kcal (418kJ). The analysis of the correlation coefficient between analytical and estimated values of sodium content in meals demonstrated strong correlation (r=0,703 and 0,897) for two restaurants, and moderate correlation (r=0,513 and 0,622) for two others out of the five restaurants in the research, indicating that, through the elaborated database, it is possible to obtain an estimated sodium intake. It is very important to know the sodium content in meals and/or foods, once this information may be used to advise on sodium reduction when preparing the meals, and also to inform consumers on how to identify alternatives for reducing salt consumption.

[pt] As pesquisas na área da biologia molecular vêm produzindo um grande volume de dados e estes precisam ser bem organizados, estruturados e persistidos. Na sua grande maioria os dados biológicos são armazenados em arquivos no formato texto. Para grandes volumes de dados, o caminho natural seria utilizar SGBDs para gerenciá-los. Contudo, estes sistemas não possuem estruturas adequadas para representar e manipular dados específicos ao domínio. Por exemplo, sequências biológicas normalmente são tratadas como simples cadeias de caracteres (tipo texto/varchar) ou BLOB, e desta forma perde-se todo um conjunto de informações composicionais, posicionais e de conteúdo. Esta tese argumenta que a gerência de dados (estrutura, armazenamento e acesso de dados) se transformou em um dos principais problemas para o domínio de pesquisas da bioinformática. Desta maneira propõe-se um modelo conceitual biológico para representar informações do dogma central da biologia molecular, bem como um tipo abstrato de dado (ADT – do inglês Abstract Data Types) específico para a manipulação de sequências biológicas e seus derivados. / [en] The researches in molecular biology have been producing a large amount of data and they need to be well organized, structured and persisted. Mostly biological data are stored on files in text format. For large volumes of data, the natural way would be to use DBMS to manage them. However, these systems do not have adequate structures to represent and manipulate data specific to the domain. For example, biological sequences are typically treated as simple strings (type text/varchar) or BLOB, and thus lost a whole set of compositional, positional and content information. This thesis argues that the management of data (structure, storage and data access) has become a major problem for researches in bioinformatics. Thus we propose a conceptual model for representing biological information of the central dogma of molecular biology, as well as an Abstract Data Types (ADT) specific for the manipulation of biological sequences and its derivatives.

O objetivo do presente estudo foi demonstrar a aplicação de uma etapa de pós-processamento determinístico, baseada em medidas de similaridade, para aumentar a performance do relacionamento probabilístico com e sem a etapa de revisão manual. As bases de dados utilizadas no estudo foram o Sistema de Informações de Agravos de Notificação e o Sistema de Informação Sobre Mortalidade no período de 2007 a 2015 do município de Palmas, Tocantins. O software probabilístico utilizado foi o OpenRecLink; foi desenvolvida e aplicada uma etapa de pós-processamento determinístico aos dados obtidos por três diferentes estratégias de pareamento probabilístico. As três estratégias foram comparadas entre si e acrescidas da etapa de pós-processamento determinístico. A sensibilidade das estratégias probabilísticas sem revisão manual variou entre 69,1% e 77,8%, enquanto que as mesmas estratégias, acrescidas da etapa de pós-processamento determinístico, tiveram uma variação entre 92,9% e 96,3%. A sensibilidade de duas estratégias probabilísticas com revisão manual foi semelhante aos obtidos pela etapa de pós-processamento determinístico, no entanto o número de pares destinados a revisão manual pelas duas estratégias probabilísticas variou entre 1.177 e 1.132 registros, contra 149 e 145 após a etapa de pós-processamento determinístico. Nossos resultados sugerem que a etapa de pós-processamento determinístico é uma opção promissora, tanto para aumentar a sensibilidade quanto para reduzir o número de pares que precisam ser revisados manualmente, ou mesmo para eliminar sua necessidade. / The objective of the present study was to demonstrate the application of a deterministic post-processing step, based on similarity measures, to increase the performance of the probabilistic relationship with and without the clerical review. The databases used in the study were the Information System of Notifiable Diseases and the Mortality Information System in the period from 2007 to 2015 of the municipality of Palmas, Tocantins, Brazil. The probabilistic software used was OpenRecLink; a deterministic post-processing step was developed and applied to the data obtained by three different probabilistic matching strategies. The three strategies were compared to each other and added to the deterministic post-processing step. The sensitivity of the probabilistic strategies without manual revision varied between 69.1% and 77.8%, while the same strategies, added to the deterministic post-processing step, ranged from 92.9% to 96.3%. The sensitivity of two probabilistic strategies with manual revision was similar to those obtained by the deterministic post-processing step. However, the number of pairs destined for manual revision by the two probabilistic strategies varied between 1,177 and 1,132 registers, against 149 and 145 after the post-processing step. Our results suggest that the deterministic postprocessing step is a promising option both to increase sensitivity and to reduce the number of pairs that need to be revised manually or even to eliminate their need.

A utilização de processadores modernos no segmento espacial possibilitou o aumento de desempenho dos sistemas embarcados críticos, tornando a operação através de um Sistema Operacional de Tempo Real - SOTR inevitável. Entretanto, os efeitos que as características do núcleo do SOTR tem na aplicação devem ser considerados. Assim, o principal requisito de uma aplicação espacial baseada em um SOTR, segundo a norma "ECSS-E-ST-40C: Software", é a verificação se o comportamento de tempo real é previsível. Atualmente, estão disponíveis abordagens baseadas em software para a verificação temporal, tais como a utilização de modelos analíticos e simulação, conjuntos dedicados ao teste de temporização, benchmarks e análise estática de código. Uma vez que não há padronização acerca das metodologias, essas abordagens podem resultar na superestimação temporal e de recursos. Nesse contexto, a utilização de ferramentas de hardware externas para medir o desempenho das características do núcleo de um SOTR são de suma importância nas aplicações espaciais. O presente trabalho propõe o Ambiente de análise de Desempenho de Tempo Real - ADTR para a medição de overheads e verificação temporal das características do núcleo de um SOTR. A abordagem é baseada em uma ferramenta de hardware minimamente intrusiva projetada utilizando uma Field Programmable Gate Array - FPGA. Os experimentos foram conduzidos com a nova ferramenta em um estudo de caso de aplicação em computadores de bordo para satélites, baseado no processador ERC32 e o SOTR Real-Time Executive for Multiprocessor Systems - RTEMS. São apresentados dois modelos de teste, considerados aqui como duas características do núcleo do RTEMS: chaveamento de contexto com preempção e latência de interrupção externa com preempção. Os resultados mostram a eficiência da nova ferramenta para medição das duas características. É possível utilizar o novo ambiente para complementar outros métodos de verificação temporal para o atendimento da norma.

A Tabela Brasileira de Composição de Alimentos (TBCA-USP) tem como meta a disseminação de dados de qualidade sobre a composição química dos alimentos, sendo que sua base de dados é continuamente atualizada com a inserção de novos alimentos e nutrientes. Vários estudos tem sido realizados com o objetivo de quantificar vitaminas em alimentos brasileiros, entretanto estas informações encontram-se dispersas em diversas publicações. O objetivo do trabalho foi a elaboração de uma base de dados referente a composição das vitaminas A, C e E em alimentos brasileiros, visando sua futura disponibilização pela TBCA-USP. Na elaboração da base de dados de vitaminas foram compilados apenas os dados originados através de metodologias validadas para cada composto, sendo que para a base de dados de vitamina A foram incluidos dados de retinol e de sete tipos de carotenoides (α-caroteno, β-caroteno, β-criptoxantina, licopeno, luteína, violaxantina e zeaxantina), enquanto que para a base de dados de vitamina C foram compilados dados de ácido ascórbico e dehidroascórbico, e para a base de dados de vitamina E foram compilados dados de todos os tocoferóis e tocotrienóis disponíveis. O conteúdo de vitamina A total foi calculado tanto na forma de Equivalentes de Retinol (Retinol Equivalent - RE) quanto de Equivalentes de Atividade de Retinol (Retinol Activity Equivalent - RAE); a vitamina C total foi calculada pela somatória dos ácidos ascórbico e dehidroascórbico; e, para a vitamina E os valores totais foram expressos tanto em Equivalentes de α-tocoferol quanto em α-tocoferol. O levantamento de dados foi realizado em periódicos nacionais e internacionais, dissertações e teses, totalizando 383 referências publicadas entre 1975 e 2011. Do total de referências, 148 foram compiladas e 235 descartadas, sendo que o maior motivo para a não utilização das referências foi a ausência de informações obrigatórias, como por exemplo sobre a validação das metodologias analíticas. A base de dados de vitaminas contem informações sobre 1.408 alimentos, sendo 825 com dados de vitamina A, 517 de vitamina C e 66 de vitamina E. A maior parte dos alimentos compilados pertencem aos grupos das hortaliças/derivados (32%) e frutas/derivados (29%), os quais representam os mais adquiridos pela população brasileira. Os dados dos 1.408 alimentos compilados geraram o banco de dados de vitaminas, os quais serão disponibilizados na TBCA-USP (www.fcf.usp/tabela). / Brazilian Food Composition Database (TBCA-USP) has aimed to disseminate quality information about food composition being constantly updated with new foods and nutrients. Several studies have been realized in order to quantify vitamins in Brazilian foods; however, the results of these efforts are found in many different published reference sources. The aim of this study was to evolve a Brazilian food composition database for vitamins A, C and E; and its provision in TBCA-USP. For vitamin database performing, it was compiled data from validated methodologies for each compound. For carotenoids and vitamin A database, it was compiled data from retinol and 7 different carotenoids (α-carotene, β-carotene, β-cryptoxanthin, lycopene, lutein, violaxanthin and zeaxanthin); for vitamin C it was compiled data from ascorbic and dehydroascorbic acids; and for vitamin E it was compiled data from all tocopherol and tocotrienol forms. The total vitamin A content was calculated considering both Retinol Equivalent (RE) and Retinol Activity Equivalent (RAE), while the total vitamin C content was calculated considering the sum of ascorbic and dehydroascorbic acids, and finally, the total vitamin E content was expressed in both α-tocopherol and α-tocopherol equivalents. Data collection was realized in thesis, national and international publications, resulting in 383 references, published from 1975 to 2011. From the total, 148 were compiled and 235 were discarded, due to lack of mandatory information, such as, validation of the analytical methodologies. The vitamin database comprises information about 1408 foods, from which 825 are related to vitamin A, 517 to vitamin C and 66 to vitamin E. The majority of the food composition data is related to vegetables/derivatives (32%) and fruits/derivatives (29%), which represent the most acquired by Brazilian population. Compiled data from 1408 foods resulted in vitamin database, and will be available in TBCA-USP (www.fcf.usp/tabela).

O termo de Banco de Dados Espacial tem sido usado frequentemente nas aplicações relativas a Sistemas de Informações Geográficas. Isto demonstra a aplicação de uma ferramenta computacional poderosa (Sistemas de Gerenciamento de Banco de Dados) na solução de problemas de Planejamento Urbano e Regional. Para que o Banco de Dados possa operar necessita uma Fonte de Dados ou Base de Dados que alimente a sua estrutura e garanta a qualidade e precisão dessas informações. Daí em diante se podeaplicar as suas próprias capacidades na solução dos problemas dos seus usuários. Reduzindo a escala podemos traçar um paralelo entre os Projetos de Planejamento Urbano e em Projeto de Edificações, logo as mesmas ferramentas podem ser utilizadas neste segundo tipo de projetos. Preparando caminho à utilização destas ferramentas, este trabalho relata o caminho escolhido, a implementação e a aplicação de uma abordagem de formação de Base de Dados Espaciais a partir do projeto de Edificações. / Spatial database is a term frequently used in Geographic Information Systems applications. This means the use of a powerful computing tool (Database Management System) in solving Regional and Urban Planning problems. A Database Management System needs a Data Source or Base of Data for the Data entry and quality and precise information guaranteening. Then we can use its own capacities in the solution of the problems of the users. Reducing the scale we can make a parallel between Urban Planning Design and Building Design and the same tools can be used for the second. Preparing the way of the utilization of these tools, this work speak about the choosing way, the implementation and an approach application of Base of Data formation from Building Design.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:49:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 444045.pdf: 8676416 bytes, checksum: 5dc6fddb810c5c4102aeef934f1d8983 (MD5) Previous issue date: 2012-08-06 / Metagenomic sequencing technologies are advancing rapidly and the size of output data from high-throughput genetic sequencing has increased substantially over the years. Our optim?zations and performance evaluations are focused in some of the most critical and time-consuming steps of a metagenomic analys?s: pre-processing, taxonomic classification assignment and post-processing of classification results. Optimizations and functions were implemented and introduced in a new architecture, PANGEA+, based on the PANGEA metagenomic pipeline. The main improvements of the present tool are: support of new input file formats and NCBI taxonomy database, new species classification methods, consensus analysis, implementation of distributed memory (MPI) for species classification step, and low complexity optimizations for the post-processing of classification results. The evaluation of the new architecture, shows remarkable improvements in many features and, mainly, in the species classification accuracy and performance. / As tecnologias de sequenciamento metagen?mico tem avan?ado rapidamente e a quantidade de dados gerados a partir do sequenciamento em larga escala tem aumentado substancialmente ao longo dos anos. As presentes otimiza??es e avalia??es de desempenho tem foco em algumas das etapas mais cr?ticas e que consomem mais tempo em uma an?lise metagen?mica: pr?-processamento, classifica??o taxon?mica e p?s - processamento dos resultados de classifica??o. Otimiza??es e fun??es foram implementadas e introduzidas em uma nova arquitetura, PANGEA+, baseada no pipeline metagen?mico PANGEA. Os principais melhoramentos alcan?ados com a presente ferramenta foram: suporte a v?rios formatos de arquivos de entrada e a base de dados taxon?micos do NCBI, novos m?todos de classifica??o de esp?cies inclu?dos, an?lise consenso, implementa??o de mem?ria distribu?da para a fase de classifica??o de esp?cies, otimiza??es de baixa complexidade para o p?s-processamento dos resultados de classifica??o. A avalia??o da nova arquitetura, PANGEA+, demonstra melhoramentos consider?veis em v?rias funcionalidades e, principalmente, na etapa de classifica??o de esp?cies, tanto em exatid?o quanto em desempenho computacional.