O presente trabalho investiga possibilidades quanto à utilização de dados desagregados, especificamente do Cadastro Nacional de Endereços para Fins Estatísticos (CNEFE) do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE), em modelos e análises urbanas. A divulgação do CNEFE representa uma mudança no quadro histórico de escassez de dados a respeito do uso do solo urbano no Brasil. Nesse novo contexto em que a aquisição deste tipo de informação – sem perder de vista suas contingências – deixa de ser uma debilidade em estudos a respeito das cidades brasileiras, apresenta-se nesta dissertação quatro métodos de modelagem e análise sob a perspectiva dos sistemas configuracionais urbanos que lançam mão do CNEFE enquanto insumo. Ao longo de três capítulos com características de artigos, explora-se primeiro a construção de modelos descritivos a partir dos dados; em seguida, busca-se como avaliar a nitidez com que os dois modelos produzidos descrevem o sistema urbano representado; e, por último, discute-se como confrontar os resultados da análise da acessibilidade do sistema urbano com os dados do modelo. Como estudo de caso, utilizou-se a cidade de Ijuí, RS. / This work investigates possibilities regarding the use of disaggregated data, specifically from the National Addressing Record for Statistical Purposes (CNEFE) of the Brazilian Institute of Geography and Statistics (IBGE) in urban modelling and analysis. The release of CNEFE represents a change in the historic scenario of land use data shortage in Brazil. Within this new context, in which the acquisition of this kind of information is no longer a weakness for research on Brazilian cities, this dissertation presents four methods for the construction of urban models and analyses under the perspective of urban configurational systems. Along three paper-like chapters, we first explore the construction of descriptive models with the mentioned data; then, we evaluate how sharply the produced models can describe the represented system; and, at last, we discuss how to confront the results of the accessibility analysis with the data. As a case study, we used the city of Ijuí, in Southern Brazil.

Bancos de dados normalmente são projetados para atender a um domínio específico de uma aplicação, tornando o acesso aos dados limitado e uma tarefa árdua em relação à integração de bancos e compartilhamento de dados. Existem várias pesquisas no intuito de integrar dados, como a criação de softwares específicos para uma determinada aplicação e até soluções mais radicais como refazer todos os bancos de dados envolvidos, demonstrando que ainda existem questões em aberto e que a área está longe de atingir soluções definitivas. Este trabalho apresenta conceitos e estratégias para a integração de bancos de dados heterogêneos e a implementa na forma do DIGE, uma ferramenta para desenvolver sistemas de banco de dados integrando diferentes bancos de dados relacionais heterogêneos utilizando grades computacionais. O sistema criado permite o compartilhamento de acesso deixando os dados armazenados em seu local de origem, desta forma, usuários do sistema acessam os dados em outras instituições com a impressão de que os dados estão armazenados localmente. O programador da aplicação final pode acessar e manipular os dados de forma convencional utilizando a linguagem SQL sem se preocupar com a localização e o esquema de cada banco e o administrador do sistema pode adicionar ou remover bancos de forma facilitada sem a necessidade de solicitar alterações na aplicação final. / Databases are usually designed to support a specific application domain, thus making data-access and data-sharing a hard and arduous task when database integration is required. Therefore, research projects have been developed in order to integrate several and heterogeneous databases systems, such as specific-domain application tools or even more extreme solutions, as a complete database redefinition and redesign. Considering these open questions and with no definite answers, this work presents some concepts, strategies and an implementation for heterogeneous databases integration. In this implementation, the DIGE tool was developed to provide access to heterogeneous and geographically distributed databases, using Grid computing, which store locally its data, appearing to the user application, the data are stored locally. By this way, programmers can manipulate data using conventional SQL language with no concern about database location or its schema. Systems Administrators may also add or remove databases on the whole system without need to change the final user application.

O presente trabalho investiga possibilidades quanto à utilização de dados desagregados, especificamente do Cadastro Nacional de Endereços para Fins Estatísticos (CNEFE) do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE), em modelos e análises urbanas. A divulgação do CNEFE representa uma mudança no quadro histórico de escassez de dados a respeito do uso do solo urbano no Brasil. Nesse novo contexto em que a aquisição deste tipo de informação – sem perder de vista suas contingências – deixa de ser uma debilidade em estudos a respeito das cidades brasileiras, apresenta-se nesta dissertação quatro métodos de modelagem e análise sob a perspectiva dos sistemas configuracionais urbanos que lançam mão do CNEFE enquanto insumo. Ao longo de três capítulos com características de artigos, explora-se primeiro a construção de modelos descritivos a partir dos dados; em seguida, busca-se como avaliar a nitidez com que os dois modelos produzidos descrevem o sistema urbano representado; e, por último, discute-se como confrontar os resultados da análise da acessibilidade do sistema urbano com os dados do modelo. Como estudo de caso, utilizou-se a cidade de Ijuí, RS. / This work investigates possibilities regarding the use of disaggregated data, specifically from the National Addressing Record for Statistical Purposes (CNEFE) of the Brazilian Institute of Geography and Statistics (IBGE) in urban modelling and analysis. The release of CNEFE represents a change in the historic scenario of land use data shortage in Brazil. Within this new context, in which the acquisition of this kind of information is no longer a weakness for research on Brazilian cities, this dissertation presents four methods for the construction of urban models and analyses under the perspective of urban configurational systems. Along three paper-like chapters, we first explore the construction of descriptive models with the mentioned data; then, we evaluate how sharply the produced models can describe the represented system; and, at last, we discuss how to confront the results of the accessibility analysis with the data. As a case study, we used the city of Ijuí, in Southern Brazil.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-04-02T12:19:53Z No. of bitstreams: 1 FredDeCastroSantos_DISSERT.pdf: 1904530 bytes, checksum: 379e23c6c92c47609a52da136aeeb02e (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-04-04T12:11:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FredDeCastroSantos_DISSERT.pdf: 1904530 bytes, checksum: 379e23c6c92c47609a52da136aeeb02e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-04T12:11:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FredDeCastroSantos_DISSERT.pdf: 1904530 bytes, checksum: 379e23c6c92c47609a52da136aeeb02e (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 / A World Wide Web ? uma cole??o de informa??es sempre crescente. Esta informa??o ? distribu?da entre documentos diferentes, disponibilizados atrav?s do HTTP. Mesmo que essa informa??o seja acess?vel aos usu?rios na forma de artigos de not?cias, transmiss?es de ?udio, imagens e v?deos, os agentes de software geralmente n?o podem classific?-la. A falta de informa??es sem?nticas sobre esses documentos em um formato leg?vel por m?quina geralmente faz com que a an?lise seja imprecisa. Um n?mero significativo de entidades adotaram Linked Data como uma forma de adicionar informa??es sem?nticas aos seus dados, e n?o apenas public?-lo na Web. O resultado ? uma cole??o global de dados, chamada Web of Data, que forma um grafo global, composto por declara??es no formato RDF [22] de diversas fontes, cobrindo todos os tipos de t?picos. Para encontrar informa??es espec?ficas nesses grafos, as consultas s?o realizadas come?ando em um sujeito e analisando seus predicados nas instru??es RDF. Esses predicados s?o as conex?es entre o sujeito e o objeto, e um conjunto de trilhas forma um caminho de informa??o. O uso de HTTP como mecanismo padr?o de acesso a dados e RDF como modelo de dados padr?o simplifica o acesso a dados, o que nos motiva a pesquisar alternativas na forma como esses dados s?o buscados. Uma vez que a maioria das linguagens de consulta de banco de dados de grafo est?o na classe de Linguagens Regulares, n?s propomos seguir um caminho diferente e tentar usar uma classe de gram?tica menos restritiva, chamada Gram?tica Livre de Contexto Determin?stica, para aumentar a expressividade das consultas no banco de dados em grafo. Mais especificamente, aplicando o m?todo de an?lise LR(1) para encontrar caminhos em um banco de dados de grafo RDF. O principal objetivo deste trabalho ? prover meios para se permitir a utiliza??o de t?cnicas de reconhecimento de gram?ticas livres de contexto LR(1) para fazer consultas por caminhos formados pelas etiquetas das arestas em um banco de dados RDF. Fornecendo, como um resultado, uma ferramenta que se permita atingir melhor expressividade, efici?ncia e escalabilidade nestas consultas do que o que existe atualmente. Para atingir este objetivo, n?s implementamos um algoritmo baseado nas t?cnicas de reconhecimento LR(1), usando o GSS [30] ao inv?s de uma pilha, e permitimos ao usu?rio fazer consultas com uma gram?tica livre de contexto (LR1). Tamb?m analisamos a complexidade do nosso algoritmo e executamos alguns experimentos, comparando nossa solu??o com as outras propostas na literatura, mostrando que a nossa pode ter melhor desempenho em alguns cen?rios. / The World Wide Web is an always increasing collection of information. This information is spread among different documents, which are made available by using the HTTP. Even though this information is accessible to users in the form of news articles, audio broadcasts, images and videos, software agents often cannot classify it. The lack of semantic information about these documents in a machine-readable format usually makes the analysis inaccurate. A significant number of entities have adopted Linked Data as a way to add semantic information to their data, not just publishing it on the Web. The result is a global data collection, called the Web of Data, which forms a global graph, consisting of RDF [22] statements from numerous sources, covering all sorts of topics. To find specific information in this graph, queries are performed starting at a subject and analyzing their predicates in the RDF statements. These predicates are the connections between the subject and object, and a set of traces forms an information path. The use of HTTP as a standardized data access mechanism and RDF as a standard data model simplifies the data access, but accessing heterogeneous data on distinct locations may have an increased time complexity and current query languages have a reduced query expressiveness, which motivates us to research alternatives in how this data is queried. This reduced expressiveness happens because most query languages belong to the class of Regular Languages. The main goal of this work is to use LR(1) context-free grammar processing techniques to search for context-free paths over RDF graph databases, providing, as result, a tool which allows better expressiveness, efficiency and scalability in such queries than what is proposed today. To achieve that, we implemented an algorithm based on the LR(1) parsing technique that uses the GSS [30] structure instead of a stack, and give means for the user to input queries with an LR(1) context-free grammar. Also, we analyze our algorithm?s complexity and make some experiments, comparing our solution to other proposals present in the literature and show that ours can have better performance in given scenarios.

O presente trabalho investiga possibilidades quanto à utilização de dados desagregados, especificamente do Cadastro Nacional de Endereços para Fins Estatísticos (CNEFE) do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE), em modelos e análises urbanas. A divulgação do CNEFE representa uma mudança no quadro histórico de escassez de dados a respeito do uso do solo urbano no Brasil. Nesse novo contexto em que a aquisição deste tipo de informação – sem perder de vista suas contingências – deixa de ser uma debilidade em estudos a respeito das cidades brasileiras, apresenta-se nesta dissertação quatro métodos de modelagem e análise sob a perspectiva dos sistemas configuracionais urbanos que lançam mão do CNEFE enquanto insumo. Ao longo de três capítulos com características de artigos, explora-se primeiro a construção de modelos descritivos a partir dos dados; em seguida, busca-se como avaliar a nitidez com que os dois modelos produzidos descrevem o sistema urbano representado; e, por último, discute-se como confrontar os resultados da análise da acessibilidade do sistema urbano com os dados do modelo. Como estudo de caso, utilizou-se a cidade de Ijuí, RS. / This work investigates possibilities regarding the use of disaggregated data, specifically from the National Addressing Record for Statistical Purposes (CNEFE) of the Brazilian Institute of Geography and Statistics (IBGE) in urban modelling and analysis. The release of CNEFE represents a change in the historic scenario of land use data shortage in Brazil. Within this new context, in which the acquisition of this kind of information is no longer a weakness for research on Brazilian cities, this dissertation presents four methods for the construction of urban models and analyses under the perspective of urban configurational systems. Along three paper-like chapters, we first explore the construction of descriptive models with the mentioned data; then, we evaluate how sharply the produced models can describe the represented system; and, at last, we discuss how to confront the results of the accessibility analysis with the data. As a case study, we used the city of Ijuí, in Southern Brazil.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-08-03T11:37:48Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Audir da Costa Oliveira Filho - 2018.pdf: 1703675 bytes, checksum: f21c9ff479b840d0cdd37dfc9827c0dd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-08-03T11:41:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Audir da Costa Oliveira Filho - 2018.pdf: 1703675 bytes, checksum: f21c9ff479b840d0cdd37dfc9827c0dd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-03T11:41:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Audir da Costa Oliveira Filho - 2018.pdf: 1703675 bytes, checksum: f21c9ff479b840d0cdd37dfc9827c0dd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-06-21 / Keyword query techniques have been proven to be very effective due of their user-friendliness on the Web. However, much of the data is stored in relational databases, being necessary knowledge of a structured language to access this data. In this sense, during the last decade some works have been proposed with the intention of performing keyword queries to relational databases. However, systems that implement this approach have been validated using ad hoc methods that may not reflect real-world workloads. The present work proposes a benchmark for evaluation of the methods of keyword queries to relational databases defining a standardized form with workloads that are consistent with the real world. This proposal assists in assessing the effectiveness of current and future systems. The results obtained with the benchmark application suggest that there are still many gaps to be addressed by keyword query techniques. / Técnicas de consultas por palavras-chave se mostraram muito eficazes devido à sua facilidade de utilização por usuário na Web. Contudo, grande parte dos dados estão armazenados em bancos de dados relacionais, sendo necessário conhecimento de uma linguagem estruturada para acesso a esses dados. Nesse sentido, durante a última década alguns trabalhos foram propostos com intuito de realizar consultas por palavras-chaves a bancos de dados relacionais. No entanto, os sistemas que implementam essa abordagem foram validados utilizando métodos ad hoc com bancos de dados que podem não refletir as cargas utilizadas no mundo real. O presente trabalho propõe um benchmark para avaliação dos métodos de consultas por palavras-chave a bancos de dados relacionais definindo uma forma padronizada com cargas de trabalhos condizentes com a do mundo real. Esta proposta auxilia na avaliaçãode eficácia dos sistemas atuais e futuros. Os resultados obtidos com a aplicação do benchmark sugerem que ainda existe muitas lacunas a serem tratadas pelas técnicas de consultas por palavras-chave.

Introdução. A violência é um dos problemas mais sérios de Saúde Pública. Para conhecê-lo, usam-se, principalmente, dados de mortalidade, reconhecendo-se, no entanto, como relevante, o uso de outros dados para o monitoramento desses eventos. Objetivo. Fornecer subsídios para a implantação de um Sistema de Vigilância de Causas Externas (CE), por meio da análise de dados oriundos de diferentes fontes de informação e subseqüente relacionamento entre os bancos de dados produzidos por essas fontes. Metodologia. Para análise da mortalidade utilizou-se o Sistema de Informações sobre Mortalidade (SIM/MS); para os de morbidade hospitalar, o Sistema de Informações Hospitalares (SIH/SUS); para a morbidade não hospitalar criou-se um sistema de informações para as unidades de urgência e emergência. Esses bancos foram relacionados entre si e com o da Secretaria de Justiça e Segurança Pública (Sistema de Registro de Ocorrências Policiais), por meio do aplicativo RecLinkII. Resultados. Dados de 1980 a 2002 mostram que os coeficientes de mortalidade são sempre mais elevados em Cuiabá que no Brasil e Mato Grosso; o homicídio é a principal causa de morte, com tendência de crescimento. As internações por CE também apresentam índices superiores aos do Brasil e do Estado, assim como as taxas relativas ao tempo médio de permanência, gasto médio e mortalidade hospitalar; o traumatismo é a principal lesão e, diferente da mortalidade, os acidentes, exceto os de transporte, são as principais causas de internação. Quanto às unidades de urgência e emergência, verificou-se que é viável e necessária a implantação da ficha de notificação; a qualidade do preenchimento foi boa nos itens identificação e tipo de CE, possibilitando o uso dessas informações; a análise epidemiológica mostrou que os acidentes são mais freqüentes e que 97% dos pacientes, atendidos nessas unidades, receberam alta na própria unidade. Um dos usos do processo de relacionamento é o aprimoramento da qualidade da informação gerada por esses bancos e o monitoramento dos eventos; o relacionamento entre os bancos é possível, mas é recomendável que se inicie com o SIM e SIH/SUS. Conclusões: O perfil de morbimortalidade apresentado para os diferentes sistemas é muito distinto, o que aponta para a necessidade de integração desses bancos de dados para ampliar o conhecimento sobre os acidentes e violências. No entanto, é necessário estabelecer metas a curto, médio e longo prazo, que contemplem, no mínimo, a melhoria da qualidade da informação, a criação de uma equipe de vigilância de causas externas e a implantação de um sistema de informação para unidades de urgência e emergência. / Introduction. Violence is one of the most serious public health problems. It is studied mainly by means of mortality data, although the use of other data for monitoring such events is also recognized to be important. Objective. To furnish support for implementing an External Causes Surveillance System, by means of analyzing data from different information sources and subsequently correlating between the databases produced from these sources. Methodology. To analyze the mortality data, the Ministry of Health Mortality Information System (SIM/MS) was utilized. For the morbidity data, the National Health System Hospitalization Information System (SIH/SUS) was utilized. For non-hospitalized morbidity, an information system for urgency and emergency units was created. These databases were correlated with each other and with those of the Justice and Public Security Department (Police Occurrences Registration System), by means of the RecLinkII software. Results. Data from 1980 to 2002 showed that the mortality coefficients were always higher in Cuiabá than in the State of Mato Grosso or Brazil. Homicide was the principal cause of death, with a rising trend. Hospitalization due to external causes also presented higher rates in Cuiabá than in the whole state or the country, as did the rates for the mean length of stay, mean expenditure and mortality in hospital. Trauma was the principal injury and, differing from mortality, accidents other than traffic accidents were the main causes of hospitalization. With regard to the urgency and emergency units, it was seen that it was possible and necessary to implement a notification card system. The quality of filling in the information was good for the items of identification and external cause type, thus making it possible to use this information. Epidemiological analysis showed that accidents were most frequent and that 97% of the patients attended in these units were discharged from these same units. One of the uses of the correlation process is to improve the quality of the information generated by these databases and to monitor events. Correlations between the databases are possible, but it is recommendable to start with SIM and SIH/SUS. Conclusions. The morbidity-mortality profiles presented by the different systems are very distinct from each other, and this indicates the need to integrate these databases in order to expand the knowledge about accidents and violence. However, short, medium and long-term targets need to be established, at least with regard to improving the quality of the information, creating an external causes surveillance team and implementing an information system for the urgency and emergency units.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-07-11T14:35:16Z No. of bitstreams: 3 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) projeto_v26016.pdf: 1271790 bytes, checksum: f724d8523f2ffdb11ce599aff1eb8eb6 (MD5) projeto_v26016.pdf: 1271790 bytes, checksum: f724d8523f2ffdb11ce599aff1eb8eb6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T14:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 3 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) projeto_v26016.pdf: 1271790 bytes, checksum: f724d8523f2ffdb11ce599aff1eb8eb6 (MD5) projeto_v26016.pdf: 1271790 bytes, checksum: f724d8523f2ffdb11ce599aff1eb8eb6 (MD5) Previous issue date: 2016-07-08 / As Instituições Federais de Ensino Superior (IFES) possuem um importante papel no desenvolvimento social e econômico do país, contribuindo para o avanço tecnológico e cientifico e fomentando investimentos. Nesse sentido, entende-se que um melhor aproveitamento dos recursos educacionais ofertados pelas IFES contribui para a evolução da educação superior, como um todo. Uma maneira eficaz de atender esta necessidade é analisar o perfil dos estudantes ingressos e procurar prever, com antecedência, casos indesejáveis de evasão que, quanto mais cedo identificados, melhor poderão ser estudados e tratados pela administração. Neste trabalho, propõe-se a definição de uma abordagem para aplicação de técnicas diretas de Mineração de Dados objetivando a classificação dos discentes ingressos de acordo com o risco de evasão que apresentam. Como prova de conceito, a análise dos aspectos inerentes ao processo de Mineração de Dados proposto se deu por meio de experimentações conduzidas no ambiente da Universidade Federal de Pernambuco (UFPE). Para alguns dos algoritmos classificadores, foi possível obter uma acurácia de classificação de 73,9%, utilizando apenas dados socioeconômicos disponíveis quando do ingresso do discente na instituição, sem a utilização de nenhum dado dependente do histórico acadêmico. / The Brazilian's Federal Institutions of Higher Education have an important role in the social and economic development of the country, contributing to the technological and scientific advances and encouraging investments. Therefore, it is possible to infer that a better use of the educational resources offered by those institutions contributes to the evolution of higher education as a whole. An effective way to meet this need is to analyze the profile of the freshmen students and try to predict, as soon as possible, undesirable cases of dropout that when earlier identified can be examined and addressed by the institution's administration. This work propose the development of a approach for direct application of Data Mining techniques to classify newcomer students according to their dropout risk. As a viability proof, the proposed Data Mining approach was evaluated through experimentations conducted in the Federal University of Pernambuco. Some of the classification algorithms tested had an classification accuracy of 73.9% using only socioeconomic data available since the student's admission to the institution, without the use of any academic related data.

A Dengue e a Febre Aftosa são infecções virais que ocorrem tanto no Brasil como no mundo, apresentando enorme impacto socioeconômico. As proteases virais são reconhecidas como alvos de grande interesse para o planejamento de antivirais, devido ao seu papel fundamental no ciclo de vida de muitos vírus, incluindo-se os flavivirus (vírus da Dengue DENV) e os picornavirus (vírus da Febre Aftosa FA). Com o objetivo de buscar e identificar novos inibidores de proteases virais (da NS2B/NS3pro do DENV ou da Lbpro do vírus da FA) propusemos modelos de busca virtual, incluindo diferentes filtros de seleção (ex. farmacofórico, drug-like, similaridade e ancoramento) aplicados, sequencialmente, a bancos de dados de compostos comerciais (280x103 a 23x106 compostos). A seleção final dos compostos foi sempre feita por inspeção visual. Para NS2B/NS3pro do DENV, construíram-se quatro modelos de busca virtual (Modelo I-DENV a Modelo IV-DENV). O primeiro foi construído, baseando-se na estrutura cristalográfica ligada a um inibidor peptidomimético, e aplicado ao banco ZINC. Ao final, dez compostos foram comprados e submetidos a testes de inibição enzimática, frente à NS2B/NS3pro, para validação experimental deste modelo. Dois compostos mostraram alguma atividade inibitória (IC50 150 - 300 µM). Visando-se melhorar estes resultados, a flexibilidade da NS2B/NS3pro foi incluída, usando simulações de dinâmica molecular (DM), e um novo banco de dados construído (ZINC-Curated). Através de uma análise extensiva do banco ZINC-Curated, usando ferramentas estatísticas/quimiométricas, confirmou-se que este foi enriquecido com compostos com características de fármacos. Outros três modelos de busca virtual foram construídos incluindo-se diferentes informações obtidas nas simulações de DM. O modelo II-DENV foi feito usando ancoramento e aplicado ao banco ZINC-Curated, selecionando dezesseis compostos. Nenhum deles apresentou atividade inibitória significativa frente à NS2B/NS3pro do DENV. Os modelos III-DENV e IV-DENV utilizaram modelos farmacofóricos, que tiveram seus desempenhos previamente avaliados usando dados de literatura, e foram aplicados aos bancos NCI e ZINC-Curated, respectivamente. O modelo III-DENV selecionou quinze compostos, tendo quatro deles apresentado atividade inibitória (IC50 30 - 100 µM). O modelo IV-DENV selecionou dezoito compostos, sendo quatro ativos frente a esta protease (IC50 4 - 90 µM), representando uma taxa de acerto de ~22 %. Ainda, uma série de treze análogos estruturais do composto mais ativo foi construída, sendo três deles também ativos. Portanto, as modificações incluídas na busca virtual permitiram melhorar, significativamente, os resultados obtidos. Para Lbpro do vírus da FA, construíram-se dois modelos de busca virtual (Modelos I-FA e II-FA). O primeiro foi construído usando sua estrutura cristalográfica, sem ligantes, e uma série in house de potenciais inibidores covalentes. Seis compostos foram selecionados e testados frente à Lbpro, tendo dois deles baixa atividade inibitória (IC50 300 - 600 µM). A partir da disponibilidade da estrutura da Lbpro com ligante, o modelo IIFA foi construído e aplicado ao banco ZINC-Curated, selecionando quinze compostos. Estes foram adquiridos e testados frente à Lbpro, não apresentando atividade inibitória significativa. Assim, as modificações incluídas ainda não foram suficientes para selecionar inibidores mais potentes. No entanto, estes modelos/resultados contribuíram para o entendimento da(s) interação(ões) no sítio ativo da Lbpro. / Dengue and Food-and-mouth disease are viral infections that occur in Brazil and in the world, causing a huge socioeconomic impact. Viral proteases are recognized as targets for antiviral design, because they are crucial for the life cycle of many viruses, such as flavivirus (Dengue virus DENV) and picornavirus (Food-and-mouth disease virus FMDV). In order to discovery novel inhibitors of viral proteases (of NS2B/NS3pro of DENV or of Lbpro of FMDV) virtual screening models were proposed comprising a sequence of different filters (e.g. pharmacophore, drug-like, similarity and docking) applied to databases of commercial compounds (280x103 to 23x106 compounds). In all models, the final selection of compounds was always done by visual inspection. For DENV NS2B/NS3pro, four virtual screening models were proposed (Model I-DENV to Model IV-DENV). Model I-DENV was built, based on the crystal structure bound to a peptidemimetic inhibitor, and applied to ZINC database. Finally, ten compounds were purchased and submitted to enzymatic assays against this protease to the experimental validation of this model. Two compounds showed some inhibitory activity (IC50 150 - 300 µM). In order to improve these results, NS2B/NS3pro flexibility was included, using molecular dynamics (MD) simulations, and a novel database was built (ZINC-Curated). Throughout an exhaustively analysis of ZINC-Curated, using statistical/chemometrics tools, we confirmed that this new database was enriched with drug like compounds. Other three virtual screening models were built including different information from MD simulations. Model II-DENV was built using docking and applied to the ZINC-Curated database, selecting sixteen compounds. None of them showed a significant inhibitory activity against DENV NS2B/NS3pro. Models III-DENV and IV-DENV were built using pharmacophore models, which have their performance previously evaluated using literature data, and applied to NCI and ZINC-Curated databases, respectively. Model III-DENV selected fifteen compounds, showing four of them inhibitory activity (IC50 30 - 100 µM). Model IV-DENV selected eighteen compounds. Four of them were active against this protease (IC50 4 - 90 µM), representing a hit rate of ~22 %. Moreover, a set of thirteen structural analogues of the most active compound were built, being three of them also active. Thus, the modifications done in the virtual screening procedure really improved our results. For FMDV Lbpro, two virtual screening models were built (Models I-FMDV and II-FMDV). The first one was based on the crystal structure, without ligands, and used a set of in house potential covalent inhibitors. Six of the in house compounds were selected and tested against this protease. Two of them showed a weak inhibitory activity (IC50 300 - 600 µM). Later on, the Lbpro bound with ligands was available being therefore used to build another model. Model II FMDV was applied to the ZINC-Curated database, selecting fifteen compounds that were purchased and also tested against the target protease. But none of them showed a significant inhibition. Thus, the incorporated changes were not enough to retrieve active compounds. However, these models/results contributed to better understand Lbpro binding site interactions

Made available in DSpace on 2016-04-25T20:20:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tadeu Morato Maciel.pdf: 4334973 bytes, checksum: 2eebfe6314e8fa127d2f4b761cecf46c (MD5) Previous issue date: 2011-06-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / From the 1980s, the Brazilian social policies assumed new features that enable more efficient management of programs and their beneficiaries. The current democratic society establishes monitorings of social policies and implements a constant control, verifying the achievement of desired results. Among the new elements that are redefining it, there are the decentralization of actions, focalisation of target public, income transfer programs, improvement of management through joint action, the appropriation of new information and communication technologies, integration of information in data banks and encouragement of citizen participation. This dissertation examines the various elements that compose the Pro-Social, implemented by the Government of Sao Paulo, for evaluation and monitoring of social programs and their beneficiaries by the use of the database, which promotes the integrated management of decentralized social projects and allows the construction of social indicators that measure the effectiveness of actions. It aims to point out the conditioners of new social policies implemented in recent years and how they are inserted in Pro-Social, activating new devices to government of population. Using concepts such as biopolitics and disciplinary society, by Michel Foucault, and society of control, by Gilles Deleuze, we locate these social policies in the transition of their applicability. From the discussion of Pro-social, was possible to situate disciplinary and biopolitical elements linked to devices that allow a quick and effective control, forward the new flowing relations in society of control. Besides the data monitoring looking to identify who will or will not be entitled to receive benefits, these devices permit greater popular participation in life management / A partir da década de 1980, as políticas sociais brasileiras assumiram novas características que possibilitam o gerenciamento mais eficiente dos programas e seus beneficiários. A sociedade democrática atual institui monitoramentos das políticas sociais e implementa um controle constante, verificando o alcance dos resultados almejados. Dentre os novos elementos que as redefiniram encontram-se a descentralização das ações, focalização do público-alvo, programas de transferência de renda, otimização da gestão por meio da atuação conjunta, apropriação de novas tecnologias de informação e comunicação, integração das informações em bancos de dados e incentivo à participação cidadã. Esta dissertação analisa os diversos elementos que compõem o Programa Pró- Social, implementado pelo Governo de São Paulo, para avaliação e monitoramento dos programas sociais e seus beneficiários por meio do uso de banco de dados, que favorece a gestão integrada de projetos sociais descentralizados e possibilita a construção de indicadores sociais que meçam a eficiência das ações. Busca-se assinalar os novos condicionantes das políticas sociais implementadas nos anos recentes e como eles se apresentam no Pró-Social, ativando novos dispositivos de governo da população. Por meio de conceitos como biopolítica e sociedade disciplinar, de Michel Foucault, e sociedade de controle, de Gilles Deleuze, localizamos essas políticas sociais na transição de suas aplicabilidades. A partir da discussão sobre o Pró-Social, foi possível situar elementos disciplinares e biopolíticos vinculados a dispositivos que permitem um controle mais rápido e efetivo, diante das novas relações em fluxo da sociedade de controle. Além de monitorarem os dados de modo a identificar quem terá ou não o direito a receber os benefícios, esses dispositivos admitem maior participação popular no gerenciamento da vida