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Développement d'un implant solide biodégradable à base d'amidon réticulé à teneur élevée en amylose, pour la libération contrôlée d'un principe actif

Désévaux, Cyril January 2002 (has links)
Thèse diffusée initialement dans le cadre d'un projet pilote des Presses de l'Université de Montréal/Centre d'édition numérique UdeM (1997-2008) avec l'autorisation de l'auteur.
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Développement d'un implant solide biodégradable à base d'amidon réticulé à teneur élevée en amylose, pour la libération contrôlée d'un principe actif

Désévaux, Cyril January 2002 (has links)
Thèse diffusée initialement dans le cadre d'un projet pilote des Presses de l'Université de Montréal/Centre d'édition numérique UdeM (1997-2008) avec l'autorisation de l'auteur.
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Metallurgical development of high-performance biodegradable twinning-induced plasticity steels

Loffredo, Sergio 14 May 2022 (has links)
Thèse en cotutelle, Université Laval, Québec, Canada et Politecnico di Milano, Milano, Italie. / L'athérosclérose est une des maladies cardiovasculaires les plus récurrentes dans le monde, consistant dans l'obstruction d'une artère par des dépôts fibreux. Un des traitements les plus utilisés consiste dans l'implantation d'un stent, une mèche métallique tubulaire, afin de rouvrir l'artère et restaurer le flux sanguin. Un stent est normalement conçu pour rester dans le patient pour toute sa vie, mais des réactions inflammatoires peuvent se manifester à long terme. Pour cette raison, et pour pouvoir aussi traiter des jeunes patients, des stents biodégradables ont été pensés. Parmi eux, un dispositif à base de magnésium a reçu l'approbation à la commercialisation dans l'Union Européenne en 2016. Bien que ce dispositif se soit démontré sécuritaire dans des essais cliniques, sa taille est beaucoup plus grande que celle des stents permanents communément utilisés à cause des faibles propriétés mécaniques de la matrice. Une famille de matériaux avec des excellentes propriétés mécaniques et un bon potentiel de dégradation sont les aciers à plasticité induite par maclage, composés de fer, manganèse et carbone. En revanche, leur applicabilité clinique n'est pas actuellement possible car leur dégradation est entravée par la formation d'une couche de produits de dégradation pendant ce processus. Ce travail propose d'ajouter une petite quantité d'argent à un acier composé de fer, manganèse et carbone pour accélérer le processus de dégradation sans réduire ses propriétés mécaniques. Les travaux de cette thèse ont porté sur le développement de ces alliages, leur validation métallurgique et l'étude de leur dégradation. Ces études ont montré que l'ajout d'argent n'a pas affecté significativement les propriétés mécaniques de l'alliage de base. Au contraire, il a été observé que cet ajout a modifié la structure de l'alliage sous une déformation plastique et sa capacité de récupérer la structure initiale après une telle déformation. Au niveau de la dégradation, la présence d'argent n'a pas permis d'accélérer ce processus, étant efficace seulement dans les premiers jours. En opposition, l'évolution du mécanisme de dégradation jusqu'à six mois détecté dans cette thèse est très proche du comportement observé dans des tests sur des animaux conduits par d'autres chercheurs. En conclusion, bien que la stratégie retenue ne se soit pas révélée efficace pour atteindre l'objectif ciblé, les avancées dans la compréhension du mécanisme de dégradation et de la mise en forme des aciers à plasticité induite par maclage pour des stents vasculaires peuvent permettre le développement d'autres stratégies efficaces à long terme pour permettre à ces alliages de se dégrader dans le corps humain. / Atherosclerosis is one of the most recurring diseases in the world, consisting in obstruction of an artery by fibrous deposits. One of the most used treatments consists in implanting a stent, a tubular metallic mesh, for reopening the artery and restoring blood flow. A stent is normally designed to remain in the patient for all his life, but inflammatory reactions may occur at long terms. Because of this, and also for treating young patients, biodegradable stents were designed. Among them, a magnesium-based device received approval for commercialization in the European Union in 2016. Although this device proved safe in clinical trials, its size is much larger than permanent stents. This is due to the low mechanical properties of the matrix. A family of materials with excellent mechanical properties and a good degradation potential are twinning-induced plasticity steels, made of iron, manganese and carbon. On the other hand, their clinical applicability is currently not possible since their degradation is hindered by formation of a stable product layer during this process. This work proposes to add a small quantity of silver to a steel made of iron, manganese and carbon to accelerate the degradation process without reducing its mechanical properties. The works in this thesis dealt with development of such alloys, their metallurgical validation and the study of their degradation. These studies showed that the addition of silver did not significantly affect mechanical properties of the base alloy. On the contrary, it was observed that this addition modified the alloy structure under plastic deformation and its capability to recover its initial structure after such a deformation. Concerning degradation, the presence of silver did not allow to accelerate this process, being effective only in the first days. In contrast, the evolution of degradation mechanism up to six months detected in this thesis is very close to the behavior observed in animal tests conducted by other researchers. In conclusion, although the retained strategy did not prove effective in attaining the targeted goal, the advances in the understanding of corrosion mechanism and processing of twinning-induced plasticity steels for vascular stents can foster the development of other strategies that are effective in the long term to allow these alloys to degrade in human patients. / L'aterosclerosi è una delle malattie cardiovascolari più diffuse nel mondo, e consiste nell'ostruzione di un'arteria da parte di depositi fibrosi. Uno dei trattamenti più utilizzati consiste nell'impiantazione di uno stent, una struttura metallica tubolare, per riaprire l'arteria e restaurare il flusso sanguigno. Uno stent è normalmente concepito per restare nel paziente per tutta la sua vita, ma delle reazioni infiammatorie possono avere luogo a lungo termine. Per questo motivo, e per poter inoltre trattare pazienti giovani, degli stent biodegradabili sono stati pensati. Tra loro, un dispositivo a base di magnesio ha ricevuto l'approvazione per la commercializzazione nell'Unione Europea nel 2016. Sebbene questo dispositivo si sia dimostrato sicuro in test clinici, le sue dimensioni sono molto più grandi di quelle degli stent permanenti comunemente usati nella pratica clinica a cause delle scarse proprietà meccaniche della matrice. Una famiglia di materiali con eccellenti proprietà meccaniche e un buon potenziale di degradazione sono gli acciai a plasticità indotta da geminazione, composti da ferro, manganese e carbonio. Per contro, la loro applicabilità clinica non è attualmente possibile poiché la loro degradazione è ostacolata dalla formazione di uno strato stabile di prodotti durante questo processo. Questo lavoro propone di aggiungere una piccola quantità d'argento a un acciaio composto da ferro, manganese e carbonio per accelerare il processo di degradazione senza ridurre le sue proprietà meccaniche. I lavori di questa tesi si sono concentrati sullo sviluppo di queste leghe, sulla loro validazione metallurgica e lo studio della loro degradazione. Questi studi hanno mostrato che l'aggiunta di argento non ha influenzato significativamente le proprietà meccaniche dell'acciaio di base. Al contrario, è stato osservato che quest'aggiunta ha modificato la struttura della lega durante una deformazione plastica, oltre alla sua capacità di recuperare la struttura iniziale dopo una tale deformazione. Riguardo la degradazione, la presenza d'argento non ha permesso di accelerare questo processo, essendo efficace soltanto nei primi giorni. Al contrario, l'evoluzione del meccanismo di degradazione fino a sei mesi rilevato in questa tesi è molto vicino a quanto osservato da altri ricercatori in test animali. In conclusione, sebbene la strategia utilizzata non si sia rivelata efficace per raggiungere l'obiettivo prefissato, i progressi nella comprensione del meccanismo di degradazione e della produzione degli acciai a plasticità indotta da geminazione per gli stent vascolari possono permettere lo sviluppo di altre strategie efficaci a lungo termine per permettere la degradazione di queste leghe nel corpo umano.
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Biodétérioration de mortiers armés par Acidithiobacillus thiooxidans / Biodeterioration of reinforced mortars by Acidithiobacillus thiooxidans

Hajj Chehade, Mohamad 09 November 2010 (has links)
Les travaux menés dans le cadre de cette thèse abordent la biodétérioration des mortiers armés par les bactéries du genre Acidithiobacillus thiooxidans connues pour rapidement altérer les mortiers et bétons dans les égouts. Les objectifs ont visés à mettre au point un dispositif expérimental permettant de quantifier et de comprendre les mécanismes bio-physico-chimiques impliqués, et à développer un test accéléré permettant de tester différentes formulations de mortiers, notamment, des aluminates de calcium (CAC) et des ciments Portland (OPC). Le dispositif expérimental est basé sur un essai de biolixiviation de mortiers armés par une suspension bactérienne de A. thiooxidans à pH inférieur à 2. Une étude approfondie des conditions de croissance de A. thiooxidans dans un milieu spécifique à cette bactérie ont été nécessaire pour disposer d’un essai de biolixiviation reproductible. A la fin des tests de biolixiviation, les mortiers armés CAC et OPC présentent deux zones altérées à leur surface ayant différentes minéralogies : une zone endommagée très altérée à l’extérieur et une zone intermédiaire moins altérée entre la zone altérée et le cœur sain. L’état de dégradation à été estimé par un indice d’attaque permettant de confirmer quantitativement que les mortiers armés CAC sont moins biodétériorés que ceux à base de ciment OPC. L’essai de biolixiviation mis en place pourrait donc servir de test pour évaluer la performance de diverses formulations de matériaux cimentaires. Les résultats électrochimiques des armatures incorporées dans les mortiers ont montré un effet protecteur plus important du ciment CAC, avec une intensité de corrosion plus faible que celle du ciment OPC. / The aim of this PHD is to study the biodeterioration of reinforced mortar by bacteria of the gender A. thiooxidans known for its fast alteration of mortar and concrete in sewer system. The objectives of this study consisted on the development of a new experimental device that allow on one hand to understand and quantify the different biological, chemical and physical mechanisms that may take place in concrete biodeterioration, and on the other hand to serve as basic reactor for an accelerated biodeterioration test allowing the discrimination of new reinforced mortar formulations mainly Portland cement (OPC) and calcium aluminate cement (CAC) formulations. The experimental device consists of a biolixivation of reinforced mortar by a A. thiooxidans bacterial suspension at pH lower than 2. A study of growth conditions of A. thiooxidans in a specific media for this bacterial strain was necessary to procure a reproducible biolixivation essay. At the end of the biolixiviation test the CAC and OPC mortar presented different mineralogy deteriorated zones. One deeply distorted zone in contact with bacterial suspension, a second intermediate zone less damaged than the first one and the cement untouched core. An estimated attack index confirmed that CAC mortars are much more resistant to biodeterioration than OPC cement. Hence the performed biolixivation essay helped to evaluate the performance of various cementitious material formulations in order to prevent biodeterioration by A. thiooxidans. Electrochemical analysis of mortar incorporated armatures demonstrated that CAC mortar composition shows a more protective effect than OPC cement displaying lower corrosion intensity.
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Biorestauration du sol contaminé par le pétrole brut non conventionnel de bitume

Li, Ziang 15 September 2022 (has links)
L'exploitation croissante de pétrole non conventionnel du bitume de l'Alberta (Canada) a soulevé des préoccupations majeures environnementales, car ce type de pétrole est intrinsèquement différents des pétroles conventionnels. Les études précédentes se sont principalement concentrées sur le bitume dilué, mais le pétrole brut synthétique, aussi connu sous le nom de "synthetic crude oil" ou "SCO", qui prend 35 % de part de marché des pétroles de bitume, n'a pas été bien étudié. Il y a actuellement très peu d'information sur la charge des contaminants dans le SCO, les techniques efficaces de décontamination après déversement, et les facteurs qui sont déterminants pour la réussite de la biorestauration. À cet égard, le but de cette étude est de développer ces connaissances en utilisant des microcosmes de sol dans des conditions de laboratoire. Premièrement, nous avons caractérisé les contaminants d'HAP qui viennent du SCO. Le résultat d'analyse du sol contaminé par le SCO (le Sol-SCO) nous a démontré qu'il y a une différence marquée sur l'abondance relative des HAP entre un sol contaminé avec SCO et un sol contaminé du pétrole conventionnel de "Texascrude" (le Sol-Texas). Le Sol-SCO contient une fraction significativement plus élevée d'HAP lourds (avec 3 à 6 anneaux) que le Sol-Texas. Les deux sols ont été également caractérisés par des taux de perte de HAP contrastés, ce qui est causé probablement par leurs compositions différentes. Cela soulève des inquiétudes quant à l'efficacité des méthodes de décontamination actuelles, car elles ont été développées originairement pour le pétrole conventionnel. À cet effet, nous avons évalué les potentiels de divers traitements pour le Sol-SCO, tels que l'atténuation naturelle (NA), l'ajout de boue d'épuration (S), l'inoculation de champignon (F), la plantation de graminées (P) et leurs combinaisons (S-F, S-P, F-P, et S-F-P). En suivant le taux de perte d'HAP (y compris les HAP alkylés et 16 HAP prioritaires de l'EPA), nous avons trouvé que tous les traitements sont très efficaces avec au moins 80 % de perte d'HAP après 60 jours. Cependant, les taux de perte d'HAP sont distincts entre les HAP légers ( ≤ 3 anneaux, ~ 96 % de perte moyenne) et les HAP lourds (4 à 6 anneaux, ~ 29 % de perte moyenne). Nous avons également observé que le traitement S-P a atteint les meilleurs résultats au niveau de la concentration d'HAP qui demeurent dans le sol post-traité (0,10 ± 0,02 mg•kg⁻¹ pour une concentration initiale de 0,29 ± 0,12 mg•kg⁻¹). Afin de trouver les facteurs qui ont donné ces meilleurs résultats liés avec les traitements avec la boue (notamment le S et le S-P), nous avons étudié les structures communautaires des bactéries. Le résultat a démontré qu'il n'y a pas de changement significatif au niveau de la structure de microbiome entre les traitements. Cependant, en intégrant toutes les données ensemble (les taxa de bactérie, les concentrations d'HAP, le niveau de CO₂ de sol, et l'humidité de sol), nous avons observé que les traitements se différencient en trois groupes - - le Cluster de plante, le Cluster de microorganisme, et le Cluster de contrôle. L'analyse de multi-facteurs iii (MFA) a démontré que ces changements sont fortement contribués par l'application de la boue et la plantation. Le MFA aussi a montré que la plupart des bactéries sont corrélées avec les HAP alkylés (tels que le 1- méthylphénanthrène, le 2-éthylanthracène, le 3-éthylphénanthrène et le 4-butylbenzothiophène) au lieu des HAP non-alkylés qui sont suivants choisis comme les cibles de l'étude environnementale. Cela implique que, en comparant avec les HAP non-alkylés, les bactéries métabolisaient principalement les HAP alkylés dans nos sols. Donc on suggère que les études futures pour la biorestauration des HAP devraient inclure plus de HAP alkylés dans leurs cibles d'analyse afin d'évider d'avoir du biais potentiellement important. En conclusion, notre étude a démontré que les traitements avec la boue d'épuration sont capables de mieux réduire la contamination d'HAP de SCO (comparativement aux autres traitements) dans le sol. Cette observation suggère que ces techniques pourraient être des bons candidats pour les recherches futures sur la biorestauration. Cependant, une attention particulière est nécessaire pour choisir l'environnement d'application, car des facteurs tels que l'humidité, le CO₂ et la concentration d'HAP auraient des impacts significatifs sur les activités microbiennes.
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Biorestauration du sol contaminé par le pétrole brut non conventionnel de bitume

Li, Ziang 15 September 2022 (has links)
L'exploitation croissante de pétrole non conventionnel du bitume de l'Alberta (Canada) a soulevé des préoccupations majeures environnementales, car ce type de pétrole est intrinsèquement différents des pétroles conventionnels. Les études précédentes se sont principalement concentrées sur le bitume dilué, mais le pétrole brut synthétique, aussi connu sous le nom de "synthetic crude oil" ou "SCO", qui prend 35 % de part de marché des pétroles de bitume, n'a pas été bien étudié. Il y a actuellement très peu d'information sur la charge des contaminants dans le SCO, les techniques efficaces de décontamination après déversement, et les facteurs qui sont déterminants pour la réussite de la biorestauration. À cet égard, le but de cette étude est de développer ces connaissances en utilisant des microcosmes de sol dans des conditions de laboratoire. Premièrement, nous avons caractérisé les contaminants d'HAP qui viennent du SCO. Le résultat d'analyse du sol contaminé par le SCO (le Sol-SCO) nous a démontré qu'il y a une différence marquée sur l'abondance relative des HAP entre un sol contaminé avec SCO et un sol contaminé du pétrole conventionnel de "Texas-crude" (le Sol-Texas). Le Sol-SCO contient une fraction significativement plus élevée d'HAP lourds (avec 3 à 6 anneaux) que le Sol-Texas. Les deux sols ont été également caractérisés par des taux de perte de HAP contrastés, ce qui est causé probablement par leurs compositions différentes. Cela soulève des inquiétudes quant à l'efficacité des méthodes de décontamination actuelles, car elles ont été développées originairement pour le pétrole conventionnel. À cet effet, nous avons évalué les potentiels de divers traitements pour le Sol-SCO, tels que l'atténuation naturelle (NA), l'ajout de boue d'épuration (S), l'inoculation de champignon (F), la plantation de graminées (P) et leurs combinaisons (S-F, S-P, F-P, et S-F-P). En suivant le taux de perte d'HAP (y compris les HAP alkylés et 16 HAP prioritaires de l'EPA), nous avons trouvé que tous les traitements sont très efficaces avec au moins 80 % de perte d'HAP après 60 jours. Cependant, les taux de perte d'HAP sont distincts entre les HAP légers ( ≤ 3 anneaux, ~ 96 % de perte moyenne) et les HAP lourds (4 à 6 anneaux, ~ 29 % de perte moyenne). Nous avons également observé que le traitement S-P a atteint les meilleurs résultats au niveau de la concentration d'HAP qui demeurent dans le sol post-traité (0,10 ± 0,02 mg•kg⁻¹ pour une concentration initiale de 0,29 ± 0,12 mg•kg⁻¹). Afin de trouver les facteurs qui ont donné ces meilleurs résultats liés avec les traitements avec la boue (notamment le S et le S-P), nous avons étudié les structures communautaires des bactéries. Le résultat a démontré qu'il n'y a pas de changement significatif au niveau de la structure de microbiome entre les traitements. Cependant, en intégrant toutes les données ensemble (les taxa de bactérie, les concentrations d'HAP, le niveau de CO₂ de sol, et l'humidité de sol), nous avons observé que les traitements se différencient en trois groupes - - le Cluster de plante, le Cluster de microorganisme, et le Cluster de contrôle. L'analyse de multi-facteurs (MFA) a démontré que ces changements sont fortement contribués par l'application de la boue et la plantation. Le MFA aussi a montré que la plupart des bactéries sont corrélées avec les HAP alkylés (tels que le 1-méthylphénanthrène, le 2-éthylanthracène, le 3-éthylphénanthrène et le 4-butylbenzothiophène) au lieu des HAP non-alkylés qui sont suivants choisis comme les cibles de l'étude environnementale. Cela implique que, en comparant avec les HAP non-alkylés, les bactéries métabolisaient principalement les HAP alkylés dans nos sols. Donc on suggère que les études futures pour la biorestauration des HAP devraient inclure plus de HAP alkylés dans leurs cibles d'analyse afin d'évider d'avoir du biais potentiellement important. En conclusion, notre étude a démontré que les traitements avec la boue d'épuration sont capables de mieux réduire la contamination d'HAP de SCO (comparativement aux autres traitements) dans le sol. Cette observation suggère que ces techniques pourraient être des bons candidats pour les recherches futures sur la biorestauration. Cependant, une attention particulière est nécessaire pour choisir l'environnement d'application, car des facteurs tels que l'humidité, le CO₂ et la concentration d'HAP auraient des impacts significatifs sur les activités microbiennes.
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Synthèse, dégradation et bio-propriétés du polyglyoxylate d'éthyle

Belloncle, Benjamine 28 March 2008 (has links) (PDF)
Ce travail porte sur l'étude du polyglyoxylate d'ethyle (PGEt) : sa synthèse, sa caractérisation et sa dégradation. Le PGEt a été obtenu par polymérisation anionique. Les conditions optimales font intervenir un amorçage par NE3 dans le CH2Cl2 à une température inférieure à -20°C. L'existence d'une température plafond (Tp = 310K pour [M]0 = 1M) nécessite l'utilisation d'agents de terminaison (phényl isocyanate ou bromure de 2-bromo-2-méthyl propionyle) afin d'obtenir des PGEt stables. La dégradation par hydrolyse in vitro du PGEt a été étudiée par RMN 1H, CES... Le mécanisme fait intervenir des coupures de chaines et des hydrolyses des esters. Les produits ultimes de dégradation identifiés sont l'éthanol et l'hydrate d'acide glyoxylique. Le caractère biodégradable du PGEt a été confirmé par respirométrie. Des études préliminaires de toxicité (sur des hématies, le nématode C. Elegans, et la croissance des plantes) n'ont pas révélé d'effet nocif du PGEt et de ses produits de dégradation.
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Biodégradation du 2-éthylhexyl nitrate par Mycobacterium austroafricanum IFP 2173

Nicolau, Elodie 07 October 2008 (has links) (PDF)
Le 2-éthylhexyl nitrate (2-EHN) est incorporé en quantité significative au gazole afin d'augmenter son indice de cétane. Ce composé est produit à raison de 100 000 tonnes par an, principalement en France. Les risques liés à son utilisation sont cependant mal connus car en cas de contamination de l'environnement, on ne sait pas s'il est biodégradable. Cette étude avait pour but (i) d'évaluer la capacité de biodégradation du 2-EHN par des bactéries sélectionnées, (ii) d'élucider la voie de dégradation, et (iii) d'identifier les enzymes impliquées. Les tests de biodégradation prenant en compte le caractère toxique et hydrophobe du substrat on été mis au point dans un premier temps. A l'aide de ces tests qui reposent sur la mise en oeuvre de cultures biphasiques, nous avons montré que plusieurs souches de Mycobacterium austroafricanum étaient capables de dégrader le 2-EHN. La souche la plus performante (IFP 2173), résistant à des concentrations de 2-EHN de 6 g.L-1, a été choisie pour étudier la voie de dégradation. Sur la base de bilans carbone et d'analyse du milieu de culture par chromatographie gazeuse (CG), j'ai découvert que la dégradation du 2-EHN était incomplète et donnait lieu à l'accumulation d'un métabolite. Ce métabolite a été identifié comme étant la β-méthyl-γ-butyrolactone par des analyses de CG-MS et LC-MS/MS. La structure de cette lactone indiquait que le 2-EHN était dégradé selon une voie enzymatique impliquant l'hydroxylation du groupement méthyle de la chaîne carbonée principale, son oxydation en aldéhyde et acide, et enfin un cycle de β-oxydation. <br>Dans un deuxième temps, les enzymes impliquées dans la voie de dégradation du 2-EHN ont été recherchées par une approche protéomique. Des analyses par électrophorèse bidimensionnelle ont mis en évidence qu'en présence de 2-EHN, la souche IFP 2173 déclenche la synthèse d'une panoplie d'enzymes spécialisées dans le métabolisme des acides gras, comme les enzymes de la β-oxydation, des alcool et aldéhyde déshydrogénases. Une analyse exhaustive du protéome de la souche IFP 2173 a permis d'identifier par LC-MS/MS plus de 200 protéines induites sur 2-EHN, notamment un cytochrome P450 de type alcane monooxygénase (CYP153). En outre, j'ai également identifié et cloné les gènes codant deux alcanes hydroxylases transmembranaires de types AlkB, qui n'ont pas été détectées par l'approche protéomique. Ainsi, la souche IFP 2173 possède trois alcane hydroxylases susceptibles de catalyser l'attaque initiale du 2-EHN. Pour déterminer laquelle de ces trois monooxygénases était responsable de cette réaction, leur gène respectif a été cloné dans des plasmides conçus pour l'expression soit chez E. coli, soit chez M. smegmatis mc². Nos résultats préliminaires montrent que dans certains cas les protéines recombinantes sont bien synthétisées. Ces constructions seront employées pour étudier l'activité des trois hydroxylases de IFP 2173 vis-à-vis des alcanes et du 2-EHN en particulier.
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Photo-et biodégradation de dérivés du benzothiazole : étude en système combiné

Bunescu, Andrei 21 December 2006 (has links) (PDF)
La dégradation en solution aqueuse du 2-aminobenzothiazole (ABT) et du benzothiazole (BT) a été étudiée par voies photochimique, microbiologique et en combinant les deux approches. La voie photochimique impliquait des complexes aqueux de fer ou le complexe entre le fer et l'acide nitrilotriacétique (FeNTA). La voie microbiologique utilisait une souche bactérienne de Rhodococcus rhodochrous. Les schémas de dégradation ont été établis pour les différentes voies. Nous avons montré qu'il existait une grande similitude entre la dégradation photochimique et microbiologique. De plus, deux nouveaux produits de dégradation ont été identifiés par RMN CLHP couplée SM et UV-visible. Il s'agit du 4OH-ABT et un complexe de fer avec un dérivé catéchol d'ABT. Nous avons montré la plus grande efficacité du système couplant le fer et les microorganismes. Le rôle majeur du fer a été mis en évidence dans les processus de dégradation comme photo-inducteur et comme activateur des enzymes bactériennes
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Dégradation de la Fumonisine B1 par la communauté microbienne dans les ensilages de maïs grain humide / Degradation of Fumonisin B1 by microorganisms in high moisture maize grain silages

Martinez Tuppia, Ccori Silbina 04 December 2015 (has links)
Les mycotoxines telles que la fumonisine B1 (FB1) produites par les champignons du genre Fusarium sont particulièrement préoccupantes pour la filière maïsicole. L’ensilage de maïs est un processus de fermentation naturel susceptible de favoriser l’évolution des teneurs en FB1. La maîtrise du risque de contamination par la FB1 et la recherche de moyens permettant la décontamination des ensilages est donc nécessaire. L’objectif de ce travail est de caractériser le devenir de la FB1 dans les ensilages de maïs grain et de mettre en évidence l’existence d’agents microbiens capables de dégrader cette toxine. Pour cela, des mini-silos contenant du maïs grain naturellement contaminé en FB1 provenant de différents parcelles et issus des deux années de récolte ont été préparés. La stratégie analytique basée sur le dosage de la FB1 libre et la FB1 complexée par HPLC-MS/MS a révélé une diminution significative de la teneur en FB1 totale qui ne peut être attribuée à un mécanisme de complexation et résulte d’un mécanisme de dégradation. La recherche du microbiote associé à la dégradation de la FB1 a été réalisée par deux approches complémentaires : Une analyse métagénomique combinant l’extraction sélective de l’ADN microbien et le séquençage haut débit «shotgun» afin de comparer la diversité taxonomique et fonctionnelle d’un ensilage dégradant la FB1 et d’un ensilage moins dégradant. En parallèle, un criblage de microorganismes cultivables capables de métaboliser la FB1 a été conduit et a permis de confirmer les résultats de l’analyse globale. Ce travail apporte une première image du microbiote potentiellement associé à la dégradation de la FB1, ainsi que des activités microbiennes responsables. / Fungi of the genus Fusarium are one of the major contaminants of maize that can produce mycotoxins, such as the fumonisin B1 (FB1). Maize silage which is based on the fermentation of whole crop plant or grains is considered the main source of monogastrics and cattle feeding in Europe. The ensiling process could favor changes in FB1 content; however this has scarcely been documented. This led to questioning regarding the possibility of managing the microbiota during ensiling in order to reduce the level of mycotoxins exposure and improve feed quality. The aim of this work is to study the fate of FB1 during ensiling process of high moisture maize grain and to identify an endemic microbiota capable of degrading FB1. Laboratory scale silages were prepared with naturally contaminated FB1 grains from two cropping years. An analytical procedure allowed assessing both free and matrix associated FB1 forms and showed a significant decrease in total FB1 content that are not linked to the presence of bound FB1. Additionally, our data showed that the FB1 content decrease was mainly due to a degradation process. Identification of a potential microbiota responsible for FB1 degradation was conducted. A metagenomics approach combining a selective microbial DNA extraction and high-throughput shotgun sequencing showed microbial specific patterns between FB1 degrading and weakly degrading silage. These results were also supported by the isolation of microbial strains able to metabolize FB1. Ultimately, this work evidenced a microbiota associated to FB1 degradation and the functional diversity involved in this activity. Bacteria and yeasts have been obtained for further studies on degradation activities and their usage as silage starter.

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