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Isolamento e seleção de microrganismos envolvidos na degradação do Herbicida diclosulam / Microorganisms isolation and slection comprised in the degradation of herbicide diclosulamRodrigues, Nadia Regina, 1959- 29 July 2005 (has links)
Orientador: Silvio Roberto Andrietta, Maria da Graça Stupiello Andrietta / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-05T09:44:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2005 / Resumo: Algumas variedades de milho usadas em rotação com a soja, são sensíveis ao composto diclosulam aplicado em solo para o controle de ervas daninhas. Esse trabalho teve como objetivo isolar microrganismos capazes de degradar esse composto. O estudo envolveu isolamento e seleção de microrganismo, otimização de meio para o cultivo desses microrganismos assim como teste para produção de biomassa em escala de fermentador. Foram coletadas amostras de solos de três localidades (Uberlândia, Rondonópolis e Londrina) em plantio de soja os quais receberam aplicação de diclosulam. As amostras foram coletadas em três diferentes parcelas do solo: entrelinhas, rizosfera e oriundo da mata de vegetação natural (mata virgem). As amostras foram diluídas até ¿10 POT. 6¿, e semeadas em placas contendo os seguintes meios de cultivo: Mínimo, King¿s B e Rosa de Bengala suplementados com diclosulam 10¿mu¿g/mL. Os microorganismos foram incubados por 72 horas a ¿32 GRAUS¿C. as linhagens selecionadas, que apresentaram crescimento nos meios onde o diclosulam estava presente foram transferidas para os mesmos meios de origem, agora com 100¿mu¿g/mL de diclosulam. Os microrganismos capazes de crescer a essa concentração foram transferidos para meio Mínimo, agora suplementado com 500 'mu¿g/mL de diclosulam. Os resultados obtidos foram: 16 linhagens provenientes de Uberlândia, 3 de Rondonópolis... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Some corn varieties used in crop rotation with soybean are sensitive to diclosulam compound applied on soil for weed control. The purpose of this work was to isolate microorganisms able to degrade this compound. The study comprised microorganism isolation and selection, medium optimization for cultivation of these microorganisms, as well as a test for biomass production at fermentor scale. Soil sampling has been taken from three locations (Uberlândia, Rondonópolis and Londrina), where disclosulam had been applied. The samplings were collected in three different soil plots: interlines, rhizosphere and from natural vegetation woods. Samplings were diluted up to ¿10 POT 5¿, and seeded in plaques containing the following cultivation media: minimum, King¿s B and Bengale Rose supplemented with 10¿mu¿g/mL diclosulam. The microorganisms were incubated for 72 hours at ¿32 GRAUS¿C. the selected strains, which presented growth in the media containing diclosulam were transferred to the same original media, now with 100 'mu¿g/mL of diclosulam. The microorganisms able to grow at this concentration were transferred to the minimum medium, now supplemented with 500 'mu¿g/mL of diclosulam. The results obtained were: 16 strains from Uberlândia, 4 from Rondon[opolis. In the case of Londrina, no strain was possible to be isolated (6 strains were isolated only at concentration of 100 'mu¿g/mL)... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Desenvolvimento de Processos Biotecnologicos / Doutor em Engenharia Química
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Identificação de transcritos de Ceriporiopsis subvermispora expressos nas fases iniciais da biodegradação da madeira / Identification of transcripts of Ceriporiosis subvermispora expressed during initial phases of wood biodegradationMacedo, Maria Lucila Hernandez 07 August 2018 (has links)
Orientadores : Maricilda Palandi de Mello, Laura Maria Mariscal Ottoboni / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-07T06:32:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2006 / Resumo: Ceriporiopsis subvermispora é um basidiomiceto classificado como white-rot, que apresenta alta seletividade de degradação da lignina quando crescido em madeira. De maneira geral, existem três tipos de enzimas lignolíticas: manganês peroxidases (MnP), lignina peroxidases (LiP) e lacases. Estas enzimas atuam degradando estruturas fenólicas e não fenólicas da lignina. Até o momento, acredita-se que o sistema ligninolítico do fungo C. subvermispora seja composto por isoenzimas da família MnP e de lacases, pelo fato da atividade de LiPs não ter sido identificada, embora possua genes desta classe de enzimas. Diferentes estudos têm sido conduzidos como sistemas modelo de ligninólise, com diferentes linhagens de C. subvermispora e outros fungos white-rot visando uma possível aplicação da ligninólise biológica na biopolpação e na indústria de papel. Apesar da importância promissora do fungo C. subvermispora na aplicação industrial, o metabolismo celular e o sistema extracelular que esse organismo utiliza para decompor a madeira ainda não estão bem esclarecidos. Embora os estudos de atividades de enzimas extracelulares e de seus produtos gerem muitas informações a respeito dos mecanismos de ação de fungos lignolíticos, há necessidade de se integrar a estas informações resultados de expressão gênica durante o processo de biodegradação. Com isto este trabalho tem como objetivo contribuir com estudos moleculares do fungo durante a decomposição das madeiras de Pinus taeda e Eucalyptus grandis em pontos selecionados durante o período de 5 a 60 dias de crescimento. Para a caracterização de genes, foram obtidos rnRNAs de cada estágio de crescimento e submetidos às técnicas de RT-PCR e Display Diferencial. Foram utilizados dois primers ancoradores T12NC e T12NG, assim como três primers aleatórios (OPJ01, OPJ04, OPJ1O). Noventa e um fragmentos diferenciais foram visualizados em autorradiografias de géis de onde foram isolados, clonados e seqüenciados. As seqüências obtidas foram submetidas à analise por comparação de homologias em bancos de dados utilizando o programa BLASTX versão 2.2.14 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)Para a confirmação da expressão diferencial das seqüências com similaridade a proteínas envolvidas na degradação da madeira, foi utilizada a metodologia de PCR em tempo real. Três genes relacionados no processo de biodegradação foram encontrados, oxalato oxidase, celobioidrolase e manganês super oxido desmutase. Oxalato esta envolvido na produção de peróxido de hidrogênio que é utilizado como co-substrato para a ação de MnP. O radical superóxido desmutase reduz Mn+2, também originando peróxido de hidrogênio que atua na formação de Mn +3 capaz de oxidar compostos fenólicos e não fenólicos dos componentes da lignina. Já a celobioidrolase esta envolvida na cIivagem da cadéia terminal de polissacarídeos que compõem a celulose. O padrão de expressão observada por RT-PCR quantitativo mostrou que os genes de oxalato e superóxido desmutase foram altamente expressos durante os primeiros 15 dias de cultivo na madeira de P. taeda e nos períodos de 40 a 60 dias em E. grandis. Já a celobioidrolase apresentou maior expressão no décimo dia de cultivo nas duas madeiras. De modo geral estes resultados correlacionam-se a análise da atividade enzimática dos extratos de cultura do fungo em P. taeda e E. grandis / Abstract: Lignin is a heterogeneous and highly cross-linked macromolecule that is particularly resistant to biological degradation but some specialized fungi developed the ability to degrade this complex molecule. Most of these fungi belong to the basidiomycetes and are responsible for the white-rot decay processo One of them, Ceriporiopsis subvermispora, has been extensively studied due to its potential applicability in industrial processes. Ceriporiopsis subvermispora is a white-rot fungus that shows high selectivity towards lignin degradation through a mechanism composed mainly by maganese-dependent peroxidase (MnP) and lacase. Both activities are secreted as isoenzyme farnilies, with isoelectrofocusing patterns that vary according to the composition of the growth media. Although the industrial applicability of this fungus has been recognized, its biochemical and rnolecular lignolytic processes are not completely understood. The present study provides additional data for evaluating the molecular processes involving the first steps of wood biodegradation by C. subvermispora cultivated in Pinus taeda and Eucalyptus grandis for periods ranging from 5 to 60 days. U sing the differential display reverse transcription PCR technique (DDRT-PCR), a total of 91 differentially expressed cDNA fragments were identified by comparing band intensities among fingerprints obtained with rnRNA from cultivated mycelia. Sixty-one differential fragments were sequenced and identified by alignment analysis with GenBank sequences using the BLASTX function. Three . genes oxalate oxidas e, manganese superoxide desrnutase and cellobiohydrolase, derivates ITom biodegradation by C. subvermispora on Pinus taeda wood chips culture, were analysed and compared the expression in Eucalyptus grandis culture. Oxalate and superoxide dismutase genes were expressed during the first growth period (to 15 days) in P. taeda cuIture and 40-60 days in E. grandis wood. On the other hand cellobiohydrolase gene showed high expression at 10 day culture in both wood. This results are correlate with C. subvermispora enzymatic activities during biopulping of P. taeda e E. grandis / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural
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Embalagens ativas de fonte renovavel / Active packaging from renewable sourceNAIME, NATALIA 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:28:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:56:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Foram desenvolvidas embalagens biodegradáveis ativas tipo espuma, obtidas a partir de fécula de mandioca, capazes de aumentar a vida-de-prateleira de frutas minimamente processadas. Para tanto, agentes ativos que evitam a proliferação de fungos, a perda de peso e, também, forneçam uma indicação visual (mudança de cor da embalagem) da qualidade do produto embalado, foram adicionados às embalagens de fonte renovável. As espumas foram obtidas pelos processos de extrusão e termoprensagem de uma massa de fécula, gel (fécula suspensa em água) e aditivos (plastificantes e/ou agentes ativos). As formulações de espumas variaram quanto: ao tipo e concentrações de plastificantes (glicerol e polietilenoglicol PEG 300); às quantidades de sólido (fécula de mandioca em pó); aos diferentes tratamentos da fécula (modificações química por acetilação e físicas irradiação e pré-gelatinização); à procedência da fécula (da Bahia e do Paraná); ao reaproveitamento de espumas descartadas; às diferentes concentrações de agentes ativos (ácido l-ascórbico, cloreto de cálcio, sorbato de potássio e permanganato de potássio) e quanto à adição de corantes naturais (extratos de beterraba e repolho roxo). Foram avaliadas, principalmente, as propriedades mecânicas e de barreira das diferentes formulações de espumas de fécula de mandioca. Os resultados indicaram que quanto maior a concentração de fécula mais resistente é a espuma. As espumas contendo o plastificante PEG 300 se mostraram bastante flexíveis, apresentaram boa resistência à ruptura e absorveram pouca água. A pré-gelatinização da fécula proporcionou melhores propriedades mecânicas e de barreira para as espumas em relação aos outros tratamentos dados à fécula de mandioca. Já a adição de agentes ativos à massa não proporcionou tais melhoras às embalagens. As espumas de fécula de mandioca produzidas pelo processo de extrusão seguido de termoprensagem foram mais resistentes à ruptura do que as produzidas somente por termoprensagem. / Dissertacao (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Desenvolvimento, caracterização e estudo pré-clínico de dispositivos implantáveis biocompatíveis baseados no polímero poli(?-caprolactona) / Development, characterization and preclinical evaluation of the implantable biocompatible prototypes based on poli(?-caprolactona)SILVA, FABIANA M. da 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:33:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:03:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1
16497.pdf: 92708 bytes, checksum: 7ccf16810b03dfc8aa4c309390f8b21a (MD5) / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Estudo da biodegradação do hidrocloridrato de fluoxetina, empregando ensaios de respirometria e toxicidade / Biodegradation of the fluoxetine hidrocloride using respirometric and toxicological methodsCaminada, Suzete Maria Lenzi 12 December 2008 (has links)
Orientador: Alexandre Nunes Ponezi / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Civil, Arquitetura e Urbanismo / Made available in DSpace on 2018-08-13T11:10:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2008 / Resumo: A Comissão da União Européia e o comitê científico de toxicologia, ecotoxicologia e ambiente, identificaram, a necessidade da obtenção de dados sobre os efeitos dos fármacos no ambiente. Estes compostos e seus metabólitos são introduzidos no ambiente, pelo esgoto em quantidades que superam 100 toneladas/ano. A literatura científica comenta que a presença de fármacos no ambiente é, geralmente, pequena quando comparada a outros produtos químicos. No entanto, a alta persistência de vários destes compostos e sua contínua reposição aumentam o risco de exposição crônica para os organismos aquáticos, como também para os humanos. Um destes compostos, Hidrocloridrato de Fluoxetina, medicamento bastante utilizado no tratamento da ansiedade e distúrbios de comportamento, obesidade e bulemia nervosa, tem sido reportado como um causador de distúrbios em organismos aquáticos. Os resultados demonstram que o fármaco em estudo foi parcialmente degradado pelos organismos no sistema teste com uma remoção de 27%. Os ensaios ecotoxicológicos indicaram que os fármacos apresentam toxicidades diferentes entre as formulações estudadas. As avaliações da toxicidade das amostras geradas pelo sistema de respirometria apresentaram uma redução na toxicidade. Os ensaios indicam uma possível acumulação ambiental com conseqüências prejudiciais aos organismos aquáticos. / Abstract: The Commission of the European Union and the scientific committee of toxicology, ecotoxicology and environment 1990, identified, the need of the obtaining of data on the effects of the drugs in the environment. These composed and they metabolics are, introduced in the environment, through the wastewater sanitary, in larger proportions than 100 ton/year. The scientific literature comments that the drugs presences in the environment are generally, small when compared the other chemical products. However the high persistence of several of these composed and its continuous replacement increases the risk of chronic exhibition for the aquatic organisms as well as for the humans. One of these substance, Hidrocloridrate of Fluoxetine, medication quite used in the treatment of the anxiety and disturbances of behavior, obesity and nervous bulemy, it has been reported as a caused of disturbances in aquatic organisms. The results demonstrate that the drug in study was degraded partially by the organisms in test system with a maximum removal of approximately 27%. The toxicological rehearsals indicated that the drugs presents show different toxicicity among the studied formulations. The evaluation of the toxicicity of the samples generated by the system presented a reduction in the toxicicity. The rehearsals indicate a possible environmental accumulation with harmful consequences to the aquatic organisms. / Mestrado / Saneamento e Ambiente / Mestre em Engenharia Civil
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Estudo da atividade prebiotica de hidrolisados lignocelulsicos / Study of prebiotic activity of lignocellulosics hydrolyzed productsMenezes, Cristiano Ragagnin de 29 June 2007 (has links)
Orientador: Lucia Regina Durrant / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-09T13:47:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2007 / Resumo: Neste trabalho foram avaliadas 6 linhagens de fungos basidiomicetos, sendo que estas foram testadas em 5 tipos de fontes lignocelulósicas provindas de resíduos agroindustriais. Estes foram testados sob fermentação submersa em cultivo estacionário no período de 30 dias de incubação. Na busca dos melhores hidrolisados para os testes prebióticos, foram selecionados os hidrolisados utilizados para fonte de enzimas dos fungos Pleurotus sp BCCB068 e Pleurotus tailândia, no 10° dia de incubação, utilizando farelo de arroz como fonte de carbono com as maiores atividades de xilanase de 0,29 U/ml e 0,24 U/mL respectivamente. Estes valores foram ampliados posteriormente com a otimização do processo de fermentação, elevando as atividades para 0,4 U/mL e 0,69 U/mL, respectivamente. Os hidrolisados escolhidos foram aplicados como fonte de enzimas lignocelulolíticas sobre a matriz de xilana e carboximetilcelulose, avaliando a degradação destas matrizes no período de 0 a 60 minutos de hidrólise. Neste período, os hidrolisados mostraram-se capaz de hidrolisar até 66,4% da xilana e 59,9% de carboximetilcelulose, formando compostos xilooligossacarídeos e celooligossacarídeos, respectivamente, além de vários monômeros de açúcares. As linhagens Pleurotus sp BCCB068 e Pleurotus tailândia também foram utilizadas diretamente para degradar a matriz de xilana em fermentação de 40 dias de cultivo, onde degradaram esta matriz em 73,6% no 20° dia para a primeira e 70,1% já no 5° dia de cultivo para a segunda linhagem, com produção de xilooligossacarídeos e seus monômeros. Os hidrolisados com efeito positivo na degradação das matrizes de xilana e carboximetilcelulose foram testados na sua atividade prebiótica, com significativa estimulação de culturas probióticas do gênero Lactobacillus e Bifidobacterium, e sem estimulação significativa de bactérias enteropatogênicas como a S. enteritidis e E. coli, em experimentos in vitro. Estes resultados indicam o grande potencial destas linhagens fúngicas para a degradação de matrizes hemicelulósicas, para a obtenção de compostos hidrolisados com características prebióticas / Abstract: In this present work, six basidiomycete strains were evaluated using five different lignocelulosic agricultural residues as substrates. These fungi were cultivated under non-agitated conditions for 30 days. Searching for the best strains able to produce lignocellulolytic enzymes, hidrolise these growth substrates and generate compounds having prebiotic activity, Pleurotus sp BCCB068 and Pleurotus tailândia were selected at 10 days of growth using rice bran as the sole carbon source, because they exibited the best xylanase activities (0.29 and 0.24 U/mL, respectively). Growth of these fungi was optimized using an experimental design, resulting in the increase of xylanase activities to 0.4 and 0.69 U/mL, respectively. The crude extract obtained following growth of these fungi used as enzyme source for the hidrolises of xylan and carboxymethylcellulose matrices, which were degradaded (66.4 and 59.9%), respectively, during 0-60 minutes of hydrolysis, forming xylo- and celo-oligosaccharides, as well as several sugar monomers. Pleurotus sp BCCB068 and Pleurotus tailândia were also used directly to degrade xylan under fermentation during 40 days, produzing xylooligosaccharides and sugars, and showing degradation of 73.6% at the 20th day, and 70,1% at the 5th day, respectively. The hydrolyzed products with positive effect in the degradation of xylan and carboxymethylcellulose were evaluated regarding their prebiotic activity, showing significant stimulation of Lactobacillus and Bifidobacterium. However, no significant stimulation of enteropatogenic bacteria such as S. enteritidis and E. coli, in an in vitro experimentation. These results indicate a great potential of these fungal strains to degrade hemicellulosic materials and produce hydrolyzed compounds with prebiotic characteristics / Doutorado / Doutor em Ciência de Alimentos
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Estudo da microbiota e da biodegradação de petroleo de bacias brasileiras, e sua implicação nos parametros de biodegradação / Study of the microbiota and of petroleum biodegradation in Brazilian basins, and its consequences on the biodegradation parametersAngolini, Célio Fernando Figueiredo, 1986- 15 August 2018 (has links)
Orientador: Anita Jocelyne Marsaioli / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-15T06:36:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2009 / Resumo: O principal objetivo desse trabalho foi avaliar a biodegradação de petróleo e suas implicações nos parâmetros de correlação do óleo realizada por microrganismos isolados da Bacia de Campos (RJ) e de consórcios microbianos da Bacia Potiguar (RN). Os experimentos de biodegradação foram adaptados à escala laboratorial, a fim de mimetizar um reservatório de petróleo. O estudo das atividades enzimáticas com moléculas representantes de algumas classes de biomarcadores de petróleo revelou a existência de enzimas capazes de realizar algumas reações como as de: lipase, esterase, epóxido-hidrolase, mono e dioxidases, redutases e liases (reações de formação e/ou rompimento de ligações carbono-carbono). Atividades essas importantes na degradação do petróleo e de outras fontes de carbono. Nos experimentos com biodegradação de petróleo pôde-se perceber que os microrganismos isolados atuaram de forma diferente entre si sobre as diferentes classes de biomarcadores. De maneira geral a biodegradação dos microrganismos isolados com o óleo P1 apresentou uma preferência na seguinte ordem: hidrocarbonetos saturados > aromáticos leves > bicíclicos > terpanos tricíclicos e hopanos. Já para o consorcio avaliado, recuperado do óleo da bacia Potiguar, frente ao óleo PS1 observou-se a seguinte seqüência de biodegradação: hidrocarbonetos leves> aromáticos leves> terpanos tricíclicos. Sendo que os hidrocarbonetos mais pesados e hopanos não apresentaram uma biodegradação tão significativa. Os resultados obtidos foram importantes para concluir que alguns dos parâmetros de biodegradação utilizados em geoquímica orgânica variam muito em função do tipo de atuação da microbiota específica presente no reservatório. / Abstract: The main objective of this study was to evaluate the oil biodegradation of the Pampo Sul oil field (Campos Basin , RJ) isolated microorganisms and the Potiguar Basin (RN) microbial consortia and how they affected the geochemical parameters. The biodegradation experiments of selected molecules, chosen to represent some petroleum biomarker classes, were adapted to the laboratory scale trying to mimic an oil reservoir, revealed the presence of lipases, esterases, epoxide hydrolases, mono and dioxygenases, reductases and some C-C bond cleaving and bond making (liases) enzymes. These activities are important for oil degradation and of other carbon sources. In experiments of oil biodegradation these microorganisms had a different beaviour upon each biomarker class. In general the biodegradation of microorganisms with the oil P1 showed a preference for: hydrocarbons > light aromatic > bicyclic terpanes > tricyclic terpanes and hopanes. Microorganims from Potiguar Basin oil had a different preference in biodegradation: light hydrocarbons> light aromatic > tricyclic terpanea, and the heavier hydrocarbons and hopanes showed no significant biodegradation. In conclusion, these results reveal that the geochemical parameters that are proxies of biodegradation depend on the specific microbiota in the reservoir. / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química
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Bactérias isoladas de solos rizosféricos de Allium fistollium L. com histórico de aplicação do fungicida mancozeb na comunidade Nova Esperança Manaus-AM.Rebière, Carolina 13 June 2013 (has links)
Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-06-30T20:04:00Z
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Previous issue date: 2013-06-13 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The utilization of pesticides in agriculture has been intensified, causing big impact in the soils
and biota. The presence of these compounds in soils has been resulting in microorganism
behavior modification, developing survival strategies to the presence of these products. The
Manconzeb is a carbamate`s fungicides group that acts, inactivating the essential enzymes of
fungi. The subjects of this study were: to characterize chemically and physically rhizosphere soil
samples with history of repeated fungicide application; to isolate bacteria from this soil; to
characterize the isolates with biochemical tests and molecular tools; to obtain the growth of the
isolates in environment with the fungicide; to establish a bacterial collection with bioremediation
potential. Samples of soils were collected and it was determined their chemical and physical
characteristic. The bacterias were isolated using two different techniques: minimal salt broth, and
Busheel Haas broth containing 3,6gL-1of Mancozeb. The isolated strains were submitted to tests
in minimal salt broth to evaluate the potential of degradation in environment with this fungicide.
The identification was made through the phenotypic characterization, using biochemical tests to
determine the gender and molecular identification using the sequencing of the region 16S, with
the primers 1492R, 513F with amplification of 1000 pb. The 23 bacterial isolates were identified
as 4 families, 4 genders and 11 species. The Bacillaceae family is more representative with
86,95% of the isolates. These tests provided to verify the tolerance of the bacteria that was
isolated in higher concentrations of Mancozeb that are used in field to control pests. The
collection of microorganisms resulting from this research may contribute for future studies
involving the biodegradation of xenobiotics. / A utilização de fungicidas na agricultura tem se intensificado, causando grande impacto nos solos
e na biota em que eles se encontram. A presença desses compostos no solo vem acarretando
modificações no comportamento dos microrganismos, que passaram a adquirir estratégias de
sobrevivência à presença desses produtos. O Mancozeb é um fungicida do grupo dos carbamatos
sendo que sua ação pelo contato, inativa as enzimas essencias dos fungos. Os objetivos deste
trabalho foram: caracterizar fisico-quimicamente amostras de solo rizosférico com histórico de
aplicação do Mancozeb; isolar bactérias desse solo; caracterizar os isolados com ensaios
bioquímicos e ferramentas moleculares; obter o crescimento dos isolados em meio mínimo
acrescido do fungicida; estabelecer uma coleção de bactérias com potencial de biorremediação.
Amostras de solo foram coletadas e determinaram-se suas características físico-químicas. As
bactérias foram isoladas a partir de técnicas de isolamento em dois meios de cultura diferentes:
meio mínimo e meio Busheel Haas acrescidos de 3,6gL-1 de Mancozeb. As linhagens isoladas
foram submetidas a ensaios em meio mínimo para verificar o potencial de degradação dessas
bactérias ao agrotóxico. Realizou-se à identificação por meio da caracterização fenotípica,
utilizando-se de ensaios bioquímicos, para determinar o gênero e identificação molecular pelo
emprego do sequenciamento da região 16S, com os iniciadores 1492R, 513F, os quais
amplificam 1000 pares de base. Os 23 isolados de bactérias foram identificadas em quatro
famílias quatro gêneros e onze espécies. A família Bacillaceae foi a mais representativa, com
86,95% dos isolados. Esses ensaios proporcionaram verificar a tolerância das bactérias isoladas
em concentrações superiores as usadas em campo para o controle de pragas. A coleção de
microrganismos decorrentes da realização dessa pesquisa poderá servir para estudos futuros
envolvendo a biodegradação de xenobióticos.
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Biopolpação a partir de cultivos mistos de basidiomicetos sobre madeira de Eucalyptus grandis e Eucalyptus urograndis / Biopulping based on mixed cultures of basidiomycetes on Eucalyptus grandis and Eucalyptus urograndis (E. grandis x E. urophilla hybrids) wood chipsGina Gabriela Seabra Cunha 02 December 2011 (has links)
A biopolpação consiste no biotratamento de madeira por fungos degradadores de lignina como etapa prévia à produção de polpa celulósica. De uma forma geral, as madeiras biotratadas facilitam os processos posteriores de polpação. Entretanto, ensaios anteriores que avaliaram a biopolpação em escala piloto mostraram que é difícil estabelecer os cultivos de basidiomicetos de interesse livre de bolores contaminantes, já que não é fácil controlar perfeitamente a assepsia durante a inoculação. Para contribuir com o avanço do processo de biopolpação, este trabalho avaliou os cultivos mistos de Ceriporiopsis subvermispora e Phanerochaete chrysosporium sobre madeira de Eucalyptus grandis e Eucalyptus urograndis em regimes de incubação em temperaturas variáveis e em condições não assépticas. A estratégia de iniciar os cultivos em temperatura mais elevada (37°C) e depois manter as culturas em temperaturas variáveis de 27°C e 37°C se mostrou eficiente para inibir o crescimento de contaminantes indesejáveis tanto nos cultivos mistos como nos individuais de cada espécie avaliada. Para avaliar o efeito do biotratamento da madeira numa etapa subsequente de polpação quimiotermomecânica (CTMP) foi feito um estudo preliminar de ajuste de variáveis de polpação por refinamento mecânico de cavacos pré-digeridos com licor alcalino contendo sulfito de sódio. Os dados mostraram que é possível simular o rendimento e as características fisico-mecânicas de polpas industriais empregando uma etapa de pré-digestão dos cavacos com 6% de Na2SO3 e 3% de NaOH a 120°C por 2 h, seguida de desfibramento e refino em refinador de discos. As curvas de refino nesse processo CTMP mostraram que os cavacos biotratados deram origem a polpas com 300 mL de Freeness (CSF) consumindo menos energia do que o observado para o refino da madeira controle. As economias de energia chegaram a 60% em alguns casos, porém não foram maximizadas pelo efeito sinérgico do cultivo misto dos dois basidiomicetos em questão. Experimentos adicionais foram desenvolvidos empregando as espécies fúngicas Pycnoporus sanguineus e Trametes versicolor que foram eficientes para competir com contaminantes mesmo a 27oC. Neste caso, as economias de energia no processo CTMP subsequente somente foram obtidas com tempos mais longos de biotratamento (30 dias) e ainda assim os valores obtidos foram inferiores àqueles obtidos com as madeiras biotratadas por C. subvermispora e P. chrysosporium. Também a combinação das espécies C. subvermispora e Pleurotus ostreatus foi avaliada. Neste caso havia informação prévia da literatura indicando um efeito sinérgico da ação das duas espécies no que diz respeito a secreção da enzima manganês-peroxidase (MnP) e na degradação de lignina. Os resultados corroboraram que os cultivos mistos de C. subvermispora e P.ostreatus proporcionam maior produção de MnP do que os cultivos individuais de cada espécie. Por outro lado, P. ostreatus foi ineficiente para promover a redução do consumo de energia no processo CTMP subsequente. Os cultivos mistos também não proporcionaram efeito superior àquele observado com o cultivo individual de C. subvermispora. / Biopulping involves the wood biotreatment by selected white-rot fungi as a pretreatment step of conventional pulping processes. In general, the biotreated wood facilitates the subsequent pulping processes. However, previous studies on pilot scale showed that the process is susceptible to contamination by molds when the inoculation and biodegradation steps are carried out under non-aseptic conditions. To contribute with the biopulping progress this study evaluated the use of mixed cultures of Ceriporiopsis subvermispora and Phanerochaete chrysosporium acting on Eucalyptus grandis and Eucalyptus urograndis wood under non aseptic conditions where incubation was performed at varied temperatures. The simple strategy of initiating the incubation at 37°C for 3 days followed by a non-controlled step where the temperature could oscillate in the range of 27°C to 37°C proved to be efficient to inhibit the growth of contaminants. To evaluate the wood biotreatment effect in a subsequent step of chemithermomechanical pulping (CTMP), a preliminary study to adjust pulping variables was performed. Wood chips were predigested with alkaline-sulfite liquor, fibrillated and refined in a disk refiner. It was possible to simulate the yield and physico-mechanical properties of industrial CTMP pulps using a pre-digestion stage with 6% of Na2SO3 and 3% of NaOH at 120°C for 2 h. The refing curves in the CTMP process showed that the biotreated chips required less energy to reach 300 mL of Freeness (CSF) in the pulps than energy required to refine the control wood chips. Energy savings reached 60% in some cases, but were not maximized by the eventual synergic effect of the mixed cultures of the two basidiomycetes. Additional experiments were developed using the fungal species Trametes versicolor and Pycnoporus sanguineus that were efficient to compete with contaminants even at 27°C. In this case, the energy savings in the subsequent CTMP process were obtained only after long biotreatment times (30 days) and these values were lower than those obtained with the biotreated wood by C. subvermispora and P. chrysosporium. The combination C. subvermispora and Pleurotus ostreatus was also evaluated. In this case, previous literature information indicated some synergic effect of the two species regarding secretion of manganese peroxidase (MnP) and lignin degradation. The results corroborated that the mixed cultures of C. subvermispora and P.ostreatus provided an increased production of MnP compared to the individual cultivation of each species. On the other hand, P.ostreatus was not efficient to promote energy savings in the subsequent CTMP process. The mixed cultures did not provide increased energy savings as compared with the individual biotreatment with C. subvermispora.
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\"Biodegradação de poliuretano derivado do óleo de mamona\" / \"Biodegradation of poliurethane derived of castor oil\"José Marcelo Cangemi 04 May 2006 (has links)
O meio ambiente requer polímeros que possam ser degradados e desapareçam por completo pela atuação de vários fatores ambientais, incluindo microrganismos. No presente trabalho estudou-se a biodegradação de espumas de poliuretano obtidas a partir do óleo de mamona, um material renovável e de origem natural, se constituindo em uma alternativa viável para a substituição das tradicionais espumas de PU. O acompanhamento da biodegradação foi realizado para a espuma PU-vegetal e PU-petróleo, através das seguintes técnicas: zona de halo, microscopia eletrônica de varredura (MEV), análise termogravimétrica (TG) e espectrometria na região de absorção do infravermelho por transformada de Fourier, utilizando acessório de refletância total atenuada (FTIR ? ATR). Outras etapas do trabalho envolveram a realização de testes de biodegradação em espumas utilizadas na adsorção de um azocorante utilizado em curtumes (C.I. Acid Orange 61) e o estudo da biodegradação do material polimérico quando se realizam modificações em sua estrutura. As várias técnicas utilizadas indicaram mudança na estrutura química da espuma de origem vegetal, após o ataque de microrganismos, caracterizando um processo de biodegradação; o mesmo não ocorreu com a espuma derivada do petróleo, indicando a manutenção da estrutura da macromolécula. / The environment requires polymers that can be completely biodegraded through the action of several environmental factors, including microorganisms. The present work studied biodegradation of polyurethane foam obtained from castor oil, a renewable natural material, constituting a viable alternative to traditional PU foams. Biodegradation was compared for castor oil PU and conventional petroleum PU, using the following techniques: halo zone, scanning electron microscopy (SEM), thermogravimetric analysis (TG), and Fourier-transform infrared spectroscopy with accessory for attenuated total reflectance (FTIR ? ATR). Other steps in the work involved biodegradation testing for foams utilized in the adsorption of a tanning dye (C.I. Acid Orange 61) and the study of biodegradation in polymer material when submitted to structural modification. Utilization of these techniques indicated change in the chemical structure of the vegetable origin foam after undergoing attack by microorganisms, characterizing a biodegradable process. Petroleum derived foam did not show the same good results, indicating the retention of the macromolecular structure.
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